3A8WA

Crystal structure of pkciota kinase domain
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
343
structure length
326
Chain Sequence
MDPLGLQDFDLLRVIGRGSYAKVLLVRLKKTDRIYAMKVVKKELVNIDWVQTEKHVFEQASNHPFLVGLHSCFQTESRLFFVIEYVNGGDLMFHMQRQRKLPEEHARFYSAEISLALNYLHERGIIYRDLKLDNVLLDSEGHIKLTDYGMCKEGLRPGDTTSFCGTPNYIAPEILRGEDYGFSVDWWALGVLMFEMMAGRSPFDTEDYLFQVILEKQIRIPRSLSVKAASVLKSFLNKDPKERLGCHPQTGFADIQGHPFFRNVDWDMMEQKQVVPPFKPNISGEFGLDNFDSQFTNEPVQLPDDDDIVRKIDQSEFEGFEYINPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structures of the PKC-iota kinase domain in its ATP-bound and apo forms reveal defined structures of residues 533-551 in the C-terminal tail and their roles in ATP binding
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein kinase C iota type
total genus 94
structure length 326
sequence length 343
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.13: Protein kinase C.
pdb deposition date 2009-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3a8wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3a8wA01
1DI8A 2E9PA 3BBTB 4ZMFA 1W84A 3TL8A 4QP2A 3JY9A 4USDA 4FGBA 4W9XA 1Y8YA 4QPSA 5E8UA 4ZJVA 3SDJA 4L7SA 2CGXA 5DA3A 5HLPA 3MJ1A 2GPHA 4L3JA 1FGIA 4CFUA 2B55A 1H1SA 1JSTA 3FKLA 3MA6A 3LCKA 4MD9E 2GHLA 1R0PA 4IAZA 4D2SA 4F65A 5KBQA 4EC9A 3HV6A 3CTQA 3MVHA 3DBDA 4XS2A 2E2BA 4GVJA 5CU3A 3DLSA 4IVDA 4P5QA 1WAKA 3BPRA 3FXZA 3U4UA 4E4NA 1V0OA 3PUPA 1VYWA 4IE9A 4CZUA 3EL8A 3ATSA 5CASA 3ZXZA 1OMWA 5KMKA 2PYWA 4DGMA 1B38A 1H27A 2PUUA 3VUHA 3EN4A 1OPJA 1WBOA 3RK7A 3SA0A 4LGHA 5K4JA 4KWPA 3ORTA 1J7UA 3RNYA 4MX9A 5AADA 4PWNA 3DV3A 4FV3A 5GHVA 5HU9A 4TYIA 4NM7A 4AZSA 5JFVA 3TNWA 5CXHA 4LFIA 5BNJA 2PSQA 4FKLA 4FSWA 4K0YA 4OBQA 4R1VA 5HE0A 4G6OA 2HW7A 3ZMMA 4H3BA 2PVHA 3QZFA 3PLSA 4BGHA 4EZ5A 3WF7A 5AA9A 5I9YA 2C5OA 4O7SA 3CP9A 5I3OA 1ZZLA 5IMEA 2QQ7A 4IIRA 2F9GA 5IQFA 1H4LA 5LARA 1BX6A 5FP5A 5LJJA 4QPMA 4D2WA 3N4TA 5L8LA 3UIXA 5HE2A 4I92A 4BI1A 1YHWA 4XP0A 3BLRA 4B99A 3OBGA 1YXXA 1I09A 3DPKA 4R78A 3DA6A 3VRYA 2X8DA 4I94A 4NU1A 5D9HA 2AC5A 4W4YA 3ZCLA 4OBOA 4JNWA 3KA0A 5E8TA 1A9UA 2P4IA 3BYOA 3QUPA 2EVAA 4I23A 4PV0A 3VUMA 3ETAA 4JL9A 2XZSA 4YZBA 5BPYA 3QA0A 2O5KA 4C4JA 3E3BX 4QP1A 4EOPA 4JX7A 4JIAA 3BHVA 3LFBA 2W9ZB 4P90A 3WYYA 4LRKA 2JLDA 2UW4A 4KRCA 3VUTA 2YJSA 2XCHA 3VUDA 2FO0A 2W1HA 3SV0A 4C57A 2OWBA 2C4GA 5BUIA 3C13A 3HMPA 2UW7A 5HTBA 1VEBA 1YQJA 2PVKA 4O0TA 2Z2WA 3V6SA 4EHZA 4QMXA 5EM5A 2FSTX 3L9LA 3ORMA 4QP6A 4O38A 4C3FA 2BRNA 4DT9A 3MFRA 3JXWA 5IISA 4AGDA 4WBOA 4X6QC 4ERWA 3LMGA 3UNZA 2ONLA 4QT1A 3GQIA 4X2JA 5G6VA 4W4XA 1YXUA 5LOHA 2PL0A 1CMKE 2YM4A 4RIOA 4WKQA 2EB2A 4FZ7A 5CEQA 3U9CA 2ZMDA 5FDXA 4AA4A 4M69B 4HGEA 4O0YA 2XBAA 1ZYLA 5CY3A 2WMBA 5EHLA 2W06A 3UZRA 3QD3A 4E6CA 4P5ZA 4TTHB 3P7CA 3U4WA 1YOJA 5AM7A 4FKWA 4RLLA 4CFMA 3GU8A 4XV3A 4KIKA 4EOMA 3KQ7A 4KS8A 1GZ8A 2GHMA 4IFGA 5FM2A 5B0XA 5D7VA 2C0IA 2C5YA 2FGIA 5M4UA 4MTAA 5EYCA 5C8KA 2B4SB 2CSNA 4QTCA 3EQDA 4FTTA 3R63A 1GIHA 2XBJA 2OGVA 3IOPA 4QMOA 5JT2A 3MVJA 5AP1A 5HE1A 5IUIA 4ALUA 2VWVA 3MWUA 4NSTA 2XUUA 3G9NA 4ZTQA 5JN2A 3L8SA 5L2IA 4CXAA 3JUHA 3OS3A 5IA3A 4FIEA 3ORNA 2IVUA 3CQEA 2XNOA 4KIOA 4MK0A 3V04A 1UNLA 5M55A 2I0HA 5E7RA 4FKTA 4OTGA 5HKMA 3NDMA 3QKMA 3WF6A 2GQRA 2YWVA 2GNHA 4DEIA 4QP3A 2VNYA 2PTKA 4ANBA 5K9IA 3QZIA 1WBPA 3RTPA 2VNWA 1DAYA 5B2KA 3WE4A 3MPTA 4MQ1A 4F99A 4O2PA 4O7LA 3CIKA 3C4CA 4ZLOA 3PFQA 5I9ZA 4DG3E 1XJDA 2WMAA 3C4XA 3C7QA 4ZS0A 3AD6A 4Z55A 5LVMA 3OXTA 3GFWA 5IQHA 1URCA 4O7ZA 5HO8A 1UWJA 4EK3A 2IPXA 1P4FA 4WG3A 1YDSE 3HL7A 5D11A 5ANEA 5JGBA 2YJRA 4ITIA 4AE6A 3LQ8A 5AP3A 4IVBA 2VTHA 4AF3A 5L6PA 3Q53A 5DH3A 2XNNA 4ZAUA 3QQJA 4FF8A 5CT0A 4AS0A 2OBJA 2OZAA 1WFCA 4NM5A 4IJPA 2YERA 3HX4A 3T9IA 3UMWA 4FG8A 5F4NA 3Q9YA 4BDDA 3F6XA 5I9XA 3NUNA 3R02A 1SYKA 3UJGA 1PKDA 2HY81 3QF9A 1PXMA 5K0XA 1WBSA 2UZUE 3EWHA 3KF7A 4WBBB 4FE2A 4OLIA 2BTSA 4FZ6A 5FRIA 3V5TA 4F08A 5E9EA 4UY9A 3LFFA 4PTCA 2XF0A 4HGLA 3BWFA 3OOGA 4FZFB 1ZY4A 3SGCA 5M06A 4NYEA 3F2RA 2XYUA 3GC7A 5HGIA 5JQ5A 4O6LA 3FLWA 3GQLA 5M07A 4ARKA 2OW3A 4O0WA 2XK7A 5LVLA 4YLLA 5GINE 3ZS5A 2JIVA 1U5QA 4LV5A 1YI6A 5HVJA 3UQCA 5IQCA 2QOLA 1OBGA 1JKSA 2R3GA 5DNRA 4J98A 2BDFA 3LIJA 2ITVA 4K18A 4BY9E 2O64A 3FPQA 5HD4A 1S9IA 3F5PA 1GZNA 2ZB1A 4PF4A 4NT4A 5M44A 1OIRA 5AUVA 2WU7A 4AOIA 1XH4A 3DAEA 3ATTA 3ZSGA 3MFUA 4CLJA 2I0EA 3A62A 1ZYDA 3ZYAA 3WOWA 2UV2A 2LGCA 2R3NA 4TW9A 2UZLA 3CPBA 3OXZA 3QRKA 3QTRA 3LCTA 5J8IA 4EQCA 5GIPE 3VS4A 1XH5A 1NA7A 5DR2A 5AUYA 2HWPA 2X7OA 2GQSA 3PZHA 2X2LA 4O2ZA 5AV4A 3W2RA 4A9YA 4R7IA 5CEPA 5FG8A 4ENYA 5HX6A 3IDBA 4CCUA 1IAHA 2YFXA 3NW7A 5FBNC 3DQXA 3C4EA 2WEIA 4PMTA 1ZOGA 4YJPA 2WTVA 5HBHA 3ODZX 3I7BA 4JAIA 1TKIA 1H1WA 3ZLSA 3AXWA 4XG4A 3BIZA 4AZVA 2GTMA 4UWYA 4BN1A 2NRYA 1QPEA 2Q0BA 4E7WA 2JDVA 4I5HA 4U0IA 1U5RA 5AUXA 4ASDA 3EMGA 3CQUA 4RJ7A 5BUEA 3BEGA 3UOKA 4RZVA 3CR0A 2PZ5A 4GYIA 4XUFA 1OKWA 4UV0A 2VU3A 4FTKA 4FV0A 1KE8A 4FUYA 4WD5A 3FL4A 4Q5EA 5DGZA 2W1FA 4IX6A 5BUJA 4JQ8A 3KCKA 2YCFA 4RVKA 4C58A 2PZRA 2Z02A 2B54A 3EQPA 4G17A 4DINA 1BL6A 4QQTA 1VZOA 2UZDA 4H1JA 4HZRA 3BU3A 2H6DA 3CC6A 4ZIMA 3SOAA 2UZWE 3KVXA 3DQWA 2C5VA 2R2PA 5CNOA 3LXPA 3IECA 4L43A 5BYYA 4OAUC 4CFNA 4IAFA 5AR5A 5ANIA 2DYLA 3QALE 3VQUA 1OKVA 2Y6OA 3ELJA 3IKAA 3QRTA 2GU8A 4IAKA 5ACBC 3VAPA 1Y6AA 4O96A 4YLJA 3ZHPC 4KA3A 4ITHA 2YITA 3TUDA 2V22A 3VBWA 5KO1A 3Q6UA 3TACA 2Z7RA 3A8WA 3C4WA 4FEWA 4JBOA 5EM7A 2J0JA 3ZH8A 3ZZWA 5KNJA 4J7BA 3OEFX 4QYHA 4WUNA 3MVMA 3NMUF 5FUTA 3FJQE 3I0OA 5K4IA 3HRBA 3H0ZA 3FXXA 1CKPA 4FZAB 3NCZA 2XK9A 3AC8A 3MVLA 3DT1A 2QU5A 4QMNA 3OF0A 3Q4UA 4RJ3A 4BDKA 4C37A 4GS6A 5IKWA 2YDJA 4OUCA 3FMDA 3QYWA 4J99A 5D41A 1BYGA 3G33A 1TQMA 2Z7SA 4ZTRA 4JT3A 4FKRA 1YWRA 3R2BA 5ITAA 3NZ0A 2BRMA 3Q6WA 5AM6A 4U3YA 3ZEWA 3IW6A 4YGAA 4IZ5A 5A46A 3A4OX 2HZNA 3FLQA 4CG9A 3R7GA 1OUKA 2QO7A 3GB2A 2QG5A 5GJFA 4FIGA 3KN6A 4FKOA 3KMMA 4AGWA 4O7WA 4YC3A 4TNBA 2P55A 2QO9A 2BALA 3IOKA 2GHGA 4S31A 4Y95A 4E1ZA 2OF4A 4X2NA 4O86A 3VF9A 1OGUA 3II5A 2ZV8A 4NFMA 4FNYA 1OL6A 4QMUA 4EEVA 1XBAA 2GQGA 4BI2A 4FV1A 3TZMA 4EC8A 1PXKA 1PRYA 3E8CA 4CT1A 3EQGA 4B4LA 4ANQA 1TQIA 2QKRA 1S9JA 4KBCA 3MPMA 3BCEA 5J1VA 4K33A 3QAME 4RPVA 4GH2A 5FDPA 4FT9A 3F7ZA 5LMKC 5M53A 4EOOA 2P33A 2ETMA 5CF4A 1PF8A 2UUEA 3CLYA 5H8GA 1UVRA 3TM0A 5IPJA 1Y57A 4KSQA 4JG7A 1O6KA 3V8TA 4N6YA 1J1BA 4FTOA 5FEDA 5D10A 3U54A 3BE9A 3R7VA 4BDIA 4CFXA 2QVSE 4UXLA 4GK2A 2UW3A 2X6DA 3KXMA 4YJVA 4C3PA 4RGJA 4MWIA 1YDRE 2J6MA 1ZOHA 3MI9A 4RIXB 2C3KA 2H9VA 3KMWA 5F1ZA 3F5UA 3R1YA 5CSVA 4G2FA 1URWA 3NGAA 5DN3A 3IW8A 4CFWA 4DFNA 4BDCA 2W5BA 3NVKI 3QD2B 2BRBA 2IVVA 2CGVA 4KINA 3CQWA 4HYSA 5EOBA 3DAKA 5I5ZA 4U97A 3RPRA 3UP7A 3QBNA 2VAGA 1K9AA 2BAJA 4XHKB 5H8EA 4EQUA 5BVOA 2F7XE 4TWNA 1IR3A 4FNWA 1JKKA 5IEVA 1SZMA 2RSVA 3Q52A 3R1NA 4KS7A 2VTQA 4QP7A 5CAVA 1XHAA 3PTGA 4XP3A 3QRJA 4ACHA 3I0QA 3CTHA 5CX9A 1W7HA 5EI2A 2QOKA 4DBNA 3QLGA 2O0UA 3F69A 4FT5A 4FKQA 4K6ZA 2JAMA 4PY1A 3CEKA 3A61A 3G90X 3PXRA 3V01A 3EOCA 5TE0A 1UKHA 4C36A 2OKRA 2RG6A 3G5DA 3VJOA 2YM6A 2WTWA 4FV6A 4U3ZA 3EQRA 4PP9A 2YIRA 3E63A 3PP1A 2OSCA 3E88A 4QYGA 2BUJA 1H1PA 4JX3A 2W4OA 3NIEA 4H39A 5DT0A 4JDHA 3VBQA 3QYZA 1G3NA 3OCGA 4GK4A 4GKIA 3FWQA 2OH4A 3I1AA 5K5NA 3UP2A 3O50A 1BL7A 2YABA 3FXWA 5IA4A 1XWSA 5BMSA 3TZ8A 2RFSA 2WPAA 3TUBA 2R7BA 2KULA 3W18A 3OT8A 3FI2A 5KMMA 3W55A 4L45A 4RIWA 4V01A 2V62A 3KF4A 5AV0A 4EWQA 2XKDA 2XNBA 3RINA 4EH7A 4CKJA 3RPOA 3O8PA 3HRFA 3FC1X 3LE6A 2QLQA 5AP7A 1M7QA 2OXXA 1PYEA 5IEXA 3C4FA 2JGZA 4FOCA 4YBKA 3RPSA 3P86A 4AW2A 2KTYA 4FOBA 3FAAA 5E8WA 4E26A 2PUNA 1FOTA 4UBAA 4XBRA 5F9EA 4BZDA 3R0TA 4I1ZA 3LVPA 4YTHA 2IWIA 3FZ1A 3RM6A 4OAVB 4O82A 2WIHA 1R0EA 4C4EA 3NNVA 3R22A 3LCDA 3RAIA 3RK9A 4MH7A 2WMWA 3ULZA 2JBOA 4O0RA 4YSMA 1H24A 2PMNX 3NUSA 4BGQA 1CTPE 1PXJA 3KRXA 2Y6MA 3N4UA 3LMIA 4K2RA 4V0GA 3UVPA 5FTGA 4EH9A 2BAQA 3D5XA 5HNBA 4DFZE 5CT7A 3U51A 4YPSA 4U41A 5HHWA 3A7GA 2G2FA 1V0BA 4IMYA 3KXHA 4S34A 4L00A 2OXYA 4PPCA 2O8YA 4D1ZA 4OTHA 3ENMA 3FHRA 2W05A 3ZDIA 2HXLA 3IPHA 4IACA 1YXSA 3U87A 2X4FA 3ULIA 2VWYA 3GU6A 3BHYA 3RPYA 4WRSA 3DKGA 4O91A 3KXNA 5AP0A 3O2MA 3RPVA 2BROA 2P2IA 3LFDA 1OL5A 3DAJA 4J1RA 2ZV2A 5H9BA 5L6WL 5E4HA 5DVRA 4I41A 5F94A 4N57A 2ITZA 3VHKA 2ITXA 1JAMA 3EN5A 2OJJA 3ZLYA 2ERZE 1YWVA 3N9XA 4AZFA 1PXNA 2XIKA 3RCJA 4K8AA 4RA5A 5IQIA 4YC6A 4BRXA 1F0QA 2XK4A 4D4RA 3DKOA 3DZOA 4YZ9A 4PTEA 4K11A 2OJIA 4FV8A 4FVQA 3TJDA 3HRCA 3VWAA 2JDOA 3AQVA 2WB8A 4RMZA 5AUUA 5B7VA 3R83A 1NW1A 3F88A 3UQFA 5HU3A 4KUJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PXL A;  2WMQ A;  2XH5 A;  3MJ2 A;  4BF2 A;  4DH3 A;  5AAG A;  2G2H A;  2CNU A;  3DBC A;  3ODY X;  3S00 A;  4FV5 A;  1WCC A;  3KK8 A;  4EYM A;  2VTM A;  3BHH A;  3CBL A;  3CS9 A;  4IHP A;  1IG1 A;  3PJ2 A;  4IAN A;  4G16 A;  1O6L A;  5ANJ A;  5AX3 A;  3V8W A;  4HNI A;  3ORO A;  4DG0 E;  2VTI A;  3IG7 A;  2E9V A;  3MES A;  3OEZ A;  4YTC A;  3LKM A;  1YI4 A;  4C2W A;  2ETR A;  1WBV A;  1IEP A;  1MRY A;  3JPV A;  4M3Q A;  4MXA A;  1KOA A;  5HOR A;  3POZ A;  2BFX A;  4I6F A;  4FT0 A;  2PML X;  1YHV A;  2X8E A;  3KFA A;  4Y83 A;  5IUG A;  2FVD A;  5IA5 A;  5HIE A;  4IAI A;  2OLC A;  4N70 A;  2C6O A;  2QUR A;  1LUF A;  2OH0 E;  2RGP A;  3NYN A;  4QMP A;  4X7Q A;  4PDY A;  4FL3 A;  1TVO A;  4TY1 A;  2WTI A;  3LQ3 A;  4X3F A;  5AJQ A;  2PU8 A;  4DIT A;  4FKJ A;  4AW0 A;  4D1X A;  3C0I A;  1KV1 A;  5GZ9 A;  1Q8T A;  1JWH A;  1VR2 A;  3OCS A;  3EKN A;  4ZSG A;  3ZZE A;  4YUQ A;  4R7B A;  1FIN A;  4ZZO A;  3TV4 A;  3WAR A;  2X2K A;  4CRS A;  1LP4 A;  4L6Q A;  2B9J A;  2J9M A;  3K3J A;  5IEY A;  1PW2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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