5EM5A

Egfr kinase domain mutant "tmlr" with pyridone compound 2: 4-[2-(4-chlorophenyl)ethylamino]-~{n}-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-2-oxidanylidene-1~{h}-pyridine-3-carboxamide
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
323
structure length
298
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKETSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYEEDMDDVVDADEYLIP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Pyridones as Highly Selective, Noncovalent Inhibitors of T790M Double Mutants of EGFR.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 298
sequence length 323
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5em5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5em5A01
3R2YA 3LXNA 2QG7A 2PMOX 3PRFA 3QD4A 4FIJA 1WVYA 4MQ1A 5C9CA 5J8IA 5JH6A 4M68A 3H30A 4EQUA 1G8AA 2C68A 3BYVA 4PPCA 2YM3A 3F61A 2HXQA 4FSYA 2WMBA 2ZOQA 3DK7A 4UMUA 5HCXA 4F63A 5LWMA 2YJSA 4PF4A 4C8BA 3ZXTA 4FEXA 4BKZA 3PLSA 4G5JA 3IGGA 4RJ8A 4XG7A 3VN9A 5CEOA 2C3KA 3EQDA 4AWIA 4UEUA 2A4LA 2WIHA 1VZOA 2B54A 3G5DA 4ZOGA 5IMEA 2JGZA 5EDRA 3RK7A 4YJTA 4Q9ZA 3BQCA 3PPKA 4LOPA 2WQEA 1PY5A 2DUVA 2W96B 2XCHA 3DBFA 4QMUA 2JBPA 4XV1A 2XNNA 4BICA 3GCVA 4D2TA 3PSBA 4EOJA 3P1AA 5TOZA 5FBOA 5IH6A 4MK0A 5HBHA 4BCNA 2XZSA 4QMTA 2C6DA 4IDVA 1K9AA 3PIZA 4NT4A 4ZJIA 5HX8A 1OPLA 2J0JA 2CGUA 4OLIA 5B0XA 4CFVA 2YERA 3DPKA 3F5XA 4WRSA 5FM2A 3FPQA 5CY3A 4FODA 4E8AA 4I6HA 3R6XA 3I4BA 4C38A 3FSKA 1IA8A 3BLRA 3OD6X 3FL5A 5CI6A 4R7HA 4YZBA 4KIOA 4FNXA 3R1NA 4OW8A 3MIYA 4FTIA 4H39A 2I0EA 1P4FA 1XR1A 2J5EA 4XEYA 2C69A 2VD5A 4IWPA 2XNEA 3UVRA 2W7XA 1KE5A 5CF4A 4JIKA 3DXQA 5DIAA 1ZZLA 5HQ0A 1DAWA 3OCBA 1PXOA 4AA0A 1ND4A 4E4NA 4RQKA 1JSUA 1H26A 3VW6A 3GNIB 4RVLA 2ERKA 3A7JA 2ZM4A 3NYXA 3N9XA 1UV5A 4FZFB 2Z7RA 4GMYA 4JR7A 3E8CA 4JX3A 4V01A 5H8EA 3GOKA 1E1XA 4CZTA 5CEQA 3UJGA 4DAWA 2VUWA 5TKDA 2BRBA 4CFNA 4J95A 1CKPA 3W2OA 2XK4A 4FG8A 3EQGA 4BZNA 5A14A 4M66A 2C6TA 2O64A 3TKHA 2DS1A 2J7TA 3FMHA 1LR4A 4FSNA 4FUXA 3EZVA 3D9VA 2R3IA 4ID7A 5E8YA 1VEBA 5A3XA 3A2CA 1JAMA 5C1QB 3D5UA 2YIWA 3DFCB 1H24A 1NVRA 2GTMA 3E3PA 4FSZA 3LFCA 4IX3A 4ZXTA 3VJOA 5A46A 3KK9A 3R8LA 3ZM9A 5IZFA 2ZB1A 3EQHA 3KU2A 4EJNA 3GENA 4G9CA 4ZTMA 3DAKA 2X9FA 2BDFA 4NTTA 4OTQA 4U43A 2B9IA 2ONLC 5IU2A 2R7BA 3DNDA 4IH8A 3BHUA 4FKGA 3MV5A 4GT5A 4O22A 4WKQA 4FKWA 1APME 2XKFA 3IS5A 5E8XA 3Q2MA 3V6SA 4GT4A 3PXQA 2C5NA 2YFXA 2W1ZA 4FV5A 3UODA 4JOAA 5HVKA 3WIKA 5DFPA 2OSCA 3EFWA 2UZLA 5E8SA 4FZ7A 1XBCA 2G2FA 2C1AA 2YABA 3PSDA 5EHLA 1TQMA 2OIBA 5IA4A 2WAJA 5I0BA 5E1EA 4TN6A 4WA9A 2WO6A 3P79A 4FV9A 3I6WA 3RINA 2H6DA 1SVEA 1K2PA 5IH4A 3R21A 5H3QA 3PDTA 3SV0A 5CVGA 3TACA 5KMLA 3CD3A 4FYNA 3R01A 3NEWA 5KMOA 5IPJA 4RX7A 4GSBA 3W16A 4CRLA 1WMKA 2X2LA 5HI2A 5HU9A 4USFA 4HCUA 2VTNA 3TV4A 3ZDUA 2ZMCA 3QUEA 2HW6A 2XNMA 3ZHPC 4PY1A 4O83A 2XK9A 4KIPA 3SW4A 5JGDA 4F70A 4R78A 4AA4A 4BCGA 5GIOE 4JBQA 3R9NA 5BPYA 4OBPA 2YIRA 4MAOA 3F69A 2W5BA 5J1WA 2QI8A 3CPCA 2E9NA 3OEFX 3MSSA 3W32A 1YHVA 3LMGA 3AT2A 3TNHA 5CAPA 3TUDA 3FZSA 4XLIA 5AP1A 5AAEA 2F7ZE 3FHIA 3O51A 3UG1A 3RHXA 3Q3BA 2EB2A 5CQUA 5B7VA 2BR1A 4E6DA 3B8QA 1LUFA 5LQFA 4XP0A 4WBBB 1ZWSA 4TZRA 3W8QA 3QU0A 3FZPA 2RFEA 4M7IA 3MESA 3PY1A 2FYSA 4BVUA 5DVRA 3C13A 5I3RA 3FKLA 5AV4A 3BPRA 2GMXA 3HX4A 2PE0A 2WHBA 4V0GA 4CNHA 2IVSA 2J6MA 4G6OA 4K9YA 3AC2A 3EOCA 3FZ1A 4IB0A 3DOGA 4IWOA 3RI1A 2XKCA 3FXWA 1XBAA 2ERZE 2C3LA 3QL8A 5AUWA 3SHEA 3QD2B 5A4LA 2C6MA 5I9YA 3MFUA 2VTOA 1Y91A 3MJ1A 4HPUE 3UYSA 5LJJA 1OKWA 3Q32A 3UG2A 4L00A 4QTDA 4GVAA 3GB2A 4FTJA 5HHWA 4BGHA 3NX8A 4BWKA 2UW3A 5EOLA 3S00A 5HVYA 4EBWA 1U46A 1QPCA 4XUFA 1OL2A 4AFEA 3LMHA 2V55A 2W4KA 3R1SA 3D5XA 3OXZA 5D7AA 3PVBA 2OK1A 4H3QA 4KA3A 2P2IA 4IX6A 4YZ9A 5GHVA 4KABA 2I0YA 3QXPA 5DLSA 4HVHA 2W1EA 4TYGA 4IB5A 5AP3A 2Y0AA 2C0OA 2PTKA 4R77A 3OWJA 3MFTA 2YM4A 4PRJA 2PE2A 4RFMA 3UGCA 3ZLWA 3SG9A 3C0GA 3IPHA 1ZAOA 3CTJA 3QQUA 4Y73A 5EM6A 5L2WA 2B53A 3BRBA 2XMYA 5HG5A 4AZEA 3AGLA 2GQGA 4WIHA 5IA5A 4GUBA 2PMIA 4AZFA 4ERWA 5D11A 2H96A 2HYYA 4I4EA 4AAAA 1PXPA 2B0QA 2YDIA 5LMKA 2X9EA 4JXFA 2YM7A 4ZSAA 5J7HA 4UMPA 4FNZA 2IW8A 4XV2A 3EN5A 5CYIA 1PHKA 5JT2A 5JEBA 2XCKA 3A8XA 3OT8A 4G1WA 4FV3A 4YHFA 2IO6A 2G2IA 3AC3A 5F1ZA 2WXVA 4A4LA 3D4QA 2YISA 1QL6A 3BHVA 4HVSA 2UW4A 4MD7E 1NVSA 2J0MB 4FV6A 4TT7A 4DGMA 2IG7A 4CFMA 3EN7A 4GYGA 3PXZA 3QGWA 4NKAA 5HLPA 2HENA 4GFMA 4TWOA 4U97A 2GS2A 2VWWA 4YTCA 3H9FA 3L9LA 3LXPA 3F7WA 3OG7A 3R83A 3F3UA 3PJ1A 3R8VA 4AT5A 2XUUA 4GS6A 4G3GA 4U42A 3F2RA 2UZEA 1M14A 4PDPA 4YBKA 2XYNA 3OY3A 4ZJJA 3MPTA 4JAJA 2WQBA 2ETRA 4IEBA 3OEZA 1IEPA 4ZMEA 5HE3A 3GC9A 4KS8A 4A07A 2WQMA 4L7SA 4FV2A 1URWA 2UZTA 3R9DA 1CKJA 2WMQA 3WE8A 3SKCA 3KCFA 3VS0A 3KRXA 3MB6A 3UNZA 3Q9YA 2RF9A 4IX4A 4QMMA 2W4JA 3OCTA 1V0PA 5E91A 4RJ3A 3QRJA 4IAZA 4ZTSA 3KXNA 4FTOA 4B6LA 3SX9A 2EXEA 4FT0A 5EM8A 1Q41A 4ACGA 4BB4A 4PV0A 5M57A 5DT0A 2ZM1A 3FC1X 5DE2A 4L9IA 4APCA 4DEGA 3VHKA 4X2JA 2QOKA 4AW2A 2YCQA 1NA7A 2R3KA 4FNYA 4AX8A 4EORA 5JGBA 4M14A 3R9HA 3TV7A 3K54A 3PPJA 2PY3A 3UMXA 5M4UA 5M4CA 1PXIA 3ORTA 1Y8YA 4CT2A 3E88A 4IAIA 3WYXA 1O6YA 5FTQA 1BL6A 2OZAA 4MD9E 3QZIA 3FMDA 1Z5MA 2WTVA 2BUJA 3G0EA 3FEGA 2V0DA 3PY3A 4K2RA 2VX3A 2PYWA 3VUMA 3KXZA 2PSQA 4ORKA 4EOSA 4DLIA 4R5SA 5A4CA 2Z60A 5JFWA 5I9VA 2J51A 2PVHA 1PMVA 1YOJA 2XBJA 4W9WA 2BDJA 4AACA 4ANBA 4AS0A 3VUKA 5EYMA 4JS8A 5C01A 4OR5A 5DR6A 2AUHA 2ZVAA 5F9EA 4QTBA 4AU8A 4W4VA 3E7VA 2YM8A 3W18A 3E7OA 2VWUA 3QTRA 4F09A 2O63A 2XIRA 3VAPA 3MVJA 3LJ0A 3WOWA 4IIRA 5IA1A 4I24A 4IB3A 4CMTA 3CJFA 3JY0A 3QBNA 3MI9A 4WSYA 4FTRA 4YMJA 4EWHA 4UYAA 3DV3A 2Y4PA 4N70A 4NJ3A 4TWCA 4CV8A 1UKHA 2RG5A 4DGNA 1RW8A 4J52A 4AN2A 2WEVA 4E26A 4PTEA 2C4GA 4YJSA 3VS2A 4TYEA 4RLKA 3GFWA 5F94A 4V0GB 4GT3A 2WMAA 2UW0A 4JDHA 4CFXA 3HV7A 1FGKA 5FTOA 5BVOA 1Q8UA 2ESMA 3PG1A 4R5YA 3ZLXA 5L2TA 5HTBA 3UP2A 3GOPA 4MVFA 2W9ZB 5HG8A 2W1GA 3GQLA 3RPVA 2VTAA 4FGRA 4CG9A 2C30A 4GRBA 2XBAA 3A8WA 3MVHA 4G17A 3JY9A 4O0YA 3ID6C 1F3MC 1L8TA 2JIIA 3IDPA 3TEIA 4EH9A 3JVSA 1BYGA 3FWQA 3V01A 4ZEGA 2KTYA 4JR3A 4L46A 5CSWA 3QTXA 2WTCA 4KRDA 4FSMA 3H10A 3R7UA 1PXNA 4ZLOA 2A2AA 4QQ5A 1OZ1A 1HCLA 4G34A 3ZZEA 3FPMA 4GFGA 2ZM3A 5HE0A 4P5QA 2QOHA 2VU3A 3LCSA 4QYYA 4ZZNA 3NCGA 4XV3A 3KN6A 4JBOA 3BEGA 2BAJA 3E64A 3ALOA 5IQFA 4TYHB 5B2MA 4U6RA 2HIWA 3VC4A 5AFVA 5HD4A 4QRCA 1H28A 4A9SA 2ZV7A 5HKMA 4CKJA 1OBDA 3IW6A 2JC6A 3GQIA 4WG5A 3MTFA 4ZIMA 4C58A 4KUJA 1XJDA 2H9VA 2Y6OA 4DYMA 1J7LA 5DYJA 3ERKA 4QMQA 4RZVA 4UWYA 2VWXA 2BMCA 4BYJA 3OFMA 1H00A 2FVDA 3RZFA 5CF5A 4DFUA 5I3OA 4DH1A 5KX8A 3WZUA 3U4WA 4J53A 3N51A 4H3BA 4FTNA 2PHKA 4II5A 5DA3A 3ZSHA 3FMKA 4DITA 2F2UA 4DEIA 4QQTA 3ENHA 3ELJA 4C36A 1XH9A 2BALA 2BPMA 2ITYA 3QTUA 1BL7A 1WVXA 1YKRA 4TRLA 5CVHA 4TNBA 2WTWA 3HMMA 3R7YA 3EQIA 4GG5A 4YJNA 1NT2A 1TQPA 2P33A 1STCE 5L2SA 3NR9A 3D0EA 3ZC5A 2VWYA 4QP7A 5HVJA 3SRVB 4GK4A 4O7WA 2VX1A 5A54A 3V3VA 3MBLA 4RLLA 3DB6A 4YO4A 4OTWA 1O6KA 2UZUE 4EH3A 4K33A 5IF1A 5AUUA 4I5HA 5K5XA 4MXOA 2BCJA 3R00A 2C5XA 3AT4A 3EQFA 4XG8A 4UBAA 4FTMA 2JFLA 3MFRA 2VV9A 3QKKA 3DK6A 1IAHA 3ZLSA 3LCDA 3KRLA 3UOJA 4IM0A 4C4GA 4XNEA 4L3JA 3D5VA 2QQ7A 4YTFA 5LMAA 5HBEA 5FDXA 1BUHA 3GT8A 4M97A 5EYKA 3E3BX 2UZWE 2C1BA 3CKXA 4D9UA 3NRMA 3W33A 1BKXA 1R3CA 5KZIA 4ASDA 2G9XA 5CENA 5KNJA 4RVTA 3OW3A 4Y83A 2CGVA 5CZHA 3VNTA 5M51A 4IFGA 2XA4A 3LJ2A 5BUJA 2ZDTA 5FD2A 2R64A 4LL0A 3V5PA 2NO3A 2NRUA 5AUXA 2C6LA 2OZAB 2OFVA 2W4OA 5LXMA 4MXYA 2Q0BA 3BIZA 2ETMA 4UALA 1P5EA 4G31A 3QTWA 5D41A 4DEDA 4NIFA 4ZTRA 1RJBA 2P3GX 4IX5A 4Z9LA 5K4IA 4FEVA 3OUKA 3ORPA 4FSUA 4YZNA 2WU7A 3EQRA 4EUUA 2OIQA 5HX6A 2J0IA 3VBXA 1IG1A 4OUCA 2PVMA 4FOCA 3U4UA 4BZOA 4D5HA 2B7AA 5BVNA 1YDRE 2QODA 4BI0A 5I9ZA 5KZ0A 1YXXA 5L2QA 1YDSE 1PYXA 2OZOA 4A4OA 2PUIA 4ZLZA 3D2IA 2I1MA 3LW0A 4QNYA 2VTLA 4KKEA 1IAJA 2VWVA 3UO6A 3AMYA 4JDIA 3ENMA 4I23A 1ZYJA 4ZSEA 4ANOA 3TUBA 3PLAE 3P7AA 2X81A 3UPXA 3VS7A 5DT3A 4DH8A 3KRJA 4IVCA 4HYHA 2PVKA 3BCEA 4F7SA 2YLEA 1UNHA 1OVEA 4BGGA 2WMXA 4I93A 3FI2A 4EK4A 4TWNA 2NRYA 5HLNA 2RFSA 5AR2A 5CX9A 2W1HA 5G6VA 5C8KA 3FAAA 4B7TA 4TPTA 3D94A 4FZAB 4QMVA 5HBJA 2QURA 3MDYA 5DOSA 3ATTA 1TVOA 2XK7A 4X6QC 3RPOA 1E9HA 3IDBA 1XO2B 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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