5KX8A

Irak4-inhibitor co-structure
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
297
structure length
285
Chain Sequence
TRFHSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLATTEELKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFTAKISDFGLARASEVMRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Efforts towards the optimization of a bi-aryl class of potent IRAK4 inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
total genus 98
structure length 285
sequence length 297
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5kx8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5kx8A01
5AV0A 1Y91A 4YHTA 2HZNA 4A4OA 3QRIA 4F70A 4Y5QA 4Q9SA 2X4ZA 1OI9A 3WIGA 2F7XE 3UVRA 4XH6A 2UVZA 3AC4A 3LFEA 3A4PA 4OTHA 3TKIA 3RM7A 2BHHA 2P33A 3D7TB 5EG3A 5AR2A 2I40A 1FVRA 3JUHA 3NNWA 2YWVA 4QMQA 4K33A 4D2PA 4FIFA 1AQ1A 5DE2A 1IAJA 2WMXA 3I5NA 3A7FA 2ZV9A 2DYLA 4HGTA 3MY1A 5JFWA 4GKHA 1X8BA 3ROCA 2EXCX 2BZJA 4W4XA 5ANEA 4AACA 2OZAA 3CBLA 1AGWA 2RG5A 4E26A 4F7SA 2X7FA 3VS0A 3PPZA 3VUHA 3ZO3A 3BHHA 4JQEA 3I5ZA 1H1RA 4RJ6A 5AP2A 3UIUA 1J91A 2C30A 3A8XA 1K3AA 1TQPA 4QTCA 4EH8A 5KX8A 3L9LA 5M08A 1A9UA 4WUNA 3EN4A 1KWPA 3F6XA 4RJ4A 4YZDA 3TUDA 3MH2A 4WO5A 4AF3A 3VWAA 3L8XA 4XV3A 4DH5A 4L7FA 2ZJWA 3KMUA 3FZPA 3V5QA 3DKCA 1KV1A 4YZNA 3KQ7A 4TWPA 4OBOA 4LMUA 3UG1A 2NPQA 5C27A 3ZLWA 2XB7A 4IMYA 4AP7A 4EYJA 1L3RE 4S33A 1I09A 3OT3A 4FTJA 3EYGA 4AXAA 4FTOA 4GL9A 4BTFA 2XRUA 4TWNA 1OIYA 3H3CA 1YKRA 4FGBA 3VS2A 4QYHA 4AT3A 1P4OA 5IH5A 2ETKA 2JDVA 3OWJA 4IM2A 1BKXA 4USDA 3BRBA 4FIJA 4MTAA 4F6UA 3G5DA 4F6WA 5EQEA 4YBKA 3KXZA 3P86A 5J8IA 5LMAA 2PZPA 3OXZA 1PXPA 1R3CA 4XEYA 4E4LA 4G34A 2O8YA 4BN1A 2YCRA 4YJPA 4MD8E 3G6HA 1ZXEA 3GOPA 5E8YA 3UJGA 2UZWE 5D41A 4D2SA 4PP9A 2FH9A 3DNEA 4XHKB 1WBNA 2X9FA 2C6OA 2ZMDA 5BUJA 2GFSA 3VNTA 4JX7A 3P79A 4M69B 3GBZA 3BWJA 2WQOA 3TV4A 3C4FA 4EK5A 4UZDA 4P5ZA 4IJPA 3DAKA 3QTRA 1UKIA 3BIZA 1AD5A 2W05A 3ZRLA 2QOKA 4EH5A 4H05A 2CKEA 2XNEA 3WF7A 5AP3A 2QO9A 3DBEA 4IM3A 4F6SA 3DK3A 3VS4A 3O8PA 5A54A 3GUBA 4MNEA 5AM6A 5F4NA 2J51A 3TCPA 2C5YA 3PIXA 3TTIA 1WBOA 2FSMX 3E93A 4V0GA 3CKWA 4G3DA 5DR2A 2RFDA 5GNKA 5HORA 4BKYA 5IA0A 1GIHA 3NIEA 4R8QA 4ZTLA 5CENA 4AE9A 4BDBA 4ZTMA 4O7NA 2QR8A 4NFNA 3ZDIA 3ETAA 2YA9A 3OUKA 1DAWA 2C68A 2OSCA 5HBEA 2CJMA 3TZ7A 5BMMA 4YURA 3REPA 4Z9LA 3RHKA 4JDIA 4AZWA 3TIYA 4C58A 4ARKA 1GIJA 3R9HA 4PDOA 2OJIA 4AT4A 2CGUA 4FR4A 4LFIA 4QP7A 3U87A 4MYGA 4BGGA 4C33A 2WOUA 4EONA 5AJQA 3N9XA 4FK3A 5C26A 4UBAA 3LFQA 3QA0A 4G16A 2OJGA 3RPVA 3E5AA 5IA5A 4EWQA 2ZM4A 2WMAA 4AQCA 4A06A 2O0UA 3O8UA 2GQRA 4P7EA 1ZYSA 5M07A 5ANDA 4RX5A 3P9JA 3ORKA 4U0IA 3HDMA 4ANBA 5DEYA 4B99A 5EOBA 4HYUA 4IVAA 3VVHA 4AGWA 4UX9A 5IA3A 2IVSA 5HU3A 3ACJA 2PVHA 3JR1A 1OGUA 1OECA 4G5PA 4QMPA 3N4TA 1HCLA 3SG8A 3PSDA 4M13A 2C6MA 3FC2A 1PW2A 3CTQA 4A7CA 1MP8A 4FTAA 2A4LA 5E1SA 2HWPA 5K0XA 4JRVA 2OH4A 3K3JA 3TN8A 2I0HA 3W33A 5LCJA 2GMXA 4EH4A 2WMTA 3HV7A 2B1PA 2WPAA 5EM5A 1YVJA 3B2WA 4L42A 4J1RA 4IIRA 4C4GA 2PMIA 3GCVA 3MYGA 3L1SA 4U80A 5I9YA 3QQLA 4J98A 2XKCA 4E73A 3EQCA 2XJ2A 2XNOA 4A9UA 4RSSA 3KVXA 3RM6A 5FEQA 1OMWA 4C61A 4QMTA 3PDTA 3EN7A 3CGOA 4G9CA 4ITHA 4GT5A 3WZDA 5CZHA 5IA4A 3NDMA 1WVWA 3MH0A 3ZFXA 4EK8A 2ITYA 4FT5A 4RLLA 5HTIA 4N57A 3QTSA 5EOLA 3EN5A 4XLIA 2YLFA 3R21A 4MKCA 3HAMA 5E4HA 4CG9A 3DAEA 3HVCA 3TZMA 4F7JA 4ANNA 2OK1A 2J90A 2WMSA 5E1EA 5AEPA 5JEBA 3DTWA 4DEAA 4F9AA 3SGCA 4DGLC 4YP8A 4RVTA 2Q0NA 5GZ8A 3F66A 1Y8GA 4HCUA 5IQFA 1J1CA 2BIYA 2J2IB 5D7AA 5EHYA 5CEMA 3OFMA 3ZC5A 4IADA 5BPYA 1Q97A 2BZHB 2Z7QA 4FGRA 2OXDA 3D9VA 3FEGA 3SA0A 2GQSA 2B54A 2R7BA 2DWBA 2BCJA 2YEXA 4W4VA 2OO8X 4CMUA 3OY3A 4BBEA 1UU9A 4UWYA 1PXMA 4NYEA 5HD7A 1WFCA 3KMWA 5EW8A 3NW6A 2IW6A 5D1JA 3MY0A 4B4LA 4Y73A 2BFYA 1OKWA 4ANSA 4CMTA 5HLWA 5I9ZA 4ACCA 4XS2A 3V5WA 3BCEA 3KVWA 1CSNA 3GC9A 3GQLA 3V51A 4ZJJA 3ORMA 1ZYDA 3PIYA 3MIYA 4TT7A 1APME 4U41A 5AR7A 4GYGA 5ETCA 5LQFA 1E9HA 3OWLA 5CTPA 2E9VA 4ASXA 4JQ8A 4M69A 3WYYA 4KIPA 3FXXA 4DC2A 2UZDA 2CLQA 3A99A 3AC8A 1FPUA 4EOMA 4I5CA 2W1DA 3DCVA 4PTGA 4O0RA 3CY2A 4EEVA 2G9XA 2GNGA 4NIFA 4E5BA 5JH6A 3R1NA 4I23A 3R7VA 3CSVA 1TQIA 2WELA 4N4SA 2JD5A 4KIKB 1V0PA 2R3RA 3BGQA 2B53A 3OT8A 3V5TA 3QCQA 5HX6A 4ZK5A 5AWMA 4E7WA 2YCQA 4PMMA 2C0OA 4FZAB 4G31A 1A48A 2IVVA 4C0TA 3V01A 3Q9YA 4YTFA 5L2IA 3CQWA 4PL5A 2DQ7X 2R64A 3IDPA 3BYSA 4NKSA 3ALNA 4YO6A 5CF4A 3NZ0A 4D4SA 2WQMA 3NNXA 5CXHA 2W17A 3G0FA 4FTKA 4L3JA 4BR3A 1O6LA 2ERKA 2HWOA 3EQRA 3FSKA 3GU4A 4G6NA 3ZM9A 3RAHA 5EYDA 4AGDA 4Z16A 1PYXA 4FSQA 4QMMA 4NU1A 4DT8A 3ROYA 5HGIA 5IQIA 4YHFA 2G2FA 1GZNA 4FSWA 1YDRE 4AZFA 3U4WA 4BC6A 5EM7A 5KMJA 3SKCA 4BTJA 2ZMCA 4MAOA 3QKMA 4IWPA 2RIOA 4YJUA 5M4UA 4JIAA 2VWYA 1FMOE 2G15A 4IZ7A 5F20A 1SNUA 3QAME 5EM6A 2Y6OA 5E8XA 3TV7A 3PRFA 4ANQA 4PF4A 3AD5A 4CRSA 3C0HA 3O7LD 4YJOA 5CEIA 3MFSA 1OKYA 4NSTA 5HTBA 4GKIA 4O83A 5C1QB 2PK9A 3RCJA 2XJ0A 4JI9A 4MEDA 3F7WA 3F2NA 3SXRA 2X2KA 3RKBA 2ERZE 1NVSA 2C6TA 1W7HA 2XK7A 3MB7A 1XBBA 3EJ1A 3O51A 3H9FA 2JFLA 3JY0A 4AX8A 4I24A 3AT2A 1CKJA 2PZYA 2UW7A 3DY7A 4FKPA 5FD2A 2R3QA 3KK9A 3C9WA 3UPXA 5CF5A 1EH4A 3LPBA 5DRBA 3TTJA 3DNDA 3QXOA 4DGGA 1JKKA 2EXMA 3OTVA 2YM7A 2UVYA 4KIQA 4OAVB 3Q2MA 3RI1A 3AD4A 3LXNA 1Q3DA 4ORKA 3SOAA 1ZMUA 4CFXA 5T6KA 3AXWA 3W2CA 4O7LA 3DLSA 4ZY6A 3PY0A 3QX2A 4BCOA 3U54A 4IM0A 4RC4A 4UZHA 2FA2A 4FEQA 4JDKA 4DEEA 2UW4A 5CWZA 2R3GA 3C13A 2B55A 3EOCA 2AC5A 2W99B 3PXZA 4O38A 3FLSA 2F2UA 4PRJA 3UG2A 4IVCA 3H4JA 4MWIA 5CEOA 4FV7A 3ZSIA 3G9LX 2YAAA 4IJ9A 2NP8A 4ZTSA 3FWQA 2WQEA 2FO0A 4KWPA 2O3PA 4M0YA 5TT7A 5CSXA 2X7OA 3FY0A 2XNMA 4FG9A 2ITUA 1J3HA 4QP6A 4JBQA 3LLTA 4YTHA 2OXYA 4YJQA 2A2AA 1UVRA 3RNIA 5CVHA 3R22A 2NNWB 2VO0A 2X6DA 1U59A 3BQCA 5KE0A 3A4OX 5HLNA 2Z2WA 4RWLA 3MBLA 5E92A 2VWIA 4O96A 3PYYA 2QG7A 3UNKA 3LXKA 3C4CA 1Q99A 5IEXA 3DKFA 3PVGA 3RAKA 3LLAA 2ESMA 4EOQA 2VTMA 3SHEA 3KXMA 3F2RA 2R3MA 4MBLA 3P23A 4BL1A 3A2CA 3CQEA 3LFBA 4IZAA 3U9CA 1ZYJA 3E7VA 3ZLXA 3ERKA 3F88A 4FOCA 3KXHA 4N6ZA 3NUSA 4O6LA 4EQCA 4FKTA 3CP9A 1W8CA 1JWHA 2DUVA 2GCDA 3MN3A 4YSMA 4B7TA 5L6WL 5A4CA 2Z60A 2WEIA 2YHVA 2W7XA 4LOOA 4RT7A 5CSPA 2WKMA 3FKOA 3OWPA 5A4QA 1STCE 1KE7A 3Q4UA 3FXWA 4DGNA 3GVUA 4FTCA 5FBNC 4BCNA 2VWUA 3D83A 2HIWA 5FEEA 3TACA 1G3NA 2WTCA 3DGKA 4KS7A 4F0GA 4MBJA 4O82A 4BWPA 4WSYA 3EQGA 1JVPP 2HELA 4O0WA 5DG5A 2QOCA 3HGKA 2LAVA 4RX9A 5JKGA 3D2IA 4NUSA 4WBBB 4KIKA 5L8LA 3VS1A 4FKWA 2O2UA 5DT4A 4BKJA 1OL2A 1UV5A 3POOA 3ZEWA 4DE4A 3RBWA 1VEBA 3IPHA 4TY1A 2BRBA 4F9CA 4IAYA 3PE1A 4R5YA 5EYCA 3UO5A 4AW2A 3GCQA 4XBUA 4D0XA 2YIQA 1OL1A 3OBJA 2G1TA 3PVUA 5LOHA 1GIIA 2JDOA 4R7IA 4F1TA 4FBXA 5FP5A 2IZSA 4AW0A 2BRNA 4GFMA 4FMQA 4HNFA 4YGAA 3B8RA 3KGAA 1Q8TA 1YXXA 3QLFA 3EIDA 5BX0A 4U44A 3OBGA 4AOJA 4I92A 3ORXA 2B7AA 3ZFMA 2QONA 4Y83A 4G2FA 3DQXA 4CNHA 4JBVA 3KXXA 4BDGA 4RVKA 5M56A 1VR2A 4XG6A 2C6DA 2B9FA 5CANA 4I5PA 3LIJA 5TF9A 4AGUA 2JC6A 3AMAA 4DG0E 5HBJA 1H00A 4K8AA 4NT4A 4ZTNA 3DKGA 3DV3A 4IWDA 5FUTA 3GP0A 4BHZA 5GIPE 4IC8A 3HKOA 4LMNA 3TKHA 2C6KA 3I7CA 5EFQA 2PVFA 4D4YA 2C3JA 2WU7A 3QU0A 4EOJA 3UPZA 3QD3A 3KXGA 2WTVA 4OGRA 2J9MA 3DA6A 2W1ZA 1DAYA 3GEQA 4A4LA 4D28A 3VUKA 4M15A 3WYXA 5LMKA 3K5VA 3NYNA 3DS6A 3BKBA 5AM7A 2VTLA 2XYNA 3C4WA 5AIKA 5AP6A 3UIBA 4BFMA 2OIQA 3QTWA 3DZOA 4AN3A 2WD1A 5CYIA 2FYSA 3NMUF 4BI2A 2VX3A 2NRUA 3S95A 5JRQA 2VGOA 3JXWA 4H39A 1ZOGA 4MNFA 3E8CA 4FUXA 2XKEA 4BDFA 4AN2A 4BI1A 4DAWA 5DT3A 3HEGA 3CY3A 4I22A 5AUVA 5HVJA 3RNYA 4IWOA 1LR4A 4IVDA 3WZKA 2UZOA 5M06A 4O86A 4QRCA 2QOLA 3AC5A 4O0TA 1H25A 4FT0A 2XNNA 3TIZA 2W96B 4FIIA 3IDBA 3LZBA 4YC3A 1JKSA 3RVGA 3VULA 3W2SA 2QC6A 3KL8A 4KNBA 3ZZWA 2JIVA 5IH6A 3EYHA 4C62A 5J9ZA 3UODA 1DM2A 5IQAA 1F5QA 3BYMA 4AWIA 3QC4A 4WIHA 2PZRA 2X2MA 4Y46A 1H1WA 4G5JA 4AA5A 3SXSA 4Z55A 4J7BA 3SXFA 1OPJA 4AA0A 3GC8A 2CKPA 4JVGA 4S31A 3JPVA 2VV9A 3DTCA 3GC7A 5BQ0A 4WRGA 5J5TA 2W1EA 3IW6A 3ODYX 5AUZA 4ASDA 4DH8A 4F64A 3LCKA 2OZOA 4J96A 4DH3A 2E9NA 1GOLA 3QKLA 3P1AA 3FC1X 3C50A 1PMUA 5GJDA 4MK0A 2PE0A 5HESA 4IAKA 3UIMA 3HP5A 4V01A 3NW5A 3R7UA 1KSWA 5FXQA 4MXYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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