2GNGA

Protein kinase a fivefold mutant model of rho-kinase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
340
structure length
338
Chain Sequence
EQESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTIGTGSFGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYMPGGDMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIKVADFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Bos taurus
publication title Structural analysis of protein kinase A mutants with Rho-kinase inhibitor specificity
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit
total genus 108
structure length 338
sequence length 340
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2006-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2gngA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2gngA02
3O8UA 3F61A 4TYJA 2J5FA 2EXCX 3PJ8A 4FSMA 5FP5A 5IA3A 2OF4A 1M7NA 3QQLA 2WMWA 3LCDA 4I6FA 3D9VA 3VAPA 2GQRA 2UZUE 2R7BA 4FYNA 3GBZA 3OTVA 4IC7A 2WGJA 2RFNA 3UP2A 4A9UA 4NZWB 4AW0A 5J9LA 4PY1A 4OTIA 3U6IA 2B55A 5M4CA 4LMNA 3F2NA 4P2KA 3OXTA 4BKYA 3EL7A 3OFMA 3EFJA 3EN9A 4X2KA 3F3WA 3FKOA 5JFXA 5M44A 4DFBA 4FUXA 2W1FA 3CBLA 4ZTQA 5AEPA 2IG7A 2HENA 2HK5A 4GYGA 4Y8DA 4BDKA 3HV5A 5GJDA 4U0IA 4XG6A 4BYIA 2C4GA 1E1XA 1JQHA 3LQ3A 4NIFB 1YXUA 3GC8A 2FGIA 3R7IA 3NVKI 3QRKA 3FLYA 4OTWA 4IMYA 3B2TA 4DFLA 4EHZA 3ODZX 5M4UA 4JAJA 4I21A 4OTDA 4Q2AA 5EOBA 4DGMA 2WTIA 1OPJA 2OKRA 4H58A 4MBJA 4QMOA 5HE0A 4EKLA 3MPAA 5AAGA 3DJ6A 4BDFA 4KIQA 1FVRA 1UWHA 2B54A 4RFMA 4QMLA 3OCBA 3UBDA 4IIRA 1AD5A 3DY7A 5HVJA 3O0GA 2Q0NA 5ACBC 4AN9A 3TM0A 2DYLA 5LVNA 2HAKA 5JFVA 4K8AA 4IBMA 1G8SA 3Q9YA 1IRKA 4JT3A 1PMUA 4UYNA 4FZDB 3R7YA 2VTMA 4N0SA 3PXQA 3AGMA 2C1BA 2YM4A 4I20A 4AT4A 4O6LA 4YLJA 4Q9ZA 4ZAUA 3F88A 4YTIA 4AP7A 4GS6A 2IVUA 5CEMA 3ZLSA 4XV1A 2VWWA 1PXIA 3R9RA 4C02A 3EQHA 4U45A 4FGRA 5CAOA 3LJ1A 4NJDA 4QOXA 4X2FA 4KWPA 4MXOA 4OR5A 3VBQA 4H36A 2P4IA 1WCCA 3SG8A 4K1BA 3W18A 1FGKA 2BTSA 5AP6A 4ZLZA 4YC6A 2V62A 3D2IA 4I92A 5EW8A 4O7ZA 3PE1A 4J1RA 4IVAA 4NM3A 3KXMA 2G15A 3GFWA 3BU6A 4O83A 4XHKB 2CNQA 4YURA 1M2PA 1RDQE 3UO5A 5ETCA 5FD2A 4DA5A 4FF8A 3R9NA 3PSDA 3FSFA 5L6PA 3NVMB 4UWYA 3I6WA 4NM0A 3OG7A 5ETIA 3IONA 3MWUA 3UGCA 3UPZA 1U4DA 1JSVA 4JG6A 4WRSA 4BCIA 3VHKA 3TDWA 5HG8A 5CEQA 4PDYA 1W7HA 2OZAA 2XK3A 5E8ZA 2CGWA 3LM5A 4CMTA 3NW7A 3CKWA 2X2KA 5FWKK 3R00A 3TNWA 4FKVA 3BYMA 2EB2A 3PIYA 2PVYA 4GFMA 3OMVA 5KMNA 3G15A 5HVKA 3AD4A 3BHYA 3SX9A 3UYSA 1LPUA 4CCUA 5IH6A 4E6AA 5LQFA 3R7UA 3V01A 4IFCA 3H30A 3P0MA 4I5PA 4I93A 3VRYA 2ITPA 3QTWA 3GUBA 1KV2A 3CE3A 3C5UA 4I6HA 3S3IA 3UODA 5CU0A 3LFFA 1ZYCA 5CU2A 3QUDA 2YM8A 5CVHA 3SC1A 3SHEA 5J5TA 2JC6A 3UOHA 1W0XC 3R0TA 3ZH8A 4W8DA 3GU7A 3A60A 4I5HA 2R0IA 4EORA 3UQCA 5EOLA 4PPBA 2CCIA 1Q3WA 4FOCA 4RZVA 4BWXA 3PJCA 5M4FA 2VGOA 3T9IA 1U54B 2Z7LA 3NUNA 3QF9A 4IXPA 5IA0A 2HW6A 4DEIA 3QTQA 5DRBA 3GVUA 1YW2A 2RG5A 4OT5A 3EN6A 3R1NA 4QMTA 3IK3A 4BL1A 1M2QA 5IG1A 3ODYX 3Q6WA 4RA4A 3Q3BA 1CKIA 5K0KA 2J5EA 2UZEA 4L67A 4DHFA 2QHNA 4FKRA 4BDAA 4CLIA 3R7GA 2UZLA 3KXGA 5TOZA 4G1WA 3AD5A 5J79A 3TXOA 4AGUA 3PY1A 3W2QA 2O5KA 4AW5A 4BICA 3PA5A 3BV3A 2HWOA 5KCVA 3A8XA 2QOCA 4QTDA 2IN6A 2F7EE 2FA2A 4L3LA 4R3PA 4FKPA 4XNEA 4FNWA 4IVBA 3W10A 3ZEWA 2OXXA 5DN3A 4CEGA 2B0QA 2J0MB 3L8SA 5HLNA 4K2RA 4XP3A 4NH1A 2YIXA 3OXZA 1PF8A 3NW6A 4IWDA 4EK3A 4FEXA 4BF2A 2WZJA 4IVDA 5A3XA 4TN6A 4GUEA 1OB3A 4Y85A 2XIKA 4KNBA 4RJ5A 4I23A 3DPKA 3RMFA 2AC3A 3JUHA 3AMYA 1DI8A 1J7IA 4F1OA 3F7ZA 3II5A 5HQ0A 2KTYA 3ERKA 4JX7A 2UW5A 3MA6A 4N6ZA 4L53A 3B2WA 3QRTA 1YKRA 2GNGA 4NU1A 5IQIA 4DLJA 3U55A 5CQWA 2XIZA 4WNOA 2CGVA 3TKIA 2HXQA 1APME 2UVYA 3IW6A 1WVWA 2H8HA 3COMA 2XNGA 4EOSA 3OCGA 3Q4ZA 4KKEA 4Y83A 4J53A 4EOKA 3QRJA 3VBVA 2KULA 4YPDA 2XA4A 4DEAA 3FY2A 3NZ0A 1BL6A 3ZRKA 2YIRA 3QCSA 3HRBA 3TT0A 4AOJA 4FEWA 1BUHA 3BHHA 4C4FA 4D55A 3NDMA 3N4UA 4O86A 4BRXA 2X6EA 5IQEA 4XS2A 2NP8A 3LCKA 3O96A 4TYHA 4XG8A 5JK3A 4O7TA 3PJ1A 3FLZA 4DEBA 3MFSA 1H25A 2GTMA 4R3RA 4D9TA 2VTPA 4E4MA 4EH8A 3FQSA 4TPTA 1FQ1B 3GB2A 4EOJA 2BIYA 1YHSA 4PV0A 4IC8A 2UW4A 2YDJA 4RX7A 4P5ZA 3R63A 4DYMA 4O7RA 5HO8A 4PDSA 4UY9A 3VQHA 5JGDA 4GK3A 2BIKB 4X7QA 1VJYA 4Y73A 4FVPA 4F70A 2GS2A 2P2HA 4HPUE 4AA0A 3MDYA 4FTIA 4QMNA 2JDVA 3U8WA 2ZB1A 4MXZA 4A7CA 4MXXA 3IOPA 4QPMA 3F3ZA 2PUPA 2R3MA 2GFCA 4QPAA 4B99A 2UW3A 1DAYA 4ZJJA 4IM3A 4RLLA 1KSWA 3BYUA 4MF0A 2HZ0A 4TRLA 1UNHA 3MH2A 4D4SA 4E5AX 2X8IA 2GTNA 3TNHA 3ZFMA 3CLYA 4AS0A 5JSMA 3EQDA 2XNPA 1JKTA 2C1AA 3LQ8A 3MVMA 1XKKA 4LOPA 1Q5KA 1TKIA 3FI2A 3NLBA 4P4CA 3R2YA 3VF8A 3WYXA 1P14A 4BCOA 5KMJA 2XNBA 3UNKA 2WD1A 5ETAA 3PXRA 3ZFXA 3AMBA 3H4JA 4W9WA 5BPYA 5CZHA 3VULA 4CRLA 4OT6A 3KVXA 2XUUA 5CVFA 4WA9A 5HBJA 2JKKA 2PVNA 4S30A 5HCYA 4RA5A 3PG3A 4EONA 3LFCA 4FNXA 4L00A 3DXNA 3POZA 3U6HA 4ZSGA 5CU3A 1XH9A 4E73A 3T8OA 3CKXA 5I3RA 3PE2A 1FOTA 4PMPA 3PJ3A 1CKPA 1PXKA 4NL0A 2OZAB 4D58A 3AC5A 3UMXA 1H26A 3F5UA 2JFMA 3L1SA 3BGPA 3A7IA 4HYIA 5FEEA 3NUYA 4AX8A 2QKRA 4YHJA 2PY3A 4I4EA 1S9JA 4LRJA 4XUFA 5JMSA 5FTGA 4M14A 5EYMA 4L44A 4C2WA 5A9UA 3JR1A 2C0IA 4FKJA 4QYYA 4XCUA 3R9DA 3MB7A 1H1RA 3IG7A 4UEUA 2Y4IB 3KB7A 3MN3A 4G17A 4N6YA 5CLPA 5E92A 3SKCA 1SNUA 2OFVA 3C4XA 3QTUA 3TG1A 3AD6A 1Q97A 2Y4IC 3W55A 2YERA 4XOYA 1RQQA 2I6LA 4MNEA 2VTOA 3C0IA 2R3PA 3HDMA 4NKAA 4W8EA 2ITOA 3D2KA 5AWMA 4F9AA 3PLAE 4TYEA 3ORXA 4C58A 2CLQA 1YXXA 2JKMA 1H1QA 3NCGA 4WD5A 4ZOGA 4CQEA 2I1MA 3OOGA 4C61A 4QMZA 3U87A 3V6RA 4K6ZA 4EZ5A 3QWJA 2YM6A 4QQJA 1E1VA 1ND4A 4LRMA 3PVGA 2YEXA 2J0LA 2QG7A 4YLLA 2WTKB 3KXHA 1JAMA 3FQHA 4L46A 3QD0A 4MK0A 4L8MA 4J98A 2WTDA 2WTKC 1U46A 2B53A 3PDTA 3QKMA 4JG8A 5IQGA 3JPVA 2VWXA 1Z9XA 3PSCA 2WTCA 3QRIA 4KSPA 3DBFA 5CSWA 3WZDA 2W5AA 5L2TA 5AFVA 3RPRA 5AIKA 4PNKA 5JEBA 1PKGA 5IPJA 5BYZA 3HA6A 4ZIMA 2YDIA 3OT8A 4PL3A 4MD7E 3JVSA 4FKUA 3COIA 3FDNA 3GFEA 3OZ6A 3F3TA 4CMOA 4PUZA 5I5ZA 3EQCA 4X6RA 4CGAA 2VN9A 4EOLA 4D4VA 3C50A 4X2NA 3ZO3A 3ROYA 3W8LA 5GZ8A 2PUNA 3EFWA 2XK4A 1DS5A 4DINA 3MFTA 3ENHA 3QLFA 4G5JA 2PYWA 2PVLA 4ZS0A 4FTCA 4OTFA 2F2UA 2OO8X 3MTFA 5CX9A 4XYFA 4UMPA 3DK6A 3RVGA 2ZM1A 2WMBA 4RJ7A 2JDSA 3E63A 3DNDA 3OCSA 4QMQA 2C6DA 1P4FA 2HZ4A 4YZBA 2WMTA 4FE2A 5E9EA 3FZPA 4JJRA 2VTIA 3QD3A 3K54A 4ZK5A 5CAPA 1XH8A 3OD6X 3R02A 4IVCA 2ITNA 2QCSA 3O71A 4UMRA 2PZYA 4LGHA 1MRVA 2WFYA 4FSYA 4LFIA 3TV6A 3NYXA 1WMKA 3DKCA 3KMWA 4YSMA 3ZO1A 1G3NA 2V7OA 5GJFA 4E6DA 5CS6A 2XNMA 5GNKA 3P08A 5EKNA 3BLRA 2QOQA 2PVRA 4O6EA 2E9NA 2GHMA 4L68A 4GT3A 2XB7A 4I5CA 4NKSA 4D2PA 3EJ1A 4TY1A 5J8IA 3WYYA 5CZIA 1KE6A 1B38A 2QONA 4O22A 5AUWA 4CFUA 3IW4A 2BZHB 3LZBA 5D41A 3BU3A 5T6KA 3EZVA 3VUDA 4D4YA 3BQRA 2NRUA 4RJ8A 5DRDA 4X2JA 4IH8A 2WAJA 3KFAA 4GG5A 4F65A 3D4QA 3I6UA 3Q96A 4K18A 5T68A 5L3AA 3ZZEA 4OTGA 4TYHB 4NFNA 4BR3A 3EYGA 3I0OA 3OT3A 5KHXA 4G31A 4O0WA 4FV1A 5BQ0A 1SNXA 5J7BA 2CNVA 3HLLA 5ETFA 4E93A 2A2AA 1A48A 3ORMA 1PMEA 2EXEA 3QC9A 5BUIA 5JH6A 3A2CA 4HW7A 4AXAA 5E8UA 3PLSA 2XMYA 1A9UA 3DXQA 4DE4A 2E2BA 5FLFA 4R7IA 4CRSA 4D5KA 5TKDA 1XWSA 5HIEA 5M57A 2UW8A 2IZSA 2YZAA 3K5UA 3D7ZA 4YLKA 5FM3A 3F5XA 4C59A 4QYFA 1XH7A 4WOVA 4M97A 3IO7A 2O3PA 3DCVA 1CDKA 2IVTA 2ZV7A 3AXWA 3BU5A 4ACCA 3LFBA 4CD0A 2BKKA 4PQNA 1R3CA 2Y0AA 2ZV9A 5HNGA 4CG8A 1Q61A 1H1SA 2WXVA 3B8QA 2W1CA 1J1CA 2I0YA 4CYIA 5G1XA 2RIOA 1R0EA 4BDJA 4DGOA 5BVWA 3FLWA 5M56A 4O0SA 3ZLWA 4D2VA 4FV5A 1J7LA 4ANLA 5LWMA 1Y6BA 2GNLA 2ZM4A 3BPRA 2X2MA 3LW0A 5L6OA 3I4BA 2W05A 1OZ1A 3KRLA 3CJGA 5K3YA 2PL0A 2OK1A 3QYWA 4UZDA 3JY0A 2AC5A 1R0PA 2WEVA 3CJFA 4IEBA 1ERKA 1WBVA 3M11A 3ZU7A 1YXVA 4ORKA 1H8FA 1OUKA 1U5RA 4WT6A 2UZTA 3OUKA 4HPTE 4RSSA 1NXKA 3F2AA 1OVEA 4LUDA 1L8TA 2WMVA 3R1QA 3EL8A 2VUWA 2PE2A 3O7LD 2ACXA 2B52A 2Q0BA 3DT1A 4ZTHA 4EYJA 2J2IB 3TZMA 2CHLA 3VJOA 4YBKA 2XM9A 4FT0A 4J95A 2IZUA 2VWZA 4N4SA 2ETKA 5H8GA 3MB6A 4ITIA 5BNJA 1QPEA 3ZEPA 2BTRA 4ZMFA 4PPCA 2QURA 2PVFA 1OITA 3I5ZA 4AZTA 2YCFA 1QCFA 4ZP5A 3OY3A 4GG7A 2JBOA 3CS9A 4S34A 2UW7A 1YWVA 2V22A 2WB8A 1YDRE 3ETAA 4IZYA 2G9XA 4MNEB 3OBJA 3UO4A 2R2PA 4FT3A 5AADA 2ZAZA 3ATSA 3FI8A 4OW8A 5IQHA 5BVFA 5EQEA 3VRZA 4O0RA 4CV9A 3O51A 4F1TA 4JI9A 4TXCA 3B8RA 1H07A 4R3CA 4EOIA 5I3OA 4HYHA 2BHHA 2GPHA 4LL0A 4ZTNA 2W4OA 4LI5A 1Q8UA 5CVGA 4ANSA 2Z02A 3MA3A 2QG5A 4EEVA 5IISA 3FYKX 2UZBA 5H2UA 4D2SA 2IVSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2VNW A;  3UNZ A;  1GZK A;  4O0T A;  4DFN A;  3AT4 A;  4DGL C;  4EOP A;  3Q53 A;  2BAJ A;  3KUL B;  3OEF X;  3G51 A;  3VC4 A;  4F9C A;  5AP7 A;  3SXR A;  4PTE A;  4BCQ A;  3FMJ A;  4FZA B;  5AND A;  3ZON A;  5FXQ A;  2QQ7 A;  1R78 A;  3I5N A;  3TDV A;  3D15 A;  3KA0 A;  1KE8 A;  4PX6 A;  4RJ6 A;  5AR7 A;  3LKM A;  1BL7 A;  5IME A;  2WQN A;  4DTK A;  3NR9 A;  3UZR A;  4YO4 A;  5C4K A;  3KVW A;  4FMQ A;  1U54 A;  3R28 A;  1KOA A;  3V8T A;  2R9S A;  4D1X A;  2V5Q A;  3R8M A;  5T3Q A;  5HOR A;  4BCM A;  3BWJ A;  2OWB A;  2PML X;  2ZDT A;  2F9G A;  5CXH A;  5D10 A;  5H8B A;  5ACK A;  3SXS A;  3C0G A;  2UV2 A;  3ZHP C;  4ANM A;  5E8Y A;  4BBE A;  3KU2 A;  4QQT A;  5A4Q A;  4DBX A;  4G3E A;  3A7F A;  3OCT A;  2VTH A;  4UB7 A;  3H9F A;  3SQQ A;  2B9F A;  4ZTS A;  2W0J A;  3C4C A;  4IWP A;  3IDB A;  3AG9 A;  4XRJ A;  3KRJ A;  4LOQ A;  3N51 A;  2C5Y A;  3QA0 A;  3Q4T A;  5IMX A;  3NUA A;  2VTJ A;  2ERZ E;  5EYK A;  4ZSE A;  3FY0 A;  5AX3 A;  3TCP A;  1JSU A;  4RG0 A;  5AUZ A;  4ANB A;  4B0G A;  3BCE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3O8U A;  3F61 A;  4TYJ A;  2J5F A;  2EXC X;  3PJ8 A;  4FSM A;  5FP5 A;  5IA3 A;  2OF4 A;  1M7N A;  3QQL A;  2WMW A;  3LCD A;  4I6F A;  3D9V A;  3VAP A;  2GQR A;  2UZU E;  2R7B A;  4FYN A;  3GBZ A;  3OTV A;  4IC7 A;  2WGJ A;  2RFN A;  3UP2 A;  4A9U A;  4NZW B;  4AW0 A;  5J9L A;  4PY1 A;  4OTI A;  3U6I A;  2B55 A;  5M4C A;  4LMN A;  3F2N A;  4P2K A;  3OXT A;  4BKY A;  3EL7 A;  3OFM A;  3EFJ A;  3EN9 A;  4X2K A;  3F3W A;  3FKO A;  5JFX A;  5M44 A;  3ML1 A;  4FUX A;  2W1F A;  3CBL A;  4ZTQ A;  4DFB A;  5AEP A;  2IG7 A;  2HEN A;  2HK5 A;  4GYG A;  4Y8D A;  4BDK A;  3HV5 A;  5GJD A;  4U0I A;  4XG6 A;  4BYI A;  2C4G A;  1E1X A;  1JQH A;  4O4B B;  3LQ3 A;  4NIF B;  1YXU A;  3GC8 A;  2FGI A;  3R7I A;  3NVK I;  3QRK A;  3FLY A;  4OTW A;  3NFG B;  4IMY A;  3B2T A;  4DFL A;  4EHZ A;  3ODZ X;  5M4U A;  4JAJ A;  4I21 A;  4OTD A;  4Q2A A;  5EOB A;  4DGM A;  2WTI A;  1OPJ A;  2OKR A;  4H58 A;  4MBJ A;  4QMO A;  5HE0 A;  4EKL A;  3MPA A;  5AAG A;  3DJ6 A;  4BDF A;  4KIQ A;  1FVR A;  1UWH A;  2B54 A;  4RFM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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