4BWKA

Structure of neurospora crassa pan3 pseudokinase
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
412
structure length
392
Chain Sequence
PKDRRENLQKKLFHMQQLLPNSGLPNLDRWHSLFPLDTKATRNSTCFGYPSWMYKAQNNKNGRHFALRRIEGYRLTNEKAILNVTKEWKKIINANIVTVHEAFTTEFFGDSSLIFVYDFHPLSETLYDHHFPPNKIPENLLWSYVCQIANALLAIHNAKLAARCLELSKIIWENNRIRLAACSILDVLHHDSPNRKTIEELQQEDFVKFGRIILALATNTPTLNFNNIDAALATIVPRYSTQLRGVLEWLIKPSAPGETKTVETLLGGITTHLANFANFVMQESDEKEFHLMRELENGRIARLMFKLSVVNERETGERLLLKLFRDYVFHQVDADGKARLDTNHYLNCLSKLDASSEEQILLTSRDNATVFVVSYRSIRQMLDRAYGELGKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Gene regulation
source organism Neurospora crassa
publication title Structure of the Pan3 Pseudokinase Reveals the Basis for Interactions with the Pan2 Deadenylase and the Gw182 Proteins
pubmed doi rcsb
molecule keywords PAB-DEPENDENT POLY(A)-SPECIFIC RIBONUCLEASE SUBUNIT PAN-3
total genus 108
structure length 392
sequence length 412
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18101 Pan3_PK Pan3 Pseudokinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4bwkA01
2ZV9A 1I09A 2O64A 2VGOA 2W1HA 4HCUA 1GOLA 1XJDA 2WTCA 3MVMA 4JBVA 2W1DA 5DR6A 3QGYA 2I0EA 3FLNC 5K0XA 3PWYA 2BZKB 4ZAUA 4BCIA 3C4XA 2GNHA 4HCVA 4ANLA 2VGPA 3V3VA 2WTKC 3FI4A 3NYNA 4JDKA 4E26A 5GHVA 3ZFMA 2OFUA 3SV0A 2ERKA 4BFMA 2QVSE 4EOPA 3C0HA 4BHZA 2GHGA 2RIOA 4Y83A 4CYJA 4RWJA 5FP6A 3RWPA 5L3AA 2W1ZA 4KINA 4F64A 4UBAA 4GJ3A 4ZSEA 5J79A 5E1SA 5HD7A 4EOSA 2OIBA 4EHEA 4ASDA 3JVSA 5FP5A 3UYSA 3ORIA 2X4FA 4PF4A 4QMYA 5DHJA 3VBWA 5AX3A 3K5VA 3QKKA 4B7TA 3EQIA 4L68A 4DEBA 1YW2A 2PSQA 4PL3A 2ZJWA 4UY9A 5E8UA 3R7UA 5B0XA 3FWQA 1SNXA 4EHGA 5CSPA 1VZOA 1M17A 1CSNA 1Y6BA 5CI7A 1Q3WA 2HY81 3R1NA 4MXCA 1LP4A 3LFQA 3WE4A 2UZBA 3ULZA 2QU5A 3SKCA 2RG5A 2LGCA 2XS0A 4G1WA 4J7BA 3LMGA 1ZMUA 3RJCA 5CEQA 3KMWA 2V22A 3TNWA 4EORA 3HP2A 3UQGA 2WOTA 2PE0A 5EYKA 3R9OA 2PZYA 3NWWA 5AUVA 3VRZA 5CEPA 4CTCA 2XCHA 3QX2A 2IZTA 4YJVA 3NLBA 4R3RA 1H26A 2UZOA 4R5YA 3C4FA 2GNFA 3EJ1A 1QMZA 3UVQA 3ZDIA 2WMTA 4M69B 4BZDA 4JIKA 2FSTX 5BPYA 2WEVA 3UP2A 3L1SA 3D14A 3VQHA 1BUHA 4P4CA 3FMJA 1Y6AA 3AC5A 2GS7A 3I5ZA 1STCE 4JJRA 4NTSA 3QQUA 3L8PA 3ET7A 4LL0A 4MWHA 1NA7A 2QQ7A 3QTQA 2P55A 5F20A 3THBA 4AE9A 4BCMA 1YVJA 2ZV8A 4F9WA 2PVLA 3FZPA 4Q9SA 3O8TA 4JQ7A 5CAOA 4X7QA 1LR4A 3P7BA 3WF9A 3NYXA 2VWUA 2XA4A 3OZ6A 5CX9A 2Y4PA 4LQMA 4L44A 4M66A 3BWFA 3CXWA 4YSJA 3MGYA 4OTQA 4DG0E 4Y8DA 3TNHA 2JLDA 3GUBA 5HIDA 2XYNA 4JAJA 2YDKA 1P14A 3B2TA 2V7OA 5CLPA 5L8KA 4FNYA 4UALA 3E8NA 3ENHA 4JBPA 1PYEA 4I20A 5EOBA 4Q9ZA 5BVEA 4D2WA 2YLEA 3IGOA 3BU3A 2O3PA 3FSKA 3MPMA 4UMPA 2BUJA 3OG7A 4G34A 3ZC6A 1FQ1B 4BZOA 5CAVA 4C8BA 5IG1A 3AD6A 5HO8A 3FYJX 2YM3A 3FXWA 5LMAA 5C8MA 5FM2A 4GG7A 5AM7A 5LCJA 5CVHA 4GUBA 3R21A 1IASA 4I23A 2O5KA 5HIBA 3UO6A 4AGCA 4AZEA 5I3RA 4D4YA 2G2IA 3HV7A 1JPAA 3FLQA 2Z7RA 4FV8A 3FC2A 4U3YA 3LXKA 3ZSIA 5I9YA 4ZJJA 3DBFA 4BL1A 2PMLX 5HX8A 5IDNA 1M7NA 3UPZA 3DGKA 3W18A 4WBBB 5FEQA 2ZDTA 3GC9A 3RPOA 3AQVA 4QPSA 3QTIA 3PY1A 3EZVA 4X21A 5T3QA 3BQCA 3QLFA 5LVLA 2R3MA 2XRWA 4MNEB 2VTNA 2VTOA 5EH0A 3JY9A 4FTUA 3PG3A 4APCA 5E1EA 5DRBA 4HVGA 2ZDUA 2YA9A 3O51A 4LG4A 3BE2A 5J7HA 2IW8A 3HNGA 4IFCA 5J9ZA 4EH4A 2ITZA 5HTIA 3CGOA 3POOA 4IAZA 3VHEA 5ANDA 5J8IA 4E20A 4Z3VA 4FBXA 3ACJA 3VO3A 5F95A 4EUTA 1V0BA 2J0MB 4ACHA 3P7CA 5LJJA 3OTUA 3MN3A 3UC3A 4RFYA 4G6LA 4RLLA 3RP9A 5BMMA 3CY2A 3QQHA 3S00A 3ALOA 3NPCA 3OCBA 1MQ4A 1KWPA 1YHSA 4JAIA 5CF4A 2CGUA 3TKHA 2Z7SA 3QYZA 4CNHA 3R1SA 4TYJA 3CC6A 3ZMMA 3V8TA 2W4OA 4AGUA 2O0UA 4IDTA 1DAWA 4S32A 4P2KA 1OL7A 2XIZA 3PXRA 5CSVA 5LMKA 3RI1A 3GU4A 3RPSA 2X1NA 2OF4A 3MI9A 5C03A 3QKLA 4AOJA 1BI7A 2YIQA 3QTWA 5A54A 4I92A 3TJDA 3ZO3A 2PUUA 4S33A 4AT4A 3QHWA 3KXMA 3MFUA 1W0XC 2JIUA 3TV4A 5KO1A 4FV3A 2XJ1A 3Q9WA 4J96A 5K5XA 1XR1A 2VTTA 4XBRA 3EQPA 3PRIA 4G9RA 4GIHA 4PNIA 5DG5A 3TNIA 3VNTA 3UGCA 4I22A 4FVRA 4CKJA 3COKA 4AQCA 2KTYA 5HCYA 3NAYA 2GNLA 3QUPA 3W16A 5DNRA 1ZZ2A 3TACA 4F0FA 3GOPA 1UWJA 5I0BA 1Q99A 1YWRA 3RMFA 2VZ6A 2YDJA 2OZOA 3OXTA 4FTLA 3ZH8A 4A9YA 4BDFA 5HG5A 2ZM1A 5AAEA 4FYOA 3W2RA 2IO6A 4UV0A 3ZS5A 4F4PA 2R7IA 2XNPA 1FPUA 4MHAA 4B9DA 4NEUA 5EYDA 3FMMA 4FV0A 3ZO1A 3A7GA 4IVDA 4ZJIA 5F94A 5BVOA 4ANSA 2VTPA 1YXSA 2Z7QA 4RIWA 4OTIA 4GL9A 2CN8A 1UNHA 2WMRA 3GNIB 4IAKA 2IZUA 5M44A 3UQFA 4WG3A 2UW7A 4RX7A 3UTOA 3ORNA 4I0SA 3GT8A 3AOXA 4PUZA 2BZIB 2BRBA 5E92A 4EWHA 1M2QA 1Y91A 4RIXA 3SRVA 3HLLA 5HO7A 3NIZA 2X8EA 4AE6A 4PMPA 3EHAA 2OJFE 4QYYA 4B8MA 5IA1A 4KIOA 3LPBA 1ZZLA 2VX0A 4TY1A 5KHWA 3R6XA 4UYNA 2AC5A 3FZTA 4LV5A 5DT0A 4DEGA 2E2BA 1Q97A 1ZOGA 3ETAA 3LFAA 3KEXA 4BYIA 4HGSA 3V8SA 4Y5HA 4QYEA 4YTIA 2UZDA 2YFXA 4CT1A 3SD0A 2WTDA 4UXQA 4BRXA 5HBJA 4QMWA 4L3JA 1YXUA 4CZYB 2F4JA 3FSFA 4MX9A 3HDNA 3KULB 4X3FB 5IEVA 3IQ7A 4PPBA 4AW0A 2E9OA 3TUCA 3GCVA 3KC3A 4JDHA 3WOWA 4OBOA 2YITA 3LQ8A 4J8MA 4DEEA 3D4QA 4EOJA 4QMQA 2BALA 4M12A 4RLKA 4FSMA 4EK5A 2NRUA 2WQEA 4BGGA 3CTHA 4II5A 4C4EA 3VHKA 4FKOA 3TIYA 2ZOQA 3KKVA 4EOLA 3OP5A 4RZWA 5HO6A 3Q9YA 4HVIA 3A8XA 3FAAA 3AD5A 3NS9A 3DKCA 3D5WA 4FKSA 3F69A 2VWBA 4TKSA 5AR2A 3ORZA 5IA5A 4AN9A 4DGOA 3CGFA 4FKPA 2VU3A 4FG9A 2X0GA 1M14A 3FQHA 4G3FA 4WUAA 2HW7A 2WMXA 4DGNA 5IA2A 4BGQA 2FB8A 2YCQA 3OY3A 4BCQA 3L9MA 3V5QA 4AF3A 3U9CA 3LLTA 4ZY5A 4C36A 4IWOA 3KVXA 4ZTSA 2CCHA 4MNFA 4XBUA 3G5DA 2ITTA 3OXZA 2HXLA 2R3OA 3U8WA 4CFNA 3G0EA 3E8EA 3EL7A 3QYWA 4E6AA 2XBAA 3OWJA 4MEDA 5J5TA 3DBQA 2XJ2A 1B38A 3G9LX 3W2CA 2R3IA 4W4YA 4A9TA 5GNKA 4BDBA 2FUMA 4C2WA 3UODA 3HZTA 4EK8A 1JLUE 3OT3A 4USDA 3VUKA 3F66A 4K18A 4H3BA 4QPAA 4B6LA 2O8YA 5M4FA 3CD8A 2NO3A 2PY3A 4H36A 5AX9A 2XNOA 1PMUA 3FJQE 2RFEA 3F3UA 3ZYAA 5KMNA 1IG1A 2PVKA 4P5QA 2W7XA 1IRKA 1GZNA 2W5BA 4DH5A 2WELA 4BKYA 2JDVA 4FIJA 5E8YA 3TNQB 4V0GB 2XK4A 4L46A 4AW2A 5ACBC 2OH0E 4U45A 3W10A 2GTNA 5JFWA 1DI9A 4MKCA 1FINA 3CQUA 1R3CA 2J2IB 4FV2A 4IJPA 3PP0A 4J52A 5AR3A 1O6KA 4HYSA 4QP1A 5CALA 2G2FA 2DQ7X 4HPUE 1H1RA 2UW4A 1PXPA 3ZTXA 2C47A 3ANQA 4ACCA 4RX5A 3ZBFA 3Q3BA 1OITA 3NUXA 2HK5A 5AR7A 2PMIA 4H3PA 4EBWA 4C02A 3ZO2A 5L2WA 3WF8A 1PKDA 5ANKA 5IUGA 5TF9A 4NW6A 3QC4A 4K77A 2C5VA 3FE3A 1W8CA 4F9YA 4EH9A 1BKXA 2W1CA 3GC0A 3VULA 5EDQA 3IDPA 5ETIA 3UG1A 3JVRA 4YJNA 3D5XA 1YDSE 1SZMA 2JITA 2R3JA 3PSCA 3U9NA 3LCTA 4GFOA 4OTRA 3I1AA 3QGWA 2QONA 2UW6A 3R8ZA 3U87A 4DFYA 2VTQA 5CENA 5KKRB 3MW1A 3GU8A 4S30A 4EH2A 4TTHB 4I1ZA 2XIRA 2C5XA 1U54B 3HA6A 3VVHA 1ATPE 5EDPA 4GT4A 5JGAA 4YBKA 3EQBA 5HG8A 4C37A 4C38A 2W4KA 5B2MA 3CTJA 3IDCA 3VS1A 4IBMA 4BBFA 3PE1A 3ZDUA 1PXMA 3QUDA 3R8LA 2O63A 3PLSA 3Q6WA 2ONLC 1NY3A 4WNMA 4C4GA 4D9UA 3ZSHA 4RWKA 3SW7A 2OJGA 5EM5A 4GU9A 1UU8A 3A2CA 4FK3A 3RCDA 2EB2A 4XEYA 4QYFA 3R02A 2GNGA 4L8MA 2JAMA 2YLFA 2XNMA 4JL9A 4QTDA 4X2KA 3CBLA 5CZIA 4I5PA 2PVFA 4EOKA 1ZOHA 4L53A 1JOWB 3IW6A 2VTAA 4TN6A 4I41A 3GFEA 1YI6A 1UVRA 2ETRA 2X81A 2XJ0A 3EQGA 1JKTA 2OKRA 4HNIA 4JIAA 2YABA 3KXGA 5CS6A 5BQ0A 3TZ9A 3KVWA 4GRBA 1F3MC 1BL6A 4W8EA 4YTCA 3MPTA 3N51A 3PY3A 3ZFXA 3MB7A 3FMEA 4F65A 3Q52A 3ALNA 5J9LA 2AUHA 2ZM4A 1SVHA 4YC3A 4C62A 4CFXA 5M57A 2ITYA 5M56A 4TW9A 4CKIA 1YOJA 1ZY4A 4IZ7A 5H9BA 4PPAA 3NAXA 1CKPA 4R7IA 3F82A 5EG3A 1REKA 3MPAA 4QQJA 5HE0A 4UMTA 3M2WA 1TKIA 3FL5A 2NPQA 3JYAA 4DTKA 3SOCA 5LOHA 2GSFA 3II5A 4FIGA 4RT7A 1KE7A 4CZTA 3MH1A 2XRUA 3MWUA 3IW5A 5I9XA 4YZBA 2JIVA 4JX3A 3U51A 4YSMA 4TYHA 1R0EA 3CD3A 4GCJA 3UE4A 4FUXA 1TQPA 3HV4A 3O8UA 2PVJA 4NM7A 3R8PA 3QTUA 2PE1A 2ZAZA 2PWLA 4EZ3A 3DK3A 3NYVA 4IZAA 2C0OA 2WTKB 4ANMA 3E87A 2UVXA 4NM3A 4U6RA 3RGFA 2QURA 4CMUA 1RW8A 2CLXA 4IX3A 1UU3A 3O50A 2ITUA 3MBLA 3HMOA 4TRLA 5EKOA 5ETAA 3TKUA 4U41A 3O8PA 3S0OA 5HESA 4BWXA 1Q62A 3LE6A 4OAVB 3E88A 3ROCA 4ZP5A 2E9PA 1V0PA 4QYGA 4UWYA 1OIUA 5HE3A 1OL5A 3W2PA 4BTMA 1ERKA 4GVJA 3W8LA 1REJA 4BCHA 4QO9A 2WO6A 3NRMA 5EW3A 1P4FA 5T68A 3CJGA 2Y4IB 4D2SA 1XH7A 2W9FB 4QNAA 5IUIA 4O0VA 3SW4A 4BN1A 2C6OA 1WVXA 2R0UA 2RFNA 2H96A 1OUKA 2IVTA 2YM4A 2W99B 1ZYSA 3AC1A 3ORMA 4QP9A 1NVSA 4LMNA 4WO5A 5CY3A 4BCFA 3R7GA 4CEGA 4FL1A 1UKHA 4ZLOA 4QTCA 4QNYA 4YTFA 1Q8ZA 4L45A 5JRQA 4O27B 2C0IA 4N6ZA 4FT7A 3ZLYA 4JR7A 4B99A 2G15A 3QA8A 3UIMA 2XMYA 4LMUA 4O22A 1UA2A 4U42A 3LAUA 2Y6OA 4ZZOA 4PL4A 5A6OA 2WTJA 4TXCA 1AGWA 3DBEA 1GIJA 1XH4A 4G5JA 4AS0A 4E6DA 2YIRA 3DLSA 5I5ZA 3EZRA 2HIWA 2QLUA 4FKLA 1O6YA 4AZVA 4GK2A 2FSMX 4O1OA 3COHA 3DAEA 3TCPA 4BICA 1VEBA 3QQJA 2W4JA 4LUDA 3Q4TA 2BPMA 5L2SA 4EYJA 2YIYA 3DY7A 3ZZEA 4MD8E 4FKIA 3DFAA 5KHXA 1Q8YA 2IVSA 3QTZA 5FQDC 4C4JA 3LCDA 1ZYCA 3C4EA 3FLYA 4MXXA 3A4OX 3U6JA 4FIEA 2O65A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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