2BRGA

Structure-based design of novel chk1 inhibitors: insights into hydrogen bonding and protein-ligand affinity
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
263
structure length
257
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Design of Novel Chk1 Inhibitors: Insights Into Hydrogen Bonding and Protein-Ligand Affinity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 74
structure length 257
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2brgA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2brgA01
5FXRA 5IKWA 4FT5A 4XBUA 5EYMA 2NRYA 3GOKA 5IDNA 2P33A 1K9AA 4DFUA 3ZEPA 4P2KA 3CY3A 4PL4A 4XLIA 2HY0A 2GNHA 3GT8A 3UP7A 4CQEA 5E8UA 2W06A 4G5PA 3CQWA 2CMWA 4HVGA 2C6DA 2J9MA 1PKDA 4K0YA 4NM0A 2GNLA 4IH8A 3RPYA 3PY3A 1PJKA 2W0JA 4XHKB 3VBWA 4KIKA 4L3PA 4DGOA 2XUUA 5CX9A 5ANKA 4YBKA 4DLJA 3ZMMA 1APME 1I44A 4RJ7A 2UZTA 4HGSA 3VHEA 5I9XA 2XIXA 3UZTA 3COMA 3PDTA 2VNWA 2RFSA 1S9IA 4I20A 4RIWB 3VS0A 4IBMA 3T3VA 3CTHA 2A1AB 3RWQA 4C4IA 5IG1A 3EN7A 4BC6A 3PY0A 1YWVA 4FKJA 4BKYA 2VTOA 2VAGA 4MXAA 4RC2A 1IAHA 4YJVA 4HNIA 2C6MA 4RSSA 5L6WL 3ZH8A 3KF7A 4B8MA 3PXYA 2UW5A 3VWAA 4FUYA 3D2KA 3O23A 4WRSA 4G6NA 4F6UA 3P78A 3G15A 1UNGA 3ORPA 4BVUA 5DE2A 1M2QA 1H8FA 2VWUA 3PE2A 4BDEA 4PMPA 3Q4UA 4YBJA 4XG9A 2R7BA 2HZIA 4O0RA 3L9MA 3MY0A 2OIQA 5HLPA 5L8LA 4V05A 4C02A 2A19B 4NYEA 1U5QA 1IAJA 3L1SA 3BWJA 4ERWA 2BR1A 5EM8A 3R1QA 3ORLA 2X1NA 4FVPA 1LEWA 4OLIA 4W9WA 1AGWA 1KE6A 2JFLA 4I93A 2A0CX 5CSVA 3F66A 3OP5A 4TPTA 1JOWB 2WPAA 4QPMA 3QLGA 3LMHA 2HY81 4U5JA 4C4JA 2UZDA 3OROA 2VTSA 4LRMA 2YCSA 3EQRA 4IX5A 3UO6A 4BCGA 3D5XA 4QQTA 4II5A 2C1AA 1PXMA 3CP9A 2YM5A 3EQDA 5EI2A 4AT5A 4C33A 4EZ5A 4OTRA 4RX8A 3R02A 1MRVA 2B4SB 2PE1A 2QU5A 3ZONA 2OW3A 3PE1A 4AP7A 2JBPA 4GKIA 2XVDA 3U55A 4R78A 3PPKA 5EOBA 3RWPA 1M52A 4FEQA 2GQSA 2Z8CA 2XRUA 3HV3A 4FSZA 4M66A 5CEKA 1J7UA 1O6LA 1KV1A 4AG8A 3SGCA 3W32A 4G16A 1J7LA 3ORNA 3V5WA 4HZRA 1M14A 2YABA 3CS9A 3KN5A 3FL4A 3KKVA 3R1YA 2E2BA 1F3MC 4FZAB 4OTFA 3R00A 3QA8A 5HE1A 5KNJA 4MBLA 3LXLA 4S31A 5EW3A 4I6HA 4EQUA 4UY9A 4QTAA 5M4UA 4R77A 2WU7A 4MQ1A 2G1TA 4L9IA 5AP4A 3Q4ZA 5KMOA 2ETRA 3AT4A 4FSMA 2BZHB 2VNYA 2HW6A 5GJFA 2ZDTA 3WZKA 1A9UA 4QRCA 5E92A 3PJ2A 2R5TA 5E91A 3VRZA 3TNQB 4K77A 3U51A 3BRBA 1Q8ZA 5M53A 1BL7A 3KULA 4BI0A 2GDOA 4FF8A 3PVBA 4EH8A 2XNOA 1PHKA 4RX5A 2BDWA 5C26A 3TT0A 5DR9A 5EQPA 4G3GA 3NLBA 4YTIA 2G2IA 1DI8A 4H1MA 4F1MA 4QQCA 2CKOA 3EQGA 4JBPA 2HXQA 3IGOA 3LIJA 3L9LA 4J71A 4XV9A 4EL9A 1ZZ2A 2OJGA 4UZDA 4DFLA 3IW4A 5J95A 3PIZA 2YEXA 5K9IA 3LFDA 2W4OA 3QC9A 5FG8A 5HGIA 2BHHA 3TNIA 4CFFA 2YWPA 5LXMA 1ZMUA 4BGGA 3RPVA 3CEKA 4B6LA 3AC4A 4WNKA 2VTAA 2ZV2A 3OOGA 3PSCA 4KIOA 4AZEA 2SRCA 3NNWA 3TDWA 3IKAA 3N4UA 3TI1A 1W8CA 4U97A 4MNFA 3TKUA 4NKAA 3UIUA 4CT2A 3LM5A 5BVNA 3BU3A 4C61A 5HVJA 4N6YA 5HG9A 3U4UA 1K3AA 4ERKA 1JQHA 4QPSA 4YR8A 2Z2WA 3G2FA 2JDSA 2X4ZA 3QD0A 5HNBA 3ZO4A 5IA1A 4NUSA 5FWKK 1ERKA 1JLUE 3P4KA 3LQ3A 2YFXA 3VS4A 2X2MA 1OKVA 3K5VA 4MXXA 1UNHA 3SXRA 4AAAA 3MI9A 2BRBA 2HCKA 4C2VA 2C6KA 2XNEA 5JEBA 5EDPA 3RM7A 4P4CA 4EH7A 5AR7A 3LFQA 2EVAA 3FMJA 3FZTA 4EH2A 1WAKA 2ITZA 2ZB0A 3AC5A 5AIKA 1SZMA 2BKKA 4BR3A 4WSYA 1H00A 2CJMA 2I40A 2PVFA 3GC0A 3MTFA 4H3QA 2RSVA 3DJ6A 3F5PA 4YJQA 4U9AA 3I5ZA 4X6QC 3TNWA 3DY7A 1G5SA 3FZRA 4BYIA 4IVCA 2WEIA 2C5VA 5HQ0A 4BWPA 2DQ7X 3E64A 4CV8A 2BAJA 3GGFA 4FSTA 4CLJA 2VTNA 2VX3A 3P7CA 1NVSA 1UKHA 4AQCA 5IQDA 3QFVA 4XMOA 3F3ZA 2UW7A 2ACXA 3E8NA 1U54A 4E5BA 5AP2A 4AX8A 2XK8A 3FMLA 4FTKA 1VEBA 1Q24A 3H4JA 5EG3A 3RALA 3GVUA 4KS7A 4LG4A 4OTDA 3E62A 4JR3A 3LLAA 1H24A 1Y6BA 5A9UA 3OT3A 3OCTA 3IONA 4MD8E 3O0GA 4AE6A 1Y8GA 2WMTA 3OXZA 1BI8A 3RCDA 4A07A 4TWCA 3LM0A 4YJRA 5IF1A 3EQFA 4W9XA 2QONA 1WBOA 3GU6A 3KU2A 3DA6A 2XCHA 5LMBA 3QTIA 4X2FA 4DLIA 4M13A 4HGLA 4YLKA 3VQHA 1ZY4A 4WO5A 3W2CA 4O21A 4O2ZA 3VUKA 5DG5A 5CF4A 4R7BA 1QL6A 3RPOA 1FINA 3DS6A 4BY9E 1XKKA 2QOHA 3Q2MA 4UXQA 5CEIA 5JH6A 4UMPA 4JR7A 4CTCA 2XS0A 4FZDB 1H07A 4G5JA 4AN3A 3F3WA 1Y57A 1HOWA 1PXJA 4IB1A 1W98A 5DBXA 5AP0A 4EH9A 5IQHA 3DNDA 3JY0A 3BHUA 1OB3A 3KMWA 3EN5A 3LQ8A 3BE9A 5KE0A 3ZO1A 4MD9E 4I5PA 2YJSA 2JFMA 4J95A 4RJ4A 4TY1A 1KUTA 3VJNA 4EOPA 4L6QA 5A4QA 2CDZA 3HAVA 4MNEB 4EOLA 1FQ1B 4EOSA 4FT7A 1OMWA 1TVOA 3LW0A 3MSSA 1YVJA 3TKHA 2HXLA 2YLEA 1GOLA 2WMWA 5KMNA 3AXWA 3FZPA 5IH6A 1H08A 4E1ZA 4EKKA 2R3FA 3HP2A 1IASA 1AQ1A 2H96A 3OWLA 2YACA 4ZJJA 3T9TA 3QU0A 5JN2A 2W1HA 1P5EA 2BIYA 3OG7A 2YM8A 4GT5A 4KRDA 3PVUA 3JXWA 4DAWA 2QKWB 4M97A 4L45A 2NO3A 2XYNA 4AS0A 1ZRZA 2VTIA 4EKLA 4BBMA 3EFJA 3UO4A 3CJFA 3ENHA 4UMUA 4LGDA 1RJBA 4LRKA 1YXVA 3MVLA 2FGIA 3LFEA 3DNEA 4GSBA 3DCVA 3NAXA 2B9FA 3K54A 2XK6A 4FT3A 4Q9SA 4AGDA 5IH5A 2QKRA 4C34A 1OL6A 4CRLA 2W1GA 2GMXA 4CTBA 4DN5A 1P14A 4RT7A 5DPVA 5ACBC 3FI2A 3OUNB 4FNXA 2YAKA 5HTCA 3QX4A 3AGLA 3ACKA 2UZEA 4PNKA 3OCSA 2FUMA 4QNYA 3O7LD 4RX9A 4RVKA 4WOVA 2R3PA 3OCGA 4FV9A 5L2SA 2YZAA 3R2YA 4Q5EA 3QWJA 5DR6A 3UNZA 1QMZA 1YDTE 3AC2A 5AP7A 4ASXA 4L53A 3Q6UA 4YHFA 2C5YA 1E1XA 4D4RA 3ORZA 4FX3A 3VW8A 4AFJA 2WTIA 4MKCA 3B2WA 3FQEA 5FRIA 4EEVA 4DC2A 4O86A 5D10A 3C0HA 4GV1A 3ZUVA 1OKZA 3TEIA 2O3PA 4JVGA 4ZTSA 4M67A 3ETAA 2PU8A 3QXOA 5I9VA 1Y91A 5AV1A 4D1SA 5I4NA 4IAYA 4MXOA 5M08A 3CE3A 4I6FA 3PJ8A 4A9YA 3R0TA 3C50A 4QMQA 3E7VA 2OZOA 3UIBA 3ZRKA 1PW2A 5A4CA 5E1EA 3QRIA 2WOUA 5B2MA 2W1IA 5HZNA 1OM1A 2UZNA 3BYUA 1VYZA 4HGTA 2AC5A 3K3IA 2QOBA 3ET7A 4FSYA 2B9HA 4ZSLA 5A6OA 1OL2A 3LMIA 4JG7A 1IA8A 4FT0A 1RW8A 4IVBA 1ZOHA 4YJTA 3SRVB 3VBXA 4OUCA 4E5WA 5IQGA 4M7IA 4IJPA 4F0GA 4EUUA 2VGOA 3ANQA 2IVUA 3UPZA 3AT2A 4EOOA 3KXXA 3FLWA 4FEVA 3EN9A 2XNNA 3F5XA 3EJ1A 5ETFA 5LOHA 5FLFA 1JSVA 3O8TA 3DOGA 5E8ZA 3E88A 4E4LA 2X39A 4QMYA 3DKOA 1FPUA 3VQUA 3OD6X 3KC3A 3TKIA 1BX6A 3LXNA 3W8QA 4YZNA 4RRVA 5JT2A 4P7EA 5F95A 5EQYA 4ZLYA 2JC6A 3CBLA 3HRBA 4IADA 4OAVB 1J7IA 2HENA 5B2KA 2YM7A 4NW5A 3LXPA 4DFYA 5DRDA 2F49A 4YZMA 3O96A 5HCZA 3AD5A 5J9LA 4ASZA 4GS6A 2RFDA 4F0IA 4I41A 5GNKA 2BFYA 2ESMA 2P2IA 3R9HA 4DG3E 4AA4A 3D7TB 4YJNA 4EK3A 3CR0A 4NTSA 5KKRC 4FUXA 4TTHB 1ZAOA 4EHGA 4FL2A 1RE8A 4L8MA 2EXMA 4DT9A 5F20A 4WIHA 3W2PA 4BZDA 2Y7JA 2Y6OA 2JKKA 3WZUA 2QOCA 1Y6AA 4CD0A 3QZIA 4AZTA 2ZDUA 4D4SA 2WMQA 4I0SA 1WBTA 4BBEA 4M69B 2FVDA 4G17A 3KK8A 4XCUA 5HO6A 3VBQA 4CKIA 2C47A 2XH5A 4LGGA 1OBDA 2A4LA 1XHAA 3BCEA 4RZVA 3VVHA 1E1VA 4OGRA 2XMYA 2X2KA 4KUJA 3P5KA 3JR1A 2AC3A 3CKXA 2RG6A 5CQUA 3S00A 4IZ7A 4DFXE 3PJ1A 2UZLA 3GI3A 5HEZA 3HMOA 2DYLA 4PMMA 4R6VA 4U44A 5CY3A 3UE4A 3UIXA 3H9FA 4UXLA 5CAUA 4DINA 4UX9A 4U45A 4S33A 2QNJA 3DBDA 3GU8A 3IW6A 4JRNA 3ZFMA 4F09A 2B0QA 1YOJA 5AP1A 4W4XA 2XA4A 3ZCLA 5CXZA 5FEDA 4F99A 2CSNA 3HMMA 3UG1A 1H26A 4CG8A 5HBHA 4FODA 4X3JA 3U4WA 1BI7A 1JKSA 4DGGA 4I92A 4JIAA 4IX4A 5DEYA 1CDKA 1CTPE 4RLKA 3D15A 3F2NA 4ZTMA 3Q32A 3QGYA 3MVMA 4FTAA 3HEGA 3R30A 4RIXA 3R7VA 4LL0A 1QPEA 2ZAZA 4FSQA 4J1RA 4ANBA 4PNIA 2AUHA 3M11A 3WF9A 3ZLXA 4O7LA 3U8WA 5KCVA 5EYDA 4MF1A 1WFCA 2R0IA 4RFMA 4WG5A 2O5KA 2ITPA 4CMTA 5FTGA 3BE2A 5CU0A 3AMYA 4XBRA 1OKYA 3BHVA 3C13A 5KMKA 1FVVA 3TV6A 3TV7A 5DIAA 3D5UA 3GUBA 4M15A 5HBEA 3MESA 3NRMA 4JNWA 4BN1A 4IX6A 4F08A 4UZHA 1NVQA 4C2WA 1GZ8A 5DNRA 3V8TA 4ALVA 3OEFX 2R0UA 3GU5A 3Q53A 3TM0A 2ITUA 1UWJA 1NXKA 4KWPA 2WNTA 1Y8YA 3DPKA 2Z7LA 3HDMA 4RWLA 3UG2A 2C3IB 3I7BA 3MJ2A 4FC0A 4IAZA 4XRLA 3AGMA 3IG7A 1KOAA 2CNUA 1L3RE 3G33A 5JFVA 2GNFA 2PWLA 4IACA 4X21A 4O82A 3PLAE 2B54A 2OJIA 4LRJA 3ITZA 4JOAA 1Q8WA 4W4WA 5JMSA 1XH7A 1SVHA 4GKHA 3TDVA 3CGOA 3AG9A 3PXRA 3R6XA 4QMVA 4AFEA 4F1OA 4U42A 3UDBA 1V0PA 3VAPA 3EKNA 3GQIA 3VRYA 5C8KA 4TNDA 3E8EA 4EHZA 5IEXA 5FP5A 4CYIA 4DEBA 2VTRA 3FZSA 3FJQE 4DF3A 3SQQA 2I1MA 5FBOA 4IW0A 4I0TA 3FPMA 4UALA 4IVAA 2OO8X 4FICA 2VX0A 2IZUA 3I60A 4ZTRA 3ZXZA 5KMLA 2QHNA 3FQHA 4HCVA 4KD1A 4HVHA 4KSQA 4RC3A 3PXKA 3CQUA 3BHHA 4AGWA 4MVFA 2O64A 3I0QA 4FTRA 5AUZA 2IJMA 1W0XC 2HZ0A 5FTOA 3NAYA 4FZ7A 2OFVA 1R39A 2XNMA 3MFTA 3OY1A 3AMAA 1CKIA 2ITXA 4FTUA 3QHRA 2R7IA 4IAIA 4EHVA 5M4CA 3H10A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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