4FTMA

Crystal structure of the chk1
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
278
structure length
263
Chain Sequence
VPFVEDWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAKRPRVTS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the CHK1
rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
total genus 78
structure length 263
sequence length 278
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ftmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ftmA01
3LFFA 5LVLA 4UN0C 3NR9A 3TN8A 5FXSA 4E4XA 5AUUA 3BEGA 2CNVA 5IEXA 4HCVA 1P5EA 5KNJA 5JQ5A 3D7TB 4LMNA 4BCFA 3QC4A 3F82A 3DTWA 2QO2A 5EI6A 5L2IA 4FIHA 4Y72A 5E1EA 3BRBA 5AUYA 3ROYA 4CLJA 5I9WA 3EYHA 2BFXA 3WYYA 4ZAUA 4U44A 5AAEA 3EZRA 4RZVA 3LQ3A 1PF8A 3MVHA 2WIPA 4I3ZA 1CMKE 3KRJA 3DLSA 3P08A 2XNOA 5HESA 4O0XA 2OF4A 3F5GA 4FUYA 3RP9A 4G16A 4JIKA 5KKRC 4OAVB 2VO6A 3CXWA 3Q4TA 2WIHA 4FIGA 2REIA 1REKA 4XYFA 3SG9A 4UYAA 2UZDA 4XV1A 1STCE 3S2PA 1FMKA 4O0WA 1XH7A 3A7JA 4B8MA 4BHNA 4QO9A 3C7QA 2XNNA 3PXZA 2WMSA 2C69A 3DZOA 3Q3BA 2XCHA 4L52A 1G8AA 3F3UA 4HOKA 3HA6A 3V6RA 4UV0A 2C3KA 4QMMA 3ROCA 3I0QA 2G2IA 2C5NA 2XCKA 3QFVA 2ZM3A 3QHWA 2VN9A 4ZEGA 4YMJA 2PZ5A 3F61A 3O8TA 5JZNA 4BL1A 3H30A 3OOGA 1ZMWA 3PG3A 4JR7A 3ODZX 5A6NA 5BNJA 4O84A 2YIYA 1OECA 4NKAA 3R1QA 4GYGA 2IVVA 5IG1A 3W2CA 5DHJA 3A2CA 3FAAA 3BYMA 4GMYA 5L2SA 5A4QA 2BR1A 4WOVA 4U41A 3W2OA 3Q32A 4Q5EA 2WTWA 5C8NA 4C4HA 2H34A 2OIQA 4GK2A 2X7OA 4NFMA 3OC1A 5BVKA 4FSQA 4S33A 2R3MA 4TN6A 4DC2A 3VULA 3TUDA 3R83A 3WIGA 3DFAA 2Y4PA 2O2UA 2R3HA 3GP0A 1UU3A 2PUIA 4L43A 2C1BA 3FYKX 3GFWA 5HIBA 4N70A 5ANKA 5DWRA 3I6UA 3QZIA 3HV7A 3Q6UA 3D7TA 3KRLA 2C6OA 2BRNA 3D5UA 4FI1A 5HG8A 4PPBA 4J8MA 4BHZA 2XKEA 3CE3A 3QXPA 2EXEA 1OL5A 4TL0A 1YXTA 2YDIA 1YI6A 3BYVA 4ITJA 2B53A 3F66A 4RGJA 3W10A 3D15A 4DGOA 1M14A 4JG8A 4GG5A 4D1SA 4EZ3A 2RIOA 2C3IB 1DAYA 1YQJA 4FMQA 4RVTA 4XOZA 4DHFA 2QURA 4NUSA 2RG5A 2YIQA 5DRBA 3BYSA 4QTDA 3QZGA 3R6XA 3DKCA 4CGAA 2WD1A 4FSMA 5ANJA 4ANNA 2BKKA 5J5SA 1JKKA 4FYOA 3P86A 3REPA 4H1JA 4C3FA 1W84A 4U7ZA 1MQ4A 1XHAA 4OLIA 3UO4A 3UMXA 2B9IA 1SM2A 4AOTA 4D2VA 3ZCLA 2PVRA 4QMXA 2BRMA 2R3KA 3MW1A 3IG7A 3E92A 5ANDA 1PY5A 3W16A 3JY9A 2XRUA 4MBJA 5HVYA 1LR4A 3Q5ZA 4QMPA 3POOA 3UYTA 4KIPA 1DAWA 1WZYA 3NW7A 4V01A 3ZC6A 2WGJA 4EH3A 4LV8A 1UNGA 2XRWA 2Z60A 4C35A 4CYJA 4EH9A 3EQFA 4R78A 1MQBA 2BIYA 1W83A 3O8UA 3NUYA 4RZWA 2CGVA 5T3QA 3CY2A 5M57A 4XG6A 5DGZA 3UBDA 3L8VA 5AP1A 4MQ2A 4C57A 3TUBA 3KK8A 3FMEA 3KEXA 4FSYA 3NRMA 4MXZA 3QLGA 5BMMA 3WF8A 3E93A 5IH6A 4M68A 3LCOA 4CMUA 5JRSA 2XIXA 4G2FA 3WARA 3ZSHA 3NYVA 3BQCA 4JT3A 3W2QA 2EVAA 4QT1A 4ANMA 3UOLA 4QYGA 4YTIA 3O23A 4L46A 1UU9A 3RVGA 2ZOQA 1OM1A 3ZDIA 4O7SA 5TKDA 4BY9E 4TYIA 4R6VA 4BICA 5EM8A 4D2TA 2BAKA 5HNGA 3V5TA 4BZNA 4U79A 3HV4A 2OG8A 3FLSA 4CKRA 1V0PA 4D9UA 5T68A 5JT2A 5HHWA 1H00A 4D4YA 2XZSA 4FV8A 3JXWA 4FV2A 4ERWA 2ERKA 3QUEA 5IQHA 2X81A 1JSVA 3PA3A 2WKMA 2WQNA 4RX8A 3ULZA 4BDBA 5EKNA 3KY2A 3MYGA 2ZJWA 4GV1A 2GNJA 3PSCA 3OXZA 4RJ7A 5B7VA 2QU6A 3CC6A 2Q0NA 3UZTA 5F4NA 4GFMA 4F0GA 4F70A 5DFPA 5E8VA 3LKMA 1M17A 2OZAB 2W1DA 3V5LA 3ETAA 4MH7A 5AR5A 4EI4A 4IX4A 4E6CA 4EWHA 1H07A 4AZEA 4OT6A 4GSBA 4CFMA 3KN5A 5KE0A 4DFZE 2YJSA 4XX9A 5ACKA 4HYUA 5AV0A 4E93A 3EQHA 4PNKA 5KHWA 3TNWA 4DH5A 4YP8A 5BVEA 1OKVA 5G6VA 1Q41A 3QRIA 4HGEA 3LCDA 3LFSA 4FKUA 4FOBA 3OUNB 3V5JA 4DT9A 5AWMA 3NMUF 3TTJA 4QP7A 4KS8A 4ZTNA 4C8BA 4FL2A 1F5QA 3VS2A 1G5SA 4WRGA 3L1SA 3HDMA 1GIHA 2OF2A 3OCSA 3IS5A 2EU9A 3PP0A 3TZMA 4AZSA 2ZV7A 1Q5KA 4DFLA 3R7UA 3MB6A 4G5PA 2IZSA 3TKUA 4A4OA 3ZFYA 4MTAA 1WBNA 4FTQA 2I6LA 1H25A 3CPBA 4OAUC 1GZOA 3TZ9A 1YHVA 3E3PA 3DK3A 2OXYA 4ASZA 3WE4A 2IZUA 1QCFA 4E3CA 2Z2WA 4DG0E 3LW0A 1DI9A 3NVKI 3TWJA 2QLQA 4EONA 2VWYA 5HO8A 2VUWA 2Y6OA 5I9VA 2YM5A 2JIIA 4IQ6A 2ITPA 2VTPA 3FPMA 2UZVA 5GHVA 3ZO4A 3FE3A 4IBMA 2XNEA 3LFCA 1KE6A 3Q5IA 4FTMA 5EHLA 5K0XA 5E8YA 3EWHA 5H8EA 2G15A 3GOKA 1QPEA 1YOMA 5FM3A 3VUGA 4J7BA 4HVGA 2QNJA 4QMTA 4RIYA 5AV2A 3RPYA 3JVRA 3GENA 3HX4A 3W18A 3HRFA 3ZLSA 4FTOA 4XMOA 5HU3A 3QA0A 3QXOA 3C50A 2W1GA 4PY1A 3TV4A 3LE6A 5D7AA 4O1OA 2P2IA 5E4HA 2C0OA 2CHLA 3FBVA 3UQCA 4RFMA 2CLQA 4RVLA 4JDIA 5JSMA 3EN5A 4ZY4A 1WBSA 1U4DA 1CM8A 1PXIA 3LFAA 3FZOA 3JUHA 3Q9XA 2R3NA 2OZAA 3ALNA 4PDYA 3R8PA 3AC2A 4AP7A 4MBLA 5E8WA 3MPTA 3CJFA 3ZXTA 2OJ9A 4WNOA 4FTJA 5TO8A 3HMMA 2VWZA 3UDBA 3PUPA 3QA8A 5ANOA 4AW0A 4LUDA 4OTRA 3WZDA 5J79A 1W7HA 4XJ0A 5HE3A 4X21A 3LCTA 2ITQA 3VUDA 4F9CA 4W9WA 4UWYA 1MRYA 4ZZMA 1Q8ZA 2O63A 1UWJA 5HU9A 1UVRA 2Z7RA 4IWPA 5J7BA 3QALE 3A99A 4PX6A 2PUPA 2Z7QA 3G9LX 4DEHA 2R3GA 2VX0A 4D28A 2W1HA 3U6IA 3NZ0A 3HRBA 3EQPA 4ZP5A 2ETMA 3PY3A 5CAOA 5LMAA 5AX9A 3CQEA 3VF8A 3LFBA 3RK7A 3BBTB 1JLUE 3F3VA 3LFNA 1ZOHA 3FUPA 5DIAA 3CCNA 3CY3A 2AYPA 3AC1A 2KTYA 1JOWB 4WSQA 4JIAA 5FBNC 5CENA 4AG8A 4F7SA 5L8JA 5HTCA 4TWNA 4RX9A 2QOBA 4F08A 1PYEA 4IVDA 4U43A 4FTIA 5HLPA 3S1HA 4AT4A 4AGWA 3V6SA 4BKJA 2GPHA 2E9NA 4IX5A 4FSZA 4AZWA 5B2MA 1H8FA 2QOKA 3UO6A 5AP0A 2UVZA 3P78A 4O22A 3R9NA 4YLKA 4IM3A 3ODYX 1U5QA 1OUKA 3E7OA 3CR0A 4QOXA 4ZTLA 3HMNA 1MRVA 3FLNC 2FVDA 3FQSA 4TXCA 4YTFA 4DBXA 1IEPA 4RC2A 1WBPA 3MJ1A 3IDBA 4C2VA 4E1ZA 1TQMA 3O2MA 3RZBA 3ZMMA 1DI8A 2PZYA 1UKHA 4Y73A 3RAIA 3C0IA 3Q52A 2F2UA 4PRJA 5A4CA 3UG1A 3RALA 5AV1A 5JRQA 5HOAA 2ITOA 3A61A 2EWAA 4E26A 4IM0A 4ZZOA 3E63A 2BRGA 2VWVA 3FY0A 4LRJA 3BLHA 3QD3A 2J0LA 2HY0A 5HE1A 3VUTA 4OTDA 2ZB1A 5ANIA 2VTRA 3DK6A 4FKRA 4K77A 3EN4A 4EH6A 2YISA 1GJOA 3V8WA 2I0EA 4EH8A 2CKQA 1XH9A 3DNDA 4JQ7A 1KV1A 3NYNA 2R0UA 2ITUA 3IONA 2JKKA 4C2WA 4U40A 2F7ZE 3R7IA 3E62A 3M1SA 2FO0A 1PKDA 3LMGA 5HKMA 2BMCA 4QYYA 4ZS4A 3AC8A 3U55A 1PHKA 2WEIA 3FKOA 3C13A 3BPRA 4FNYA 1R0EA 5K5XA 3BX5A 4FUXA 4O2ZA 3V5QA 1JKSA 1YW2A 4X0MA 5CNNA 2WNTA 3JPVA 4WNKA 5F94A 4CV9A 4F4PA 2JC6A 3VS5A 4PDPA 1YVJA 4DTBA 3RTPA 2X8EA 3LMIA 4NJ3A 2JITA 2XM9A 3D9VA 2QR7A 2QVSE 4FVRA 4KRCA 4U5JA 4EK6A 2CPKE 4AT3A 2WELA 4USFA 1SVEA 3QCXA 4C4IA 4E4MA 3TKIA 4BR3A 5J87A 4X2NA 4AGUA 1GZ8A 1LEZA 3PPKA 4JBQA 3ZLYA 5CAQA 3C4EA 1WBTA 3R22A 1P4OA 4DYMA 2OFUA 5ETFA 5J1WA 5JFWA 3FWQA 2HZ4A 3C51A 3EIDA 5BYLA 4QTEA 2QO9A 2HWPA 2PMIA 3KXZA 4APPA 4EC8A 4EK3A 4DFBA 4IXPA 4IW0A 5JFXA 1HCLA 2DS1A 3HNGA 3VAPA 4BGQA 4TWPA 5IA3A 4LI5A 4I5CA 4O91A 2XK4A 3R73A 4C7TA 2OJJA 3QX2A 1XR1A 3EN7A 1YHWA 5A3XA 4GCJA 4YU2A 4DAWA 5C1QB 5IA0A 2GNFA 3E8DA 1SNUA 5HCZA 2C30A 3EB0A 1HCKA 1LUFA 2HAKA 4MF1A 5CSWA 4F0FA 2CDZA 4X2JA 4M69B 3DBCA 3QQLA 4Y85A 4CVAA 1Q3DA 2VWUA 3OCGA 3PRIA 4CRSA 2NPQA 5HVKA 2A0CX 2VRXA 4E4LA 3R02A 1UV5A 4NKSA 2P55A 4NL0A 4X6RA 4EBWA 2UW4A 4PMPA 4KIQA 3I5NA 5DR9A 5FRIA 3VQHA 4A7CA 3LVPA 3DXQA 3SRVB 4PQNA 4E7WA 3W2PA 5DR2A 4R3PA 1ZMUA 4W4WA 3CTJA 5EDQA 2BPMA 2PK9A 1H1WA 2XIZA 2R3IA 2PVNA 3IOPA 2RFDA 1KE5A 4HPTE 3ET7A 2QO7A 3W33A 2RFNA 4KNBA 4MD9E 2X4ZA 3KC3A 4HGTA 3D5XA 4RJ8A 4WO5A 3ZU7A 5ETCA 5FDXA 4PPCA 5EOLA 4WSYA 5TT7A 3P79A 4JQEA 4XG4A 4HVHA 3F2AA 4EZ7A 2YA9A 1WVYA 3MS9A 4WD5A 4D4RA 5DOSA 4JL9A 3LFEA 2Y8OA 4GL9A 2O8YA 2R9SA 3GC0A 3R7OA 3RPRA 4WG4A 2ZV2A 1LPUA 5BVFA 3DU8A 1O6KA 2W1FA 3CBLA 3R1SA 4J71A 3AC3A 3HECA 4XRLA 4FKJA 5ITAA 3TM0A 5CXHA 2VTJA 2WMRA 1W98A 4HW7A 3KVWA 4FKTA 2OZOA 4MHAA 1P4FA 5FTQA 3W8QA 4G3FA 4ZLOA 4PNIA 1YXVA 3OCBA 3GCVA 4P5QA 2W4JA 4A9UA 3WZEA 4K0YA 1RW8A 4J95A 4R7BA 2ERZE 3AG9A 3NCZA 3KF4A 3QD2B 4BCQA 2BRHA 2PY3A 1KSWA 4JVGA 3P5KA 3ZSGA 5J5TA 4NM3A 3MH0A 4IJ9A 5J9ZA 5CU6A 3CD8A 3JYAA 4BIBA 3R2YA 2YITA 3R63A 4D2WA 1YWRA 1K3AA 5AAFA 5DBXA 2HELA 2R3RA 3BQRA 1GIJA 2H8HA 3KMWA 4TKSA 4R5YA 4FTLA 3FMDA 5AR2A 5IEVA 2ITYA 1J7IA 4I24A 3RWPA 3PVBA 2VTNA 4YC3A 2H96A 2J6MA 2OGVA 4ASXA 3R8ZA 3QUPA 2IW8A 1Q99A 3QQHA 4I0SA 3UP7A 4ALUA 2VU3A 4M15A 4IE9A 4NFNA 3QTSA 4O6LA 2PULA 3KRXA 3A60A 1CKIA 2UV2A 4I0TA 4KINA 5CVHA 4JRVA 4D0XA 1ZYSA 3BEAA 3C0HA 2PVJA 1MUOA 2VTSA 4EOKA 3V01A 5EHOA 3QD0A 5C03A 5AMNA 3VBXA 2FA2A 3PXQA 3KCFA 2WO6A 3FXZA 2YAAA 3W2RA 4CTCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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