2BFXA

Mechanism of aurora-b activation by incenp and inhibition by hesperadin.
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
270
structure length
269
Chain Sequence
RKFTIDDFDIGRPLGKGKFGNVYLAREKQNKFIMALKVLFKSQLEKEGVEHQLRREIEIQSHLRHPNILRMYNYFHDRKRIYLMLEFAPRGELYKELQKHGRFDEQRSATFMEELADALHYCHERKVIHRDIKPENLLMGYKGELKIADFGWSVHAPSLRRRMCGTLDYLPPEMIEGKTHDEKVDLWCAGVLCYEFLVGMPPFDSPSHTETHRRIVNVDLKFPPFLSDGSKDLISKLLRYHPPQRLPLKGVMEHPWVKANSRRVLPPVY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Mechanism of Aurora B Activation by Incenp and Inhibition by Hesperadin
pubmed doi rcsb
molecule keywords AURORA KINASE B-A
molecule tags Transferase
source organism Xenopus laevis
total genus 88
structure length 269
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2004-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bfxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bfxA01
4FIEA 2OBJA 4BDJA 2G2IA 2XK6A 4I6BA 4OTHA 1UU3A 5AR5A 4FG8A 4QYYA 3OUKA 3VAPA 2C3LA 4S33A 4BI1A 2XJ0A 5JK3A 4NYEA 2P2HA 3PRFA 2UW6A 4O6EA 5J7BA 5EYDA 4RA4A 4PQNA 4RIXA 3Q4ZA 4E7WA 4F9YA 5AA9A 3R7GA 3BHUA 3RMFA 1KWPA 3NVMB 4YR8A 3I1AA 3NUNA 4I5CA 3QF9A 1STCE 1JSTA 3R6XA 4O91A 2VTLA 4D5HA 4C3RA 5A9UA 5L6PA 2X4ZA 5KMNA 3QWKA 3IONA 3POOA 1YVJA 4JR3A 3HZTA 4G6NA 5B2KA 1JKSA 3R00A 3C5IA 1KE8A 4GIHA 4R3CA 3RTPA 3RPVA 3QTQA 4GT3A 2J0IA 3RI1A 3KB7A 3EIDA 5KMOA 2GHLA 3WZJA 3RNIA 3II5A 4MNEA 4EJ7A 2BRGA 4XV1A 2IVUA 2A0CX 2YJRA 4K2RA 3QALE 4RIYB 3R8UA 4WKQA 2UZLA 4XMOA 4IC8A 3OEZA 2C69A 2WEIA 4AGUA 4DGOA 3UQFA 5JGAA 4RJ3A 4MQ2A 3V8TA 3EZVA 4IZYA 4UMRA 3HA6A 4GJ3A 5CU0A 4QMTA 4EQCA 3MB7A 4QPAA 4I4FA 2HIWA 1PKDA 3HV7A 2NP8A 4FV9A 5L2TA 3PVUA 3D7ZA 2QHNA 3C4WA 3Q5ZA 4DA5A 4O38A 3ANQA 5AP6A 5DHJA 3C4CA 2GS6A 4IDTA 2GMXA 3IDCA 4XYFA 3O2MA 5LVNA 5BYLA 4O7VA 1V0OA 3RPYA 3JR1A 4DEEA 1UWJA 5HLWA 2ITUA 2UW4A 1NA7A 4CKIA 2BRBA 3DKCA 4GFMA 4OT5A 4Y83A 2IW8A 2IG7A 4UXQA 4AZSA 3EQFA 1JAMA 3R21A 3EQIA 3KK8A 5LCJA 4XOZA 4CSVA 2HY0A 4TYHA 3RPOA 2JC6A 4UMTA 5BMSA 2W7XA 2YZAA 2C6MA 2QU5A 4BDDA 4UY9A 1CKIA 1KE6A 3OOMA 4AP7A 4IAZA 3HDNA 1L8TA 3WYYA 4J7BA 1VR2A 2A2AA 1JNKA 4GKHA 2QI8A 2BDWA 4G3EA 4M15A 4X3FC 3JY0A 3SKCA 3LFFA 3EN7A 3ODZX 4JDHA 4R77A 4C35A 3C5UA 2W5BA 3I60A 1IG1A 2ITVA 4JRNA 4M0YA 4EH3A 2ZB0A 1OUYA 3RZFA 1JVPP 2PK9A 5DFPA 5KE0A 3OUNB 4BTFA 4L3PA 2O8YA 3EQRA 4KIPA 2JKQA 5E8UA 4PUZA 2XKFA 1XQZA 3BV3A 4GKIA 3KMMA 3A4PA 3ZONA 3CTQA 5AFVA 3DAJA 2NO3A 3OXIA 4P7EA 2YFXA 3UPZA 2ZB1A 2Q0BA 3PY3A 4X3FB 5GJFA 3E63A 5KMMA 2PVKA 3HRBA 3UVPA 3NDMA 3PYYA 4GVAA 2BALA 2VAGA 2E9UA 4PMSA 1KE9A 4E6CA 4BCFA 1YHVA 4AGDA 5LJJA 1Y6BA 4ORKA 3MFSA 3UIMA 4B6LA 2HWOA 3RJCA 2Y6OA 4GU9A 3R9HA 2G1TA 3ZHPC 4EHZA 4FKUA 2FSMX 3V8WA 3FL5A 4A4OA 3ZSIA 3W55A 3QQUA 3GFEA 4FEVA 4PDPA 1FMKA 4LUEA 3ZO4A 1XH9A 2PVLA 3BCEA 5L8LA 4U45A 3MVLA 1QPJA 4DGGA 4ZY4A 5EKNA 2ESMA 3FE3A 4N4SA 4YP8A 2HWPA 4IAYA 4JOAA 3SAYA 4PMPA 3THBA 2VZ6A 4FK6A 1RJBA 1TQIA 3DPKA 4AT5A 1GJOA 3VS0A 2YAAA 4EQUA 2XK8A 4U6RA 3BGPA 2B9IA 2FSLX 3P9JA 3VS6A 4UZDA 3FC1X 1JBPE 2XYNA 4TYEA 5AAEA 5ETAA 2YDKA 2IW6A 4PP9A 4FV1A 2PZPA 4RLKA 2J5FA 4BIDA 3R8VA 1GZ8A 4FVQA 4FYOA 4IB0A 5IU2A 5KX8A 1ZARA 2YIWA 4CKJA 4DGNA 3GU8A 4KABA 4JT3A 3BLQA 3PY0A 1IAHA 2ONLA 3QGWA 4MNEB 4F0GA 2WAJA 5FUTA 4MXYA 2R3PA 3R2BA 4LL0A 4EOMA 1E9HA 3F2AA 5IG1A 3PJ1A 1OKVA 4QYEA 3QUEA 4WG3A 4KINA 4JLCA 3B2TA 2JKKA 3COKA 3TDWA 4NJ3A 1SVGA 5HEZA 4F99A 3EQGA 1SM2A 2XCKA 3P7BA 5HLNA 4UB7A 3QC9A 4FC0A 2V5QA 2XH5A 3KXNA 3NUXA 5CXHA 4RVLA 4IBMA 3TIYA 2HXLA 4PL4A 3ZC6A 4RIWB 3MN3A 5AV0A 3LXPA 4QMNA 1OBDA 2I0EA 4FTQA 3QU0A 3TV4A 4H39A 3FQEA 1SMHA 2YLEA 1FMOE 4FIHA 4K77A 1JLUE 3S0OA 5DRDA 4YTHA 4C36A 1TQPA 2HZ0A 3D5XA 4Y5HA 5FEDA 4F7JA 3VS1A 1UWHA 2O0UA 2XM9A 3VUDA 4UMUA 3F5GA 4L45A 2XIXA 1W7HA 3OZ6A 4QYGA 4FNYA 2RSVA 5TKDA 4QQ5A 3PIYA 4ZTMA 3V6SA 3DFCB 3GCPA 3DY7A 4IANA 5C8KA 3MWUA 2PVRA 5DR2A 3VBWA 3GGFA 2VV9A 2BAJA 3RAIA 4K8AA 1Y91A 3H3CA 4WRSA 5EW9A 2HZ4A 4ZY6A 2Q0NA 1ZLTA 5E1SA 3UMWA 3V5PA 3BEGA 2W05A 1MUOA 1SZMA 3Q9XA 4MBLA 2BMCA 1K9AA 2PE2A 4MD8E 1Q8WA 3V8SA 4QMWA 1M2RA 3N4UA 3JS2A 2VO3A 2YM8A 4FVRA 2ZDTA 3U51A 2E9PA 3A8WA 3LJ1A 4TTHB 4EBWA 4CFXA 1I44A 5A14A 2WMQA 1T45A 3OHTA 4DBXA 2OGVA 3R1QA 1JPAA 5TT7A 1RDQE 3G6GA 4DFUA 5AP1A 4FNWA 3D83A 2VWBA 2JDOA 4C4FA 3NRMA 5L3AA 3TN8A 4OAVB 5KUPA 3QXPA 3L1SA 2PZIA 5JH6A 4JQ8A 4QP6A 4RWIA 1M2QA 3NYNA 3NYOA 2UV2A 4JG7A 4LUDA 4QMYA 4YZNA 1VYWA 5EHLA 4IX5A 4ZZOA 3UIBA 2WZJA 3I4BA 1CSNA 3A8XA 4RJ8A 3QZFA 2WMBA 4EKKA 3OS3A 5A4QA 3COMA 3OY3A 2PZRA 2QOQA 3ORMA 3PXFA 3QC4A 5LVOA 5IMEA 2X8IA 2CGUA 3A60A 4TZRA 5ANGA 2ZYBA 3OG7A 4IB5A 3D5WA 4WNMA 3VIDA 2FO0A 2QC6A 3WZKA 3R01A 1P4OA 4BTJA 4XG2A 2QVSE 2ZV7A 3R8MA 4QRCA 5AUVA 4FV5A 5JZJA 2CKQA 3AT3A 4HZRA 4LOQA 3Q9ZA 4C02A 5DH3A 3BI6A 5DA3A 2W4JA 2QOLA 3U55A 2G9XA 2WMVA 2Z2WA 2ZJWA 3Q53A 5FLFA 1KUTA 1CMKE 3QQLA 4YGAA 2XA4A 3W33A 4F9WA 4LM5A 4FIJA 4M0ZA 4EOSA 4IWDA 1XJDA 2GDOA 3NNVA 4FG9A 4AA4A 1OL1A 5TR6A 2IVTA 1U59A 2QG5A 2Y6MA 3GFWA 4IM3A 3NEWA 5DNRA 3Q32A 4AOIA 3M1SA 4NM5A 1FINA 4F7LA 4U5JA 3MIAA 3QZHA 4LGHA 2GCDA 3ATTA 3VS2A 2W1FA 5A6OA 2GS2A 3VBVA 3NNWA 4ZOGA 3F3TA 4JAIA 5IMXA 3UTOA 2X8EA 3Q6WA 4FYNA 4TNDA 4PNIA 3AMYA 5HVYA 4QMUA 4U3ZA 2VX3A 3PWYA 4W4WA 5CEMA 3BYUA 4FKOA 4AAAA 4EHEA 5L8KA 3NYVA 4H58A 4Z16A 1O6YA 4DEGA 5KHXA 3QRJA 5IA3A 4BIBA 5C27A 1YXUA 2BTSA 4I5PA 1Q5KA 2VTHA 1A06A 3HV3A 2V0DA 4C4GA 4DFLA 5K4IA 4BDAA 3JYAA 3PSBA 3QHRA 3IDPA 4L52A 4DGLC 1GIIA 3CIKA 2I6LA 2Z7QA 5KZ0A 5C01A 4W9XA 4BCIA 4FT5A 4IMYA 2IJMA 4MH7A 2CGWA 3QLGA 3TTJA 5JT2A 5L2WA 3D2IA 5FQDC 2WMRA 3S1HA 2VWVA 4D55A 3HUBA 3IGGA 5CASA 4XP0A 2V22A 3QYWA 2DWBA 2XRWA 2WMUA 4AU8A 3QQKA 4QMMA 4O0UA 4GYGA 5HX8A 3D2KA 4WA9A 2UZOA 5D1JA 1B39A 2X9FA 2HY81 1O9UA 4G3FA 1QPDA 4RT7A 4IZ7A 5AR3A 3LZBA 3BQCA 2W4OA 1XH4A 3P4KA 2VO6A 5CU6A 5ETFA 4EWQA 4A9SA 3LXNA 4CMOA 4C57A 4BI0A 3FMJA 3MFRA 4PX6A 4E4NA 2J0MB 4I93A 4MXXA 5M44A 2QHMA 2X9EA 3D94A 3FL4A 3MVJA 4ASZA 4ZS4A 2CN5A 4YZBA 5HIBA 1ZOEA 2WQOA 5IH5A 4RX7A 2B9FA 4UV0A 3L8VA 1JKKA 4P4CA 3PJ8A 2OXYA 2CKOA 2PVHA 4O27B 4WNOA 4FTAA 3UVRA 3TV6A 3CBLA 2H9VA 5CSHA 2H6DA 4AW2A 5GJDA 3CS9A 3GCVA 4O83A 4NW6A 4B8MA 5JN2A 1UU7A 3SD0A 2F2CB 4OTWA 3NVKI 4IX3A 3NSZA 3A4OX 1FGIA 4BHZA 3DK7A 3PA5A 5CXZA 4FMQA 5EHOA 1LUFA 2YM6A 2REIA 4W8EA 4BDBA 1XBBA 5IDPA 4FKIA 3D7TA 3LM5A 5G1XA 2FB8A 4B4LA 4PTCA 3MY1A 2JDSA 5CZIA 4DEDA 2XVDA 1NVQA 2VTRA 5ITAA 2GNLA 2E9VA 4KS8A 4M67A 1Q8YA 4KD1A 4BBFA 4C2VA 2WIPA 2WEVA 3IOPA 4NCTA 3ROCA 2YERA 3VUIA 4BY9E 1MQ4A 4O7SA 2CJMA 5F1ZA 2X81A 1U5QA 4I92A 4RBLA 5HBEA 4ZJJA 3MV5A 4GJ2A 4QMQA 4H1JA 4MD7E 3QCYA 4U79A 3MH0A 3IW7A 2WOUA 2IZTA 4EH2A 4QT1A 5CSPA 5AX3A 3NUSA 3KU2A 4QYHA 1YHWA 4DTAA 1MP8A 3WF9A 3UG2A 2XEYA 5IQEA 4Z55A 5IEXA 3NLBA 4FTTA 4GG5A 4PMTA 5HO7A 2BDFA 3VNTA 4H05A 3KULB 3LJ0A 3U6HA 3KRXA 3TZ9A 5AP0A 3VJNA 4GMYA 3C0IA 2UZVA 2WTCA 4FNZA 4RZWA 4XOYA 2LGCA 2B7AA 3MVMA 4J71A 3SRVA 2PMOX 3D0EA 3N4TA 3DA6A 4YZMA 5H9BA 3RWPA 4BZDA 1H1SA 1W8CA 3P79A 4G1WA 4QQCA 4R6VA 4XV2A 4ZP5A 3ZUVA 3ELJA 4F1MA 4EC8A 2RG6A 2Y9QA 3UNZA 2WMWA 2R3IA 3MDYA 3ZBXA 3HECA 4ZTLA 4EL9A 1A48A 5A54A 3RPSA 3QD4A 3LCSA 4ZTNA 2PHKA 4FUYA 1OZ1A 5CEQA 1YHSA 4FZ6A 4M7IA 3QD3A 3WE8A 5M56A 2NRUA 4D2PA 1BUHA 3G0EA 3PLSA 1IAJA 3PFQA 4DEBA 4JDJA 4XBRA 5L2IA 5LVLA 4CG8A 2JDTA 4S31A 4O1OA 2OFVA 2YACA 4M69A 4QNAA 4UYNA 4E4XA 3DS6A 3V51A 4FTCA 2VTAA 4ZTSA 3GOPA 3K5UA 3E92A 3ZLWA 5AWMA 4IIRA 3CC6A 3HKOA 5DYJA 3E3BX 1W98A 3C1XA 1U5RA 2C6TA 3HX4A 4CYJA 3BYSA 3ODYX 2B1PA 4JR7A 4KNBA 2UZBA 3RBWA 4EQMA 4H36A 5HE3A 3KRWA 4Q2AA 3A62A 4Z9LA 4FTMA 3SOCA 3OY1A 3OF0A 4OR5A 5AUUA 4G5PA 4HYSA 1PXKA 1SNUA 5KCVA 4OBQA 4O0SA 5ANDA 1FBNA 2V7AA 1DI8A 5FTQA 3UOHA 1NY3A 2XNMA 2FUMA 2W1HA 1Q97A 3GC0A 3QRIA 2OJFE 3EB0A 5F4NA 3VRZA 4A9YA 2B0QA 3VN9A 3ZLSA 4TW9A 2R64A 4J97A 3KGAA 4IC7A 3KN5A 5M53A 3CGOA 3Q60A 3LQ3A 2X6EA 4PDYA 4TKSA 3FQSA 3GU4A 3AT2A 4YZCA 1U46A 2ERZE 1UA2A 3HNGA 4NM7A 3EKNA 4P5QA 4QP3A 5AP2A 3TUBA 1AQ1A 3MIYA 4DLJA 5IUIA 3IECA 5B0XA 4D9TA 3EQPA 2P33A 3M2WA 3F3ZA 5AP4A 1M14A 3OMVA 4MXCA 4O7RA 1MRUA 5IPJA 3VW8A 5CQUA 4U80A 3DLZA 3LFDA 4QPSA 3FKOA 4IHPA 2PL0A 5CEIA 5J1WA 4OTQA 5HNIX 3OXZA 5AMNA 4RIYA 4D5KA 5KKRB 2PULA 3TJDA 4FOBA 2C1AA 3MI9A 4W4YA 5CT7A 1MRVA 4HW7A 1Q24A 1YDRE 2C1BA 3D7TB 5E8WA 2IPXA 2PU8A 3AGLA 4GK2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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