5H8EA

Crystal structure of ck2 with compound 7h
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
331
structure length
331
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Potent and Selective CK2 Kinase Inhibitors with Effects on Wnt Pathway Signaling in Vivo.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 331
sequence length 331
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-12-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5h8eA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5h8eA02
5IUHA 3KQ7A 3QA0A 4QP3A 4AW5A 4FOCA 5BMMA 4H3QA 2RFSA 1OIQA 2BFXA 3GU8A 3RTPA 4ACMA 1JPAA 5TR6A 4FKWA 2BPMA 3M1SA 4GUEA 5G1XA 5H8BA 4RQKA 5AP6A 4RGJA 3R7VA 3BLQA 5FXQA 2JDRA 2WTVA 1U46A 2YIRA 3E7OA 2GNGA 2BRHA 4O84A 4U43A 4ANLA 2WTCA 3HYHA 3EQPA 3P79A 4S30A 3AC3A 3ZCLA 3MPMA 4NWMA 5HE1A 1OKVA 4CLIA 3LMIA 3Q5ZA 5H8EA 3VS2A 3G0FA 5CVHA 5BVWA 4PP9A 4G17A 2VWIA 1K9AA 3R8MA 5FUTA 2O64A 3FWQA 2WMTA 3A8XA 3KA0A 4UYNA 5CI7A 2WXVA 4YZ9A 3ZHPC 4CMTA 3JYAA 1WBWA 5EHLA 5EQPA 4ZTRA 4I5CA 4O0SA 4I0RA 3TIYA 3VUHA 2PVFA 3FC1X 1QMZA 5J9ZA 3FI3A 5BUIA 4AT5A 3UIMA 5KHXA 3GCVA 3VN9A 4D2WA 4KA3A 3OVVA 5JGBA 2CKQA 4LRJA 3OUNB 4J95A 5E8TA 4HGEA 2UW9A 5CS6A 3EQBA 3FLYA 1GJOA 3BYUA 3ZLSA 4GK2A 5BPYA 4JAJA 3Q4TA 3LFCA 3BYVA 3MSSA 4J52A 4X2GA 5EDQA 3RAWA 3D5UA 5J1VA 3AG9A 5AUZA 4FR4A 4BWXA 4BHZA 5CSVA 4C36A 3LCSA 4E4LA 4D2TA 4F08A 4RT7A 3P08A 5KZIA 3GUBA 5TOZA 3DKGA 3FKOA 3UOKA 5LXMA 2F2CB 4BTFA 3FY2A 4NKSA 3VS0A 1YDSE 3D2KA 4FTLA 2ITTA 3RCJA 4B8LA 4BI1A 4M13A 1SNUA 1F5QA 4NW5A 4RPVA 2XUUA 5AADA 2A1AB 2BDFA 4I22A 3AGMA 4XS2A 2YISA 4QQTA 1PRYA 2HELA 3MESA 4I6FA 4OTGA 3W32A 3EQCA 2YDKA 2UW7A 1PXPA 3R22A 4QP9A 5E8SA 4EZ3A 3MBLA 4GU6A 2WMXA 3HDMA 1UU3A 2VTRA 3F3VA 2W4KA 2FH9A 3V3VA 3NUSA 4GCJA 4E6AA 5HO6A 3RNIA 2YM8A 2IZRA 2XVDA 4QNYA 1VZOA 4GL9A 2WGJA 5CY3A 1TQPA 1H25A 3UPZA 1Q8ZA 3CTHA 1UKHA 4M68A 3UZPA 4WG3A 5JGDA 4QMVA 3F3TA 1JWHA 2IVTA 2QOQA 3IQ7A 3NW7A 4UN0C 1GZNA 4UMUA 4JQ7A 3FZTA 5D41A 3VF8A 3ZC5A 4EC9A 5KMIA 4KIOA 4A9TA 3LCDA 1CTPE 5EOLA 3ZXTA 5FDPA 4IX6A 1F0QA 2Z7SA 1UV5A 4DG0E 1Y6AA 2C68A 4UY9A 5IU2A 4FTKA 4ENXA 4O7NA 3CQEA 4BZOA 3VWAA 4C37A 4CCBA 4C4IA 1GAGA 3QLGA 3KY2A 3ZFMA 2HW7A 2QD9A 2W1IA 4JDHA 5LARA 3LMHA 2ITVA 3W10A 4L8MA 3PY0A 2ONLA 3FQHA 5M4IA 2C6OA 1ZARA 3MW1A 2GDOA 2XM8A 1KOAA 1ZMUA 2C0OA 3Q4CA 4M69B 4QP4A 5CT0A 4F65A 4WT6A 1TVOA 4U7ZA 4C4GA 3DJ7A 3CR0A 4O7YA 4YHTA 2O8YA 5AUUA 4AA5A 3F61A 4B6LA 3LKMA 3I79A 1FGKA 4IIRA 2B4SB 4ZSLA 4ZLYA 4TKSA 4F7JA 3T9TA 1DI9A 2XIKA 4EORA 3KF4A 3L9MA 1OPKA 5AIKA 4F9AA 3OXTA 4QNAA 2OICA 2YIXA 2XIXA 4W9XA 4WNMA 3QALE 4EQMA 5JKGA 1NVRA 2ITUA 3UMXA 2WQMA 5EKNA 2ZDUA 3F5UA 2CKEA 3NCZA 1UU8A 4QP1A 3C0IA 4U3ZA 3VUMA 2YEXA 2W7XA 4PTGA 4FBXA 3FSFA 4ZSAA 3TNPC 3FKLA 2CHLA 4ORKA 4BHNA 3BGQA 4D5KA 4XG9A 5CEQA 3D7TA 4J8NA 2CLQA 3S4QA 3GCUA 2W5HA 4EUUA 1AGWA 3DGKA 4IWOA 4QMYA 1YHSA 5CU4A 4ANMA 1BL7A 2H8HA 4XG6A 4EOIA 5IMEA 4LUDA 2EB2A 5CSWA 4C2WA 3F2RA 1KE8A 3N4UA 2JDTA 2RIOA 3GU6A 2P33A 3MH3A 4BGGA 5ETCA 3A7HA 2JBOA 1OBGA 4IZ5A 3MFUA 4TN6A 2HWOA 2YCSA 3RP9A 2V7OA 3KVWA 2XYNA 3BELA 2CLXA 4R1YA 2XMYA 4YNEA 5HKMA 4QYFA 5E1SA 4F9YA 3DJ5A 3TUBA 1OPLA 4J71A 4QMMA 1OL7A 2J90A 3JVRA 3SRVB 4NCTA 4RIOA 5DEWA 3M11A 5CWZA 1YXXA 2P55A 4XV1A 2IW6A 4ZAUA 3NNUA 4AA4A 4IAIA 3QUEA 4CMUA 3VAPA 5JRSA 2X6EA 3TV6A 1OIRA 1FBNA 5DT3A 2OJJA 5EK7A 3LVPA 5DT0A 3AT3A 2BDJA 3RPOA 5J79A 2UZNA 3LHJA 4UXQA 4QMSA 2Y8OA 3A7FA 5E8ZA 2F7XE 1QPCA 5AV4A 2RF9A 2CKPA 3NDMA 1CKPA 3IDPA 3RPSA 5DEYA 2JGZA 3R1SA 3KK8A 3UO4A 4EH4A 4ZY6A 3VJOA 3FPQA 5KX8A 2BAJA 4KINA 4BDEA 2CKOA 2ESMA 4BZDA 3HP2A 5DR2A 5CX9A 4HCTA 1OZ1A 5J87A 2VWVA 3O96A 5ICPA 3Q04A 3QWJA 1ZWSA 2EWAA 1W8CA 2VRXA 2WQNA 3DNDA 4L7FA 4PPBA 4FUYA 5D7VA 4EWHA 2HCKA 3UOLA 2W1GA 3IGOA 5FBNC 3F9NA 5J7HA 3C4FA 2UW4A 4IBMA 3DB6A 1SNXA 2C30A 3Q4ZA 5E8WA 2B9FA 4IJ9A 3TG1A 4AN3A 1ZOEA 3Q60A 1ZMVA 2PSQA 3AOXA 4KD1A 2QKWB 4AP7A 1OITA 3VBXA 5KKRC 1FPUA 1RW8A 2HW6A 2Z7QA 5EI6A 3VQUA 4PL4A 4RIWB 3C13A 4UXLA 3NEWA 3ALNA 2B7AA 4MF1A 3IOKA 3K54A 4HOKA 3I60A 4JG8A 4FNXA 5BVEA 4D5HA 2PVLA 4DFUA 5I3RA 2QHMA 3V8TA 2CNQA 4Z3VA 4FIGA 5ETAA 2OGVA 4MEDA 1LEWA 2G2FA 3PZHA 5AR3A 4UALA 2I40A 2PVKA 3VW8A 1CKIA 4C4JA 4OAUC 4MBLA 3R8ZA 1SVHA 4MNFA 2IN6A 4W8DA 2UVXA 4I5HA 4ZTMA 3MIAA 3OT8A 4P2KA 2ZOQA 5GJGA 3RI1A 2OLCA 2YJRA 4U81A 2VO7A 3VS4A 3HGKA 3RKBA 2VTHA 3IKAA 5EQYA 4NTSA 2R3KA 1OMWA 4CYJA 2CNUA 1CMKE 4G6OA 5I9WA 5AP7A 2OXYA 3OW4A 2QHNA 3FUPA 3B2WA 3MTFA 4NM5A 4H05A 5IH4A 2C6LA 2ZM1A 3BU3A 3UODA 4K11A 1P4FA 4BCFA 3E3PA 2B9JA 4YHFA 3UOHA 2NRUA 2Y4PA 2CMWA 3LQ8A 4C7TA 5AV2A 3W2RA 1ZLTA 4LM5A 3F3UA 4RC4A 2VU3A 3DFCB 5AUYA 4Y5HA 4BIBA 4RWKA 2F9GA 3QTQA 4FTQA 3C4XA 5IQGA 4HYIA 1Y91A 5HG5A 2XYUA 3RINA 3ROCA 3NVMB 3REPA 3ZSIA 4ANOA 3KCKA 4M12A 4YTFA 1OECA 3PE1A 5EI8A 2GFSA 4Y8DA 2IZUA 3QTZA 3MA6A 2XK7A 3LFNA 4CCUA 2VGOA 3OZ6A 3FI2A 5HU9A 3IDBA 4M0YA 4FL1A 4PMPA 1UU7A 5A4CA 4EOJA 4XP2A 3IO7A 2EUFB 3P78A 4Z7GA 5FTGA 1KUTA 3PA5A 1FOTA 5AM7A 2QOLA 5CALA 3ANQA 2PVNA 4HJOA 1SMHA 3RPRA 3RM6A 2G01A 3TZ9A 4D58A 5IQFA 1S9IA 4YLJA 4GS6A 4WOVA 5EYCA 3HZTA 1FQ1B 5E8XA 5L2TA 2QU5A 4G34A 4IVBA 4OTPA 3PXRA 4JXFA 3C50A 3DB8A 4U97A 5B0XA 5J8IA 5T3QA 2UW0A 4L7SA 5HIBA 4AN2A 2PUPA 4ZJVA 4C02A 4L53A 4A9UA 3Q2JA 4BWPA 4IM3A 5A54A 3UBDA 3R0TA 2C4GA 2G1TA 3VJNA 1J1CA 4WRSA 1F3MC 5IQHA 5M09A 4R7IA 1OM1A 3ELJA 3MFRA 3NYNA 4U9AA 4AX8A 1PYEA 2J6MA 1Y8GA 3QLFA 2BKZA 4H58A 2JAMA 1WVYA 1M2QA 2R4BA 3RWQA 5KMMA 4AZVA 4I0SA 2CGVA 1O6LA 3ACKA 5CU2A 4W4WA 3GC9A 3ROYA 5AAGA 4BCNA 3PTGA 2GTNA 2R5TA 3FMMA 4PPAA 2Q0BA 2WD1A 3EHAA 3ZFYA 3ZUTA 3W8QA 2FA2A 2F49A 1DAWA 4AG8A 3MGYA 4PX6A 3RBWA 3D83A 4ALWA 5HEZA 3R6XA 2XEYA 4HVSA 3LXKA 1Q99A 4GKHA 4CQGA 3MIYA 4ZLOA 4W8EA 3U4UA 3UPXA 3Q9XA 1BI8A 4X3FC 3I4BA 4M15A 3F7ZA 5L8KA 4MXZA 3MV5A 5C01A 4EJNA 2EU9A 3NR9A 4RQVA 2HK5A 3Q53A 4PMTA 3W8LA 1DS5A 4C4HA 5DPVA 4K0YA 1PMEA 2W9ZB 5DFPA 4IDVA 3TKIA 5GZAA 4JBQA 3W16A 2J0IA 3EYGA 4M8TA 1CM8A 1ZZ2A 2C5XA 3DCVA 3GNIB 3E3BX 1XH9A 2R3LA 4AFEA 4ANQA 5CAVA 2Z60A 5CU0A 3LOKA 4GFMA 1U54B 2XCHA 4O1PA 3NNXA 2WTIA 3UQFA 1YWVA 5D12A 2XNEA 5EOBA 1OB3A 3CKWA 5DBXA 4M69A 5HE0A 2UZWE 2YM4A 2QODA 4ONAA 4FSRA 4QMLA 5D1JA 4LL5A 5DRDA 4BCMA 5CZIA 4O7VA 4LGGA 3P7AA 4Y95A 5HCYA 1STCE 2OZOA 4MXCA 5GINE 2C0IA 2WOUA 4GW8A 3DXQA 4QMXA 4FG7A 3ZSGA 2VO0A 3Q6WA 4IXPA 4AOTA 3QYWA 4GG7A 4ZY4A 4JJRA 2OJ9A 4FZFB 4LV5A 4OTRA 2W1FA 3IDCA 3PYYA 3PVUA 3G90X 4ZP5A 3FMEA 3PY1A 4GYGA 4FV6A 3MH1A 2QNJA 3MA3A 5CSHA 2F7ZE 2WTJA 3PJ3A 2OBJA 3T9IA 3UMWA 2OZAB 2XIRA 5CXZA 1DI8A 3PJCA 3PDTA 3PXFA 1IAJA 2X6DA 2I1MA 2W4OA 3M2WA 2WMSA 4HYUA 2B0QA 2B55A 2PVYA 4RWIA 4XG4A 2JKOA 4N57A 4NL0A 5GNKA 4ANSA 4BZNA 3UGCA 5AIRA 5I9VA 4DINA 5HU3A 2XK6A 3HNGA 4DH8A 4E3CA 4R5YA 1XO2B 4FKJA 2UW3A 1UNLA 3D2IA 4XG3A 5FDXA 2JITA 4BL1A 1Z57A 2QONA 5L2QA 3UO6A 4DFXE 4GUBA 4AT4A 5LWNA 4E4MA 4ZMEA 3R9DA 2R3JA 2PE2A 4MBJA 4A4XA 2C5NA 5CAPA 4KRCA 4JVGA 3BYSA 4XMOA 1ERKA 2W5BA 5HD7A 5CQWA 4BB4A 4O7ZA 2UW6A 3PSCA 3R7IA 3WARA 3FXXA 4QTCA 3FC2A 3QZFA 4ZIMA 3VQHA 4Z55A 3CLYA 3SRVA 5IA1A 3HMOA 2Q0NA 1REKA 2BTRA 5D11A 3DS6A 1KWPA 1VJYA 4AZFA 1WBSA 3KN6A 3FZPA 3P0MA 2V55A 3H9FA 2IVSA 3EQDA 4OTQA 4F1OA 1SVGA 1B39A 3QCQA 4OGRA 5KCVA 2VWBA 2JFLA 3NIEA 4CEGA 4CRSA 1PXJA 2JDVA 3KVXA 3NAYA 3NAXA 4DLJA 4NEUA 3ZH8A 5BUJA 3EZRA 2OH0E 4LUEA 4NIFA 3TZ7A 3PJ2A 2VAGA 4FV3A 4DT8A 3NS9A 4OTWA 1O6KA 3K5VA 3DNEA 2RG5A 3DA6A 2PZIA 2YABA 3QTSA 3IONA 4ID7A 1L3RE 3R28A 4TWCA 3WIGA 5B7VA 1Y6BA 3ZEWA 4XYFA 5A9UA 2NNWB 1ZYLA 3L8VA 2BRNA 2B52A 2VNYA 3TI1A 3P86A 3KN5A 4I21A 4B7TA 4A9YA 4K18A 4F9WA 1OL2A 3EN7A 4X6QC 3MB6A 1IR3A 4U40A 3ITZA 3UYTA 4USFA 2BMCA 3LZBA 3HV7A 3FMDA 3OY3A 4XV2A 4NT4A 4X2NA 3RGFA 4DYMA 3LIJA 2FO0A 3BYOA 3W2PA 3DT1A 3OTVA 4FV2A 4LMUA 4O7RA 2YIWA 3QCYA 4YJOA 3JR1A 1JNKA 3GCQA 4IFGA 3CEKA 3VRZA 1CDKA 2EVAA 3ULIA 3ZONA 4A9SA 5KBRA 4FSZA 4O7SA 3TUCA 4G5PA 4P5QA 5LOHA 2PULA 3S95A 1SZMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1PMU A;  5HBH A;  1JSV A;  2W1H A;  4JLC A;  3SGC A;  1M2P A;  4QMP A;  4RX5 A;  2WQB A;  3R9H A;  1H1Q A;  2DWB A;  4JX7 A;  3Q3B A;  3SKC A;  2XRW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2IVT A;  2QOQ A;  3IQ7 A;  3NW7 A;  4UN0 C;  1GZN A;  4UMU A;  4JQ7 A;  3FZT A;  5D41 A;  3VF8 A;  3ZC5 A;  4EC9 A;  4BJJ B;  5KMI A;  4KIO A;  4A9T A;  3LCD A;  1CTP E;  5EOL A;  3ZXT A;  5FDP A;  4IX6 A;  1F0Q A;  2Z7S A;  1UV5 A;  4DG0 E;  1Y6A A;  2C68 A;  4UY9 A;  5IU2 A;  4FTK A;  4ENX A;  4O7N A;  3CQE A;  4BZO A;  3VWA A;  4C37 A;  4CCB A;  4C4I A;  1GAG A;  3QLG A;  3KY2 A;  3ZFM A;  2HW7 A;  2QD9 A;  2W1I A;  4JDH A;  5LAR A;  3LMH A;  2ITV A;  3W10 A;  4L8M A;  3PY0 A;  2ONL A;  3FQH A;  5M4I A;  2C6O A;  1ZAR A;  3MW1 A;  2GDO A;  2XM8 A;  1KOA A;  1ZMU A;  2C0O A;  3Q4C A;  4M69 B;  4QP4 A;  5CT0 A;  4F65 A;  4WT6 A;  1TVO A;  4U7Z A;  4C4G A;  3DJ7 A;  3CR0 A;  4O7Y A;  4YHT A;  2O8Y A;  5AUU A;  4AA5 A;  3F61 A;  4B6L A;  3LKM A;  3I79 A;  1FGK A;  4IIR A;  2B4S B;  4ZSL A;  4ZLY A;  4TKS A;  4F7J A;  3T9T A;  1DI9 A;  2XIK A;  4EOR A;  3KF4 A;  3L9M A;  1OPK A;  5AIK A;  4F9A A;  3OXT A;  4QNA A;  2OIC A;  2YIX A;  2XIX A;  4W9X A;  4WNM A;  3QAL E;  4EQM A;  5JKG A;  1NVR A; 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