2BRMA

Structure-based design of novel chk1 inhibitors: insights into hydrogen bonding and protein-ligand affinity
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
268
structure length
263
Chain Sequence
EDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure-Based Design of Novel Chk1 Inhibitors: Insights Into Hydrogen Bonding and Protein-Ligand Affinity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 73
structure length 263
sequence length 268
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2brmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2brmA01
2BTRA 3M1SA 4Y46A 5DVRA 1IASA 1Z5MA 2J0MB 4H1MA 5FDPA 2Z7QA 3FY2A 5JRQA 3LFCA 4BTMA 3PYYA 5A9UA 2HW7A 2VWWA 4ZP5A 3IPHA 4NCTA 4U7ZA 5EQYA 4CFXA 5HU3A 4RWLA 2XKDA 3BU5A 3OBGA 4M12A 5E8YA 5DWRA 4FEUA 4FG7A 5HE0A 1H28A 5JFVA 3I81A 2BDFA 3DK7A 3PLSA 3HAMA 2XCHA 3Q5IA 4XV9A 3VHKA 4FE2A 3OUNB 3OXIA 3RK9A 4W4YA 4AQCA 2UVZA 5E1SA 3I1AA 1WBPA 2CCIA 5CEOA 2CHLA 4USDA 4HVSA 3POOA 2HOGA 1NVSA 1U54B 4I41A 4IX4A 4F7LA 5J9ZA 5L2IA 5LWNA 5C8KA 2ZJWA 4DA5A 2GMXA 1XH7A 4LV8A 4PMSA 4XJ0A 4AN9A 5BPYA 5CU2A 3DGKA 4JS8A 2OFVA 1XKKA 3KRWA 4IZAA 4GUBA 4HYSA 3TUCA 2RKUA 3UO5A 4W8DA 2OJJA 5DRDA 4ZSEA 3WZUA 2YDKA 5HX8A 1ERKA 4IWPA 4U43A 1Q8UA 2EVAA 5I3RA 2FVDA 3QTIA 2PSQA 1PRYA 4ANLA 4O38A 3SKCA 4YTFA 2R4BA 4J95A 1TQPA 3LXKA 1YDSE 3HZTA 2XBAA 3QQUA 5IPJA 4CFVA 3N4TA 5ETCA 3FLSA 3DNEA 5J1VA 2JKMA 1M2PA 2RGPA 4FIEA 3FMDA 4I5HA 2JDVA 2UW4A 3LJ0A 3Q6WA 4O84A 3P7CA 4OBOA 3LLTA 3QF9A 1ZAOA 4R7BA 3BYMA 4U40A 2CKOA 2ITXA 4FZ6A 4FTNA 5M07A 3ZMMA 4H1JA 3ULIA 4GJ3A 3O51A 4R7IA 2ITWA 3VUHA 4F7JA 5FG8A 2NO3A 3FLYA 3UNJA 4D4YA 3QZFA 2W0JA 2XS0A 1M52A 2WMQA 4DH8A 3LQ8A 3VULA 2B54A 4MQ1A 2FSMX 2VWIA 4Z16A 3ATTA 3PA5A 3QZGA 4MHAA 3QKKA 5HE2A 5FEDA 4UXQA 2VU3A 2F7EE 3R22A 4IAYA 4MX9A 4M69A 1UU9A 2VX3A 5HHWA 3DB6A 4BZOA 3ET7A 3QCYA 4CMOA 4CZTA 4AW5A 4IM3A 2BROA 2YLFA 3BQRA 5B0XA 3FMLA 1U59A 3BKBA 3R7GA 5CENA 3VWAA 3R6XA 1RDQE 3TUBA 3GCUA 1ZOEA 3I6UA 3MWUA 4FSTA 4JDIA 3W18A 3KF7A 5HCXA 3W33A 2FYSA 4FTRA 4BCKA 1PXJA 2PVHA 4U80A 4JIKA 4YTHA 2FH9A 4FKIA 5ACBC 3RMFA 1ZYSA 4CQEA 4FTIA 2OU7A 4U9AA 5LMKA 5BYLA 3NW6A 4YU2A 3OT8A 5HVYA 2XNOA 4CCUA 4OLIA 2PUUA 3HA6A 2OZAA 4FL1A 1A9UA 4MD8E 4G6NA 4EKKA 2R7BA 4AT4A 5F4NA 2CKPA 5IG1A 3P08A 4NH1A 4E5BA 3EFLA 3P86A 4FX3A 2OO8X 5BYYA 2JEDA 4K1BA 1SVEA 2VTJA 5CSXA 4FKWA 4UMPA 3ZO3A 4K77A 1EH4A 4CYIA 5GNKA 3NYVA 5IH5A 5AUYA 4YJNA 3JY0A 1Y8GA 4QT1A 3OXTA 4KSPA 2JAVA 3WE4A 3NCGA 3F61A 5EFQA 3DTCA 3QC9A 4FTKA 5TT7A 4HOKA 4JBVA 5A46A 2AUHA 4ZTLA 4OR5A 4F6WA 3BHYA 4DTBA 1O6YA 4S30A 4O7RA 1M2QA 4YPSA 3R9HA 2XM8A 2W1IA 3TZ7A 4X2FA 4FOBA 3QA8A 4FKGA 3VS2A 1NT2A 3PXQA 5BVKA 1QPDA 4IX6A 2UZVA 4UEUA 5HTIA 4H58A 3FQHA 3SGCA 3ULZA 4OAVB 1MRYA 2C0TA 4IM0A 3NVKI 3P0MA 3HRFA 2C3KA 1VEBA 5FQDC 3AC2A 2QOCA 4UB7A 4QOXA 2NNWB 3OOMA 4LGGA 4WUAA 1UVRA 2R3OA 4AZFA 2I1MA 4O7SA 5IQAA 3V8TA 2YN8A 2ZV7A 2PYWA 1UWHA 2IZTA 2XUUA 3ODYX 3Q9WA 5LQFA 3D7TB 2YACA 3PE1A 4FSUA 4IVBA 5AM6A 4IAZA 4D2VA 3CQEA 2X2MA 1OL2A 3C0GA 2Z2WA 2YIWA 4H3BA 3SHEA 2JD5A 3SW4A 2JDTA 3K3JA 4D4RA 1V0PA 4D2WA 3F3UA 4EBVA 1UWJA 4P90A 4ENYA 5AUTA 4JG8A 4YC3A 2F49A 4DFZE 5AR7A 3MIYA 4R3CA 3ZRKA 4CV9A 4X7QA 2C0OA 3G5DA 3S4QA 4NKAA 1DS5A 3ZZEA 3K3IA 5AIRA 3PDTA 4BTKA 3PZHA 4EWQA 3G15A 1K3AA 4MXCA 1FVRA 3OZ6A 2UW0A 4MD7E 2ESMA 4FZDB 4EYJA 1WBOA 2W1EA 3WF6A 3RZBA 2OICA 2WMVA 4IM2A 4DTKA 3R63A 2CKEA 3RI1A 2OJ9A 5AP1A 3CPCA 3RAWA 2OJIA 3U4WA 3W2CA 2RG5A 4NTTA 3ANQA 3MB6A 3HA8A 4ZZNA 4EWHA 3EFWA 2BRGA 3FZRA 4GW8A 4LUEA 4BI1A 3U8WA 2X9FA 1A48A 5FUTA 3G9NA 2GFSA 4N6ZA 3T8OA 2AYPA 4FKQA 4DHFA 1VZOA 4RIXA 2CKQA 2VTSA 4JDHA 1FQ1B 4XH6A 4RLLA 3UDBA 4O7YA 1DI8A 4D1XA 4PL3A 4G6OA 2VX1A 1JAMA 2PL0A 2XNNA 2QVSE 3FZ1A 3P7AA 4JDKA 5CXHA 5ETFA 4B4LA 2WTCA 5DR6A 3GBZA 3KRRA 4OT6A 5DR9A 4QPMA 4EH4A 3R1SA 4FOCA 4FYNA 1PMUA 2OLCA 3ZFXA 3O8UA 3GU6A 3PE2A 4IX5A 2GQRA 2OI4X 1J1CA 4C3FA 5A54A 5IA0A 2O3PA 2XMYA 5CQWA 2YJSA 5FEEA 3DQWA 3OD6X 4G3EA 4TWNA 3MGYA 5B2KA 1J3HA 4C0TA 1GJOA 2WD1A 3THBA 3KVWA 3MS9A 3FYJX 4HVGA 4OAUC 4QP7A 4QNAA 4XBUA 3ZDUA 4BDAA 4QQTA 1J7UA 2XIRA 3ODZX 4PDSA 4O27B 3LPBA 3EQPA 4YR8A 5GHVA 5JZJA 3DZQA 3V5LA 3NUSA 4XOZA 4XS2A 5L2TA 2R3QA 3PZEA 3AC3A 5EYDA 3G2FA 4BY9E 3P78A 4BCIA 5F94A 3HUBA 3TN8A 4C4HA 3GQIA 5FD2A 4DEAA 3IGOA 3OWJA 4FTTA 3BBWA 3PFQA 3R83A 1WMKA 4RFZA 1UU3A 2FSOX 2OF4A 3MH0A 4FG8A 2Y6OA 3MJ2A 4M68A 4NW5A 5FTQA 5CVFA 5ANDA 5LWMA 3TV4A 4C4JA 2OXDA 2ZAZA 3W10A 2BIYA 4NZWB 5E8TA 4FV3A 4J96A 3HAVA 1ZZLA 3CTHA 3R0TA 3HRBA 2KTYA 4N6YA 2BALA 5DI1A 4ZTNA 3PVGA 5A4CA 3CBLA 5ACKA 4CCBA 3NPCA 3OEZA 3DOGA 4F08A 3IW4A 4PV0A 4R8QA 4TTHB 3UNKA 1OBGA 4X2NA 2VN9A 4CNHA 3AQVA 2EB2A 3V5JA 4IJPA 3ZRMA 5AJQA 4KKGA 4Y73A 3TTJA 3COIA 2WPAA 3CD8A 2PHKA 4D5KA 4U6RA 3NGAA 1B39A 4I5MA 4YJSA 4DTAA 4ZSJA 4BCPA 4PY1A 4YJTA 2OH4A 1GZOA 3F3ZA 2WU7A 5IEVA 2VTAA 3BI6A 3CGOA 1UKIA 3PJ1A 5T6KA 4HVHA 5EM5A 5BMMA 4P2KA 1H0WA 4J1RA 3GCPA 4OTWA 4O86A 5HLNA 3JY9A 1P4FA 4ALWA 5IA2A 4O0UA 4Y8DA 1JBPE 3LHJA 3QWJA 4AN2A 2UW3A 5CAQA 2XIZA 4QP1A 3V51A 5JFSA 4FTLA 4BBMA 2J51A 4OBQA 4RSSA 5EKNA 3EN5A 1H01A 3BLRA 4FKLA 5CSPA 4C3RA 2WB8A 3TI1A 3K2LA 4GKIA 4HYUA 5IUGA 1YHWA 4KIQA 2VTHA 1MQBA 4FODA 5D12A 3R8PA 1ZMWA 2R5TA 3V5PA 3EWHA 3FE3A 3PJCA 3FI3A 4BCFA 4O0VA 2DQ7X 2G2FA 3OTUA 5HD7A 4A06A 3OWPA 4O0WA 3FLNC 5HEZA 3REPA 2BVAA 4FV2A 4B0GA 1CKIA 3M2WA 5HTCA 5A6OA 4E1ZA 2QOBA 4QP9A 2WTJA 4ERKA 3L9MA 4YO6A 3F88A 4I20A 1FMKA 3D5VA 5BUIA 4FSZA 2PVMA 1REKA 4JQ8A 4CLIA 1L3RE 4CD0A 5IUHA 3DBFA 4I6BA 3R8MA 1TVOA 4O82A 3Q04A 5C4KA 3TT0A 5AV1A 3CCNA 1YI3A 3LCKA 2QG5A 3F5UA 1MP8A 3CQWA 2UZWE 4RJ5A 5CI7A 4F1MA 3ATSA 2BKZA 2CJMA 4Y72A 4U97A 2CDZA 5KMKA 3W1FA 5CSWA 1YXUA 3DU8A 1ZYCA 4MXYA 2UW6A 4AT3A 2YDIA 5EM6A 3AGLA 3IONA 4FTCA 2Q0BA 3ZCLA 5LOHA 1SNXA 3A4OX 2C6IA 4MBIA 3ZLWA 2REIA 3UZRA 3UZTA 4DG2E 1PXMA 2ETRA 4J52A 4MXXA 5FLFA 3UOHA 4Z9LA 1VYZA 3IO7A 4K33A 1XQZA 3KN5A 4E93A 2PZIA 2W5AA 5JQ8A 5L8LA 4DFLA 4ZS4A 3EJ1A 4E73A 2UZNA 2VTLA 2ZYBA 3CXWA 3O2MA 4OTRA 2IG7A 2A0CX 3QUEA 4TZRA 4RIOA 2WMBA 1YWNA 2J0JA 2DS1A 5T68A 3O8TA 5CF4A 1JQHA 2QONA 4NM0A 4B8LA 1ZMUA 1NY3A 3UO4A 2Y8OA 4TXCA 4ANSA 2J0LA 4CG8A 2PVLA 4QTCA 4X3FC 5GZAA 3U4UA 4FTOA 1WBNA 2C3LA 4YO4A 1OBDA 4AGDA 4FV7A 4FTAA 3KL8A 1IG1A 3UTOA 3AT4A 1KE5A 3QRTA 3QTUA 3HMOA 4JOAA 4MVFA 3H3CA 1OZ1A 4LI5A 4ZZMA 4QTEA 3A8XA 1OM1A 5BMSA 5HTBA 5A14A 5D7VA 4JAJA 4RFMA 4X3JA 4HVIA 2C30A 3PWDA 3AD4A 1BLXA 3U6JA 3TTIA 2X9EA 4FIHA 4ASDA 1ZXEA 5D7AA 4EC9A 1OKWA 2KULA 4PTEA 4ZMFA 4BBFA 2R3RA 2GHLA 4OW8A 2VO6A 2CNUA 4OBPA 2BKKA 5JN2A 2R3HA 1GOLA 2FA2A 3E5AA 4XYFA 3NUNA 4L42A 4DT9A 4GFOA 5A4TA 3ZFMA 4ZK5A 3UG2A 3FEGA 2VGOA 4IDVA 5T3QA 2QLUA 5CS6A 3FSKA 5IQHA 2QOHA 4WO5A 3CQUA 2P2IA 3TV7A 3C9WA 3EN4A 2I6LA 4FR4A 3R8VA 1PXNA 3GENA 3UIMA 3E88A 3EB0A 1ZOHA 4IJ9A 4NJ3A 4PWNA 3E8NA 2PZ5A 3MDYA 5ANKA 3G9LX 4IEBA 4KD1A 4QTBA 3TKUA 4QP6A 2XIXA 4TYHA 4F0GA 5ANGA 4UYAA 2HWOA 3FKOA 3RINA 4RIWA 3RTPA 3SRVB 2GS6A 5KMLA 3D5WA 3MA3A 3AD5A 4OTFA 4KBAA 1FVTA 4MEDA 3C0IA 3DB8A 2HWPA 4BB4A 4IQ6A 2ACXA 1CKPA 3QTSA 4WT6A 4L3PA 4BKZA 4NFMA 4ALVA 4QTDA 2FB8A 3IG7A 4H36A 1PMEA 3LAUA 3F69A 3PVWA 3R2BA 4AOIA 2CCHA 3DT1A 4QD6A 4R5YA 2FGIA 3HUCA 2WU6A 3IW5A 3CSVA 2QO7A 4EQUA 2X4ZA 3SAYA 1JSTA 2IZSA 2UVXA 3PA3A 4X21A 3RGFA 4Z3VA 2QI8A 1ZOGA 1H1SA 2Q83A 4KRDA 3C13A 2QOFA 3QQGA 2UW7A 3UJGA 3BHHA 2OJGA 4HYHA 2Z7RA 4PMTA 4RZWA 4W4VA 5AWMA 4DCAA 4Q5EA 3F3VA 4FKVA 2V22A 4RIYA 2X7GA 4CEGA 3DBEA 2QD9A 4CMUA 4M84A 5M06A 2O2UA 4PX6A 3CJFA 4FF8A 4NTSA 1NXKA 2WTDA 5M4IA 4WG5A 3BU3A 2YIRA 4JAIA 3TNIA 1STCE 4EOOA 2P55A 3FSFA 5LVLA 2HXQA 4AACA 5J1WA 3MY5A 5CU0A 5TKDA 4ID7A 4R1YA 1YRPA 3SVVA 4AW1A 4IACA 1SVGA 2Z8CA 1BYGA 4DF3A 3LFEA 5E8UA 3L8VA 4FYOA 2C47A 4AA4A 5J7BA 3L1SA 3HYHA 3PY0A 2QU6A 3AC4A 2UW9A 2UZEA 5ANEA 3ZM9A 3W2RA 5TR6A 2GHMA 4D28A 5EW3A 3FDNA 4I92A 4ENXA 3L9NA 3TKHA 2C5VA 1TQIA 1YHSA 3DAKA 3LKMA 3GGFA 3EH9A 1GZNA 2HZ0A 2X1NA 5JT2A 3AC1A 2BZKB 1LEWA 2OFUA 4A9UA 5DRBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4AXC A;  2BTR A;  3M1S A;  4Y46 A;  5DVR A;  1IAS A;  1Z5M A;  2J0M B;  4H1M A;  5FDP A;  2Z7Q A;  3FY2 A;  5JRQ A;  3LFC A;  4BTM A;  3PYY A;  5A9U A;  2HW7 A;  2VWW A;  4ZP5 A;  3IPH A;  4NCT A;  4U7Z A;  5EQY A;  4CFX A;  5HU3 A;  4RWL A;  2XKD A;  3BU5 A;  3OBG A;  4M12 A;  5E8Y A;  5DWR A;  4FEU A;  4FG7 A;  5HE0 A;  1H28 A;  5JFV A;  3I81 A;  4O4F A;  2BDF A;  3DK7 A;  3PLS A;  3HAM A;  2XCH A;  3Q5I A;  4XV9 A;  3VHK A;  4FE2 A;  3OUN B;  3OXI A;  3RK9 A;  4W4Y A;  4AQC A;  2UVZ A;  5E1S A;  3I1A A;  1WBP A;  2CCI A;  5CEO A;  2CHL A;  4USD A;  4HVS A;  3POO A;  2HOG A;  1NVS A;  1U54 B;  4I41 A;  4IX4 A;  4F7L A;  5J9Z A;  5L2I A;  5LWN A;  5C8K A;  2ZJW A;  4MUQ A;  4DA5 A;  2GMX A;  1XH7 A;  4LV8 A;  4PMS A;  4XJ0 A;  4AN9 A;  5BPY A;  5CU2 A;  3DGK A;  4JS8 A;  2OFV A;  1XKK A;  3KRW A;  4IZA A;  4GUB A;  4HYS A;  3TUC A;  2RKU A;  3UO5 A;  4W8D A;  2OJJ A;  5DRD A;  4ZSE A;  3WZU A;  2YDK A;  5HX8 A;  1ERK A;  4IWP A;  4U43 A;  1Q8U A;  2EVA A;  5I3R A;  2FVD A;  3QTI A;  2PSQ A; 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 2OIC A;  2WMV A;  4IM2 A;  4DTK A;  4DDG A;  3R63 A;  2CKE A;  3RI1 A;  2OJ9 A;  5AP1 A;  3CPC A;  3RAW A;  2OJI A;  3U4W A;  3W2C A;  2RG5 A;  4NTT A;  3ANQ A;  3MB6 A;  3HA8 A;  4ZZN A;  4EWH A;  3EFW A;  2BRG A;  3FZR A;  4GW8 A;  4LUE A;  4BI1 A;  3U8W A;  2X9F A;  1A48 A;  5FUT A;  3G9N A;  2GFS A;  4N6Z A;  3T8O A;  2AYP A;  4FKQ A;  4DHF A;  1VZO A;  4RIX A;  2CKQ A;  2VTS A;  3NFG B;  4JDH A;  1FQ1 B;  4XH6 A;  4RLL A;  3O5A A;  3UDB A;  4O7Y A;  1DI8 A;  4D1X A;  4PL3 A;  4G6O A;  2VX1 A;  1JAM A;  2PL0 A;  2XNN A;  2QVS E;  3FZ1 A;  3P7A A;  4JDK A;  5CXH A;  5ETF A;  4B4L A;  2WTC A;  5DR6 A;  3GBZ A;  3KRR A;  4OT6 A;  5DR9 A;  4QPM A;  4EH4 A;  3R1S A;  4FOC A;  4FYN A;  1PMU A;  2OLC A;  3ZFX A;  3O8U A;  3GU6 A;  3PE2 A;  4IX5 A;  2GQR A;  3BLA A;  2OI4 X;  1J1C A;  4C3F A;  5A54 A;  5IA0 A;  2O3P A;  2XMY A;  5CQW A;  2YJS A;  5FEE A;  3DQW A;  3OD6 X;  4G3E A;  4TWN A;  3MGY A;  5B2K A;  1J3H A;  4C0T A;  1GJO A;  2WD1 A;  3THB A;  3KVW A;  3MS9 A;  3FYJ X;  4HVG A;  4OAU C; 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