4CRLA

Crystal structure of human cdk8-cyclin c in complex with cortistatin a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
362
structure length
339
Chain Sequence
DDKMDYDFKVKLSSERERVEDLFEYEGCKVGRGTYGHVYKAKRKDGKDDKDYALKQIEGTGISMSACREIALLRELKHPNVISLQKVFLSHADRKVWLLFDYAEHDLWHIIKFHRASVQLPRGMVKSLLYQILDGIHYLHANWVLHRDLKPANILVMGEGPERGRVKIADMGFARLFNSPLVTFWYRAPELLLGARHYTKAIDIWAIGCIFAELLTSEPIFHCRQPYHHDQLDRIFNVMGFPADKDWEDIKKMPEHSTLMKDFRRNTYTNCSLIKYMEKHKVKPDSKAFHLLQKLLTMDPIKRITSEQAMQDPYFLEDPLPTSDVFAGCQIPYPKREFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Mediator Kinase Inhibition Further Activates Super-Enhancer- Associated Genes in Aml
pubmed doi rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE 8
total genus 105
structure length 339
sequence length 362
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2014-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4crlA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4crlA01
4MTAA 2G2IA 4BCGA 4B8MA 1LR4A 4BTJA 3W2SA 1HCKA 5DBXA 3UOJA 3I6WA 4G3CA 3EJ1A 4MBJA 4TL0A 3FPQA 1BL6A 4OGRA 4FNWA 4KS8A 4WRGA 5H8BA 1V1KA 2ITNA 1YXVA 1BX6A 3QTRA 4FNXA 4EWHA 2JAMA 2ERZE 3BYUA 3GOKA 4RFZA 4XLIA 5T3QA 4FKIA 5BVOA 5DA3A 5M4UA 4FIIA 3R7OA 1RDQE 4EQMA 2R3RA 4IC7A 3R8MA 2XNBA 3E62A 1UNHA 4IXPA 3BIZA 4C02A 5F95A 4CZYB 2ZM4A 3NCGA 2CCIA 4WOVA 4EOMA 2E9OA 4C58A 4DGGA 5JQ5A 2QR8A 3BHHA 3QTZA 1Q99A 4U44A 4RT7A 4AF3A 1UVRA 2ZM1A 2XCHA 2O63A 4FSRA 2I0HA 2XIXA 3VF8A 4NKSA 4ZTNA 2VTQA 4O7NA 4NK9A 4XG6A 5AFVA 4ZLYA 1ZLTA 1WBSA 4I6FA 3BX5A 4QMXA 3V6RA 3PY0A 4L42A 4O6EA 1S9IA 4ZK5A 4WNKA 2C6OA 2VWBA 3DKGA 4AFEA 4JAJA 3V5JA 3TTJA 2RSVA 3R8UA 3TNPC 4ZJIA 3FLYA 4G3GA 3VUGA 4NL0A 5JFVA 2V5QA 4L68A 4O1PA 3D7TB 4E4XA 5L4QA 4DF3A 1URCA 4RJ5A 5L2TA 5DEYA 4JBVA 2VTJA 4R7HA 4FG8A 2GU8A 4XRJA 4AZVA 4CEGA 1KUTA 5HTIA 2HWPA 4YURA 2R0UA 1ZMUA 3CPBA 5KHXA 3Q6WA 1BMKA 4DEBA 2B54A 2YEXA 2BKZA 3ORNA 1ZYCA 4FVRA 5HE1A 2C0IA 3TNWA 5IDNA 3TTIA 4DH7A 4R8QA 2Y7JA 3RTPA 2OFVA 3E3BX 5HE2A 1Q8UA 3L8VA 3MIYA 5GZ9A 2C6MA 2X7GA 4D9TA 4OTPA 2C30A 4XUFA 3V51A 4FL2A 4G6OA 4II5A 3WF8A 3R1NA 4UZHA 2R3NA 4NT4A 4AQCA 3P4KA 2C5VA 5A4LA 4YJPA 3D2IA 3NUSA 3VUMA 3AD6A 4A4OA 4G31A 1GIHA 5HQ0A 2DYLA 2IW6A 2RIOA 2XKEA 2XNEA 3FYJX 3RPOA 3ZHPC 2YZAA 3KL8A 3POOA 2XYUA 4U43A 5LMBA 3H10A 2Q83A 4ZZMA 2HOGA 1XH8A 4C62A 4TY1A 4Z3VA 4J7BA 5C4KA 1H1QA 1VJYA 4NM0A 5DT4A 1IA8A 4MXYA 5BYLA 5JT2A 4DGOA 3PJ3A 3UDBA 5L6OA 4TT7A 5CSHA 5CF6A 5IQCA 1NXKA 1H24A 1VYWA 3VS5A 3MVLA 4YJNA 4FTJA 4IH8A 4BKJA 5K9IA 2E2BA 4B7TA 4FI1A 4GUEA 4MQ1A 1OI9A 4IEBA 4LG4A 4BWKA 3O8UA 4WBOA 1ZXEA 4KBCA 5GZAA 4LRMA 4IVDA 2R3LA 4FTKA 3BQCA 4FIGA 4UMTA 1XH5A 4YZNA 3Q9YA 3R21A 3KVXA 2HZ0A 3WF7A 2JFLA 4RLKA 2PY3A 4RRVA 4A9SA 3VQHA 1VZOA 3E88A 4Q5EA 1PXNA 3AT3A 3C4FA 3PFQA 3E87A 4JAIA 3ID6C 3QQFA 5BQ0A 2C3LA 5M4CA 4PDPA 2WKMA 3O23A 4YJTA 1E9HA 1MRYA 1RQQA 3LXPA 3C4WA 5DRDA 4FV5A 1GIIA 2I6LA 4FSWA 5AUYA 3ZRMA 1XH7A 2W9ZB 5E8XA 1Q41A 5LARA 4M69A 2YJRA 4EJ7A 2I0EA 3ZFMA 1OL1A 2BAKA 3ZM9A 2BROA 2C47A 4EK4A 2C6KA 3MY0A 2R3OA 3OXIA 3PJ2A 5ETIA 1W7HA 1T45A 3E8EA 4IX3A 5BVEA 3QRUA 4DBNA 3QQLA 4UEUA 4PQNA 1XH6A 5FM3A 4ZS0A 1HCLA 3VUKA 2BMCA 5EFQA 3TI1A 3FMNA 3SGCA 2WTJA 2XK4A 4QQ5A 3VS2A 5G1XA 5BVDA 5FXQA 3UJGA 3OT8A 3ZRKA 4BHNA 5LQFA 3FI8A 2R3IA 2JITA 4EONA 1AGWA 3OTUA 3T9TA 4DHFA 2LAVA 5CQWA 3UNKA 1M52A 3FHIA 1Q97A 3GU8A 5CQUA 5FQDC 3PXRA 2Z2WA 4FZFB 4QMWA 2X2KA 2BVAA 3IGOA 2OZAA 3VW8A 1OBGA 3HV4A 4PV0A 3C4CA 3R83A 1JBPE 1M14A 5IF1A 2R5TA 3LFEA 3Q9XA 2BIKB 4FL3A 1PKDA 2UVZA 4RJ7A 5E8YA 3EN4A 5IA1A 3UP2A 4X3FA 3DB8A 4IWQA 3CKXA 4M68A 4C35A 2W96B 2IW8A 2OO8X 3K5VA 3QTWA 3RZFA 3KRWA 4HYUA 4RWIA 5TR6A 4W4WA 3NAXA 4UV0A 3MY5A 2NNWB 3VN9A 1GAGA 3EQFA 2I0VA 4F70A 4MK0A 3CY3A 1I09A 3HYHA 4OBQA 5K0XA 3LHJA 4ZSLA 2J9MA 4MKCA 4C33A 3DOGA 4RGJA 4W9WA 2C6IA 5J5SA 1ZWSA 3LLAA 4PMTA 4EH3A 4EOLA 2OSCA 4BDFA 3TIZA 4WO5A 3DPKA 4ZY6A 2OICA 4JNWA 4JRVA 5DNRA 2VWWA 3HL7A 4QP9A 2FSOX 3I0OA 2XKDA 5BVNA 3F7ZA 2GNGA 1JPAA 2H34A 2XK6A 5F20A 4CYIA 2A27A 2YDJA 3DQWA 3WF5A 4YTHA 3MJ2A 3Q5ZA 3WOWA 2W5HA 1H1PA 3ALNA 2R3GA 4F7NA 5HU9A 1ZYJA 3LM0A 4MVFA 2I40A 5ACBC 3ULZA 2HCKA 4D4VA 4D1SA 2QOKA 4DEGA 4OTRA 1PJKA 3UG1A 5HKMA 3LFSA 4DLIA 3LFDA 4I0TA 2PVHA 3ZC5A 4EI4A 5JRQA 4KA3A 1X8BA 4GT5A 5L8KA 4I4EA 4YHTA 3LW0A 1MP8A 4U97A 3EL7A 2QO9A 4HNFA 3D7TA 4DA5A 1K3AA 3DTWA 4A4LA 1YI6A 5FEEA 2EXEA 2WTIA 3JXWA 4J71A 3D7ZA 4F6WA 2PVYA 2WB8A 3MYGA 5CASA 4AAAA 4YUQA 4V01A 1GZKA 3NGAA 2BZJA 1DM2A 2UW9A 3OWLA 4XV3A 3AD5A 3BHYA 4G9CA 3TZ9A 4DTAA 1YKRA 5A4QA 1FGKA 3GQLA 3PJ1A 2FO0A 4Q2AA 2OXYA 4XCUA 5JRSA 3NZ0A 4P4CA 1JOWB 4CCUA 1OPJA 5CU6A 3G51A 1M7NA 1XHAA 3BKBA 5FUTA 1O6KA 3KMMA 4RIOA 1WZYA 2ETMA 3NUNA 3W2QA 2PE0A 2VX3A 5ANEA 5IA3A 4YZDA 4I3ZA 2ONLC 4K11A 4RX9A 5FM2A 3I1AA 3V01A 3VBWA 5C9CA 4BIBA 3V8SA 3ODZX 3R0TA 3QRKA 3UVQA 4BWPA 2UW6A 3KXXA 2VNWA 2VTHA 3R7EA 2A19B 4EH6A 1P14A 5DRBA 5FP6A 5LCJA 2GDOA 4L3LA 2ZB1A 3N4VA 1WBOA 5CU2A 4O84A 1APME 3QUPA 3WE8A 4E7WA 2QCSA 2Y4PA 2OKRA 4FL1A 4M67A 3QZFA 4D4RA 5F94A 3VS0A 4Z7GA 5EYCA 4D28A 4AE6A 2WMWA 4HW7A 5IDPA 3HRCA 3Q9ZA 5E8ZA 1OL7A 1OKWA 2JDSA 3V5QA 1DAWA 3DZQA 2ZV2A 5ANJA 4AZSA 3SX9A 2VRXA 4ZTMA 4FTMA 3T9IA 1Z5MA 3NPCA 5EG3A 5EI6A 1PXIA 2W17A 2J90A 4QYFA 4RWJA 3R9HA 2EB3A 4KKEA 2AYPA 5EW8A 3R9OA 1JKTA 1BUHA 2W1HA 1K9AA 4FC0A 5IA4A 3EQIA 2OJFE 2FYSA 2W4KA 3FI4A 2VTTA 5IQBA 3ORXA 4BI0A 4U5JA 3EFKA 4YZBA 3DK3A 4R78A 4NSTA 3TL8A 2YM7A 3PJCA 2UZDA 2BDFA 3FMEA 5BX0A 4R7BA 1CDKA 3BEGA 3MDYA 4L44A 4B0GA 3TNHA 4YJQA 5AP3A 5LVPA 3BE2A 3Q04A 4AN2A 1J1CA 4FE2A 3DFAA 2GHGA 3CXWA 2VNYA 4FKSA 5EW3A 1OIUA 5L3AA 4IX4A 3L8SA 3ZH8A 4BC6A 3RK7A 5ETFA 4NCTC 4HNIA 3FZRA 3ZUTA 2F4JA 3TWJA 2HZIA 4J97A 2XJ2A 3TZ7A 3QUEA 4WNMA 3JVRA 2XIYA 3MPTA 3DAEA 3TIYA 3IECA 2ZMCA 2W1IA 3MY1A 2CN8A 3R01A 3ERKA 4TPTA 4OTFA 4WNPA 5EI2A 5A14A 3QHWA 5IISA 1OIQA 4PMSA 3MB6A 3DNEA 3V8TA 4I24A 4D55A 3GXLA 3KCFA 3KF4A 3QD3A 4NM3A 5AUVA 3OW3A 4HCVA 4AZWA 4FV4A 3CGOA 3KF7A 4YPSA 5A4CA 4QT1A 3LXKA 3EQBA 2OGVA 4XLVA 3LCDA 1PKGA 4IAYA 2X2LA 4MF1A 4OTWA 3VS7A 5IH4A 2P33A 4ZJVA 4CGAA 5DR6A 3BHUA 5D7AA 2WTVA 4R5SA 3WBLA 4UALA 5TOZA 2QOIA 3FMLA 3FQSA 1W98A 3VIDA 1CSNA 4ITJA 4LL5A 5AR3A 4E93A 4I5CA 1URWA 4P90A 2PHKA 3BGPA 3OOGA 1WCCA 4JOAA 4C8BA 2W06A 5FGKA 4CG9A 2B9HA 2JD5A 4AWIA 1NW1A 3D14A 3R1QA 3ORMA 4L01A 4QMOA 4AA0A 3ZXZA 1WVXA 4BBMA 5AX9A 4YMJA 4QMUA 4B99A 3C9WA 2XH5A 3DFCB 4FODA 5BUJA 4K33A 3R9RA 5CT7A 1HOWA 3CTHA 4D2WA 2XYNA 2C6DA 3HMNA 4U8ZA 5AIKA 3IK3A 3WZUA 3MVHA 3MI9A 4A9UA 4JL9A 5AUWA 3PSCA 5HCYA 4IM2A 5CF5A 4XG4A 3I0QA 3QQUA 3QTUA 2CSNA 4QMPA 3MTLA 3EYGA 5ACKA 3PWDA 4HGEA 4PP9A 4F6UA 4USDA 4YZ9A 1WBNA 4WT6A 1FVVA 2P2HA 2YABA 4IX5A 3QQHA 5LMAA 3MFRA 3DKOA 4C3FA 1WBWA 2UZWE 1RJBA 5FDXA 5DN3A 3REPA 3PRFA 4NM7A 4IAKA 4O86A 4ZSGA 3AC8A 1BYGA 2WD1A 2JDTA 3BGQA 4XMOA 4Y73A 1IRKA 3ATTA 4QMVA 4W4YA 4GJ3A 4EYMA 4P5ZA 4CFVA 3RVGA 1ZY5A 5HD4A 2PK9A 3LE6A 3V6SA 4JBQA 4MF0A 5I9UA 2ITOA 5KHWA 1QPJA 1KOBA 3QC9A 2PUIA 2ZVAA 3H9RA 5JGAA 2UZBA 3L8PA 3GCQA 1PXJA 5H8GA 4QMQA 3FLWA 4PL5A 5E8VA 2X8EA 4C2VA 2OF4A 2RGPA 3MGYA 1AD5A 2C3IB 3BZ3A 4YZCA 1OKVA 3OY1A 1SMHA 5AP0A 4CNHA 5A3XA 2JKQA 5HESA 4IB5A 5EM7A 4L8MA 5CF8A 1OITA 1H0WA 4TXCA 3SLSA 5JSMA 5LMKC 4TYHB 3W2CA 2WHBA 5DIAA 3I5NA 3COKA 2H9VA 3PYYA 5CWZA 3G9LX 4F7SA 2IJMA 2W4JA 4NZWB 2HENA 5HIDA 4CT1A 4EOPA 1ZOEA 2V55A 2YLFA 2PMLX 5EHOA 4FF8A 3NRMA 4XBRA 4BICA 2VWVA 4F9AA 3D5WA 1RW8A 4M0YA 5DH3A 3V8WA 3OCSA 1FMOE 5ICPA 3W2RA 4CCBA 4IBMA 3OWJA 3PA4A 5IKWA 3ZBXA 1SVHA 1H1RA 3ENHA 4KS7A 4BDEA 3QALE 4D2TA 2WTWA 1WFCA 2XNNA 3GVUA 3WZJA 4BCPA 4FA2A 4UBAA 2JFMA 3D83A 3R1SA 4FKUA 3MPMA 5FBNC 3W8QA 3OMVA 4PDSA 4RMZA 4GT3A 3A7FA 3U87A 2W99B 3GI3A 3ZFYA 1OB3A 4IANA 1U5QA 2R0IA 4FV0A 4RLLA 2Y4IC 2WMXA 3PXZA 3HV6A 4BBFA 4QPSA 5HE0A 2PWLA 5CAUA 5LOHA 4D4SA 4GW8A 4L3JA 3CS9A 4V05A 2ZM3A 5FBOA 3R8LA 3GUBA 2FSTX 5J8IA 3FKOA 2JIUA 1U46A 3GNIB 2VTAA 1QPCA 3MN3A 3Q2MA 1YXTA 3ANRA 2JKMA 1O6YA 3GC8A 4W4VA 4BTFA 4EC8A 3DAJA 2GNLA 3MH1A 2B9IA 3QLFA 4LM5A 5G6VA 4DCEA 5A46A 4A7CA 4IDTA 4O7LA 4I5PA 4ZLOA 4JG8A 4M15A 3AT4A 5AP2A 3RWPA 3OP5A 2XM8A 2YACA 1JSVA 1REKA 3UP7A 1H1SA 2HXLA 4RJ3A 3TUDA 1CKJA 5CXZA 4X2JA 1WVWA 2BALA 1KE9A 4IB3A 5HOAA 4ZZOA 4HJOA 5K5NA 4O81A 2R3QA 3ZDUA 3W1FA 2EU9A 3R7GA 4QPMA 4FICA 4EHZA 2H8HA 4CZTA 3FKNA 1PXLA 4RIYB 4YJOA 3BHTA 2PVFA 2XEZA 1H0VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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