3VW8A

Crystal structure of human c-met kinase domain with its inhibitor
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
328
structure length
303
Chain Sequence
VQYPLTDMSPILTSGDDLSLNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHV
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structure-based design, synthesis, and evaluation of imidazo[1,2-b]pyridazine and imidazo[1,2-a]pyridine derivatives as novel dual c-Met and VEGFR2 kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
total genus 94
structure length 303
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-08-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3vw8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3vw8A01
1PXOA 4I6HA 4MBJA 3HX4A 5CU0A 5T3QA 4X6QC 4CFUA 4R3PA 3R6XA 5A4QA 3VNTA 4O7LA 3LM0A 4AUAA 1Q24A 1HCKA 1ZYDA 2YDJA 3LFAA 2NRUA 4FL2A 2E9OA 4R8QA 5DH3A 3LFSA 5CY3A 3D5UA 2ZYBA 4GW8A 1GJOA 5H8BA 3FZRA 3REPA 1H1PA 2WMVA 4FTKA 3BWFA 4ZY6A 4IB5A 1M17A 4CTCA 5FP5A 2WO6A 3K3JA 4FSNA 3HMNA 1R3CA 3Q9ZA 4U5JA 2V7OA 4WG3A 3W32A 3KRJA 2J0LA 2BIKB 1VR2A 3ZHPC 4FC0A 5EOLA 2C1BA 4FSTA 3O0GA 4ITHA 3QRTA 5JFWA 4G3EA 2QKRA 4AX8A 2BUJA 2GNGA 2QOBA 3DBFA 2GNHA 1XHAA 1YXVA 4UMQA 2R4BA 5CWZA 5CVHA 5FQDC 1OPLA 3R7EA 4EHVA 4AZFA 1FVVA 2X9FA 2XNBA 4I23A 1WVWA 2B9IA 1PXMA 2O63A 2PVKA 2UZWE 4I4EA 4C57A 4A06A 4FTLA 4WD5A 4QNYA 4BDFA 2QONA 3S2PA 3FI8A 3KRLA 3KK9A 4AE9A 3HRCA 3ZS5A 2JDVA 4UBAA 2WTCA 4K33A 1VJYA 2XH5A 4BDJA 2JLDA 4RIWA 5CSWA 1H28A 3EZRA 4ONAA 4KINA 4OLIA 3RHXA 3QTXA 1PXLA 3Q32A 3PY0A 4QMSA 5LMKC 4NM3A 4XP2A 4ZZOA 3E8NA 4AGWA 3QRKA 3IDPA 4JR7A 5CENA 5CU2A 5DT4A 4CMTA 2UW0A 5I9VA 5I9UA 2UW3A 5TO8A 5E8SA 2XP2A 5IQCA 2XEZA 1XH5A 4AFEA 4FGBA 3Q9XA 4XBUA 4LL0A 2ITXA 1GIHA 3SRVB 2IVUA 2EB3A 4O0SA 1APME 2YIWA 5DWRA 5HU3A 4YSJA 1U54B 4EH7A 3DBEA 3D5XA 3MH3A 3UZTA 1ZZLA 3QTQA 2R9SA 5ETAA 2H8HA 2ITPA 4FOCA 5CX9A 3UYSA 5CXZA 4YJVA 3UMWA 1XQZA 2C3LA 3MPMA 5B7VA 4FBXA 1IAHA 4ZAUA 2FB8A 2Z7LA 3TZ7A 4CCBA 1J7LA 3ZBFA 3H9RA 4RVLA 4DGNA 4J7BA 3NNWA 3LZBA 1H08A 4L6QA 1QPEA 5E90A 4QMTA 3WF6A 2QOKA 1AQ1A 4EJNA 4FEWA 4CZTA 1FGKA 1U5QA 1YI4A 4E6AA 3VO3A 4UN0C 3BQCA 1FPUA 3I79A 3VS2A 1TQIA 4NCTA 3WZEA 5AADA 2BR1A 3L8VA 4LGGA 4LRKA 1M7QA 1XKKA 3BYSA 4AW1A 2J5FA 4F9CA 4GJ2A 4WNOA 2VO0A 1Q61A 3GFEA 3CPBA 3L8XA 3PRFA 5JRSA 3SC1A 3MFSA 4IAZA 1PMVA 3U51A 3QX4A 3ZZEA 3FQHA 2CHLA 4XHKB 2XK4A 4CFWA 3KULA 1UA2A 4BB4A 1JWHA 1PW2A 4CFXA 2GDOA 4HVHA 4XH6A 3EMGA 5DR2A 3GU4A 5CANA 2PUUA 5ANKA 4ZY5A 2X2LA 2XIXA 3NRMA 2OWBA 4EOMA 2XNOA 3IO7A 3UMXA 2VWBA 4YHJA 3OCGA 3QZFA 2R3QA 4EH6A 3Q4UA 3ACJA 5IDPA 4ZXTA 3PSCA 4FSWA 1UNHA 3A61A 3O8UA 2F2UA 3RI1A 1YHVA 3MW1A 1Q97A 5AAEA 4O7RA 4FEXA 5IA5A 3Q60A 4ANBA 3NX8A 4KBAA 3L8SA 4YJOA 3CY3A 3ZOSA 4L45A 4RQKA 2WEIA 3FZOA 3E8CA 1FOTA 1Q8YA 2X8IA 4IVDA 2BIYA 2P33A 5J7HA 2UW5A 3A7FA 3FMEA 4FK6A 4C59A 1FINA 3HV5A 4EKLA 4O0XA 1JBPE 4I5PA 3EJ1A 4IVCA 2CJMA 2UVXA 4N70A 4BHNA 1WBWA 3OUNB 4HW7A 5E9EA 5C03A 3R1SA 2YEXA 3NW5A 3OS3A 3ZLWA 4EWQA 3CTJA 2ZOQA 1H01A 4FZAB 4CRSA 2UZOA 4U9AA 5JN2A 4AGUA 3GQIA 2UUEA 2WOTA 2GHLA 3TIYA 1KV2A 5CAPA 1OPJA 2ITVA 3L1SA 1UNGA 5BYYA 3BHYA 4IBMA 4O7YA 2VUWA 4RJ4A 4LOPA 3QKLA 5FWKK 2WTIA 4DC2A 1ZZ2A 4NW6A 4RX7A 3C4XA 4R5SA 3DDQA 1PXNA 3C4WA 2OJFE 3KRXA 3UVPA 4ANOA 4XX9A 4Y46A 3ZO2A 3LFQA 5FM3A 2JD5A 2W7XA 3QTSA 3QD4A 4U80A 4BIEA 2VWZA 2HW7A 4FYNA 5J5SA 2BFXA 4ENYA 2BFYA 2I0VA 1J3HA 1RJBA 5F9EA 4L8MA 5AUZA 1DS5A 2OFVA 1ZMWA 3GU8A 5HE2A 4FZFB 4CRLA 2JBOA 3NNXA 4O1PA 5GZAA 3NMUF 5CT7A 5HBEA 4PX6A 4XBRA 4PMSA 1YHSA 1SVHA 5TE0A 4IH8A 4ZMFA 3UNKA 4CCUA 4APPA 3DJ6A 4WO5A 3RJCA 1WBSA 3LFBA 5EW3A 2QR8A 4K2RA 1MRUA 3H0YA 3GEQA 5DT0A 1OBDA 3T9TA 3B8QA 3AMAA 3QZHA 2EVAA 3DKGA 3D7TA 3W18A 5JMSA 5C9CA 1BI7A 1FMOE 5ANOA 3RAIA 2XJ1A 2NO3A 2CN8A 2WQBA 3JXWA 4A9RA 4EZ5A 4RJ8A 4J95A 4BKZA 5M44A 2JFLA 2F9GA 4X7QA 2VTHA 4QQJA 4CEGA 2C0OA 1KUTA 5AAFA 4I92A 2WELA 4WA9A 4E3CA 1JNKA 3FPMA 2GQGA 4RA5A 4BCJA 3DGKA 1YWVA 3UNZA 4DH5A 4YLJA 4D2VA 5L2IA 2YM5A 3NAXA 3R9NA 1ZAOA 4EWHA 3O50A 1QPJA 4AN2A 4C62A 2XM9A 4JS8A 4DFZE 4MK0A 4CKJA 2LGCA 3VUMA 5M06A 4FK3A 1JKLA 4DAWA 3CJFA 3OG7A 3ZZWA 3OBJA 3FKNA 3G9LX 4QO9A 5IEXA 2R2PA 4BTKA 4ORKA 3I81A 4G1WA 4M84A 4BYJA 3COKA 3ITZA 5CF5A 4H1JA 3BWJA 2BKZA 5HESA 3ZFMA 2ZV9A 2GU8A 4U81A 5HU9A 5LVOA 4NWMA 2PSQA 2QOCA 4K77A 2OXDA 3LMGA 4BI0A 3H9FA 5L2QA 4D4SA 5D1JA 2NRYA 5FDPA 2JIIA 3F2NA 4DA5A 4BZNA 3FKLA 1GZOA 4NJ3A 2KULA 3QALE 4TYHA 3P1AA 4FV6A 4BBFA 2Y6MA 1BX6A 2F2CB 4RA4A 3D5VA 3EQDA 3RK7A 4GFOA 3R8MA 4O7NA 4OTFA 4U0IA 3QA8A 2REIA 4EONA 3EN5A 5KMMA 5CTPA 2YACA 5A4LA 3MSSA 1DI9A 3WBLA 4J52A 5K9IA 4TRLA 2W9FB 4AACA 4RC2A 2AC5A 3FAAA 4FG7A 2IVVA 1ZRZA 4BCHA 1CTPE 4PP7A 5C8KA 4QTDA 3KMUA 2ITQA 5B2LA 2GHGA 3BIZA 4QYFA 5J95A 3MB7A 2W06A 1ZARA 2VTMA 3JR1A 4L3PA 2WQEA 3NVKI 4BCOA 3FZPA 2DS1A 3UQGA 4OTDA 1WBOA 1OGUA 5FLFA 4O0RA 4FR4A 2F49A 4ZTHA 2R3FA 5H2UA 5KZIA 3FMHA 3R1QA 3A62A 3PE1A 4FICA 5F4NA 3C1XA 3VBXA 4RBLA 2WIHA 3A7JA 4FUXA 4CFMA 3MJ1A 4ANLA 1U4DA 2YISA 3DZQA 3FMKA 5CAQA 3SVVA 2BAQA 3BLQA 3W2CA 1OL5A 3QGWA 2G2FA 3BEGA 3BGPA 2VX3A 5CU6A 4BZDA 3IDCA 1R0PA 5EG3A 5HCZA 4KS7A 3DTCA 3LFEA 2VWXA 3SXFA 3CS9A 1OKWA 2QG7A 3G0FA 4C58A 4KABA 2B9JA 3BX5A 4FKIA 4D4VA 3FMMA 4QMPA 2F7EE 3RCJA 4F6WA 2R0UA 3T8OA 4EOLA 3GCVA 3HUCA 4MXOA 4AE6A 4ZJVA 3FQEA 4NIFA 3CEKA 2QO9A 2VTJA 3S3IA 4HOKA 3MH1A 5LXMA 1REKA 2JAVA 5JKGA 4JVGA 4RWJA 4E5WA 4YJNA 4EUTA 1JKTA 4A4XA 4KIKA 4Y83A 4EQUA 3TDWA 3FZ1A 3U6JA 4JAJA 4LRJA 2RG5A 3OOGA 5F1ZA 3Q4ZA 4NL0A 4XYFA 4M68A 2PVJA 3OWKA 1LEZA 5FXSA 4G9CA 3TT0A 3QQLA 4C2WA 5L6OA 1F5QA 5IUHA 4J96A 4RQVA 5H9BA 3R7VA 3ZM9A 1YWNA 3FXZA 1XH7A 5M09A 4GMYA 3QKKA 2VWYA 5BVWA 3NCZA 5IA2A 3F61A 4KS8A 4KBCA 4WT6A 5DR9A 5JQ5A 1OVEA 2JIUA 3PVWA 1TQMA 2PVRA 5AR8A 5IF1A 4NFNA 2YDKA 5KHWA 4BTMA 4RFZA 2X6DA 3BBWA 3D14A 3R8LA 4BCFA 3KY2A 3QQJA 4NFMA 4DTAA 4DEDA 3AXWA 4BIBA 1I44A 2QQ7A 3PJ3A 4WG4A 3GFWA 3P23A 2PUNA 1H27A 3ORIA 2WMRA 5DI1A 4FV7A 1Q3WA 5DT3A 3VS4A 4BFMA 5IA3A 5IISA 1FQ1B 3ALNA 4O0TA 2I0YA 4ZSJA 3ATSA 1KE8A 2VWWA 3I7CA 4K6ZA 5L3AA 3AC1A 3RWPA 4HCUA 2GS2A 5AP1A 4WKQA 2QOHA 4M15A 4Z9LA 2C6LA 2ITWA 4MKCA 1PYXA 4U40A 5A4TA 2I6LA 3LCTA 4AN9A 3C5IA 3Q9YA 3F3TA 5LMAA 3R8VA 4BDKA 3BV3A 3W8LA 3N4VA 4A7CA 1JSVA 4EH2A 4EQMA 5CI7A 3ZRMA 5FTGA 3JPVA 3SV0A 3V5TA 3FLSA 3PIZA 5T68A 3RINA 5BUJA 2X0GA 1Y91A 2YM4A 4O38A 4E93A 3PVGA 4ZIMA 5IMXA 2RGPA 4MF0A 1BMKA 2CGWA 2O65A 2XCKA 3GXLA 3ZO3A 4AA4A 4WHZA 5DVRA 5CEMA 3O51A 4OGRA 3CD3A 3HECA 5E8XA 3BHVA 5ACBC 3RK5A 2O8YA 3SLSA 2PU8A 3CBLA 4HZRA 4IIRA 4F9YA 5I3RA 3AC4A 4FF8A 3E92A 3CPCA 3DAKA 3FMLA 5JGAA 3ORTA 2HIWA 4IC7A 5EDPA 2BRNA 2JGZA 4NU1A 3CQEA 4LMNA 3QXPA 4Q9SA 5G6VA 3EQRA 3CCNA 5EW9A 3TG1A 3R2BA 3CTHA 3ZSHA 1TVOA 5D7VA 1Q8ZA 3P7CA 4PL5A 2YZLA 4X2JA 2HZ0A 4NKAA 2JKQA 4QTEA 3TNQB 4F7LA 3T3UA 2XS0A 2OGVA 2XM8A 3C4CA 2Z7RA 4GEOA 4TKSA 4TZRA 3GB2A 2J90A 3A8WA 3RNYA 4BGHA 3MBLA 2C0IA 4BDAA 3GC8A 4F0FA 5ICPA 3AT4A 3NYVA 4IM3A 4Y73A 4UMUA 3TM0A 3MS9A 2B55A 3D7ZA 5EI2A 3PXFA 4GK3A 5D7AA 3KXGA 4BHZA 3C4FA 3V01A 4W9WA 2ZAZA 2VD5A 3E64A 2VTQA 4O96A 3VUHA 3PSDA 4XLVA 3OT8A 2PVMA 4FVRA 4I6FA 3K54A 4ZJJA 1P2AA 4K11A 3GCUA 3CD8A 3OZ6A 2R3OA 4M69A 5CZHA 5L2SA 4CQEA 3UJGA 2Y8OA 4X3FB 1SMHA 3DBDA 5AUWA 4O0WA 4YTFA 4IB3A 5HLWA 4LI5A 3F5XA 3KXMA 3BZ3A 2YCFA 3E88A 4X21A 2OIQA 1LPUA 2Y6OA 4ZTSA 5EKNA 4NK9A 4XMOA 3QLFA 5IU2A 3BYOA 4FL3A 4OTRA 3IDBA 1OIRA 2AUHA 3EYGA 3OWLA 4G3CA 5AV0A 3RNIA 3EFWA 5M55A 3ZDIA 4K0YA 5JFVA 5M56A 5C26A 4FTIA 4Z3VA 4GK4A 2Z7QA 2QODA 5C8NA 3BYUA 3ZUVA 2OFUA 5HTIA 3C5UA 3F2AA 1JAMA 3NSZA 4O0VA 3R9OA 1OIYA 2PTKA 2PMNX 1NA7A 4U97A 2XJ2A 5BYZA 1H1RA 4I6BA 3HA8A 4HCVA 4IAFA 1Y6AA 4D58A 4JL9A 2WHBA 1CSNA 1YKRA 3KXHA 4WNMA 3AT3A 2UVYA 4YJQA 1IA9A 2HYYA 4RWKA 4Y5QA 4BDEA 3NUUA 5KMJA 4B8LA 1Q8WA 3C4EA 3WYYA 3KMMA 4O86A 5HNGA 2BPMA 4L3JA 4FV5A 4QNAA 2WD1A 3MYGA 2CNUA 3U4WA 5CAVA 2JC6A 1WBVA 4W4XA 3D4QA 4G34A 1GZNA 5ANEA 2CGVA 4IWOA 5AUYA 3MPTA 2UZBA 4FKOA 5HOAA 3QC4A 5HIBA 3V51A 5A6NA 3TV6A 4RMZA 3KXXA 2J0IA 3LJ1A 4UB7A 4DH3A 4WUAA 4GIHA 2VV9A 4C4IA 4WSYA 2CNQA 3CSVA 5CVGA 1CKIA 4DH7A 2BHHA 5CYIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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