3FLSA

P38 kinase crystal structure in complex with 6-(2,4-difluoro-phenoxy)-2-((r)-2-methanesulfonyl-1-methyl-ethylamino)-8-methyl-8h-pyrido[2,3-d]pyrimidin-7-one
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
349
structure length
343
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
publication title The Discovery of Pamapimod, R1503 and R1487 as Orally Bioavailable and Highly Selective Inhibitors of p38 Map Kinase
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 110
structure length 343
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3flsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3flsA01
1H1SA 5F1ZA 1BX6A 2FB8A 5J95A 4BWXA 2RG6A 2Y0AA 3ROCA 1M2RA 2XNPA 3F3TA 4FX3A 3WYXA 4ZTRA 4CV8A 4DAWA 4RFZA 2OBJA 2OIQA 2BILB 1PXNA 4FV7A 4IC7A 3CY3A 2B53A 5IA2A 4K1BA 2ITTA 3PPKA 2PZIA 2V62A 4E1ZA 4RZWA 2JKQA 4WNMA 2XIRA 4V0GB 3C0GA 4M69B 4C4JA 2G9XA 4AS0A 4AXAA 1FPUA 5H8GA 4F63A 1W83A 2QO7A 5L6PA 3T3UA 1IAJA 3A99A 5HO7A 3KRWA 2XB7A 4X2FA 3SLSA 4FIFA 2YIXA 4P5QA 4LFIA 5A46A 3VJNA 4GT5A 3EQGA 4CMTA 4OTPA 2BALA 4N70A 4EHZA 1ZOEA 2WMVA 1U54B 4DINA 2JAMA 3E93A 4FTCA 4BCOA 4Q2AA 3NNVA 2UW5A 3BE2A 3IK3A 4PWNA 4WHZA 5EFQA 4FIEA 3FDNA 4R7IA 5HIDA 4UBAA 3QLFA 3OEFX 3UO6A 3TEIA 3DNDA 3PP1A 5AUTA 3BX5A 4LMUA 3KK9A 1ZYLA 3FXWA 3QX2A 2EB2A 3F69A 4TYHB 4S30A 3VBWA 3W18A 4B6LA 1HOWA 3QQLA 4PTGA 4J95A 5T6KA 4KBAA 5ANJA 4ACGA 3H9OA 2VTIA 4I21A 3ZUUA 4ANQA 2JIIA 2YM5A 3HAMA 2BTRA 2W1EA 4RIXB 3IOKA 5T3QA 4I4FA 5CI6A 5AR4A 5ETIA 2LAVA 1MQBA 5ETAA 3NYVA 3PPJA 4H3QA 5IU2A 3Q9XA 3E88A 4A4LA 4I5PA 4XUFA 4WNPA 4JBQA 1WCCA 1U46A 4R5SA 3QD2B 1U5QA 4DTKA 1R0EA 3HL7A 3IW7A 2P0CA 2YHVA 4BDDA 2GHLA 3WZKA 2IN6A 3DJ7A 2XJ0A 3WF5A 3ZZEA 4ZS4A 4YBKA 3ZONA 2BZKB 4D5HA 5CNNA 3VS2A 5J7HA 4O0TA 2OJ9A 3IECA 3ZSIA 3TDWA 1K2PA 2EUFB 3PJ8A 3WYYA 3FPMA 3R21A 2XNMA 5CEMA 1ZYCA 4DBXA 4CG9A 1H8FA 3CSVA 1ZARA 3GC7A 4G6OA 3U55A 5HTCA 2AC3A 5EYMA 4DHFA 3DB6A 3FLWA 4JQ7A 2ONLC 4EK6A 3BGPA 3PXRA 3O2MA 2GFSA 2YM8A 3AC5A 4JS8A 4JRNA 5EDRA 3PJCA 2UW4A 2UW3A 3FJQE 4EH9A 4X6RA 4OR5A 2J5EA 4FSTA 4EK3A 2HENA 3GCUA 4DFZE 2RFEA 1QMZA 1H01A 1GOLA 1ZMUA 3F61A 4MD8E 2F49A 4GMYA 4P5ZA 4U43A 4U9AA 3QBNA 1W7HA 4HPUE 4QTBA 3ZM4A 4NZWB 1G8AA 5AFVA 3O0GA 4KB8A 4C4FA 5HU9A 5M06A 2E9OA 2I40A 3OUKA 3DJ5A 5AP3A 3UNJA 3QXPA 4MF0A 2F9GA 3Q04A 2QR8A 5JSMA 2XNNA 2V0DA 3IGOA 5AM7A 3RM6A 3RI1A 4EHGA 1BI7A 2UZBA 4TWCA 4F6WA 5AUVA 5HCZA 2BAKA 4YHFA 5E9EA 5H3QA 2YM3A 4LL5A 4II5A 2Z60A 4QMVA 1URCA 3MGYA 3EH9A 4G3GA 4AA0A 2UZWE 2WTKC 4M84A 5GZ9A 2QHNA 5C9CA 3W2RA 3QCXA 4I94A 4PQNA 4PRJA 4O1PA 5E8VA 5ETCA 1GZ8A 4MYGA 1DS5A 4O0VA 5HEZA 3O8UA 4XBUA 4CV9A 2NP8A 4AT4A 4L3PA 4GK3A 2Z7SA 1H07A 3ORLA 3CPBA 4M68A 2W1FA 3DBFA 4OGRA 2WKMA 2HAKA 4QP9A 1V0OA 2Y7JA 4GT4A 3OW4A 4GT3A 4UZDA 4NTSA 4C59A 4LG4A 3NNUA 2W7XA 3TM0A 4ALUA 5DRBA 3C51A 4L8MA 3UQFA 3A7HA 4CFWA 2BDJA 4PMPA 1HCLA 4J52A 2WIPA 3Q52A 3P7BA 5E7RA 1XBBA 3HGKA 4EKKA 3F2RA 2JIVA 1PXPA 2QC6A 2DS1A 3LJ0A 4GCJA 3GOPA 5HE1A 1XH6A 3OCTA 4FBXA 2WFYA 4DN5A 1E9HA 2QNJA 4IACA 5B0XA 5HE0A 2R2PA 3FE3A 2PUNA 2ONLA 5EQEA 3K2LA 4AOTA 4L3LA 1DAWA 2O65A 3AT3A 3QFVA 4XP2A 4LOOA 4APPA 4CEGA 4EEVA 4OAVB 1PHKA 1ERKA 5HVKA 5DT0A 1KE6A 4M14A 4E6AA 4FKWA 5IQDA 4QYHA 4A9SA 4B99A 1W8CA 4X2NA 2PMIA 4JDKA 5CENA 5LXMA 1FOTA 4EH5A 4K18A 2C5NA 3SHEA 4F09A 1OUYA 3BYVA 3P79A 5M08A 4ZS0A 3UJGA 5F4NA 5DYJA 2VWZA 4LRKA 5J1WA 5C4KA 5GNKA 3F3VA 1J1CA 1H0WA 3KL8A 3QX4A 2YDKA 4D28A 3RVGA 2RSVA 2C0TA 2ZV9A 4RIWA 5CSHA 2XBAA 3LFAA 2YAAA 4IADA 4Y72A 5TR6A 5KMMA 2ITQA 4FKIA 2VN9A 5IQEA 2GNIA 2FA2A 1LP4A 4E7WA 4UZHA 3L9NA 4O84A 4F0IA 3SXSA 4RC4A 2G15A 4F7NA 5ANIA 5HLWA 4AZFA 4NM3A 4XG9A 2GSFA 3KMWA 5KMIA 3B2WA 4C34A 4O21A 5AJQA 4S33A 1WBWA 2CCHA 5AMNA 5CQWA 4PMTA 2VTMA 3HV3A 1YQJA 5EW9A 3HMOA 2BRHA 2C6LA 2WMXA 4CMOA 3A8WA 4RT7A 2P55A 1WVXA 4M67A 4ASDA 4IEBA 2NNWB 4QP2A 4TY1A 3VBTA 3UODA 2OU7A 1B39A 4DLIA 5I5ZA 4IVCA 4NTTA 4NW5A 4G34A 4D55A 4OBPA 2Q83A 2QD9A 3O51A 4CRSA 4A4OA 4BI2A 3OXIA 2B55A 3E3PA 3FSFA 5K4IA 4BB4A 5DOSA 5K0KA 2GS2A 3FKOA 4JQEA 2XEZA 2XK9A 3DT1A 4FSNA 2UW7A 5LVMA 5BMSA 1OL7A 2W9ZB 4APCA 4FIHA 5F20A 2H8HA 5DFPA 5FQDC 1AD5A 3RAKA 4CFUA 4YC3A 1GZNA 3BLHA 3QHWA 1Q5KA 2UW8A 3QA0A 5AV4A 4LRJA 5G1XA 3UNKA 2I0YA 3ODYX 4HVHA 3G6GA 4KIKA 4PP9A 2GFCA 3BYOA 3LCKA 3R8ZA 2CNVA 3OROA 2VX3A 4DFYA 2PVJA 1GIHA 2OO8X 3UPZA 3FLQA 1MUOA 2JKOA 2HXQA 4F4PA 2WQBA 2W1DA 1OMWA 3MJ1A 4I4EA 3GEQA 1Q41A 1V0PA 2HZNA 2QODA 2WU7A 3DOGA 3HV7A 1FVTA 3QL8A 1OUKA 3LCDA 3EQDA 3BHVA 4GEOA 5ICPA 2RFNA 1GNGA 3GI3A 3IW8A 3QHRA 4HCVA 4I93A 5BX0A 3C0HA 1YRPA 2I0EA 4YPSA 4GUBA 5BVDA 3Q2JA 5IMEA 4I1ZA 4RVTA 2KULA 4FG8A 2WELA 2PWLA 5EM5A 2WMUA 2ZDUA 1ND4A 3KMUA 3KVWA 3LAUA 4ASZA 3R2BA 5C8MA 1WBSA 2BPMA 3CTHA 3FI4A 3R9NA 2GTNA 4MXXA 4CFXA 5H8BA 3CR0A 3OC1A 1M2PA 3C13A 3GFEA 5AAGA 2I7QA 1UU9A 4ZLZA 5IUGA 2ZMCA 2C6TA 1PXLA 1XHAA 3D7TB 4E6CA 3R9OA 2IG7A 3NCZA 4BCPA 2OF2A 3Q9WA 4BDAA 3SKCA 1EH4A 4LI5A 5BVEA 4EOIA 5KKRB 4AZWA 2BHHA 2VWYA 1YWRA 4Y83A 3FMEA 3W2CA 4FZAB 5EQYA 4BCJA 2JFMA 2X6DA 4I0TA 4LUEA 3MTFA 1UWJA 1L3RE 4FT5A 4FV1A 4LMNA 5AV2A 2C3KA 2YCFA 1S9JA 4M7IA 3V8TA 3W16A 3O71A 3QCYA 4IX3A 4IW0A 5IDPA 4JQ8A 2Z7QA 3S95A 3UGCA 1M2QA 5F9EA 3VUHA 4DGOA 3UQCA 5J9ZA 1YDSE 5M4CA 1XBCA 1R1WA 4RQVA 3RAHA 3QGWA 4ZY5A 4QOXA 1CM8A 4L3JA 2B0QA 4C3RA 2QI8A 4YHJA 1ATPE 4LV5A 5L6WL 2OZAA 3P08A 4J53A 4N6ZA 4X3FC 4EONA 4NFMA 4YJUA 1WBVA 4MWHA 3KULA 3OOGA 3P78A 5JT2A 3R6XA 4L00A 2WU6A 4FV3A 3G5DA 3GCSA 4IQ6A 3NUUA 2OJIA 3DPKA 3C0IA 2GHGA 3FMHA 2XYNA 2V5QA 4BDKA 3DBQA 3F5GA 4BCMA 4ANNA 3I5ZA 3MV5A 4FT0A 5AA8A 5DEWA 1KE5A 2WD1A 2J2IB 4D1SA 3NX8A 4EH7A 4OTGA 4OT5A 3N4UA 3OT8A 2W5HA 4B8LA 2F2UA 5HZNA 2QOOA 4RX5A 1YI4A 3MSSA 4P2KA 3RPVA 3KN5A 2BFYA 3GU4A 3L8XA 4I0RA 4JG6A 2ITWA 3ORNA 5FG8A 3QALE 4HNIA 5AX3A 4IAAA 2PZPA 3A7GA 2OK1A 1ZMVA 3M11A 4JRVA 1Y91A 4JL9A 4YZMA 4WSYA 3RMFA 5E8ZA 5HG9A 3NWWA 4CRLA 1J1BA 3HLLA 5CVHA 2GQSA 4CFMA 4WOVA 4FGBA 4PMMA 4BWPA 2OG8A 4UALA 3FI3A 5DT4A 1KE9A 5HD7A 2BMCA 1PYEA 1YDRE 3UYTA 4O83A 3A4OX 1OITA 3DBCA 5A4EA 3I4BA 2Z02A 5CXHA 1PRYA 2JITA 3DDPA 3E8EA 3F2AA 4YHTA 4IX4A 2W0JA 2C6MA 2JDTA 3F7WA 1G3NA 2XCHA 1A9UA 3TN8A 4BC6A 4CKIA 5HX8A 2QG7A 2BROA 5IQGA 4UB7A 3TIYA 4EK5A 2GQGA 3QKMA 3OY3A 3KCKA 2C68A 5L4QA 2VTPA 3SRVB 4F7SA 4UYAA 2G2IA 3MJ2A 4UMTA 4Z7GA 5A6OA 3U54A 3ETAA 5CAQA 4XHKB 1S9IA 4OTDA 1PJKA 3PP0A 2AC5A 4FKOA 1OM1A 3LM0A 5L2IA 4I92A 3ENHA 5DH3A 3FL5A 3I7CA 4QMWA 4H39A 4N6YA 1LEZA 5T68A 3QQFA 4D9UA 4D4SA 3PA5A 4X3FA 3AD5A 2BKZA 3VIDA 5GINE 4GU9A 4YZNA 4E5AX 4NH1A 4JLCA 2CNQA 3RALA 4RIYB 4W8EA 2CLQA 2YIQA 3C4EA 3VS6A 2HZIA 2WOUA 3PWDA 2HXLA 4ACCA 4D5KA 2XM9A 4EI4A 3O7LD 4O22A 5IQAA 3QD4A 5HVYA 2HWOA 1PMEA 5L2WA 4O91A 2X0GA 3U4WA 4X21A 5K0XA 4EH4A 2QU6A 3KK8A 4K0YA 2O2UA 3DNEA 4E26A 1WMKA 4D9TA 4QP8A 2VO6A 2DYLA 4PDOA 3VBYA 2VRXA 5CI7A 4A9TA 3PE1A 3HUBA 3K5UA 1E1VA 4PDPA 3OCBA 3OW3A 4FOBA 5BUEA 3QCSA 3SX9A 4NYEA 3OVVA 3CJGA 1PMVA 2BIKB 2IWIA 3IS5A 3PWYA 4U8ZA 5IA4A 5IQHA 5IA3A 1GZKA 5A4QA 1FGIA 4LGHA 4GG5A 4BF2A 4FEWA 3G6HA 2UZNA 2IZRA 2UZLA 4PPBA 4EBWA 3V5PA 1RJBA 2C5YA 4FT3A 5K4JA 3LMIA 3AD6A 4TNBA 4EUTA 1RQQA 2HZ4A 4RGJA 2XNEA 3R7UA 3REPA 4DITA 2YJSA 4WNKA 4G5PA 5IMXA 3O8TA 3VBVA 2W4JA 4ONAA 1XKKA 4BIBA 5EKOA 4GL9A 4CNHA 5FXRA 1X8BA 2WEIA 4CKJA 2YISA 3PSCA 1YW2A 3NYNA 4JIKA 4RX9A 2H9VA 2ITZA 4L7SA 1LEWA 1M7NA 3ZC6A 3GBZA 4HYUA 4GH2A 2CMWA 2JKMA 4I5HA 4N0SA 1OL5A 4JBOA 4DE4A 4YO6A 4I41A 3PYYA 4I6QA 4TT7A 3CQEA 3H3CA 3RNIA 2JDRA 4RJ3A 4ZSGA 2R3OA 3OBGA 2FSMX 5ANKA 5FWKK 1OL6A 2FYSA 1Q8ZA 3EQFA 3F3ZA 3LQ8A 3QQHA 4TWOA 2IZTA 4YGAA 5M56A 2CKQA 2VTQA 3WE8A 3MN3A 1TKIA 4YZCA 5FP5A 1REJA 5LOHA 3QRIA 1BL7A 5A4CA 2VWWA 3D2IA 4J1RA 4RVMA 5ACBC 4BBEA 4BGGA 5BVOA 4YBJA 2PSQA 4ITIA 4WT6A 4NKAA 3EL8A 5ANDA 3M1SA 4BDEA 3W55A 2FSOX 5B2MA 3FZ1A 4LGDA 3L9MA 4QMPA 3CE3A 3ORKA 4AP7A 3S3IA 2GS7A 4FYOA 4BFMA 3TNIA 2I6LA 4CQEA 4KABA 4UMRA 3PG3A 5M57A 5LCKA 3KRLA 2X7OA 3N51A 1MRUA 2VGPA 4IC8A 2UVZA 3OXZA 4RJ8A 5HNIX 5TOZA 4WRGA 4CFNA 4EOLA 3VF9A 3OTVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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