2XKFA

Structure of nek2 bound to aminopyrazine compound 2
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
277
structure length
250
Chain Sequence
SRAEDYEVLYTIGTGRCQKIRRKSDGKILVWKELDYGSMTEAEKQMLVSEVNLLRELKHPNIVRYYDRIIDRTNTTLYIVMEYCEGGDLASVITKGTKERQYLDEEFVLRVMTQLTLALKECHRRSRDLKPANVFLDGKQNVKLGDFFVGTPYYMSPEQMNRSYNEKSDIWSLGCLLYELCALMPPFTAFSQKELAGKIREGKFRRIPYRYSDELNEIITRMLNLKDYHRPSVEEILENPLILEHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Aminopyrazine Inhibitors Binding to an Unusual Inactive Conformation of the Mitotic Kinase Nek2: Sar and Structural Characterization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE NEK2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 250
sequence length 277
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2xkfA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2xkfA01
3COHA 3QD0A 3DJ6A 4OT5A 2QHNA 5E90A 3DA6A 3ZEWA 4EHGA 4O7SA 3EZRA 3C5UA 3OXZA 3ZS5A 3AC4A 4F6SA 4L42A 5HG8A 4JRVA 5EDRA 1BL6A 2J0KA 1YXUA 2VO3A 3T9IA 5JGAA 5EQYA 1CTPE 2P0CA 1Q5KA 4UZHA 3MN3A 2WPAA 3ELJA 3F69A 3E64A 2LGCA 3DTCA 2HW6A 4CGAA 2VWZA 1ZYJA 3EQDA 3BHUA 4FSRA 4HYUA 3VUGA 3E8EA 4Y95A 4ANBA 3DBEA 3IW7A 4ONAA 5LVPA 3DQWA 3NLBA 4L3LA 5FP6A 5L3AA 3OWPA 3KN5A 4FKTA 2VWBA 1XH6A 5E8UA 2BTRA 2W0JA 1OECA 3PYYA 1GOLA 1YW2A 4QTDA 4ZTLA 4I4EA 2Z7SA 4IAFA 3PSDA 5K3YA 4PL4A 3KL8A 3GC7A 4NZWB 3P1AA 5M55A 3WZEA 3SXSA 2JBPA 3AG9A 3EYHA 3OCBA 1Q62A 4LUDA 3RAHA 3RVGA 2WNTA 1QPJA 1YWVA 4QTBA 4Y5QA 4PUZA 3NYVA 4YZ9A 5B2LA 1GZKA 4B8MA 3EN9A 3GU8A 3Q04A 5H8GA 5J79A 4J53A 1PMNA 4TPTA 4FNYA 4Q9ZA 4I92A 3NW5A 2R3LA 2CKEA 4FVPA 3FSKA 5AV3A 4CD0A 4E6QA 4PTCA 1CSNA 1REJA 3DY7A 2XB7A 4QYHA 4NKAA 3UQCA 1ATPE 1J7IA 3DXQA 4MWIA 2B0QA 3GFEA 4CT1A 4O6LA 1UV5A 3DKFA 3FMMA 3PPJA 2VGOA 3Q9YA 4XOYA 5F1ZA 2W1CA 3POOA 2F57A 4K9YA 4QO9A 4BL1A 4E4NA 5IQHA 2V0DA 3RI1A 4FTCA 4UMUA 2Y0AA 3ANQA 4FT0A 4L9IA 3W2CA 4CFUA 1QCFA 5F95A 3LFEA 4M68A 4ZTHA 3GVUA 3MESA 2W9ZB 4UMTA 5IU2A 4L44A 4RJ4A 4BWPA 3UE4A 4A07A 5EDPA 4DFNA 3PWDA 3QQKA 3THBA 2QOIA 3F5XA 2XNOA 5FTGA 2PE0A 4U40A 1MQ4A 4EH5A 5KX8A 4YTIA 3VBTA 4MF1A 1SVEA 2WO6A 3D15A 3MPMA 2XKEA 4BCFA 4EOIA 3H9FA 4EORA 5KNJA 1CMKE 1AGWA 3V51A 4EOOA 1OIRA 5G6VA 2XK9A 4I4FA 3UYTA 3QZHA 2FO0A 3D2KA 3PY1A 4BKZA 2JKOA 2VX3A 4GMYA 4X2KA 4BZDA 2X7GA 4EWHA 3ZH8A 5LXMA 1H1SA 1ZY4A 5B7VA 1MQBA 4O0YA 1Q61A 4RIWA 4QTCA 4BGGA 4RX9A 2J50A 2X81A 4YC3A 3POZA 3FLZA 3UZRA 2HAKA 3QU0A 3PJ3A 4WNMA 5IA4A 5D10A 1NVQA 3E8DA 2VTRA 3R8UA 1LP4A 2VWXA 4FV4A 1H00A 2C5VA 4RG0A 4QMZA 4FKWA 4C2VA 3NRMA 4ZTQA 3O8UA 4BTMA 1VYWA 3VBYA 5CEQA 4BI2A 3NNXA 2XH5A 3HP5A 1OMWA 4TL0A 3QL8A 3CPCA 3I81A 4EK8A 2I0VA 5CSXA 4FTLA 5CALA 3RCDA 2XM8A 4EK4A 2PMNX 3DB6A 2I1MA 1K3AA 5EYKA 2YZAA 2HZ0A 4L3JA 4IZYA 2RG6A 3F61A 2PYWA 3H9OA 3U87A 4GW8A 3QQJA 4EOMA 1H8FA 4ANOA 3DAJA 5E8XA 5AUYA 3HV7A 3PPKA 4RJ3A 2JDRA 5ACBC 1OL7A 3WF7A 5JZJA 4RQVA 5BUIA 4R5YA 4MQ1A 3R73A 1GZNA 3VUTA 2VN9A 3ET7A 4O7NA 3GCPA 2PVYA 4BBFA 4FTOA 3D4QA 2C4GA 2VUWA 4DCAA 1XQZA 4RFMA 3RNIA 5AP6A 4Q5HA 4R5SA 3QLFA 4PL5A 1KE7A 4B8LA 4NFMA 4AOJA 1YDTE 4CQEA 3F3ZA 2BZJA 3AOXA 4O6EA 1AD5A 5CSPA 1DAYA 2J5FA 4NK9A 1W7HA 3A7JA 3HDNA 4YO4A 4D58A 5ANGA 5K0KA 3QD2B 1K9AA 3NAYA 3MH1A 5TE0A 4F7NA 3ATSA 1SYKA 4EONA 2QLQA 5I9YA 1OL5A 2WD1A 3SW7A 5FRIA 1G8SA 2GDOA 4C3PA 4G3FA 5EQPA 3RPVA 3DK7A 3VHEA 5BVFA 2ITOA 3E87A 3CJGA 5HLPA 3LCOA 1E9HA 5D9HA 3KRJA 3NUPA 3RPRA 4M13A 2G2IA 2ZYBA 4UMPA 4IANA 3W2QA 5LQFA 5M51A 3LM0A 3ZBXA 4C4GA 4TN6A 4UMQA 2E2BA 5ITAA 3OY3A 3G9NA 3R04A 3R6XA 4LRJA 4ZSGA 4D1SA 3PA5A 3IOPA 4ZXTA 4IWDA 3I5NA 3DB8A 4BDJA 4II5A 2JDTA 4BCIA 3BI6A 4BDGA 5HVYA 4KB8A 4Z7HA 2XEYA 4QMMA 5GIPE 3RPYA 1JVPP 2GHLA 2WB8A 4BF2A 3VUHA 2XKDA 3R21A 4FF8A 4BIEA 5A3XA 2UW7A 1PXNA 5DI1A 4QP7A 5EQEA 5F20A 2VO6A 4C59A 2ITYA 2FYSA 4FEQA 1R0PA 5DNRA 4FSUA 3VQUA 1NY3A 4C37A 3LMGA 4IBMA 3U55A 3TUCA 3HVCA 3UNJA 4BDKA 5L4QA 3ZLWA 3FI2A 3ACKA 4CRLA 4FTJA 2YLFA 2WTKB 3VO3A 2CLQA 1P4FA 2HXLA 2JIVA 2PZ5A 1U4DA 3ORNA 3FZ1A 2ZV7A 2JC6A 4B6LA 4MWHA 4AP7A 4MXXA 1YQJA 3FKNA 4EOJA 2IZSA 3C50A 4G5PA 4O0WA 2B7AA 4K0YA 5IH6A 4M67A 4F9WA 2OH4A 2IJMA 1ZYSA 4IX5A 3RZBA 4EZ5A 1NA7A 1PHKA 3HMMA 3M42A 2VTNA 4TW9A 4LQMA 3EOCA 3SD0A 4BDAA 1U5QA 2W4KA 5HBHA 2IPXA 5BQ0A 2NRUA 3VS5A 1OUYA 4AW5A 4G6LA 4XEYA 4YJOA 4F08A 4RX5A 1JLUE 4OTIA 2BFXA 3KXHA 2B4SB 2XNPA 3R30A 4GS6A 2WQEA 4O0VA 4C4EA 4HGEA 4XRLA 3VF9A 3R2BA 4QMPA 3TTIA 3KULB 3U6HA 5EYDA 1WBSA 4FIHA 4GVAA 4FYNA 4EQUA 3UO4A 3WBLA 4A4LA 4CFXA 4E4LA 3ERKA 3U6JA 2F2UA 4YZMA 3R1YA 4FKLA 1ZYCA 5IQIA 3QRJA 5EH0A 4HCUA 1FBNA 3IW6A 2WTJA 5EHLA 5AUZA 3W33A 5J1VA 4QYGA 4M7IA 5HG7A 3TV6A 4HVSA 2OIQA 2WXVA 5FWKK 5FGKA 1BUHA 4DH7A 2Q83A 4ERWA 3R7EA 5AP0A 2I0YA 4I22A 4YTFA 3LJ0A 2HWOA 2WTDA 4DCEA 3V8WA 3EIDA 2WMVA 4R3PA 5CF5A 3QQUA 1OVEA 3QWJA 1OIUA 1APME 4IXPA 1JQHA 3MPAA 5H8BA 3ZO4A 3I60A 4DE4A 2PY3A 4KS7A 3HNGA 2BFYA 5L8JA 3R9OA 2R3RA 5AMNA 3TZ9A 2ACXA 4IX3A 3QRUA 5CU3A 5CTPA 3DOGA 4K11A 3GU4A 5DA3A 3T8OA 4BCNA 4DC2A 5LMBA 4X2JA 4Y8DA 3HECA 3IOKA 2RIOA 4EYMA 3EZVA 3QZFA 4YURA 4UWCA 3N51A 3PXFA 1IAJA 5AP7A 2X2MA 5L6OA 1KUTA 4BTJA 3M2WA 4FKRA 5EM7A 1J3HA 2ITVA 4RIYA 4K77A 3PWYA 3CPBA 4OTGA 3M11A 2UVXA 5K4JA 5BYLA 5BVDA 3OS3A 4USEA 4AFJA 1QPEA 3DQXA 1UWJA 3D94A 5FEDA 1YWRA 5M07A 4O2ZA 5JEBA 4QOXA 2BPMA 4FYOA 5ETFA 3UVRA 5ANIA 4UX9A 4JBPA 4ZZMA 4C4FA 2BKZA 4TTHB 2ITQA 4RA5A 3FHIA 4AT4A 2W1HA 3O8TA 1YWNA 3Q96A 4YBJA 3BCEA 4I0SA 2BROA 1FVTA 4RVKA 5AUXA 4Y85A 3WZDA 1YI4A 3FPQA 4R1YA 2QODA 1HOWA 3EFJA 4QMTA 4HPTE 2UZLA 4AF3A 5FQDC 4I1ZA 4IC7A 2XIYA 2UW3A 2X1NA 3QCSA 1YKRA 5I3RA 2R3IA 3EQFA 4A9TA 1XH9A 4ZZNA 3AGLA 2PVFA 5CF8A 3PE1A 4L68A 4TYIA 5TT7A 4JQEA 1ZYDA 3MA3A 2WFYA 2X8DA 2OGVA 4EH2A 4OBQA 4YLKA 4ZLYA 5M57A 2GMXA 4ITHA 4YR8A 3C1XA 5CVHA 3ANRA 3AD4A 5C27A 2PVMA 1GIJA 4AE6A 5CF4A 4J52A 5CT0A 3E5AA 5AR5A 4MCVA 1W82A 4TYJA 4WSYA 2BRMA 2XNBA 2R2PA 4FIJA 2W17A 1URWA 4M69A 2XCHA 4QQ5A 5LARA 4APPA 4F1MA 3QRIA 4XCUA 4DAWA 3RM7A 2VNWA 3BBWA 4Y46A 2CNQA 3FLQA 3P23A 4L43A 2WQMA 3ZYAA 2EVAA 4C33A 3JXWA 4I3ZA 4CYIA 2V7OA 2C6DA 4UYAA 4JT3A 4ZSJA 3GOPA 3R1QA 3MFTA 4D5KA 3BLRA 3ORIA 3WF9A 3AQVA 1PYXA 3DK3A 5FTOA 2WMTA 4QYYA 4FZDB 5IA1A 3I6WA 5CF6A 3ZDUA 1YVJA 3DKGA 5C03A 2B9JA 3SDJA 2DWBA 3TTJA 4LMNA 3V8TA 4RIYB 4IHPA 1OKYA 2A19B 3MIYA 4FKVA 1UU3A 3O8PA 2GNGA 4ANQA 2ITZA 3ZZWA 4C4HA 3OOGA 2OJ9A 2XNNA 2BRNA 2FGIA 4LYNA 4YJUA 1UA2A 2OJGA 2W1GA 2WMAA 4IDVA 3ETAA 2ITUA 4FV6A 3FLWA 4KKGA 3LCSA 4O7ZA 5L6PA 3EQHA 5IPJA 3PRIA 3QQHA 4EHZA 2VTMA 4U42A 5BNJA 2R3PA 5KKRB 1CDKA 4WIHA 3WE8A 2HK5A 4MK0A 1P2AA 3QD3A 3F3WA 5HO7A 3SRVA 3SC1A 4FMQA 4O7LA 4F9CA 2QONA 3GCSA 1R3CA 2UW5A 2VGPA 3TZ8A 3KXNA 5K9IA 4MXZA 5E92A 5AWMA 4AN3A 4ASDA 3ALOA 2XK4A 4I21A 4IADA 5EKNA 4L52A 3I0QA 3KF4A 3A7FA 3MI9A 4RWKA 5AR7A 3R00A 4RIXB 5I9WA 4PDPA 4GKHA 1NT2A 5D1JA 3BEAA 3GENA 4HJOA 4FNWA 3C4ZA 1YI6A 5AR3A 4FTTA 5CAQA 2V5QA 4AZEA 5IA5A 3JY0A 1WVYA 2HIWA 2G2FA 3CY2A 3Q3BA 4F65A 2WMXA 1LEWA 3EQCA 4GK2A 5GINE 4FGBA 3I6UA 5EM5A 4EWQA 4IWQA 3DJ5A 2PMIA 2RFDA 1BI7A 1BYGA 3FZPA 2IZRA 3OEFX 3PTGA 4IC8A 4NW5A 4W8DA 4DYMA 5HX8A 2W1FA 5A4CA 2Y6MA 4M69B 4YJSA 5EOBA 4CV8A 2CKPA 3FZTA 4DTKA 5GIOE 4GYGA 3G15A 2C5YA 5IKWA 1YOJA 1JPAA 5HQ0A 2Z7RA 2ZJWA 3NSZA 1ZWSA 1TVOA 1H1QA 3VIDA 4NU1A 1E1XA 2YIRA 4O0UA 4UXQA 4L00A 4D2PA 4IAYA 1H25A 5DOSA 4FV2A 4KABA 2VTSA 3GU5A 2CKQA 4KUJA 3Q60A 3MA6A 3LXKA 3QTRA 5I4NA 4IM3A 1Q24A 4WKQA 4RJ7A 2O8YA 4JLCA 2YCRA 4KRDA 4CLIA 2W99B 3U9NA 5HCZA 3D5VA 4NKSA 3KXMA 3TNQB 3ZXTA 2UZNA 2Y6OA 2NNWB 5CEMA 2VX0A 4O86A 4IQ6A 5LOHA 3F6XA 3HAMA 1MP8A 1PJKA 4O27B 3QYWA 4IM0A 3ORLA 3GI3A 3MJ1A 4FSMA 4BIDA 2ZDTA 3UVPA 4M3QA 5IQFA 3UYSA 4E3CA 2GSFA 4GT3A 3E63A 3NWWA 2VTQA 3OBJA 5IEYA 3NMUF 4J96A 1Q8WA 5CI7A 5IQGA 2VO7A 5AA8A 4EQCA 4L01A 2DS1A 3SRVB 2VX1A 1UU9A 3LQ5A 4F99A 3HV5A 1Q4LA 3RWQA 3QUEA 5IA3A 3TG1A 2ERZE 3FZRA 3LZBA 4I5PA 3TV7A 3IQ7A 3TNPC 3HYHA 3HKOA 3P79A 1YHSA 2YM6A 4E6AA 4F9BA 2IWIA 4QYFA 3LLAA 2ESMA 3I7BA 3IGGA 4AA4A 4BN1A 3WI6A 4MQ2A 3UTOA 3RHKA 3KY2A 4P7EA 3V6RA 4Y72A 3OTVA 4WSQA 1WBNA 5B0XA 5H9BA 3N4TA 4BY9E 3FXZA 4KBAA 4E5BA 2VWIA 3DT1A 2WMUA 2C68A 3C0HA 4UZDA 4XNEA 5FP5A 5BMMA 2C30A 2IVVA 2E9VA 3MVJA 4PF4A 3WZKA 3E62A 2GNLA 3ULIA 1GNGA 5M4UA 3DXNA 2ITPA 2OH0E 2OWBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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