3PG3A

Human p38 map kinase in complex with rl182
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
350
structure length
337
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKSQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDSELKILDFGATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSLESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based design and synthesis of cell active N-pyrazole, N-thiazole urea inhibitors of the MAP kinase p38alpha
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 108
structure length 337
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2010-10-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pg3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pg3A01
4O21A 1AGWA 2W1IA 1BI8A 5JMSA 3DAEA 3BWJA 4ID7A 2WAJA 4I22A 4YPDA 4FICA 4OTWA 4P90A 1WBVA 3B8QA 2XBJA 3F5GA 4AA4A 2UZWE 5FP6A 3OMVA 2P55A 3QXOA 4F0GA 3ZCLA 1OIQA 1OBDA 3T3UA 5FD2A 2BZHB 2ZJWA 5CXHA 4EONA 1YQJA 3OWLA 4KIKA 4LQMA 4BC6A 5IDNA 4IMYA 4ZEGA 3U9CA 3KREA 2V7OA 1K2PA 1OPJA 3FSKA 4FSMA 3EQGA 3R7GA 1GIIA 3CTHA 1XH7A 1WBWA 3KY2A 2OKRA 1WBOA 1BKXA 2XH5A 3DJ5A 3R9DA 3RJCA 4AGUA 2VWVA 3JVRA 2BTSA 4ZY5A 5FBOA 3AD5A 3PZHA 3MVJA 4UWCA 5AP7A 4FE2A 3FYKX 5IZFA 3ROYA 2O63A 2XA4A 1YVJA 4OBQA 2QOQA 4FZDB 3FMHA 1O9UA 4J95A 4GU6A 1Q62A 4PV0A 5CEIA 4CRLA 2QURA 3F5XA 3PIXA 3NW5A 3R2YA 1JBPE 3WZJA 3EN6A 4F1TA 4FZ6A 1OKVA 3SXSA 4EQMA 4B6LA 4FSTA 2JBOA 4QPMA 5HG5A 3ZC6A 3QHRA 1YHVA 3ZH8A 4D5HA 1IAHA 3QXPA 3M42A 4BB4A 1BL7A 3Q6UA 5DI1A 2JAMA 3WYYA 3R1SA 3D94A 4ACHA 4HNFA 4U9AA 4MEDA 3F3VA 4PMPA 5HVKA 4RVMA 2WMTA 4A7CA 3FL5A 5L6PA 3HLLA 2C6EA 3KN5A 4YZDA 1P4FA 2B7AA 5AJQA 4BGGA 4YNOA 1F0QA 3HA6A 4C38A 4D9TA 3Q4UA 4QMPA 1KE9A 3ZZEA 2YLEA 1MP8A 3QQKA 3F2NA 4KS8A 2GFSA 2WQNA 3QKMA 2WOUA 4XRJA 3TG1A 3KA0A 3RGFA 2OXXA 3H9OA 4BBMA 2QHNA 3MPMA 2UZVA 2WTIA 3BX5A 3GC9A 4A4OA 5LMBA 4L42A 4QMNA 4YJUA 1MUOA 4X2GA 3WF7A 5IEVA 1OL7A 1OM1A 5D1JA 1W82A 4DEGA 2Y6OA 1QPJA 3BHVA 1X8BA 1LEWA 3ALOA 4XEYA 2VGOA 3AT3A 5I9VA 5HG8A 1CTPE 4YSJA 5DYJA 3OW4A 5C9CA 3PY3A 3UO6A 5DBXA 4RWKA 4WOVA 4CNHA 5HBJA 3QCXA 4FNZA 1B38A 2X6EA 3P9JA 2A0CX 3WILA 4Z16A 3OTUA 4YBKA 3KRJA 2ESMA 4EOJA 4YHFA 5CEQA 2C5NA 2C47A 4EK5A 2BALA 3FV8A 4AZEA 4U6RA 3MTFA 3WZEA 3WIGA 3FLSA 4C4IA 3R7VA 4UX9A 3HAMA 3SW7A 2B9JA 3CPCA 2ETRA 3H9RA 4IH8A 5K5NA 1OMWA 3NYOA 4IAAA 3IOPA 4JIKA 3TNQB 4FI1A 3IK3A 3P7AA 3E7VA 4JAIA 4MVFA 3L9PA 3VS3A 4QMYA 1M7NA 1O6YA 2VTSA 4AWIA 5HORA 1OKWA 3FMKA 4BCFA 4R6VA 3CQUA 3D5VA 3PUPA 4FTAA 3ZO3A 3P1AA 5HNGA 2PU8A 3ITZA 3FI3A 5AIKA 1PXNA 2R3QA 3LFDA 3P7BA 4J7BA 4FKQA 5BYZA 4GJ3A 2VTOA 4BTFA 2VNWA 4IX5A 2YWVA 3FKOA 4BN1A 2GS7A 3GNIB 3GVUA 3PFQA 4M14A 1YRPA 3HP2A 1YXSA 1MRUA 2PK9A 2PZIA 4JS8A 5IQGA 3S2PA 1TKIA 5J9ZA 4X21A 2W1EA 3LLAA 1OIRA 4V05A 2B9IA 2X0GA 3IONA 3TDWA 3MY0A 2BDJA 2BZIB 2CGXA 3DK3A 2R7BA 4FODA 3L8XA 1RW8A 4M69A 3VQHA 5M06A 2VX1A 2PUUA 4BTKA 2XKEA 4I4EA 5I4NA 2ZV2A 2W1HA 2I40A 3L8VA 3GQIA 3HDNA 2PE1A 5M4IA 1JAMA 3ZU7A 2BAJA 2J0MB 3LJ0A 3WF6A 3W2CA 4RLLA 3OEFX 2PWLA 3LFQA 5BQ0A 3TUBA 4F99A 5IQFA 3TZMA 3L9NA 3UBDA 4UB7A 2YM5A 4IWOA 1U59A 4PDPA 4AE6A 2XK9A 5G6VA 4MBLA 3OW3A 4DINA 3I6WA 3ZDUA 4JX7A 2C6DA 4RBLA 5DNRA 4CZYB 4L67A 3IPHA 3EQCA 5HX8A 1R1WA 2BUJA 1JKLA 4MD8E 3UNZA 3KRWA 3TCPA 3L8PA 4RVLA 5GINE 3D5UA 5EI8A 4BZNA 4K33A 1OB3A 4O96A 3OZ6A 2ZVAA 2FA2A 5B0XA 3ZEPA 1Y6BA 4ACMA 4B7TA 4RIYB 3JR1A 1EH4A 1CSNA 3UGCA 4H1MA 4JL9A 2J0IA 5AP2A 3UOJA 3R02A 4JRVA 4C02A 3PRIA 3EZRA 4WBOA 3ODZX 5ICPA 3ZC5A 2CNUA 3WBLA 2X2MA 5CASA 3O17A 4AA0A 3QWJA 4YZCA 4QYGA 3VIDA 4RGJA 4JBOA 3PJ8A 1JQHA 4I0RA 2WZJA 2F2UA 4F64A 3P08A 3DDQA 3OROA 3FPQA 4RJ6A 3VULA 2YM4A 2OIBA 2JIUA 4TWOA 4I0SA 4EUTA 1NT2A 4Y46A 5C01A 3GXLA 3F6XA 2IW6A 5J7HA 3TI1A 5EKNA 2P33A 1DI9A 3CQWA 3C50A 4S2ZA 5ANDA 1FOTA 5IA4A 3QCQA 3KCFA 5AP5A 4OTGA 4U81A 3MFUA 4FC0A 3ORPA 2Q0NA 2PTKA 3Q4TA 3KF4A 4RRVA 4CXAA 3QD3A 3W2SA 4USFA 1YXXA 4JLCA 1JKSA 2QOFA 3A99A 4MWIA 1SM2A 4D2RA 4UALA 5EDRA 4C0TA 5EK7A 3CXWA 3GCVA 3MTLA 3OT3A 4YZNA 2WFYA 4BY9E 3DK6A 2YLFA 3VBXA 4KINA 3QTUA 5C4KA 4QP9A 1SVEA 3ATTA 4L3LA 4L7FA 3PA3A 2VWWA 3L1SA 4UYNA 5FDXA 3R7IA 4K8AA 5E8SA 2F2CB 2VUWA 3K5UA 5KMLA 3FDNA 4HVHA 4O82A 5AADA 5D9HA 2IZUA 1PMVA 4BDKA 2YIYA 3SAYA 4YNEA 4M68A 3DJ7A 3DBEA 4FOBA 2GQGA 2XNPA 4MHAA 1UKIA 4QP1A 3RK9A 3LM0A 3OF0A 3EN9A 3HL7A 4BHNA 4D5KA 2XCHA 2XMYA 1YXUA 3SC1A 4FTOA 3IDBA 2CGVA 2YABA 4BF2A 3UQFA 1KOAA 2BRGA 3AGLA 3FLQA 3QBNA 4RX8A 3ZM9A 4CCBA 4FYOA 4CCUA 3DCVA 4ZY6A 3CBLA 3FZTA 3SXFA 4A4LA 4WUAA 2RSVA 3KKVA 1M2PA 3OCBA 3BQCA 3L8SA 4NFMA 5HCZA 3AMBA 3Q9WA 3SW4A 3ZUUA 5BVOA 3GUBA 2Z02A 2HZNA 4O7SA 4O7RA 3VUKA 4ZY4A 3EIDA 5LQFA 2OZAA 1KV1A 3HRCA 4JI9A 3P0MA 2PVHA 2X39A 5E91A 3CKWA 2XJ1A 3PE2A 4O7WA 3MIYA 4WSQA 2XNEA 4IACA 3C0GA 5E8WA 5EOLA 3VVHA 4EQCA 4XG4A 5ETIA 4YJQA 4BI1A 4CLIA 4Z3VA 4YLKA 2BIKB 3PIZA 3E3BX 4FV1A 3CTJA 3RK5A 3OCSA 1H0WA 2GNFA 5D7AA 1PY5A 2PUPA 2VO7A 4ITHA 2DWBA 2UVXA 4IDTA 3TTIA 2O0UA 4JDIA 2X4FA 3SRVA 4JG7A 3R7YA 3LMHA 3PE1A 2ACXA 2WELA 3QQUA 3QTXA 5J95A 3E5AA 2BHHA 2WIPA 4OT5A 5HE2A 3DKOA 4IZAA 4EHGA 4O83A 3I0OA 1PXIA 1K3AA 3QX2A 4QMVA 4Y83A 3BQRA 2DS1A 3G90X 3O71A 2Z60A 4Q2AA 4MXCA 4UZDA 1UNLA 2QI8A 5TO8A 2B54A 3UNKA 4YTCA 3TZ9A 3MESA 3BRBA 4AFJA 4IJPA 4I5CA 4EC9A 3S0OA 2QCSA 2VTJA 5AR7A 2OU7A 3WF9A 1G8AA 4FBXA 4PY1A 2PVJA 2IJMA 2UZNA 2YZAA 4BBFA 4AZVA 3TNHA 4FV8A 3VNTA 5FRIA 5DWRA 2JAVA 2YM3A 1T46A 2QNJA 3FMJA 3HKOA 1URCA 2WQEA 1YDTE 3EH9A 4X3FA 4DGNA 4WUNA 4CD0A 1J3HA 5ACBC 1PYEA 3OUKA 1Q8WA 1F5QA 4YGAA 4M0ZA 3GU8A 4QPSA 5H8GA 4L46A 2R3LA 4IAZA 4L6QA 4F7NA 3A2CA 4XNEA 4B8LA 3I7BA 4ZSEA 4GT3A 4RPVA 2BHEA 3AC8A 5E8TA 2B55A 3VQUA 1JSVA 4A9RA 2WTKB 4TRLA 3VS0A 5FTGA 4FKUA 5CXZA 1OUYA 2C6OA 2PVLA 3REPA 1GIHA 5I9UA 1V0BA 2P0CA 2C30A 4ANSA 3AT2A 3KQ7A 2HW6A 4V04A 5GZ9A 4DGMA 4DH1A 5IA2A 3E7OA 4HYSA 4MAOA 4PUZA 3DKCA 1ERKA 1OVEA 3NRMA 3W16A 4F70A 4R7BA 3R9OA 1M2QA 3C4WA 3PTGA 1MRVA 4PMSA 4WNOA 4CLJA 3I7CA 3W8LA 3DBQA 3COIA 2UW3A 5IMXA 5L2QA 2BRHA 3UPZA 3OVVA 5AV1A 3ROCA 4KRCA 3VAPA 1JKKA 4RIWA 4XMOA 4FSRA 3G6HA 3QGWA 4C7TA 3U55A 2XM8A 4D2SA 4FA2A 3GCSA 4HNIA 5HG7A 5AAEA 5M57A 3QZHA 2EXEA 2ZDTA 4GK4A 4U3ZA 4WG3A 5IDPA 3E8EA 3FMNA 1XH6A 4LL0A 5CEKA 3AC1A 3PJCA 4L53A 2ETMA 4B4LA 4OTPA 3IW5A 3LMIA 1XBAA 4F65A 3RM6A 2YACA 4DFZE 4DH5A 3PSBA 4RJ5A 4PNKA 5JGDA 5L4QA 4KBAA 5I9XA 5HOAA 2B4SB 2R9SA 4TYIA 5BVNA 2WO6A 4PPBA 3QD4A 2PVYA 4FIIA 3CCNA 1A48A 3MWUA 1JVPP 4BDCA 3PWYA 5FTOA 3NIEA 5DRBA 3FZSA 4DFBA 2XK3A 4ANBA 5D7VA 1S9JA 2R3OA 3L9LA 4FV9A 4CMTA 4EJNA 3ORTA 3VS6A 4O0WA 3C5UA 3QTIA 5CSVA 4ZJVA 2CPKE 5IQDA 1Q8YA 3GOPA 5J9LA 2NPQA 4EOOA 4E8AA 1NW1A 4G2FA 2WIHA 4YLLA 3ZLYA 4ASXA 3QHWA 3QQLA 5KCVA 4JJRA 2CJMA 4R1YA 1H26A 5EM5A 3CQEA 3RAHA 3NNWA 2CNQA 3H9FA 2O64A 4I4FA 4HGSA 2YM6A 5B2KA 3MSSA 1GZ8A 2VWZA 4RJ8A 2WNTA 2QU5A 4UV0A 4F7JA 2LAVA 5BYYA 2JDSA 2R3FA 4S31A 4IVBA 5DMZA 3MYGA 1DM2A 4FSUA 3R8VA 4C36A 4NFNA 4C57A 3OC1A 5L6OA 1KE6A 4KABA 3FMMA 3H30A 3LXLA 4XG8A 3CGOA 5CQUA 3RTPA 1Q4LA 5IF1A 3R8PA 3P78A 5LVPA 3FL4A 3QZFA 1BYGA 2RG5A 4J8NA 4F7LA 3NUSA 1XH9A 4ZS0A 4CZTA 3QD0A 4FGBA 4FIEA 4WD5A 4C35A 2YEXA 5CEMA 2UW4A 3LPBA 4J52A 3F3TA 5A4QA 3U6JA 3A60A 2ITUA 2OGVA 5AWMA 1SNUA 4D28A 5FM3A 1UVRA 4Z7HA 5C8KA 2Y6MA 2VTQA 5AR5A 5KBRA 4YBJA 4K2RA 2E9PA 3O50A 3R1YA 1ZYLA 3CGFA 4QMMA 4TYHB 4CFNA 3JPVA 5L8JA 2WTKC 4QQJA 5HO6A 3PXFA 2W1ZA 4EZ3A 1YI4A 3MJ2A 4FTUA 1S9IA 4BDHA 4XX9A 2VAGA 5AP0A 3D2KA 3OWKA 4E5AX 3TN8A 2C5VA 5AP6A 3V5QA 4DBNA 3JYAA 4JVGA 4BCHA 4ZSGA 3MB6A 1H1SA 3TEIA 1OKYA 3FKLA 4L3PA 1JKTA 5CLPA 3UZTA 1J91A 4UMQA 4L3JA 1VEBA 4U40A 2BRNA 2UVYA 4HGTA 2CGUA 2UZEA 3MGYA 3HVCA 4D2WA 3ULIA 1G8SA 1OECA 4LUDA 3CPBA 3ETAA 2YAKA 2B9FA 4XP2A 4O6LA 5DLSA 2YITA 4FX3A 3UVRA 4O7YA 3ZS5A 4BKYA 2H9VA 4IB1A 3MV5A 4JDKA 4O6EA 5AV0A 4WNMA 3OY1A 4AACA 1KV2A 2H96A 3FLYA 3GT8A 4J53A 3S95A 3ZDIA 3EHAA 3ALNA 4CQGA 1G3NA 3OCGA 1RJBA 3W18A 4EH9A 4L45A 3FZRA 5CENA 4PP7A 5LMKC 3EFWA 2BZJA 3LJ2A 4FV3A 3BHYA 3BHHA 4H3PA 4NTTA 3PVGA 3QTQA 3OT8A 4UMTA 4I24A 4PDOA 1P4OA 2VWIA 4D0WA 5H9BA 2OLCA 4RIOA 4H05A 4IHPA 3A8XA 3KK9A 2CKEA 3KEXA 4S33A 5ETCA 1W83A 5GZAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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