4DEBA

Aurora a in complex with rk2-17-01
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
264
structure length
264
Chain Sequence
KRQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSVHAPSSRRDTLCGTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Development of o-Chlorophenyl Substituted Pyrimidines as Exceptionally Potent Aurora Kinase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aurora kinase A
total genus 76
structure length 264
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4debA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4debA01
3FY0A 4MNEA 4QOXA 4AA4A 5T3QA 3P0MA 2ZJWA 1PXKA 2QU6A 4CFMA 4OAUC 4E5BA 3UPXA 2FSLX 2YEXA 4ZLYA 4GG5A 1PY5A 3PP0A 1KE6A 3ORXA 3H9RA 2GMXA 3P1AA 5CQWA 5J5SA 3FI8A 4ACDA 4CFWA 2PHKA 2W96B 4AZTA 3HAVA 1ZMVA 5HORA 4O7NA 4A9TA 4G2FA 2FSMX 5J87A 5LXMA 3KMMA 2W4JA 1BMKA 2KTYA 4OTGA 5HO8A 1GOLA 4ANSA 2OG8A 1DI8A 5LVPA 4PPAA 4E4XA 3FSFA 3DNDA 3QTXA 1S9IA 5LVLA 3V6RA 5AA9A 4FNZA 4PL3A 4TWNA 2C1BA 4KIKB 1X8BA 4FV4A 3MFUA 5JGBA 4EZ7A 2WQOA 3TEIA 3Q96A 5L6WL 4DFYA 4CG9A 4G9RA 5KHXA 5LVOA 3QXPA 2P4IA 4ZOGA 4IANA 4D2SA 2BRNA 4RA5A 1UU7A 3FZOA 2GS7A 4BHZA 4C35A 3W8QA 4O22A 5DIAA 1UNHA 4FBXA 2RL5A 3UQFA 3JVRA 2PUPA 3A7JA 5EDPA 5J9YA 3VS0A 2AC5A 4J52A 1ZRZA 2R3IA 4EONA 2PMNX 3D14A 3SAYA 3WZUA 4F64A 4EHZA 4MXXA 2FH9A 4XV1A 4YHJA 4DH7A 3F66A 4MD7E 4BYIA 4IFCA 4IWDA 1Y6AA 3ENHA 3TUDA 5GZ8A 2VN9A 3EWHA 2CNQA 3TDWA 3VS7A 4DT8A 3ZDIA 2OZAB 5AUWA 3LQ3A 3AMBA 4IJPA 2GNFA 2HIWA 4J95A 4XNEA 5EOBA 4L46A 5EYCA 4QQ5A 4AZFA 3ZU7A 5IA4A 2Y6MA 4MF0A 3VBWA 5GIOE 2YM3A 2CCHA 4RFMA 4KRDA 3G51A 3L9LA 3CKWA 2PVLA 3PG3A 4FTJA 4W4WA 4E4LA 3H0YA 1GZNA 2HXQA 3BHUA 3OUNB 4BCKA 4D0XA 3Q9ZA 2G15A 5HTBA 3ORMA 5LCKA 4C62A 2VTMA 4IB1A 1G8SA 1SZMA 1Q5KA 5IUHA 5H8GA 4PMSA 1BX6A 3NVMB 5CAQA 3FDNA 5M08A 5A4QA 1F0QA 3F3VA 3KULA 1JLUE 3RPSA 4QMXA 4DH8A 3QRJA 3VUMA 4O2PA 1OPLA 4AA5A 3DJ7A 4YPSA 1YDSE 2I7QA 3V8WA 4FODA 3VO3A 4G6LA 4ANOA 3O23A 3DXNA 5CSVA 5DH3A 3KRWA 1XH7A 4DAWA 5EYMA 5CEKA 4EH7A 2ZB0A 4TZRA 4EJNA 5A4LA 2QI8A 3OTUA 4IM0A 4BKYA 5FEDA 4RZVA 4AGDA 4E4NA 3RPRA 3GI3A 4N6ZA 2O65A 2HENA 2WQBA 3LPBA 5L2WA 3QU0A 5AEPA 2B9JA 3F9NA 4NIFA 3G15A 2R2PA 4ASEA 5E4HA 4AX8A 2GFSA 2JIUA 5CEMA 4XG6A 3NSZA 3C4ZA 2VTPA 3EN9A 3EYGA 5LMKC 4JVGA 2Z2WA 5DE2A 1H1RA 5EI6A 3WYXA 4EWHA 3VW8A 5A14A 1JSVA 3PE2A 3PZEA 4FL2A 4OBPA 3QWKA 2CGUA 4M69B 5TR6A 4DH1A 5B2MA 3U55A 1OUYA 4LFIA 3CCNA 3OY3A 4RBLA 2NNWB 4LYNA 4O81A 5A4TA 2BZKB 3DLSA 4Y95A 5T6KA 4AW5A 2XK4A 1W98A 5HVJA 2R3NA 2BROA 1PXMA 4FZFB 4G3EA 3TZ7A 3LMHA 1YW2A 4GH2A 1UU3A 4YC6A 4ZTSA 4WNMA 3R9OA 4C8BA 1E1VA 1ZYCA 3JR1A 1H08A 1WMKA 1Y8YA 3K5VA 3OWKA 4D5KA 3D2IA 5LMBA 5JKGA 4MEDA 5L2IA 2ZYBA 2QVSE 3QD0A 3DY7A 4DFNA 3PSCA 4AACA 4LGHA 4RC4A 1FBNA 4O91A 2Q83A 1W84A 2CMWA 4ZSJA 1GJOA 2HW7A 4J71A 4HVGA 3Q5ZA 3N9XA 2XP2A 3P86A 5CALA 3KRLA 3ZO1A 3VQHA 3W8LA 2WEIA 5GZ9A 3LFEA 2XKCA 1H25A 2C6EA 2VRXA 2XNMA 3LXKA 4L52A 4R5SA 3P7AA 1SVEA 1Q61A 3BQRA 1JVPP 3PPKA 4CCBA 3IW8A 5IPJA 3OUKA 3F2NA 3ZZEA 4D4YA 3UOJA 4GSBA 2I0EA 2WIPA 3R21A 3R04A 4YLKA 4DEIA 4ENYA 3LM5A 3IW4A 3MIYA 3R8UA 3UZRA 2ITVA 2GS2A 3Q2MA 4FKJA 1RE8A 2XK9A 4BDEA 3AC4A 4O27B 4OUCA 4PF4A 3RCDA 4QYEA 2PVMA 3VIDA 2VTRA 3OFMA 4CKJA 2PU8A 4FKTA 4W4VA 3P5KA 4D55A 4DF3A 5IUGA 2ITUA 2PMLX 4RIWB 4R7IA 1IASA 3IO7A 4DN5A 1Q8UA 3OC1A 5HKMA 3FV8A 3ORNA 4I23A 5C8MA 4AN2A 4GT3A 3GUBA 4HNIA 3QRUA 2WO6A 4DGNA 2EXCX 3EQRA 1YI3A 3I4BA 2X7GA 5AX9A 4YSJA 3NAYA 2GHGA 4HVIA 3FE3A 2PL0A 3E8DA 4IAYA 5L8JA 3UE4A 5I9VA 3LCOA 5IMEA 5HU3A 1PMNA 3OXZA 5AP5A 5HU9A 2PVHA 2QU5A 4F99A 3LIJA 5AP7A 3O2MA 4BWPA 3TACA 2XNOA 3LFAA 3CKXA 4MXZA 3HV7A 3PXRA 4Y85A 3GC8A 4CKIA 4F6SA 3QUEA 5KBRA 3C5IA 5HTIA 3SC1A 1UU9A 4RWJA 2JGZA 4F9AA 1ZY4A 1ZXEA 3H4JA 5J95A 5DT0A 3DPKA 1ZWSA 4JAJA 4YBKA 2PZPA 4CFUA 3IECA 4FV6A 3BKBA 3KKVA 3QTIA 3JYAA 1H01A 2WOTA 4IAZA 5JFXA 3GFWA 2BUJA 5J9ZA 3ET7A 2CKEA 4DCEA 2IWIA 4FSUA 2OFUA 1Y6BA 3KRJA 4IB3A 2I40A 3FMHA 3PDTA 5M06A 2WMAA 2J9MA 3BE2A 2UUEA 4O0WA 2UW6A 5C27A 3RHXA 3N4TA 2UW8A 4I5MA 4OT5A 3QTWA 4N4SA 4BTFA 1W0XC 5JSMA 4XUFA 1OL1A 1PXOA 4NFNA 2OJGA 4AZEA 4FX3A 3CIKA 4PNKA 3E93A 3FSKA 2BFXA 4ZJJA 2E9UA 4FI1A 1A06A 3BBTB 3AC3A 5CAOA 3PA4A 3GOKA 3L1SA 4C2VA 3B8RA 1L3RE 4C4JA 1R0PA 3ZEWA 2GNJA 5JFVA 4QP7A 3SXFA 4C2WA 3AT4A 2R3LA 5JN2A 2HZ0A 2H9VA 5IDPA 2J0IA 2Y0AA 3I0QA 4CT1A 2A19B 4U80A 1ZYSA 1OECA 4PMTA 4CTCA 4QMZA 4TWPA 4RJ4A 4NEUA 1K2PA 5CU3A 3RPOA 4E8AA 4F0FA 3BIZA 3RK5A 1W82A 4M14A 4DINA 2YCQA 4OBQA 3O7LB 4WUNA 1YHSA 3VF9A 1GIJA 1OPKA 1ZOEA 3JY9A 3ULZA 3DLZA 4TN6A 4WG3A 4NM3A 4XBUA 4BDDA 5AUVA 4Y46A 2J6MA 5K3YA 4OTHA 5CF8A 4NW6A 3QKKA 1PW2A 3QHRA 5KE0A 2WD1A 3CQWA 2ZVAA 4UALA 4BBEA 5EM7A 3IW5A 3NCGA 4J96A 3UOLA 3S00A 3MBLA 1AGWA 2I0VA 4GKHA 4PPBA 3MH3A 2BAKA 4M68A 3GCVA 5BX0A 3ORTA 2DWBA 3QKMA 1VZOA 4O2ZA 2W9FB 3I5NA 3MJ2A 2XIRA 5M51A 4GV1A 5KUPA 3GT8A 2VWYA 1F5QA 2GU8A 4QMMA 5C4KA 4LRMA 4QP6A 3R2BA 3ELJA 3PE1A 4UXLA 3DNEA 4JBOA 3Q53A 3R22A 3QZHA 3MPMA 5M55A 4NJ3A 3WF9A 5AAGA 4C33A 3HAMA 5IQCA 4JBPA 3C5UA 1PJKA 3BQCA 4OTRA 5C03A 4B8LA 4IVDA 1Q8TA 4IFGA 2PVRA 3RALA 4FG8A 2QOCA 3R01A 4IAKA 3FYJX 5CAPA 1PYEA 3R9HA 1JSUA 3I79A 2UZNA 1GNGA 3NNXA 3A7GA 4FG7A 3SHEA 4BDHA 3NVKI 4BTJA 4IVBA 4BGHA 2BIYA 4Z3VA 2OJ9A 1J7IA 3GCPA 4JDIA 5AM7A 4FGBA 4TW9A 1YVJA 5K0KA 5M4CA 4R7BA 3OROA 2OI4X 4J99A 4NWMA 1PXPA 5ETCA 5BYYA 2X2LA 4G6NA 4HYIA 2F7ZE 3GFEA 3TV6A 3NMUF 2C3IB 1GIHA 2JC6A 4J8NA 4ALVA 2B53A 2JDSA 2YM4A 4FIGA 2IW6A 4GT5A 3JS2A 5TO8A 4RIXB 4UYNA 2AC3A 2BALA 2FO0A 5DLSA 1URCA 5E8VA 4FYOA 3D7TA 3WF7A 3ZBXA 2HWOA 2WMRA 2XYUA 2XIXA 4M15A 4C38A 5ANDA 2WTKB 2XYNA 2B54A 3U9NA 2WAJA 1CKPA 3HMIA 4DLIA 4FTTA 4HCTA 3H3CA 5JGAA 4WHZA 4TYJA 4BGGA 3F61A 3LCDA 4U41A 2C0IA 5D1JA 3HV4A 3VUTA 3IGOA 4GEOA 1YXTA 2BRBA 5HNIX 3RNYA 4O7VA 5C26A 2YLEA 2J5FA 4S2ZA 3R1QA 5E9EA 4XG3A 2JAVA 5DR9A 4RWKA 4FKUA 4EHEA 5HD4A 4A4LA 4FOCA 4EOSA 1M52A 5KZ0A 4A9SA 4D58A 2WIHA 4O21A 3I6WA 3EL8A 3UZPA 3ZRMA 3PXZA 5EKNA 4F09A 3ORKA 3MI9A 3D94A 2W9ZB 3MGYA 2C6LA 4JQ8A 5IH6A 4OBOA 5FEQA 1YDRE 5EI8A 5AUXA 3JUHA 4FKOA 1XO2B 5EW8A 4AOTA 1EH4A 2IVVA 4IIRA 1M17A 4F7NA 2NP8A 4Y73A 5JRQA 4RVTA 3QBNA 3ID6C 3QA8A 5CWZA 2QG7A 4FC0A 3R7IA 4KIKA 2WB8A 2ZMDA 3ZZWA 5DNRA 2IPXA 1G5SA 2VWXA 4EK3A 5BVNA 1WAKA 4DFLA 2OXYA 5BVOA 4RX9A 5DVRA 3HNGA 5E8XA 3C51A 3TCPA 3EQIA 4LV5A 4IDTA 1PXNA 4X3JA 4ZY6A 2UVZA 3BRBA 2CLQA 2WFYA 3BU5A 3FXWA 3ZCLA 3WE4A 4EQMA 4O0YA 5IF1A 2C3LA 5AR4A 4F9CA 3FMNA 3QQHA 5EK7A 4XJ0A 2RG6A 4LGGA 2QO7A 4YJQA 3AT2A 4NTTA 5HNBA 4B9DA 4QMQA 2R3PA 3QZIA 3CJFA 4J98A 5D41A 3POOA 4MWHA 4YJVA 4YHFA 3V8TA 3WZDA 1XHAA 4HJOA 4IZ5A 2PE0A 2J5EA 4PDOA 4YJOA 5EW3A 2Z7QA 4MX9A 4BCQA 3K3JA 2PZ5A 3EKNA 2Y4IB 1IRKA 1KWPA 2E9NA 4G16A 3SKCA 4TWOA 5EM8A 3TG1A 3A62A 3HRFA 3K54A 4ALWA 2G9XA 4B7TA 1NVQA 3HEGA 4CZYB 3VF8A 1ZYLA 4L53A 5TF9A 2QOBA 4BGQA 1OITA 5CASA 2GS6A 2WMQA 3H9FA 3WF6A 4C61A 3IS5A 3ODYX 5HTCA 4YC3A 5I9ZA 2PTKA 3Q52A 4O1OA 2YDIA 4U43A 3QZGA 4FT5A 3VC4A 3ZC5A 4FEWA 2JLDA 3NS9A 4FTCA 4IX4A 3V5TA 1YI4A 4L7SA 3MFSA 5EM6A 2C68A 2WQMA 3ZONA 1BYGA 4D28A 3VHEA 1Q8ZA 3IONA 1OL6A 1LEZA 5BVWA 4I5HA 1OUKA 4G17A 4G3FA 3QA0A 1JKLA 5HO6A 2GTNA 4YTIA 4O7TA 4GT4A 4D4RA 4I22A 3S4QA 4NKAA 2J2IB 1Y8GA 4KBCA 3E3PA 4HGLA 3SRVB 4FTIA 3R7VA 5EDQA 2VO0A 1FINA 4MXAA 2E9VA 3HP5A 3P9JA 3DAEA 3PRIA 2W7XA 2VZ6A 2Q0BA 3BWJA 3EFJA 3I60A 4F1TA 3BWFA 1BI7A 3P23A 4XEYA 3DKCA 1YWRA 4BZNA 4I5PA 5E8TA 4ERKA 3W33A 3OF0A 4ZLZA 1PXIA 4GRBA 3RJCA 4F6WA 3VQUA 4PTGA 3TXOA 3PVUA 3QQUA 3VHKA 5C8KA 3WZKA 4I21A 3QQKA 3BCEA 1IEPA 1OIYA 5E8SA 5M09A 5CANA 3VUDA 3Q04A 3VUHA 4XS2A 2WKMA 4M69A 5CI7A 4ZXTA 5K9IA 1QPJA 2JIVA 2V55A 4ZTQA 4I3ZA 4L67A 2ITXA 5FBOA 2R3JA 2PZYA 3ZOSA 3D7ZA 2YITA 3BHYA 2IN6A 3F2RA 4FGRA 3FZTA 4R7HA 1JSTA 2WELA 4GU9A 5FM3A 3ALOA 4BCHA 2PSQA 2ZM3A 4PRJA 4RVLA 5ANEA 3V04A 3ACKA 4I6FA 4EI4A 3TTIA 4LMUA 3HGKA 5J1WA 2OICA 4MVFA 3ZUTA 5IQHA 4FVPA 2C3KA 3TWJA 4GJ3A 4Y5HA 4CNHA 4NSTA 4Q2AA 4RG0A 1F3MC 3EB0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FY0 A;  4MNE A;  4QOX A;  4AA4 A;  5T3Q A;  3P0M A;  2ZJW A;  1PXK A;  2QU6 A;  4CFM A;  4OAU C;  4E5B A;  3UPX A;  2FSL X;  2YEX A;  4ZLY A;  4GG5 A;  1PY5 A;  3PP0 A;  1KE6 A;  3ORX A;  3H9R A;  2GMX A;  3P1A A;  5CQW A;  5J5S A;  3FI8 A;  4ACD A;  4CFW A;  2PHK A;  2W96 B;  4AZT A;  3HAV A;  4DHJ A;  1ZMV A;  5HOR A;  4O7N A;  4A9T A;  4G2F A;  2FSM X;  5J87 A;  5LXM A;  3W0R A;  3KMM A;  2W4J A;  1BMK A;  2KTY A;  4OTG A;  5HO8 A;  1GOL A;  4ANS A;  2OG8 A;  1DI8 A;  5LVP A;  4PPA A;  4E4X A;  3FSF A;  3DND A;  3QTX A;  1S9I A;  5LVL A;  3V6R A;  5AA9 A;  4FNZ A;  4PL3 A;  4TWN A;  2C1B A;  4KIK B;  1X8B A;  4FV4 A;  3MFU A;  5JGB A;  4EZ7 A;  2WQO A;  3TEI A;  3Q96 A;  5L6W L;  4DFY A;  4CG9 A;  4G9R A;  5KHX A;  5LVO A;  3QXP A;  2P4I A;  4ZOG A;  4IAN A;  4D2S A;  2BRN A;  4RA5 A;  1UU7 A;  3FZO A;  2GS7 A;  4BHZ A;  4C35 A;  3W8Q A;  4O22 A;  5DIA A;  1UNH A;  4FBX A;  2RL5 A;  3UQF A;  3JVR A;  2PUP A;  3A7J A;  5EDP A;  5J9Y A;  3VS0 A;  2AC5 A;  4J52 A;  1ZRZ A;  2R3I A;  4EON A; 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