5L6WL

Structure of the limk1-atpgammas-cfl1 complex
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
306
structure length
290
Chain Sequence
SMPHRIFRPSDLIHGEVLGKGCFGQAIKVTHRETGEVMVMKELIRFDEETQRTFLKEVKVMRCLEHPNVLKFIGVLYKDKRLNFITEYIKGGTLRGIIKSMDSQYPWSQRVSFAKDIASGMAYLHSMNIIHRDLNSHNCLVRENKNVVVADFGLARLMDRKKRYTVVGNPYWMAPEMINGRSYDEKVDVFSFGIVLCEIIGRVNADPDYLPRTMDFGLNVRGFLDRYCPPNCPPSFFPITVRCCDLDPEKRPSFVKLEHWLETLRMHLAGHLPLGPQLEQLDRGFWETYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure Of the LIMK1-ATPgammaS-CFL1 Complex
rcsb
molecule keywords LIM domain kinase 1
total genus 84
structure length 290
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-05-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
L PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l6wL02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l6wL01
3A7JA 3NW7A 4EUUA 3R00A 3SD0A 2VWYA 5AV4A 4ZK5A 5IG1A 4FKSA 3V5TA 3I0OA 2QOKA 1CM8A 2UW5A 3LFAA 4PDSA 3UP2A 4RSSA 3ORMA 2QLUA 4HVHA 4JVGA 3DBEA 3MGYA 4RZVA 4IAAA 2FSOX 4ZZMA 3VIDA 3VRYA 4PY1A 2IZSA 5CAVA 5AR8A 4WG4A 4S2ZA 1U54A 5LVOA 3V6RA 2C1AA 2ZV9A 1K9AA 4LV5A 3GNIB 2WTDA 3LMGA 5E7RA 5JEBA 3W2QA 2FA2A 3PSDA 3DK7A 3OHTA 4KABA 4JRNA 2FSLX 3LXNA 2P55A 1BL6A 4FTNA 3PIXA 4J7BA 4UV0A 4WNMA 3A8WA 4Y85A 4ERWA 3N4VA 3KGAA 4O0VA 4A4LA 3OBJA 1ZYJA 1JKSA 3V8TA 2R0UA 3HA6A 1PXMA 3MB7A 5IPJA 3FZSA 3TT0A 4GVJA 4FKTA 4ZY4A 3EQIA 3MJ1A 3MBLA 3MFTA 4FG8A 4MYGA 5GZAA 5I3RA 2BMCA 4X2GA 4AN3A 4I20A 1U5QA 4J99A 4JX7A 2CKOA 4XOZA 1W98A 4HGTA 4JBVA 4FG7A 3COIA 3E3PA 3UOLA 5LCJA 3QWKA 3MWUA 5BMSA 3R9HA 3BX5A 4BZOA 4QP4A 3DGKA 5K9IA 3VBQA 4X6RA 2V55A 4AN2A 3FZ1A 4TWPA 5EM8A 4E93A 3L8XA 2YA9A 4F6SA 3L9LA 4QMYA 2V22A 3HKOA 1CKPA 5AP7A 5GZ8A 3HV5A 2CPKE 4FIJA 4QP1A 4BDFA 5IF1A 4S32A 2BIKB 2PZYA 2O64A 4CZUA 2JEDA 3LMHA 2BVAA 3ZM4A 4EI4A 2IVSA 5J9YA 1R0PA 4NFMA 3BLQA 4CGAA 4Y83A 2R3FA 4Q2AA 4FTKA 5EFQA 4DHFA 5CXZA 3Q9WA 1YWVA 2GMXA 2F57A 2KTYA 2ZYBA 2W4KA 4IVDA 4JBPA 3DXPA 3LXLA 3VVHA 4CFVA 3OCTA 4ZTRA 4XLVA 1X8BA 3BU3A 4O27B 5EKOA 4UMQA 4G17A 5CVHA 4FEQA 3C5IA 3SDJA 4A9UA 3ODZX 3HAVA 2X8IA 3BRBA 2R9SA 4K6ZA 2GNLA 3S2PA 5KHXA 4PNKA 3O23A 4F65A 4HGLA 5HG8A 4B7TA 3E62A 3C4WA 4G3FA 5A4LA 3D9VA 4XG8A 1PXNA 3KRJA 5AIKA 3KL8A 1T45A 3DY7A 2V62A 2BFYA 3MJ2A 4V05A 4DA5A 3KMMA 4ANNA 4TYHB 2C5VA 5K3YA 4EHVA 4CYJA 3F5UA 5CU0A 4D28A 3Q4TA 4EZ5A 4IX4A 3KMUA 4FTCA 3IW6A 4I5HA 2H6DA 1RE8A 3C0IA 3O50A 4M15A 2PVNA 4BC6A 4CFUA 1H07A 5E8UA 5T3QA 3O8UA 1W8CA 1J1CA 4FSUA 2ZB1A 4U80A 3CEKA 3P0MA 4P7EA 4KD1A 4RWLA 3UVQA 2UZDA 4H3QA 4JJRA 5HCXA 3NIEA 3UG2A 1XH7A 1BYGA 4D4RA 3OWKA 2RFDA 4UXLA 1MQ4A 5IQEA 4D2PA 4DEHA 4RLKA 5B2MA 2FVDA 4ZZOA 3N4TA 4O2PA 1A48A 4D2WA 4I6HA 5KBRA 4EOSA 2CMWA 3UPZA 2WTKC 1XH4A 1Y6AA 3HZTA 5BQ0A 4IACA 4TY1A 3SAYA 3MFRA 2RIOA 2HYYA 4GH2A 5FM2A 4ZSAA 5HZNA 2YITA 4FV4A 2QOCA 3VUHA 2YM4A 3PPJA 2ACXA 2OJGA 3SRVB 4CFMA 4WKQA 4DFBA 3IDBA 2C68A 3CC6A 2ITVA 1M2RA 5LMKA 3I5NA 2UZEA 4FZFB 5TF9A 3OW3A 3WOWA 4YC8A 5J5TA 4FTMA 1Q5KA 2C4GA 3MIAA 1RW8A 3TV7A 1M7NA 3UBDA 2PHKA 3QC9A 5CQWA 4RGJA 3ZO4A 3C4ZA 4KRDA 4PPBA 4FK3A 4GW8A 4XHKB 3TV4A 4QMUA 2UZTA 5M53A 2VTHA 2J90A 2OK1A 4K1BA 5EQYA 4CRLA 4I5PA 3CQUA 4XV9A 3VUMA 4BYIA 4YSMA 5CEOA 5KNJA 3KVXA 3O17A 1YVJA 2OF4A 3QD3A 4O1OA 4ENXA 2O2UA 4C8BA 1UU3A 5F95A 3PJ8A 4EH7A 4BIEA 3OTVA 4RWJA 3HP2A 1J7IA 3DJ7A 4FICA 2ZM3A 5HBJA 4XUFA 2WKMA 3KULA 3EHAA 3G6GA 1B39A 2R3LA 4O0WA 4DT8A 4LOQA 3TZMA 4ENYA 4R5SA 1ZMWA 1Q3WA 3GU7A 3FXWA 4IEBA 5CF4A 5BYLA 3WZDA 4C58A 2JD5A 4G16A 5AR2A 1OUYA 2XKDA 3MPMA 5D1JA 2PZ5A 3F3UA 3PSBA 4R7HA 4CQEA 5KBQA 3BQRA 3HV4A 5FUTA 2R3IA 3FJQE 1YRPA 3I6WA 1UWHA 4LUDA 3WILA 4A7CA 3R9RA 1JBPE 2YAAA 4NZWB 3OXZA 4MWIA 4MVFA 3D15A 2NRYA 2X4ZA 1Y6BA 1K3AA 3POOA 2C0IA 2X7FA 4CRSA 2GHGA 4F1TA 4HCVA 4JDKA 4EBVA 3NUUA 1XH6A 4L7FA 4JR7A 4U5JA 4IXPA 2OO8X 4EOLA 5M07A 2OJJA 4YHTA 4HVDA 3FC2A 3NYOA 4IVCA 2QKRA 4RX8A 2RGPA 3FZTA 5IA5A 4AT3A 4QYYA 3OCGA 1SVEA 3CPBA 3DLZA 2QOIA 1XJDA 3ORNA 3QKLA 4M8TA 4QPMA 3VS6A 5C26A 2CKQA 4X3FC 2BFXA 2IPXA 1QPJA 2X2MA 2XNBA 3DA6A 3G33A 3BPRA 4WRGA 4ZEGA 4AZFA 3GFWA 4DGMA 1SMHA 1JKLA 3C1XA 3UYTA 4OTDA 4OTHA 3VHKA 3UYSA 3A4OX 3RI1A 4F6UA 2X2KA 3WZUA 4EC9A 3FKOA 3E93A 5FDXA 2XKFA 3SC1A 1IASA 2QR8A 4PL4A 3FMHA 2XBJA 1MRYA 3UZRA 1XHAA 1FMKA 4E73A 3WZEA 2J0KA 1H25A 2A0CX 2HWPA 3GI3A 3QZGA 4FL2A 5DMZA 3ORPA 4FX3A 2YIYA 2CCIA 3Q2MA 2YCSA 3LLTA 4AZVA 1OPJA 3TUBA 5HOAA 4AGWA 3MTLA 1JVPP 3BU5A 5ANIA 3KA0A 5AR7A 3R7UA 3VF8A 2EU9A 5T6KA 4EZ3A 4JG6A 3QRKA 3NUPA 3TTJA 5BUJA 2OIQA 5IDPA 1VEBA 4NIFA 3V5QA 4ACHA 3I4BA 4FV1A 4PMTA 4CYIA 5IU2A 2F4JA 3MFSA 4BDHA 3UVPA 3GB2A 4GT4A 3DFAA 3QGWA 4QPSA 3UNKA 3H10A 3IDCA 2XNEA 3WF9A 4A4OA 3Q60A 2RG6A 1OIQA 2LGCA 3FHIA 1PXKA 3LM5A 1WBVA 3QRUA 4ZY5A 3KF7A 2W1IA 1PXJA 2X7OA 3V01A 3ZFYA 3U54A 3BCEA 5CTPA 5LVLA 3CR0A 2FYSA 3NYVA 3TM0A 1OITA 5JFXA 1TQMA 3NGAA 3P9JA 4ARKA 3ZEPA 3I7CA 4ZSEA 1ZWSA 4K11A 2PZPA 1YI6A 4G5PA 4PPCA 1PKDA 2GS2A 4RJ4A 3FLYA 4WHZA 1GNGA 4GU9A 4FEVA 4HVGA 2XK4A 3HV3A 2VWWA 3WF8A 4DFYA 2C1BA 3R7OA 5C8KA 3C5UA 4KIKB 3ZUVA 2QO2A 2UVZA 4H3BA 1IA9A 2O3PA 5AUVA 3N4UA 3EZVA 3V5LA 5A54A 4XMOA 1Y91A 4D0XA 1E9HA 3AC4A 3LCDA 3MN3A 4ZJIA 2UZNA 3BHHA 5E90A 4FZ7A 3R9OA 4NJDA 4FUYA 3LQ3A 3COKA 4O21A 2GQSA 4FEUA 3LFQA 3FV8A 1BI7A 1GZ8A 2WOUA 3SVVA 1EH4A 1VZOA 5CAUA 5CF8A 3R7IA 3OFMA 3BGZA 3RK7A 1Q8UA 4PDYA 5AUTA 2JDRA 4RJ3A 2RSVA 2PUPA 2W5BA 3ZCLA 4QQTA 1GJOA 5JKGA 4UMPA 3OXIA 2A19B 5IH6A 4IJ9A 4HYUA 4YJNA 4FNWA 4G9CA 3A7HA 3GP0A 4JLCA 2W7XA 3ZTXA 2PMLX 5H2UA 2CNUA 3E8DA 3IOKA 2BIYA 5CXHA 4XG3A 5JRSA 4TYGA 3PY1A 3MIYA 4PUZA 4A9RA 3GCPA 2XJ0A 4FODA 2AC5A 4MBLA 3S3IA 2GS6A 2X2LA 2ZDTA 1ZZLA 3GCUA 2PU8A 3E8CA 5HX8A 3RINA 3R1QA 3CE3A 5EK7A 3NUSA 2QONA 3ZSIA 3OY1A 4EEVA 5HD4A 3S0OA 3TUDA 1R78A 5ETCA 4X7QA 4O84A 2YM5A 4J97A 4YZBA 3NUAA 4RWIA 4BZNA 4C37A 4UMTA 2Z8CA 2XIXA 4WNKA 3QA0A 4O6EA 5HTIA 3FQSA 1F5QA 3NDMA 2WD1A 4UY9A 4K77A 5AUYA 4BGHA 2R5TA 2O65A 4P5QA 2FSTX 4I22A 2GHMA 4NT4A 2ZJWA 3NYXA 3G0FA 4EJNA 3QYWA 4X2JA 3FYKX 5EHYA 2X1NA 1M52A 5DRDA 4Q9SA 3VBWA 4YHJA 4O7LA 3CD3A 5BX0A 4YJQA 3W2OA 5BMMA 2VNWA 3KU2A 2J6MA 5BVDA 3W8LA 2QO9A 3T9TA 5AV3A 1PMNA 5AX9A 1R0EA 3WE4A 5M51A 3TTIA 4GMYA 4LL5A 5EM6A 4FSYA 3Q4CA 4PQNA 4U9AA 5DH3A 3MYGA 4E6AA 2IN6A 2J0LA 1V0PA 3FMDA 4Y95A 2A27A 2BAKA 5AEPA 1KUTA 4ANBA 4BI0A 3ATSA 2BZIB 5LMBA 1NXKA 3DB8A 4BF2A 2R3NA 4YMJA 2V7AA 2QHMA 4D2VA 1P2AA 4FV9A 4TWCA 4ACMA 2VTPA 3CCNA 4ZIMA 5ACKA 4EWQA 3IKAA 4NM7A 4NTSA 4YC6A 5A14A 1PMEA 2VO6A 4YZMA 3W1FA 3TUCA 4AT5A 2ITUA 2YFXA 4ITHA 3AC2A 3DXNA 5AP0A 1LUFA 5E4HA 2G15A 3NVKI 5HQ0A 4MXCA 3KC3A 1OZ1A 2Z7LA 2EXEA 4E4MA 4F63A 4B99A 2PY3A 3EN4A 4M69B 3GBZA 4CNHA 3RHXA 2I7QA 2I1MA 1KE8A 2XP2A 4MXAA 4QYGA 3D14A 2VO0A 3HMNA 2WQOA 2F7ZE 3ORLA 3F69A 1CMKE 4AF3A 5C1QB 4XCUA 5IH5A 1CKIA 2IZUA 4IC7A 4FSQA 2NO3A 4U3ZA 3RP9A 3GC8A 4E5WA 4MQ2A 3G9NA 2PVKA 2B1PA 4DEDA 3LJ2A 4RIYB 2ETRA 3ERKA 1URWA 4TW9A 3OG7A 3ZC5A 2OFVA 5GJDA 3O8TA 5HO6A 2GU8A 4I92A 4XJ0A 5BVKA 4NUSA 5J1WA 3ZSHA 1P4FA 4FYNA 4U41A 1PXOA 1U59A 3VC4A 2QLQA 4BTKA 3V5JA 3BEGA 4QO9A 4QQJA 2BPMA 3ANRA 2PSQA 3LCSA 4D0WA 3NLBA 3OVVA 2YM7A 2WELA 5DWRA 4AZEA 4RG0A 2PMOX 4C4IA 2JBPA 3LQ8A 1Q8TA 4FZAB 3C4XA 4MNEA 4DBNA 5HVKA 3EH9A 1KE6A 2C5YA 5HE2A 3LE6A 4UEUA 1GAGA 4EUTA 5AR3A 3FI3A 4UWBA 2ZB0A 4YJSA 3ROYA 4O81A 3Q53A 3KXZA 3ACJA 3TKIA 2XS0A 4QNAA 5ANKA 3WZJA 2HELA 4JG8A 2ETKA 2VU3A 3FKNA 4CMUA 1MP8A 1YXTA 3Q3BA 2BDWA 5IUHA 4OLIA 3B8RA 2YDKA 5EDQA 5FEEA 1ZMUA 4X2NA 3VS1A 4GYGA 5CY3A 1TVOA 3BE2A 3BYOA 3IONA 3TJDA 4EKLA 3DBDA 3L9MA 4LGGA 4CFNA 4FZDB 3H0YA 5C03A 2WGJA 5HX6A 2XK7A 3TNPC 4YR8A 2WTVA 3QTSA 3UOKA 4DCEA 4OTIA 4E7WA 4BDKA 5I0BA 4TYIA 4XS2A 4D2TA 3E64A 4C4GA 4DEIA 4NYEA 3MVMA 1YWNA 3ID6C 3RALA 4E6DA 1Z9XA 5BVNA 2G2FA 4QMPA 3GEQA 4FTLA 4R77A 3ZDUA 4DT9A 3NNVA 3VBYA 3ZRLA 2IVTA 4IWPA 2R3JA 4MQ1A 3KN6A 2XYNA 5DEWA 4EHEA 3R7GA 3FZOA 4RC4A 3CQEA 3WF6A 4N70A 2J5FA 5ITAA 2CSNA 3Q96A 3ENMA 3OWLA 5HG7A 3QLGA 2O8YA 2BDJA 2HOGA 3PTGA 3RWQA 2PVLA 2ITOA 4BDAA 3QKKA 4W4VA 2XM8A 4ASEA 4IBMA 3KB7A 4A4XA 4D4SA 2Y4PA 4B4LA 3KKVA 2XRUA 3NUYA 1ZYSA 2XK8A 4L53A 4H36A 1T46A 4MH7A 3UG1A 1YDTE 3QQJA 3O7LB 3EQGA 4RMZA 4TYEA 3ZO3A 2UW7A 3NW6A 3EKKA 4RWKA 3QC4A 3IPHA 3EL8A 2Y8OA 5T68A 2LAVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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