3MSSA

Abl kinase in complex with imatinib and fragment (frag2) in the myristate site
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
274
structure length
264
Chain Sequence
MDPSYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVSAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Binding or bending: distinction of allosteric Abl kinase agonists from antagonists by an NMR-based conformational assay.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase ABL1
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
total genus 82
structure length 264
sequence length 274
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3mssA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3mssA01
3DBFA 3OVVA 4DT8A 4XOYA 1FVRA 5D1JA 4HW7A 4MVFA 3RP9A 3LMHA 2X7OA 3B2WA 5EYDA 5EW8A 3MESA 5DRDA 2BTRA 3OEFX 3N9XA 4AA4A 4A4OA 2QNJA 3BBTB 5FGKA 1XBAA 4AN2A 1PKGA 3FSFA 4OTIA 3TXOA 4JG7A 2GHGA 3ORPA 4L7FA 1REKA 2XK7A 4LGHA 2H9VA 3DK7A 2B55A 5EQYA 3S3IA 5HG5A 3CXWA 4OTPA 5HTCA 3SAYA 2HYYA 3KULB 5JFSA 4KWPA 1NVSA 1E1VA 4G6NA 3PIXA 3D5WA 5BYYA 4NUSA 5LVPA 3DLSA 4JI9A 5HVKA 2W5HA 4D2WA 4U42A 3TNPC 3CY3A 3A61A 4BKZA 4JR7A 5IF1A 2XBJA 3VW8A 1URCA 3NUXA 4NL0A 4A9TA 3IW6A 3DCVA 4LOOA 4OTRA 2CGXA 4NCTA 1AGWA 1OECA 3BYOA 2IZUA 4UYNA 2XNBA 3NUAA 5GJDA 3FLNC 4GU9A 2ZB0A 4MBIA 5EM6A 5FM2A 4B0GA 3AQVA 2PWLA 2WTVA 4M15A 3BEGA 4MHAA 4DFUA 2XK4A 3GCPA 2J7TA 4HYUA 4O7SA 5F95A 2IW8A 2QR7A 2HY0A 5HE1A 3TKHA 4QYHA 5D9HA 4R5YA 4WG3A 4BCGA 2W17A 3DKFA 1H07A 2YITA 3UNZA 3OD6X 4RJ8A 4RVKA 4E20A 1Q8YA 3EFWA 3OCGA 3RAKA 3PVWA 3Q4UA 2RFSA 3QRTA 2CN5A 3F3WA 1DI8A 4R3PA 4A9SA 3ID6C 2ETRA 5AR8A 4FV3A 3QALE 4H39A 4Y46A 3RPVA 3FMMA 4GL9A 4LFIA 5AJQA 2QU5A 2YDJA 5DMZA 3QD0A 4I6HA 4A9UA 1H1QA 4FG8A 4IAKA 1OKWA 4IAIA 5IDNA 4WNMA 1DS5A 3RPRA 4FOCA 2VTJA 3NNUA 4EKKA 2BRMA 3EIDA 5M06A 3A62A 4N70A 1GJOA 4QMOA 3ORLA 4FX3A 4DEBA 5A9UA 5C8KA 2A4LA 3TKUA 2ITXA 2X2LA 3HV5A 4R1YA 5GJFA 1IA9A 1ZZLA 3KF4A 5JN2A 4AP7A 3UZRA 4EQUA 3TM0A 2UW9A 3CD8A 3UG2A 5L2IA 2VTTA 4JRNA 2PVJA 2CCHA 3PWDA 2C6IA 2W1GA 3IGGA 5AX3A 3VF8A 5FTGA 4J97A 4RA5A 5HHWA 4NW5A 4RJ4A 4IAFA 3QTQA 3UO5A 2YZLA 1UWJA 3HRFA 3HVCA 3O8PA 3H9FA 2WXVA 5D12A 3ZFMA 3GT8A 2BHEA 2VO6A 3EYHA 4O22A 5I9YA 3KRLA 3EN9A 4FKSA 3RAHA 4BCPA 3E62A 4LGGA 4O7NA 1W82A 5IA0A 1SMHA 4YPSA 5HG7A 4JL9A 3HRCA 4AAAA 4QTAA 4M12A 3RWPA 2VU3A 2X0GA 2BFYA 3KRJA 5AP0A 2PPQA 2GTMA 4HCVA 2WQEA 2LGCA 4TXCA 4ZLZA 1M52A 4OTFA 5HE0A 3ZBXA 2NP8A 4DGLC 2VZ6A 4A4LA 4WSQA 4YJVA 4OAVB 4Y73A 3SXRA 4TNBA 5FBOA 3NW6A 4TYGA 3V5WA 1OL2A 3OC1A 4GK2A 3R9RA 4P5QA 4C4HA 4ZSLA 4ZS0A 4TZRA 4AT4A 3LIJA 3AXWA 4KRDA 4QMQA 3VJOA 2H8HA 3UPXA 3CIKA 5HD4A 4MBJA 4YBJA 3UP2A 4XLIA 4FKWA 5AUTA 3MSSA 3NGAA 2WB8A 4C37A 4Q9ZA 4EI4A 1QPDA 4U3YA 5CQWA 3TV4A 3LXLA 4RA4A 2CHLA 3ET7A 4F99A 3QCQA 3VULA 2GS6A 2CNUA 3MIYA 4BIBA 4ZLOA 4AX8A 4RJ3A 4FTRA 4GK4A 4JBVA 1KE6A 3H3CA 5DVRA 4FT0A 1BLXA 5CAUA 3NNWA 4AG8A 2PE0A 3QTUA 4RT7A 5E7RA 2R3JA 1I09A 4I1ZA 5AAFA 4YU2A 5AIKA 5IQHA 2E9NA 3MFRA 3E88A 1F3MC 2DWBA 3HA8A 2E9UA 3F2NA 3VS2A 2FB8A 3EHAA 1PXPA 5AUWA 3VBVA 3HUBA 2PK9A 1YXUA 5BYZA 3RM7A 5EW3A 3DGKA 3WF6A 3HLLA 2V0DA 3C4ZA 3IQ7A 3ATSA 3NW5A 2OJJA 3OWLA 1KE9A 4YGAA 4AE6A 4QMZA 4PNIA 2OJFE 5JT2A 4IAZA 2YEXA 4UWBA 4DH8A 1B38A 3DZQA 1QPJA 4K1BA 4RIWA 4OGRA 4JDKA 2J51A 4NK9A 2ZM3A 4PP9A 2OZOA 4BDGA 3ORKA 4BDEA 1QPEA 3Q96A 3RNYA 2WMWA 1Q99A 4XUFA 1OIUA 2GHMA 2R3GA 4IJ9A 4G34A 4I23A 4AW5A 5B7VA 1UA2A 1Y6AA 5ANJA 4C3PA 4O7YA 3DNDA 3BWJA 4YO4A 3MIAA 2BTSA 4TTHB 4AGCA 5LMBA 2OW3A 2QI8A 3DAEA 3WILA 3KCFA 1WBSA 5LWNA 4F9BA 3OF0A 1KV2A 4K2RA 5M56A 4EJNA 4XBRA 3TTIA 2HWPA 2IVTA 2FSTX 2XUUA 3AD4A 4WNPA 3I7CA 5BVNA 4HCUA 1PXOA 3QTZA 3UYTA 2YIRA 2DYLA 2UZEA 3LXKA 4RLKA 2WELA 3TT0A 4BCMA 4QQ5A 5HGIA 1ZAOA 3M11A 2KTYA 4NW6A 4BBFA 2FUMA 4BTJA 2PMOX 1YW2A 2PZ5A 2RIOA 2WHBA 5DH3A 5L8JA 4FBXA 4RFMA 4XX9A 4QMXA 2GNFA 2J0MB 3EQCA 1XBBA 4BF2A 4JOAA 4EH9A 1RDQE 2HY81 2JC6A 3DA6A 5ANDA 3W55A 3OW3A 3A7JA 3DXPA 5A54A 4D2TA 4EL9A 4X3JA 3BGPA 4G5JA 1ZRZA 4I5MA 4U6RA 4U43A 4DH5A 3Q9WA 1PW2A 2C6DA 2VWIA 3MH3A 5IA2A 4JX3A 4YJUA 4JG6A 2C30A 3BU5A 4EORA 2X8DA 5HZNA 3O17A 1H1WA 3M1SA 4I0RA 3R7GA 4TYHA 5ETCA 1W83A 3OTUA 4AA0A 1IEPA 5IQAA 2F57A 4Q2AA 1XO2B 2YFXA 4D1ZA 4H3BA 4V0GA 2XB7A 3Q4CA 4KSPA 2GQGA 2ITPA 4JRVA 3HMMA 4MXYA 3NWWA 5DIAA 2P3GX 4IZAA 3RGFA 4EZ7A 5A4CA 2RFEA 2XKCA 4F65A 4NJDA 5IKWA 5AUZA 1R39A 5LVMA 3LXNA 5EHOA 3ZBFA 1PF8A 1Y8GA 3FYJX 4X3FB 3VHEA 3PSBA 2VTOA 4L43A 4DEGA 5DYJA 4I93A 5L2QA 4QNYA 1NVRA 4USFA 3D5UA 5AUYA 2RL5A 4NWMA 4ANNA 5CEKA 4MF0A 2BILB 1XH8A 3D5VA 3L8PA 3QHWA 2Q0NA 2ZV2A 4AZSA 4DEEA 5K5NA 4FKUA 4C3FA 3LKMA 4Y85A 3F5GA 3KK8A 4DC2A 4R7BA 5AWMA 4EHVA 4D9TA 1W8CA 4FTJA 1E1XA 3SW4A 3QCSA 5G6VA 2YIQA 4F1TA 1YOJA 5EDPA 5CZIA 2VN9A 3WZDA 4D1XA 5HQ0A 2Z7SA 2ESMA 4IANA 2B9JA 5FLFA 1AQ1A 4C3RA 4CFMA 3GNIB 1OITA 4E26A 4Z3VA 4FV5A 3U4WA 4M67A 1Y91A 4WBOA 1CDKA 3MBLA 3HAMA 5F20A 2KULA 3HKOA 3MY1A 3QU0A 4GJ2A 4Y8DA 1L8TA 3TKIA 1OIYA 5BVDA 5M07A 2XYUA 4I0TA 3O7LD 5HVJA 5F4NA 4XHKB 1CKJA 4H05A 2HWOA 5LXMA 4FKTA 4EKLA 2RFNA 2BAKA 2Y6MA 5A3XA 4OBOA 3WZJA 3EFJA 4IDTA 3KKVA 2YCRA 2YDKA 2Z7QA 3V6SA 5F9EA 2C6EA 2A2AA 4FTKA 3CGOA 4NM3A 3BHHA 4QP2A 4BZOA 1GZKA 5J5SA 1XJDA 2C0OA 4UMPA 3TWJA 4CFVA 1OIRA 3FLZA 4C57A 4YHJA 4BTMA 5DLSA 5EOBA 5CWZA 3OEZA 4ZTHA 3A4PA 3VF9A 4E5WA 5DHJA 3U8WA 5C26A 4S2ZA 5HCXA 2VD5A 1SZMA 4DTKA 2YZAA 2PHKA 2ITYA 2PMIA 5E4HA 3E8NA 3E3PA 4EOKA 3H10A 3COHA 3COMA 3VS3A 3Q5IA 3VW6A 4XEYA 4ZK5A 3E63A 3WOWA 4FSZA 2HAKA 4A4XA 4ZMFA 3UQFA 4FTCA 4CKRA 3ZSIA 3T3UA 1M2PA 1PMEA 4JQ8A 3R1NA 4H58A 4PTEA 4RIXB 3E8CA 4U97A 5KZIA 3WZEA 4BR3A 3Q52A 4FV1A 4FZ6A 1FMOE 3OT3A 3NUPA 3O50A 4GK3A 4IQ6A 4UWCA 1YOMA 3V5TA 3FMJA 4QMYA 3IOPA 3RK9A 3IDBA 1CTPE 1U4DA 3FXWA 4GU6A 4B4LA 3UPZA 2BDFA 3QA8A 5DFPA 4KNBA 3PPJA 4AN3A 4ZJVA 3P1AA 3AT3A 1ZMVA 2RGPA 3AT4A 5HIBA 4D2PA 3NDMA 4LI5A 1SNUA 5GHVA 3ALNA 4B6LA 2VTQA 3P23A 3JXWA 1K9AA 2CGWA 4EK3A 3PP0A 2R3RA 3TN8A 2W4JA 4IW0A 5CI7A 2YERA 3G9LX 1JWHA 3VBYA 3CSVA 3ZEWA 5I3RA 5CALA 2NO3A 4MK0A 1BI7A 3LJ1A 4DFBA 4BCNA 3P7BA 2YDIA 5L6PA 4GYIA 2B9IA 3GGFA 4EK5A 4KB8A 5FRIA 2A27A 3NYOA 2R2PA 5IEVA 4EOOA 4R8QA 5BVKA 3GOKA 1KOAA 3HECA 5TOZA 2G9XA 5ANKA 5AAGA 2W99B 3UIXA 4D1SA 3ODYX 2PVRA 3I1AA 2I1MA 2ITTA 3A7FA 4KBAA 4OTGA 4QP8A 3GEQA 4ANLA 4I22A 3NVKI 1T46A 2WQBA 2WU7A 3KXNA 4J95A 4UZHA 4QQCA 4RBLA 4AZEA 4DHFA 5A4LA 3ZC5A 4I3ZA 2PSQA 5HKMA 4YJNA 5EHLA 2OO8X 3LPBA 2BROA 3WARA 1YXSA 4CRSA 2ETKA 2Z2WA 4S30A 2QOKA 5AR5A 5KMMA 4PRJA 3PYYA 4IAYA 3RPSA 4C62A 3KY2A 1TQMA 4U41A 3DU8A 2J50A 3LFQA 5CU3A 2JBOA 3WZUA 5JZNA 3PFQA 5AADA 2XNMA 4M84A 3FPQA 2XKDA 3OZ6A 4HGEA 4PNKA 4QQJA 3FMHA 4O91A 5J79A 3ZZWA 1UNHA 3IDPA 3ZLWA 3R9HA 3U6HA 4CV8A 4E6AA 3BHTA 1H1SA 2GNHA 4AZWA 1LEWA 3NVMB 3WE8A 4QPMA 4NM0A 4UN0C 3UIBA 4BCJA 2QG5A 3DQXA 4EZ3A 3ZTXA 4M3QA 2XRUA 4C0TA 5ETFA 1XH5A 4KIOA 3F3VA 3EOCA 2YCSA 4RWLA 4MEDA 4MD9E 2QCSA 3HP5A 4MWIA 1YWVA 3P4KA 4NIFB 4R7IA 5IMEA 3EN4A 4NU1A 3PSCA 4CV9A 2YWPA 4BBEA 1XH6A 3GU5A 3JY9A 1Q8WA 2ITVA 3DV3A 4APPA 5E8XA 2PUNA 3QKKA 3PVUA 4YURA 5CU4A 4WOVA 3LCDA 3ZO4A 2QOLA 4TW9A 2CPKE 2CCIA 2CMWA 1MQBA 2WNTA 3QTXA 2EUFB 3SX9A 3ZRLA 1YXXA 4YZNA 5CF6A 5CXZA 4ACHA 2GQRA 1WMKA 2XA4A 5B0XA 2WKMA 4W4XA 2C6OA 4D0WA 4ZY5A 2E2BA 3GFEA 4MWHA 1OKZA 1UWHA 3BHYA 3FHIA 5HIDA 4XJ0A 4YTIA 1VEBA 1OGUA 2X6EA 3E5AA 3LMIA 5IH4A 3AC8A 3D14A 4WKQA 4CMTA 2HW7A 1H24A 3WE4A 1V0BA 4F7NA 3W8LA 4YLLA 3OY1A 2JDTA 5IA4A 3GU4A 2QD9A 3L1SA 5JKGA 4FTLA 3G15A 3VBQA 4YTCA 3U54A 4BDAA 3MS9A 2QR8A 5HD7A 1STCE 3F6XA 3VUGA 1Q8ZA 4L3PA 4OUCA 4BDKA 4EHEA 4M7IA 3ERKA 1J7IA 4ZAUA 2XF0A 2PVMA 1Q97A 1IR3A 2X81A 4X6QC 3AMAA 4AWIA 2BHHA 3G33A 1J7LA 1YDRE 4QP6A 4ALVA 4I20A 3ZC6A 2WTCA 2YM4A 3PP1A 2YAKA 3G2FA 4MD8E 1JSVA 4GKHA 2BKKA 3OY3A 3Q6UA 4BCIA 3HRBA 2JDRA 3QF9A 4GYGA 4D55A 1MRYA 4GKIA 5KO1A 3MJ2A 3WF8A 4D28A 3S00A 2X9FA 5H8GA 4GVJA 5AR2A 4ZEGA 3F7ZA 3QZIA 4BWXA 4U79A 3V5LA 3BQRA 4ANSA 4EYJA 2IVSA 2JGZA 5ETAA 4CD0A 3CCNA 1YRPA 3W32A 2QKWB 2QOOA 2ZMCA 3DFCB 3F9NA 5M4IA 4XLVA 1T45A 2NRYA 3SXSA 1YOLA 3TZMA 4NM5A 5M4CA 2YJRA 3M42A 2VV9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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