1WVWA

Crystal structures of kinase domain of dap kinase in complex with small molecular inhibitors
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
275
structure length
275
Chain Sequence
TVFRQENVDDYYDTGEELGSGQFAVVKKCREKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQHPNVITLHEVYENKTDVILILELVAGGELFDFLAEKESLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIMLLDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQDSLQHPWIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of kinase domain of DAP kinase
rcsb
molecule keywords Death-associated protein kinase 1
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 275
sequence length 275
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2004-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1wvwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1wvwA01
4YPDA 3W55A 3KN5A 4GV1A 3GBZA 3PA4A 2WQNA 3QHWA 3LFEA 5EW3A 5I9VA 3NNXA 3ZFXA 3DV3A 2JIVA 5DOSA 4C57A 3KMWA 3R28A 1A9UA 4MK0A 2P2HA 5K9IA 2JKMA 3IG7A 5AAEA 3UQFA 3ATSA 3R1YA 2C5VA 2LGCA 3OHTA 2R3MA 5ETCA 4FEXA 1MQBA 4PMMA 4A7CA 5FBNC 4Y73A 5DBXA 3SXSA 2VTJA 4FSTA 2YWPA 5GINE 3IW6A 4I0TA 4KD1A 5IPJA 1M7QA 1CKIA 5DT0A 4AP7A 3EQHA 5CX9A 2CDZA 3KXHA 4AGDA 3FEGA 2X8DA 4FK3A 2CMWA 2C6DA 3EYHA 2J51A 4YBKA 2YDKA 3C4CA 4H1JA 4JBPA 3DBCA 4U6RA 5IQAA 3AT2A 5EOLA 2R64A 3BGQA 1MP8A 2VGOA 5ETFA 4R77A 5DIAA 1WAKA 2Z7SA 3IQ7A 4DEHA 3MVJA 3QD0A 5AR5A 4L3LA 1H26A 3QGYA 4FKSA 2QG5A 4GMYA 3BYOA 3IOKA 5I3RA 3V6RA 4YTFA 2CN8A 2BKZA 4W4WA 4WNMA 1YI3A 1Q97A 4C38A 3A4PA 4DFNA 1VJYA 2YHVA 3NUUA 3CJGA 4PMSA 3LJ0A 4KAOA 3HX4A 4X0MA 2NRUA 4YTCA 3AMYA 4P7EA 4YZBA 3PJ1A 1E1XA 5AIKA 3RAWA 4I21A 3B8RA 4I5HA 4EH5A 4M7IA 1B38A 5LQFA 2VTTA 2C47A 3DS6A 4HVGA 4CG8A 4OAUC 4ZP5A 3ETAA 3WZUA 3UOKA 4YO4A 3IS5A 2HXQA 5FG8A 5BYZA 3DU8A 2J9MA 1WMKA 2HYYA 3Q6UA 4RA4A 4RPVA 4EZ5A 2PVMA 1W8CA 3HMOA 3TDWA 3OT8A 3CCNA 4CYIA 1KE5A 2XIXA 4CT2A 4UALA 5I3OA 2X9EA 4ANNA 4FV2A 4X3FB 4QTEA 1RQQA 3AT4A 3RP9A 3ZEPA 3EQPA 3LOKA 2C68A 1BI7A 2BRMA 3DBDA 3PXRA 1ZMVA 3FY2A 2Z8CA 3OXTA 3IGOA 4EQCA 3MW1A 4C35A 4OTQA 4G9CA 3A99A 3NAYA 3H0YA 5HCZA 1JSVA 4LL0A 3ZO2A 3NW5A 3FXXA 3ZOSA 2OGVA 4XOZA 3NUYA 4RIOA 3FL4A 3UP2A 1URCA 3D7ZA 4IB5A 4BL1A 4QO9A 5CY3A 3Q6WA 4TWNA 1CKJA 1Q41A 2PZPA 1DAWA 2YCFA 3RI1A 3ZCLA 4BCHA 4O21A 4F6WA 1M17A 4AGCA 2BPMA 2OJGA 3MVHA 1JVPP 4QP4A 5FXRA 1Q61A 4AACA 4B8LA 3QZFA 5C27A 4PQNA 3FZRA 3OCTA 3IOPA 1YDSE 4YBJA 5HCXA 3KCKA 2W5BA 4FKQA 2W06A 2VZ6A 4F1MA 4RVKA 5EOBA 3VUDA 4NJ3A 4FTOA 3VS2A 1PXLA 2JFLA 2XEYA 3HUBA 4XG4A 2VUWA 3BI6A 4U81A 3QX2A 5K0KA 3LZBA 4JS8A 4DAWA 4ZLOA 2YFXA 1WZYA 4IAYA 3TUCA 5ICPA 5D7VA 2R2PA 2QQ7A 1VYWA 4MXAA 4XBRA 2I0VA 4RC2A 5CS6A 5M55A 4FZFB 4A9RA 1OKVA 2R3IA 3EWHA 4LI5A 3AGLA 4C62A 4BDEA 2Q0NA 3CS9A 2OH0E 3NGAA 3Q96A 4BI1A 5BUIA 4F70A 2JAMA 4ZJJA 2VWVA 4GIIA 2V5QA 4PY1A 5HBJA 3OZ6A 4OTGA 3W18A 4QNYA 5BVOA 4L68A 4MD9E 4YJPA 4L67A 2RFDA 4FV3A 3ITZA 4YHTA 4BIEA 1AQ1A 4D2VA 5KMJA 2YM8A 4FEQA 4FEUA 2PYWA 2CPKE 4YZMA 5LOHA 4CG9A 4QMQA 4BCNA 5HKMA 4TT7A 3TIYA 3OY3A 4K6ZA 1NVRA 4MBIA 4FV6A 1U54A 2V7OA 3A4OX 3ORPA 5CVFA 2UVYA 4E26A 1NW1A 5H8GA 1PXNA 5BVKA 3QZIA 3MGYA 3MPMA 4K77A 3RGFA 3UZTA 4FT9A 3D7TB 4BCPA 5IQBA 4ENYA 4ONAA 3BYVA 2C6IA 2W9FB 4DA5A 3PXQA 4R3CA 4BYJA 4BCJA 5K5XA 4WO5A 2RG6A 5J8IA 1T46A 1J7IA 2ZM3A 4C4FA 3DBEA 5HOAA 4Z7GA 2R3LA 1JBPE 3DOGA 5AR2A 5ETIA 2PUNA 2VTAA 3OC1A 4IB3A 2BAQA 4IBMA 4MXXA 4EOKA 3R7YA 2XUUA 3QC9A 4DFLA 3MFRA 2BCJA 1IR3A 1FPUA 3V5JA 3FSKA 2FSLX 4B4LA 3D0EA 4FKJA 1H24A 4M12A 3Q4ZA 3U6HA 2BZJA 3F7WA 1NVSA 4UXQA 2NPQA 3F5GA 3VUGA 4BICA 3SDJA 2WTDA 4WOVA 3P5KA 5JFVA 4I3ZA 3CD8A 3IW8A 4BKYA 4LV8A 4FF8A 2WMBA 4QYEA 3V3VA 3HP5A 4PPAA 5ANGA 3FJQE 4IEBA 4XG6A 3ULIA 4AXAA 5GIPE 1Q8ZA 2PE1A 3POZA 2XNBA 4ZAUA 3CXWA 3E8CA 4NUSA 1WVXA 1Q99A 5I5ZA 4FIGA 2ERKA 2V0DA 4XV9A 4CKJA 3G6GA 2H9VA 2OF4A 4MAOA 2UZWE 1GAGA 3MDYA 1QPCA 2GNHA 2J7TA 4TXCA 5E8SA 2IW9A 2GMXA 5AIRA 4BCQA 4FR4A 2V22A 2BR1A 3UBDA 3NAXA 4IM0A 2W4JA 4U3ZA 4O84A 1YKRA 3I5NA 4GK3A 4L7SA 5FD2A 3FV8A 5DRBA 5DH3A 3GU4A 4RLKA 2VTHA 5DHJA 4BDJA 4FKUA 4I6BA 2QO2A 5AP1A 1WBWA 3TJCA 4D4SA 3QYWA 3HDMA 1P2AA 2VWUA 1LEZA 1JKSA 1W7HA 4H3BA 3KXNA 5DRDA 3GOPA 2FB8A 4FVQA 2PMIA 2W7XA 3PG3A 4AN3A 2EUFB 2XBAA 3OCBA 3SOCA 3PRIA 5ETAA 4DITA 3FLSA 3LFQA 5AUVA 3R7IA 4OR5A 5J1VA 4F0IA 2GS7A 5H2UA 3W8LA 2XKEA 4EH9A 1H28A 2WIPA 4FV8A 3VS0A 2BUJA 2QHNA 3E63A 3PZEA 1SM2A 1OITA 2O2UA 3KMUA 3Q4UA 4O38A 3LXNA 1STCE 2QVSE 4FT5A 4ZLYA 3EHAA 4FIFA 1WBPA 3JXWA 3Q5ZA 3M2WA 4TYIA 4HVIA 4P5QA 2XCHA 2WNTA 2YACA 5I0BA 4WRGA 2PZ5A 2O5KA 4MBLA 2F49A 4O27B 3WYXA 1XKKA 4OTHA 2UZEA 2F7ZE 3GCSA 4ZY5A 5HX8A 1PXJA 3QCSA 3OS3A 2WOTA 4YHJA 5IU2A 4QP9A 3G0FA 3JY0A 3C5UA 4L52A 4AGUA 3A61A 2PY3A 3FMLA 2IJMA 2WOUA 4FTAA 4OTFA 5CXHA 3CBLA 3KULB 3EMGA 1J1BA 3PTGA 2ZB1A 3BV3A 3QX4A 4HOKA 2XIRA 3G5DA 2IZTA 5FTQA 5M08A 2ITWA 4BHNA 3DDQA 1FVTA 2OICA 2ITXA 2PWLA 1HCKA 5A4TA 3N4VA 3F5UA 3PJ8A 2FUMA 5HZNA 3E8NA 2VX1A 4I6FA 4QQJA 5L8KA 3PXYA 4YP8A 2Z60A 3EN9A 3QA0A 3UG1A 5IUGA 1YDRE 3P7CA 4ZJIA 3SOAA 2R9SA 2JITA 2C69A 5LWMA 5EG3A 3BWFA 3UQCA 4GYGA 3G90X 4DCEA 2GNLA 4LGDA 5KE0A 3KK8A 3ZU7A 5IDPA 2WU7A 3BU3A 3NS9A 3C13A 3GUBA 3CY3A 2XRWA 3TZ9A 3LQ8A 2BKKA 2X8IA 4DTBA 1Z57A 2XJ1A 4JR7A 3V8SA 4FTUA 5GZ9A 4J53A 3LCKA 2WIHA 5ANKA 3G9LX 4H1MA 4M0ZA 4OTDA 4FTCA 2HXLA 3DAEA 4QOXA 2WMTA 3EL7A 4XH6A 5HLPA 4F1OA 3D2IA 5AV4A 3GU6A 5IEVA 3KXGA 3H9RA 3ZLYA 5JT2A 2QOFA 4USDA 4IAKA 3AC4A 4EBWA 5AUUA 2OU7A 1RE8A 4IADA 4JVGA 4FOCA 4WBOA 5M06A 2WB8A 1H27A 3TG1A 3RAIA 4LG4A 3E8DA 2GCDA 4FEWA 3QA8A 1YI4A 2VTLA 4JG7A 4D0WA 3SVVA 3U6JA 4XEYA 3LQ3A 1W82A 4UMUA 4I0RA 5DVRA 4F4PA 3V8TA 2VV9A 4BDKA 4BGHA 5EQPA 3F82A 4EOLA 4QMVA 2PVFA 4LL5A 3LFCA 5I9WA 4JNWA 3VBTA 3LCTA 4S34A 3S3IA 5C4LA 1ZAOA 1ZYSA 2QKRA 4KNBA 5J7BA 5E8ZA 4ZZNA 2EXCX 3T9IA 3Q9YA 4UWYA 4LYNA 4QP6A 3UMXA 4BN1A 3MTFA 3PA3A 4FSYA 4Z9LA 3RVGA 5IA1A 1A48A 1Y6BA 2RL5A 4UMPA 5DPVA 2IZSA 3HV3A 3LXLA 4IC7A 3QRKA 3DBFA 2HAKA 1PXMA 3AT3A 2ITNA 4R5SA 2QHMA 1OUKA 2XRUA 4UYNA 4GFGA 5E7RA 4EC9A 3FXZA 3ZC5A 3SV0A 4G16A 3ZH8A 4ASXA 2C5YA 3T8OA 1YWNA 1XH4A 4AT5A 3FYKX 4NIFB 4NTSA 5CQUA 4U3YA 3UNZA 5C03A 3ZYAA 2WMSA 3FQEA 4O1OA 4F7JA 5M09A 2CNQA 3HGKA 4GSBA 4MXCA 4CTBA 4C3FA 5JN2A 2R3RA 3L8SA 3MI9A 5KMKA 5FTOA 3L8XA 4HJOA 1F3MC 2UZBA 3O71A 4O7NA 4FL3A 3IDPA 2WKMA 3O0GA 5KMLA 3D5UA 3DQXA 4WRSA 2XYUA 1Q3WA 1UWJA 3UJGA 2CNVA 3TKIA 2WMXA 4J99A 4QMMA 4FUYA 4RC4A 4AUAA 3MYGA 3U9NA 3GP0A 2OFUA 1OL7A 5CAPA 2CLQA 2JDRA 4ZTLA 4RFZA 1TVOA 3UO6A 3OEFX 4DLJA 3BWJA 4CXAA 4XG9A 3ANRA 1SZMA 2C1BA 3II5A 4OBPA 2QR7A 3PJ2A 3VULA 4CRSA 3SA0A 1SVGA 2Z7RA 3THBA 1Q24A 1UVRA 3DBQA 3K3IA 3P4KA 4AT4A 2W1ZA 3OWPA 3EQCA 3R01A 5AUTA 5J95A 2YM7A 2BRNA 3EQFA 4NW5A 5DMZA 2C5XA 4M69B 2XKCA 4WNOA 1PF8A 3W2PA 2G2FA 4QMOA 2JDTA 2YCSA 4YSJA 2PL0A 4ORKA 2RSVA 3GGFA 3HMPA 4B0GA 4E4MA 1FMOE 2C0IA 3OWJA 3EZVA 4CQGA 4IFGA 5AADA 2FH9A 5AV0A 3E64A 4G6OA 4PL4A 3P23A 4Y83A 2W1FA 3EKNA 4V0GA 3RM7A 4FIEA 3BPRA 4ZTHA 2CNUA 4O7RA 5D12A 2YLFA 4XP0A 2WTKB 5AV2A 4IACA 3MPTA 5A4CA 2R7BA 4FGBA 2BVAA 3BLRA 3OBGA 4RWIA 1GOLA 5EFQA 4DFUA 2UW7A 2XK4A 4OT5A 4EH7A 5IZFA 3W10A 5BYYA 4X2GA 5H9BA 4R6VA 2F7EE 4E5WA 3MA3A 5FEEA 3TKHA 3FC1X 5I4NA 4IFCA 3ACJA 3O8TA 5F4NA 3FSFA 3NW6A 3NUNA 4TKSA 4G9RA 4ANLA 5GZAA 5C4KA 1I44A 1OMWA 1X8BA 4K1BA 5KMMA 4ZMEA 1VEBA 4R7IA 4B99A 2CHLA 4L46A 2QOCA 4AA0A 4FSNA 3SAYA 4HGTA 4B8MA 2PVJA 2VGPA 4TYHB 3CKXA 3V5TA 4LM5A 4CYJA 4XG7A 1CDKA 5FBOA 3V5LA 4CMTA 4IM2A 5KBQA 4PP7A 5EM7A 2GHMA 4FTKA 4EYMA 5LMKA 4C4EA 3ZMMA 5EKNA 3NIEA 1WVWA 1FOTA 3U6IA 5CF6A 4CFXA 5G1XA 4QYFA 3PWDA 4HYHA 4I0SA 3P7BA 3LAUA 5DR6A 3EZRA 3A8XA 5H8EA 1REKA 4HZSA 3VF8A 4KBKA 4LMNA 4X3FC 3MV5A 4A06A 5LVMA 4FT3A 5C8KA 4Y5HA 2J4ZA 2XNOA 5CYIA 1XH5A 4ZSEA 3VAPA 4FL2A 4KIPA 5HESA 2XKFA 3UVRA 3UVQA 1LPUA 5A6NA 2XM8A 3DJ7A 2OH4A 3A62A 5AV3A 4YLJA 4IX3A 4ZZMA 4C2VA 3TM0A 3BLHA 4OGRA 1IRKA 4Y46A 3UG2A 1U59A 4HCTA 3WF9A 3ZLWA 2C3KA 3NUPA 4KBCA 3F5XA 3R7GA 1WVYA 2B9IA 4YJNA 3PSDA 3NRMA 5L6PA 1Y91A 2BZKB 2DYLA 2H8HA 2YIQA 2YM6A 3IGGA 3UTOA 1T45A 2C6OA 1M2RA 3ORMA 2ETRA 2VNWA 2PVHA 3UYTA 3BGPA 4IIRA 4QMPA 3MY0A 2PVLA 4GJ2A 4WUAA 5CSHA 5CEPA 3JR1A 1H1WA 3JPVA 5AP4A 2YM4A 3F61A 4FZDB 4AW1A 5HTCA 3NIZA 4WSQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YPD A;  3W55 A;  3KN5 A;  4GV1 A;  3GBZ A;  3PA4 A;  2WQN A;  3QHW A;  3LFE A;  3UDZ A;  5EW3 A;  5I9V A;  3NNX A;  3ZFX A;  3DV3 A;  2JIV A;  5DOS A;  4C57 A;  3KMW A;  3R28 A;  1A9U A;  4MK0 A;  2P2H A;  5K9I A;  2JKM A;  3IG7 A;  5AAE A;  3UQF A;  3ATS A;  3R1Y A;  2C5V A;  2LGC A;  3OHT A;  2R3M A;  5ETC A;  4FEX A;  1MQB A;  4PMM A;  4A7C A;  5FBN C;  4Y73 A;  5DBX A;  3SXS A;  2VTJ A;  4FST A;  2YWP A;  5GIN E;  3IW6 A;  4I0T A;  4KD1 A;  5IPJ A;  1M7Q A;  1CKI A;  5DT0 A;  4AP7 A;  3EQH A;  5CX9 A;  2CDZ A;  3KXH A;  4AGD A;  3FEG A;  2X8D A;  4FK3 A;  2CMW A;  2C6D A;  3EYH A;  2J51 A;  4YBK A;  2YDK A;  3C4C A;  4H1J A;  4JBP A;  3DBC A;  4U6R A;  5IQA A;  3AT2 A;  5EOL A;  2R64 A;  3BGQ A;  1MP8 A;  2VGO A;  5ETF A;  4R77 A;  5DIA A;  1WAK A;  2Z7S A;  3IQ7 A;  4DEH A;  3MVJ A;  3QD0 A;  5AR5 A;  4L3L A;  1H26 A;  3QGY A;  4FKS A;  2QG5 A;  4GMY A;  3BYO A;  3IOK A;  5I3R A;  3V6R A;  4YTF A;  2CN8 A;  2BKZ A;  4W4W A;  4WNM A;  1YI3 A;  1Q97 A;  4C38 A;  3A4P A;  4DFN A;  1VJY A; 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