5GZ8A

Crystal structure of catalytic domain of protein o-mannosyl kinase in ligand-free form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
284
structure length
272
Chain Sequence
CPPGYFRMGRMRQCSRWLSCEELRTEVRQLKRVGKRVFLSEWKEHKVALSRLTRLEMKEDFLHGLQMLKSLQSEHVVTLVGYCEEDGTILTEYHPLGSLSNLEETLQQDVNTWQHRLQLAMEYVSIINYLHHSPLGTRVMCDSNDLPKTLSQYLLTSNFSIVANDLDALPLVDVLIKCGHRELHGDFVAPEQLWPYGEDTPFQDDLMPSYNEKVDIWKIPDVSSFLLGHVEGSDMVRFHLFDIHKACKSQIPAERPTAQNVLDAYQRVFHSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title 3D structural analysis of protein O-mannosyl kinase, POMK, a causative gene product of dystroglycanopathy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein O-mannose kinase
total genus 78
structure length 272
sequence length 284
ec nomenclature ec 2.7.1.183: Glycoprotein-mannosyl O(6)-kinase.
pdb deposition date 2016-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5gz8A00
4G3GA 4KA3A 5JZJA 4RX7A 2YJSA 5DT3A 4EONA 2YITA 3GC9A 4ITJA 4F4PA 3I0OA 4IVBA 1LR4A 2W1EA 2YA9A 3CLYA 4FKUA 5LVLA 4J7BA 4DEDA 4PMSA 3Q9WA 2FVDA 5DWRA 4JG7A 4MWIA 5ANEA 3UPZA 2BFXA 2WELA 2CKEA 3QQJA 3VS7A 1NY3A 4IFGA 4JX7A 1EH4A 2ZDUA 4QT1A 4RA4A 3BBWA 4ID7A 4D1SA 2F7ZE 2ITXA 3NCZA 2CGXA 3QAME 3DBFA 4GIHA 1T45A 4MXXA 3W32A 2C1BA 2QD9A 4WUAA 4AFJA 4ANNA 4L7SA 3EYGA 4FKWA 3EQDA 3HDNA 4RQVA 5HLWA 4CD0A 5IA0A 3GU6A 2C5YA 4FYNA 2E9VA 3VS4A 3EN6A 2BUJA 4ZSJA 3ZDUA 4IX5A 3D83A 4R8QA 5AWMA 3IQ7A 5ANKA 1LUFA 4ZY5A 3S1HA 3T9TA 3FJQE 3I5ZA 3QCXA 3MS9A 3FLSA 3RK5A 4LL0A 3FV8A 1ZZLA 1W83A 2VTMA 4MEDA 3CIKA 3C4EA 1O6KA 4L9IA 3KRRA 5ANGA 5FRIA 2A4LA 3ZDIA 2W9ZB 2YM4A 5FDPA 4N0SA 2ACXA 1UNHA 2WTKC 3DK3A 2C6TA 4F09A 1WBVA 3AD6A 2V62A 2XCHA 3OFMA 3KRWA 4CT1A 4U81A 3QALE 2QOQA 3FMMA 4OUCA 4IDTA 2WPAA 3KK8A 5JFSA 3PTGA 3W55A 4EZ5A 2R3IA 5IF1A 3KFAA 4RFZA 2ITVA 5EOBA 3O8TA 1YI6A 2QG5A 2RGPA 2VV9A 4J8MA 3NNWA 4PTCA 2XKEA 3AC8A 2HIWA 1OUYA 5HU3A 3UVRA 1ZLTA 3D2KA 3VUIA 3LIJA 4E4LA 2UUEA 1O6YA 4BDIA 4II5A 3FMLA 4MK0A 3Q4TA 5BVEA 5GZ9A 5KUPA 4Y46A 3U6HA 1Q8ZA 3F3TA 4QTEA 2FB8A 3ZUUA 3PZEA 2IVVA 2W05A 4C33A 1IEPA 3A4OX 4PF4A 5J1VA 2E9PA 5CXZA 1NVRA 3QA8A 1DAYA 4R5YA 3W16A 1O9UA 2AC3A 4RC2A 3OXZA 2GHMA 3PIZA 4H39A 1V0PA 4KIKA 4QMSA 3EOCA 1ZYJA 2SRCA 5AP2A 3TNQB 3C50A 2YM7A 4G5JA 3LXKA 3DKOA 3QF9A 3UDBA 4O91A 5TT7A 4I94A 4DFXE 3BELA 3DCVA 4BTMA 4K11A 2GNGA 2Z7LA 2VTOA 1PHKA 4NTSA 2F2UA 4Y73A 3RGFA 5E8SA 4EUUA 2ZM4A 3G6HA 5C27A 1B6CB 1P5EA 4GK3A 2PVJA 2B7AA 1YRPA 3B2TA 3MV5A 2BTSA 4F0IA 3QU0A 3UQGA 4G2FA 2OJJA 2EB2A 4FSTA 2BRMA 5L8LA 4O2ZA 3EQRA 1MRVA 4B4LA 4QP2A 3R9DA 2EUFB 3QD0A 4MD8E 3F7WA 2XUUA 3F88A 4C62A 3VS1A 3IGGA 4QTBA 4KIKB 1PY5A 1Q3WA 2BVAA 2OZOA 3OOMA 4AGCA 1TQMA 1V0OA 2UVXA 4GMYA 3UG1A 4CQEA 3QD3A 4I0SA 3PXRA 1P14A 5HI2A 1U59A 3LHJA 1APME 1VYZA 3VS0A 5IG1A 3VRYA 2QOHA 3MJ1A 3W2OA 1ZAOA 3NUXA 3QWJA 5HTIA 4JDJA 4HW7A 3EL7A 1ZZ2A 4N6ZA 5TF9A 4BICA 4KKHA 4YC8A 2R2PA 2R7IA 4HOKA 4U5JA 3V01A 3U9CA 3HKOA 3LLTA 5KNJA 2R64A 2V0DA 5H8EA 4X6RA 3UE4A 4XJ0A 1XH5A 1Q41A 2DUVA 3TG1A 4Y83A 4AACA 2BTRA 4TN6A 4B9DA 3IGOA 4DLIA 3L9LA 2Y8OA 4ZTHA 4D0WA 2CCHA 4B8LA 3ZHPC 3D5WA 3A7JA 4IAYA 4BCIA 4E3CA 2ZM3A 4FSNA 4HCTA 4QP8A 1PXJA 2VTRA 3UBDA 4FF8A 4JS8A 1YOMA 4FT9A 5TR6A 3Q6WA 3MN3A 5CVFA 2WD1A 5FD2A 2W96B 4BCMA 4Z55A 4FSQA 4CT2A 4D1XA 3GC7A 3GGFA 2OXXA 3ANRA 3TEIA 1H25A 3E8CA 5DR9A 5JKGA 5CXHA 5LCJA 3NYOA 4Q9ZA 2FSTX 3H9FA 3HA6A 4M66A 3UG2A 1J1BA 4U44A 4YLJA 3WE8A 4NM7A 4BGGA 5A4LA 4DN5A 4FIGA 3GU5A 4XG4A 4IX3A 2LAVA 3Q04A 5M4IA 3U6IA 3PWYA 2ETKA 4FOBA 4ASEA 3PE1A 1FPUA 1BMKA 5AAFA 4QPMA 4S33A 4NW5A 5FM2A 4XG9A 2VWXA 4X0MA 2WTDA 5LVMA 3VQHA 5GZAA 2HW6A 3WIGA 1ZYLA 4BHNA 3MIAA 2IVUA 3P0MA 4IJPA 1OM1A 3NGAA 1K3AA 1CKJA 1Q8TA 3OP5A 4DH1A 4GW8A 2HZ0A 1Q8WA 5FXSA 1XBBA 1BUHA 3IW7A 5AP6A 3R83A 4FIIA 1Y91A 4NZWB 2RFNA 4KSQA 2JD5A 3QGWA 4TXCA 1KE6A 3R2BA 4FTQA 5BVOA 5IH5A 5K4JA 3R00A 4ZP5A 4GJ3A 5J87A 5CASA 3A7GA 1YOLA 2YERA 3HMNA 5DBXA 4YTFA 4CKRA 3EZRA 4QQCA 5ETIA 3SXFA 3T3VA 3OXTA 3AMBA 5J79A 3JUHA 5CF6A 1H1SA 1R3CA 1ZYCA 3V5JA 4C8BA 4TRLA 2BHEA 2WKMA 2WHBA 5AUXA 2ITQA 4QTAA 3VUDA 5JEBA 3EQPA 4BYJA 3CBLA 3MIYA 4N70A 1YXXA 2P4IA 3GCPA 2R3QA 4AZFA 4ZTRA 4XV1A 5DA3A 2CHLA 4RA5A 3Q9YA 3H9OA 1OIRA 3P5KA 1Q24A 3UYTA 1WBOA 2W4OA 2E2BA 2E9OA 2VNWA 4FBXA 1J91A 1FVVA 3DNEA 5KMJA 2C0OA 3UIUA 1WVWA 2BRNA 3B8QA 5HZNA 4Y8DA 3TNWA 3BGPA 3BLHA 4JDHA 4J96A 3DAJA 5CQWA 2XKFA 5AP0A 4EK8A 5JRQA 3ODZX 3NYXA 3R30A 4BDEA 5C1QB 4E6CA 4EYMA 2NRUA 3H9RA 4QYFA 4RVLA 4F9WA 3F5XA 4BDHA 2IW6A 3C4FA 4ZSGA 2C3KA 3EN5A 4AGUA 4YP8A 4A9TA 2C5OA 4AZWA 3O96A 5ITAA 2WMQA 4Q9SA 5CSPA 3UP2A 3ZLSA 4JDKA 3AMAA 4A9YA 1WZYA 5HGIA 1ZXEA 4WNKA 5D11A 3TNPC 3S00A 3V8WA 1JKLA 2HWPA 3FMDA 4GEOA 4G3FA 4XV2A 4QYYA 5GZ8A 5IDNA 1GNGA 2PMOX 3MPTA 4EK6A 3ZFXA 4O0UA 4FTTA 3R7VA 4GYIA 4EOPA 3QKLA 1DAWA 4KBCA 5CT0A 1ZOGA 4BDCA 4U3ZA 2GTNA 3O0GA 4RZVA 1OL5A 4E4NA 2XKCA 3MH3A 2XK3A 1OL1A 3KF7A 4FTUA 4ZXTA 3VS3A 5FDXA 2J7TA 3OCGA 3RTPA 4MHAA 4RVKA 5J7BA 5AUVA 4XG2A 3VBWA 4DG2E 5J1WA 4PY1A 1REKA 3ELJA 2YWPA 1FQ1B 3OCBA 5BMMA 4FL1A 4JIAA 4DAWA 5IISA 4DEIA 1PW2A 4FTAA 2ZVAA 4BHZA 4BI2A 5EG3A 2R0IA 3RI1A 4CCUA 3UC4A 5B0XA 2RFSA 4M14A 4M68A 4XEYA 3ZC5A 2PE0A 2VWVA 4IBMA 2HXLA 4QNYA 5AMNA 1H0VA 2XMYA 4TPTA 1JAMA 2WTWA 2PUUA 4RWJA 5HBHA 5C8NA 2WIHA 4ZZMA 3VO3A 4RMZA 5F20A 3OTUA 3V5LA 2F4JA 3AD5A 5HCZA 3SLSA 4KIPA 3SQQA 2X6EA 2BAQA 1KE7A 3FMNA 3DTWA 4JL9A 4WG3A 3CC6A 4L45A 4YHJA 1WBTA 1RW8A 2G01A 1E9HA 2UZEA 3Q2MA 2VWBA 3Q53A 4G17A 1Q99A 4BCQA 4AN3A 3E63A 5E8TA 4CTBA 4EORA 4KIOA 2ZDTA 2A1AB 4P2KA 2VU3A 4MKCA 4NW6A 1OKWA 3CKXA 3AXWA 3GI3A 4YJOA 1PXLA 2JC6A 3KU2A 5DGZA 3NIEA 4YJRA 3JVSA 5DR2A 3TV7A 4B7TA 2GTMA 4S34A 4DC2A 3BRBA 4NM5A 4CMUA 3LQ5A 3DT1A 4BWPA 1Q8YA 3IDCA 3ETAA 1Y8YA 4JG6A 2BPMA 2WAJA 4GYGA 5J5TA 2F2CB 5C03A 3RHKA 5G1XA 2C6DA 3MFUA 5HVKA 4IANA 3EH9A 3ZXTA 3QCSA 2QKWB 4ZTLA 1UWHA 2QCSA 4BCPA 3BEAA 1Z9XA 3H10A 2Y7JA 4DBNA 1AGWA 2PZYA 3BQCA 4CEGA 4O0SA 5HHWA 1UWJA 1Y6AA 5IEYA 3LFBA 1W8CA 4ONAA 1W98A 3DTCA 3HV3A 5H2UA 4TNBA 4L43A 4RFYA 4CYJA 2XEZA 2X9EA 4RLKA 3ROCA 4ZTQA 1H1WA 3QTQA 3QXPA 4AFEA 4BTFA 5JGBA 1OI9A 2R0UA 4CFNA 4ANLA 2XEYA 4JNWA 3S4QA 5LMKC 4AT4A 2W1DA 2YZAA 4QNAA 3ITZA 2Z2WA 3RPRA 4AOIA 3K3IA 4XCUA 3KRJA 3UNKA 1OIQA 3RCJA 2F9GA 2PTKA 4YZ9A 5A14A 3OC1A 4IVDA 4S2ZA 4GG7A 4CTCA 3H3CA 3A2CA 2VTJA 4GVAA 4O96A 3JVRA 3ZZEA 2PL0A 3WF5A 2G1TA 3COKA 4JI9A 4QMOA 4ZAUA 4YNOA 3AC2A 3O50A 5AX9A 2BIYA 2JKMA 3NNVA 4IMYA 3O51A 2X9FA 4O38A 4B0GA 3EKNA 2R4BA 1T46A 4E6AA 2C6LA 3QQLA 5EH0A 4C4JA 4C3PA 4F0FA 3ZUTA 2GNIA 4ZY4A 4WSYA 2OJGA 5HKMA 3ZO4A 4FX3A 2I0VA 4FK3A 5AV3A 2AC5A 5AA9A 2G2HA 4ZZNA 4BDDA 4WUNA 4M3QA 3RM6A 2BIKB 4BKYA 3ORLA 3HX4A 4U3YA 1OKYA 1F5QA 2JIIA 2XNMA 2VN9A 4E5BA 1GIJA 3RZBA 2C6MA 4NKAA 5HO7A 3RM7A 5DG5A 4LRKA 4AW5A 5EYCA 1PYXA 3ENHA 3BHTA 4L00A 2J9MA 3DPKA 2XNGA 3KY2A 4QMPA 4FTKA 4YJQA 3ZFMA 4D4VA 4L42A 2OICA 3FY2A 5JN2A 5DN3A 4OGRA 4FV2A 5FBNC 2VTHA 2X0GA 5HBJA 2FH9A 3R73A 5HQ0A 1OZ1A 3R7GA 2VTPA 3R9HA 3KXMA 1ZRZA 4F1MA 1IG1A 4BDAA 1RJBA 5HE0A 5B2KA 3Q9ZA 3ZH8A 4N4SA 3CJFA 4EWQA 1I09A 3UO6A 1UA2A 2X2MA 3SKCA 3KQ7A 4D4YA 4U80A 1JBPE 3EL8A 3RWPA 4RJ4A 1WFCA 4FIJA 3HMOA 1MQBA 2HZ4A 2PY3A 2W7XA 3BI6A 3QHWA 4I92A 4YGAA 4AOJA 3BU6A 3GCQA 4TWPA 3RZFA 1U54A 2GS6A 2Y6OA 3TWJA 1PXOA 2XK8A 3ZC6A 3ACKA 5AR8A 4IEBA 2OG8A 3WZJA 3FLWA 2ONLA 4BZNA 5CF4A 1XWSA 2BALA 4V0GB 3ULZA 5I9VA 4CFWA 3A7IA 4RG0A 3F66A 3C1XA 5EI6A 3PY0A 3IG7A 3IS5A 3R7IA 5CAUA 4KAOA 3AT4A 4FZDB 3ZS5A 3ZRLA 5FXRA 3R8LA 2QVSE 4FZAB 5CEOA 2BRGA 4ACHA 4IWDA 2WMAA 4FKGA 5HIBA 5L2TA 4MXOA 2R3HA 4BDFA 3IW8A 3QRJA 3VUTA 4QP7A 3R02A 3VBQA 5IZFA 2UVYA 2C6KA 1U54B 5I9ZA 4NCTA 3HMPA 4GT5A 2CSNA 4BCGA 3OWPA 2BROA 2CLQA 4I6FA 5L4QA 3OEFX 3RPVA 4N6YA 5HG5A 4AW1A 2JDTA 2QI8A 4OBPA 4IZ7A 3RALA 5CEIA 4TZRA 4WIHA 3UTOA 3SD0A 5J7HA 4F65A 2BFYA 4IAFA 2G9XA 1UNGA 3VF8A 2FYSA 3CXWA 2C5VA 3ZYAA 2ZMDA 1GZ8A 4Q2AA 4YPDA 4BF2A 3COHA 5BVFA 1JKTA 3QL8A 4AN9A 2X8EA 2WGJA 3WZDA 3MPMA 3V8TA 5LVNA 4K0YA 3PVBA 3GXLA 5FLFA 3PE2A 3FPQA 4X3FA 4RJ3A 4FV8A 4GFMA 3WF6A 2VO0A 5DHJA 1NVSA 3W8QA 1BKXA 1ZOEA 5IDPA 4M7IA 2EU9A 5ICPA 5K9IA 4JOAA 3VBXA 3EHAA 2UZLA 4EJNA 3DZQA 5I9WA 4FV1A 3QRKA 4UYNA 4CFMA 3D5XA 5CU6A 3VUHA 4CLJA 5L6PA 3QQKA 3EZVA 2GNHA 1NXKA 4E1ZA 3HZTA 4HPTE 3CJGA 4FT7A 4KB8A 3Q3BA 2RL5A 5HESA 1QPEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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