5GZ8A

Crystal structure of catalytic domain of protein o-mannosyl kinase in ligand-free form
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
284
structure length
272
Chain Sequence
CPPGYFRMGRMRQCSRWLSCEELRTEVRQLKRVGKRVFLSEWKEHKVALSRLTRLEMKEDFLHGLQMLKSLQSEHVVTLVGYCEEDGTILTEYHPLGSLSNLEETLQQDVNTWQHRLQLAMEYVSIINYLHHSPLGTRVMCDSNDLPKTLSQYLLTSNFSIVANDLDALPLVDVLIKCGHRELHGDFVAPEQLWPYGEDTPFQDDLMPSYNEKVDIWKIPDVSSFLLGHVEGSDMVRFHLFDIHKACKSQIPAERPTAQNVLDAYQRVFHSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Protein O-mannose kinase
publication title 3D structural analysis of protein O-mannosyl kinase, POMK, a causative gene product of dystroglycanopathy.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 272
sequence length 284
ec nomenclature ec 2.7.1.183: Glycoprotein-mannosyl O(6)-kinase.
pdb deposition date 2016-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5gz8A00
2JIUA 3LXKA 4I6HA 3MSSA 2XYNA 2BFYA 5KBRA 3GI3A 3CGOA 3KVXA 3ORNA 4WG4A 3NPCA 2Y7JA 1PXPA 3VBQA 4YP8A 3N9XA 5CY3A 3E88A 2BAKA 3K54A 1JSUA 1ZMVA 4R3PA 4YZBA 4FYNA 4AU8A 4ACDA 4MF0A 5A4CA 3CY2A 3RHKA 5IA3A 1WBWA 3FBVA 2KULA 3QA0A 4RFYA 4V0GA 4PNKA 2B9FA 5CNOA 3VW8A 4AZEA 3ZYAA 4QMPA 4D9TA 2P2HA 3IW6A 4HOKA 4GUEA 2BFXA 4F99A 2B55A 3G0EA 4EK5A 5GZAA 1LEWA 1DI8A 4YJQA 3OCGA 5ANIA 5AUXA 5E91A 1FGKA 2R2PA 2J0LA 4J7BA 4OUCA 5JGBA 4X0MA 4E6QA 2R7BA 4F7LA 3ZONA 5A6OA 2QURA 3GCUA 3FLZA 3JVSA 3V5LA 4YC6A 3PA3A 3DK3A 3U87A 4CT1A 1YDSE 5AP1A 4QPMA 2VO6A 3NUPA 3V01A 2X2LA 4JDKA 1OKZA 5EI6A 3HLLA 4U42A 3BV2A 3AG9A 5HTCA 2JDTA 2O2UA 4PTEA 1RQQA 3LW0A 2YIWA 2PY3A 4PDSA 3DCVA 2CCIA 4FKUA 5DT3A 3RPYA 3V8WA 2PUUA 4ZLOA 3Q2MA 3OUNB 4NM5A 4EOKA 4D2PA 3DA6A 4IX4A 3SKCA 4D4RA 4FODA 2QNJA 3ZSGA 4BTFA 5CANA 3O8TA 3DDPA 4IB0A 5EHOA 5AV4A 1TKIA 4IDTA 3KRJA 3L8SA 1RDQE 3SW4A 4EC8A 4V01A 2E2BA 2I0EA 5FTOA 4UMTA 1Q41A 1HCKA 2WXVA 3KRWA 2HELA 4ZZMA 2ZM1A 3LCKA 1I44A 3LJ2A 4QP6A 5TOZA 4FL1A 3R8MA 1A9UA 2X2MA 4LRJA 4QMZA 3KY2A 5F4NA 4BBEA 4FKWA 2IW8A 2OU7A 4C2WA 2XCKA 2X2KA 3QC9A 3GFWA 5CVHA 3UE4A 4C3RA 2C6TA 4F7SA 3GU8A 3OFMA 3DFCB 4KBCA 4Y73A 5J5TA 4GV1A 3QTIA 3QLGA 4TYGA 3NYVA 5EDQA 4FV6A 5E90A 3MBLA 5JSMA 4JNWA 2FGIA 4AGCA 4BZNA 4RC3A 3TTJA 2WTDA 4EHVA 4ZTHA 2I1MA 3G51A 3SW7A 3C4WA 3JXWA 4GT5A 4L45A 4NWMA 2VWXA 3Q6UA 2YIXA 5ICPA 4RA4A 4M68A 4ZJJA 3EZVA 4GVJA 4EOMA 1KE8A 3E8DA 3HGKA 4E6DA 4NZWB 1WFCA 2XK9A 4RWLA 2ITZA 3OW4A 4I23A 5GHVA 3AT2A 2C6OA 2JGZA 1Y8GA 4XH6A 3V5PA 1PMVA 3S0OA 4GFGA 4FNZA 4IJ9A 3QTXA 4EZ7A 1NA7A 2ZAZA 4CYJA 3UQFA 3FZRA 1UNGA 4ASXA 4YGAA 4PV0A 5KMKA 2W7XA 4M7IA 4EK4A 3LFFA 3K3JA 4H3QA 5HVKA 2B4SB 2XJ0A 5HNBA 1H27A 1RE8A 2QHNA 5JFWA 2HY0A 5AA8A 1JKSA 1ZMUA 5E8ZA 3V5TA 3E7VA 3OP5A 5I9VA 2HCKA 4XRJA 4FV2A 4WT6A 2KTYA 1SZMA 4G9RA 5AR3A 5KMNA 3N51A 2X8DA 4CZUA 4XG3A 4F63A 3A7FA 2P33A 3E87A 2YZAA 3RVGA 5D41A 4CLIA 4FSQA 2J0JA 2XNOA 5L3AA 3R9OA 1MUOA 5AEPA 4FTRA 5CEPA 3A4OX 3KCKA 4W4XA 4I4EA 2JFMA 4QOXA 3FMKA 4PRJA 5FWKK 4JR3A 4TYJA 3O7LB 4YJOA 1UV5A 1IR3A 1AD5A 1H07A 3L8VA 3BWFA 1Z5MA 4IZYA 4O0RA 3OBJA 2HK5A 4A9RA 4ALVA 4G3GA 4OBOA 3TUBA 4ENXA 2ZJWA 5ANKA 5FM2A 4FKIA 3BI6A 3KN6A 2HENA 5HVJA 3K3IA 4BIDA 1MRYA 3PY1A 3PFQA 4FTOA 1BX6A 2GS2A 4KS7A 5H8BA 1Q8WA 3ANRA 4CNHA 2DYLA 3RP9A 2GMXA 4AGWA 5L2WA 3CCNA 2IVSA 5CVGA 2ETMA 4S30A 4DG3E 1V0BA 3U6IA 5IF1A 4BYIA 5DH3A 2OXXA 3HMNA 4AN2A 4UV0A 4PPCA 4S32A 2IW9A 1SVEA 3HUCA 3NW7A 5IG1A 4RQKA 2G15A 3NIZA 3ETAA 4IZ5A 4YBJA 3TKIA 2XKCA 1ZAOA 2WTIA 3VBTA 3WIKA 2WD1A 5AIKA 3C51A 1OM1A 3KF7A 5BVWA 3QYWA 4Q5HA 3KC3A 3PJ3A 3SLSA 4ANQA 5A54A 5CTPA 3IGOA 3RMFA 4NUSA 3TEIA 1FVVA 3CJGA 1NY3A 3EN5A 2AUHA 2PMNX 4FSYA 4G3CA 2BRBA 3GENA 2YCQA 3QQKA 2JKOA 1OUKA 3VS7A 2WQEA 4HVHA 4KIPA 4TXCA 3L9NA 2JEDA 2FA2A 2YN8A 3Q53A 4FKGA 5CAQA 3H9OA 1URWA 4D55A 5AP2A 1FMOE 4YNEA 2F2UA 3LFNA 1WZYA 1UU8A 2ZOQA 4OTWA 4TN6A 3MI9A 2QC6A 4ZY4A 4FV3A 3UG1A 4CTBA 5HLPA 3MFTA 5CF6A 4OLIA 3LFSA 3R21A 3R2YA 2FSLX 2ESMA 3QQJA 4MXXA 3HP2A 4FTKA 4RWIA 2Z7SA 3OTVA 4EC9A 1CKPA 3GC7A 3NW6A 5IEVA 3LXLA 3PSCA 4OAUC 5HU9A 5CT0A 3KFAA 2CGVA 2WHBA 2XIRA 1O6LA 1H1PA 4H3BA 1V0OA 2PK9A 1G5SA 4UY9A 5HBEA 4BDFA 4LOPA 5HCXA 4BZOA 3QU0A 4O2ZA 5HU3A 4R5SA 2GTNA 1OB3A 4L44A 3F3ZA 4QMOA 3I7BA 1UWHA 5BVKA 4RSSA 1FOTA 3TI1A 4IAIA 4FV7A 2CPKE 2VWUA 2IN6A 4F7NA 3GOKA 2BVAA 4FKLA 4IB5A 5CAUA 1P4FA 2WEIA 3FUPA 2PMIA 3QQLA 3C0IA 4FSTA 3Q32A 4LYNA 5JFVA 3D9VA 4IAAA 4V05A 2VWBA 3QRTA 5AUTA 1P5EA 4EQCA 3GCQA 1ERKA 4F1TA 2BDWA 1DAYA 4RC2A 3FMLA 3MFRA 3VULA 3CEKA 4NH1A 1BYGA 4QMTA 1NXKA 5ANEA 5LMKA 5J8IA 5JGDA 3FWQA 4HVGA 5FP6A 5JGAA 3W2RA 3ULZA 3FYJX 2PVMA 2F4JA 2HWOA 1JAMA 4QP8A 4WNKA 4Y72A 4PMPA 1STCE 3HVCA 3D15A 4Y83A 4CV9A 4MVFA 2G2IA 4PTCA 1Y6AA 4YLKA 5J95A 4YZDA 4N0SA 5KKRB 4Y5HA 5D12A 4R7HA 4AS0A 4U97A 4X2JA 2YM6A 5ANDA 1YOLA 2C30A 3DKGA 4X6QC 3VRYA 3W16A 5DA3A 3UOJA 1R39A 4CMUA 2VTNA 4C02A 4ZZNA 3ZEPA 3MVMA 4XP2A 4BDDA 4O22A 4DLJA 2QOBA 5E8TA 3H30A 2WAJA 1FQ1B 1VYWA 4GH2A 2YAAA 4GK4A 1YI6A 4JDJA 3HRCA 5E1EA 1H25A 4G6NA 4WIHA 5BVEA 4AQCA 5IPJA 3NCGA 1H4LA 3CTQA 1PMNA 3COHA 3P7AA 5M57A 2XKDA 3DNEA 4DEAA 3UTOA 4NSTA 3EQGA 4FKRA 3U51A 3U6JA 3F3WA 5E8VA 3R63A 4EYJA 3SOCA 2WIPA 4R7IA 4FTUA 4FIHA 4TPTA 4U3YA 2J5EA 5ANOA 3VS0A 3C4CA 5A4EA 3TJCA 3R28A 3C4ZA 3MWUA 3COKA 4BHNA 1HCLA 2R3HA 3II5A 3QTSA 2J5FA 3V5QA 4KWPA 5HCYA 4DFLA 4FIFA 4CD0A 5LVLA 4JX3A 2EWAA 4XX9A 3I4BA 1OI9A 2X7OA 4K9YA 4CKJA 4CFMA 3H10A 5ETAA 4PL3A 1OITA 5AR7A 3Q5ZA 4XLIA 4ACMA 3O7LD 4QPSA 4BB4A 3ZBFA 3R01A 3ENHA 4U3ZA 3BHYA 2XBAA 5EI2A 4WBBB 2XP2A 2PVYA 2NRUA 1QPDA 3CBLA 2QONA 3FLNC 4IACA 2YHVA 3WF5A 3B2TA 3ZO2A 3IOPA 4ZLZA 5TO8A 5EG3A 3RPOA 3MVJA 4F9BA 2XF0A 2QOFA 3FY0A 5DNRA 3QZIA 4IX3A 3M11A 2YISA 4DBNA 3AC8A 3SQQA 4QMMA 3G9LX 4G17A 1BLXA 4OT6A 3RI1A 4DC2A 5HNGA 4QRCA 4ASZA 3KK8A 3Q60A 2GNIA 5ITAA 2O65A 3U4WA 4RMZA 1E1VA 3RTPA 5EYMA 3MH2A 2XVDA 4L53A 4PPAA 3OWKA 4ZSJA 3AD4A 2RIOA 1JBPE 4D2TA 3A8WA 2C6KA 5DRDA 1Q3DA 2RSVA 4QYYA 5CSHA 4AZWA 3NR9A 3IDCA 3VVHA 3HMPA 1YKRA 3ZM4A 3TWJA 4C7TA 3AC4A 4QYFA 2ZDTA 5HG5A 4C4EA 1LP4A 1QPJA 3LMGA 2YABA 3E8CA 1O6YA 3SXFA 4CV8A 4WD5A 4WG3A 3FKOA 5I9WA 2PZIA 3AC1A 3OEZA 3UIUA 2I0YA 3VBYA 3SOAA 2GNHA 2G9XA 3C4XA 2XJ1A 2VTQA 2YJRA 2J9MA 2ITVA 2QKWB 4FSWA 4QP2A 1YQJA 2XK4A 3R7UA 4C62A 4D1SA 2X6EA 5CEMA 4FIJA 1H0WA 2AYPA 2VX1A 2XKFA 3CD3A 4DG0E 3HRBA 4ANLA 2O63A 5HCZA 3PXRA 4U0IA 5AP0A 2W9FB 4CKRA 1OECA 3FKLA 3WZEA 3ZUTA 2X7GA 4C36A 1XWSA 2W4OA 1BI8A 2VO0A 3EB0A 4PMMA 3AMAA 4FSUA 4O0XA 5G6VA 4DH3A 3W18A 4PF4A 1IEPA 2C3LA 2FSOX 3EQDA 2OF2A 3KXGA 3NDMA 4K6ZA 4QPAA 4OTDA 1GOLA 2VWWA 5JZNA 2JDVA 3BEGA 4R3RA 4YTFA 2J6MA 3R8PA 2WTVA 3VF8A 2BCJA 1JNKA 3QWJA 5LVMA 2HIWA 3TNQB 2JDOA 4RVMA 3LQ8A 3GT8A 2BPMA 2I40A 3QGYA 4IVDA 1PMUA 2JLDA 4X3FA 4U81A 1U5QA 4FIIA 1Y6BA 4U80A 4RJ8A 5EYKA 2C5YA 2X81A 4WNOA 4D0WA 2XCHA 3HV6A 4QP9A 3DAJA 3CKWA 1YOMA 5AV1A 3UG2A 2A0CX 3RZBA 3RK9A 2ITQA 3QCXA 5KBQA 2R3KA 4K18A 5TT7A 3RPSA 1HOWA 4NTSA 5DOSA 4EH3A 4I6BA 4YSMA 3P1AA 3H0YA 2PTKA 3M2WA 2PL0A 1KSWA 1PHKA 3MY5A 2WMAA 3QQFA 5FLFA 3O17A 4MQ1A 4QMYA 4EL9A 3PP1A 3ORMA 4MKCA 3UOHA 3HA8A 3O0GA 4HGTA 2UZLA 4H36A 4F7JA 4P90A 4GG7A 4GL9A 4RT7A 3DQXA 1YHSA 3WIGA 4GIHA 1PYEA 2OI4X 2JIIA 4H1JA 3DZQA 4C57A 2B54A 4XOYA 4WHZA 5DLSA 4OW8A 1Z9XA 3OT8A 3PG3A 3QRKA 4U9AA 2OZAB 4JOAA 4AT4A 4BF2A 5M4IA 2Z60A 4I1ZA 1YOJA 3RCDA 4F9AA 2V5QA 2VWVA 5A3XA 2E9PA 5CZIA 3A7JA 3F2AA 3FHIA 1V1KA 5AMNA 4FX3A 4QTEA 4ANMA 2C1AA 3VUIA 4HZRA 1SM2A 3BYVA 4TW9A 3GU7A 5CXHA 1BL7A 5HGIA 3V3VA 4BCKA 5JH6A 4F0IA 3T3VA 3ACKA 3NW5A 1AQ1A 4RRVA 5EK7A 3MGYA 3KVWA 2J51A 2PVNA 2WTWA 4IM0A 4APCA 4BWKA 2H8HA 4KIKB 4YHTA 4UMPA 5K4IA 3ORZA 1XH6A 1Q8UA 4N70A 4IC7A 2HW6A 4FVPA 3U8WA 4NM3A 3A7HA 4AA4A 4AZTA 4OTGA 5J9ZA 2IVUA 3A4PA 4FV0A 3OCTA 1REJA 3F66A 4E4MA 4L42A 4FZ7A 2CJMA 3Q4UA 3R71A 5FBNC 2F49A 2ITTA 3COIA 4PDPA 4YC3A 3R1QA 4GIIA 5HLWA 2XM8A 3FL5A 3NNWA 2HOGA 4IQ6A 3R1NA 4WBOA 3EQFA 3BZ3A 4L52A 5DR6A 2VTPA 3W2QA 4PWNA 4TWOA 1ZZ2A 2YAKA 1PF8A 2FO0A 2UW6A 2FYSA 5D7AA 1OPJA 3BE9A 3VS2A 3JUHA 4LG4A 4E1ZA 1U5RA 3DTCA 4R3CA 2W5BA 3PG1A 5J7HA 3GU4A 3IQ7A 3MTFA 3G2FA 4V0GB 3DQWA 4I0RA 3P4KA 3HA6A 4BHZA 4AW0A 4DGOA 1URCA 1M2RA 4JRNA 2Y6MA 3PIXA 4LMUA 1A06A 2VN9A 4NCTC 4YPSA 3WBLA 1XKKA 1M2QA 4GT4A 3TZ8A 2W1DA 2W1FA 4ASDA 2GHGA 3FMNA 4JAIA 4B99A 2DS1A 4A9YA 2CN5A 2EB3A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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