2WMTA

Crystal structure of checkpoint kinase 1 (chk1) in complex with inhibitors
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
263
structure length
248
Chain Sequence
DWDLVQTLGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMNIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Identification of Inhibitors of Checkpoint Kinase 1 Through Template Screening.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
total genus 74
structure length 248
sequence length 263
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wmtA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wmtA01
3FHRA 3C0GA 3RMFA 3SKCA 3F7WA 3EYGA 3THBA 5JT2A 4FE2A 2PTKA 3LFFA 4UWCA 2FUMA 4E6CA 3LZBA 5IQCA 5HO6A 3C1XA 4L45A 1JKKA 3QQUA 4RC2A 3NCZA 3ORNA 2BMCA 5CQWA 2FGIA 1QMZA 4TZRA 4J53A 5CASA 3OTUA 2E2BA 3KKVA 4I6QA 3R1SA 3FKOA 4EBVA 4QMZA 4K0YA 3EN6A 1OIYA 5AAGA 3TUCA 3A99A 3UQCA 2C6KA 3SLSA 4AOTA 2SRCA 2XIKA 3FLQA 3QAME 3DBFA 3DTCA 5F94A 3KL8A 4DF3A 2OF2A 5E8VA 4PP7A 5I9ZA 3Q4UA 2BRBA 5FEDA 3I5NA 5HO8A 4X2FA 4QP1A 3DK6A 5I9XA 4E6DA 3RWQA 3CIKA 5KKRC 2OJ9A 3TNHA 4TT7A 2EXMA 4U3ZA 3LJ2A 4WG5A 3CQWA 4RJ4A 5IA1A 5EW3A 2X2MA 3OMVA 5JK3A 2XIRA 3QL8A 3FMJA 1ZYJA 4O96A 3FC2A 4FV2A 3HECA 3G0EA 1OVEA 2BAQA 3RCJA 4L3PA 3VBWA 3G15A 3ZM9A 2XYUA 5AV0A 2VX0A 4F9BA 4EKKA 2OWBA 4YHFA 3TT0A 3CC6A 5IZFA 3B8RA 3LFQA 4W8EA 4JG7A 3QUPA 3WIGA 3KXGA 4APCA 2WMWA 3AC1A 4LOQA 4NJDA 2O64A 4XHKB 4KS7A 4PL3A 4BC6A 2F2UA 4HGLA 3MJ1A 3SAYA 1FBNA 3NUPA 4QYGA 4IAKA 5DLSA 4B6LA 4UALA 5ANIA 5BYYA 4XRLA 2VWUA 4L01A 5HQ0A 5EI6A 2R7BA 4DCAA 4NFMA 4QQCA 3MH1A 3U51A 4MF1A 4YZCA 3ELJA 2Y4IB 5AV3A 5M06A 4LOOA 1ZY5A 2E9VA 2XK6A 4FODA 4L42A 3DTWA 3ZMMA 4CTCA 5AFVA 3W18A 2OU7A 4BDFA 4QMNA 1XJDA 3FZTA 4B9DA 4FC0A 2JDOA 3F9NA 5LWNA 4NZWB 2Y7JA 3C5IA 2IZRA 1RDQE 2WTJA 4FZDB 5IQHA 2A27A 1MRUA 3MDYA 3PXFA 4LGDA 4CGAA 4UXQA 4BGHA 2XK4A 4X2NA 1FMOE 2YIRA 2ITXA 3GI3A 3QQFA 4GKIA 3PP0A 4MKCA 3E8NA 3EJ1A 3C50A 4GU9A 3EZVA 4I5CA 2ZV2A 4YZDA 3CQEA 4L46A 4RT7A 4QPMA 5AP2A 2OXXA 3F5XA 3QKMA 1M2QA 2XEYA 2R3LA 3I5ZA 4PPBA 5A4TA 3PWYA 4ITJA 4DFNA 2DS1A 4IWPA 3L8VA 3RWPA 3W16A 5EYMA 5HG8A 3EN7A 4ASEA 4F7LA 3JY9A 4PY1A 3BYUA 5TKDA 1PKGA 4KIKB 4C62A 4M67A 4AZEA 2B9FA 4M68A 2QHNA 3NW5A 3FZPA 3OCTA 2XB7A 5BVFA 5JGDA 2UZEA 2RIOA 4ANMA 2F57A 2IZSA 3CTJA 5AV2A 3E62A 3L8XA 2ITQA 3WF8A 4NKAA 3IW8A 5E8XA 3NW7A 2KTYA 4LOPA 4EHEA 4D4VA 4IB1A 2J0MB 3OEFX 4IANA 2JFMA 3QXPA 4K6ZA 5CF6A 3PY3A 4CQEA 1JPAA 1YOJA 1XBBA 1WBSA 3C13A 5IA4A 5KCVA 2HW7A 5IQFA 2YDKA 3LE6A 1QPJA 3ZU7A 5DIAA 4PL4A 3VBVA 1PXJA 3LFCA 4GMYA 5AP3A 4ACGA 5CY3A 2PU8A 3ZYAA 3GB2A 2BDWA 2PVRA 3DAKA 2OIQA 1K9AA 2GQGA 4IAYA 5EQPA 2YDJA 2WQMA 5AR7A 5DR6A 4CLIA 3NWWA 4BBEA 3SRVA 1M14A 3GU6A 4C3PA 4G6LA 2UUEA 3CJFA 4C38A 3HDMA 4R7BA 2W5BA 4DITA 1Q41A 2J2IB 2PZIA 4MK0A 4EUTA 3SHEA 2Y4PA 3KMUA 1PYXA 5HU3A 1L8TA 3FSFA 3Q6WA 4QMXA 4YHTA 4EC9A 5J1VA 1GAGA 2WMAA 2O0UA 1OUYA 3C0HA 3ITZA 4Z9LA 2FYSA 3KULA 1CTPE 2BRHA 2I0EA 3Q2MA 3B2TA 1JLUE 1Q99A 4H1JA 4QMUA 4LGGA 1PYEA 4D2SA 1GY3A 2VTPA 3UC3A 2W4JA 2JC6A 3NUSA 3NW6A 3R1NA 4GFOA 1YI3A 4YNEA 1Q3WA 5C8NA 4F9CA 3OOGA 4OTQA 3W8QA 1IEPA 4ZY4A 3A7HA 2GQSA 5HE1A 4IDVA 1H4LA 5AUZA 4C7TA 2WPAA 2X9FA 4ID7A 3U9NA 4KIPA 3H9FA 4TYJA 1DAWA 3QQHA 3FEGA 2ITZA 1X8BA 4NWMA 3D7ZA 3ALNA 3PVGA 4OTDA 2OW3A 3BGQA 1SMHA 4FBXA 3V01A 3EMGA 5I9VA 2QOBA 2R3HA 3PP1A 3QD0A 1PXPA 1NVSA 2B9HA 3G5DA 5F4NA 2WEVA 4BIEA 4DBXA 4A9YA 2XNNA 4JX3A 3WZUA 4CSVA 2CN8A 4MQ2A 5K3YA 5CSVA 5KZIA 4CRSA 4YSJA 5KHXA 5GZ8A 2BR1A 4LYNA 4W8DA 4H1MA 2PUIA 4GK3A 2NNWB 2H9VA 2J50A 2W99B 4UB7A 5JSMA 4TNDA 3IOPA 3FUPA 2OO8X 5AX3A 1H27A 4NUSA 4JVGA 3EL7A 4FEUA 4O7YA 2V7OA 3G2FA 3GP0A 2PZRA 4OTWA 1G8AA 2I0YA 3IW5A 3R2BA 2QOIA 1Z57A 4FZAB 4FNZA 4C36A 4ANQA 2XYNA 4OTHA 3ZUVA 4PWNA 4MCVA 5CLPA 5FLFA 3F3VA 2WKMA 3CD3A 2PWLA 1ZY4A 1XH5A 1DAYA 4DT8A 4EWQA 3LHJA 2CDZA 3BCEA 5IA5A 4GEOA 3B8QA 4KAOA 3UTOA 5L2SA 4O0RA 3RPYA 3WI6A 4KSPA 2W1ZA 3SQQA 4ANLA 1Q61A 2VWVA 2AUHA 4L3JA 3QRJA 5CU4A 5DWRA 4EH6A 4YJSA 4F1MA 4CEGA 2P0CA 2W1GA 1BI8A 4GKHA 2YM8A 4JT3A 1PMUA 2ZVAA 4R5SA 4RWLA 3R8MA 3OY3A 3RM6A 3UPZA 3I7CA 2W1DA 5FEEA 4WIHA 5J9LA 1XBAA 4I5MA 4YMJA 2GHMA 3G51A 4X3FA 5IKWA 4V0GB 2WTKC 2V7AA 3R7GA 4ONAA 4FKJA 3P79A 4EK4A 1A9UA 4O2ZA 2YISA 1PKDA 2BAJA 3TZ9A 4U97A 4WG4A 5HBHA 3VBXA 5H8BA 4CYJA 2C6LA 5TE0A 4J98A 3FXZA 4UYAA 3T3VA 4BCHA 3U6IA 5J1WA 2YERA 3NR9A 2ETRA 4ZAUA 4IZ7A 4O7TA 3A7FA 4O81A 3QQGA 3V04A 4Y8DA 4YTIA 2GDOA 3LXNA 3IDPA 4F99A 3Q2JA 4TWNA 4U6RA 4KB8A 3SDJA 1YI4A 3OT3A 3P7AA 3V6SA 4OAVB 2EXEA 1JSTA 3HP5A 2X9EA 4HPUE 2WMVA 4IH8A 5HNGA 1SVHA 4YC6A 4H58A 4IAZA 1JKSA 2C0TA 2Z7SA 4M3QA 2HIWA 4KNBA 1DS5A 3HMNA 4HVDA 5M44A 4KSQA 3W2SA 1SNUA 3JPVA 1BL6A 2XIZA 1BI7A 4JDJA 4ZZOA 4J52A 3UIXA 3VVHA 2NRUA 5C4LA 2CPKE 3PTGA 5AV1A 4YJOA 2EU9A 4RA4A 3IO7A 3C4XA 3E8EA 4UWBA 5FP6A 4FV0A 4HVHA 3L1SA 4ZP5A 4AOJA 5AR5A 1PXMA 3R8PA 3OT8A 3HLLA 1ATPE 3E87A 4M12A 4D4SA 4G5PA 3ACKA 3VULA 2R0UA 3P86A 4L00A 4DEGA 1PF8A 1U4DA 2W7XA 2XF0A 3L8PA 4U45A 3E92A 4AA4A 1Q8UA 5B2MA 4M0ZA 2XKFA 5H3QA 4AN3A 4BGQA 4OGRA 2W1CA 5CVGA 2ZAZA 4Q9ZA 3UOKA 3R9DA 4IAIA 3ZZWA 2YM7A 4IIRA 4C58A 1F0QA 4F09A 2JKKA 4S2ZA 3OTVA 4IVDA 4F9YA 4CMTA 3A60A 4D58A 3ZHPC 5JMSA 4R3RA 4D5HA 1W84A 3LFAA 2J5FA 4GU6A 3CR0A 4HVIA 4G6NA 5AR2A 1ZYDA 2H34A 3R1YA 5ETIA 3TZ7A 5BUEA 3QZFA 3CXWA 3AC4A 2YM3A 4D2VA 5CXHA 3ZO4A 4NCTA 4EQCA 5K5NA 2UZDA 2UZOA 4HJOA 3EQIA 4NFNA 3LOKA 5G6VA 3D2IA 4OTIA 3FV8A 3NNXA 3NIZA 4JQ8A 2Y4IC 4QYYA 1DM2A 5IA2A 5CQUA 1PXNA 3PY0A 3N51A 4WNKA 4DHFA 3TTIA 2X81A 3TWJA 4UX9A 2QO2A 3PLAE 4U8ZA 4A9RA 4EK8A 4TKSA 3UVRA 3VBYA 3DGKA 4ZEGA 4LMNA 2B1PA 4NSTA 4BI1A 4YR8A 4KKHA 5JQ8A 2YHVA 4Y73A 1ND4A 4I93A 4JR3A 4QMMA 5FTQA 4Z16A 4NKSA 3DJ6A 4RSSA 3ZUUA 3UMWA 4YNOA 4GJ2A 2YLEA 5C27A 2W96B 3F2AA 4K2RA 5DE2A 2E9NA 4FKQA 4AFEA 3V8SA 5E8SA 3AGLA 4JQEA 4S31A 1KSWA 1M17A 3P1AA 4FG8A 1JSVA 4I24A 1JWHA 2BDJA 3QTUA 2HZNA 3BV3A 4DE4A 3DB6A 4DINA 1WBOA 3VS1A 5LVPA 3JR1A 1WBTA 1OITA 5AR3A 1FINA 4DEEA 3SOAA 1J7IA 2A19B 3RM7A 2Z60A 4HNFA 3V5LA 4B0GA 1TVOA 2G2HA 3TV6A 4G6OA 3LXKA 4IX6A 4DFUA 4O1PA 1YHVA 4P2KA 1OPKA 3F66A 4F6UA 2W17A 3QHWA 4KIKA 4X2JA 4DGNA 3AXWA 4QD6A 3LMHA 5BX0A 3MI9A 1ZMUA 4XBUA 1YOMA 1WZYA 4BGGA 2ITOA 1GIHA 5I5ZA 2OBJA 3RCDA 1K3AA 5HHWA 4JX7A 4U42A 3W55A 3K5UA 1V1KA 3QWKA 1UKHA 2W0JA 4AFJA 2ITWA 4EOKA 3W8LA 1G3NA 2XNMA 4Z7HA 3LCKA 3UIBA 3Q9WA 1KOAA 3UYSA 2CGXA 3VHEA 2XRWA 3VN9A 3VS4A 2VTIA 4MBLA 5HG7A 4ASXA 2WTVA 3CQUA 2C5OA 4GUBA 1Z9XA 4PMMA 1OIQA 1SNXA 4J7BA 3R9OA 3DQXA 3MIYA 5HNIX 4UMPA 3G90X 5IDNA 2PUNA 4ZZMA 3ID6C 2BHHA 5FG8A 4E7WA 2JD5A 4WD5A 1AGWA 2BCJA 3RK7A 1AQ1A 4AW5A 4IWDA 3K54A 3ROYA 2BZHB 3EOCA 5DRBA 5BMMA 3ZXZA 4IWQA 4QTBA 2OSCA 1FOTA 5KX8A 1SZMA 2ZM4A 4QTCA 2QR8A 2V55A 3GCUA 3GOPA 3HNGA 4CMUA 3NZ0A 3TIZA 5IA0A 4AGWA 5L2IA 3TZ8A 3GU7A 2QO7A 3GFWA 5J5SA 4OBOA 1XH7A 4ZSAA 4XOZA 3DXQA 3C7QA 3O17A 3AG9A 4IEBA 4UBAA 4E1ZA 1GNGA 3H9OA 1O6YA 2B9IA 3FAAA 3D0EA 3A61A 3R9HA 1REJA 3I6UA 3BKBA 4YJQA 3TACA 2PZYA 1ZOGA 3A2CA 3L9NA 4D4YA 4FF8A 3F3WA 3MH2A 4GH2A 3RAWA 4ALUA 3BHTA 4C8BA 1YXSA 3LJ1A 4EYJA 2Z8CA 5E92A 4YTCA 5BMSA 2WTIA 4BCQA 2E9PA 3FMNA 3HEGA 4S30A 3FL4A 3UBDA 4BTFA 4YZMA 1JOWB 4MQ1A 3COKA 2XKCA 4BDKA 3RPOA 3R28A 4C61A 1GOLA 5KMOA 1T45A 5KNJA 4GRBA 5EKOA 5EI8A 4PQNA 5AR8A 3PPZA 3K2LA 5CS6A 5AX9A 4Y46A 3RJCA 2IVVA 5HKMA 5AM6A 4C57A 2XK9A 3P7BA 4TYIA 2C3JA 5AA9A 2W5AA 2X4ZA 4ZSJA 1YHWA 5AAFA 3R8LA 4I3ZA 1H0WA 1XR1A 3ROCA 5L3AA 3F7ZA 2XJ2A 2XEZA 4AXAA 2HY0A 3VW8A 3DPKA 3TCPA 3EL8A 4IBMA 5FEQA 5GZ9A 3AMYA 3CCNA 4WKQA 4ZTLA 1OKWA 4I22A 5C26A 3K3IA 2Z7RA 4K8AA 5C03A 1FPUA 4ANOA 4RZWA 4C4FA 4NT4A 5LMKC 3OZ6A 5E90A 2VO6A 2XNPA 5D11A 3FZSA 2C3KA 3EIDA 3VUIA 3JVSA 3LFDA 3EKNA 2PVNA 2WMQA 2X7OA 3ORPA 3QTIA 4RJ8A 3PA3A 4Y85A 1M7QA 4ZTMA 2VX1A 4AZVA 3VS6A 4RIWB 1H26A 5DR9A 3C9WA 4J96A 5CZIA 4WA9A 5H8EA 4BTMA 1Q8YA 4HYIA 1H8FA 4GT5A 4TN6A 3VS0A 1AD5A 1V0PA 3FLWA 4HOKA 3KN6A 2VV9A 1WFCA 3QQLA 4M69B 3N9XA 5EK7A 4HYUA 3MVMA 2J9MA 4WNMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3FHR A;  3C0G A;  3RMF A;  3SKC A;  3F7W A;  3EYG A;  3THB A;  5JT2 A;  4FE2 A;  2PTK A;  3LFF A;  4UWC A;  2FUM A;  4E6C A;  3LZB A;  4LV7 A;  5HO6 A;  3C1X A;  4O4F A;  5IQC A;  4L45 A;  1JKK A;  3QQU A;  4RC2 A;  3NCZ A;  3ORN A;  2BMC A;  5CQW A;  2FGI A;  1QMZ A;  4TZR A;  4J53 A;  5CAS A;  3OTU A;  2E2B A;  3KKV A;  4I6Q A;  3R1S A;  3FKO A;  4EBV A;  4QMZ A;  4K0Y A;  3EN6 A;  1OIY A;  5AAG A;  3TUC A;  3A99 A;  3UQC A;  2C6K A;  3SLS A;  4AOT A;  2SRC A;  2XIK A;  3FLQ A;  3QAM E;  3DBF A;  3DTC A;  5F94 A;  3KL8 A;  4DF3 A;  2OF2 A;  5E8V A;  4PP7 A;  5I9Z A;  3Q4U A;  2BRB A;  5FED A;  3I5N A;  5HO8 A;  4X2F A;  4QP1 A;  3DK6 A;  5I9X A;  4E6D A;  3RWQ A;  3CIK A;  5KKR C;  2OJ9 A;  3TNH A;  4TT7 A;  2EXM A;  4U3Z A;  3LJ2 A;  4WG5 A;  3CQW A;  4RJ4 A;  5IA1 A;  5EW3 A;  2X2M A;  3OMV A;  5JK3 A;  2XIR A;  3QL8 A;  3FMJ A;  1ZYJ A;  4O96 A;  3FC2 A;  4FV2 A;  3HEC A;  3G0E A;  1OVE A;  2BAQ A;  3RCJ A;  4L3P A;  3VBW A;  3G15 A;  3ZM9 A;  4AQK A;  2XYU A;  5AV0 A;  2VX0 A;  4F9B A; 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 4QPM A;  5AP2 A;  2OXX A;  3F5X A;  3QKM A;  4QEB A;  1M2Q A;  2XEY A;  2R3L A;  3I5Z A;  4PPB A;  5A4T A;  3PWY A;  4ITJ A;  4DFN A;  2DS1 A;  4IWP A;  1XML A;  2AEG A;  3L8V A;  3RWP A;  3W16 A;  5EYM A;  5HG8 A;  3EN7 A;  4ASE A;  4F7L A;  3JY9 A;  4PY1 A;  3BYU A;  5TKD A;  1PKG A;  4KIK B;  4C62 A;  4M67 A;  4AZE A;  2B9F A;  4M68 A;  2QHN A;  3NW5 A;  3FZP A;  3OCT A;  2XB7 A;  5BVF A;  5JGD A;  2UZE A;  2RIO A;  4ANM A;  2F57 A;  2IZS A;  3CTJ A;  5AV2 A;  3E62 A;  3L8X A;  2ITQ A;  3WF8 A;  4NKA A;  3IW8 A;  5E8X A;  3NW7 A;  2KTY A;  4LOP A;  4EHE A;  4D4V A;  4IB1 A;  2J0M B;  3OEF X;  4IAN A;  2JFM A;  3QXP A;  4K6Z A;  5CF6 A;  3PY3 A;  4CQE A;  1JPA A;  1YOJ A;  1XBB A;  1WBS A;  3C13 A;  5IA4 A;  5KCV A;  2HW7 A;  3BL7 A;  5IQF A;  2YDK A;  3LE6 A;  1QPJ A;  3ZU7 A;  5DIA A;  4PL4 A;  3VBV A;  1PXJ A;  3LFC A;  4GMY A;  5AP3 A;  4ACG A;  5CY3 A;  2PU8 A;  3ZYA A;  3GB2 A;  2BDW A;  2PVR A;  3DAK A;  2OIQ A;  1K9A A;  2GQG A;  4IAY A;  5EQP A;  2YDJ A;  2WQM A;  5AR7 A;  5DR6 A; 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