2O8YA

Apo irak4 kinase domain
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
295
structure length
278
Chain Sequence
FHSFSFYELKNVTNNFDERPISVGGNKMGEGGFGVVYKGYVNNTTVAVKKLLKQQFDQEIKVMAKCQHENLVELLGFSSDGDDLCLVYVYMPNGSLLDRLSCLDGTPPLSWHMRCKIAQGAANGINFLHENHHIHRDIKSANILLDEAFTAKISDFGLARASVMSRIVGTTAYMAPEALRGEITPKSDIYSFGVVLLEIITGLPAVDEHREPQLLLDIKEEIEDEEKTIEDYIDKKMNDADSTSVEAMYSVASQCLHEKKNKRPDIKKVQQLLQEMTA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of the apo and inhibited IRAK4 kinase domain
rcsb
molecule keywords Interleukin-1 receptor-associated kinase 4
total genus 90
structure length 278
sequence length 295
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2o8yA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2o8yA01
1UWHA 3T3VA 4C4JA 3FKLA 5HCZA 4JS8A 3W18A 3ZC5A 2XIYA 1YKRA 1GZ8A 4RX7A 4Z9LA 3DBCA 3OXZA 2G15A 3FI8A 3TUDA 1NW1A 2R3MA 1GZOA 2BCJA 3ACJA 3ALOA 5DNRA 3BGPA 3RAWA 4L3LA 4BIEA 2H8HA 5EQEA 2C5VA 4ZMEA 1E9HA 5CT0A 5CXZA 5IA1A 3C4FA 3GU8A 3NUSA 5HE3A 3A8WA 3VS2A 5LMKA 5L2SA 4PMMA 5AUTA 2PZ5A 5IA0A 4FUXA 3NW5A 3MIYA 4EK5A 3FE3A 4H3PA 3Q9WA 5CU2A 4BCMA 4BI1A 2BDWA 5TKDA 2VTMA 2W9FB 3BV2A 3K5UA 3PSCA 4EONA 5GJFA 4HGEA 4BTKA 1EH4A 4RT7A 1Q8UA 2Y4IC 4BCPA 4O0TA 1GZNA 4L43A 2WTCA 4OUCA 5H2UA 5IMEA 3KCKA 1KE8A 5EKOA 2QHMA 3CTQA 3BQCA 3OY1A 3F5PA 3FPQA 5HORA 3GC9A 4ASXA 4DH3A 4FT3A 4PF4A 4XH6A 4KIKA 5IU2A 4FF8A 2ZVAA 3EL8A 5AR2A 3R01A 3L8PA 4MWIA 3UG2A 3C9WA 3Q4CA 4O0WA 3UVRA 4CQGA 3C13A 4EOPA 1IA8A 1WBWA 4H1MA 1YDSE 3FC2A 3DT1A 3FUPA 4HVHA 2WTVA 4Y83A 4I23A 4Y5QA 3QXOA 4QMYA 5C27A 5HOAA 1OB3A 3NPCA 3HZTA 4E26A 5CY3A 4G1WA 4CMUA 3GCUA 4L52A 4NM3A 4MTAA 3ZRKA 5AAEA 4ITIA 4EUTA 3S3IA 4C2WA 4D4VA 4MXXA 5AP7A 4C34A 5JK3A 4UZDA 4ENXA 4RC4A 4RFMA 1YQJA 4O27B 3ZXZA 5HO8A 3SD0A 2F7EE 3E5AA 3QZIA 3AC2A 3L8VA 3JY9A 3UOKA 2WTJA 2G1TA 5DPVA 5IPJA 2E9NA 3WF8A 4FTLA 5T6KA 5TT7A 4J98A 4C35A 3SGCA 4YURA 4EUUA 4TRLA 4XOZA 4I6FA 2RGPA 3EN9A 1ND4A 4CFUA 5IA4A 3FEGA 4J7BA 3ZM9A 5HNBA 4DAWA 5M08A 3SC1A 3K3IA 4DG2E 2WGJA 5B7VA 1NXKA 3EQDA 5FTOA 3VRYA 2PU8A 2PVJA 2EUFB 2VTPA 3LFCA 4MXCA 4BDDA 5ETIA 3VUMA 2VTRA 2YITA 3ULIA 1LR4A 3QWJA 4RIOA 5IQAA 4DCAA 2FVDA 3FWQA 3NUYA 4ZTNA 4ALUA 1U4DA 4P7EA 2OXXA 3ORPA 4WRGA 4GT5A 2C47A 5LJJA 3HUCA 4DGOA 2JFMA 2XKFA 2XP2A 4A9YA 4OBQA 2XJ1A 3QKLA 4LOQA 3EQPA 4HNFA 4O2PA 2UZVA 4YC8A 1FINA 4TYGA 3IS5A 4O0YA 3QLFA 2W0JA 4KB8A 3ZUVA 4AA0A 2PZPA 2OICA 4HVSA 1BLXA 2GPHA 3PJ3A 3QGWA 4RJ5A 4FSRA 5CVHA 3VBQA 3ZO4A 1WBNA 4DE4A 5H8EA 3VC4A 1JLUE 2QOHA 5HLPA 2GS6A 3QKMA 2DS1A 3QCYA 4E6CA 5I9VA 1GNGA 2X9EA 2UZUE 2E9VA 4YHJA 3D7TB 4AW2A 4BTMA 1UU8A 4JVGA 3QCXA 5JMSA 1QPDA 3L8SA 1R0PA 5AR5A 3BGZA 5G6VA 4FEUA 3DK3A 3ORNA 5BVEA 5ACKA 4YZCA 4NM0A 2CCIA 4L45A 3AT3A 1KWPA 5HZNA 3R7GA 3JUHA 4G16A 2BDFA 4GG5A 2XIRA 4QTAA 4EWQA 2V5QA 2VTQA 1X8BA 2BFXA 3DPKA 3NX8A 1OPKA 5IG1A 3MFUA 4ZJVA 2XB7A 2HZ0A 3QD2B 2YAAA 3MH3A 1XO2B 5EYMA 4AACA 2IPXA 5DFPA 4XLIA 4JDIA 3UO4A 3NAYA 3EN4A 2J90A 3KQ7A 5GIPE 3WOWA 3TNPC 4ENYA 2JBPA 5CAOA 1U59A 4FG8A 2WTWA 4ZTRA 5CEKA 4IX3A 5HVJA 2UZOA 4JT3A 3F3ZA 4S30A 4E93A 3SRVB 3P7AA 2WEVA 4AT3A 3G51A 2HCKA 3EQRA 4ID7A 4PMTA 4X6RA 2YJSA 4X3JA 3TKIA 3EH9A 3MB6A 2ZV8A 1B38A 1YOJA 1UA2A 5EYDA 2LAVA 2ZDTA 4YJUA 3ERKA 2HWOA 3QZHA 3U8WA 3VIDA 2X0GA 4NU1A 3D83A 3R73A 5K0KA 2JAVA 2XK4A 5EDQA 4R77A 4FTJA 4A7CA 4DEDA 4HZRA 4AG8A 4KNBA 3BQRA 5C4KA 4PDOA 1OI9A 4IB5A 4DEIA 5J8IA 5C26A 4FKJA 3UGCA 5J5SA 2ZYBA 5FBNC 4RZVA 3OZ6A 4R3RA 4D2WA 3CBLA 2AC5A 3A99A 2GS7A 3VHKA 1XH7A 4RVKA 3QL8A 4DG0E 4FL2A 3GGFA 4G3FA 3UDBA 4ZZOA 5EYKA 1ZAOA 3HLLA 4FNXA 3LKMA 5IZFA 5J7HA 3OP5A 3DTWA 4U9AA 2C6EA 3UYTA 1VYWA 4BBEA 5JN2A 2XNEA 4BDCA 5CSVA 3BHTA 4L53A 2G9XA 4MX9A 4RPVA 1H1PA 2GNGA 4YC3A 5FM3A 4F7NA 2QODA 5IA5A 3QQFA 2W1HA 3NIZA 4NW6A 4W8DA 4DFLA 3VF9A 4L67A 3H9FA 3FMHA 4L44A 4MNFA 5AP6A 2BPMA 2RFSA 3VUGA 4KWPA 4GJ2A 4MF0A 1GAGA 4MCVA 4WG4A 4EH7A 5HIDA 2C5OA 4F9AA 2FSOX 1YXUA 2JDRA 3PWDA 4QMNA 1AGWA 4FVQA 5BVOA 3OWPA 2JFLA 1SMHA 2PL0A 3CQWA 4M13A 4RVMA 3RMFA 5HG5A 4ZLYA 5J9ZA 2OIQA 2SRCA 4DH8A 3C7QA 2OSCA 1OMWA 1V0OA 4PPBA 2J4ZA 2WZJA 2XJ2A 5CEIA 1ZRZA 3ZONA 4G3CA 1OGUA 2QOQA 3C0IA 4UBAA 2B53A 3SA0A 3TV6A 3PWYA 5HEZA 3LLAA 1Y57A 2F57A 3D2IA 5KE0A 3ZZEA 4KIKB 3BU3A 4U3YA 2BZKB 4OTHA 4ZSGA 3OBGA 3B2TA 4R3PA 5IDNA 4J95A 3G0FA 1GOLA 5LVLA 4EOMA 4DBXA 2X4FA 4KIPA 4PP9A 3U51A 4D1ZA 3NS9A 1G8AA 1KUTA 5AM6A 1V1KA 4FEQA 4A9SA 4FNZA 1RW8A 2CMWA 2KULA 3VVHA 4IVBA 5TOZA 1ZYCA 3L9MA 4CV8A 4CZYB 4I0TA 4QRCA 2F4JA 3BLQA 2V55A 5IQEA 4M84A 4YHFA 1H8FA 3KF7A 4A4XA 3CIKA 1J1BA 3FMJA 2QQ7A 3REPA 2ZV2A 2PWLA 4CFXA 2WU7A 4BDKA 2WMUA 2RF9A 4QMWA 4XS2A 4CRLA 4MXOA 5AUVA 3CXWA 2GNHA 3QC9A 3C1XA 3QRTA 4JDHA 4TKSA 2WXVA 3K5VA 2BKZA 3V5LA 4AFJA 4IADA 4RBLA 2Z7RA 4WSQA 3D7ZA 4ZEGA 2ITZA 3W33A 3CS9A 3OW4A 4QP2A 5M4UA 2BTRA 3POOA 4ZZNA 4FZ6A 4QP4A 3DZOA 3OD6X 3UIXA 2CKEA 2HENA 2GDOA 4I94A 2O8YA 4ITHA 4RIYB 5HD7A 3MESA 3JS2A 3UZTA 4ZJJA 3AQVA 4RRVA 3QRJA 2CKPA 1XR1A 1XWSA 2XRUA 3BELA 4XBUA 4QTDA 1BI7A 2R9SA 3Q9ZA 4C4HA 2C5XA 4UX9A 4IFCA 4RJ4A 1PJKA 1PMUA 4FKWA 3DXPA 1R3CA 3R8ZA 3R8UA 3TV4A 2PVKA 3RALA 2BIYA 3OUNB 3MA3A 4HOKA 4RSSA 5E8YA 5HBEA 4R7BA 3GFWA 4NM7A 3P4KA 2J0KA 4B9DA 3QF9A 2HZ4A 3ID6C 2OJGA 3KCFA 3QGYA 5E1EA 4FL3A 4FV4A 3RWPA 4U43A 1G8SA 4HPTE 3GU7A 4I5MA 3OHTA 2JITA 5L2QA 3IGOA 4BCGA 4O7WA 2HY0A 3Q96A 4GK4A 3JVSA 4YZDA 4E5WA 5FBOA 3UJGA 4Q5EA 3AG9A 3R7EA 3A7GA 1YDRE 3DU8A 3LJ2A 3M1SA 4LOPA 3VJNA 2F2UA 4D0XA 2YDJA 1ZLTA 5FXRA 2C3KA 4LL5A 3EHAA 4RFYA 1H0VA 4KD1A 5DT4A 3E64A 3KFAA 4JX3A 2B55A 3PA3A 3R7OA 4F9BA 2YLFA 5JQ5A 1XBAA 3LXLA 3RVGA 2C1AA 3PVGA 2J9MA 3KRXA 4WA9A 1TQPA 2QI8A 2VWWA 5HO6A 4AWIA 4NCTC 4LUDA 3QHRA 1WBVA 2W96B 5E90A 3PJCA 4DBNA 3WBLA 2UZLA 1QMZA 2P33A 4LI5A 4XG6A 4EHEA 1YI6A 3BYOA 1TKIA 2I0YA 4JAJA 4O0UA 4IAIA 4QMOA 4UMTA 2E9OA 4I3ZA 4TWPA 5AFVA 4FIFA 4XRLA 4WT6A 5E8WA 3QUEA 5JH6A 3ZM4A 3MFTA 2WFYA 1GIJA 3I81A 3PYYA 4IW0A 4D4RA 5IA3A 5K3YA 3S1HA 1OL7A 4K11A 2OFUA 4RJ8A 2VWYA 1I09A 5HLWA 3AT2A 3DDPA 3ZFYA 2OZAA 4M67A 4BBMA 3FQHA 3F3UA 4ANNA 5I9YA 2J2IB 3QAME 4M3QA 2Q0BA 3VQUA 4CMTA 2YJRA 2YFXA 3FZRA 3MY5A 4I0SA 5DE2A 2VTIA 1P5EA 3ZSGA 4E5AX 4Q9ZA 3O8UA 4FKTA 4FTKA 4MEDA 5CEOA 1OKVA 5CQWA 2XM8A 4BKJA 5CNOA 3R30A 5F1ZA 4DEEA 4EBWA 2ITUA 1KV2A 4NTSA 4BZNA 4XOYA 3OY3A 1ZMUA 3MVHA 5AR7A 3ODYX 1XH4A 3ZUTA 2V7AA 2OJFE 2IVVA 3AMAA 2GHLA 4QYHA 3RJCA 3VBWA 4OT6A 1J91A 5AMNA 5C03A 4ASZA 4QMUA 5A46A 3TUCA 4GS6A 3MJ2A 3WARA 3WI6A 5CALA 4EI4A 5TR6A 4O84A 2BFYA 4CT1A 2NO3A 2UVZA 3PXKA 5F94A 2GU8A 4YTIA 4BRXA 4ACCA 4BHZA 1FBNA 3I6UA 3SX9A 3SG8A 2W5HA 1ZY4A 4RWJA 3CY3A 2BRBA 5GZAA 4IXPA 3ORLA 4LGHA 4HYHA 5GNKA 4Y73A 3VWAA 1O6YA 3M11A 3ITZA 4DEAA 1H24A 1JBPE 2FO0A 3EZRA 3SDJA 4O21A 5BNJA 2OIBA 3PY3A 4R6VA 3I79A 4GYGA 4UEUA 2YWVA 2ESMA 3VS1A 3W2QA 4IX6A 2VN9A 2HELA 3EJ1A 3A4OX 3FQEA 1VYZA 5HKMA 1YXXA 3OVVA 3H9OA 3E3PA 4XG7A 3GC7A 3FZSA 3QD0A 1Z5MA 4U40A 3CY2A 4G6NA 3TZMA 5LXMA 4W9XA 1KE9A 3BHYA 4FSNA 2X2MA 5CU3A 4L8MA 2UZBA 2Y6MA 2FH9A 2QU5A 1JSVA 1OIRA 1WFCA 3CE3A 3GVUA 2W4KA 3HNGA 4EZ5A 3TZ9A 2BHHA 3NCZA 2ACXA 2C30A 2GQSA 4C58A 5JT2A 4U45A 3Q53A 5A54A 2ONLC 3RPSA 3LMIA 4N6ZA 2YIYA 3II5A 1OBDA 4JBOA 3VS7A 4XG2A 4OBPA 4A07A 3ORTA 5AV4A 4OR5A 4E4NA 3PE1A 1BL7A 5AX9A 2R3LA 4C33A 2X2KA 2UZNA 5HE0A 2NPQA 2Z2WA 2WELA 3AGMA 3DKFA 2QOOA 4H1JA 4OLIA 5TE0A 5KKRC 2YIWA 3CD8A 3ETAA 1XQZA 3QQLA 3C51A 3CCNA 5E7RA 5F20A 4Z55A 4Y72A 5BQ0A 3EN6A 4LMUA 4YR8A 4FV5A 3HKOA 2J5FA 3KXZA 2VO0A 3KL8A 3DKOA 4BCFA 2XMYA 3UQFA 4ACHA 2PVHA 4GU6A 2VU3A 3C4XA 4IJPA 4W4VA 4AGDA 3D5WA 4C8BA 2ZM3A 3HV6A 5ETFA 1UNLA 4E3CA 3BI6A 4AU8A 4M15A 3PA5A 4LYNA 2EXEA 2OW3A 3UZRA 3TACA 3MPTA 3KMWA 4EH5A 4KS8A 2WTKC 4M68A 4O22A 5I4NA 3PUPA 2HXLA 3AD5A 2B1PA 2R64A 3ORMA 4GIHA 4U0IA 4FZAB 1CMKE 3A7IA 4U44A 3QQHA 5AIRA 3UIBA 5A6NA 3I5ZA 3UNZA 3ORXA 3MPAA 4YNOA 3PXYA 4CNHA 2YACA 4OT5A 2HOGA 1I44A 1KOBA 3DJ7A 1FVVA 1BL6A 2WQEA 1JPAA 4MVFA 5HO7A 3VF8A 5EOBA 2VGOA 2CJMA 2VX3A 4NUSA 2W1EA 3KA0A 3A62A 5EI2A 3EFKA 5HG9A 2QLQA 2OWBA 4FTOA 3UZPA 3VN9A 4AN9A 3E63A 4JR3A 4FR4A 3GI3A 4N70A 3WF5A 2ITXA 1UU7A 3HMNA 1QL6A 4NM5A 3FYJX 4P5QA 2BR1A 4MF1A 1YDTE 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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