5L8JA

Aurora-a kinase domain in complex with vnar-d01 s93r
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
266
structure length
253
Chain Sequence
RQWALEDFEIGRPLGKGKFGNVYLAREKQSKFILALKVLFKAQLEKAGVEHQLRREVEIQSHLRHPNILRLYGYFHDATRVYLILEYAPLGTVYRELQKLSKFDEQRTATYITELANALSYCHSKRVIHRDIKPENLLLGSAGELKIADFGWSTLDYLPPEMIEGRMHDEKVDLWSLGVLCYEFLVGKPPFEANTYQETYKRISRVEFTFPDFVTEGARDLISRLLKHNPSQRPMLREVLEHPWITANSSKPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Allosteric inhibition of Aurora-A kinase by a synthetic vNAR domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Aurora kinase A
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 83
structure length 253
sequence length 266
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l8jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5l8jA01
4KBKA 4IWQA 4AGDA 3QXOA 2HY0A 1GZKA 3TCPA 4EHEA 3RAIA 4BTJA 3FXXA 4KKHA 4RQVA 1WBSA 2P2HA 4ZS0A 4APCA 3MPMA 4FTUA 3E3BX 4JL9A 2C0TA 3NYXA 4WSQA 3NW7A 3ZTXA 5CF4A 5JGAA 3NNWA 3FI2A 4WNKA 2R3MA 4O2ZA 3SXSA 2UVXA 1A06A 2XVDA 1OM1A 4FKQA 5GNKA 4EKKA 2B54A 4LOQA 3R7EA 2B55A 2F2UA 5AP4A 3CS9A 5IMXA 2YM7A 4IJPA 2G2FA 2AYPA 2CSNA 3MH2A 3CD3A 4KIQA 3ZLXA 3VS6A 3GQLA 5AV2A 3CEKA 3JVRA 5LJJA 2G2IA 4IZ5A 4PNKA 4CFMA 2FO0A 4JBOA 4U80A 3R8UA 4I5HA 2X8EA 4AE6A 2X8IA 4FL1A 4RJ3A 5CENA 4FVRA 3SD0A 4ZJIA 3SXRA 3ETAA 2WTDA 4TYGA 2X7GA 1XHAA 3KKVA 4EL9A 3ZRLA 1Q99A 5L8JA 2BFXA 4N57A 4JRVA 3VIDA 1QCFA 1GIJA 4O82A 4DGOA 2OXYA 5EI8A 3N51A 3EQCA 3L9LA 1YI4A 2F49A 4YTIA 4CFUA 5A54A 4BKJA 4E73A 3BE9A 4LL0A 4MTAA 5CAUA 2J6MA 2Z2WA 3R8MA 3PA4A 4GCJA 1UKHA 5HHWA 1DAYA 1TQPA 1CSNA 4IX6A 3DAEA 5AJQA 5I9UA 1L3RE 4AN9A 2W1CA 3NIEA 1ZYDA 4C4FA 1WBVA 3DBCA 4DT8A 3D9VA 4HVDA 1XJDA 2W1EA 3KY2A 3ZRKA 4EHZA 4AA5A 5DT3A 2GNIA 3RBWA 4APPA 2FA2A 4TWNA 2IZRA 4YO6A 1G3NA 3AD4A 3FKLA 3L9NA 2VWBA 3MPAA 4IC8A 4L01A 5FQDC 4TWOA 1KE5A 4DAWA 5KMOA 4WKQA 5LVOA 2JGZA 3MTFA 4YGAA 5K4IA 4O22A 5EM7A 5HKMA 3QBNA 1H1WA 3EQBA 4BCGA 4F0IA 5CLPA 3UMWA 1U5QA 3WBLA 4ACDA 4M15A 2BTRA 3MWUA 1I09A 3I1AA 4FICA 1MRYA 2Y7JA 2AC3A 3S0OA 2W7XA 3FI3A 2X4FA 4C62A 4QP1A 4RSSA 3ZO2A 2VNYA 4LMUA 4HVSA 4QYGA 2A1AB 3HUCA 4OTDA 5AM6A 4IWPA 2F7XE 1YXTA 3EN7A 3DKGA 4JG8A 5D7VA 5T68A 5TE0A 3T9TA 4EONA 3VUKA 4IAFA 3PVWA 4JDIA 3TTIA 1GZNA 3UQGA 4NU1A 1QPDA 4IB1A 3PIYA 4XRJA 2X6DA 4XG9A 2WU7A 3UO5A 2O0UA 4GU9A 4X21A 3VBVA 4G3DA 4DGLC 4XEYA 1R39A 4RVMA 3T3VA 2PZIA 3SGCA 2VWWA 3A7IA 4B9DA 5EW8A 1G5SA 4RIXB 5L6WL 5A4QA 4BY9E 2BTSA 2Y6MA 4I24A 4NM5A 5EW3A 2OIBA 4G3GA 4F1MA 3QLGA 1OIUA 4FR4A 2YHVA 3ZC6A 5IQGA 5AUVA 1V0OA 3E5AA 2B4SB 4LGHA 5HU9A 2B9IA 5A6OA 5GJGA 3QXPA 4RG0A 4ZLZA 4YBKA 4B99A 5KKRC 2F7EE 5DEWA 5BVKA 2PWLA 2R64A 2IW6A 3Q3BA 2QC6A 1IASA 3CTQA 3OW4A 4Q9ZA 3O17A 5LWNA 4DEAA 4ASDA 4ENYA 2ZMDA 4MXZA 1E1XA 3FHRA 3ZLWA 4U44A 4ZXTA 5HZNA 4DBXA 4BWPA 4RIXA 1DI9A 4FSRA 5HIDA 2WNTA 1G8AA 2PTKA 2R3RA 4TY1A 4ZSGA 4AF3A 4NKAA 3QLFA 3GC0A 4D55A 2V7AA 3BELA 4DITA 2JEDA 4G5JA 1PXIA 5DG5A 4JAJA 3VQUA 2X39A 3EFJA 3Q4CA 3FZRA 1YQJA 3NZ0A 5T3QA 4RVTA 2E9VA 1UU3A 2CLXA 2OLCA 2HYYA 1H0VA 2RG6A 5AUYA 4EI4A 1KOAA 2XM8A 5I3RA 1YHWA 2F9GA 4F7NA 2X2LA 1REJA 3W18A 4D9UA 1OIQA 3DQWA 3GU8A 3NPCA 2IZUA 4FX3A 3R8LA 3R8VA 2P0CA 5DH3A 5DIAA 1YOMA 1HOWA 3TNWA 3QCSA 5I9WA 3IECA 4ZEGA 5HBHA 5AA8A 4O96A 4DN5A 3R02A 3BGZA 3DFCB 4RQKA 3I6WA 4U45A 4CZYB 1RDQE 2R3NA 4L6QA 4ZTSA 5KKRB 5I9XA 2PL0A 4R3RA 5C8KA 5EQYA 5KMKA 3G5DA 3AC8A 4X2FA 2BALA 4PUZA 3A7JA 5HEZA 4YJVA 3ZRMA 4YURA 5JQ8A 4O7NA 4C4EA 4MNEB 3W16A 3DJ5A 5H9BA 5FDPA 1GOLA 4F1OA 4W4XA 3HMMA 3PJ1A 4RVKA 5E8SA 4NH1A 1XH7A 3C4ZA 4PP7A 3W32A 4FNYA 4A9RA 1PY5A 4ASZA 1GIIA 1SVHA 4A06A 5IF1A 2O8YA 3R7IA 2JIUA 5HG8A 2R0UA 4I4EA 3FMKA 3DLSA 4FTTA 4XJ0A 3TKHA 4BHZA 2IPXA 2UZUE 4R5SA 4Q5EA 3PA5A 2ITYA 4ZMEA 3DTCA 3NX8A 2B7AA 3LIJA 4EJ7A 3F3WA 3OC1A 1PKDA 2I0VA 4JDKA 4AW1A 4EH4A 5E4HA 5BX0A 5LVNA 5HLWA 4FNXA 3IK3A 3RPYA 4F0FA 4BCMA 4BI2A 3P86A 1NY3A 4CZTA 4BGGA 4WG4A 3DXPA 5CYIA 2YAKA 2J0LA 4CT1A 2WFYA 4CQEA 4JIKA 3BX5A 4QMOA 1OKVA 3H30A 3QD4A 5IG1A 4YTHA 4A9YA 2J4ZA 4TRLA 5EYMA 3C4EA 4FEWA 3BCEA 3P5KA 3QTXA 3RVGA 4O81A 1OL5A 1OB3A 1XH5A 2BPMA 4RWJA 2QHNA 1T45A 2C6LA 2OWBA 3KL8A 3P08A 4NZWB 4UY9A 5AR4A 3W33A 1S9JA 3OTUA 5IA4A 5L3AA 4K1BA 4HOKA 3VBTA 4DTAA 5DVRA 1XQZA 1YDRE 4LV8A 2V55A 5FRIA 1FVTA 3QD2B 4DEHA 3BYMA 4U9AA 4QD6A 5IDPA 1KSWA 3N9XA 4O91A 4YC8A 3TV6A 3JVSA 2P4IA 3EN9A 1ZOEA 4F6SA 1MUOA 5B2LA 1CKPA 3A7GA 3II5A 3QUEA 4FIGA 3VRZA 4EK4A 5CU3A 4EBVA 4U5JA 3QTWA 4BZDA 5C26A 4GYGA 3TDVA 3UO6A 4CGAA 1GZ8A 4DE4A 2XYNA 3QL8A 3EYHA 4QTEA 3SVVA 4FVPA 4H36A 4AZTA 5ICPA 4X7QA 5I3OA 2Z7RA 3DTWA 2QOIA 5E9EA 3CC6A 2EUFB 2J0KA 2YCQA 3U8WA 4C58A 2ONLC 1OKWA 3PSCA 3TZ9A 1BMKA 2PVRA 4FTMA 5FEEA 3V51A 4BC6A 2IZTA 3PSDA 3NDMA 1KV2A 3P23A 3H9OA 5IQDA 4Y95A 4IACA 3M1SA 4F7SA 4HW7A 4A7CA 4M0ZA 5EKOA 2JC6A 4I93A 1M2RA 2I0HA 3CPBA 2XB7A 3ORPA 4M67A 1REKA 4O7LA 1TQIA 5JZNA 4KSPA 4AOIA 1OL7A 5TKDA 2VO0A 4UZDA 5FXSA 4JI9A 1Q4LA 3ET7A 2XYUA 4O0XA 4RC2A 4M0YA 2I0EA 2EU9A 2O2UA 3F5GA 3H4JA 4FYNA 5L2IA 3TZ8A 5AX9A 4YZDA 4L46A 3MJ2A 4CXAA 5HTCA 4YJTA 4JG6A 4S32A 2XKFA 3WZUA 4EJNA 2QOBA 5F1ZA 3ZSGA 5IH5A 4TYIA 3IDPA 3W8QA 2LGCA 4MWHA 4AOTA 4CFXA 4FIJA 4D5KA 4DTKA 5EI2A 5M4IA 4E4LA 4YUQA 3G9LX 3OUKA 4KWPA 3PP1A 5LMKA 5DE2A 3KN5A 4R5YA 4NTTA 5H8BA 4Y5HA 3CPCA 4D9TA 4HNIA 4W8DA 4AGWA 3EQIA 3BZ3A 4ZTQA 2OGVA 3MVLA 3MGYA 2V62A 4IM3A 3RNIA 2VO3A 4L7SA 4PRJA 2JLDA 5IQBA 4W4YA 2OI4X 3F82A 3KQ7A 5GZAA 3NUSA 5BVNA 2OZOA 4FNZA 3KMMA 3TUBA 3QYWA 4RT7A 4LI5A 3PJCA 1IRKA 3W2OA 4F99A 5IH4A 1ZY4A 2J5EA 3MFSA 5DNRA 1Q8ZA 2UZLA 4MF0A 3KU2A 4EBWA 4GH2A 1FBNA 3EQPA 3ANRA 4KUJA 4KS7A 4FEVA 5TR6A 2VRXA 5C4KA 1J91A 2GNHA 3LKMA 1OI9A 4L68A 1TVOA 4LOOA 5D7AA 3QAME 5AFVA 3Q60A 4NEUA 1H08A 4WOVA 4FTNA 3GFEA 5LVPA 3Q9ZA 1H25A 4ZK5A 4EOQA 3QRKA 1XKKA 4WT6A 2JFLA 3EQFA 4CVAA 2WTVA 3QRUA 2QI8A 5D11A 4F70A 3OCSA 3A2CA 1YXSA 4Z9LA 4FEUA 3QCXA 3NNUA 2ETKA 2UW9A 3WI6A 3R22A 4GVJA 1JKLA 2W1HA 4YC3A 4G34A 2XNOA 2R0IA 2C1AA 3F7ZA 4QMZA 3EN4A 5IUHA 1E1VA 5TOZA 4CKJA 2ITZA 2KULA 2VX3A 5IQIA 4DLIA 4NJDA 3D14A 4UWCA 5B2KA 5AUTA 1BL7A 2RFDA 3AC5A 4EWHA 2XS0A 4AGCA 3D7TA 1WZYA 3DPKA 5CSHA 3LCOA 3KEXA 3ORNA 5EHLA 1WAKA 5JK3A 3OCGA 4EUUA 4YC6A 3KVXA 2J90A 1R3CA 3PE2A 3QTUA 2W05A 3NNXA 4OTQA 4DH3A 2ACXA 3FL5A 2VN9A 4O2PA 2BKKA 4PNIA 4O7YA 3TV7A 3LW0A 5CY3A 2X4ZA 1FQ1B 3C0IA 3F69A 3QTZA 2PMIA 5GJDA 4ANQA 2FUMA 2RKUA 2GNFA 3U4UA 5DR2A 1MRVA 5K0XA 1FVRA 5FP6A 5GHVA 3UODA 2J2IB 1XBAA 1XH9A 2Y9QA 2W1ZA 1UU8A 5J1VA 3VHKA 4FKSA 3TUCA 2OJFE 3K5UA 4XHKB 3E64A 2I40A 3F3ZA 3U87A 2C6MA 3GB2A 4OTWA 3PPKA 2EVAA 3RAWA 2YA9A 4N70A 2OICA 3VF9A 5J9YA 2PVMA 4I22A 4FTIA 1Q41A 3FV8A 4QO9A 1UV5A 2WAJA 3PPJA 3Q4UA 3BBTB 3PRFA 4QTCA 4PMTA 4F1TA 4FTKA 2GTNA 3FPQA 3SOCA 4LUEA 1I44A 2QO9A 2GS7A 1U5RA 3DZOA 4IX3A 4ZP5A 4PL3A 2YM4A 3QALE 3MFUA 4XLVA 5E8TA 3UG2A 4ACHA 4F7JA 3UQFA 2ITPA 2VTHA 3OROA 4P7EA 2BRHA 5DOSA 5EFQA 4BDFA 3UIMA 3UZRA 2QOCA 4A9SA 4EOLA 3BPRA 3I7CA 2CGVA 2ZMCA 3NS9A 4UN0C 3AC2A 2E9PA 1JKSA 1JPAA 3H0YA 4G5PA 4TNDA 3QKKA 4LQMA 4RFZA 3LCTA 5LCKA 2PVYA 4DG0E 1BX6A 4V05A 3LVPA 3E93A 2PMNX 5IMEA 2RFNA 2FYSA 1Q8YA 3HP2A 3C1XA 4U97A 2Y6OA 4J8MA 4B4LA 4TYHB 2W9FB 4CD0A 4NKSA 3MVHA 4GG7A 4NIFA 2XH5A 2ZM3A 2DYLA 1B6CB 3QHRA 4PMMA 1QPEA 4XG3A 3OWKA 3FYJX 5ETCA 1PMUA 5CSVA 5KO1A 3Q52A 5J9LA 5L8LA 4FBXA 5FLFA 4WUAA 3CTJA 4RJ8A 2X8DA 4XLIA 1QMZA 5BMSA 4MQ1A 4AP7A 4NW6A 5JFWA 2VWVA 3Q5ZA 4ZSLA 3NUAA 2XK9A 4MWIA 3EQDA 1XBCA 2YZLA 3D2KA 4E6QA 4AT3A 3FLNC 4XBRA 3M2WA 4YLLA 5H3QA 5KE0A 5AIKA 5IUIA 1V1KA 2XNMA 3LFEA 4H1JA 2CKOA 4TYHA 4A4OA 1GY3A 3KMWA 4XBUA 3KXHA 4ENXA 2H34A 3F6XA 5JZJA 3OUNB 2UZWE 2VTMA 3A4PA 2HZ0A 2OIQA 4FI1A 2Z60A 3GQIA 4QTDA 4ONAA 3SC1A 3EQGA 5HD4A 4O84A 3QRJA 5IH6A 5AV0A 4IX4A 2BZHB 4O1PA 4CCBA 4YO4A 4FK3A 3VS0A 3LQ8A 2O63A 3I0QA 1ZYLA 2C3JA 2WEVA 4FVQA 2ZVAA 3DKCA 4PTCA 3QYZA 4OTFA 4R7IA 3IDCA 4FSQA 4ZTRA 3WZKA 4X0MA 5J79A 1PXMA 1Y8GA 2WQNA 4CV8A 5A9UA 4PX6A 1KE7A 2WQOA 4BDIA 4K9YA 4QMUA 2WTJA 4X3FA 3LFQA 3REPA 4U81A 4IWDA 4KIOA 2GPHA 4M12A 5M56A 3MH1A 2R2PA 4BGHA 4ZY5A 2OIDA 2ITWA 3DJ6A 1IG1A 5BYZA 3CLYA 5EDQA 5FM2A 2RSVA 3MVMA 2OXXA 1BI8A 5C9CA 2UW6A 4M97A 4BKZA 4DGNA 2YERA 4HYIA 5J5TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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