5EDRA

Egfr kinase (t790m/l858r) with inhibitor compound 27: ~{n}-(1~{h}-indazol-3-yl)-7,7-dimethyl-2-(2-methylpyrazol-3-yl)-5~{h}-furo[3,4-d]pyrimidin-4-amine
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
322
structure length
299
Chain Sequence
EAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLIMQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGRAVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYEEDMDDVVDADEYLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title 4-Aminoindazolyl-dihydrofuro[3,4-d]pyrimidines as non-covalent inhibitors of mutant epidermal growth factor receptor tyrosine kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epidermal growth factor receptor
total genus 93
structure length 299
sequence length 322
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-10-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5edrA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5edrA01
5A4CA 3RK5A 5JFXA 2W05A 5A4QA 3FMHA 4C7TA 3H10A 2YCFA 4KS7A 1E1XA 5HEZA 2A2AA 3D94A 1R0EA 3VNTA 3JY0A 4C36A 2YZAA 1DM2A 4DFZE 4F1TA 3KQ7A 4EH4A 3PG3A 5ANDA 2PUPA 4BTMA 3MVJA 5CWZA 2WOTA 1XBCA 4NM3A 4UWYA 4DFUA 3KRRA 2HXLA 5CI7A 3K5VA 2LAVA 4LOPA 3V6RA 4E5WA 2GS2A 3NUAA 3EQHA 3HGKA 1J7LA 4RC4A 3RAHA 2C3KA 4Y72A 4J7BA 4E93A 2QNJA 3EQRA 3WF8A 2HY81 1XJDA 4XP0A 2WTDA 3F5XA 2GCDA 3OCTA 2VTTA 3UDBA 3DNEA 1SVHA 4GKIA 3KK9A 3ATSA 5DH3A 2HZIA 3LFCA 1OVEA 2PVKA 4BI0A 4C57A 3VF8A 3NUYA 4MYGA 4MXYA 2YAKA 4O7NA 2I0YA 3Q6UA 4CQGA 4R8QA 1LPUA 3SRVB 3BCEA 4N4SA 2WB8A 2B52A 4PL4A 1SNXA 2R3JA 2QOQA 5CT7A 4BWKA 4W9XA 4IDVA 3KREA 1Q3DA 5J79A 4O2ZA 5HBHA 3SQQA 3R7YA 5KZIA 1JOWB 4JDKA 3FKNA 1YOMA 4QQTA 4BCHA 1L8TA 1U5RA 1J91A 1GZ8A 1J7UA 5CAUA 5DT3A 4AUAA 3A60A 1OUYA 1GIJA 2VN9A 1XR1A 2XRWA 4XYFA 5AAEA 1PW2A 3RP9A 2XUUA 3E62A 4XS2A 4D55A 4E6CA 3ORMA 4A7CA 3Q3BA 5KMIA 1YXUA 2PUUA 3DLZA 3RI1A 5E92A 5F20A 2JDVA 4AN9A 2W1ZA 1ZYCA 2OW3A 3ZOSA 4ACMA 4BCPA 4BKZA 5K5XA 3EN5A 5H8BA 2RFEA 4K9YA 4I22A 4MBJA 2PVHA 4ASXA 3VN9A 4G3EA 4LGHA 4CMTA 3PG1A 4A9SA 4TYHA 3QGYA 3IECA 3IQ7A 1Q8TA 4I0TA 3W2QA 5AUZA 5L3AA 2HW7A 3R1YA 3LPBA 4ZSJA 5FGKA 3DFAA 4BCNA 3A8XA 4PWNA 1NVSA 3NR9A 3MBLA 4H36A 2PPQA 2C5XA 2YDIA 3KXXA 1OL5A 4L68A 4TNDA 3LLTA 3PRIA 4H1MA 1ZLTA 2G01A 3NRMA 5E8WA 5HBEA 2E2BA 3KXZA 4P7EA 4GCJA 4PUZA 1CKIA 3UZTA 2CLXA 2VRXA 4O7SA 2ETMA 4RVTA 4ZIMA 4B6LA 4EWHA 3ZC6A 2OKRA 4MKCA 1YDRE 2YISA 3V8WA 3RNYA 4TYEA 2YAAA 2QR7A 4RQKA 1YRPA 4TZRA 5CSHA 5FLFA 3FXZA 5KUPA 3OCBA 3FZ1A 4AWIA 5LCKA 4BDGA 3FQHA 2XP2A 1ZMUA 2OIDA 3MFUA 2XBAA 3SG8A 4L01A 4EKKA 3UZRA 5CU3A 4NIFB 2X39A 3F61A 4LRKA 5D10A 5BVKA 4F1OA 2FSLX 3O8TA 1P4OA 4JXFA 1CTPE 2UZBA 2VO7A 1OL1A 5A3XA 2UUEA 1XHAA 3LQ5A 4Q5EA 4G3CA 2I0VA 5JRQA 2Z7QA 1PXIA 2XKEA 4CTCA 3OVVA 3Q5IA 5IF1A 4QP7A 4RIWB 4X2GA 3QCXA 4IWOA 5ETFA 3COHA 3LFDA 2IZRA 3E63A 4EJNA 3EQBA 3HUCA 5LMKA 3P7AA 2UW0A 4OW8A 5HORA 3FE3A 4YBKA 4FSNA 4JRNA 4RVKA 2WPAA 4XMOA 4A4XA 1RW8A 5AR8A 5AV3A 4KSQA 2WTKC 3FXXA 4BWPA 4LUEA 1U54B 2PK9A 4KS8A 4QNAA 5ANJA 3I81A 4CYJA 4ID7A 4QMMA 4OR5A 3QD2B 4QPMA 3IW6A 3ZM4A 2XYNA 4E20A 5AM7A 4JI9A 1QMZA 2OJGA 4LM5A 4O7VA 4LV5A 2WMXA 5H8GA 2EB2A 3FLWA 3OW3A 3CGOA 3PJCA 3QTWA 3A62A 2WMTA 3E92A 3HV7A 1XH7A 3NUXA 4CNHA 5JMSA 1R0PA 2W17A 3QRKA 3TNIA 3VUHA 4D0WA 1TVOA 3NNUA 4FZAB 4HNFA 4W4WA 4QMLA 4F6SA 2H6DA 2JIUA 1O6KA 4U7ZA 2W1CA 5E8TA 3PZEA 5LVNA 3S00A 2ZYBA 4ZXTA 2Y4PA 2WMRA 3BBTB 5K0XA 2R64A 3ODZX 3H0ZA 4QTDA 5D12A 4ASZA 2X4FA 4KRDA 5CF4A 2C6EA 3HECA 3QYZA 1FGKA 3LHJA 1Z9XA 4NCTA 3RMFA 4HCVA 3RAWA 4XG7A 4L00A 4XX9A 3VBYA 4QMOA 4K8AA 3EN7A 2CKEA 2F7XE 2W7XA 3QXOA 4QTAA 3ZUVA 2PE0A 3QUDA 2G9XA 2CJMA 2C30A 1PKGA 1YXSA 4GUEA 4UWCA 5BYZA 3D5WA 3V5LA 3OBGA 4WUAA 5EHLA 4F09A 4NTTA 4OAUC 5BYYA 3EFLA 3R9RA 1RQQA 4E5AX 4CMUA 3P7CA 4BB4A 4AACA 4F99A 4IX6A 1W8CA 4J1RA 5EYMA 2P3GX 2JDSA 4NM0A 5KMNA 4MCVA 3QGWA 3RINA 4O7TA 3SG9A 2QI8A 3ZLXA 4XRJA 4DH3A 4N57A 4XEYA 3JVRA 2CHLA 4IQ6A 4RJ8A 1B6CB 5A6NA 2NNWB 3LAUA 4RFMA 3MH3A 4DEIA 3BE2A 3MWUA 5JKGA 4KWPA 2IPXA 4C02A 5E8UA 1IR3A 1H27A 4YJPA 1OL6A 2YIXA 3FPQA 4G5JA 4BBEA 3FEGA 2P55A 4RGJA 5AEPA 3GENA 1F0QA 3KMMA 3QX2A 3ZFXA 2IVSA 5EDRA 4MXOA 4TPTA 4FNXA 3DPKA 5DIAA 4YJVA 2WEVA 2C6MA 4DLJA 3D7TB 4KAOA 5J7BA 1Q8UA 4I92A 4PPAA 3P7BA 1JNKA 5HNBA 3EOCA 4FV1A 4K2RA 3MB6A 1Q41A 3GXLA 3PWDA 4IMYA 4LGDA 2XK3A 4YBJA 3R7VA 1PMVA 3ZYAA 4JQEA 4K1BA 4EUUA 4FKRA 4FTAA 3VS7A 4DGLC 4BCQA 4C38A 4DGOA 4WBBB 4EHZA 3KL8A 1CM8A 3FLNC 4FKOA 3RK7A 3LVPA 1OIQA 1R3CA 1GAGA 2B9JA 2WU6A 1GY3A 3MI9A 3UODA 2YABA 1GNGA 3WZJA 4ZMFA 3QWKA 4RSSA 2XCKA 4JLCA 1FINA 4PQNA 4O0YA 4EH2A 4IAZA 4YHFA 3FYJX 4MF1A 2Y6MA 2Z8CA 2BRNA 3WZUA 3BBWA 3HLLA 4JDHA 5M08A 3F3WA 3IGOA 4FG8A 2WQMA 2EXMA 2ITZA 4BR3A 5CF6A 3HRFA 1UNLA 2BRBA 1PF8A 4YGAA 3Q5ZA 5B2KA 4D4RA 1JSUA 4X2KA 4W8DA 2QOKA 4HJOA 3UOLA 1O9UA 5I9WA 4G3GA 4O7RA 1FVRA 4JNWA 4I5PA 3R9HA 3D9VA 4IVDA 4FKIA 4NWMA 2GFCA 2VTJA 3BHHA 4BCMA 4UEUA 4USDA 4EOIA 4O96A 5IQIA 4CFVA 3O0GA 4S34A 3DNDA 5KNJA 3H9FA 4I4EA 1PXOA 2XK4A 4QMSA 2ZM3A 3P79A 2RF9A 3HVCA 4EKLA 3Q60A 4M14A 4N70A 1Y6BA 4HGTA 4FE2A 4UZDA 5AA9A 2WMUA 2B53A 3BKBA 4MD8E 3OXTA 4LQMA 5FXRA 3VAPA 2SRCA 2WMVA 5F4NA 2OSCA 2VZ6A 5E8ZA 4P90A 1WBWA 2R9SA 3GCSA 4C34A 4D2VA 2DQ7X 3A8WA 4J53A 2R0IA 3BU3A 3WZDA 1UWHA 2QLUA 5HVKA 2GHLA 3GI3A 2HZNA 4BVUA 3QQKA 4U80A 5DRDA 2E9OA 2RFSA 3U6HA 3CS9A 4M0ZA 4IWPA 4ZTMA 4MQ1A 2WQNA 3UGCA 4I24A 4FKGA 4EBVA 4X3JA 3BU6A 1FMOE 1H08A 4UYNA 2R5TA 4AN2A 3PJ8A 4FEWA 4FTRA 4R1YA 2WELA 2C6DA 4EBWA 4RZVA 4BIDA 1W7HA 2X7GA 3KXHA 4RVLA 2BROA 4FIEA 3TUCA 3W32A 4ZSGA 4P5ZA 3PXRA 1W0XC 4R7HA 2CKPA 3ZRLA 4TTHB 4E5BA 4FVQA 4HVGA 1T45A 1ZOHA 2R3RA 3VQUA 2XIYA 2B1PA 4IIRA 4OTDA 1YI3A 3LMHA 3VBTA 4DT8A 4ZS0A 5CEMA 5HU9A 3NUSA 2QO9A 3NW6A 3ZO1A 3NEWA 1W82A 3KRLA 3I79A 5AUTA 4ZMEA 3P5KA 2C68A 3QZHA 1H28A 5IQBA 5EW3A 5HHWA 3W55A 1PJKA 5KKRC 2XEZA 3WE4A 4F0GA 2WMSA 4DFYA 1JWHA 3LJ2A 2E9NA 2QC6A 4E6QA 2JDTA 3BU5A 4D1ZA 4QYEA 4EJ7A 3TI1A 2Y8OA 3JYAA 1IEPA 5AMNA 3PXZA 4F9AA 4W4YA 2R0UA 1E1VA 4XV1A 2IW6A 4IAYA 5CEQA 3EL7A 5BVFA 1MQBA 4TYHB 4PL5A 3FYKX 4BTKA 3O7LB 3VQHA 2GTMA 2R3KA 3M1SA 4AAAA 1XH4A 5FD2A 4K33A 4G9RA 4ZTLA 4DF3A 4X2FA 3OP5A 2QO7A 3R71A 5JZNA 5L8JA 3WI6A 2J9MA 5FTQA 4FTTA 4FUXA 4JIAA 4NW6A 3TV7A 2GHGA 5EFQA 3IPHA 3OW4A 3HUBA 4ACCA 4GW8A 5CSVA 4EQMA 3QLGA 2PZ5A 4G16A 2YIWA 3VS4A 4F64A 5BVNA 3DQXA 2BIYA 5K9IA 3VWAA 2O0UA 4FKVA 3UP2A 3DJ5A 3G6HA 2IW9A 4DITA 4LG4A 2B9HA 2C3JA 3EKKA 3LQ8A 5AP5A 5H2UA 5HI2A 3OTUA 4PY1A 5J1WA 4BC6A 3FHRA 5C01A 3O96A 4JOAA 2R3PA 5LOHA 4EHGA 2HWOA 4FSTA 2AYPA 5AAFA 3DJ6A 4MWIA 4EH7A 1Y57A 5HE2A 3EFKA 3C4ZA 4H1JA 4H3PA 4NFMA 4HVIA 4UN0C 1MRVA 2Y6OA 3OT3A 4KUJA 5AJQA 1STCE 2YCQA 1FQ1B 2DWBA 3S0OA 3NPCA 1VZOA 3EN9A 2A19B 3NX8A 3CGFA 4GH2A 2WQEA 4O1PA 4FODA 5ANKA 3MH2A 3C4XA 1UU3A 3UIBA 5G1XA 4DG2E 3K2LA 4FK6A 5GJGA 3ZU7A 3G33A 3CTQA 5J5SA 2GNGA 2W5HA 5BMSA 2HCKA 3MDYA 4N0SA 4G5PA 5I9ZA 2XB7A 1VYZA 3FLZA 1PXNA 2VTMA 3HL7A 2GQRA 1BUHA 2IVVA 3HV4A 2KTYA 2OBJA 3QAME 2O63A 4D2PA 3GU4A 3FPMA 2QOBA 1NY3A 3ELJA 5CNOA 5HTBA 4IJ9A 2PE2A 4YMJA 4TKSA 2BTRA 4YJRA 5KHXA 2XMYA 5M4IA 2QOCA 2VGOA 4W4XA 4Y73A 4WD5A 3E3PA 4FL1A 4N6YA 3W2CA 4QP2A 5H8EA 4JQ8A 3TNHA 5JGDA 2XKCA 2XKFA 3FXWA 3PLAE 4JG7A 4XP3A 2C6TA 5DFPA 2FSMX 5HE3A 3PRFA 2EXEA 3I0OA 5E8SA 3SOAA 5LWNA 4CFFA 3ATTA 3PXFA 2VTHA 3KMUA 2IVUA 1PXMA 3GU5A 4CEGA 2UW4A 4F65A 2XIKA 4U9AA 3FSFA 3G2FA 4EOKA 5FWKK 5BYLA 2W1HA 3VBQA 1Z57A 4ZY6A 5IH5A 5IEYA 5D41A 5JGBA 2JDRA 5C1QB 4JAIA 4JG6A 5TE0A 3KN6A 2UW8A 5I5ZA 4FVPA 2PMOX 3IDPA 4YO4A 3R00A 5AUXA 5BX0A 3EHAA 3LFNA 4ERWA 2GS7A 3ROYA 3IOPA 5J9LA 3GFEA 2ZDUA 4FV7A 4XOZA 5D7VA 4NL0A 3OWJA 4WNPA 4F9BA 3OG7A 2CN8A 2Y4IB 1UNGA 1YXVA 3OHTA 5AP3A 5EQPA 3UE4A 3KULB 3QUPA 3R7OA 1WVYA 2QKRA 2V22A 3HYHA 2BILB 2C3LA 4RC2A 4EL9A 5DEYA 2YIYA 2ZMCA 5EYKA 4E1ZA 3N9XA 4Z9LA 5IISA 3N4UA 2G2IA 3LLAA 4X2NA 3RM7A 1AQ1A 4USFA 4NM7A 3L8SA 1M7NA 3GU8A 1Q5KA 3D14A 1YQJA 2JFMA 4AW2A 4AGDA 4Y83A 1Q8YA 3KN5A 1UA2A 4BYJA 3R7EA 3EZVA 5BVWA 3GC9A 5LVOA 2VTOA 4FKJA 2GSFA 2EVAA 3OTVA 1R1WA 2IZUA 3VUIA 4ARKA 2VO3A 2W1DA 1ZYDA 1U5QA 5C9CA 1Q61A 1BMKA 2R3FA 3MY1A 3QYWA 4C3FA 4D2WA 3VRZA 1UNHA 4EQUA 5FDPA 3GQLA 4YJTA 1UV5A 4KIPA 3OEZA 4C2VA 3AGMA 5HO7A 1HOWA 4CQEA 4RPVA 4FR4A 5TT7A 4F7JA 4HGLA 1UU8A 4M67A 2XRUA 4LI5A 2OXYA 4PPCA 3PDTA 2XM8A 3E64A 4OT5A 3NUPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2ETM A;  4RVT A;  4ZIM A;  4B6L A;  4EWH A;  3ZC6 A;  2OKR A;  4MKC A;  1YDR E;  2YIS A;  3V8W A;  3RNY A;  4TYE A;  2YAA A;  2QR7 A;  4RQK A;  1YRP A;  4TZR A;  5CSH A;  5FLF A;  3FXZ A;  5KUP A;  3OCB A;  3FZ1 A;  4AWI A;  5LCK A;  4BDG A;  3FQH A;  2XP2 A;  1ZMU A;  2OID A;  3MFU A;  2XBA A;  3SG8 A;  4L01 A;  4EKK A;  3UZR A;  5CU3 A;  4NIF B;  2X39 A;  3F61 A;  4LRK A;  5D10 A;  5BVK A;  4F1O A;  2FSL X;  3O8T A;  1P4O A;  4JXF A;  1CTP E;  2UZB A;  2VO7 A;  1OL1 A;  5A3X A;  5BV3 A;  2UUE A;  1XHA A;  3LQ5 A;  4Q5E A;  4G3C A;  2I0V A;  5JRQ A;  2Z7Q A;  1PXI A;  2XKE A;  4CTC A;  3OVV A;  3Q5I A;  5IF1 A;  4QP7 A;  4RIW B;  3UDT A;  4X2G A;  3QCX A;  4IWO A;  5ETF A;  3COH A;  3LFD A;  2IZR A;  3E63 A;  4EJN A;  3EQB A;  3HUC A;  5LMK A;  3P7A A;  2UW0 A;  4OW8 A;  5HOR A;  3FE3 A;  4YBK A;  4FSN A;  4JRN A;  4RVK A;  2WPA A;  4XMO A;  4A4X A;  1RW8 A;  5AR8 A;  5AV3 A;  4KSQ A;  2WTK C;  3FXX A;  4BWP A;  4LUE A;  1U54 B;  2PK9 A;  4KS8 A;  4QNA A;  5ANJ A;  3I81 A;  4CYJ A;  4ID7 A; 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