1OKVA

Cyclin a binding groove inhibitor h-arg-arg-leu-ile-phe-nh2
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights Into Cyclin Groove Recognition. Complex Crystal Structures and Inhibitor Design Through Ligand Exchange
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 295
sequence length 295
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2003-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1okvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1okvA01
3AXWA 3OT8A 4I4FA 5IH5A 4AF3A 3ZLSA 4IXPA 2ZV2A 5A6OA 2KULA 4B99A 3COIA 3EFJA 2IVTA 3PXFA 4OTIA 3QCSA 4UMRA 2YM6A 5F4NA 5A46A 4I41A 4FT0A 2QD9A 4FVPA 5M55A 4BL1A 5C1QB 1TQIA 4G5JA 3U6IA 3PIXA 2J5FA 2PMNX 4AOTA 3P5KA 3QUPA 3PJ8A 3LLAA 1FVVA 5CEKA 3QBNA 1OL6A 5D41A 5EDPA 1M52A 4F6WA 2CCIA 2G9XA 1WBNA 3KF7A 3OWJA 4EHVA 4RC2A 3FL4A 3P9JA 2QC6A 4O0SA 4F0FA 5J5SA 5KNJA 2OG8A 4QTCA 3ZS5A 3Q53A 3CKXA 3NUXA 2P2IA 4YPDA 4TY1A 3NAYA 1FVRA 3KU2A 2QONA 4WNKA 3R9OA 4FYNA 4W4XA 3DTWA 3FHRA 4IEBA 3TZ7A 4CSVA 1ZLTA 3IGOA 4O86A 4H1MA 3LCTA 4NT4A 2YN8A 5I9ZA 4HGSA 5CZIA 4FV8A 3R8VA 2WTKC 4DCAA 3O7LB 3HMOA 4FICA 3PY0A 3KC3A 4WG4A 2X7OA 4D0WA 3Q6WA 4IB1A 4LL5A 3UZPA 3HNGA 4FSYA 4FV9A 5HGIA 3ZO2A 3FLSA 2C6TA 3SXRA 4M8TA 1J7LA 5KCVA 2B9FA 3EWHA 3OCGA 2R3PA 4MXXA 3T3VA 5JN2A 4PPBA 1OI9A 3DK3A 3R1NA 4OTHA 4PL3A 2HYYA 5EK7A 2X8DA 4ZSJA 4FSMA 1YVJA 2ITZA 5HVJA 4CFNA 5J5TA 3MN3A 2XYUA 4IM2A 3RP9A 4QMQA 3O17A 2OXDA 4DTKA 3BHYA 3GOKA 5CNOA 2JIVA 3K5VA 5M4FA 3V01A 2W5AA 3COMA 4E1ZA 3F5PA 4I5CA 5CT7A 2HXLA 4E6QA 5I9WA 4ACGA 3KFAA 1GJOA 3GU8A 5AJQA 3VBVA 2P33A 3UNJA 5CASA 3DLZA 4FNYA 4F9BA 3DXQA 4XG2A 3NUPA 1STCE 3QF9A 2VWVA 1ZY5A 4XJ0A 4AZWA 2R3MA 5IA0A 5JZNA 3V5QA 4IW0A 4F1TA 4GT4A 4ACMA 2JBOA 4NCTC 3NCZA 4MEDA 2VX3A 3SHEA 2NRYA 3LM0A 3NNWA 5IQAA 5JKGA 5BUIA 4JIAA 4NM7A 5EM8A 3WBLA 3RVGA 4PTGA 2X6EA 3UPZA 3NEWA 4NSTA 2YDJA 3BYVA 2CN5A 3D0EA 2VO7A 3R0TA 4F63A 3SW4A 4C57A 4XBUA 4TNDA 4YURA 2PSQA 4YJOA 3EB0A 4XMOA 2OIQA 4CLJA 3DPKA 3AG9A 4ANSA 4CXAA 5IQCA 2PVRA 3ORZA 5KMJA 2VNYA 3D5WA 2F2UA 5FBOA 4TYHA 3P7CA 4QTAA 2W5BA 5CVHA 3I79A 4DEHA 1LR4A 3LXPA 1VJYA 2BAJA 3OTUA 4H3QA 3CPCA 5DIAA 4CCBA 2WQEA 1MUOA 2XEZA 3NIZA 1QL6A 3TKHA 4D58A 3KVXA 4DTBA 2BAQA 1OIYA 3AOXA 3UQGA 3QQJA 3D9VA 2YACA 4DC2A 3OWLA 4QMNA 4AZEA 5JZJA 2QOHA 5ANGA 5BVEA 3ZFMA 3F66A 2NNWB 4DEGA 3FMKA 4PL5A 4USDA 5JGAA 3GU7A 5BX0A 5BVOA 2H96A 4F70A 1Q8UA 4YNEA 4O7VA 3VIDA 4Q5HA 4NYEA 4V04A 4AZVA 4KD1A 3TIYA 4HVGA 3TUBA 4MYGA 2GMXA 4G3CA 1F0QA 4QPAA 4D2VA 3UVPA 4HCVA 1SVHA 4UZDA 1FQ1B 2O5KA 2X7FA 4F99A 4MHAA 5E91A 5IH6A 4G3EA 4FTAA 2PZYA 5EM5A 4WO5A 4O7SA 5IA4A 2WTIA 3NDMA 1PYEA 3O2MA 3DCVA 5AP6A 4TYHB 4CZUA 5AA9A 3AMBA 4NWMA 2RGPA 4O21A 2R3HA 2YDIA 3U51A 2Z60A 3UOHA 3DV3A 4CT1A 4FTJA 5AR5A 3MPMA 4BZOA 3BIZA 3VUKA 4BB4A 4E6CA 4BDGA 2VO3A 1WBSA 3PG3A 3KRWA 3RAKA 3HX4A 4FKVA 5BQ0A 3ET7A 3FZOA 3HEGA 3T9TA 5DRBA 3OWKA 4TYEA 3Q2JA 3PJ2A 2G1TA 4YLJA 4A9YA 3ZBXA 5FG8A 4DGLC 2UZEA 2BDFA 3NIEA 2YHVA 5EI6A 4CVAA 3NUYA 3R73A 3U54A 4K0YA 4ZSGA 2CSNA 4JI9A 3E62A 4PP9A 5HCZA 5AV4A 4UMQA 4IIRA 1OKWA 4QMYA 5AWMA 4RGJA 3NUAA 4AA0A 3DQXA 3JPVA 1J91A 3FKOA 3RK7A 2WQBA 5CAVA 4BR3A 5BUJA 3I6WA 4ZS0A 4BWXA 1R39A 5J9ZA 3NCGA 3RPOA 2JEDA 5CF6A 2QOCA 4E4LA 5F9EA 3FXZA 5E8ZA 3CPBA 4FSNA 3MB6A 4CTCA 5AAGA 3W2OA 2R64A 4KKEA 3EL7A 4CV9A 3DFAA 4P4CA 3FQEA 3QD4A 1XH7A 2VTOA 1XBCA 2GTMA 2IZSA 2B9HA 4YTHA 1REKA 5T68A 4ALUA 4CKIA 3U8WA 4Q9ZA 4WHZA 2C0OA 3BBTB 3UC4A 3W1FA 3QYWA 3C4FA 4E5WA 4LOPA 3VF8A 4C33A 3P7AA 4F0GA 3UIXA 1YW2A 1ZMVA 2V62A 5I9VA 4RIYA 5IU2A 2J90A 3OY1A 2B7AA 3ORPA 3R30A 1FVTA 4RIXA 3UNZA 3LJ0A 2OO8X 1RE8A 5CEQA 5CAPA 3U87A 3E8DA 3SVVA 2QKWB 3AMYA 3O23A 2WNTA 1IRKA 3D7ZA 3OBGA 4L6QA 4EZ7A 3L9PA 2W1HA 5K5XA 4R1YA 1W7HA 5EYDA 3EOCA 3DK7A 3TJDA 2O63A 4JQ8A 4O83A 2EB3A 4YJNA 4S33A 3LMIA 3KEXA 4IVBA 4EOIA 3PA5A 4FZ7A 2RFSA 4LQMA 5HX8A 5FQDC 3LOKA 4Y95A 1H25A 1I44A 1JBPE 2F7ZE 2XA4A 5L2QA 2B0QA 3TUDA 4I6BA 4KIQA 1YWRA 4PL4A 4M69A 3UDBA 3GCVA 5HIBA 5J7HA 3MVLA 3QALE 3GFEA 4WIHA 5CU3A 3IO7A 5I5ZA 2WAJA 4FA2A 4L8MA 4C02A 2YIXA 4A9TA 3UOKA 4LV5A 4CFUA 1P4FA 2OJ9A 3A99A 3JY9A 4FV7A 4RIYB 5A4TA 3EQIA 4D2SA 4ZTMA 5HLNA 5JK3A 2FSMX 1OITA 2V0DA 4A9RA 3NGAA 4FIGA 4I3ZA 2WTWA 4RIXB 5HTCA 4ZTRA 4EOPA 3SW7A 4A4XA 2Y9QA 4BGQA 5LVMA 4DBXA 3C1XA 3BGPA 4YZ9A 3Q9XA 4X2KA 2H34A 4C2VA 4TNBA 4EONA 1UU3A 2OIDA 1KV1A 5T6KA 4HYSA 4FKWA 3ETAA 4C3RA 3R9HA 4UMPA 4XV2A 3WZJA 1G8AA 2YLFA 4OW8A 3RZBA 2BIYA 4I24A 2YIRA 2GCDA 3I7BA 5EQYA 2C3LA 5DE2A 1SMHA 1KE5A 2PL0A 3KXMA 3OROA 4QP7A 3WF5A 3D7TA 3NPCA 3IDCA 3OCTA 4FV1A 4M69B 5E8YA 3RM7A 5AIKA 3VS2A 4FTCA 5K5NA 4R77A 3ZC5A 4RX8A 5D7VA 3HV4A 4V0GA 1H07A 4GS6A 5CU6A 3OF0A 4I93A 3CQUA 3W8QA 5CAQA 4QP3A 4AAAA 3C5IA 2JAMA 3WF7A 4AE9A 3PZHA 5F94A 4ANOA 4B8LA 4FKOA 1SNUA 3OFMA 2C6EA 4GKHA 3PUPA 4FIJA 2DWBA 3Q9ZA 2GHLA 4XH6A 5FRIA 4D1SA 4X3FA 3BHHA 4YZDA 2ONLA 4UWCA 1OM1A 1UU9A 3D15A 3LM5A 4IWOA 3OBJA 4Y72A 4C0TA 5H2UA 5A6NA 1FBNA 1BKXA 2GNLA 3JS2A 4IJPA 3Q5ZA 4JBVA 2H8HA 2YCQA 1MQBA 5EFQA 1VEBA 3BE2A 3VBWA 5CENA 3MI9A 3A7JA 4PQNA 5AM7A 4RWKA 1Z5MA 3F9NA 4IDTA 4NW6A 3SOAA 4IAYA 4KIOA 3ZO3A 5ETFA 2C4GA 3COHA 3T3UA 4FTQA 3D7TB 4FIFA 3ZU7A 1ZZLA 4QPMA 2YWVA 4FSWA 2GNJA 4LMNA 1V0OA 4V0GB 5DR2A 3PSCA 3CTJA 2BMCA 2EUFB 3BV3A 4QYHA 2YIYA 2YIQA 4RC3A 5HEZA 3VUGA 3MGYA 1PHKA 2PVHA 4ACDA 5KHXA 3TM0A 3F7ZA 5LQFA 2Y8OA 2JKKA 4ERKA 4DGGA 3R7GA 1WFCA 3SKCA 4O22A 5AP4A 4MNEA 3F3ZA 1CM8A 3G33A 4M14A 3AC3A 3EQHA 4JDJA 4BGHA 3HA6A 4QMWA 3VUTA 2R3OA 4XS2A 5J1VA 1JNKA 1KSWA 2EB2A 1W84A 2RFDA 2VTNA 3ACJA 3F3UA 2QLUA 4KIKA 4UV0A 4X3FB 3BYMA 3QCQA 2YABA 3R7OA 5JGBA 4O84A 4QTEA 3EQRA 3VUHA 3CE3A 3KXZA 1AQ1A 4L01A 4FTOA 3NYVA 1F5QA 4G3DA 1QPCA 5EYCA 4O0TA 3VHEA 5CANA 5L2WA 3KMUA 4R7IA 4HVHA 2JIIA 3PPZA 3TL8A 3DFCB 3UTOA 3C5UA 4BDBA 2IN6A 2ZAZA 5CXZA 1JSTA 3TKIA 2PMOX 4G34A 3ZM9A 2OJJA 4LOQA 5LCKA 3ALOA 3LCDA 4YZBA 4CTBA 4CYJA 3U6JA 3ZLYA 3HRBA 4G17A 4IVDA 3HA8A 5EOBA 4A07A 3AC5A 3GQLA 3RCDA 3VBXA 5KZIA 2AUHA 3II5A 3UIBA 2UW3A 4I1ZA 4TWCA 1UKIA 2VWZA 3F7WA 2UW5A 2XCKA 3I5NA 3IGGA 4TZRA 3TTJA 4LG4A 4L45A 3RPVA 4FZFB 4AOJA 4F7NA 5M09A 4MNEB 2QVSE 1O6KA 1NT2A 3VBQA 4FYOA 3WE8A 2Y4PA 2OJGA 3OD6X 4D2PA 2ITQA 4GVAA 4KIKB 4PNIA 2WMSA 3DKOA 3E92A 3U4UA 4CZTA 3V5TA 3V8TA 3ZFYA 3LE6A 4TYIA 2WEIA 1UU7A 5KX8A 4D2WA 1JSVA 4HJOA 3TG1A 2VTAA 4F7JA 2YCSA 5HORA 4RZVA 4IZ5A 2ZDTA 4E5AX 4TPTA 3AGMA 2OZAA 4PNKA 4C59A 4EWQA 5A4LA 4JG7A 3E5AA 3PWYA 2WMUA 3IW5A 4GYIA 3SC1A 2PZRA 3R2YA 3G15A 3N4VA 2HWPA 2VWUA 4O0XA 2OF2A 3R7UA 4FZAB 3V5LA 4YHTA 4KS7A 4AGDA 2CNUA 5LVOA 2HW7A 1WBVA 4JVGA 4R3CA 3OXTA 4EJNA 3TNQB 1VYWA 3KL8A 3RPYA 4RVKA 3RK9A 4PWNA 4HPTE 3W10A 4F9YA 4KAOA 1BI8A 2WU6A 3EQBA 3FY0A 4LOOA 4YJTA 3KMWA 5TT7A 2WB8A 3HDNA 2JIUA 4YJQA 3OCSA 4UMUA 4M3QA 4CQEA 2IG7A 1NVQA 2BRMA 2QO7A 3QTQA 4WNPA 1K2PA 3EQPA 3H3CA 5FXQA 4K18A 1H27A 4FTKA 5M51A 5ANEA 2OZAB 3QU0A 2VV9A 2X81A 4CRSA 2XK3A 1UU8A 4C2WA 4DE4A 4YLLA 4IZYA 3RCJA 5IQIA 2IO6A 3EZVA 2RFNA 4FGBA 4DFUA 3MY0A 1U4DA 1PXMA 4XUFA 3TV7A 1WCCA 3IDBA 4FVRA 4IADA 5M57A 3QRJA 3FE3A 5E8UA 1JKSA 5HE2A 4C4GA 2UW4A 3CQWA 3RAIA 3KB7A 4D4RA 3K5UA 4E4MA 5M06A 3VAPA 2Q0BA 2CGUA 4KWPA 3EIDA 2C3JA 3G51A 3PRFA 4ZZOA 4ERWA 4LV8A 4R1VA 1Z57A 1B6CB 5AAEA 1IAHA 2PVLA 4IFGA 3KRXA 4D4YA 2XBAA 3PXQA 4YJUA 5E8SA 2WMXA 3S0OA 3U6HA 5HG5A 3QX2A 3OUNB 4B8MA 3A8XA 1YXUA 2KTYA 2YISA 1ZOEA 3M42A 3QZHA 3O50A 3SG8A 4LRKA 5T3QA 2YJRA 4RG0A 3Q32A 3V5PA 3MDYA 1YI4A 4JRNA 1Q8WA 4HYHA 5DBXA 3KGAA 4ANNA 5H8EA 2ZMCA 2V55A 4O7ZA 1OECA 3DAJA 2WTDA 5HU3A 3MFRA 3FHIA 4F9CA 4X2GA 4G31A 3V8SA 2W7XA 1IAJA 4EHEA 1Y6AA 4O91A 3KULA 5LVLA 3RPSA 5E4HA 4Y83A 4UYNA 5L2TA 3TXOA 4AUAA 5CF4A 3GEQA 4USEA 1G5SA 3QWKA 3QLGA 2C5VA 2WMTA 5BYLA 1Y6BA 3RALA 4RT7A 4DN5A 5J9LA 1S9JA 4XOZA 3DQWA 2CGXA 4J8NA 2W1DA 4RZWA 4U80A 2UW6A 1SYKA 1W0XC 3O7LD 5EG3A 5K0KA 1Q41A 4IJ9A 1H0VA 3CGFA 2EXCX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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