5A4TA

Dyrk1a in complex with nitrile benzothiazole fragment
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
347
structure length
341
Chain Sequence
KVYNDGYDDDNYDYIVKNGEKWMDRYEIDSLIGKGSFGQVVKAYDRVEQEWVAIKIIKNKKAFLNQAQIEVRLLELMNKHDTEMKYYIVHLKRHFMFRNHLCLVFEMLSYNLYDLLRNTNFRGVSLNLTRKFAQQMCTALLFLATPELSIIHCDLKPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQIQSRFYRSPEVLLGMPYDLAIDMWSLGCILVEMHTGEPLFSGANEVDQMNKIVEVLGIPPAHILDQAPKARKFFEKLPDGTWNLKKTEYKPPGTRKLHNILGVETGGPGGRRAGESGHTVADYLKFKDLILRMLDYDPKTRIQPYYALQHSFFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Probing the ATP-Binding Pocket of Protein Kinase Dyrk1A with Benzothiazole Fragment Molecules
pubmed doi rcsb
molecule keywords DUAL SPECIFICITY TYROSINE-PHOSPHORYLATION- REGULATED KINASE
total genus 109
structure length 341
sequence length 347
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.12.1: Dual-specificity kinase.
pdb deposition date 2015-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a4tA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a4tA01
3I0OA 1FQ1B 3GC9A 4TXCA 4O6EA 5CXHA 5AUXA 5CASA 3NS9A 4I20A 4HGTA 4DINA 1Y6BA 3A61A 4FE2A 4D55A 4JG6A 5T68A 4FGRA 5GZ9A 2OXYA 2VAGA 5HBEA 3L9MA 4PP9A 4EHGA 5CEPA 2ITPA 3O8UA 4TW9A 1WBNA 4ITIA 4R3RA 3QAME 4MWIA 1M7QA 5JFXA 4IC7A 3RCDA 2IZSA 3JYAA 2ZV7A 5FP5A 3VS7A 5JK3A 3ACKA 3ZO1A 1Y8YA 4CQEA 4HCTA 2VD5A 5I9ZA 3W1FA 4DEDA 4XMOA 4DEBA 4DLJA 4FT7A 4BHNA 2GQSA 1IG1A 4AA4A 4YUQA 3E3BX 2XM9A 4L46A 3WF6A 4WHZA 3EFJA 4WIHA 4RA4A 3VRZA 2W96B 3QZIA 3OZ6A 1ZZLA 3OXZA 4IVCA 4X2GA 3TNQB 3DK3A 3W2CA 5J1VA 4HYUA 2GHLA 2OJJA 3DQXA 2OIDA 1IAJA 4GH2A 3EN4A 1JVPP 3KGAA 4MXOA 4HYIA 5HIEA 3R30A 4D5KA 2XIXA 3DTCA 3ZXZA 1ZYDA 3NUPA 4IB0A 4M14A 5C9CA 2E9UA 3EL7A 4K77A 1PW2A 3RPRA 4H3PA 4DAWA 2AC5A 2FVDA 4CFWA 2R4BA 3A7JA 2YWPA 4OTQA 4I6QA 4TNDA 4U44A 4MD7E 3TWJA 4TKSA 2ONLA 3CJFA 3HV4A 3DAEA 2W9FB 2V5QA 4XV1A 3UG1A 2PVHA 4A9SA 3VHKA 1BI7A 2W5HA 5J7HA 3VBQA 4UMRA 4FIJA 3IDCA 3FKLA 4I92A 5CZIA 2V22A 2DS1A 3AC8A 4GYIA 4JDJA 4U7ZA 3T3UA 4BWPA 1WAKA 4C2VA 3QX2A 3HUBA 2RFDA 4QPAA 3ZM4A 3AXWA 4FSQA 1W0XC 4AW5A 4PDYA 3KXZA 4IZAA 3GU7A 2QU6A 3AT2A 3C5UA 3E92A 3FMMA 2ONLC 4NKSA 4PWNA 4YJUA 3FPQA 4K9YA 3R9OA 3U9CA 5IA0A 5IEXA 3OBJA 1XHAA 4W8DA 4PL3A 1P14A 2OG8A 4FL3A 4M8TA 4B8LA 3ERKA 3EYGA 4AE9A 2X6EA 4G16A 4GL9A 5GIPE 4CFVA 1M14A 2J0KA 3FMJA 2AC3A 1KE9A 2YISA 3F5GA 5HGIA 5L6PA 4DE4A 3VS4A 4ITJA 2Y4IC 1YKRA 1H28A 3PIZA 2RF9A 1GIIA 3E7OA 3EOCA 4AS0A 3QD2B 3GP0A 3EFLA 3I6UA 3ITZA 4ZTHA 3ELJA 2YJRA 4ANLA 3BKBA 4XP2A 2ZOQA 3LOKA 3TL8A 1JPAA 2GFSA 2XA4A 3AQVA 5E8ZA 5HG5A 5KKRC 4XHKB 4I3ZA 3LAUA 3AC4A 1P4FA 4G3EA 5F94A 5HICA 2X81A 1OECA 4JQEA 4RJ6A 5JFVA 3FLNC 4RT7A 1V1KA 4XLVA 4HGLA 3RAWA 4O84A 5EDRA 4EK6A 3K5UA 3NAXA 4IC8A 5AX9A 4BR3A 1UNLA 4LYNA 4E6CA 2O0UA 3WYYA 5M56A 2PK9A 1ZZ2A 4I5CA 5AJQA 3QCYA 4X21A 5FRIA 4EEVA 4G6OA 2BTRA 3DJ6A 3BX5A 5B7VA 3QD3A 1YDSE 3FLSA 3AC5A 4CLIA 3TV6A 4AT3A 1H01A 3ULIA 5CALA 2J90A 3F61A 3DKFA 4LV8A 4QPSA 2WELA 4IM0A 5JN2A 4RMZA 5AUWA 5CEKA 3LFSA 2VWXA 3KA0A 5CS6A 3A7GA 2CNVA 4ZLOA 4OTIA 3Q2JA 3FQEA 5I0BA 1Q41A 5ANDA 3QHWA 4PP7A 4HVIA 2IVTA 2X7GA 3FL5A 4O0UA 4O7YA 5JEBA 2W1EA 4G3GA 5AA9A 2F2CB 5IH5A 2BIKB 3OWPA 2XKEA 4CG8A 5AAEA 2GTMA 4FIIA 4C57A 2C68A 4G3FA 4YJTA 4AWIA 3QKLA 4OTDA 2UVXA 3WF8A 3ZH8A 5AEPA 4ZLYA 1RQQA 3AD5A 3NW7A 4BCFA 5IG1A 5EHYA 5AUUA 3EKKA 4F7SA 5KO1A 5AP3A 3BWJA 4AZWA 3Q32A 1YI3A 2LAVA 5IZFA 4NCTA 4DTBA 2OLCA 4QMQA 2HZIA 3FSKA 3LJ1A 4LM5A 4YHJA 4W4WA 3R9NA 5HNBA 4YO6A 5DRDA 4BZOA 3WARA 2WQOA 4FL1A 2PSQA 3F6XA 4HGSA 5I5ZA 5L3AA 4QTAA 1AQ1A 5HLNA 2DUVA 4UWBA 3W2RA 2C6EA 1MQBA 4MQ1A 2HIWA 3EQFA 3EQCA 3L9LA 4TWPA 2ZDUA 3VQHA 2HW6A 3LFCA 5DPVA 3R9DA 5L2TA 1Q8TA 3GBZA 3R21A 3W16A 2UZTA 4MXYA 3QXPA 5LCKA 5LCJA 5M44A 3FYKX 1ERKA 5IH4A 3K54A 2CMWA 2YDIA 3HDNA 3R1SA 4USDA 5HCYA 4B6LA 4F64A 4JIAA 3RINA 3QQGA 3UC3A 2BPMA 3BCEA 2WIPA 4BDJA 3QGWA 1Y57A 1JBPE 2RIOA 2XNGA 3ZFYA 4ASXA 5BX0A 2I1MA 3R1NA 4A9YA 5AV1A 2CGUA 2PUNA 1OIYA 4L7SA 2VTJA 3GCUA 4KKGA 1Y91A 3WOWA 4DH5A 4YHFA 3PP1A 3NNUA 3PPKA 3DK7A 2QNJA 3ZTXA 3HYHA 5ETCA 4GIIA 4AOJA 4APCA 5ITAA 2YFXA 3G33A 5CU4A 3VW8A 4CV8A 3R7OA 5HEZA 3TIYA 3DPKA 5CF6A 1PMUA 5EI8A 5L6OA 4CD0A 1PXKA 2EU9A 5LVNA 4FTLA 2CLQA 3CTHA 5DH3A 4YO4A 3LFAA 1YOJA 5CEMA 4HZSA 4OBPA 4GJ2A 4CTCA 2QR7A 4NYEA 2XKDA 5A4LA 5IQFA 5BVKA 5FXQA 3JY9A 5C1QB 4PDSA 3EB0A 4GU6A 5D12A 4PMPA 1X8BA 4YTFA 2C5VA 4FV0A 1Q62A 3SRVA 3JR1A 4I93A 5IF1A 3HP5A 3R8UA 5HBJA 1Q8UA 4AN3A 2XK7A 5HOAA 4JR3A 1G8SA 2R3HA 4EOJA 5KMLA 3F66A 4CT2A 3DXPA 2QONA 3GEQA 3QGYA 2FSMX 2XEZA 4CZUA 3JPVA 4M69B 4EOIA 1CKIA 4JX3A 3FZ1A 3OOMA 5AR7A 2QG7A 2XH5A 2JIUA 4BCGA 4C8BA 1ZAOA 2I0HA 4C33A 3AGMA 2Z60A 5B2KA 2C6LA 3SOCA 1XH4A 5BUIA 4QQJA 4CT1A 1Y8GA 1PRYA 4ZSGA 1Q24A 4ZEGA 1YDTE 2GNFA 3POZA 3VHEA 3UC4A 2BAKA 3LMIA 3KB7A 4FNZA 3VN9A 5AV3A 4MK0A 4RX7A 5HI2A 5C03A 5IQAA 2VTPA 4C3PA 4NWMA 1VEBA 2WMBA 1SVGA 4LGDA 3D5VA 2FB8A 2WMRA 3VAPA 3MPTA 5EQPA 2HZ4A 4BZDA 3P7AA 4XCUA 4YJQA 3WZKA 3P78A 5AADA 1YHWA 3FMHA 5HVJA 3IG7A 5AP0A 3Q52A 3ZLWA 4DGGA 1JSTA 2VWZA 4BTMA 4NM3A 5ETAA 4UMPA 1PXMA 3S3IA 3DZOA 3P23A 1JOWB 4RZWA 2OBJA 4OTHA 3U8WA 4IWQA 4FZ6A 2WMSA 2CN8A 3OWJA 3PYYA 3F3ZA 1M2RA 1FGIA 2UV2A 2UW4A 3C4ZA 4Q5HA 4TYGA 4KINA 3MSSA 3D7TA 2V62A 4LOPA 2VTHA 3EFWA 4CFXA 2GHMA 5LOHA 1OL2A 4JDHA 4PY1A 3I81A 4QYYA 4EBWA 3QKKA 3HMIA 4HPUE 4X3FB 3CBLA 3GGFA 5CSXA 3LQ3A 4IX6A 2OK1A 3VS5A 3ZO4A 1XH9A 5FTQA 4WOVA 3VF8A 1HCLA 4AA0A 2J9MA 5FDPA 4DFBA 2XS0A 5D10A 1O6LA 4K0YA 1RW8A 5DR6A 2BRBA 4CNHA 2DQ7X 4RIWB 5J79A 2JDOA 1JSUA 4RIXA 1KWPA 3CY2A 3PLAE 4L3PA 4IAYA 3VBXA 4F6WA 2XF0A 4M0YA 5C4KA 3QQFA 2PE0A 4PMMA 4CZYB 3EFKA 3KRWA 3MY5A 3TACA 5FD2A 3P7BA 2JDVA 3ZUTA 1WBWA 2QOFA 4BDGA 4CKRA 2FSTX 4QRCA 3P4KA 4WKQA 4YZNA 3LXNA 3NW5A 4U80A 2A2AA 3IDPA 3O8TA 3T9TA 4FVQA 1YWRA 4L3JA 4FL2A 4FOBA 2X2LA 3IW6A 3BHUA 4F1TA 4FNXA 4ERKA 4ACHA 3NCGA 4FODA 4TWCA 2R3FA 3IQ7A 5CYIA 5BUEA 2ITWA 3W10A 4OTGA 3ZOSA 2RG5A 5IDNA 4UYNA 3U6IA 4YZBA 4M15A 3BZ3A 3E88A 3NIEA 4L42A 2OF4A 4EK4A 1ZMWA 4BI1A 4IE9A 3QQKA 5FDXA 2PVKA 1QL6A 4MBLA 1FPUA 4LMUA 3G51A 4BGHA 3PE1A 4OTPA 2R0UA 2F57A 3QRUA 5FUTA 4X6QC 2H9VA 1TQPA 2W1CA 4UYAA 3WYXA 2HOGA 3UOHA 5HLPA 4FSUA 5H8BA 4NKAA 3Q4ZA 4XRJA 3ZBFA 3TTJA 4V0GB 3VBWA 1GJOA 2A0CX 5EYKA 5M08A 1H25A 4JBOA 2ZB0A 3KF4A 3Q9XA 3TTIA 4EJNA 3QD4A 2ITTA 3F88A 5J95A 3RHXA 3MJ1A 4YTCA 4EOPA 2ETMA 4QP7A 3ZMMA 4U3YA 4IAIA 1OL7A 3FY2A 3EHAA 1WMKA 4PTCA 4FSYA 4O21A 4RJ7A 5IEYA 1DM2A 4JL9A 2XYNA 2JKKA 3HRBA 3BEGA 3WZEA 5I9VA 2ITUA 2CHLA 2WD1A 4AE6A 5F20A 4BGGA 2HXQA 1ZMUA 3V5LA 3OXIA 1H0WA 3LCKA 2WIHA 3UJGA 5I4NA 3PSCA 4FKSA 4BBFA 2W06A 2G1TA 1UV5A 1OL6A 1PMVA 1Q8YA 2W4JA 2X9FA 3COMA 3DKOA 4IJ9A 4TYHB 1HCKA 5AP4A 3UVRA 2P4IA 2OH0E 4DEIA 2CKOA 3D5WA 3R2YA 1ZXEA 4WBBB 4DT9A 3OCTA 4QP6A 3FYJX 2YCSA 5E8VA 3NPCA 3WF7A 2YZLA 3VS6A 2V7OA 2W1GA 5DWRA 3NZ0A 3BIZA 2YITA 3IONA 2ZMCA 2R7IA 3GC8A 5EI2A 2GU8A 3HKOA 1PMEA 1H08A 4I5HA 4D9UA 3MVLA 5CVGA 4UEUA 2QKWB 2YHVA 3DY7A 5DNRA 4FZ7A 4JDIA 3BHVA 1WCCA 3BU6A 4Q2AA 3GNIB 1A48A 2BZJA 4USFA 3NYVA 2ESMA 5CLPA 5BYZA 4XBRA 2I0EA 3UZTA 2JAMA 2ZV9A 3CSVA 4B7TA 1JNKA 2RSVA 4W4XA 4AW2A 2BHEA 3QTWA 3PG3A 4X2JA 4JJRA 2OWBA 3Q3BA 3R1YA 3RVGA 4HYSA 2OXDA 5HQ0A 4YLJA 3R8VA 5CAPA 3C5IA 2NPQA 3TZMA 3OCBA 3RI1A 3UODA 4ZXTA 1GAGA 2UW7A 4UWYA 3CPCA 4TRLA 3NUXA 1O6YA 1H1SA 2C6KA 2JBOA 3I4BA 3MA3A 5A6OA 4E26A 3ORKA 3FI3A 5DA3A 1M52A 3FC1X 4FG7A 4DG0E 4QO9A 3FV8A 4OW8A 1IA9A 3BE9A 5BVEA 3BYVA 2JKMA 4EHEA 2WHBA 3SKCA 4Q5EA 5HIDA 2PU8A 1GIHA 4LL0A 3PSBA 4FKJA 2WFYA 2Z02A 3ZDUA 3F2RA 4E8AA 2B7AA 1NT2A 4IJPA 4HVHA 4LGHA 4D2WA 3SXSA 4XG2A 3TIZA 1Q97A 4P4CA 2XIZA 4DFZE 3A8XA 3IW8A 2I7QA 4TNBA 1TKIA 3OD6X 3DB6A 4FEQA 1QPJA 2QOLA 4O22A 2G9XA 3VS3A 1FMOE 3NUUA 5LJJA 3OW4A 3FWQA 5EM6A 4ALVA 3F3VA 5AR3A 3QCQA 2ZVAA 4PDPA 3VVHA 4OAVB 4LRKA 4R5YA 5B2MA 3LMGA 1GZ8A 1FVTA 1BI8A 1U54B 2A4LA 2UUEA 3IW4A 3EQRA 1YDRE 4AN2A 4M12A 5IQEA 5J9YA 3IW5A 4EJ7A 3H9RA 3C4FA 2JFMA 4IM2A 2QR8A 4WG5A 3QCXA 2YABA 3V5TA 2UW3A 3JY0A 4FUXA 4IWOA 4L43A 4OT6A 4UZDA 5HTCA 3EN6A 3BV2A 3QTQA 2WTVA 3TUBA 3GCPA 4QMXA 4LG4A 1MRUA 1J7IA 1YXUA 3A7FA 3PVGA 3MVJA 4O96A 4MXZA 3CC6A 1RDQE 4LL5A 5ANGA 3DAKA 3PVBA 3WIGA 3BV3A 5KZ0A 4BCJA 4C38A 4RA5A 4JXFA 3DJ7A 4GSBA 2R7BA 2VGPA 3I7BA 3GI3A 2J6MA 1MRYA 2VTTA 4LOQA 5H2UA 1FINA 2BMCA 4H3BA 1UWJA 2XBJA 5E90A 3MW1A 3S1HA 4JDKA 3BRBA 2WGJA 3N4UA 4GRBA 4F7NA 5AA8A 4ZTMA 2WMXA 3VJOA 2XB7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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