2WKMA

X-ray structure of pha-00665752 bound to the kinase domain of c-met
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
286
structure length
286
Chain Sequence
NPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDNDGKKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Structure Based Drug Design of Crizotinib (Pf-02341066), a Potent and Selective Dual Inhibitor of Mesenchymal-Epithelial Transition Factor (C-met) Kinase and Anaplastic Lymphoma Kinase (Alk).
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEPATOCYTE GROWTH FACTOR RECEPTOR
total genus 93
structure length 286
sequence length 286
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2009-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2wkmA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2wkmA01
3M11A 3ZO3A 4FNZA 1Q97A 3KVXA 3GT8A 2O8YA 3O2MA 3BYUA 5GINE 4L68A 2UZVA 5EW3A 1FBNA 4L46A 3R7IA 2XIZA 2OWBA 1VR2A 1YI6A 3IW5A 4YZDA 5AV1A 3RKBA 4CT1A 2PK9A 4DHFA 4JI9A 4D2VA 4F9CA 5A14A 4FG7A 3HRCA 4IAAA 5IMXA 4GKHA 4M69A 3N4TA 5FDXA 4FV3A 1U5QA 2FUMA 2W9FB 4KWPA 4R3PA 4YJVA 2QONA 5CANA 4GT5A 4O96A 5A6NA 4ACDA 1OPKA 4NCTC 4QQJA 4DH5A 2YFXA 4ASZA 5H8GA 5HLNA 5AUZA 2P2IA 4BTFA 1O6LA 1P14A 3E64A 3GCPA 1Q8ZA 3LW0A 4RRVA 2HWPA 5M4FA 2G1TA 3HDNA 5JGAA 2V22A 4OTGA 5A6OA 5I9VA 1GIJA 3P7CA 4BWXA 3Q6WA 1KE8A 3R7UA 2Y7JA 3D2IA 5AFVA 4X7QA 2WHBA 4Y72A 5F1ZA 3LCTA 3HV4A 1DI9A 4EZ7A 5C01A 4YSJA 4E8AA 1S9JA 4IVBA 4O6LA 2F57A 4JVGA 2YIYA 5DHJA 5T68A 2GS6A 4BCPA 4IXPA 4Z3VA 5ETIA 5LQFA 4MXYA 3EN6A 3VW6A 3P79A 4KIKB 3TG1A 3VUDA 1YXXA 3OCTA 3HECA 4C4EA 4R5YA 4C34A 4EH8A 3QCQA 3TJDA 2BRBA 2I0VA 2IVVA 4R6VA 5FGKA 3VUHA 4RJ4A 3QXPA 4FYOA 3QU0A 1ZYDA 3D5XA 4M67A 4U79A 1GOLA 4JBQA 3VBVA 2O64A 3QUPA 4K18A 4MVFA 4TWCA 4UWYA 5TR6A 3U9NA 3C0IA 4IACA 4BR3A 5CNNA 5FEEA 1SMHA 2CN5A 3HUBA 3FZPA 3V6RA 3QYZA 1OVEA 3LE6A 5HIBA 5ACKA 4FT7A 3P23A 3BWFA 3GCSA 5K5NA 4BGGA 5M44A 4OLIA 1J7UA 5D12A 3NNWA 5AAFA 3R73A 2WEVA 4LMNA 4DEBA 2QO7A 2XYNA 3L9NA 4NZWB 3BRBA 3MPAA 5HCYA 3FPQA 1XH8A 3ZLSA 2W17A 4O7RA 2OK1A 1IG1A 3DJ7A 1OL5A 4IM2A 4UY9A 4KS7A 2F2UA 1OKYA 1SYKA 4JDKA 4RFZA 4X6RA 1SVHA 4KS8A 1EH4A 4YU2A 3U6HA 3HLLA 2WTWA 3ZMMA 4N6ZA 2ITVA 3DNDA 3R02A 4L3LA 3UG1A 1PRYA 3MVMA 3RK7A 5KMKA 4YJOA 2PMNX 3A99A 2QO9A 4TT7A 3SXFA 1XH5A 3FZSA 4YMJA 3RBWA 5DEYA 3P5KA 2X7GA 5J1WA 2ETRA 4A9UA 5A9UA 2C0OA 3RPYA 2UZOA 3PY0A 4DEDA 4PL3A 2GQSA 4O81A 3PE2A 3NNUA 3OOMA 4BDBA 4JAJA 2XKEA 3QKKA 1V1KA 4FE2A 4TTHB 2I0HA 3A7FA 1JQHA 4PPAA 5JZNA 1LEWA 5AP3A 5G6VA 2IPXA 2PULA 1YI3A 3FC2A 4O7NA 3UZPA 4YJSA 2HWOA 3VRZA 3D2KA 3RHXA 3KU2A 2YWVA 4AFJA 4FG8A 3R8UA 3RVGA 4S30A 4EOMA 5EFQA 5I3OA 3V8WA 3ZCLA 3FPMA 4XEYA 5AX3A 3PXRA 4IFGA 3QL8A 2PVKA 3Q32A 3PIXA 4J97A 1JAMA 2VWUA 4GU9A 2FYSA 4WA9A 1OECA 4YJPA 4UMRA 1H0WA 3C4EA 4K8AA 4AGWA 4DFXE 3DQWA 4RIOA 4Y83A 5F20A 3DT1A 3QRKA 3TUDA 4RJ8A 5L2QA 3W2QA 5HU9A 4ALVA 5KBQA 1H8FA 2OJ9A 4YPDA 3P0MA 4H36A 5HICA 2H6DA 1ATPE 4C02A 2HW6A 2R7IA 4X3JA 3A7HA 3LM0A 2PUUA 4FKQA 2YCQA 5GIOE 1U59A 2VTJA 4H3BA 4O0UA 1OL6A 1STCE 4C36A 1WBOA 5A4CA 4EK5A 3BELA 1Q61A 1NA7A 1G3NA 5IUHA 2OIDA 3KXXA 5CU3A 4UMPA 1JSVA 3OROA 4QNAA 4EOIA 3DKOA 3SQQA 3MFRA 3TV4A 3V51A 3EQDA 4FZFB 4L9IA 3WZDA 2XKDA 3SRVA 4FX3A 2E2BA 4HGTA 4HZRA 1JPAA 5BMSA 3BYSA 3ODYX 5IA3A 4BZDA 4IE9A 2YACA 3TT0A 5CSXA 3NW6A 4J98A 2GSFA 1R0EA 2YN8A 3QUEA 5F94A 1L3RE 2R7BA 3QLFA 2ZV9A 1QPCA 3VC4A 5B0XA 2VGOA 3W8LA 3NUYA 1XH7A 2XM8A 2XB7A 3G0FA 3JPVA 3DCVA 3W2RA 2ETMA 3F66A 4CZTA 2Q83A 3R1YA 4FICA 3II5A 4EC9A 3FZ1A 5GJGA 3GU5A 4XV9A 4WD5A 3HAMA 1QL6A 4BCKA 4BTJA 4DG0E 2C5YA 3NAXA 3FWQA 4WNMA 1ZMUA 4FZ6A 3OEZA 4FG9A 2OFUA 4ZK5A 2ACXA 3UOLA 2ZOQA 3ZTXA 4EQUA 4M15A 5K5XA 3EZRA 4E7WA 2GNIA 3DU8A 2R3NA 4V05A 4C8BA 4UB7A 3HMIA 2WMQA 5L2TA 3K54A 2C3KA 5IQHA 2VD5A 4LGGA 3GFWA 2Y8OA 3CJFA 3UG2A 5CQWA 2JKMA 4FV9A 3VW8A 2C69A 2GNHA 3RM7A 4MQ2A 3CBLA 3TCPA 4BGQA 1JSUA 3NDMA 3BQCA 4R3RA 2BZKB 2P4IA 3QQFA 3R7EA 5CAPA 4FOBA 4RVLA 3WF9A 1J1BA 4FTRA 4RVKA 4F1TA 3VS3A 4ZZNA 3F3WA 2OGVA 2JEDA 3ETAA 4ZSAA 3G6HA 4KBKA 3UVRA 2UZNA 4UEUA 4FTMA 2JDVA 2VAGA 3OEFX 3WIKA 4UWBA 4F4PA 5DE2A 5LVNA 2OJIA 4GUBA 1OBGA 2WZJA 3O8PA 3QCXA 3RPVA 3I60A 4D1SA 2C3JA 4D1ZA 4DG3E 5LCKA 5CS6A 5CEIA 2W1CA 2RG5A 3ITZA 3TV7A 5ICPA 3PDTA 3Q04A 5EYMA 2YM3A 4S34A 3W2OA 4WT6A 3BHVA 2HENA 3N4VA 3GUBA 4YGAA 4LV8A 3PPJA 4TXCA 5FP6A 2ZM4A 5ITAA 2XJ2A 3OCSA 3EQRA 3Q53A 4J95A 4KKHA 2PTKA 3R00A 4GEOA 3ZO1A 2WQNA 4FMQA 4RX8A 4FSMA 2WIPA 3A8XA 2IG7A 5JGDA 3FEGA 2KTYA 4DN5A 2PPQA 3TNIA 2UVXA 1CKPA 3I7CA 1OB3A 5HOAA 3MGYA 3PY3A 1JKLA 3NWWA 5AUYA 4FSWA 5GZ9A 3NNVA 5J95A 4BCFA 1ZYLA 3RCJA 4BY9E 3HRBA 5HX6A 2ZB1A 4GSBA 2ITTA 4U40A 4YHJA 3NUXA 2B9FA 1E1XA 2V7AA 4TPTA 2GFCA 4EWHA 2O3PA 3FQHA 3ATTA 3CTQA 4LOOA 5E8UA 5BVDA 1APME 4C3FA 4DGOA 5LJJA 3AT3A 5E90A 1ZWSA 3B8RA 3ULZA 3MY1A 2H34A 4KNBA 4AXAA 4O84A 4WSQA 5CASA 3DDQA 4U42A 5CAOA 4UMQA 4KIOA 3FLQA 3PSBA 4WBOA 4RWLA 3KC3A 4I1ZA 2BRNA 2HXLA 4BDAA 2YEXA 4FODA 4W9XA 5HTCA 3BYOA 4R78A 2O5KA 4EHGA 3QQHA 5DGZA 2GS2A 3QRUA 3R01A 4I6HA 2XBAA 3F3TA 4IAYA 1ZYCA 5A4EA 4J71A 4CG9A 3CGFA 5CNOA 5IEXA 2W99B 5JMSA 5DRBA 2GDOA 4YZ9A 1B6CB 1MQ4A 3FMDA 5JT2A 4YTFA 2WMTA 1OM1A 2C5VA 3G15A 3FJQE 5HE0A 5JFWA 4ZTHA 3RPRA 5JQ8A 4RIXA 3OY1A 4NM3A 4BCHA 3HV6A 4G3DA 2XNNA 4S2ZA 4YNOA 4DT8A 5BUEA 2VTSA 3R7OA 4TWOA 5K4IA 4AAAA 2IZSA 5GZAA 4CFNA 2OJJA 5FEDA 4MNEB 4QPMA 4DG2E 4EI4A 3ZYAA 3H10A 1JLUE 2YDIA 2QURA 1X8BA 3IGOA 4ZP5A 1XH6A 5KMIA 4NYEA 1W82A 4Q9ZA 2BTRA 5F95A 4EYJA 3FLWA 3GCVA 4YSMA 3PJ1A 4CFVA 4G5PA 3DBCA 4IW0A 3P7AA 5BYZA 4J8NA 4NW5A 3BU6A 4ZTLA 5CVHA 2C6OA 3QHWA 4U80A 4X3FA 3TDWA 3FLZA 4JXFA 4D5KA 4C4GA 4PX6A 5IUIA 3EL7A 5LVMA 3I0OA 4CVAA 3P08A 2VNYA 5IEYA 5JK3A 5M56A 1YKRA 4QYFA 3QTIA 3SA0A 2EXEA 1P4FA 2QU6A 5M06A 4TRLA 2VTPA 3UTOA 4L7SA 4Q9SA 3V8TA 4JG8A 4EHVA 1AGWA 4JJRA 3R7GA 4QMZA 5ANIA 5EQPA 4FGBA 5AA9A 4I0TA 4P2KA 3B2WA 3UO5A 4PDOA 1H25A 2G2HA 2GTMA 3IQ7A 3ZBFA 5FRIA 4FNYA 3UPXA 1T45A 3V8SA 2JLDA 2C47A 3MFTA 4YTHA 4ZTNA 2Y6MA 2YAAA 3MA6A 4OTPA 5ANKA 5IA2A 3TZ8A 2YLEA 3OUNB 1ZZ2A 2PVLA 2SRCA 3NYXA 3QKLA 4RZWA 4YPSA 4OAVB 3WF8A 3G5DA 4IB1A 3ZUTA 4C37A 4TL0A 1WBWA 2BAQA 3NVMB 1WAKA 2VZ6A 2F4JA 2O63A 4TYIA 2WO6A 4KUJA 5ETFA 3VIDA 1V0BA 3CPCA 4G9RA 4K1BA 3RALA 4G3EA 4HCVA 4BFMA 2WTJA 3WE8A 4PDSA 3AT2A 3F5XA 4M7IA 4ZZOA 3O7LD 5HNGA 3U87A 2AYPA 3QHRA 2IO6A 5FBNC 2PVJA 2QOCA 4E5BA 4RA5A 3EYHA 4BGHA 4JIKA 2A2AA 2F2CB 2ITPA 3KF4A 5IZFA 4ANNA 3S00A 2UW0A 2I7QA 4XJ0A 3LFFA 1PYEA 5DT4A 4AZWA 4CCUA 1GIHA 1XBAA 2XK3A 3F5PA 3NUUA 4PP9A 3BHTA 3U9CA 4XP0A 5GIPE 2PZIA 4PV0A 5KE0A 3PJ3A 5CU6A 1WFCA 3QGYA 5EW8A 3EHAA 4IZ5A 2J0JA 5CZIA 2YAKA 4TW9A 4AE9A 1FMOE 5IPJA 4P7EA 3U54A 2WEIA 2HZNA 2YITA 1OIUA 3D7TB 3ZLYA 5HQ0A 3ZBXA 4F1MA 5BYLA 4TYHA 2J2IB 3DY7A 4WG3A 3FC1X 3LIJA 4BHZA 3POOA 2W5AA 1RDQE 3VO3A 4AE6A 4CV9A 3C4FA 3WILA 4XG2A 3MH0A 5IQCA 4FL2A 4YBJA 4BTKA 3TTIA 1GAGA 2OJGA 4QT1A 4YTIA 4O6EA 4ASDA 3JR1A 3PA4A 4NIFB 5LCJA 3F3ZA 4WG4A 4BKYA 4X2GA 2B54A 2GHLA 4GFMA 5IQAA 3HEGA 2BKKA 2GTNA 3QZHA 4HGLA 4F64A 5HBJA 2CGXA 3DQXA 1IAJA 4PDPA 1PXOA 1BL7A 1FOTA 2HYYA 4E6AA 3PRFA 3CY2A 3DBDA 3R63A 3FKLA 3PZEA 3S2PA 2REIA 3FI8A 2XIYA 2UW8A 3ORMA 4A9SA 2W9ZB 4F6WA 5JFXA 3UO6A 3HX4A 5AR8A 2BUJA 3RWPA 3EB0A 3K2LA 4FV5A 5J9LA 2DUVA 5AP1A 2R3PA 4J8MA 3F69A 3PXKA 2XCHA 3DAJA 3H9OA 4QYEA 5CEOA 4XRLA 4FL3A 1OI9A 5KNJA 5HTBA 5IF1A 4MXCA 5FTGA 2HOGA 4HVIA 1YWVA 4MX9A 3PVBA 5TOZA 3FMHA 5A4TA 1P2AA 4IC8A 3QQLA 1NXKA 4RC3A 1PXJA 1AD5A 3D9VA 2C6DA 4ASXA 4E73A 2YISA 2BMCA 1VZOA 3MPMA 4E5AX 4EL9A 3MVJA 3EQHA 4XYFA 2BROA 2J6MA 5C8NA 1YDTE 3EL8A 2QOKA 3PXZA 1SVEA 5CVFA 5HO6A 3COKA 4K33A 5HU3A 4K0YA 3COIA 3Q3BA 3HVCA 3EQIA 2HY0A 3VBTA 3FLSA 4NFMA 4RX7A 3W1FA 4U41A 4RQVA 3Q2MA 5C8MA 3QLGA 3BE2A 5A46A 3BEGA 3HL7A 2DWBA 2Q0NA 4MF1A 3UGCA 3FZOA 2B9IA 2R4BA 3BKBA 3U4WA 2WMAA 1YDRE 5IH5A 2RSVA 2R3JA 3RZBA 4FEUA 3OCBA 5FUTA 3LLTA 1XH4A 2PMIA 3GU8A 4BHNA 4DFUA 3OW3A 2UZBA 2WOTA 2FSMX 5M4UA 2BPMA 4I94A 3KA0A 2X2KA 2R3LA 3PXYA 3VBYA 4O7SA 2OO8X 4JBPA 3D15A 2ZJWA 3MH3A 3IDCA 3PJ2A 2G2FA 3HA8A 3CC6A 4G3GA 4NW6A 4C3PA 4CZUA 4F0FA 4S32A 3O0GA 3W55A 4FTIA 2BTSA 2IZUA 5HVJA 5KMOA 3NLBA 2F7XE 2P3GX 5IQBA 4DBNA 1M14A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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