4L44A

Crystal structures of human p70s6k1-t389a (form ii)
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
337
structure length
321
Chain Sequence
RGPEKIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAMIVRNAKDTAHTKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESIHHTFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPLLQSEEDVSQDSKFTRQTSESANQVFLGFAYVAPS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of S6K1 provide insights into the regulation mechanism of S6K1 by the hydrophobic motif
pubmed doi rcsb
molecule keywords RPS6KB1 protein
total genus 88
structure length 321
sequence length 337
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4l44A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4l44A01
2WHBA 2HZ4A 1JSTA 3GGFA 4R5YA 4DFBA 5JQ8A 2ZMDA 1FPUA 2W06A 4ZZMA 2QOQA 3BWJA 4L00A 1Q61A 1UU3A 2WU6A 4PTGA 4BKZA 4U0IA 5ANDA 4B8LA 3QKMA 2GHLA 5CASA 2Z7RA 2P55A 1WMKA 4FSMA 3H9FA 4GVJA 4IE9A 4JAIA 5DR2A 3PE2A 1Q8TA 3M2WA 5AR7A 4LG4A 3BWFA 1IRKA 4K11A 1I09A 4DCEA 4EH4A 3PLAE 3MPAA 4PMSA 4MF1A 4UYNA 4E6AA 4FTKA 3D7TB 3NUPA 2YWVA 4D0XA 4FYNA 1KV1A 4GT3A 3R83A 3EL7A 4UMTA 5EK7A 3ANQA 5KHWA 3FXXA 4FTUA 1UVRA 4AOIA 4FX3A 4ZAUA 3EQBA 5FUTA 1M7NA 4LV5A 2WTIA 3UYSA 3QKKA 5BYLA 2JDRA 1YHSA 3G33A 3L1SA 5HVKA 5I3OA 3OWLA 4F0IA 5L3AA 3FZ1A 4DFYA 2NRYA 5CT0A 2HZIA 3IW6A 5IQGA 2HWOA 2A0CX 4XG9A 4DTKA 4AZEA 3ZMMA 2GNLA 4IM3A 2HOGA 3ALNA 3VS1A 3O50A 3C51A 3PIXA 1S9IA 2H6DA 4X2KA 4UEUA 4V0GB 3FXZA 3UQGA 5IUHA 5KMNA 2QOCA 4FICA 3TI1A 4MBJA 1GY3A 3OVVA 5CU6A 3ZEPA 5E8TA 1J91A 2PUPA 3TIYA 3DKGA 3BE2A 3FAAA 3HGKA 1ZYSA 3KMMA 3QTRA 4IVCA 1U54B 5LARA 5BVFA 2YIRA 2WQNA 3UTOA 5JGBA 3FQSA 4RIXA 1LUFA 2I40A 3D5VA 3SKCA 3SV0A 4AXAA 4IAIA 4RJ3A 1ZWSA 4WHZA 5HOAA 4F9WA 2GNGA 2QU5A 4ZS4A 3GU5A 4G5JA 5DLSA 2OLCA 5AEPA 3SXRA 3UODA 3HECA 1V0PA 2WMWA 3M1SA 1H27A 1A9UA 3ORLA 4FK3A 2R5TA 4ZIMA 5CWZA 4O81A 3EFJA 4JG7A 3CIKA 4DE4A 5TR6A 1W98A 3VUDA 4OTRA 5E7RA 4DFZE 2VTLA 4EWQA 4D4RA 4AN3A 3NUYA 2QOHA 3HV4A 3QYWA 3Q60A 4Y5QA 3MBLA 5AUZA 5FXSA 3SD0A 3ZCLA 2PL0A 1H28A 4WG5A 4CT1A 4NEUA 1H1WA 1FGIA 3LCOA 2PVJA 2QOOA 3LXNA 2CSNA 3GC8A 4M66A 2IZUA 2J90A 4BDEA 5L2WA 5FDPA 3IDCA 1H24A 1H8FA 4ASXA 2W1EA 3OCSA 5DN3A 4I4FA 3OY3A 2UVZA 4FSTA 4IB5A 2RL5A 3PSCA 2VTSA 5IA1A 3KN6A 4PWNA 4AN2A 1TKIA 2XNOA 2VWIA 3BYOA 1TQIA 3EH9A 3PUPA 3OCTA 4F9BA 4ZXTA 5HEZA 3L8VA 4AW0A 2C1BA 4FL1A 5IA2A 5ETFA 2H34A 5LJJA 4QMYA 4Y8DA 5KKRB 4PDPA 2OF2A 2UZUE 4M84A 4YJVA 3VHKA 2W9ZB 3E8CA 4JIAA 3S95A 3QTZA 4R1VA 5CEMA 1Q8ZA 4ZSAA 5I3RA 1K2PA 3ZH8A 3ELJA 4QP7A 3WZJA 4HVHA 4TRLA 5DNRA 5JGDA 3BZ3A 2B52A 2EXCX 4RC4A 4EC8A 3UNKA 1ERKA 5ANKA 3K2LA 4HCTA 4ALWA 5CEKA 2ZM4A 3OTUA 1OB3A 1U5RA 4FV7A 4TZRA 5FWKK 5EKNA 3ZEWA 4DLJA 3BBTB 2BFYA 3CGOA 3G51A 3R1SA 5L2QA 4G1WA 4BZDA 1WVYA 5HX8A 3ZLYA 2Q83A 3QTIA 5M4CA 2F7XE 3R6XA 1F3MC 4W4VA 4HPTE 3B8RA 3VBQA 3V8WA 2J0KA 2UW7A 3P9JA 3R01A 4XJ0A 5AP6A 5EM8A 5A4QA 3LFSA 3OUKA 4E26A 3HRBA 4QYHA 3VF8A 3VS5A 2QG7A 4DN5A 3N51A 3A4PA 1WVXA 3C4ZA 3D7ZA 4EOMA 1YI6A 3POZA 4O83A 4XG6A 2UW9A 2BIYA 2IO6A 3IW8A 1OKVA 4ZMEA 4TYGA 2C6KA 2XM9A 1R39A 4UB7A 4OAUC 3E3BX 3G9LX 3SHEA 5IQCA 1IG1A 4DGLC 2ZB0A 2XK3A 4FNXA 3UIUA 3DQXA 3RAIA 4C0TA 2QR8A 3PJ3A 1Y8GA 5FBOA 5L8JA 2AUHA 4PY1A 4BICA 3CPCA 4YR8A 2OXDA 2X4FA 2QCSA 3KL8A 3THBA 3FWQA 4FT3A 3FV8A 2IW8A 3COHA 2F2UA 3Q4UA 3QXOA 4ITHA 4C33A 2NO3A 5EYMA 4EQMA 1A48A 2WPAA 4QMTA 2ZM1A 5K9IA 2VX1A 4EOOA 2BRMA 3KMWA 2XIKA 3FQHA 5IKWA 4XG3A 5HBHA 4E93A 1P5EA 3E8EA 4PTCA 1E1VA 3PZHA 1PMEA 1NW1A 3MJ1A 4I3ZA 5DWRA 3DKCA 2VWVA 3IQ7A 1QPJA 4FYOA 4G6OA 3ZC5A 2YERA 2PE2A 5CEIA 2B7AA 4P5QA 3OCGA 2HENA 1IAJA 4CGAA 4ZP5A 3TNQB 2VTNA 5BUEA 1YXSA 4MXCA 4RMZA 3W16A 2F7ZE 2PK9A 3CP9A 5DT4A 2VTPA 4FNZA 1H4LA 4YPSA 3TJCA 4UMRA 4WA9A 2GMXA 4IXPA 4LM5A 3GQIA 1GJOA 5F1ZA 4KIKA 2UW5A 4NU1A 2VGPA 2PVKA 4IACA 4U3YA 5J9ZA 1STCE 1T46A 3I0QA 3D5UA 4BDAA 4C4FA 2Q0BA 2A4LA 2E2BA 3T9TA 1Y8YA 4C61A 3MVJA 3PVUA 3TKIA 5IA3A 4YBKA 2ITYA 4ZY5A 4XX9A 2OJ9A 4IB3A 4ZLOA 4QMNA 2G2FA 2CKEA 3JYAA 4TXCA 1WBNA 5HX6A 4PMTA 5D7AA 2GS7A 1OPLA 4UXQA 3Q6WA 4S32A 3HRCA 5KMJA 2WMXA 4XG4A 1U46A 1LPUA 3HVCA 4IAFA 2ITWA 3F3WA 3QTQA 5M4IA 3ZXZA 4DEGA 2OZOA 4M15A 3OD6X 4R6VA 3NIZA 1OPKA 5JH6A 2W5BA 4D2SA 4X3JA 3LE6A 4HYHA 5AR3A 4XP3A 4AZVA 5K4IA 4IC8A 4YTHA 4EBVA 2Z02A 3EN7A 4FKLA 4D5HA 1J7UA 2QONA 4BI2A 4DLIA 4FUXA 4JQ8A 5J5TA 4JL9A 1XH8A 2OJIA 4EUTA 3DB8A 4O7WA 3LLTA 4O96A 2OWBA 1BKXA 2Y8OA 4HZSA 3IO7A 4RX5A 4XNEA 4RLKA 3E3PA 3MA6A 1PXJA 4A9YA 4BCGA 1EH4A 3D2KA 1KSWA 2GTNA 2QQ7A 3VW6A 5LVPA 4RWJA 2A1AB 3ZRKA 1JQHA 3V8SA 5KNJA 1Q8UA 1B6CB 2AYPA 2J0LA 2VRXA 4EKLA 2ZJWA 3KK8A 1YRPA 2PVNA 4N6YA 4BI0A 4BCHA 2ERZE 4CD0A 3AGMA 5LMKC 2GCDA 4AAAA 4QTEA 4BFMA 2GNFA 4U79A 5AUYA 4C8BA 5L4QA 3LMHA 5EM7A 4DEDA 4YZDA 5FRIA 4D2PA 4TYIA 3C7QA 4LL5A 4IANA 4IX5A 5E8SA 4F7LA 1OUKA 2HZ0A 5HGIA 4GKHA 2P2IA 3U6JA 5KE0A 4Z7GA 1ZY5A 3NNUA 4I20A 5HICA 5EW9A 3SXSA 4WG4A 1UWHA 2VWWA 4W4XA 3BE9A 2PE0A 2WKMA 4GT4A 4BVUA 2ETRA 3MH0A 3TM0A 3KRWA 3U6IA 4FTRA 3LFDA 3ZU7A 2XA4A 4OT5A 5AAEA 3HUBA 4DH5A 5IUGA 3M42A 3FLSA 3L8SA 4OAVB 2Z8CA 5HG8A 4AF3A 4ZSGA 4I22A 3QD4A 2QO7A 3PFQA 3BYUA 4CCUA 3QAME 2CGWA 2GHGA 5BYYA 5HU9A 3BEAA 3Q9XA 4R7BA 2X2LA 4GK4A 4A4XA 3KRLA 5A14A 1ZAOA 3UMWA 4W4YA 1P2AA 1RW8A 3GCPA 5DA3A 4EOJA 5EOLA 1H1PA 4XV9A 4G6NA 1CDKA 5HD4A 2W1CA 2BAJA 3AD6A 4I4EA 5AP5A 4ZY6A 3PJCA 2PUNA 5IQAA 3AC3A 3ZUVA 5HQ0A 2ETMA 4EORA 4JRVA 3JY9A 3FPQA 4ZS0A 3QZFA 1DAWA 1H01A 4OTGA 4AGWA 5B7VA 1WBVA 2RF9A 3F6XA 2W1GA 4YJUA 2B53A 4MXOA 4GS6A 3MN3A 4FV1A 4IVDA 4HGTA 4WRGA 4PF4A 2WTDA 1QL6A 2C4GA 4W9WA 1JAMA 3CQWA 4FKIA 4O7YA 1XO2B 4K0YA 4NJ3A 3UIMA 4EYMA 2W4JA 3BYMA 4IDVA 4AT3A 4UX9A 4DBXA 3N4UA 2VO6A 2IVSA 2PE1A 5ANOA 2BTRA 2YHVA 3AT4A 4L42A 3R8PA 4TWCA 2HW6A 4TYEA 3TTIA 4F70A 2UW0A 3JPVA 4MHAA 3ET7A 2X8IA 3D9VA 3GP0A 1JNKA 1E1XA 3NUUA 2X39A 5K0KA 3FZRA 2WU7A 2LGCA 3Q32A 2J51A 3OWPA 3WI6A 4L7FA 5HNBA 4PL5A 2VD5A 4HCVA 3KVWA 4U7ZA 5DBXA 5AAFA 3V5QA 4GU6A 3EFWA 4EBWA 4G3CA 4IAYA 3AQVA 4U43A 5HLNA 4PMPA 2VN9A 4G3DA 5M55A 2C6TA 4RPVA 3HEGA 5AP4A 1SVHA 2C69A 2BUJA 3A8XA 3DFAA 3QCYA 4FE2A 4Y95A 3R7YA 1LEWA 3MDYA 4GYGA 2P0CA 4TL0A 3PVBA 1ZZLA 3G90X 3I1AA 2XMYA 4OR5A 4XMOA 2PVHA 4PDSA 3HYHA 1UNHA 3BLHA 4WG3A 2LAVA 4MX9A 3CS9A 4YJTA 5AX9A 3DCVA 1YDRE 2B9JA 4CMUA 4O0WA 3EZRA 3ZC6A 4MNEA 2BRNA 3IPHA 3MPMA 3WIKA 4FG9A 3MB7A 3LCSA 4RFYA 3DNDA 2YIQA 2XIYA 4O7TA 2RG6A 3NS9A 4EH2A 3BBWA 4YTCA 2FUMA 4TNDA 2XK6A 3Q3BA 4CSVA 3TZ8A 4MD8E 4QNYA 3E93A 3OROA 4C7TA 3TUBA 2XJ0A 3HX4A 3LPBA 4V05A 5CY3A 5CANA 2R3JA 4HOKA 4KIOA 4BHNA 4KS7A 3VS7A 4K2RA 2XBJA 3PY0A 3F3UA 4PPAA 3RWPA 3V5TA 4F64A 4BIDA 3ZXTA 4EZ5A 5B2MA 2JGZA 4XG7A 3TG1A 2XNGA 3DY7A 2CGVA 2W99B 3NAXA 3BELA 3POOA 4JDJA 4WNKA 5KBRA 3Q4ZA 5M06A 2XNNA 3RAHA 2O65A 3KQ7A 4GUEA 3W1FA 3VUTA 2XK7A 4RWKA 1VR2A 3RINA 3WF9A 1GIIA 3F9NA 3L9PA 2CPKE 4FSRA 4O6LA 1W83A 2XKDA 2PMOX 2WOTA 3EQRA 3K3IA 2UUEA 4U97A 2C6IA 4BZOA 5I9ZA 5E8UA 2O5KA 4RC3A 4M13A 3IK3A 3TL8A 4FEUA 4A06A 2H96A 2I0EA 4ITIA 3R7EA 3A99A 3KREA 3D4QA 3QD2B 5EQYA 4RC2A 1ATPE 2HAKA 4EQCA 2W1FA 3IDBA 4J52A 3QRKA 4X6RA 3DJ7A 3RAKA 3QTSA 3AXWA 1MRUA 4FV0A 4G34A 3N4TA 4UWBA 1KE9A 3VWAA 3GU6A 5DOSA 5AP1A 4GG7A 1F0QA 2HXLA 2GS2A 4LMNA 4LGDA 4ZTNA 3Q5ZA 2VO0A 3S1HA 4YZ9A 4YLKA 3Q53A 5J5SA 2JAVA 1SMHA 1ZARA 5CVGA 3UOJA 5FG8A 4L7SA 4ID7A 4L52A 5CU4A 4ZSLA 4AP7A 3GFWA 4LMUA 2XNPA 1IEPA 1M7QA 3ZOSA 5IPJA 4NYEA 4CFWA 4YGAA 3FL4A 3VAPA 2W7XA 4GU9A 3KK9A 5FM3A 3VQUA 4ACCA 2J5EA 4MWIA 3DAKA 3QXPA 3F3TA 1XKKA 3ZRMA 2WAJA 3R9HA 5CVFA 5HTIA 5CEPA 1PW2A 4B8MA 5JK3A 2YJRA 2I6LA 4KRDA 3R9RA 3OT8A 3NUSA 5ITAA 3HKOA 2PU8A 3AGLA 4KD1A 4ZTLA 2BMCA 3BLQA 4X7QA 5JFWA 2BR1A 2ITVA 3F66A 4QP3A 1G3NA 3OEZA 1QPDA 3EN5A 4X6QC 4BIBA 3NW6A 4EK6A 5ETAA 2V55A 1ND4A 1PYXA 1ZOEA 3C0HA 3OBJA 5F20A 3EYGA 4USDA 2VWYA 3ERKA 4EUUA 4NT4A 2CLQA 3TXOA 4C36A 3R8VA 5T3QA 4IDTA 1UKHA 2WMSA 4BDDA 4BIEA 3UO5A 3F2NA 2YCFA 2ITPA 2C3KA 2A2AA 3G6GA 4I6FA 4FMQA 5TKDA 3RJCA 4BCPA 5BUIA 3OC1A 3CLYA 4FSNA 3SXFA 1NVRA 5K0XA 3P5KA 5IQBA 4ZY4A 4XG2A 2XH5A 1FVRA 1G8AA 2XEYA 2YABA 4E1ZA 2RFSA 3PPZA 4OW8A 4R5SA 5DT0A 2BHHA 4QMOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1JVP P;  4CKR A;  3V01 A;  3KXZ A;  2WIP A;  2BCJ A;  5DVR A;  5EOB A;  5GZ8 A;  5JSM A;  4QQ5 A;  4FKQ A;  1PRY A;  2YIY A;  4R3C A;  3REP A;  1JLU E;  4H3B A;  3PLS A;  3RNI A;  3VS2 A;  3KB7 A;  2CNU A;  3HUC A;  4NKA A;  4YZN A;  3UDB A;  5FM2 A;  3DBF A;  4BDG A;  3LMG A;  3ZSG A;  1ZMU A;  2OI4 X;  3PJ1 A;  5IQE A;  4PMM A;  3IW4 A;  3QAL E;  4MXX A;  3ATS A;  1JKS A;  4O1O A;  4FK6 A;  2GQR A;  4QQT A;  3CQU A;  2VO3 A;  1BLX A;  2GDO A;  3ZRL A;  3A60 A;  3FMJ A;  1O6Y A;  1JKK A;  4LGG A;  4M0Z A;  4DEB A;  2JKQ A;  2XKF A;  4U5J A;  3CY3 A;  2YCQ A;  3HZT A;  4WUA A;  1OIQ A;  1YKR A;  5EH0 A;  1TQP A;  5CNN A;  1Q3D A;  4C57 A;  2VO7 A;  3H10 A;  3PWY A;  3FHI A;  3KC3 A;  1V1K A;  4EH3 A;  3DK3 A;  3OBG A;  3KRJ A;  1WBP A;  5GNK A;  3ORK A;  3U54 A;  1CM8 A;  3PIY A;  3LCT A;  4KRC A;  3ZLX A;  5TO8 A;  4BKY A;  2XK4 A;  1PXK A;  2ITX A;  3NYN A;  5GJF A;  5HO8 A;  4EC9 A;  4QMP A;  4YUQ A;  4FZD B;  1W7H A;  5AV0 A;  3UO4 A;  4WBB B;  4FKS A;  3BKB A;  1YHV A;  2J7T A;  3O71 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WHB A;  2HZ4 A;  1JST A;  3GGF A;  4R5Y A;  4DFB A;  5JQ8 A;  2ZMD A;  1FPU A;  2W06 A;  4ZZM A;  2QOQ A;  3BWJ A;  4L00 A;  1Q61 A;  1UU3 A;  2WU6 A;  4PTG A;  4BKZ A;  4U0I A;  5AND A;  4B8L A;  3QKM A;  2GHL A;  5CAS A;  2Z7R A;  2P55 A;  1WMK A;  4FSM A;  3H9F A;  4GVJ A;  4IE9 A;  4JAI A;  5DR2 A;  3PE2 A;  1Q8T A;  3M2W A;  5AR7 A;  4LG4 A;  3BWF A;  1IRK A;  4K11 A;  1I09 A;  4DCE A;  4EH4 A;  3PLA E;  3MPA A;  4PMS A;  4AXE A;  4MF1 A;  4UYN A;  4E6A A;  4FTK A;  3D7T B;  3NUP A;  2YWV A;  4D0X A;  4FYN A;  1KV1 A;  4GT3 A;  3R83 A;  3EL7 A;  4UMT A;  5EK7 A;  3ANQ A;  5KHW A;  3FXX A;  4FTU A;  1UVR A;  4AOI A;  4FX3 A;  4ZAU A;  3EQB A;  5FUT A;  1M7N A;  4LV5 A;  2WTI A;  3UYS A;  3QKK A;  5BYL A;  2JDR A;  1YHS A;  3G33 A;  3L1S A;  5HVK A;  5I3O A;  3OWL A;  4F0I A;  5L3A A;  3FZ1 A;  4DFY A;  2NRY A;  5CT0 A;  2HZI A;  3IW6 A;  5IQG A;  2HWO A;  2A0C X;  4XG9 A;  4DTK A;  4AZE A;  3ZMM A;  2GNL A;  4IM3 A;  2HOG A;  3ALN A;  3VS1 A;  3O50 A;  3C51 A;  3PIX A;  1S9I A;  2H6D A; 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