2C5OA

Differential binding of inhibitors to active and inactive cdk2 provides insights for drug design
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Differential Binding of Inhibitors to Active and Inactive Cdk2 Provides Insights for Drug Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2005-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2c5oA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2c5oA01
4F7SA 4UMTA 3UE4A 3WZEA 3ORIA 3K5UA 5CU0A 2YIWA 3RPSA 4CRSA 3NSZA 3Q9YA 3WE4A 5DI1A 3BGPA 2VZ6A 3DQXA 4BCOA 4FV0A 3TIYA 1M2RA 3LFCA 4RBLA 3ETAA 2WTJA 2UZOA 3NUSA 4K1BA 5EYCA 3FLQA 4ENXA 3FEGA 4R77A 1KE5A 5CAPA 3Q4ZA 2O64A 5EI6A 3TZ8A 3NNWA 4M69A 1YI3A 3KK8A 2C5OA 4IAIA 1M17A 5IDPA 2XB7A 3P4KA 2W1GA 4NJDA 4WNKA 4DE4A 3IW6A 3MPTA 5AM7A 3VRZA 3G0FA 4GFOA 5KCVA 4YTHA 3E63A 4M3QA 5FBNC 4DEAA 4KUJA 2BHHA 1XH7A 3COHA 5EDRA 4D5HA 1UNGA 2JIVA 3NUYA 3OEFX 4FTKA 5CZIA 3RK7A 2GNLA 2PU8A 4AA5A 4JBQA 3QRUA 5LMKA 4ZZMA 5J1VA 4BTFA 4FL2A 4DTAA 4F1OA 3HAMA 4C02A 3OG7A 2GNIA 4FV9A 3NZ0A 4IZAA 3WF7A 3BEGA 4AA0A 3D5XA 4QMPA 4OBPA 2W4OA 5DT4A 2VRXA 4EUUA 2OH0E 2W1ZA 3NNVA 4JVGA 3OT8A 4BHZA 5HLNA 2X0GA 3N9XA 2WMWA 4TXCA 2GFSA 4BCIA 4O7TA 4I21A 5D10A 4O91A 5HOAA 1OL7A 4X21A 5HTBA 1JPAA 3DZOA 3PRIA 3Q52A 3PDTA 2IW6A 2PMIA 4XV9A 3OXIA 4MKCA 5AUXA 2VWZA 4YO4A 4AOIA 5IQEA 3NR9A 1XH9A 3DGKA 4JR7A 4E3CA 5BX0A 3OWLA 2RG5A 1FVRA 4C3FA 3E7OA 4RA4A 4M67A 5ETAA 3MIAA 3VBVA 4AS0A 5HZNA 4QMNA 3PWYA 4UMRA 4R8QA 4TW9A 3QXOA 3G51A 4J97A 3UP7A 1YXSA 1R1WA 2XS0A 4HGLA 1RQQA 2GMXA 4K11A 1OIYA 2VTNA 3AD5A 2JBPA 5I9VA 3AC5A 3TJCA 3VS4A 2YACA 4C7TA 5CVHA 3TJDA 3LXKA 4D1ZA 3R1YA 2GHLA 2XM9A 5BYZA 3I7CA 2FB8A 3WYYA 4EQCA 4FA2A 2PZPA 1U5RA 3BHTA 3FZSA 3GEQA 4QO9A 3K3JA 3KKVA 2Y4PA 5TKDA 3DT1A 3Q4CA 3NW6A 3QHWA 3ZS5A 4BDCA 3WF6A 2BRNA 4KB8A 4OTQA 2BVAA 5HG7A 4BCQA 3QC9A 2VTLA 3Q5IA 4HGEA 3I1AA 4F08A 5EM6A 3PY0A 1NVSA 3KMWA 1URCA 4USDA 5TF9A 2XK4A 4ANSA 3PXKA 1DAYA 3JVSA 1WVXA 2F7ZE 1Z57A 4JI9A 3NS9A 4LYNA 2C5YA 4BZNA 4JS8A 1KE9A 2OJ9A 3EOCA 5AEPA 3S1HA 4LGGA 3AC2A 2UW8A 5IH4A 3D2KA 4BR3A 2WELA 3MI9A 3NPCA 3QRKA 4L67A 4RVKA 3BYOA 4YZCA 5HHWA 3AMBA 4YJSA 5BVNA 4MEDA 4CZUA 3BHYA 3EQDA 5E8XA 3MY5A 3QKLA 3RALA 3P0MA 2GS2A 3F5UA 5ETIA 1VYZA 4AFEA 4CSVA 3UBDA 5GJGA 1XH8A 3TG1A 3PJ8A 3C1XA 4JRNA 2QOIA 4UXLA 2YCSA 4ZIMA 2I1MA 2KTYA 5I9WA 3QTRA 2ETRA 4FSYA 3TDVA 4BZDA 2VO0A 5HG9A 4LOPA 5E90A 3FLYA 3LMHA 5E4HA 3LMGA 1BI8A 2YM8A 4ANLA 3HMOA 3PVBA 4FKSA 2QR8A 3GC7A 3MVHA 4NFMA 3C9WA 1UU7A 3QKMA 4MBJA 3KXXA 3UG1A 5A4EA 3ZLXA 4CVAA 4X2KA 3D15A 3UZPA 4MWIA 3KULA 1YHWA 3DJ5A 3H9FA 1JKSA 3KY2A 3M1SA 4J7BA 4APPA 4CV8A 4EOMA 2WOTA 5EI2A 2GNGA 3OW4A 2OF2A 5H9BA 4CMUA 4E4XA 4BIEA 2UUEA 4D4SA 3MYGA 3GQIA 3ZO1A 1XH6A 4BDKA 4D9UA 2XKFA 3BWFA 1I09A 1ZMVA 3E8EA 3OF0A 5HTIA 3DKCA 5HICA 2J0KA 5LVOA 5BVFA 4CRLA 2VWIA 1ZOEA 3DKOA 3MA6A 3M2WA 4EHVA 2ITWA 4F0GA 5HX6A 3G0EA 1FQ1B 4DG0E 4LRKA 5AR7A 5L2WA 4NW6A 4JG7A 2EB3A 4D2SA 2ZM1A 4OTGA 5J7HA 3NMUF 3L8PA 1B38A 1TQMA 3WF9A 1CMKE 4GKHA 1VZOA 3BHHA 5IA3A 3GUBA 5A6NA 4RX8A 1ZXEA 3NYXA 5B7VA 2R2PA 2WTVA 5AM6A 4F65A 4LV5A 3IKAA 4DGMA 3C4XA 4PF4A 3KRJA 4OTWA 5A4QA 4XG7A 4GYGA 4O7RA 4JG6A 2BHEA 4QP9A 5DBXA 4ZZNA 2CJMA 4NM3A 1CDKA 4RRVA 2C4GA 5AADA 4CFUA 3QXPA 5BVEA 3PJ1A 1UWHA 2PK9A 1HCLA 3CXWA 4FZAB 1V0PA 4NIFB 4I0TA 3AC8A 4EQMA 4DTKA 5IF1A 4BKJA 2BRHA 3CTJA 4DYMA 3IPHA 3EMGA 3HGKA 3OOMA 4RG0A 2C69A 4EOSA 5FLFA 4ZY5A 4G17A 3TDWA 4I92A 1OPLA 1JOWB 3KC3A 5FXQA 3W2PA 5AFVA 2QR7A 5IQFA 2JKOA 4MNEB 3BYMA 4E6CA 2HZ4A 3E64A 5J8IA 2XK8A 2GU8A 5HBHA 2GQGA 3EWHA 4NUSA 5K5NA 4FVRA 4CKJA 4RWIA 5EK7A 4QMTA 2OW3A 3HDNA 2JAVA 3AC1A 3PSDA 4CGAA 4MHAA 1MUOA 1BMKA 1IA8A 4FV1A 5J87A 5HG8A 3UOLA 3K54A 5FD2A 1BL6A 4Q9ZA 3PE2A 3FL5A 4PTCA 4FT0A 4WSQA 3VUKA 5A4TA 3UNJA 3BYUA 4L3PA 4FSQA 5D41A 3O50A 4EK8A 3GGFA 3DAEA 3GFEA 5AAFA 4O0UA 3K2LA 4FIIA 4I5CA 3A62A 3MPMA 3RP9A 3Q9XA 3BRBA 4OUCA 5K0XA 4S34A 4JDJA 3LLAA 4MVFA 3LAUA 1I44A 4QPSA 4EYJA 1OUKA 1YOLA 2WMVA 3QL8A 4MD8E 4PL3A 3W2CA 3KN6A 2JKQA 4C8BA 2C5XA 2JGZA 3CBLA 5DA3A 5CF8A 4ANMA 1YI6A 4NEUA 3VUIA 3RZBA 1H26A 4V01A 2CGXA 2VTIA 4I23A 3W8QA 5DMZA 2JITA 2YISA 2C6KA 2R3GA 3TZ7A 5CAOA 3NCGA 4I6HA 3F61A 3RAKA 4C58A 4UMPA 3OW3A 4MXCA 3ZONA 3ID6C 4Q9SA 2WTKB 4D9TA 3DTWA 5BYYA 4DT9A 2OBJA 3DB6A 2UZUE 4G3FA 4R6VA 1MQBA 4CT2A 3VW6A 2A1AB 4E5AX 5KKRB 4ACCA 4BDBA 2EB2A 3UQFA 3NAXA 2C6EA 3QD2B 4EH8A 3EJ1A 3F3TA 4AAAA 1ZOHA 4GYIA 3NWWA 4F64A 3TIZA 3R30A 2LGCA 4M66A 3GU4A 4BCPA 3C50A 4G3DA 5C9CA 4AGWA 2YDKA 3MFSA 2IPXA 3LFEA 4Y5QA 3RAIA 1ZZLA 4C37A 3D9VA 1B39A 3Q5ZA 3QQFA 4FTNA 4AT3A 3DBDA 5AP3A 1K2PA 2W1CA 4C2WA 3AQVA 4JR3A 3DTCA 4OTPA 4AOTA 2XYUA 3O8TA 4DLJA 4ERKA 3UNZA 3AOXA 1BYGA 2IVSA 1OL5A 4R1YA 4O0VA 2AC3A 4WG5A 3RINA 4D0WA 3VUMA 4U0IA 1H25A 1H1QA 5DE2A 3THBA 4ZY4A 4O2PA 2VD5A 3OWJA 2YN8A 4BZOA 5AV3A 5LVPA 3WZUA 5A4CA 4AT4A 1X8BA 1W7HA 5AUWA 1A06A 2CGVA 5HG5A 2ZJWA 3W2QA 3W18A 1JWHA 4YJPA 5F20A 2XIXA 2VNYA 4L43A 3OWKA 5EQYA 1O6KA 3TXOA 2O63A 3HZTA 5EH0A 3LFAA 3RKBA 2WU6A 4NM7A 4FZFB 4XV1A 4BKZA 3FLNC 5E8VA 4W4YA 4L3JA 5KE0A 4EH6A 2ITPA 4MCVA 2KULA 4PY1A 4XUFA 5CVFA 4KIKB 5EFQA 3F3VA 5C03A 4CTBA 4CKRA 5C4KA 5JRSA 2ZV7A 5EHOA 4DG2E 1YHVA 4HVHA 5I9YA 5K0KA 3FV8A 5CT0A 4D58A 3EFJA 1SYKA 4AW2A 3H4JA 3P5KA 4Z16A 2HIWA 5FWKK 1UKHA 3MW1A 4MNFA 2B55A 3R8ZA 4E5BA 2ITUA 1V1KA 2R7IA 2XH5A 3FI4A 3C0HA 2YAAA 1LP4A 3HLLA 3LE6A 3QD4A 4I5MA 1WVWA 5FEEA 3DKFA 5HVJA 4CYJA 4O0RA 3FUPA 4P7EA 5CXHA 2W5AA 3ZUVA 2C3LA 3PZEA 1KOAA 1H07A 2WTIA 4PUZA 3ZRLA 1YQJA 4IX4A 4YBJA 2R3KA 4WUNA 3BU5A 5J5SA 5JZJA 4FTCA 4EWQA 4IZ7A 2ETMA 4G3GA 4W4XA 1Q8UA 4XYFA 4DH8A 4QMSA 2P3GX 3ATTA 4FTUA 4C4JA 4EONA 2NPQA 4YSMA 4RSSA 5AR2A 4B7TA 4NH1A 4YLLA 5AWMA 3DZQA 3Q2MA 3RHKA 2R3FA 3IW8A 4NT4A 3ORZA 4BRXA 4I5HA 4O6EA 3FMMA 5G6VA 3RTPA 4JG8A 4QQCA 3ALOA 1Y57A 5FXRA 4IW0A 2BZIB 2FA2A 4QYGA 2RSVA 3NUNA 2BDFA 3BI6A 3KN5A 4DFLA 5HIDA 3G90X 4V05A 3CLYA 4QOXA 2ONLA 3HMMA 1OIQA 4B99A 4ZLOA 4IFGA 3O17A 2YJRA 4UWBA 3ORLA 1OBDA 2G1TA 4ZSEA 2WMBA 2UW7A 4IDTA 3H9OA 1JNKA 3GENA 5K4JA 4UMUA 4DITA 2GTNA 3S3IA 4KKHA 2QU6A 2J5FA 3Q9WA 1ZLTA 4O86A 5M4FA 1Q8TA 1IAHA 2BILB 4FK6A 1WBOA 4O27B 3OEZA 5CU2A 2ITNA 2B53A 3LM5A 4MH7A 2GNJA 3O7LD 4RPVA 1Q24A 3QUDA 3ZM4A 5HTCA 4HJOA 3QX4A 3N51A 3R02A 4BB4A 2AC5A 4AN3A 1PXMA 4M68A 2ZYBA 3MV5A 5AP0A 3ERKA 3FLWA 3HRBA 3Q6WA 5F9EA 2P33A 2Y4IB 2F49A 2BALA 3HMNA 5CS6A 5CEOA 5EHYA 1G3NA 4FV8A 3NDMA 4FKVA 4J52A 3F7ZA 2PVHA 5JRQA 5DT3A 4UMQA 3ZRMA 4LQMA 4D2PA 5K4IA 3U87A 2I0VA 3FKNA 3HECA 1ZZ2A 3AMYA 3PVGA 4YO6A 4BDGA 3DBCA 3QQUA 1H24A 4LM5A 2Z60A 3UZRA 3NIEA 3E8DA 3NYOA 3OMVA 2BTRA 1URWA 2GQSA 3TN8A 4FEWA 4C57A 2H6DA 5CNNA 5JQ5A 2IZSA 2CPKE 1E1XA 3ATSA 3I6WA 2XMYA 3ANQA 2UW9A 4IX6A 4TYHB 1GOLA 5EI8A 3KK9A 1ZYJA 4HYUA 3CE3A 3ZH8A 2BFXA 2F4JA 1ZWSA 1OMWA 3DK7A 4F1TA 4K6ZA 4O83A 4IWPA 1Q8WA 2H34A 3BX5A 2UW0A 3S2PA 3KVXA 3DA6A 4KD1A 1F5QA 4E6QA 3FC2A 2BRBA 1GAGA 4JT3A 4EC9A 3L9MA 3ZXZA 4F63A 3ZSGA 1BUHA 4FSMA 1NVQA 3LHJA 3IECA 3GB2A 3FJQE 3WIKA 2XNPA 4J98A 3C7QA 3EL7A 3HP2A 5CY3A 3EB0A 4S31A 3RWQA 2J90A 3QQGA 5LARA 4N57A 2HY0A 2ZM3A 1VYWA 4U41A 2O2UA 3TZMA 3FI8A 3QZHA 2RKUA 2DUVA 4Z9LA 5DPVA 4BDHA 5IPJA 4C62A 4ZY6A 4OAUC 2H8HA 3R1SA 1PXOA 2XVDA 3FY0A 2OIBA 3TNPC 3DXQA 5CAQA 1XHAA 3JY9A 2I7QA 3R01A 3U6IA 1IASA 2X8EA 5FXSA 3TV6A 3PIXA 3UOHA 4CZTA 4ITHA 4YJNA 5EHLA 3AT3A 3SG9A 4BY9E 2GTMA 4OTIA 5A54A 2XNMA 3GC0A 3SW7A 5HE3A 4DGOA 3QD3A 5TR6A 3BEAA 3JUHA 1UU3A 3CKXA 3E92A 4ZAUA 5L2SA 2EVAA 2ONLC 3UTOA 4IVCA 3HRFA 3KRRA 4XBRA 4ZSJA 5DR2A 3W55A 1Q41A 1RDQE 4MD7E 3EQIA 4PQNA 2VO6A 2YM4A 3PRFA 4RJ3A 5DT0A 4LRJA 3WBLA 4XG3A 4D4VA 4USFA 4EK4A 5L6WL 3L9PA 2ITZA 4E26A 4FV7A 4WA9A 3VULA 4CEGA 3FLZA 2IO6A 5TE0A 1UU8A 1OVEA 4N4SA 2IG7A 5GIPE 3BHVA 4TY1A 5AP5A 4FF8A 4XP0A 5J7BA 3OUKA 4QP6A 4BCMA 3U51A 3C4EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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