4C34A

Pka-s6k1 chimera with staurosporine bound
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
340
structure length
336
Chain Sequence
EQESVKEFLAKAKEDFLKKWENPAQNTAHLDQFERIKTLGTGSYGRVMLVKHMETGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVLEYLPGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLMIDQQGYIKVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFSEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Discovery of Potent Ribosomal S6 Kinase Inhibitors by High-Throughput Screening and Structure-Guided Drug Design.
pubmed rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Bos taurus
total genus 106
structure length 336
sequence length 340
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4c34A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4c34A02
2AUHA 3LMIA 5FTGA 5E8YA 5M07A 3BE2A 4FSTA 4R3RA 3ZUVA 4ACCA 4O0WA 4KIKA 4G17A 2WTDA 2GQRA 4FTUA 4XV2A 2A0CX 2G2HA 3LLTA 5EOBA 3LXKA 3LCSA 5TO8A 3WF6A 2GMXA 3TNWA 2W4KA 3ZEPA 1JBPE 3HP5A 3K3JA 3VUTA 3LOKA 3GVUA 4AWIA 5JKGA 4XEYA 1Q8YA 4IE9A 3UO5A 4IB3A 3C7QA 2QC6A 3EMGA 3I0QA 4R5SA 2QKWB 5KMNA 2JFMA 2OJGA 2WTKB 3QZFA 3NZ0A 4EJ7A 1ZMUA 4Q9SA 4X6QC 2CKOA 5CNOA 1I09A 3CY2A 1GNGA 3QQGA 4BZOA 5KMMA 2IZUA 3FE3A 3BYMA 4RVLA 4BKZA 2ACXA 3FWQA 4RG0A 3PTGA 3PXFA 2VWBA 4DFUA 3IDPA 3KA0A 3QTWA 3O0GA 5CI6A 5A46A 1WBWA 3CGOA 3QQLA 1M2QA 2VTPA 4BDGA 1R3CA 3HV7A 3JY0A 2JAMA 4FSRA 4J8MA 4WG5A 5EDPA 2NRUA 3BEAA 4FTMA 5T68A 2UW4A 4QRCA 4DC2A 2JDOA 3V8SA 4UXQA 4U43A 4ZXTA 3E88A 3UQCA 3R01A 3DNEA 3KY2A 3PWDA 3U9NA 4B8MA 3EFLA 3FZSA 3IG7A 2QO2A 3POOA 3ZM9A 2PUIA 2X81A 3NNXA 3TZ7A 4C58A 5IA2A 4F1TA 2W1CA 3KC3A 3OTVA 4WNKA 4MKCA 5EM5A 2GTNA 4ACMA 4BDKA 4JG7A 3W33A 2I40A 4TPTA 4HZRA 3LFFA 4DEEA 2XRWA 3ZO2A 5BPYA 1LP4A 5J7HA 4O7TA 2BR1A 4Y8DA 3HAMA 3DPKA 1OIYA 5FDXA 4JIAA 2JKMA 3GCSA 5FXQA 3RPSA 2WMVA 5FM2A 5ANKA 5CAOA 3ORKA 5IDNA 5BMMA 3COHA 3R8UA 2HYYA 4A7CA 2XNBA 3RJCA 3UOJA 1XWSA 3CS9A 4LUDA 5H9BA 4KBKA 2YCRA 4LV5A 2YIXA 4G6OA 2IW9A 1Z57A 2AC5A 3S3IA 3OZ6A 3AD6A 1RW8A 4U81A 3R7UA 1XH9A 2QOIA 3CTJA 3R02A 5CSWA 2HCKA 3RPRA 5CAPA 4AT5A 3GP0A 3MVJA 1J1CA 1SNUA 4HJOA 5CU2A 5HO6A 1S9IA 2PSQA 4K0YA 4U8ZA 2ONLC 3VN9A 5JFXA 4GVAA 2CNVA 3UP2A 3OY1A 4QMLA 3UODA 1GZKA 4BVUA 4DA5A 4UBAA 3R1SA 2YM6A 4FSUA 5BNJA 5HBJA 3ANQA 2OBJA 3AC4A 4QNYA 3M42A 5IH4A 3Q2MA 2VTOA 5I0BA 4E6DA 2WNTA 3OT8A 3PVWA 4X3JA 1YXVA 4X6RA 4F6WA 4DG3E 5CLPA 2QVSE 1K3AA 2Y4PA 2Z7QA 4F0GA 3TDWA 5CU6A 4N70A 3BHHA 5H8BA 1OL5A 3ZU7A 4I1ZA 3AC2A 4MXOA 4U41A 4C3FA 2HZ4A 3CIKA 5DGZA 4E4NA 4PL5A 4MNFA 1AGWA 1HOWA 4MQ1A 4NW5A 5DHJA 2XNGA 4FKQA 3MVLA 4JQEA 3L9LA 1OKYA 2WB8A 4YJTA 3T9IA 4A07A 4U3ZA 2GNJA 4W9XA 3FPQA 4ZZOA 3E8NA 3R21A 4UXLA 5JFVA 4ACGA 4JBVA 3QQUA 4WA9A 3MVHA 4DGGA 2JKKA 4I0TA 2WEVA 1BYGA 3VO3A 4BTKA 3NEWA 2PU8A 1F5QA 4QTBA 4YTCA 4F08A 1H08A 3CTQA 2QNJA 3I60A 5B2KA 3MB6A 4DGMA 5GZ8A 1H25A 3DQXA 3QQHA 5CU0A 2J90A 4LFIA 1WBNA 3FHRA 4MHAA 1XBBA 4I5MA 1BMKA 4C02A 2VTSA 2BFYA 1PY5A 4BC6A 3E63A 3FC1X 2VNWA 2VTJA 3PFQA 2IJMA 5ACKA 3SW4A 4QT1A 2J5EA 3UVRA 2X7OA 2YDJA 3QRKA 5IG1A 4BIEA 2HY0A 2NNWB 4IAAA 2VWIA 1G5SA 2WMTA 4TYIA 1H0WA 3F69A 4W4VA 3SOCA 2J0JA 5LJJA 5LMBA 4G3EA 4ASZA 4HGTA 4F7SA 2GU8A 2C6DA 4FTIA 5AR5A 1M2RA 3Q4UA 5M44A 4TWOA 5H8GA 3TI1A 3A60A 3GT8A 2YITA 3FMKA 2VX0A 1OKWA 1MQBA 4G5PA 3EN9A 2WFYA 2H34A 2QKRA 2F49A 3GCVA 5LXMA 4DTKA 4IZ7A 3II5A 4QPSA 3VBTA 4YR8A 4D9TA 3Q3BA 3D7TB 3ORMA 3TV4A 4J7BA 3VF8A 4RC3A 2B9IA 3NRMA 4YHTA 4ZLZA 4IHPA 4FV0A 2ITXA 3EKNA 2OLCA 4XV3A 2UZVA 2ERKA 3F7WA 4E5BA 4M12A 3QU0A 4O0VA 3FZ1A 1UWHA 4FSNA 3N51A 4MBLA 4M84A 5CENA 4K1BA 3QTUA 2VZ6A 3QKLA 2XEYA 2IVUA 3C4EA 2UZDA 4FSQA 4RFYA 4WNMA 2IO6A 3LFQA 4QMWA 3C4FA 5DT3A 1GIHA 3DK7A 2IW6A 3QF9A 5FP6A 4ANNA 5IA0A 3PRFA 4BCGA 5LCKA 3R73A 3W8QA 4EKLA 3SXFA 5IH6A 3KCFA 4JRVA 3C51A 4NCTA 3TDVA 4WUNA 4BBEA 2WEIA 3BQRA 2VO0A 3V04A 2BZHB 3QTSA 4KWPA 5L2WA 3FI8A 4R77A 4X3FA 3DXNA 3ZLYA 5BYLA 1GIIA 2ZM4A 3MH2A 3PIYA 3PG3A 4G3GA 4M0ZA 2RG6A 5AIKA 4XUFA 4KRDA 3QD3A 3QA8A 2C5OA 3MY5A 4LGDA 5HTCA 3Q53A 1XBAA 2J0IA 3AMAA 4JI9A 2Y8OA 3LPBA 1M52A 3FL5A 4XG7A 3I5ZA 3VUDA 3BZ3A 3OW3A 4JQ7A 4PMTA 3EQDA 5K5XA 3WYXA 1ZYSA 4XX9A 3ENHA 4FKIA 3CD3A 5EDRA 5CALA 2W99B 5CX9A 1UWJA 5AP7A 4QMVA 5D41A 3TKUA 2HELA 4EOMA 4F9CA 2XIZA 4CZUA 4O0YA 3EB0A 4HNFA 3UYTA 4BBFA 2BROA 3A7HA 3QHWA 3Q4TA 4DTAA 2OZAA 4K18A 2WIHA 4O7RA 2JBPA 2HOGA 5HQ0A 1V0PA 2VWUA 1P5EA 4IB0A 4U97A 2W1EA 3D2IA 3WARA 4EHEA 3UQFA 1R78A 4K8AA 3TCPA 3IOKA 3R6XA 2OKRA 4TYJA 4HVSA 4EHVA 4NU1A 4XS2A 3VRYA 4YZDA 5HBHA 3G51A 4Y95A 4R7HA 3OMVA 2QOBA 3N4TA 3FDNA 2WELA 4ZTNA 4EBVA 2ZDUA 1UU7A 4C0TA 5H2UA 4J8NA 4ZIMA 4EK5A 4JAJA 5AJQA 4WNPA 4H39A 3GNIB 2OJFE 3QC9A 3R00A 3R63A 4FEQA 3Q52A 1Q5KA 3D5WA 5G1XA 4YZBA 2XIRA 2LAVA 4DFLA 3OOGA 2YWVA 3POZA 2X2MA 2X7GA 4U0IA 2O0UA 2XYUA 4OTWA 3WOWA 4AE9A 3DOGA 1PXJA 4GV1A 4JNWA 2X1NA 3MY0A 1B6CB 2CKQA 3SA0A 1F0QA 2EXMA 2IZTA 2BIYA 4QP6A 4RVTA 1FMOE 3LW0A 4KIOA 3DXQA 3LCTA 3OFMA 4EZ7A 3HMIA 4R1YA 3L9MA 5FEEA 3DZQA 1CTPE 4KAOA 4RLLA 1OMWA 4D0WA 2XNMA 3KMMA 1XH5A 3AC5A 3LXPA 4O2PA 4EBWA 1PMUA 4CCUA 2PUNA 2V7OA 4MX9A 5KKRB 3PA5A 5FRIA 2VRXA 4QQJA 4ZS0A 5KO1A 2Y9QA 2AC3A 4DT9A 4GK3A 2W96B 4FIIA 2XJ2A 3OUNB 3PG1A 2Z8CA 2VTHA 2IN6A 3DKFA 4IXPA 4JG6A 4RA4A 1E1XA 4OR5A 4XG3A 3PIXA 3Q9ZA 2BZIB 5CVGA 4TY1A 1JKTA 5IA1A 5J9ZA 3R04A 4RGJA 4CMUA 4Y5QA 3C4XA 1PMVA 3WF8A 3EQIA 3KMUA 4TYHA 3O23A 2PY3A 4W4YA 4L3PA 3A2CA 3N9XA 2ITUA 4QPMA 5DRBA 4EK3A 5C9CA 2QOFA 2BALA 4QTAA 3AMYA 4JDIA 5C27A 1P14A 3FMJA 4YJVA 4BB4A 3U55A 3R1QA 1QPCA 3BU5A 3EIDA 4MAOA 2OIDA 3DDPA 3PVGA 4O81A 2OICA 4FV8A 5ETCA 2W1IA 5J79A 5AR2A 4XNEA 1KOBA 4CFXA 4Q5HA 1B39A 3VS4A 3ZFMA 4FNWA 4QP8A 3O7LB 3HV3A 5CZHA 4BCQA 5AIRA 5JQ5A 3QZHA 3LCOA 3ORZA 3D5UA 3PPJA 3RK9A 3FSKA 4WKQA 4EK8A 4S30A 5IQIA 3R71A 4FF8A 3LXNA 2HK5A 3MN3A 3F6XA 4IQ6A 4NSTA 2HW6A 2JAVA 4UYAA 4X0MA 4CT2A 5CSPA 4ZOGA 3QD0A 4EC8A 1YXTA 3KCKA 1CDKA 4U80A 4C4GA 2BDWA 3MA3A 1JAMA 4FV4A 4AX8A 4DEBA 1B38A 3QTZA 1PXMA 2GHMA 4PDOA 4XG6A 5CASA 5IQFA 2XM8A 4FEXA 4FKGA 1FBNA 5EI8A 1NA7A 2J6MA 4TWCA 4FTCA 4IEBA 3FUPA 2CKEA 1PKGA 2XK7A 5BMSA 5M51A 4DBXA 3NDMA 4E6QA 2WTVA 4ALWA 4FA2A 1SVEA 4FZ7A 4QP4A 2ETMA 4NL0A 3P7CA 3FXZA 4FZFB 3D14A 4H05A 4O1PA 4AA0A 3QUDA 4O7YA 5FEDA 2PE0A 4V04A 3WF9A 4PX6A 3MJ1A 2C6MA 2I7QA 5TE0A 3OP5A 4TNDA 5C8MA 4CD0A 2GPHA 2SRCA 3UYSA 2RSVA 3HDMA 2GQGA 4GT4A 5K5NA 1SYKA 3R9RA 5AR8A 3EKKA 4PPAA 5K3YA 5KZ0A 4AP7A 4DH8A 3SW7A 3EN7A 3MFSA 4EQMA 4WG3A 1YOJA 3PJ3A 2CGXA 2PVFA 4PMSA 3DBDA 4U5JA 1CMKE 1QPJA 4UZDA 3QZGA 3O71A 4C7TA 3GOKA 3FYJX 4P7EA 2VV9A 3QQJA 5CT0A 4AN3A 4D2WA 4F1OA 3TG1A 3MA6A 5EKNA 2QR8A 2VX3A 2CCIA 3P7BA 4PNIA 2QO9A 1RDQE 1FQ1B 1IASA 2WXVA 5J7BA 3LKMA 2VGOA 3ATTA 4C34A 3HV6A 2R3LA 5IQGA 3W16A 3MSSA 1UU3A 3R7VA 2Z7LA 4DFXE 5KBRA 4IX4A 4DE4A 4F64A 3BELA 3D0EA 3OXIA 1SZMA 4JAIA 3RAWA 4ZEGA 2WQBA 3RWQA 3UC3A 1OL1A 4V0GA 5AP1A 2VUWA 3U4UA 3UGCA 3S2PA 4CT1A 2ZV8A 3MJ2A 4ANQA 1VEBA 4Q5EA 4OAVB 2F9GA 4X2KA 2QCSA 3AOXA 5J5SA 4FX3A 4FTOA 5HBEA 2HENA 3P5KA 5CEKA 2ITOA 4GT3A 5AWMA 5T6KA 3AC8A 3UPZA 3RPVA 4D4VA 1ERKA 5L8KA 5KCVA 1FMKA 4QQTA 2V7AA 4OTPA 4EH9A 3COMA 4E5WA 4ZZMA 3ZZWA 2JFLA 2QODA 1YI6A 4ZS4A 4BDJA 1PXPA 3QCXA 5L3AA 1U54A 3JUHA 4L9IA 5H8EA 3WE4A 2VTTA 5LARA 1OUKA 5AUTA 3K54A 4DH3A 4KA3A 4FVQA 2ITPA 1IG1A 2ZB1A 3R9HA 4NYEA 3HMNA 4QTDA 1SVHA 3G6GA 3F66A 3GC8A 3KVWA 3RP9A 4FKLA 3P1AA 3MIAA 4MQ2A 4S33A 3I81A 2E9PA 5JMSA 2VWXA 4AXAA 5CQUA 5CY3A 1ZWSA 3PSCA 5KMJA 4FG7A 4OTRA 3IOPA 4ZMFA 3UVPA 2J50A 1IA8A 4EHGA 3GU8A 4X21A 4EUTA 1PHKA 1PXNA 5DG5A 4YTIA 3HV4A 1ZYLA 3MV5A 4EH8A 3IW5A 2V5QA 2ZAZA 1DI8A 4IW0A 3ODZX 4WBBB 3SAYA 4KSQA 2WQEA 3R0TA 4DGOA 5KMKA 4FZDB 4NK9A 3K3IA 2CKPA 2XKEA 4FODA 4UN0C 3QTXA 4B99A 5AP6A 5FWKK 3QTQA 4DFZE 3V8WA 1KE9A 3BU3A 3K2LA 3PY0A 3L9PA 3FZPA 5IQAA 1DAWA 2XNNA 3ULZA 3BHUA 3BBWA 2WAJA 2JEDA 2PVMA 2UZWE 2PMIA 3OY3A 4PTCA 4USEA 2WTKC 5LQFA 1PRYA 3EHAA 1H1RA 3BV2A 4C38A 2R3JA 3RPYA 3KGAA 4ZY4A 2VWYA 4DEAA 4PWNA 3TTJA 4FV7A 3BYSA 3QCQA 3FZOA 3S4QA 5CF5A 5M4UA 3ZRLA 2EU9A 4CFMA 1KWPA 4UMTA 5IUIA 4DGNA 5HHWA 4Z3VA 4R3PA 1YDRE 3V01A 3OBGA 1KV2A 3CJGA 4CV9A 3MH3A 3O17A 3AT2A 4ALVA 5I9ZA 5IMXA 1MQ4A 5LWNA 5HCYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3IS5 A;  1WFC A;  3FKO A;  3AQV A;  4PQN A;  2XBJ A;  4BWP A;  2EVA A;  1WBO A;  3FMN A;  3H9F A;  2IVT A;  5KMI A;  1OPL A;  2PZY A;  5IIS A;  5FBO A;  3QX4 A;  5CXZ A;  5LOH A;  3E3B X;  5JT2 A;  3RCD A;  4O1O A;  4ZAU A;  4IH8 A;  5DR9 A;  2QG7 A;  3AC3 A;  1GAG A;  4XG4 A;  4RWK A;  3C0H A;  2O63 A;  1JKS A;  1O6L A;  5E8S A;  5FTQ A;  4FKU A;  5F4N A;  3VVH A;  3TUC A;  2UZO A;  4LMN A;  5BUJ A;  5LCJ A;  5AUU A;  4LRM A;  5KNJ A;  3FQH A;  2ZM3 A;  4QMP A;  2OJ9 A;  1WBV A;  1JQH A;  4O0U A;  4BCJ A;  3VS6 A;  4D2P A;  3U6J A;  4BKY A;  4HVH A;  5HU9 A;  3PY1 A;  2ITT A;  4RX8 A;  3OEF X;  3W2O A;  3G9N A;  4I6H A;  4LRK A;  2Q0B A;  3F2A A;  5G6V A;  3Q6W A;  3RK5 A;  3WZK A;  4UMP A;  1JST A;  1PF8 A;  3DAK A;  3NLB A;  5L4Q A;  5IQB A;  3F82 A;  3BWF A;  4F9W A;  2UVY A;  3HDN A;  3E7O A;  5CT7 A;  4O21 A;  5EM8 A;  3U6H A;  1TQM A;  2UW5 A;  3F3Z A;  4CFF A;  1IAJ A;  4YTH A;  2P0C A;  4GK4 A;  2YAK A;  4D2T A;  5IQD A;  4ZP5 A;  3FQS A;  3PP1 A;  4IAK A;  4E4X A;  2OI4 X;  5IEX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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