4L42A

Crystal structures of human p70s6k1-pif
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
334
structure length
299
Chain Sequence
EKIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAMIVRNAKDTAHTKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCKESIHDGTVTHTFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKEMFRDFEYIADW
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of S6K1 provide insights into the regulation mechanism of S6K1 by the hydrophobic motif
pubmed doi rcsb
molecule keywords RPS6KB1 protein
total genus 90
structure length 299
sequence length 334
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4l42A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4l42A01
1DS5A 3FHRA 4YO4A 1UA2A 3T3UA 4FUXA 4GIHA 4XP2A 2OJGA 1UVRA 2XIYA 4TWPA 4CRSA 4G6LA 4RZVA 5E8UA 1LR4A 3LFQA 5AR4A 3FBVA 2WMTA 2V55A 3VBYA 4I5MA 3TV6A 2W5AA 5A4QA 5HTBA 3QTZA 4FT0A 4GU6A 3RINA 4EH7A 5LVOA 1VJYA 4MWIA 4RLLA 3OMVA 4XNEA 4K18A 2H8HA 3DZOA 3VHKA 3H3CA 4EH9A 5CF8A 1XKKA 4WT6A 1Q3WA 2W05A 5BPYA 4Y8DA 5DPVA 3KMWA 4H3BA 2BRNA 4ZK5A 3POOA 2UW0A 4ANNA 2PVYA 3NNVA 3KN5A 1RQQA 4NSTA 4RJ6A 4DG2E 5M4IA 4TYGA 4JQEA 3C4XA 4BIBA 3F66A 3V6RA 4GVJA 3DXQA 3BGQA 1H24A 1UKIA 3SG9A 4EH3A 4XCUA 2IN6A 2VX1A 4D58A 5IDPA 3L8VA 3QXPA 3QTSA 2JFMA 4I93A 2GQSA 4J97A 3PP0A 4QTAA 2OFVA 5AP2A 4A9TA 4EH6A 2P3GX 2WMBA 4JNWA 2W96B 4AU8A 3ELJA 5IH4A 3UQCA 2DS1A 5E8WA 3QD0A 3HP2A 4IM3A 3QRUA 5I5ZA 5B0XA 4MBLA 3ETAA 3KULB 4CQGA 5L2IA 5C1QB 4CFWA 4JDJA 3SQQA 4ACMA 3AD6A 1DAYA 4U43A 4QMXA 3UTOA 2IVVA 2W7XA 3TZ8A 4CYJA 4LUDA 1Q8TA 3TN8A 2R3OA 4RX5A 2BMCA 3KRXA 4FKWA 4XS2A 3AD4A 3GCVA 1QCFA 1Z57A 4O0XA 5AADA 2W1CA 4FOBA 4FNZA 5KKRC 3BU5A 4OTQA 4NEUA 4ITHA 4P5QA 4F0IA 2A1AB 1M52A 4LGGA 2OIDA 2LGCA 4USFA 3A7IA 1SVHA 2X8EA 4LOQA 1Y6BA 1FQ1B 5J5SA 5CLPA 4AN3A 5JEBA 1CTPE 2XYUA 4OGRA 4BDGA 2CNVA 4O7LA 4AZWA 4DFZE 2C1BA 1XQZA 4NM0A 3ORTA 5D9HA 4Z7HA 2WIHA 4C4IA 5DBXA 4AUAA 3GU5A 4I23A 5HI2A 5CS6A 2GQGA 5DNRA 3KREA 1RW8A 2YAAA 4WD5A 3ZTXA 4C58A 4NJDA 4NU1A 3WF7A 4V0GA 2WMAA 5CEOA 4A9YA 2VTLA 1H01A 2QOOA 5HLWA 4FK6A 4Z55A 5HE2A 5E1EA 1NVQA 3SC1A 2C6IA 2OICA 3KRLA 5I9WA 5JFSA 3KXHA 4MNEB 4U44A 4I41A 4J8MA 5IZFA 3I0QA 2EB2A 1XH6A 4OTFA 3DBQA 2WTKC 4XUFA 2JBPA 4A4LA 1J1BA 4X6RA 4IACA 1QL6A 5CT7A 4QQTA 4Z9LA 5EH0A 5J7BA 2PVJA 4V05A 3QQFA 3A61A 3EZVA 4IANA 3QUDA 3N51A 3NVKI 4L3LA 3EKKA 2QO2A 4BHZA 1ZMWA 4TTHB 4AZEA 4D2PA 5EYKA 3OCTA 3NUXA 2V22A 4A9SA 4HCTA 3C4ZA 4CTCA 2CKQA 3TIZA 5C27A 3ENMA 4FTIA 3BWFA 4WG5A 2R0IA 3FI3A 3H4JA 4JJRA 4V01A 2OH4A 2ZOQA 5KMNA 2VO7A 1OITA 2J90A 5AWMA 3QKMA 3EFJA 4DGOA 5IUHA 2PYWA 2CKOA 2QHNA 4QQCA 4ZTHA 4XV9A 4GFOA 2VAGA 3CY2A 2YIRA 4FTJA 4CGAA 3PYYA 3HV6A 3VS6A 2PU8A 1ZY4A 2XKFA 1AGWA 4PF4A 5HU3A 4O82A 4WNKA 1ZYLA 3CQEA 4O7VA 4R3RA 4NKAA 1QPJA 3W18A 3R02A 3RHXA 4FV0A 5F1ZA 4I6HA 5TKDA 2PL0A 2CHLA 2H6DA 3O8TA 4CD0A 3BHYA 4JIKA 2G15A 1VYZA 3SW7A 1Q99A 4GFMA 1YVJA 4EHVA 4DG3E 3NEWA 3QQGA 3KXZA 3N4TA 1KSWA 3FLNC 3M11A 1J7LA 4MQ1A 5IA2A 5E8VA 5CXZA 4G1WA 3OXZA 3QWJA 4YLJA 5HNBA 5BNJA 4FZ7A 4IVCA 4I0TA 4MXCA 5FRIA 3FI8A 3CJFA 3ORNA 4PL4A 1IASA 1G3NA 3DTWA 1PMVA 4RIWB 4YNOA 3BEGA 4WNMA 2RKUA 4YZCA 3SD0A 5AUYA 5E8XA 3EH9A 4RJ3A 5FM3A 4S2ZA 4S33A 2J6MA 3R2YA 2FVDA 2NO3A 3VS0A 2IJMA 3MY0A 3DLZA 2G2IA 4FV4A 4QPAA 4YMJA 4QMPA 3U4UA 3ZFYA 3CSVA 4FL2A 2VGPA 3Q2JA 5L8LA 4WNOA 1OL5A 4XOYA 3BV3A 3P23A 2Z7QA 4TY1A 2PE1A 1W0XC 2XIZA 3OT8A 1AQ1A 2XF0A 4RVLA 4WRGA 3D0EA 3MW1A 4QNYA 3UG1A 3VBTA 4BI1A 1OIUA 2IPXA 4NJ3A 2FSTX 1WCCA 2ZB1A 3LM5A 3UIMA 5CAOA 5HE3A 2UW7A 3MS9A 3P1AA 2W9FB 3O23A 3QCSA 4MNFA 3IONA 4AXAA 3DY7A 2GS7A 4F99A 5DT3A 4P90A 1NY3A 1OVEA 5KE0A 3T9IA 4I6QA 4DEGA 4PNKA 1A48A 5BVKA 4RZWA 3ORLA 1PKGA 3PWDA 5TT7A 4BZNA 4BTMA 2UVXA 4QQJA 5FTQA 1YXSA 3O8UA 2ZMDA 1R0EA 2BDFA 3KL8A 3FZ1A 2VTAA 4FGRA 1M14A 3Q3BA 4RJ8A 2WOUA 3HA6A 4PL5A 4WUNA 3QA0A 3RMFA 3HRFA 4WUAA 4F6SA 4NKSA 3GOPA 3JY0A 3QCYA 2R3QA 3MH1A 4WKQA 4U80A 1ZMUA 3ZLYA 2J51A 4E7WA 1JSTA 5AP4A 3OFMA 4L43A 4BYJA 4IB3A 3PJ3A 3F88A 3R8UA 5L6OA 2GHGA 5AAEA 2GS2A 1WFCA 2JDOA 2VWUA 2ZM3A 5KKRB 1UKHA 4DEBA 2P33A 2BHEA 3IECA 3R7GA 5L2WA 1SVGA 4RIYB 3DK3A 1Q5KA 1H8FA 4IAKA 3ANRA 4YZDA 4YSJA 2FH9A 5KMOA 3UOJA 4NW6A 3FYKX 3EQCA 3LW0A 2BUJA 3NUNA 3RK5A 5M4CA 3HL7A 3ZZWA 3R22A 4IZ7A 5EDPA 2UZNA 3P86A 3QHRA 1I44A 5K0XA 1ZAOA 4BF2A 4WBBB 1Q3DA 4C0TA 2OFUA 2E9UA 2KTYA 3DK7A 4N70A 4OAVB 2OU7A 4QMTA 3C5UA 1QMZA 3V8WA 3BE9A 4O7ZA 4XJ0A 3L9LA 1M7QA 3NUYA 3D5VA 5C4KA 5IISA 4YLKA 5IEXA 4JIAA 5DR9A 1Z5MA 3DS6A 3QZIA 4XG3A 1PF8A 4I94A 3LE6A 5EW3A 2PZPA 4MK0A 3Q4CA 4JAJA 5AR8A 3Q9YA 4H36A 1U5QA 4HVGA 5GZ8A 3LFFA 2F4JA 2WEIA 4Q5HA 3ZRMA 3S4QA 3DXPA 5CSXA 3CQUA 5IQIA 4O21A 3OUNB 5BVEA 1KE9A 4OT6A 3LFSA 3QRIA 2I0HA 1YXXA 5EQEA 4W9XA 4BZOA 4Y73A 4BFMA 4AW2A 2YM3A 2YN8A 3NCGA 4O27B 3ZMMA 2ITPA 2XNNA 2QO9A 4IX3A 2J5FA 1ZXEA 1XWSA 5CAPA 3LMHA 2I6LA 4PDYA 1ZOHA 4E6QA 3MFUA 4UALA 2RG5A 4O2ZA 3MA6A 2IW6A 3G0EA 2BCJA 2GNIA 3F3WA 3H10A 3NCZA 4M68A 4TYEA 1XBCA 4QMOA 5AUTA 2BKZA 3BGPA 5I4NA 2IVSA 5AA9A 2PHKA 5HTIA 4BN1A 2XMYA 1YHWA 3BHUA 3U55A 2JIVA 4OBPA 4O1OA 2F9GA 4RGJA 4TNBA 2OZAA 2VWVA 3CTJA 4AWIA 3VN9A 5FTOA 4YHTA 3G51A 4ZXTA 4BDCA 4C4EA 2VGOA 4F63A 2GCDA 2OBJA 4EWHA 4L44A 3AOXA 2WXVA 1GAGA 3HMNA 3OOGA 3MFRA 2GSFA 3UE4A 4BI0A 4JBOA 4GYIA 5A3XA 2C5VA 2J50A 2BVAA 3MGYA 3O50A 3VUIA 5BYLA 2ZVAA 3OD6X 3FXXA 4FSZA 4IWPA 1UU9A 5BUEA 5LVMA 2PVMA 4FODA 1WVXA 5CSVA 5BYYA 5CU0A 5JZJA 4IZ5A 4DAWA 4IB5A 2YZLA 2BRMA 3P79A 2GHLA 2YIXA 1PMUA 3C1XA 3QRTA 4FI1A 4D1ZA 4BCOA 5CF5A 4H1JA 5TO8A 5BVNA 3F6XA 2E9NA 3ZZEA 5L6PA 3RHKA 4F70A 2WMVA 5AV4A 2W1IA 4QTDA 4DFYA 3MVLA 5HD4A 4C7TA 3NSZA 1J3HA 4JQ7A 4BTFA 5IA3A 3E62A 4YNEA 3BBTB 5F95A 3AC1A 4XP0A 5IH6A 3CKXA 2HWPA 4IZYA 1BL7A 2WKMA 2C68A 5HGIA 3ZOSA 4AOJA 4FTRA 2QOQA 4X3FC 4MWHA 2C47A 4W4XA 4E93A 4IVDA 1SVEA 1REJA 3EFLA 4QMQA 5JH6A 4OTPA 4IAFA 3RPYA 1OI9A 4A4OA 1GIIA 5IEYA 3I5NA 2JEDA 3QX2A 2QG7A 4DTBA 4GK3A 3O7LD 1R0PA 2R3NA 3KCKA 5A6NA 5K5XA 3LFBA 1O6LA 4HOKA 2I0VA 1STCE 3FLWA 4FT5A 3TKUA 3EYHA 5J9ZA 3EN5A 1P2AA 3KRJA 3K54A 3FLQA 4MHAA 4HGSA 4JVGA 1GJOA 4EONA 2YCFA 3PLSA 3V5QA 5KHXA 5CSWA 4Z16A 2G1TA 3BHHA 3SOCA 4XEYA 5CXHA 1LPUA 4NL0A 3PA4A 3PXZA 3WILA 4EEVA 3TDVA 3FJQE 3Q32A 3C51A 5AP5A 2EU9A 4W8DA 4FTAA 2XM8A 3RCDA 5BUIA 3A99A 4BDIA 3ID6C 4AG8A 3LOKA 1FGKA 3FKLA 4FR4A 5L2QA 3P0MA 4BBEA 5EI2A 3MH2A 4YTHA 3VWAA 4BKZA 3PPKA 4FL1A 4YHFA 4J7BA 2PE2A 3C0GA 4IH8A 3FLSA 4FT9A 1YQJA 3GNIB 4R3CA 4R6VA 3VUGA 4IVAA 5LMKA 3PXRA 1VR2A 2ZDTA 3LQ5A 4CXAA 2Z02A 3WZKA 4Y5QA 1H07A 4EH5A 4X3FA 4Q2AA 2XBJA 3NAXA 4JX7A 3UNKA 2BTSA 2W4OA 2WTDA 1DI9A 3JVSA 1CM8A 2UUEA 2ZYBA 4G9RA 4OTWA 2X2LA 3HRCA 3HV7A 3LKMA 2JKKA 1MP8A 2OJ9A 4HYSA 1J91A 4J98A 4BTJA 1FMOE 4NIFB 5DRDA 3WZUA 2PVNA 3DPKA 3Q52A 1JWHA 3OEFX 3DKOA 2W1HA 3FC1X 4UZHA 5AR3A 4LMUA 4DH1A 3AT3A 4BCJA 3PXQA 3TNHA 3WF5A 4HVIA 4LG4A 4KRDA 5BUJA 1OL6A 3COHA 4JOAA 4C02A 4QMSA 3QCXA 5CVHA 5BX0A 4YJUA 4D0WA 4HCUA 3JS2A 4YJTA 4JBVA 3FQEA 4DFNA 3WOWA 4EK8A 3V5TA 2WQOA 3QXOA 1PYEA 3C0HA 1R1WA 4BGQA 2JDTA 3W1FA 3F3UA 1L3RE 4HGLA 4G31A 1YRPA 4KSPA 4BR3A 5DG5A 3ZO4A 3NGAA 5J9LA 4ZY6A 4LL5A 2JKOA 3F3VA 2PE0A 2F7XE 2QONA 4C3FA 4FG9A 4ID7A 4I5HA 2B4SB 2R2PA 5HE1A 4NUSA 5EDQA 5BMMA 3SXSA 4LYNA 3MN3A 2JLDA 4YJNA 2XH5A 4BWXA 4PP7A 2OH0E 4FIGA 2P55A 4PPAA 5C9CA 4G3EA 4CT1A 3BI6A 4NTSA 3BYMA 2W06A 2X4ZA 2C1AA 4DYMA 4RT7A 2BR1A 3I5ZA 5E4HA 3RWQA 3GCUA 4M8TA 3K2LA 2OGVA 3ORPA 5HE0A 3DQWA 4IZAA 3RNIA 2QODA 3Q4ZA 1HCLA 3EB0A 4P4CA 5EW9A 4BDHA 4JL9A 4U41A 4JG8A 4RX7A 4FKTA 4M69B 2PVLA 4PP9A 2PMLX 5C8KA 4PTGA 3S95A 4P2KA 3MFSA 3F61A 2XIKA 3FY2A 1SZMA 5HCZA 4F7LA 4AGUA 1H28A 2OW3A 4AACA 2CCHA 3CTHA 4EZ3A 2DWBA 4RVTA 5J7HA 3BLRA 3MH3A 4FSNA 5CF4A 1XO2B 1TQPA 4ALUA 4EH8A 3KXGA 2OG8A 3NMUF 3HUBA 4PL3A 4CFVA 5EFQA 4B99A 5FDXA 3QTUA 3MV5A 3O2MA 2ZM4A 2YHVA 3P9JA 3IDBA 4O7TA 2FUMA 4UWCA 5M06A 3F9NA 1YI6A 4CCBA 4QO9A 4GSBA 3DV3A 4KIOA 4BVUA 2Q0BA 5FXRA 3R7IA 5IA4A 4DE4A 3UP7A 4IX6A 4FSTA 3WIKA 3IDPA 5AAFA 5LOHA 2WTCA 4W4YA 4FV2A 1WVYA 4CZUA 3VUHA 3W16A 4L6QA 5KBQA 5FQDC 3PIYA 3SLSA 3REPA 3QCQA 2VX3A 3AC4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2FSO X;  3E92 A;  3RM6 A;  3UNZ A;  1IEP A;  1V0P A;  2F2C B;  3HEC A;  3LFN A;  4FTU A;  4ASZ A;  2CDZ A;  3QZH A;  3RAI A;  3KXX A;  5C01 A;  2GS6 A;  4NCT C;  4D5K A;  2W1G A;  3HLL A;  4AF3 A;  4U45 A;  4ZSG A;  1ZLT A;  1OIQ A;  4D9U A;  2GPH A;  4A06 A;  4EYJ A;  2GNH A;  3L8S A;  2R3I A;  2XYN A;  3MVJ A;  4OW8 A;  3TZ7 A;  1SNX A;  1ZAR A;  5CAN A;  4B0G A;  2C6O A;  3E8E A;  3LIJ A;  3D7T B;  5LVN A;  5IQC A;  2J9M A;  5TE0 A;  5GZ9 A;  5IEV A;  3V01 A;  2VU3 A;  3ZLS A;  3N4V A;  4MBI A;  4E4N A;  5CYI A;  2VTN A;  4FEX A;  2AC3 A;  3Q4T A;  2Z60 A;  5EHL A;  2R4B A;  5HG7 A;  2X6D A;  5IME A;  4K8A A;  2PVR A;  5FGK A;  3I7B A;  2G2H A;  3T8O A;  4AP7 A;  3QKK A;  4ANS A;  3D9V A;  1H0V A;  4ERW A;  2VTS A;  3VO3 A;  1YDR E;  5HID A;  1ATP E;  2QR8 A;  2RFE A;  3G6G A;  3H9O A;  4TKS A;  4CZY B;  3HV3 A;  3A2C A;  2WTW A;  3RTP A;  3LQ8 A;  3EN7 A;  3IDC A;  4IFC A;  4PTE A;  5CU2 A;  5ANG A;  3ZSH A;  2UZT A;  3R28 A;  4BWP A;  3FI2 A;  3WIG A;  1H1S A;  4RIX A;  3BE2 A;  3UYS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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