4M84A

Calcium-dependent protein kinase 1 from toxoplasma gondii (tgcdpk1) in complex with inhibitor uw1455
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
464
structure length
464
Chain Sequence
TAIFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKITGQECAVKVISKRQVKQKTDKESLLREVQLLKQLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVGEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLESKSKDANIRIIDFGLSTHFEASKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEYDILKKVEKGKYTFELPQWKKVSESAKDLIRKMLTYVPSMRISARDALDHEWIQTYTKEQISVDVPSLDNAILNIRQFQGTQKLAQAALLYMGSKLTSQDETKELTAIFHKMDKNGDGQLDRAELIEGYKELMRMKGQDASMLDASAVEHEVDQVLDAVDFDKNGYIEYSEFVTVAMDRKTLLSRERLERAFRMFDSDNSGKISSTELATIFGVSDVDSETWKSVLSEVDKNNDGEVDFDEFQQMLLKLCGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Toxoplasma gondii
publication title Potent and selective inhibitors of CDPK1 from T. gondii and C. parvum based on a 5-aminopyrazole-4-carboxamide scaffold.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calmodulin-domain protein kinase 1
total genus 159
structure length 464
sequence length 464
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13405 EF-hand_6 EF-hand domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4m84A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4m84A01
4HZRA 4ZEGA 3RPRA 2V7OA 5CTPA 2H9VA 2QQ7A 3F66A 4RIOA 5AUZA 3W2OA 3R04A 4BR3A 3DS6A 3HV6A 4RBLA 5M4UA 2KULA 3Q2MA 4YJOA 4YURA 3BX5A 3I81A 5EDPA 3HMOA 2HWOA 2BRGA 3CC6A 3OW4A 4D58A 4L3PA 4U97A 2UW5A 3O8PA 3V6SA 3UPXA 5HICA 3R73A 4JR3A 1Q4LA 4XG3A 1GIIA 4AA4A 4XG6A 4AZEA 4IH8A 1Q8YA 3F5UA 5JFVA 4X2JA 3MY0A 3PSCA 4FKUA 5A4QA 5KBRA 4M14A 1XBAA 4U3ZA 3ORXA 3RPYA 4ASXA 4YTFA 2FB8A 5AV3A 4Z7GA 4CVAA 4OTRA 3OCGA 1OUYA 2X8EA 3GCSA 3HKOA 1H1WA 3MDYA 4XRLA 5FTOA 2YJSA 1H0WA 2OZAB 2Y4PA 3EN6A 5CVGA 2UZNA 5JZNA 1ATPE 3QD2B 3FHRA 5KMIA 2CGXA 2R9SA 3K3IA 4PMPA 5J79A 4C0TA 2C47A 5JN2A 3RALA 3D14A 5ANOA 2P2HA 1SZMA 1JSUA 2PMOX 4ACDA 2YM7A 3ORKA 2W1FA 2XK3A 3Q5IA 4O7TA 4U43A 3QRKA 3DB6A 3D2KA 2CLXA 4QTDA 3OD6X 3F61A 4FTUA 4D5HA 2YIXA 3MB7A 4FOCA 3R8LA 4BTKA 3ORPA 4IVDA 5IH6A 2W5HA 4AA0A 4BCMA 2WMBA 4C4IA 2VWBA 5CLPA 4BCFA 2FH9A 5JMSA 5LMKA 4QMTA 2E9OA 1OIUA 3I7BA 5GIOE 2PZRA 1JSTA 2RFSA 3JUHA 4JX7A 4N4SA 2R3LA 5J95A 3V04A 4BDKA 3N4UA 4ZJIA 3HLLA 3PPKA 2YCSA 4GT5A 3F3VA 3MH1A 4EC8A 4CKJA 5IU2A 2XS0A 4RQKA 2EXMA 3PXRA 3DB8A 4J71A 3VS1A 1DM2A 4IVCA 5M06A 4D55A 1DAYA 2I6LA 2WTDA 5DT4A 3QQKA 5D10A 4DLJA 4R78A 4ZTRA 2C5XA 1YOLA 2C6OA 3AMAA 2REIA 4FIGA 4YZCA 1PYXA 4PMMA 2JGZA 2JD5A 3DOGA 4FKPA 4D4VA 1J1BA 5BVOA 4WOVA 3L8XA 3QUPA 5I9WA 4F9YA 3R83A 2GNHA 4IWPA 4IJ9A 5IPJA 1M7QA 3PPJA 4BCKA 2HXLA 4R6VA 4XEYA 4DG2E 1BUHA 1XQZA 3ZC5A 4QMUA 4HYSA 4JBVA 4YC8A 3V51A 2EB3A 5DRBA 1OVEA 4YHJA 4UMQA 1WCCA 4UYNA 5E90A 2PVNA 4L7SA 4EQCA 2W17A 2B7AA 4ZTNA 2JBPA 3A2CA 2PE2A 5FTQA 4AG8A 5CEKA 2PYWA 2VUWA 5C4KA 4FKRA 4FKGA 2FUMA 3IK3A 4YMJA 3NUAA 1E1VA 4FSTA 3BGPA 4ZP5A 1R0PA 3B8QA 3L9NA 4H58A 2PVFA 5GHVA 5L8KA 5CQUA 2PVHA 3FLSA 2EB2A 5CS6A 4IFCA 4ID7A 4I5PA 5IA5A 4LRMA 5EOBA 3PZEA 2YLFA 3H0ZA 1R0EA 2VX3A 4NH1A 3ZS5A 5KE0A 5K5XA 3E8EA 5E1EA 2NRYA 5L4QA 2JAMA 4WD5A 3DV3A 4KS7A 4QP7A 4FL3A 4BBMA 3MH3A 5D12A 3P9JA 3FXWA 4IW0A 5HQ0A 3PXKA 4FKTA 4M69B 2XJ1A 3MS9A 1JPAA 3LVPA 1CM8A 3CD8A 4BTFA 4EQMA 3M1SA 4WO5A 4RX7A 1DI9A 3EMGA 3FLYA 2WTKB 3FI2A 4F63A 2R4BA 3FAAA 3RCJA 5IEVA 4DF3A 4ACMA 4N0SA 4D1ZA 3EB0A 1OGUA 4GU6A 5EYKA 4OTDA 4ZSEA 5B2KA 5T68A 5DR6A 4BGQA 5GNKA 2VTJA 2Z7SA 4MKCA 3IW4A 4JBPA 4TWNA 3TV7A 3KCKA 4HVIA 5H8GA 3DK7A 3TTJA 4JVGA 3AD6A 3JYAA 2IN6A 4EOJA 2UV2A 4ZSAA 5LWNA 2VWUA 1U59A 5AUVA 4TKSA 3SQQA 2BILB 4GG7A 1UKHA 1YWVA 4KSQA 5HCZA 4NKSA 4ACHA 4E93A 4A4XA 5KKRB 4CRSA 4RMZA 3RK9A 2ZAZA 3QYZA 4X21A 3ZSGA 5KMJA 3UZRA 3TXOA 2VWWA 4O91A 4IWQA 3EH9A 5AR5A 4AZFA 3S4QA 3FXZA 4OBPA 5IEYA 5GZAA 4GYIA 3DQWA 3UOLA 5J9LA 1STCE 3NVKI 2UZDA 2W1IA 2AC3A 3FKLA 3QRUA 4KSPA 4I6QA 4U7ZA 4Y8DA 3MI9A 1Q8WA 3HZTA 4IACA 3MPMA 4A4LA 3MIAA 4G5JA 4CKRA 5AUXA 3KXGA 3D0EA 2HZNA 2WOUA 4LV8A 4KKEA 4PQNA 3QC9A 3AGMA 4MBIA 4FIFA 3VS4A 4AWIA 3ORMA 3V5LA 4D28A 4O86A 2G15A 4X6RA 3V8WA 3FZSA 3NUNA 5LJJA 1J91A 5C03A 3R28A 3LLTA 5EI8A 5BVDA 4RJ4A 3PJCA 5HO7A 4ZIMA 2VWZA 5JKGA 1QMZA 4LUDA 5AUWA 4JNWA 1XBBA 3QX2A 2QD9A 4WA9A 2W5BA 3PDTA 3SD0A 2UW0A 4IX5A 3CS9A 5CF4A 5TOZA 3RJCA 3LE6A 2JBOA 4RZVA 4MXOA 4C3FA 4WNPA 1CMKE 2QCSA 4G9RA 5CSHA 2YDKA 3QA0A 3EQDA 3F3ZA 3Q52A 2J4ZA 5K4IA 1JKTA 4QTAA 5EM8A 2Z7LA 5FWKK 4U40A 4UBAA 3TTIA 4QMVA 1OL7A 3FLNC 2QR8A 5EQYA 4TNDA 3LMGA 1UA2A 3E87A 2BPMA 2VN9A 3A7FA 1J3HA 3R8VA 4JAIA 3JVRA 4DH1A 3RWQA 4U3YA 1YOJA 5JGDA 4FG7A 1OM1A 3E62A 3AC3A 2WIHA 3UGCA 5EK7A 3KXZA 4HGLA 5E91A 5EHOA 2VO0A 2W05A 4K77A 4XYFA 5L2WA 3C5IA 3VIDA 3F2AA 3Q4CA 5DOSA 3QD0A 1OKZA 3KMMA 3RAIA 4IC8A 2IVTA 2J90A 3ETAA 3B2TA 3IONA 4L6QA 2WU6A 5I9XA 5L2QA 3OF0A 3WF5A 4L3JA 5HD7A 2WTIA 1NA7A 4B6LA 4F64A 3NVMB 3KXXA 3NNUA 1SM2A 3COMA 2QOHA 1PW2A 2XEZA 4H1JA 4AN2A 4XG2A 4C3PA 4D1SA 4TYIA 1R39A 4F1TA 5KBQA 3ZDUA 3ZXZA 4F7LA 5DEWA 4KIOA 4F9CA 5A3XA 2PULA 2B53A 3D7TA 1Y6AA 3MVHA 2GMXA 4NW5A 2IW9A 4FZ6A 1YVJA 4M68A 4IAZA 2ZOQA 3CBLA 4YLLA 3UO4A 1FGKA 3PLAE 3R1QA 3ORZA 2OICA 5D7VA 2VTOA 3ELJA 3DAJA 4JDKA 4OUCA 1VYWA 3ROCA 5C26A 2CKPA 2BZIB 3TKUA 4PL4A 4O7YA 1R78A 5AP4A 1YXVA 2KTYA 1MRYA 4EQUA 4FIJA 2R3JA 4G9CA 4G16A 4AZSA 4DLIA 3S00A 3ROYA 5HHWA 2XEYA 3AC2A 4E6AA 1NXKA 1M14A 2UW6A 2BRBA 2IG7A 2O63A 4ZZOA 4QP8A 2X1NA 4CXAA 2W4OA 3KGAA 4PUZA 2PTKA 1QPJA 2RSVA 3R7IA 4HVDA 5AUYA 1BI8A 2C0TA 4GT3A 5E92A 1G8AA 2PVMA 4UZDA 3S3IA 4MNEB 4IFGA 2BAQA 3ZFMA 2QO9A 1XWSA 4EHVA 4O27B 4RIYA 1FPUA 2VGPA 5IA2A 3FMLA 4U5JA 3BYUA 3D94A 3KMUA 5HESA 5KX8A 3RAHA 3QL8A 3UYTA 2NP8A 3K5UA 5AA9A 1B38A 4ASEA 1PXNA 2YIQA 3RI1A 3IG7A 3S2PA 2WKMA 4C02A 1PMVA 4HOKA 1OPKA 2CCIA 2JIVA 3HL7A 4I6HA 2QLQA 3ATTA 2GHMA 3ALNA 1MQBA 2VTNA 2BCJA 4A9YA 2NNWB 5CEMA 4M12A 4G6NA 2OF4A 3OFMA 1UWHA 5AV4A 1ZOHA 3FDNA 2W99B 4GK3A 3W8QA 5AV2A 1XJDA 5BPYA 3SW4A 2J6MA 3LXNA 3VBVA 2WGJA 3RBWA 3UE4A 5L6OA 4KBAA 1G3NA 2Z2WA 3LFAA 4IX4A 4ALVA 3DPKA 4QTBA 3UIXA 4DEDA 4RC2A 2H96A 4RA4A 3E8NA 5E8SA 5HTBA 3NW7A 4XLIA 3BHYA 3POOA 3RK7A 3UVRA 4E5AX 2OJ9A 2B0QA 3FXXA 1UNGA 1YDSE 4LRJA 4BCJA 4H3PA 4IIRA 2XNOA 3CKWA 4FIEA 1WVXA 1J7IA 4X6QC 4P7EA 1REJA 3DLSA 4GJ3A 2YAKA 4DEEA 1NT2A 4IM2A 2CDZA 3PA3A 4RVMA 1RQQA 4QMPA 4D5KA 4X3FC 1WBSA 3UBDA 5JT2A 3OHTA 4LOPA 5HCXA 5FTGA 1H07A 4MNFA 3W2RA 2E9PA 2WXVA 4JXFA 3CQWA 3TIYA 4CFUA 3BU6A 4GCJA 4D4SA 2CN5A 2UW9A 5E4HA 4FNZA 3NNWA 3PG1A 1PXLA 4BC6A 3BBWA 2DWBA 4YBJA 1Q99A 3GVUA 4LRKA 4PDSA 4FE2A 1Q3WA 5CEPA 4AT3A 5B2LA 3IS5A 3HYHA 3TV6A 4ZJVA 4QMMA 2X2KA 3FMMA 4RJ5A 5H9BA 2Y6MA 1Y8YA 1MRVA 3QHWA 5KHWA 3QTQA 3CY3A 1GOLA 2UZTA 2WMXA 4ANBA 5IA4A 3UOJA 5C1QB 4NZWB 2QVSE 3EKKA 1RW8A 2R3HA 4N70A 3RINA 5L6WL 3EZVA 5LXMA 3DCVA 3PY0A 1H01A 4GK4A 3UP2A 4EK3A 3BYVA 3PXQA 5DN3A 4NUSA 4MXXA 4FYOA 2W7XA 5CX9A 4CCUA 4Q2AA 2X9EA 3C4FA 3GCVA 4PL3A 4RJ8A 5F20A 4ZTSA 5I3OA 1Z9XA 5J5SA 2QODA 2IVUA 4K6ZA 5DGZA 3CQEA 2BRHA 3UIMA 1CDKA 1QPDA 4M67A 4M69A 4LL0A 4QMWA 1URCA 1XH6A 3SC1A 5JRQA 2C69A 5IQGA 3AD4A 2VTIA 1UU9A 2VTQA 5IQIA 4UXQA 3QX4A 1ZWSA 4QMZA 2BMCA 2EXCX 3H9OA 4FKQA 4GYGA 3MTLA 4RPVA 1YHWA 4K8AA 4JR7A 3G0FA 4G3CA 5HCYA 2W96B 2J5EA 3TZ8A 4QNYA 4S30A 4LMNA 4ANNA 3TDVA 3TIZA 4F9BA 1KE8A 3GU5A 4DITA 4CT2A 4FSRA 4F0IA 2R3GA 3GFEA 5HVYA 5K3YA 3DAEA 3NZ0A 3FMNA 2UW3A 3P7AA 3LJ2A 3TUCA 3CPCA 3F7WA 5AJQA 3QLGA 3HAVA 1Z57A 2A1AB 4I1ZA 2XBAA 3UNJA 4BBFA 2QOFA 4NW6A 2QC6A 4BDGA 2C6DA 4DTAA 5FDPA 3VW6A 3T3UA 5B0XA 4W4YA 5DHJA 4E20A 2CSNA 2ONLC 3I7CA 3GT8A 2WTJA 2BKZA 2GNIA 4G2FA 4IXPA 4DH7A 3GU8A 2VWXA 2W1GA 1LP4A 3LFFA 3MN3A 3ZLYA 3TDWA 5CYIA 4Q5EA 4QYFA 3ITZA 4D2SA 2JKOA 2XNNA 1Q8TA 2ZMDA 1PKDA 1VJYA 4RA5A 3T9TA 3QCQA 3ZBFA 3F88A 5CAPA 3KRJA 4YSMA 2C5OA 2B52A 1OPLA 1U54A 4D2PA 1J7UA 5A14A 2JFMA 1UU7A 3DZOA 4TYEA 1FINA 2UZUE 3ZLWA 1OIYA 3MVJA 4FVQA 5FUTA 4LI5A 3BHUA 4TYHA 2Y4IC 3QQJA 3MFTA 2FSMX 3BYSA 1BI7A 4BWKA 4BDIA 1T45A 2HELA 4KKGA 4DFXE 2E2BA 3LOKA 3OT3A 4QYEA 2PZ5A 4YHFA 4EOMA 2P55A 1Q24A 3QWKA 3UIBA 4CZTA 1XH5A 4BCGA 1GZ8A 3OCBA 2PVKA 3ALOA 1JVPP 4FEWA 4WSQA 4GG5A 3EL7A 2ITOA 3PP0A 4I4EA 4KD1A 4HYIA 1H1PA 4JIAA 2YM8A 2YWVA 3AT3A 3ZUVA 2C3LA 4RJ6A 4HGEA 3Q4UA 3FKOA 4GKIA 2JKMA 3ENMA 2BIKB 3ZO4A 2I0VA 2FA2A 4FTNA 3C5UA 3V5WA 1O6KA 4IAIA 2YACA 4Y46A 2J51A 3OWPA 3R02A 2ITWA 4NTTA 3RHXA 4JX3A 2DS1A 2CPKE 3D5VA 3NDMA 3VAPA 2J0IA 5IQCA 2QO2A 2VTTA 3EQGA 2PK9A 4G31A 2CKQA 4O0RA 4PMTA 1MP8A 2X81A 3UC3A 3FSFA 3IDPA 4PV0A 3SXSA 2OW3A 3ZTXA 2PZYA 3BELA 4GMYA 3U87A 4EK8A 4DC2A 2RIOA 1ZMUA 3VVHA 2J5FA 3R8UA 4R7HA 3JY9A 5HVKA 5A6NA 1PMNA 3VRYA 4RJ7A 3RNIA 4QQTA 2XYUA 3GCPA 3QKKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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