1REJA

Crystal structure of camp-dependent protein kinase complexed with balanol analog 1
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
335
structure length
333
Chain Sequence
KEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Mus musculus
publication title Balanol analogues probe specificity determinants and the conformational malleability of the cyclic 3',5'-adenosine monophosphate-dependent protein kinase catalytic subunit
pubmed rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase, alpha-catalytic subunit
total genus 104
structure length 333
sequence length 335
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2003-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1rejA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1rejA02
3VF9A 4M3QA 3R2BA 5FDPA 1XKKA 3IS5A 3ORIA 3C5UA 3DXNA 5E8SA 3S1HA 4F09A 3CEKA 1Q8UA 2QR7A 4J53A 4LI5A 4NTTA 1OECA 1L3RE 3JPVA 4O21A 3G9NA 4F6SA 4DA5A 2P2IA 2XKFA 3HMOA 1EH4A 2WMWA 4NM3A 4H39A 3V5WA 3FJQE 1PXJA 2W1EA 5EI2A 4KAOA 2QURA 3OD6X 3NWWA 3A7FA 3MFTA 4HJOA 4NJ3A 5CZIA 5GZ9A 4CT1A 5CEKA 2YM3A 2PZRA 4DTKA 5M08A 2FGIA 3DAJA 4HNFA 2QKRA 5CEOA 5JZJA 5KUPA 4EYMA 1Z9XA 4NFNA 4QQ5A 2BZHB 5BUJA 2NP8A 1FVVA 3D2KA 4KINA 1YKRA 1Q61A 4DHFA 5A14A 4ZSLA 1MRVA 1YOLA 3GNIB 4IJ9A 2UW4A 3A99A 4LRMA 1WBTA 1TQPA 4LL5A 5HD7A 4UV0A 4IM3A 5EDQA 1M2PA 4MD7E 2RF9A 3FMNA 2UW6A 2WMUA 4I0TA 4D2WA 3BYOA 4LUEA 3T3UA 1ZZLA 2W9ZB 3N4VA 3SAYA 3ETAA 3KK9A 5DPVA 3ENMA 5HNBA 4ANQA 5I3RA 4K6ZA 1V0PA 5IKWA 2X6EA 1Q99A 2OIDA 3MY1A 4QRCA 4G5JA 2HZNA 3ATTA 1ZMUA 1VYZA 5J7BA 4YHFA 4JS8A 3ZDUA 3TV4A 5FM2A 2OW3A 3GC7A 4N6YA 4RIXB 2DQ7X 4EZ5A 4GFMA 4AQCA 2GS6A 2PMLX 2PVYA 2Y6MA 3PP0A 2HXLA 4RJ5A 4YZNA 4QMQA 4IDVA 3Q5IA 5DR2A 4USFA 5L8KA 2B9JA 5HLWA 4ZTQA 3MYGA 4E4XA 2XKDA 4BDCA 1JOWB 2J5EA 3HAVA 3H9FA 3BPRA 4BTKA 3IW4A 3PRFA 2F49A 2ZV7A 4YC6A 2CKPA 4ZY6A 3PIYA 3QLFA 3U9CA 3VS0A 4C36A 3MA6A 4X2JA 5A46A 5J79A 4C4JA 4D4SA 3CD3A 5L6WL 4W4VA 3GI3A 3TXOA 3RK5A 4X2NA 3SKCA 4C2VA 4HYUA 2Y9QA 3VIDA 4DINA 5J9LA 1UWJA 3UZTA 4O7ZA 5GIOE 2B4SB 5FG8A 4YZCA 3RTPA 3EWHA 3QC9A 4EI4A 5KMMA 1GIJA 4I4EA 2XNBA 4BTJA 2YIQA 4HYSA 4MF1A 2JC6A 4M69B 2UW5A 3W32A 4GG7A 1JBPE 4F7SA 4QP1A 4QTCA 4GCJA 4HNIA 3IECA 3PG3A 4F4PA 4D4RA 3NYOA 5DBXA 2UZWE 2VU3A 4MAOA 3W2QA 1OBDA 3B8RA 3GU7A 4NKSA 3PZEA 3QRIA 3E3PA 3T3VA 4EHVA 4GVJA 3K5VA 5HOAA 1PYEA 4FEQA 3ZOSA 3LCTA 4G34A 4B6LA 4FTQA 3EN7A 1QL6A 1ZLTA 3RPYA 1FINA 4OTHA 3WOWA 4JJRA 3LFDA 1R3CA 2JLDA 4FSQA 2C5NA 2XB7A 3DJ7A 3MFUA 1Q5KA 1ZARA 2O2UA 3FI8A 3R0TA 3VUMA 4GK2A 5HE1A 5EYDA 4ZJVA 4X2GA 1J7LA 1W83A 5CI6A 4FF8A 4E20A 1CM8A 4ZS0A 4R3RA 1XH4A 1VR2A 5ITAA 2Y0AA 2F2UA 2ITZA 4FKQA 5CF6A 3T9IA 3MSSA 4EH5A 5EW9A 4C35A 3UE4A 5HI2A 4FZ7A 3TG1A 3MJ2A 3IO7A 4DH5A 3EJ1A 4U42A 3CGOA 2ITXA 4FSTA 5HHWA 3UNJA 3DLZA 3C4FA 1ZOHA 5M4CA 1H0VA 3F5XA 4BZOA 4N4SA 3VN9A 2H9VA 1LEZA 3RBWA 2PVMA 2WU7A 4BCNA 2I6LA 2YWPA 1OIRA 1REKA 4FBXA 5CZHA 2C0TA 2CN5A 4GSBA 4QMNA 2YABA 4U41A 3W33A 4OBOA 3O2MA 3OY3A 4GYIA 4ACMA 2R7IA 4JQ8A 1WCCA 2VWYA 1YHVA 3H0YA 3HRFA 3COKA 3GC0A 1WBWA 5BYZA 3GUBA 3D9VA 2QOKA 2Q0BA 4IW0A 4F65A 4PY1A 3R8VA 2J2IB 3DXQA 3VQHA 4KA3A 3KRXA 4RWLA 4YZBA 4Q5EA 5AR5A 5E4HA 3RHXA 2PMOX 4BR3A 5DYJA 1JPAA 4NIFB 4O0RA 2GMXA 3KXZA 4ZTLA 2GU8A 2W1DA 4IQ6A 3CJGA 2XH5A 5EI8A 5IDNA 4YLJA 2NO3A 1NXKA 3D7TB 4X2FA 4JT3A 1B39A 3R9OA 3OWPA 3LKMA 4BY9E 4DH7A 4RX7A 4FKVA 2ZJWA 5EQYA 3QU0A 2XBAA 4J1RA 2HY0A 3C7QA 3TV6A 1Y8YA 4IX6A 3U6IA 5DI1A 1HCLA 2QOCA 3AMAA 2G9XA 1XBBA 3R1SA 4BN1A 2XNEA 3KXHA 2QVSE 5HX6A 4O83A 4EWHA 5CF8A 3FAAA 2WMQA 4D0WA 5L2QA 5L8JA 4TTHB 1J7UA 4BCKA 2XYUA 2YCFA 1H08A 2VRXA 1BMKA 3OS3A 4DEEA 4RC4A 2GQRA 3QA8A 5CX9A 5LMKC 3WIGA 2W1IA 3OCBA 2O5KA 1VYWA 4BDEA 3W18A 1A06A 3DTCA 3NMUF 3ZXTA 4FZ6A 3O23A 3SG8A 5IZFA 3A8WA 4C3RA 2OGVA 3QTQA 3FPMA 3UZPA 3L9NA 3N9XA 4DE4A 3E62A 3R22A 2VO0A 3V5TA 2HW6A 3AG9A 3ELJA 3UOJA 4JIKA 3POOA 5EM6A 4FZFB 2I0EA 2O65A 4LQMA 2UZBA 5IU2A 1BLXA 4G3EA 4PWNA 3UGCA 5AFVA 4TWPA 4BCQA 3RM6A 3LLTA 4FNZA 3A62A 3FLYA 4C61A 2GTNA 5EW8A 5CF5A 3U9NA 4B7TA 3BLRA 4ZK5A 4AW5A 4FTLA 3PXZA 4BDFA 1R39A 3LFBA 4DG2E 3F5UA 2OU7A 4IB1A 1DM2A 1IEPA 3ULZA 4FG9A 4U7ZA 3QA0A 5CY3A 1UKIA 3R8PA 3TKHA 1CSNA 4ITJA 2O64A 4D5KA 2FSOX 3PXFA 4G6NA 4YURA 3PVBA 5IUGA 4Z7GA 4FG8A 3QCSA 4CFFA 1CDKA 3FPQA 4Z55A 4IAYA 3F9NA 4DGOA 2JFMA 1SMHA 5HLNA 3EZVA 4FTAA 1IAJA 1WBPA 1P4FA 3Q52A 4M97A 5E8TA 4EYJA 4DTAA 3OC1A 4A9SA 4M68A 2BRBA 4BDGA 3UDBA 3HA6A 2FSMX 4IMYA 3AC2A 4E8AA 3NRMA 4G16A 4D2TA 3LOKA 5HO8A 3D0EA 2C4GA 4M12A 4HZSA 3F66A 3NIEA 2XBJA 4U9AA 3SQQA 2W5AA 3HKOA 4IANA 1O9UA 4F99A 2XK4A 1IG1A 5LVPA 1SZMA 3RK7A 3QZIA 2R3PA 4MXXA 4ITHA 3SG9A 4TNDA 5T3QA 3PE2A 2Y8OA 3LE6A 3HL7A 4M67A 4OW8A 5IUIA 5ACBC 3RINA 2VWIA 4CCUA 5AP0A 4EOQA 5IQCA 3QQLA 2C3KA 3BU3A 4I1ZA 2WZJA 2CLXA 2UVZA 4H3PA 5TR6A 4L3LA 4UMTA 2VGOA 4P4CA 1UVRA 1IA8A 1GIIA 1Y57A 4HVIA 4Z3VA 5D9HA 3LM0A 4L7FA 4U44A 5I9ZA 4DLIA 5JFXA 2V7OA 3RNIA 2R7BA 3RVGA 2PUUA 3UOLA 3CQEA 3ZUTA 5BX0A 4D2PA 4CKJA 4FT5A 3OZ6A 2CGWA 3ZDIA 1WBOA 1ZRZA 2VNWA 5FEEA 3TUDA 2R3KA 3KCKA 4FV9A 3RPRA 3L8VA 5JSMA 5J8IA 5L2WA 1ZAOA 1M14A 2BTRA 5KBRA 3M2WA 4M14A 5IQDA 5EYCA 3KN6A 2HENA 1RE8A 2C3LA 4D28A 3D2IA 4FNWA 4DYMA 4EOIA 5L4QA 3AC3A 3C4XA 4UMRA 3LW0A 4QYFA 4L3PA 2PSQA 4JBVA 2ZMDA 3OT8A 4UN0C 2WMRA 1APME 4JR7A 3ROYA 3VS6A 4R6VA 1J91A 1W7HA 4TN6A 4TNBA 4EK5A 3OCTA 1JKKA 1GZ8A 2VTLA 4FL1A 4L53A 2XK3A 2W1GA 3WZJA 3C4WA 5CAVA 2YJSA 2YM7A 3ZLWA 3E8CA 3L8PA 4Q5HA 4KUJA 4L68A 3MB6A 3MGYA 2O0UA 4W4XA 2WTVA 2X7FA 3GU4A 4GK4A 3ZYAA 3TTJA 5F9EA 3BEAA 3R6XA 4CYJA 2B9IA 4G5PA 3Q32A 3UJGA 4PL3A 4HGTA 4D1SA 3R8LA 4F0IA 4TYHB 4YJSA 5GNKA 5K0XA 2J90A 4YLLA 3QQFA 5AUXA 3AC1A 3JS2A 1XQZA 2UZVA 3V01A 1GJOA 1YHWA 3MPMA 1OIYA 5KHWA 4HVSA 1YWNA 2UZDA 5CAQA 2ITOA 3QD4A 4C4IA 4RA4A 4UWBA 2JEDA 4E1ZA 3LQ8A 4ALVA 2YHVA 5CQUA 3KMMA 4E4LA 5CSPA 3TIZA 3DKGA 1XBAA 4YNEA 4O86A 4MHAA 1PXOA 3SXSA 4LGHA 2W1CA 3LCDA 3KCFA 2GNHA 3QGWA 4HGEA 3IDPA 4FKWA 4PL4A 3ZM9A 3I0OA 5EOBA 3NDMA 3P9JA 5KZ0A 5AV4A 3ZO1A 4RC2A 3EQRA 5JEBA 5JFVA 1Q62A 3DBCA 3ORZA 4BICA 1BI7A 5DN3A 4GU9A 4U3YA 3ZXZA 3G15A 4XCUA 4GV1A 5L2SA 2W4KA 4QMMA 5J5SA 3GFWA 5GIPE 4E6AA 1HCKA 1G5SA 1YW2A 3WILA 1OM1A 3WYXA 2CJMA 2PK9A 2RG6A 5HKMA 3QTXA 1XR1A 4FL3A 3VUHA 4IXPA 3RAHA 3EFJA 3ERKA 2WO6A 3A2CA 1NT2A 2CNUA 4QNYA 3TJDA 4RIYA 1XO2B 4O0UA 1TQMA 2QLQA 2YJRA 3FZTA 3NYVA 2XNGA 2P0CA 3BV2A 3RALA 3ZRMA 3O51A 4IAZA 3LHJA 3UZRA 5AP2A 3W2RA 4U79A 2BAJA 4U40A 3QCXA 4GT3A 2CGXA 3F5PA 4KIKA 2R3JA 5D1JA 2XIXA 3UIMA 4FT3A 3COHA 2OICA 4II5A 5L6PA 2UZOA 4MWHA 3JVSA 2QOOA 3FMKA 4L52A 2G1TA 3ALNA 3R8UA 5I0BA 3FY2A 3KRLA 3R04A 3AMYA 4MXOA 5HBHA 3FLNC 4IDTA 4AGCA 5JN2A 5IG1A 4S32A 1H00A 4EH6A 1ZYLA 4P5ZA 2HWOA 4IX4A 2G15A 2X4FA 5AP3A 4JAIA 4O0WA 4O2PA 4EORA 4O0SA 4YP8A 4RFMA 5J9ZA 4RQVA 2YACA 4NUSA 2CDZA 4IFGA 3I6WA 4XOZA 3RPOA 3PJ2A 3HNGA 2VWBA 1PMEA 5JGDA 2RFNA 4U6RA 4O0TA 3VUTA 1XH9A 4MXCA 5AMNA 5L8LA 2GFSA 2SRCA 4IVBA 4BI0A 4QYEA 2WGJA 5IQGA 3MA3A 4XEYA 4RJ7A 4ACHA 3QKKA 4FUYA 4ENXA 3VHKA 4CFWA 2C6OA 2BFXA 4XYFA 5D7VA 5L6OA 5JKGA 3HP5A 1ZY4A 4CKRA 5A3XA 4YHTA 4BCFA 2IW8A 3TNHA 2CGUA 1URWA 1M2RA 1OITA 2IJMA 5HIBA 4C2WA 3QUPA 4J52A 3HA8A 3RZFA 4BWPA 1BYGA 2ITWA 2OF2A 4G3GA 2C6EA 4Y95A 1L8TA 3WI6A 4RMZA 1GOLA 1OL2A 4W4YA 5HG5A 3W55A 4C7TA 4CYIA 4R7HA 4ZTMA 3GCVA 4EJNA 4JQEA 2PHKA 4WSYA 4EZ3A 2VTRA 4FKTA 3DKFA 1YI3A 3OTUA 3E3BX 3HECA 3EL7A 3PSCA 4UYAA 1PRYA 4ANMA 3K2LA 1XH8A 3KF4A 1O6KA 3NYNA 5A4TA 4D55A 4MD9E 1FGIA 3FXWA 4A4OA 4C59A 4AOIA 4EBVA 2R3QA 4IVDA 3UMXA 3FKNA 4I6QA 4Y5QA 2A27A 5BUEA 2Z7RA 4LG4A 1H01A 2OI4X 2XJ2A 2Z2WA 2QCSA 5IISA 2R3GA 2XA4A 3L9LA 5CLPA 4BVUA 4IX3A 4ZSAA 5CSVA 3EB0A 4TW9A 3FQSA 3PSDA 3QXOA 4KIQA 4IM2A 4RFZA 3BGZA 3QF9A 4FKLA 4IE9A 3HV7A 4MWIA 2VTMA 3TTIA 2VGPA 2WD1A 3DNEA 2ACXA 5TO8A 4X21A 5JQ5A 3AT4A 4IZYA 4CSVA 4BCHA 4L67A 4D2RA 4EHZA 3DB6A 4ARKA 4F0FA 2CKEA 5EQPA 5AR4A 4A4LA 1IRKA 5IEVA 3ZLXA 2QD9A 1UU9A 2YERA 2Y4PA 4DFBA 4HGLA 3PSBA 3MVLA 5HGIA 5KBQA 5KHXA 3DNDA 4DH1A 3OXTA 4J98A 3WZEA 4ZXTA 4GEOA 3PWYA 5IMXA 5JQ8A 2X9FA 3UG2A 4AN9A 3I5NA 2WIPA 4QD6A 5I9YA 5AAFA 2FB8A 2ITPA 3KU2A 4IC7A 3PVWA 4QMVA 3WF7A 2Z7SA 4O7YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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