4O96A

2.60 angstrom resolution crystal structure of a protein kinase domain of type iii effector nleh2 (ecs1814) from escherichia coli o157:h7 str. sakai
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
163
structure length
163
Chain Sequence
KSPVPGNVIGKGGNAVVYEDMEDTTKVLKMFTISQSHEEVTSEVRCFNQYYGSGSAEKIYNDNGNVIGIRMNKINGESLLDIPSLPAQAEQAIYDMFDRLEKKGILFVDTTETNVLYDRMRNEFNPIDISSYNVSDISWSEHQVMQSYHGGKLDLISVVLSKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Type III Effector NleH2 from Escherichia coli O157:H7 str. Sakai Features an Atypical Protein Kinase Domain.
pubmed doi rcsb
molecule keywords type III effector protein kinase
molecule tags Hydrolase
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 47
structure length 163
sequence length 163
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4o96A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4o96A01
2P3GX 1ZY5A 4W4WA 3UIXA 4WG5A 2X1NA 2XKDA 4RIXB 4GRBA 2OFVA 5C8NA 3PXRA 3QD3A 2FB8A 1SVGA 3KXXA 3LMGA 4DFUA 4KKGA 4Y85A 5CEMA 2BRNA 2WQEA 4PF4A 1ZYCA 3GU4A 4NTTA 4I3ZA 4H1MA 4N6YA 3AD6A 3PA3A 2WZJA 2YFXA 3NYXA 4FG8A 1CDKA 2C6TA 5JFXA 4M3QA 2OLCA 3F2RA 5ACBC 4IM0A 2QLQA 1WAKA 3OWLA 3EZVA 4QMUA 2HWPA 4CFXA 5EFQA 5TOZA 4XS2A 2WIHA 2UW7A 5BUIA 3DV3A 2YITA 3BU5A 4YO4A 4KIOA 4A06A 1QMZA 3HV5A 3QTWA 4YPSA 1I44A 4PTGA 4FSYA 3FHIA 1CM8A 3LQ8A 4BI2A 3FLWA 3MIAA 4HYUA 3B2TA 3MTFA 5LXMA 1YHWA 5AAGA 3MV5A 4U40A 4I23A 4MQ1A 4J1RA 4DEDA 4XOYA 3TNWA 3P7CA 3LM0A 2HZ0A 2NRYA 3O8TA 4ZIMA 1TQPA 5EHYA 3ZO2A 1PW2A 4QMWA 3QKKA 1U5QA 5EM6A 1GOLA 4AUAA 2WOUA 3RM7A 2YHVA 5A4CA 3ZEWA 4NJDA 2XYUA 3F82A 5CF4A 2R3PA 3GU6A 4QO9A 3AC4A 5HG7A 4U8ZA 3KKVA 4WA9A 3ZMMA 5FBNC 5CAOA 4KWPA 2XJ2A 5A14A 4DG0E 3K3JA 5LVLA 4J71A 2W1FA 2X8DA 3RPRA 3ORNA 3TKIA 4GU9A 3PJCA 2YCFA 1YDRE 3WILA 4ZSEA 3P78A 5AUWA 4IX6A 4L9IA 2WMTA 5AP5A 3Q9WA 4ACMA 2C6DA 2I0HA 2XNMA 4ZAUA 5FTGA 4WUNA 4BIBA 1OI9A 3DU8A 4MNEA 4O27B 5DR9A 3R2YA 5ANDA 4UWBA 3REPA 3UZTA 4F65A 3VQUA 4XOZA 3V8WA 4L45A 3R9NA 2UUEA 5TKDA 3NUAA 5IQBA 3TKHA 5L8JA 1ZLTA 4DEBA 3QZGA 4ZMEA 1VZOA 4MD9E 3UO6A 3IDCA 1J7UA 1KE6A 2IZUA 5BVOA 5IPJA 2VD5A 5JRQA 2JD5A 5K0XA 3LIJA 3NNWA 3O7LB 4G6LA 4ACCA 1KUTA 3RMFA 4YHFA 3WIKA 4U45A 1J1CA 2OWBA 3BHHA 3IK3A 4QP4A 3WZEA 3S2PA 3MVLA 3CGOA 5AP0A 3K2LA 2BAQA 4JX3A 5ANEA 5ETAA 2Z7LA 4F9YA 5J1WA 3P4KA 4PL4A 3QZFA 4ZY4A 3HGKA 5FWKK 3NAXA 2I40A 2IZSA 5CS6A 1OL7A 1JKLA 2R3OA 2XNPA 4FTRA 1BI7A 3RAIA 3DPKA 3TM0A 4FV0A 4MNFA 1GY3A 3UP2A 4QYGA 5EKOA 3RAKA 4MBJA 4H1JA 2YIYA 4WBBB 4UYNA 3FSKA 2P4IA 3QBNA 2PSQA 5K4IA 4EHEA 2ZM1A 4RG0A 4EK4A 4YO6A 2OJIA 5IF1A 5TF9A 1MUOA 4ZP5A 4BDIA 3UOKA 5CAVA 4PPCA 2JIVA 4AZSA 5BNJA 3IW7A 4HNIA 3D5XA 2WTKB 5HCXA 1ZYSA 3DAEA 1MRYA 1UV5A 2QOOA 4K8AA 4D5KA 4DC2A 2RIOA 2GDOA 3NAYA 3SQQA 4JX7A 1BKXA 2PMNX 5C26A 3A60A 3HZTA 4GKIA 3ZBFA 1RDQE 1Z5MA 4JL9A 4GMYA 4R1VA 3C4XA 5D9HA 3FL5A 4XV1A 2ETKA 3KN6A 1PXLA 4LI5A 1ZWSA 4UB7A 5A54A 5DEYA 4C3FA 4HVIA 2FSOX 5IA2A 4KB8A 5JGAA 3UODA 1P14A 3GXLA 4ITHA 3TKUA 3WZKA 4AW1A 1GJOA 1DM2A 2DS1A 4QP9A 2JIUA 3TDVA 1UU8A 4IVBA 4A7CA 4C2WA 5L6PA 3JXWA 3ODYX 3QC9A 3SW4A 1FGIA 3HVCA 3EH9A 5LMBA 3DQXA 3PVBA 4I6BA 1W82A 2OJFE 5FGKA 5CEQA 3S1HA 3WZJA 3Q53A 4ZTHA 3QC4A 4L68A 3M11A 4WRSA 5M08A 2ITUA 4GJ3A 3BLHA 4DGMA 4UBAA 2BAKA 4HJOA 4AXAA 4B4LA 4F9AA 3QA8A 4BWPA 5C8KA 2X4FA 4FIGA 3VIDA 1SMHA 5GIPE 4QP3A 3KF4A 4CFFA 4KS8A 1BLXA 5BYZA 1MRUA 4GK3A 3R83A 4RMZA 2FO0A 4G16A 4EH6A 4HCTA 3UQFA 3KU2A 3V5WA 1J7IA 2ZV8A 3HV6A 4GG5A 4EOLA 4ANLA 2ZM3A 3R9DA 5CVHA 1WBVA 2QOIA 4E5BA 4PDOA 3R7EA 3ZSGA 3NRMA 2GQRA 3QQHA 4JI9A 5KBQA 1YWNA 4BFMA 5CVGA 4EK8A 4RSSA 4YSJA 1M52A 2OIBA 4DE4A 5T3QA 4MTAA 2B54A 1URCA 4FVRA 4GK2A 1BL6A 5K4JA 3C7QA 2YLFA 5HESA 5BVNA 4AZVA 3WZDA 3OXIA 1G8AA 3DXQA 3ZC6A 3KULB 3P23A 5KMOA 4APCA 4GW8A 1ZXEA 4Z9LA 3ZTXA 4YTFA 3FI8A 3Q5ZA 1REKA 2WEVA 4EHVA 2YM7A 3VBQA 5KMIA 1KE7A 2X6EA 2YZLA 2VWXA 3D5VA 5JRSA 3U9NA 5IQAA 1ZYJA 3ZU7A 1U4DA 4OUCA 3D0EA 2ITOA 3ERKA 4XP0A 2ITYA 4YLKA 2QOKA 3GBZA 1CMKE 3CE3A 3JYAA 3BHVA 3WYYA 3QALE 3QRIA 4F6WA 3EN4A 4JJRA 4QP2A 2W9FB 2DQ7X 4EOSA 4FKIA 2YJRA 5CZHA 4ASZA 3S95A 4QP6A 2PYWA 3R8UA 2OW3A 4ITJA 4O96A 2Y7JA 5GZ8A 5IMEA 2W4KA 3MH2A 3NW5A 3H9FA 5HLNA 3RINA 3HLLA 4FEWA 4DH7A 4TZRA 4O7ZA 4FTMA 2O0UA 3BQCA 1J1BA 3D94A 3I6WA 4L44A 5L2SA 3HMIA 4FSUA 4OBOA 1GIHA 1WVXA 5DVRA 3UMWA 3CCNA 4O0RA 4XX9A 3AGLA 4D9UA 4UMPA 3FKOA 3SRVB 4CTBA 2R3FA 4HGLA 4S30A 2WFYA 4RJ7A 3ZDUA 3NX8A 3SRVA 1H1WA 2YDJA 3CLYA 4AT3A 4P5ZA 2XVDA 3NZ0A 4BCHA 3JUHA 3FZRA 4NFMA 3UYSA 4FTOA 3RHXA 3MYGA 3AGMA 4FKUA 3BELA 3R7YA 5ICPA 4FTIA 2R0UA 5FRIA 3PXZA 4F64A 3FMDA 4S33A 4B9DA 2GNJA 3R0TA 2VUWA 4RFZA 3TACA 5IQHA 2VAGA 1DI9A 3NYVA 2UV2A 5L2QA 1G3NA 4R5SA 1YI6A 3A4OX 2NRUA 3G2FA 1H1QA 4C4FA 5JK3A 2E9NA 5AM6A 4IW0A 3QD2B 4OLIA 4FKVA 4BBMA 4CZYB 4QMTA 2C5OA 4PMSA 4WNMA 5CAQA 3GGFA 3CIKA 1W98A 1T46A 2QR8A 3D7ZA 1UNHA 4D58A 2HWOA 5CNOA 4KD1A 4G34A 4YHJA 1H27A 1JQHA 3U6IA 3FAAA 4QYFA 2C3KA 4FGRA 3Q9ZA 2KTYA 1PMNA 3FMMA 1ZYLA 3MVJA 2ITQA 3OWPA 1M2RA 4U97A 4F7JA 3GENA 5HZNA 4CV8A 4RBLA 3HV4A 2G15A 4HPTE 3P08A 5ANJA 5BX0A 4XEYA 2YN8A 3UNJA 4IB3A 3UIBA 2VTQA 4BDJA 2WB8A 4C38A 5M56A 4CGAA 4FGBA 4RJ4A 1ZYDA 3V5LA 5CAUA 3EHAA 2W4OA 5CSVA 2HW6A 3CTHA 3DKFA 2FH9A 2ZMCA 4ALUA 1CTPE 2YM4A 3GB2A 3UDBA 2WMAA 4DFBA 1YDSE 3SD0A 5JMSA 3P86A 4Q2AA 5IA1A 2PVYA 1F3MC 4DA5A 1U5RA 1VEBA 3FMHA 2W4JA 2PPQA 3FHRA 3N4UA 3NVMB 2VNYA 4C57A 4FT9A 2WMVA 3PFQA 4O6EA 2CPKE 1YQJA 1Q3WA 2W0JA 4GT3A 4IAFA 2JKMA 5L3AA 1OUKA 2WQOA 2RSVA 3BE9A 1CKIA 5AIRA 4A9SA 3RCDA 1RQQA 2RGPA 3QLGA 4IDVA 3PJ1A 4BC6A 2Q0BA 5CVFA 4HVHA 4ZTMA 4BCNA 5LARA 2BDJA 4JQEA 5DFPA 3PJ8A 4YZDA 2ZV7A 3MI9A 3MY5A 3QTSA 4LG4A 4XP3A 4UZHA 3OC1A 4O1OA 1Q8TA 3IOPA 3FXWA 3V3VA 3F88A 3B8QA 3VO3A 4JBVA 5EDPA 4BI0A 1B38A 3I6UA 2WTDA 2RFEA 2JLDA 5JQ5A 2JDRA 4BZDA 4IDTA 2G1TA 3PRIA 3N4TA 4FZ6A 1M2PA 1OL5A 5HG5A 2ERKA 4NM5A 1XJDA 3RZFA 3EFLA 1YKRA 4PRJA 1L3RE 2JDVA 4XRLA 4BYJA 5I5ZA 3II5A 5LQFA 4BDGA 2E9PA 1RJBA 3VS4A 4RWKA 2E9UA 4V05A 5CNNA 3RPYA 3V04A 3ROCA 5IA4A 3HRBA 3KRXA 3MDYA 3QGYA 4I5CA 2RFDA 4NK9A 3ZYAA 4BHZA 4HYIA 4D2PA 4EC9A 1CKJA 4E7WA 4CMOA 2W5HA 3G33A 2I1MA 3IPHA 4L00A 3DXPA 1MRVA 4LOPA 4QQ5A 4CQEA 5DI1A 2VTOA 3AMBA 2WTJA 2EB2A 2GNIA 3ZLXA 4ASDA 2OGVA 3POOA 4WG3A 1V0OA 3NVKI 3TNIA 5H3QA 4ZLYA 3A61A 2BZJA 5FXQA 2OZOA 4QTAA 5CSXA 5J5TA 4IWOA 5CXHA 2F2CB 3FMKA 3I5ZA 4YJTA 4K18A 2JEDA 2OZAB 3PY0A 3U51A 1R1WA 5EK7A 5CQWA 4PDSA 4R3CA 3D7TB 1OITA 2OZAA 5HE0A 2VTIA 4TXCA 3PY3A 4JQ7A 4AN3A 4IVCA 3F3ZA 4UALA 3UQCA 4X3FB 2QURA 3Q9XA 3RK9A 3SG9A 5IQCA 1LEZA 3PPKA 4MXZA 4AW5A 1KV1A 5HE2A 4D4SA 2X81A 3F61A 5HE3A 5CU2A 1VYZA 3DB6A 3O7LD 5GJFA 5E8UA 1GIIA 2C0TA 2EXCX 3R21A 1W7HA 4LRMA 3TZ9A 4G3CA 3QRUA 2XK8A 4X6RA 3W2CA 5KUPA 1OUYA 4FTLA 1PMEA 4QMSA 1UU7A 3QYWA 3RM6A 2ZB0A 4MXYA 3MSSA 4UXLA 4IJPA 4NCTC 4F1OA 4FEVA 4D0WA 4NUSA 3EQIA 3R7UA 3E3PA 4HVSA 4FNWA 1KOBA 4NH1A 4NM7A 5FTQA 2OJJA 3C9WA 4B8LA 2WD1A 4D4VA 1YVJA 4GUEA 3COHA 4I6HA 4CFUA 3D4QA 3ACKA 3FL4A 4L43A 5D7AA 4AU8A 1OPLA 2EU9A 1VR2A 1BUHA 2XUUA 2VGPA 2X6DA 4V0GB 2ETRA 5ETIA 5AUTA 3PP1A 1QPCA 3N9XA 1GAGA 2BTRA 3CY2A 5CEKA 1H24A 4P4CA 4AW0A 3F3VA 1SVHA 4DBXA 4O7WA 5AUVA 5J87A 3FE3A 4TWNA 5M55A 3COIA 4MCVA 3ID6C 4QOXA 4JOAA 3AMYA 2J0JA 4IJ9A 1V1KA 3NIZA 4X0MA 4GS6A 5KHXA 3HRFA 4D2RA 1H00A 3QD4A 3IECA 4XBUA 5J7HA 3VW6A 4ZLZA 3R01A 3D15A 5M4UA 4EH3A 1NVQA 5IQDA 1Z9XA 3H3CA 4EHZA 3ANQA 3E93A 4LV5A 4OTGA 4FSTA 2XS0A 2HELA 4I5MA 2WPAA 3L8SA 5DR6A 3LFSA 3K54A 4Y72A 4JG8A 4RWIA 4HZRA 3H10A 4QTDA 3G6HA 2XK4A 4E4XA 1YRPA 2YAAA 1XHAA 2YM6A 3LFFA 4QYHA 2UVZA 3FLYA 3R8VA 4DG2E 2BIYA 2Y6OA 5EM8A 1K2PA 4FYNA 4MK0A 1H25A 5I3RA 2R5TA 4YJUA 3M2WA 5EYMA 2I0YA 5I9VA 2GFCA 4NW6A 4O0VA 3ZDIA 2Z8CA 4AT4A 4RX5A 2BDFA 5H8BA 2R3LA 3KQ7A 2WTKC 2PVNA 3LOKA 3QQFA 1PXKA 1S9JA 4G5PA 4KIQA 4P90A 3NUUA 4TT7A 4DLIA 4FV1A 3RBWA 2QODA 4YTHA 4GCJA 3Q60A 4LOQA 5AR5A 3R1NA 4I22A 5KX8A 3BWJA 2H8HA 5EQPA 2C47A 2QO2A 3MS9A 3PWYA 4O0SA 3PVWA 2QD9A 1E9HA 4JS8A 3FZOA 4IEBA 4Y83A 3OFMA 2I0EA 4J96A 4LMUA 3WF9A 5HNGA 3BX5A 3OXZA 4ID7A 4YNOA 4D9TA 2XCKA 2YJSA 3A8WA 4ZJJA 3ZHPC 4ZSAA 4EH7A 1GZKA 4EORA 2IJMA 4QPMA 4RA5A 5KKRC 3UTOA 5CU0A 4MXXA 4IAAA 4AP7A 4EYMA 4FG7A 5AADA 2XCHA 4I0SA 4GYIA 3VS6A 1AGWA 4R6VA 2GMXA 3DAKA 4M8TA 4OTWA 2VWZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2P3G X;  1ZY5 A;  4W4W A;  3UIX A;  4WG5 A;  2X1N A;  2XKD A;  4RIX B;  4GRB A;  2OFV A;  5C8N A;  3PXR A;  3QD3 A;  2FB8 A;  1SVG A;  3KXX A;  3LMG A;  4DFU A;  4KKG A;  4Y85 A;  5CEM A;  2BRN A;  2WQE A;  4PF4 A;  1ZYC A;  3GU4 A;  4NTT A;  4I3Z A;  4H1M A;  4N6Y A;  3AD6 A;  3PA3 A;  2WZJ A;  2YFX A;  3NYX A;  4FG8 A;  1CDK A;  2C6T A;  5JFX A;  4M3Q A;  2OLC A;  3F2R A;  5ACB C;  4IM0 A;  2QLQ A;  1WAK A;  3OWL A;  3EZV A;  4QMU A;  2HWP A;  4CFX A;  5EFQ A;  5TOZ A;  4XS2 A;  2WIH A;  2UW7 A;  5BUI A;  3DV3 A;  2YIT A;  3BU5 A;  4YO4 A;  4KIO A;  4A06 A;  1QMZ A;  3HV5 A;  3QTW A;  4YPS A;  1I44 A;  4PTG A;  3O5A A;  4MUQ A;  4FSY A;  3FHI A;  1CM8 A;  3LQ8 A;  4BI2 A;  3FLW A;  2IEW A;  3MIA A;  4HYU A;  3B2T A;  3MTF A;  5LXM A;  1YHW A;  5AAG A;  3MV5 A;  4U40 A;  4I23 A;  4MQ1 A;  4J1R A;  4DED A;  4XOY A;  3TNW A;  3P7C A;  3LM0 A;  2HZ0 A;  2NRY A;  3O8T A;  4ZIM A;  1TQP A;  5EHY A;  3ZO2 A;  1PW2 A;  4QMW A;  3QKK A;  1U5Q A;  5EM6 A;  1GOL A;  4AUA A;  2WOU A;  3RM7 A;  2YHV A; 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