3FKLA

P38 kinase crystal structure in complex with ro9552
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
349
structure length
344
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein, transferase
source organism Homo sapiens
publication title Mapping Binding Pocket Volume: Potential Applications towards Ligand Design and Selectivity
rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 112
structure length 344
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fklA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fklA01
4YTIA 3QHWA 3I7BA 4FTOA 1Q8ZA 3ZLYA 3NLBA 4C3FA 4E3CA 2Z2WA 4BDFA 3OEFX 4QMOA 5IEYA 4XUFA 3M2WA 4ZLYA 5L2WA 3TM0A 1J3HA 4DG3E 2ZVAA 5DOSA 1OL1A 4EWHA 3VRYA 3KF4A 3DB6A 3R1QA 5FP5A 3WYYA 3VUTA 4L3PA 3U6IA 4FGRA 3FQHA 5HNGA 4E1ZA 2VNYA 2ZYBA 3KREA 2CGVA 1BI7A 4FEXA 4JIKA 4JX7A 2GNFA 4XG2A 3VS1A 3ZXTA 5AUZA 4GS6A 3DDQA 5GJFA 3C0GA 4AU8A 1H1RA 4FYOA 3R9NA 3RGFA 5M4CA 3LFSA 4EYJA 2WMRA 2ZDTA 1PKDA 2YEXA 4A9TA 2XKCA 3C4EA 3RHXA 3FPMA 3R6XA 4W4WA 2WTIA 4Z7HA 2JBOA 5AP3A 5GZ8A 3M11A 3I60A 5IA1A 2OIQA 2IW9A 2Q0BA 5DE2A 3V5JA 1YRPA 1JWHA 4IB5A 3ENHA 1JKSA 3ZXZA 3LLAA 4NTTA 4NUSA 3R8ZA 4H3BA 4GFGA 4M0YA 3D5XA 4D5KA 4DH8A 4HNIA 5DG5A 3VAPA 4FNXA 5I5ZA 3OD6X 4EK8A 1G5SA 2IG7A 3PIXA 5AUWA 3FI2A 1IRKA 5CSWA 2GTMA 2W1HA 1ZYCA 4M15A 3FLQA 4RMZA 1Z57A 4GFMA 5AR7A 1J7LA 5GNKA 4IX4A 3NNUA 3O51A 4UV0A 2QQ7A 2ACXA 5IQBA 1W83A 4EQCA 4DEAA 3FUPA 3QQFA 4IIRA 2Q83A 3MJ2A 4RLLA 4Y8DA 1SMHA 5JGBA 3GOPA 2YLFA 3LCDA 4QNAA 4BCOA 5CU4A 4O7SA 3LFDA 4O86A 2QU6A 3O8UA 3SG8A 4MVFA 4PPBA 2G9XA 3KCFA 2OJJA 4II5A 4AWIA 1OL2A 4RQKA 2YM5A 3H9RA 5IQIA 2VX3A 3R04A 5E8SA 4ACMA 4LFIA 4XH6A 5BUIA 1IASA 2CCIA 3CGOA 4JDHA 3TKHA 4AW5A 2QHNA 5HORA 5IEXA 4O2PA 4ANQA 1YI3A 4CQGA 5C8NA 5HIDA 4E4LA 2WIHA 1YXTA 1J1BA 3I5NA 4IM3A 5J7HA 3U55A 4BDKA 1YXXA 2R0IA 3O50A 3EQBA 4X7QA 3GB2A 5EFQA 2ZMDA 4YJQA 3VWAA 2UZBA 3G9NA 4B0GA 4BFMA 4BCHA 4XOYA 3D5VA 2UW8A 2R2PA 2J0IA 3FMNA 4L3JA 4CYIA 4YHJA 5CENA 1BL6A 3PA3A 4TPTA 1GIHA 5FXQA 5LWMA 1PXJA 3PSBA 3S2PA 4FVPA 5CI7A 4Q9ZA 4ZLOA 3G33A 3RPYA 5CSVA 3BV2A 3MH0A 4M13A 5EKOA 5C8MA 3KKVA 3WILA 2XF0A 3CR0A 4M84A 5IQFA 4D2RA 3LZBA 3OTVA 5CVGA 2BZJA 3HP5A 3W16A 1OL7A 3R0TA 1J7UA 1WBNA 4I41A 1VYZA 4D58A 5FTOA 4BC6A 4FIFA 4TZRA 2WQMA 1YI6A 4YJOA 3TNQB 4AOTA 4ZS4A 2REIA 1WBWA 2C6TA 3IOKA 1TQMA 3O17A 4FSTA 2VTPA 3TEIA 3OTUA 5I3RA 4AT3A 4YJVA 2O5KA 4R3CA 3WF5A 2KULA 3S4QA 2BRHA 4Y83A 5TR6A 4I6HA 5DLSA 5EDQA 4DGMA 3WE4A 4IMYA 3VBQA 3LLTA 5C8KA 4AT5A 3UMXA 4IVDA 4C4IA 2F7ZE 3CBLA 3LCOA 2VTAA 3AMYA 1U4DA 1WBTA 3R28A 5HCZA 3O96A 3QALE 2V0DA 4AZEA 2ZB1A 5E4HA 4FODA 4FV2A 1OUKA 4FV4A 2I0EA 4QMNA 4ZLZA 4CLJA 5F1ZA 4GK2A 2VD5A 3I7CA 3M1SA 3T9IA 4A4LA 1QPCA 4HVGA 1HCKA 2PZPA 2C5OA 4IZ5A 2YIXA 3BU5A 4ACGA 5IMEA 2VO0A 1ZOEA 4RX8A 2JIVA 3FHRA 3VRZA 4EZ7A 1TKIA 3MW1A 5L2QA 4PL3A 5IUHA 4FEWA 4HGLA 4L00A 3AC3A 1FVRA 2XKEA 1FPUA 1O6YA 3DOGA 5AP4A 3ORMA 4RFYA 4PWNA 5KKRC 5L8LA 3PRFA 5HOAA 3O8PA 5HU3A 3UOJA 3ORKA 4I0SA 3KXZA 3V5QA 3UOHA 1QCFA 3VBVA 4HNFA 4NJDA 4RJ7A 4D4YA 4Y85A 4Z55A 4GMYA 4QPSA 4O0WA 2O8YA 3QWJA 2LGCA 3NDMA 3L9MA 2CN5A 3Q32A 2QG5A 4WOVA 2JEDA 4P5ZA 4QMWA 5F4NA 4PNKA 4KIPA 2W05A 1OPKA 3WF7A 1VZOA 2VX0A 3LW0A 2BR1A 3R9OA 1Q61A 4FZFB 4BBMA 4WNOA 1OKZA 1ND4A 4AE9A 4ZK5A 5BUJA 2WQEA 3I4BA 4FTKA 4MXCA 4EBVA 4DEBA 2WTKB 3EHAA 4H58A 3QWKA 4AZTA 1GY3A 4FE2A 4A7CA 1S9IA 4GJ3A 3CP9A 1SVGA 1T46A 3AC5A 3OG7A 2YM7A 2PE2A 3IG7A 4LRMA 1IA8A 2XYUA 4R5YA 4FKWA 2WIPA 4CFWA 2XNNA 2J90A 5HVYA 2GSFA 4M68A 4QP8A 5EHOA 3HMMA 4GW8A 3E8CA 2XIXA 3E8EA 1M7NA 2HAKA 3KB7A 1SVEA 5DH3A 5L6OA 4IWDA 4C4FA 2O63A 2VU3A 4XP3A 3U6JA 4HZRA 1PHKA 4MQ1A 4ZEGA 3OW4A 2V7OA 2XP2A 4UMQA 3K2LA 4RIYA 4MWIA 5DRBA 3G6HA 3F2RA 4KWPA 5B2LA 4IX5A 3Q5ZA 4FTTA 1JKTA 2CLXA 2XEZA 4JOAA 5EM8A 2P0CA 4ACHA 2OO8X 2YM3A 1ZYJA 1B39A 5I4NA 4QTAA 4FVRA 3R7YA 3ORIA 4CFUA 5GJDA 3SXSA 3NVMB 3L9PA 3D7TA 3EQHA 3MGYA 4O82A 5CEOA 5AEPA 5JGAA 3QTXA 4J52A 3F61A 5TE0A 1E9HA 1Q3WA 4C61A 4ZJIA 4AF3A 3BU6A 2UV2A 3LXKA 1H1SA 3R63A 4M0ZA 3HX4A 1UV5A 5AP6A 3DFAA 4A9RA 4F4PA 4DEGA 4D2TA 3QCYA 2X4ZA 3F9NA 3HMIA 1VJYA 5BVWA 4Z16A 3CQUA 3TI1A 3MH2A 5HE3A 2X2MA 2YIRA 4UZHA 3GI3A 3IW4A 3HV4A 3VF8A 2OXXA 2W7XA 4IB0A 1T45A 1H26A 2QKWB 3FC1X 4H1JA 4JL9A 1OZ1A 3W8QA 2PVNA 3MSSA 2F49A 5J5TA 4DLJA 3MESA 2QOKA 3HKOA 3K5VA 3B8QA 3R8UA 1W82A 3GCSA 4QOXA 2G2HA 2GQGA 3FZSA 3H0YA 4G31A 4FOBA 4L46A 4KB8A 4LM5A 4MBLA 4PQNA 3LE6A 3OZ6A 4ZZMA 4E20A 3FXZA 4EH7A 3N4UA 5JK3A 5JFSA 2WFYA 3QUPA 3MTFA 2I0YA 4OBOA 3OUNB 3DNEA 4EOQA 3QLGA 4AGDA 2WXVA 4YC8A 4EOKA 4NYEA 3CJFA 4H36A 4OBQA 2W4JA 1DAYA 1SVHA 1WMKA 3UVQA 5H8BA 4BWPA 4DFLA 4TNBA 2P3GX 3BV3A 4O7YA 3UGCA 2EUFB 3R71A 4FG7A 1KV1A 4UWCA 3G2FA 3VUKA 5IH5A 2WKMA 3HMPA 3ZM9A 3NIEA 2EB3A 2QG7A 2BTRA 4D2PA 2R5TA 4DAWA 4F7JA 1VR2A 1VYWA 1ZRZA 3D5UA 4F9CA 4ZJJA 1PJKA 3F3TA 3UP7A 4R3PA 4U80A 3UBDA 2OH4A 1OIQA 4K9YA 2UZNA 3QFVA 3LIJA 4FKIA 4WBOA 4BL1A 2JIIA 3BPRA 1CSNA 4F9BA 2W06A 3COHA 4FR4A 4PY1A 1GOLA 1PXMA 3AT3A 2ITTA 1CKJA 3TZMA 3WZUA 5BMSA 4XRJA 2RG6A 1SNXA 2GNHA 4D4SA 2QO9A 2QOOA 4RX9A 4W9WA 4WKQA 5L2SA 2RFDA 4O0VA 5AP2A 3U54A 1PRYA 1P2AA 3PXQA 3RAKA 5J95A 1R0PA 3PJ2A 4V0GA 2E9VA 3LFQA 4YU2A 3SA0A 4FEVA 1Q8WA 4QMVA 4UN0C 5CT0A 3CD3A 4AFEA 2C6LA 4U8ZA 2UZOA 3AD5A 4FNZA 4M12A 4EK6A 5K3YA 5BVNA 3QTSA 2C6MA 3LJ0A 5AR3A 3JY9A 3M42A 3Q9ZA 2ITOA 5M06A 1FMKA 4J8MA 3NIZA 4XP0A 4TWCA 2WU6A 1OITA 4FTNA 1DI9A 2R3GA 3OVVA 1PXNA 3P7AA 3EQIA 3O71A 2R3LA 3ZH8A 2W9FB 4KIQA 4FKUA 5D11A 4CV8A 1UWJA 5EM6A 3E93A 1Q24A 4EK5A 3H9FA 4FMQA 2BTSA 4A4OA 4GUBA 5C27A 2BRNA 5ETAA 4C33A 4IXPA 4NCTA 2W96B 4D55A 3BYVA 3HA8A 3MWUA 3U51A 3TZ8A 1XKKA 3SQQA 3TNIA 3QKMA 3UQGA 4FTRA 4F0FA 2BDFA 2BPMA 1JKKA 2YM8A 2ZDUA 2ETMA 4E7WA 1GIIA 2UW5A 4AG8A 3EJ1A 4YJRA 3OCBA 2EXEA 1IG1A 3ORXA 4CMUA 4PP9A 4WO5A 4O7RA 3AGLA 3RBWA 2R3MA 3ULZA 4ANBA 5EH0A 5IA0A 3P78A 1V1KA 1BYGA 3AC1A 3L8PA 5HX6A 1REJA 5CU2A 3DK6A 2JGZA 4YZMA 3E7OA 5ANEA 3PP0A 4J71A 1WAKA 2YWPA 2GMXA 4FV5A 3VBTA 1LEZA 4FL3A 4ITIA 3V6RA 5KBQA 4O83A 5E8UA 1UA2A 2J2IB 2B7AA 3PWDA 4DH5A 1JPAA 3H4JA 4R7HA 4W4VA 3QX2A 3UG2A 5GIOE 4UY9A 2QVSE 3WF6A 4XBRA 3PSDA 3ACJA 3C9WA 3C51A 4YP8A 3TDWA 4EOIA 4Q5HA 4E6CA 1KUTA 3CS9A 1ZMWA 1X8BA 3C0IA 4YZ9A 3PXRA 5CYIA 3QZFA 2X6DA 3UC4A 4E5WA 3NNXA 4C34A 5L6PA 2W1FA 3ZFMA 1DM2A 4NWMA 3AT4A 4G6OA 4USEA 4EZ5A 5LJJA 2JDVA 3WIKA 2XA4A 4UXQA 4WG3A 3HA6A 3L9NA 2UZVA 4FSWA 3KFAA 3NPCA 4GV1A 4KAOA 2FSOX 3QQUA 3PVGA 4FG9A 3C4XA 1EH4A 3OXTA 3ZUTA 4KS8A 2C0OA 3RCJA 3F3VA 3R1YA 1NT2A 2WMUA 3QD2B 4IAAA 4RIYB 2PK9A 4X6RA 3EN9A 2YCQA 2WO6A 4BGHA 3P9JA 5CEMA 2AC3A 3R22A 4O0TA 4AN9A 3RAHA 5IQGA 3GU7A 4I93A 4CCBA 2QOCA 3GCQA 4QP2A 5K9IA 2F2CB 4BDIA 4AAAA 3EYGA 4A9UA 4N6YA 3F5XA 3FLSA 2JDSA 2Y4IB 2X7OA 2ZMCA 2J6MA 3D7TB 3HYHA 3R73A 4KRDA 2HK5A 5HE1A 3FPQA 3F88A 4GSBA 2YFXA 3WOWA 4F0IA 3ATTA 3TJCA 1KSWA 4DH7A 4QP7A 4BIBA 3UQFA 4KRCA 4I5PA 5GIPE 5HU9A 5JQ5A 1OM1A 5IA4A 5CI6A 5EI2A 2JAMA 4APCA 4YURA 5JZJA 2RG5A 5EW8A 2HXLA 4TT7A 2FUMA 3F5UA 4FIHA 5AR2A 3WIGA 4XNEA 2OJIA 2PUNA 3G15A 3ET7A 2B1PA 2OKRA 5CAOA 1PXPA 2PVHA 5D41A 5CANA 5DR2A 4Q9SA 3S95A 1XBAA 2DYLA 3DQWA 3HGKA 5E92A 2WTVA 4IACA 3W2SA 4F1MA 5HO7A 2A2AA 2XCKA 3GC7A 3UOKA 1PF8A 3ZDUA 3FMHA 3COMA 3T3UA 4CYJA 5IH4A 3KA0A 2GS2A 2W5HA 4LRJA 5E8WA 4A4XA 4F6UA 4LV5A 2BAQA 5EOBA 3KY2A 1YVJA 1K2PA 1UKIA 1YDTE 2KTYA 3KU2A 4IJ9A 2CHLA 2ITUA 4FGBA 2UZUE 5DEWA 1NVQA 2HENA 1H08A 4FSUA 3NUSA 4Y95A 2JIUA 3KRWA 2WGJA 5KMIA 2I7QA 4L01A 3RHKA 3A62A 1PYEA 3GQIA 4GIIA 5TO8A 4HCVA 5HTCA 3ELJA 4G5PA 3EFLA 4E26A 4ZY6A 2BDWA 4BZOA 5CVHA 2C0IA 4C62A 5E8ZA 3R8VA 3ZC5A 4RSSA 5E1SA 2V22A 4F64A 4HYSA 4RGJA 2R4BA 1JSVA 3LXLA 4RJ6A 3TG1A 3F2NA 5DPVA 3RPSA 2R3KA 3QCXA 3JXWA 5CASA 2FO0A 1V0PA 3BEAA 1I44A 1YXVA 4E6DA 4G3FA 5AM6A 4DHFA 2C1BA 4XG9A 3BKBA 4CFMA 4DH3A 3ZO1A 3MIYA 2B52A 2VWVA 4FZAB 4BCFA 4J8NA 4HOKA 3RJCA 1FMOE 3E8DA 2OGVA 4OAVB 5DYJA 4DITA 2UVYA 1K3AA 2ERKA 3QLFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YTI A;  3QHW A;  3I7B A;  4FTO A;  1Q8Z A;  3ZLY A;  3NLB A;  4C3F A;  4E3C A;  2Z2W A;  4BDF A;  3OEF X;  4QMO A;  5IEY A;  4XUF A;  3M2W A;  4ZLY A;  5L2W A;  3TM0 A;  5BV3 A;  1J3H A;  4DG3 E;  2ZVA A;  5DOS A;  1OL1 A;  4EWH A;  3VRY A;  3KF4 A;  3DB6 A;  3R1Q A;  5FP5 A;  3WYY A;  3VUT A;  4L3P A;  3U6I A;  4FGR A;  3FQH A;  5HNG A;  4E1Z A;  2VNY A;  2ZYB A;  3KRE A;  2CGV A;  1BI7 A;  4FEX A;  4JIK A;  4JX7 A;  2GNF A;  4XG2 A;  3VS1 A;  3ZXT A;  5AUZ A;  4GS6 A;  3DDQ A;  5GJF A;  3C0G A;  4AU8 A;  1H1R A;  4FYO A;  3R9N A;  3RGF A;  5M4C A;  3LFS A;  4EYJ A;  2WMR A;  2ZDT A;  1PKD A;  2YEX A;  4A9T A;  2XKC A;  3C4E A;  3RHX A;  3FPM A;  3R6X A;  4W4W A;  2WTI A;  4Z7H A;  2JBO A;  5AP3 A;  5GZ8 A;  3M11 A;  3I60 A;  5IA1 A;  2OIQ A;  2IW9 A;  2Q0B A;  5DE2 A;  3V5J A;  1YRP A;  1JWH A;  4IB5 A;  3ENH A;  1JKS A;  3ZXZ A;  3LLA A;  3PFY A;  4NTT A;  4NUS A;  3R8Z A;  4H3B A;  4GFG A;  4M0Y A;  3D5X A;  4D5K A;  4DH8 A;  4HNI A;  5DG5 A;  3VAP A;  4FNX A;  5I5Z A;  3OD6 X;  4EK8 A; 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