2WHBA

Truncation and optimisation of peptide inhibitors of cdk2, cyclin a through structure guided design
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Truncation and optimisation of peptide inhibitors of cyclin-dependent kinase 2-cyclin a through structure-guided design.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 296
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2009-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2whbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2whbA01
4OTGA 2E9OA 2WPAA 1PMVA 3QHWA 4O2ZA 4QT1A 4EK8A 5IZFA 1UU8A 4LV8A 2C4GA 4XRJA 3PTGA 2OH4A 4AGUA 3DFCB 5AEPA 3OF0A 4LRKA 1OL6A 3WF9A 2PZYA 3GT8A 1IA9A 1JOWB 3ZEPA 2BFXA 5IUGA 1Q61A 5DRBA 4BCMA 3D83A 3UZTA 3LCKA 3HV5A 3WZEA 3PLSA 1NA7A 2UZBA 4DFBA 3KY2A 4CFVA 4IDTA 3FI8A 3LHJA 2JAMA 3D9VA 3UVRA 4IB3A 3UMXA 2C5YA 2ITWA 4R6VA 3Q4TA 2P55A 4JJRA 4JXFA 4E73A 2ZAZA 5EHYA 1WBSA 3C13A 5CZIA 1PKDA 4CMOA 3EN4A 2QHNA 4FNXA 5J79A 2XRWA 2Z60A 3SAYA 4ERKA 3BKBA 5AIRA 4C4GA 5DT3A 1PMUA 2GTMA 2WXVA 3SRVA 5I9ZA 4USDA 4D9TA 5JKGA 3H0YA 4IQ6A 4FV7A 4OT6A 4V04A 4W4WA 3V5QA 3R0TA 5D9HA 1KE6A 4KUJA 5CAPA 5FG8A 3QCXA 3B8QA 4AGCA 4AE6A 5CY3A 3ZRKA 3G9NA 4RWJA 2IZUA 2UW3A 4YZDA 4BL1A 2PSQA 3ENHA 2WMTA 3V8TA 2JDRA 4D2TA 3QQKA 3V04A 2UZWE 4OBOA 4AGDA 3MTLA 2V22A 1WCCA 3U54A 3SDJA 3AMYA 3KXMA 4F0GA 4MXXA 1PXIA 4ID7A 3F5GA 3BEGA 1UV5A 3VQUA 4PNKA 3C4EA 4NM7A 4F7NA 4BDBA 5DOSA 2GMXA 3KCFA 4O0YA 3UODA 4U3YA 3GGFA 4EUUA 3BHVA 4J97A 4FKRA 1PY5A 3CY2A 3DK6A 2W9ZB 4TZRA 5F95A 4R8QA 5HKMA 3TEIA 5BPYA 2JD5A 4J99A 1JKSA 2WU6A 2J90A 2PUNA 1TQIA 1M2RA 2FH9A 3HP2A 1ZOHA 1KE5A 5M4IA 1Y8GA 5IQHA 3VHKA 2GHLA 3V3VA 4CNHA 4E4MA 3C50A 4A4OA 3IPHA 5HESA 4R77A 1YVJA 2C47A 5GJDA 2G2HA 5HU3A 3BHHA 4GT3A 4IAAA 1J1BA 4RZVA 5DYJA 2VUWA 2HW7A 4L7SA 4U7ZA 4EC8A 3A4PA 4AN9A 1YI6A 3PXZA 4LM5A 1XO2B 4YHFA 3U55A 2XCKA 2F7XE 3CGFA 4I5CA 4X2NA 2PE2A 2QOCA 5M53A 5EYCA 4DN5A 4NYEA 4YJQA 1OPLA 2A4LA 4PMMA 4RJ4A 4RX5A 4JBVA 3PVUA 3EYGA 1FQ1B 3R9OA 2WMWA 4AP7A 4CZUA 3EH9A 1J3HA 4LG4A 2QOKA 4HCTA 2IZSA 2XK3A 3A7IA 3UOJA 4F6UA 1ZARA 3W2OA 3GU5A 4BN1A 3MDYA 3OCSA 4FZ6A 4MH7A 4QMXA 1FOTA 5I9VA 3QXPA 3DDQA 1TQPA 2WMVA 4YHTA 3THBA 4BICA 4GG5A 4DH5A 3U6HA 3EQCA 5H8EA 1CMKE 2R3LA 4G3EA 3GC8A 3FC2A 2VWBA 4QP7A 3SRVB 3ZUVA 2XM9A 4ZAUA 5EQYA 4ASZA 3RAKA 3BGZA 3TIYA 3I7CA 4IDVA 3P7AA 3O2MA 3LFEA 4BR3A 4AZEA 3SQQA 3WF5A 1CKJA 5JQ5A 3R7YA 4EH3A 1WBPA 3D4QA 3HDNA 4FK3A 3HRFA 3NEWA 1RW8A 2I0HA 5AUWA 3JPVA 3QKMA 3SLSA 3ULZA 4K6ZA 4PTCA 5BUEA 4IAYA 4J71A 4KINA 5G1XA 4OTDA 3HAMA 4S2ZA 1BI7A 2I6LA 2Q0NA 3BEAA 3O17A 1LUFA 1RE8A 3QGWA 5EI8A 5LVPA 3OFMA 5A6OA 4AUAA 4EOJA 1M7QA 4QMSA 4L3LA 4WNOA 2PYWA 2JKKA 1XH4A 4D4VA 3FZ1A 3KXHA 3EKKA 4FKOA 3LZBA 4JL9A 1KOBA 4GSBA 3W8QA 1W84A 4KBAA 2W5AA 5DPVA 1Q3DA 2XK7A 3UG2A 1LR4A 4WKQA 4F6WA 5FQDC 5AV4A 4TNDA 3VUDA 4PP7A 2ITVA 3LFQA 4PDPA 4YNOA 4Z7GA 2VX1A 5CI6A 2BRBA 4NZWB 3GCPA 4BZOA 3KRXA 3PA3A 1KUTA 4IH8A 5IQIA 3F2NA 2PZRA 4EWHA 4EOKA 1R0EA 4HZRA 4E6CA 4C36A 1CDKA 2VTOA 2PVRA 3HKOA 5FLFA 1BMKA 2UZUE 4O7YA 4ACMA 3MWUA 1SNUA 2V55A 3PYYA 4FTLA 2WU7A 1WMKA 3RHKA 3LQ5A 3HUBA 4FL1A 3TIZA 4ASEA 3TWJA 2R3PA 5DR9A 2PVFA 3TG1A 2HK5A 5AP0A 3Q53A 4A7CA 3I5ZA 2ETMA 5AA9A 3QWJA 4XP2A 2WFYA 3R6XA 3E88A 4D55A 3GCSA 2YCFA 4RLLA 3MPMA 4FTRA 3RCJA 5BQ0A 5IA3A 2XH5A 4EH4A 2GS2A 4QYEA 3GP0A 5E8ZA 4EJNA 3DAEA 2PVLA 5CTPA 4DGGA 2W05A 2P2IA 3OUKA 4X3FC 4FC0A 3PXKA 4BZDA 4XJ0A 4JX7A 4BFMA 5I9XA 4JOAA 1Y6BA 3GUBA 4NM5A 3TNWA 3VUIA 4H05A 4A9SA 5FEDA 3BV3A 2UW8A 2WEIA 4O82A 3EQGA 4J96A 3ATSA 4FTQA 2YERA 1GOLA 4I22A 5IEXA 2VO3A 3LXNA 1YXSA 3PE2A 4TYJA 4B8LA 2XIYA 2W1IA 2Y9QA 3K54A 3DXPA 5HD4A 4C62A 3F88A 3FL4A 4BY9E 1GIHA 5HZNA 2OKRA 1J7LA 2YACA 5D1JA 4AZWA 3V6SA 4BDJA 3R7EA 5IH5A 4XG2A 4RWIA 2VX0A 2XUUA 3T3VA 1JSVA 5C9CA 4BHNA 5M06A 4TY1A 4I6QA 3PJ1A 4U5JA 4EOLA 2C0OA 1YRPA 3E7OA 3MVLA 5KCVA 2VO7A 5IQEA 4QMYA 4ACHA 3G90X 2B0QA 4TNBA 4DGOA 2W7XA 1Y91A 1E1VA 4X6RA 3LCSA 5KBQA 3IW7A 5IEVA 4XH6A 1F5QA 4YJRA 3MV5A 2PMLX 4EH8A 4R3PA 2A0CX 4Z16A 4OTIA 1YXXA 5LWMA 1VJYA 2YIRA 4IWOA 4ALWA 3ORZA 3TT0A 3OS3A 3LE6A 4DCAA 4M7IA 3R8PA 1WBVA 3C5IA 3LMIA 1U5RA 5DRDA 2OG8A 3MBLA 2VNWA 4XG3A 4ANLA 2R7BA 4JT3A 4YSMA 2C1BA 5E92A 4C57A 3TNPC 1MRVA 4CKJA 4L9IA 3FMJA 3Q9YA 1KV2A 1J7IA 1GNGA 1M52A 2QO7A 4RVLA 4IB1A 4RZWA 2IJMA 3NUSA 4I3ZA 4YR8A 2QO9A 1NY3A 2C3LA 5CSWA 5EOLA 3PSCA 4WG4A 1FVTA 3SXFA 5K0XA 5TT7A 2EB2A 2OF4A 3TV4A 4R7BA 2RL5A 4PX6A 4O7VA 3ZC5A 3GCUA 4A9UA 4ANBA 3F7WA 1WBOA 3WZJA 4E6QA 2W4KA 5HOAA 3R83A 5M07A 4P4CA 4RIXA 2ZMCA 3ULIA 1OPJA 2WQBA 3HP5A 3Q6UA 3UO5A 3OXTA 2VV9A 3HVCA 3TTIA 4RA5A 3K3IA 4IVDA 1CKIA 2PL0A 4UXLA 2ITYA 3F3VA 4QP1A 5AV0A 4QQTA 1K9AA 3FMMA 4BCPA 4DH1A 5KMKA 2C6OA 1SYKA 4R3RA 5HCYA 5C27A 3DQWA 4DLIA 5B2MA 2VTAA 1IG1A 1H1WA 4TWOA 2YM8A 4ZZMA 3RK5A 5EQEA 5IQBA 3OTUA 4CQEA 5M08A 3GENA 4KRCA 3TV6A 3EKNA 3ZUTA 5B2LA 4HVHA 3UZRA 1WAKA 3FZPA 2I7QA 3CXWA 4IJPA 4QMQA 3NDMA 1YKRA 4WRSA 3U6JA 3CD8A 3PSDA 2OXYA 2ITTA 3FY0A 2FSTX 2HWOA 1Q8ZA 4HCUA 4RIYA 2R3JA 4O0XA 3TTJA 3PP1A 4MXOA 3NCZA 4KA3A 3HLLA 4E5AX 2VTJA 4YLKA 4XUFA 4C4JA 2BIYA 4RGJA 3G2FA 4ZXTA 2XCHA 4MBLA 4BZNA 4DF3A 2XB7A 3P5KA 1UKHA 2C68A 4ZMEA 2XBJA 5HCZA 4BI2A 2W1FA 4EONA 4QYGA 2GQGA 1HCLA 2X0GA 2UZDA 1Q3WA 3WF7A 5E9EA 2PE0A 3PG1A 2OJJA 3KN6A 2R3FA 3O71A 4J7BA 3KMWA 4MCVA 3MTFA 1KE8A 3W2RA 4AW0A 2R4BA 3POZA 2WO6A 4KSPA 3OXIA 1S9JA 3IW4A 4HPUE 3AG9A 3D2KA 3TNHA 5KMLA 5CSXA 2VTQA 3WIGA 5BNJA 4UZHA 3GFEA 2PMIA 3E87A 3R73A 4G17A 3FJQE 2HY0A 3QFVA 4FTKA 5HIBA 2PPQA 4JI9A 2VTTA 4YBKA 3MH3A 2BDWA 3HUCA 4ERWA 4JQ7A 4CRLA 4AZTA 3HMNA 4MF1A 3QC4A 2V7OA 4KD1A 3EJ1A 4RWKA 5EW8A 5EKNA 1DAWA 3MH0A 4FKQA 4RIXB 5LXMA 4OAUC 4IADA 5CT0A 4BWXA 4MQ1A 3VW8A 2BPMA 3FKLA 2F2UA 4ACGA 2YM7A 3F5PA 4NW6A 4FV8A 4A4XA 2CJMA 1TVOA 1E1XA 5GJGA 3T9IA 2HCKA 3PZHA 3EIDA 4QYHA 4YHJA 5IQCA 1ZYJA 4AA4A 1E9HA 3D15A 2QONA 2QOHA 4FSUA 4YP8A 2AYPA 1YHWA 3I5NA 3NYVA 4L01A 2J50A 3DPKA 5DHJA 4FG9A 4NW5A 5HCXA 1K3AA 1A06A 3C4XA 3DV3A 1H01A 4XCUA 3NAXA 5IA0A 4RIYB 5CZHA 3FMKA 3HL7A 2A19B 3AMAA 3ID6C 3DBCA 2XK6A 3A8WA 4CYIA 2QD9A 2FA2A 3TNQB 1NXKA 3EFJA 2E9UA 3OY3A 2V0DA 4ANMA 2W1CA 3F9NA 3IW8A 4UB7A 3DT1A 4XV1A 4PPCA 2WMXA 2XBAA 5HICA 3GNIB 4TYIA 2QG7A 1UNGA 4JDKA 4L6QA 3BZ3A 4AS0A 3H9FA 4J52A 2UW0A 3TN8A 2CN8A 4L44A 1B38A 2HOGA 3HV7A 3IOKA 2VGPA 3DLZA 3D7ZA 3JY9A 4RSSA 4UWYA 5EI2A 1YDTE 4Y73A 4DH7A 2R5TA 1ATPE 2XK8A 1IASA 3QD2B 4DTBA 4TYEA 4QTAA 3B2TA 5KO1A 4CG9A 1MUOA 4Z3VA 4F70A 3FUPA 2RG6A 3UYTA 4QMOA 4GH2A 2JAVA 1YXTA 4WBOA 4EK4A 3Q2MA 5FTOA 4YGAA 5DH3A 1MQ4A 2FSLX 4F7SA 3CPCA 3RPSA 4FTCA 4ZZOA 1OUKA 3E8EA 2GNGA 2PZIA 5LOHA 1BUHA 3EYHA 4RLKA 4IZYA 2CNQA 2YEXA 4G9CA 4G6NA 2C3KA 4CFFA 1ZLTA 2VTSA 3DKOA 3EN6A 3O50A 3UNJA 3MB7A 4CVAA 3U8WA 5FXSA 3EQDA 2UUEA 2R7IA 3TACA 5GIOE 4FUXA 2GNFA 4QYYA 5DEWA 4M69A 1S9IA 1JWHA 3FMLA 3ZO3A 3A2CA 2JDVA 3QZHA 4ITJA 3KA0A 3ODYX 4RPVA 4YTHA 2J6MA 3II5A 3HYHA 3ZDUA 3FQSA 2Z7SA 4M3QA 3BHYA 3HRCA 3H9RA 4FV2A 3GC9A 2CGXA 2XJ0A 3DNDA 4DGMA 1GIIA 3R9HA 5AADA 2VD5A 4E5WA 1Q62A 3LXLA 5IMXA 3I0QA 4C3FA 4EH7A 2YIXA 3R71A 3D5WA 4QOXA 4XP3A 4D2VA 3LM5A 4FV3A 4TYGA 4F9WA 4YZCA 4EH2A 5JN2A 4JVGA 3W33A 2YJSA 4W9WA 3IS5A 1GZ8A 4USFA 3R7UA 5M51A 2XA4A 2R3RA 2JDSA 1M2QA 2B9JA 2ZM1A 3AC4A 3DFAA 1A9UA 3R1SA 4IB5A 5DG5A 3UC3A 2PHKA 4UMPA 5CU4A 3REPA 1Z57A 5CAVA 2F4JA 5EG3A 4BCJA 4EH5A 3GCQA 4NTSA 1PXOA 4G2FA 5DI1A 2B52A 4AFEA 2CKPA 4GU9A 3E8CA 2ZV7A 3DDPA 5BMSA 3FLYA 4MEDA 4ACCA 3EL7A 4FZ7A 3PY3A 4HGTA 2GQRA 1YQJA 3TCPA 5IU2A 3MY5A 4FSRA 4CT1A 5F9EA 2J7TA 4BBMA 3LKMA 1Q41A 4P90A 4F65A 3GEQA 3Q96A 5AR5A 3BGQA 4RC2A 4G6OA 4GIIA 5ITAA 2A2AA 4BWKA 2J0LA 2HYYA 2X6EA 4DC2A 4O7ZA 3K5UA 3GC0A 5M56A 3QCYA 2ZDTA 4JRNA 5GZ9A 2JIUA 4G34A 4LV5A 1JKLA 3EB0A 5AP4A 3RP9A 3OVVA 3Q5IA 4AG8A 4PMTA 4BI0A 1J7UA 4FKWA 4D2WA 3V01A 2PMOX 3BU6A 2W0JA 3QD4A 2OBJA 2BAJA 2BDJA 4FIGA 5DGZA 1OKWA 4K77A 5EFQA 4ENYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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