3LPBA

Crystal structure of jak2 complexed with a potent 2,8-diaryl-quinoxaline inhibitor
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
290
structure length
278
Chain Sequence
TQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPLQDNTGEVVAVKKLQHSTEEHLRDFEREIEILKSLQHDNIVKYKGVCYNLKLIMEYLPYGSLRDYLQKHKERIDHIKLLQYTSQICKGMEYLGTKRYIHRDLATRNILVENENRVKIGDFGLTKVLPQDKEKVKEPGESPIFWYAPESLTESKFSVASDVWSFGVVLYELFTYIEKSKSPPAEFMRMIGQMIVFHLIELLKNNGRLPRPDGCPDEIYMIMTECWNNNVNQRPSFRDLALRVDQIRDNMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery and SAR of potent, orally available 2,8-diaryl-quinoxalines as a new class of JAK2 inhibitors
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tyrosine-protein kinase JAK2
total genus 100
structure length 278
sequence length 290
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-02-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lpbA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lpbA01
3ZUUA 1PXJA 5BQ0A 4H3PA 4XV9A 2HW6A 2XCKA 3QTSA 2R0IA 2NNWB 3BE2A 3UYSA 3RINA 1WCCA 2OJJA 3VS5A 3QX4A 2PE1A 2CMWA 4YZCA 3LCTA 4CQGA 5HIEA 1NVQA 3KRJA 1PYXA 2UZLA 2J6MA 2XA4A 3NUAA 2B9HA 3OROA 3TUBA 3LLAA 4E4XA 2QO9A 4AGCA 3ERKA 2WD1A 3OBJA 2OJ9A 3VHKA 2P33A 2WTWA 1JWHA 3NCGA 4GMYA 4I23A 4NK9A 3NLBA 4FEUA 1P2AA 3HDMA 4KB8A 5IA1A 5DEWA 5E8YA 5IH4A 4YJNA 3BLRA 3HMIA 3VF9A 2H6DA 3R00A 1J3HA 2Y6OA 1O6LA 2C6IA 4ZTHA 5HX8A 4O83A 2OJGA 4RZVA 2XK9A 4OT5A 4UMUA 4EUTA 5HQ0A 3RTPA 5CANA 5A9UA 4DH7A 4LI5A 4QP7A 4TYHB 2Z7QA 5AUTA 3R7UA 4FIEA 3HV3A 5AA9A 2R3PA 4F0IA 4YO6A 2XBJA 3HX4A 3E92A 4CEGA 4IVBA 4QQCA 3W32A 4EOJA 4L7SA 4K8AA 3DJ5A 2YM3A 4HYHA 4QP1A 5EQPA 3TT0A 4MAOA 5HBEA 2ZDTA 4QQJA 3ORXA 3V5QA 3WE8A 3QZIA 2FVDA 4A9YA 5CSPA 2R3NA 3FYKX 4UMPA 2IVVA 1PRYA 5D9HA 5EW3A 1IG1A 3F5UA 3Q4UA 5EG3A 1K3AA 5KCVA 1J7UA 4G31A 5CQWA 3F6XA 4XHKB 2OK1A 1SNXA 4NTSA 2C5NA 4WSYA 4C61A 4IHPA 5GJFA 3FZSA 4IB1A 4BDHA 4W4YA 4FTKA 2YM8A 2A4LA 3G2FA 2WOTA 3FMKA 1VZOA 2XKCA 4IX4A 4O7NA 3JYAA 4KIOA 5H3QA 1YI4A 4BDAA 4LYNA 5LVOA 4LOPA 4HGLA 4B6LA 1CKPA 5D12A 2CKQA 3OWLA 2XIRA 4MBIA 4EOSA 3G9LX 3DNDA 5T3QA 4GYIA 4AA5A 5K4IA 4TKSA 1WMKA 3W33A 3Q4TA 3PTGA 4BDKA 3Q5ZA 4R1VA 3SRVB 5M57A 1H08A 3AC4A 1PXOA 2NRUA 1QPEA 3HECA 1XO2B 1Z57A 3V5PA 4KNBA 4O0SA 2OZAB 5JGBA 3H0ZA 2B1PA 4ERWA 4XH6A 4USDA 5J9ZA 2FB8A 5FXSA 4BL1A 2ITZA 2PMIA 4FEWA 2PPQA 3G6HA 4Z7HA 4CZUA 3EIDA 4EJNA 2G01A 4OW8A 5DI1A 2E2BA 3QALE 2VGPA 3R8VA 4XV1A 4ZZOA 5EM8A 5A54A 4EOOA 3Q3BA 3RPVA 1OIRA 3O8UA 2JBPA 3W1FA 2YM5A 3A7FA 3NAYA 3CQUA 3IKAA 4D4RA 2DWBA 4C2VA 1MQBA 4ZJIA 4FVRA 4FIFA 4M97A 4FV2A 4F70A 4EQUA 2YZLA 4DFXE 3A7JA 1NVSA 3BHUA 1G5SA 2C0TA 3Q96A 2W1ZA 2WQNA 2IZSA 4GUBA 3RAKA 3OXIA 4WSQA 4IW0A 1YDSE 2BDJA 3NYXA 3W8LA 4F0FA 2XRWA 3LFFA 4TNBA 3RNIA 3T9IA 3R7OA 5FRIA 3VJOA 3BYUA 3CTQA 4DHFA 3LQ3A 1YQJA 1ZMUA 4ZTSA 3A61A 4D5HA 4NH1A 2UW3A 5DOSA 5L2SA 3VO3A 1XJDA 4G6OA 4ANSA 5HTCA 2PUPA 1H1RA 4CTBA 2PE0A 2BILB 4F65A 2W5HA 3D7TB 4OTFA 1AQ1A 5FTGA 3TG1A 2QLQA 5L2IA 4IX5A 4YTCA 4RQVA 3N4VA 3R6XA 4H3BA 4W9WA 4FKLA 3VHEA 4BDGA 2GTNA 5FBNC 2H34A 3MVLA 4TN6A 2BCJA 4FG7A 4OTDA 3ZH8A 1ZYJA 3R63A 4X7QA 4FKQA 4H58A 3AC5A 3BX5A 5CEKA 2WTCA 4FIGA 3PJ2A 3FLQA 2QO7A 2XNGA 3VIDA 4QOXA 4PNIA 3NNVA 4J53A 5ICPA 2OG8A 5CWZA 5AX9A 4BFMA 1O6YA 4RA5A 4YJTA 3KREA 2E9PA 4U81A 4IJ9A 3GC0A 1KV2A 2C5OA 2R3QA 4NIFB 3FC2A 4UYAA 3MPMA 2UVXA 4AU8A 5HO7A 5J79A 4RVMA 3KVWA 4WG5A 2YA9A 5TKDA 2V0DA 2ZYBA 4D2PA 4J97A 4FV7A 1OPKA 3RWQA 5IH5A 5M09A 3BYVA 3H10A 5IQEA 4XOZA 3R2YA 5FEQA 3FKNA 3MB6A 4Q5EA 3MSSA 4L67A 1GIIA 1SVGA 3AGMA 3GCUA 2HENA 4HYIA 3AOXA 3IPHA 3BU3A 3ET7A 4FSRA 3KRLA 3TNHA 1BI7A 2ZB0A 4RFMA 4BGQA 3F5GA 5E8UA 4CGAA 5KZIA 4L46A 4YNEA 5AR7A 4FTMA 5HICA 4DEHA 4WHZA 4YJOA 3TN8A 3VBWA 3Q32A 4TL0A 3LCKA 3CIKA 3KXGA 3O23A 4QMOA 3G33A 4ENXA 2QLUA 3UIUA 3UPXA 4ITJA 2CKOA 4C3FA 1OGUA 3DCVA 1PYEA 4CYIA 4NT4A 3OTUA 4NCTA 4U41A 4C38A 4BCQA 4JAJA 2WELA 4HNIA 4EEVA 4FICA 3OOGA 3FHRA 5EHOA 2VTSA 4QMLA 5IUIA 4F9AA 1BUHA 2Z60A 4YBKA 3UO5A 3BELA 4ZY5A 3VUIA 3V8SA 2WIPA 5E8SA 4CKRA 1Q3WA 4CMTA 2CGUA 2FGIA 2X4FA 3CQEA 2ZJWA 4ASEA 4O7VA 3EQGA 2BROA 3L9LA 4RJ6A 4RIXA 2IZTA 2EXCX 3HEGA 3IECA 4PX6A 5IMXA 5HD4A 4WBBB 3WIGA 3BV3A 2R3OA 3OUNB 4MD9E 3DFCB 3KXXA 4HCTA 5AX3A 3VWAA 3WZJA 2O64A 4EKLA 4CKJA 2E9UA 3OXTA 3U4WA 4RIWA 2XP2A 3E62A 1R1WA 1IA8A 1J91A 2C1AA 3PVWA 3RWPA 2G9XA 4F99A 3OVVA 4O22A 5LARA 1GZKA 5AADA 5EQYA 4B8MA 4YJRA 4L45A 2CKEA 2CPKE 4R3PA 5M4UA 3EJ1A 2W1CA 5IH6A 3CQWA 3S4QA 5IUHA 2YM7A 3EOCA 4BVUA 4FEVA 5BYYA 3JXWA 2W5BA 4V05A 1Q8YA 2RL5A 3QQJA 4WG3A 4MWIA 2X0GA 3HV5A 3LM0A 5HNBA 2WTKB 4L00A 4WNMA 4L52A 1H27A 4AZWA 4V01A 3DDQA 2XNPA 5TT7A 4X6QC 3ZO3A 4BIDA 2BR1A 4PPAA 4CRLA 1WBNA 1YOJA 3POOA 3Q4CA 4IM2A 3OFMA 3VW8A 4DTKA 5I9ZA 2ONLC 1DI9A 5HD7A 1OBDA 4J8MA 5DYJA 5H8GA 4DFBA 4P2KA 3LFEA 3A8WA 1Q41A 3PXRA 4I5CA 4GVAA 4CFVA 2ITQA 3RPSA 3LM5A 4PL3A 4D1XA 3MH3A 2J7TA 4MBLA 1MRVA 3QD0A 5AIKA 2QOHA 5IEYA 3R22A 5DRBA 4PPBA 1QPDA 2VWYA 5CLPA 4KD1A 2KULA 2EB3A 4E5BA 5ACKA 3VQHA 5JFWA 3QD2B 5C9CA 2C0IA 1XH5A 4UB7A 1MP8A 3I0QA 4F7JA 5CAUA 1QL6A 3E3BX 5A6NA 3MI9A 3PPJA 3QD3A 4M68A 1F3MC 3G5DA 4JBPA 4MYGA 3P08A 2NPQA 2W99B 3DKGA 4IAIA 4JG6A 4P5ZA 3QYZA 4QP4A 4EWHA 3GU6A 4USEA 5KO1A 3V3VA 4R7BA 2QOIA 2QODA 5AR5A 2ZB1A 3GQIA 4YZ9A 3SAYA 3MYGA 2HY0A 2J50A 1STCE 4XJ0A 1A48A 5J9LA 3AD6A 1PY5A 3FJQE 3QLGA 2XF0A 2W1FA 5BUIA 3WF7A 4RJ4A 4FG9A 3IW4A 3QQLA 4CV9A 1A06A 5E1EA 2GPHA 4K0YA 3BLHA 3KN5A 4BBEA 3PPKA 3E64A 3BLQA 4AZTA 3VJNA 4M0ZA 3KGAA 1NT2A 1XBAA 4PTGA 4E7WA 4NW5A 4G6LA 5CZIA 5HKMA 4D1ZA 4DEIA 5KHWA 4X3FC 5AR8A 2GQSA 4AA0A 3CGFA 1YHSA 3EQDA 3WYXA 4O27B 4ANLA 3F2RA 4QT1A 1BL7A 2JFMA 2G2IA 2PVKA 4YC6A 3TEIA 4DLIA 2IPXA 4X3FB 2X7FA 4U3ZA 3TI1A 4WRGA 5GIOE 1OI9A 1XHAA 4IDTA 5HO8A 2VWBA 3E8EA 3BYMA 5LVLA 3V01A 4J95A 2BTRA 5CSWA 3HV4A 4AUAA 1OIYA 2V5QA 5M55A 2R3IA 4FTJA 2OF2A 3D0EA 4HVHA 3H9FA 4BWXA 3IDBA 4QP8A 3MTFA 5G6VA 4IWPA 4O7WA 5K0KA 3H9RA 4DFLA 3C9WA 3PPZA 3MIAA 3OW3A 5HBHA 4NW6A 4C2WA 4FZ6A 2WOUA 3CD8A 4D55A 4TW9A 4Y46A 2IWIA 3PVBA 1HOWA 3U9NA 3U8WA 5HG5A 2VWXA 1Q5KA 5TE0A 3UIMA 4QYHA 3PWYA 4JOAA 5K5XA 4C0TA 3HNGA 4KKGA 5EQEA 2WTVA 1H1PA 3MY1A 4DC2A 1OL5A 3LFDA 3R2BA 2GHGA 5HCXA 4PF4A 2VTAA 3B8RA 2W0JA 4YHTA 5DE2A 2C6OA 2W1GA 2WTJA 4YO4A 5KMNA 3BI6A 3FPMA 4FTCA 5ANOA 4H1JA 3WZUA 3OCBA 3IGOA 2R3JA 4YLKA 4ACDA 2QU5A 1CM8A 2JEDA 3D94A 3NAXA 1CKIA 3ANQA 4FGBA 5IQDA 4HJOA 4RFYA 5AM7A 2VTRA 3C5UA 3LMHA 2QKWB 4KWPA 4D2WA 3FLSA 2GNHA 2AYPA 4OLIA 2VX3A 4FKVA 5CF8A 5CSXA 4I0SA 5IMEA 4YC8A 3QRKA 2J2IB 3VBVA 2Y0AA 5IQCA 4II5A 4QMNA 2OIQA 5I9WA 1IEPA 3UOKA 5LJJA 2UW4A 3Q2JA 3PXYA 1H1QA 4OTQA 2X1NA 2VO6A 3F2AA 3GU7A 4KBKA 4HVSA 4GL9A 4F6WA 2H9VA 3E8DA 3ENHA 2YERA 4CMOA 3U54A 3F88A 4LUDA 3R7GA 4BCNA 4CQEA 3OCSA 4BZOA 2O0UA 3JY0A 3PFQA 3RAHA 4OTPA 4D2VA 4F4PA 2F9GA 3ZRKA 2XJ0A 4J98A 2C3JA 5C01A 1WVXA 2ITWA 3AC1A 4FT5A 4NU1A 3BU5A 3GCPA 2WQOA 2O3PA 2X2MA 4EOIA 4ANBA 2Y4IC 5HNIX 3GNIB 3W2RA 3AMYA 3MH0A 4EQCA 3I60A 3DBCA 4PL4A 2WU6A 3PP0A 4QTCA 4I92A 5HOAA 1WVYA 5IEVA 1I44A 4EC9A 4PDPA 2Y4IB 4C4GA 2HW7A 4O0WA 4NM0A 5ANIA 1UU8A 4GK2A 1OMWA 2QKRA 4AP7A 1XH7A 3QZHA 1VYZA 4FZAB 4KKEA 5HE0A 4OBOA 2VTLA 2VWVA 2VO3A 4TWNA 1TQIA 2R3MA 2EUFB 3PE1A 2WQEA 3GFWA 1APME 5L4QA 4EOLA 1GZOA 2HWOA 2BVAA 2OXDA 3O17A 3R0TA 4JT3A 4F09A 5GHVA 4YPSA 3E7OA 3F69A 1E1XA 3H30A 4O82A 2YDJA 5CU4A 5AR4A 4CFFA 1OVEA 4PP7A 5B2LA 1MQ4A 3UZTA 3HV7A 2W1HA 4XBRA 4OTGA 4Q9SA 4LL0A 5E8WA 3R28A 3WF6A 4I6FA 3P5KA 4MTAA 4WOVA 3P0MA 3CCNA 2YDKA 5HCZA 2BFXA 3R7VA 3SQQA 5HI2A 5HLPA 3LXKA 3LW0A 4FK3A 3ZDUA 2BALA 4AT4A 3DQWA 3FKLA 4YLLA 4O7YA 2RFEA 3BBWA 3DXNA 4ZTLA 5HORA 2YACA 2V22A 3FI8A 3EH9A 3ACKA 4ZTQA 3PXKA 1KE5A 4GCJA 3HVCA 4U5JA 2YCSA 3TUDA 4FKTA 4LGDA 3R7IA 3KF4A 5F1ZA 5KBRA 4IACA 3NUYA 3V5WA 3DTWA 4HZRA 5B2KA 3EFJA 4KS8A 2WMBA 5D7AA 4QQ5A 4A9RA 5A46A 5JQ5A 3KMWA 5IISA 5JSMA 4EONA 3NUUA 3DOGA 5LVMA 4BWPA 3K3JA 4PL5A 4BICA 3VBQA 3FZRA 4U97A 4L68A 2PUNA 5AFVA 5AIRA 2WMUA 3TV4A 4OBPA 4HCUA 4ASXA 5A4TA 5AP6A 3OCTA 2R3LA 1JKKA 4GJ2A 3HMNA 4ZEGA 4WKQA 4MXYA 3KB7A 2YIYA 4A9SA 2QHMA 4BDBA 1AD5A 4IWDA 3Q6WA 3QZFA 3OUKA 3F61A 3OY3A 3VBXA 1M52A 5E8XA 4QNAA 3R9DA 4E20A 2R3FA 4FTOA 2Z7SA 1JAMA 4EK6A 2XMYA 1FGKA 4GVJA 3Q9XA 2Y6MA 3FQHA 3TM0A 2P55A 3CTHA 4EK5A 5CASA 4RJ8A 5CYIA 3B8QA 3KN6A 4D58A 1R78A 3G15A 3PY0A 1L3RE 4LGHA 3MESA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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