4FOBA

Crystal structure of human anaplastic lymphoma kinase in complex with acyliminobenzimidazole inhibitor 1
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
310
structure length
295
Chain Sequence
NPNYSFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRAGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIEYG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title The Discovery and Optimization of a Novel Class of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Anaplastic Lymphoma Kinase (ALK) Inhibitors with Potential Utility for the Treatment of Cancer.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
total genus 100
structure length 295
sequence length 310
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4fobA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4fobA01
4XV3A 2I7QA 3VQUA 4AFEA 4O0VA 3C9WA 2CN5A 4JBQA 2YHVA 3D15A 1SNUA 3QTZA 4I20A 5BQ0A 3A8WA 3U4WA 4FC0A 4EYMA 4IADA 3BRBA 4KAOA 5CLPA 2CSNA 4IB0A 1PKDA 5J87A 4BWPA 3HMNA 3UPXA 2VO0A 4DFZE 4KBCA 4CFFA 4G31A 4ZSEA 3BHUA 5E91A 3ZO4A 3H30A 1DS5A 4DH1A 4J53A 4F1OA 3C51A 5CAPA 3N51A 1WBOA 3V6SA 4TY1A 3CIKA 4EOSA 2R7BA 2YA9A 1OITA 2VO6A 4O38A 3HL7A 5A46A 4ASDA 2E2BA 5F94A 4W4WA 3BGPA 3CJFA 2W7XA 4I6FA 2PPQA 3TNQB 3TACA 4BBMA 4MK0A 1S9IA 1JQHA 4NW6A 5CF8A 3RPRA 3ZUUA 2VTSA 1W8CA 4RJ7A 4C3PA 3LJ0A 1VJYA 2H34A 3DBCA 2JIIA 4ZZNA 2Z7QA 3CJGA 4ERKA 3T9IA 3MA6A 1BL7A 3BZ3A 3HYHA 3EZRA 4UB7A 5JRSA 4D2VA 4DLIA 4YTCA 5C8MA 4FK6A 2C6IA 4GUEA 2ZAZA 2UW3A 1BLXA 4I5MA 2ZV9A 5HX6A 2V22A 4G17A 1G8AA 3TIYA 4FEXA 4FG8A 5FUTA 5HE3A 4I0RA 4FEUA 5GIPE 1XH4A 5DBXA 4Z9LA 3RALA 3V5JA 1YQJA 4Y5HA 2Y7JA 4FNXA 4O91A 1VR2A 4QMOA 5CT7A 4CMOA 2PVNA 3EL8A 4F1TA 4R7BA 4YZNA 3R22A 2YITA 3HUBA 2G1TA 2OIBA 4FSRA 3RWQA 4CYJA 4A9SA 5HI2A 3NIZA 3TXOA 1PMNA 3ZS5A 3QZGA 2GPHA 2GNHA 3LFNA 3DAKA 2R9SA 3Q6UA 3Q04A 5HG5A 5BMSA 5CSVA 3RK5A 1RDQE 3NYOA 4BDGA 3R28A 5HIBA 3LKMA 4ZMFA 2C68A 3DJ7A 5JH6A 3SDJA 3DTWA 3QTUA 2WMRA 2XNBA 4II5A 1I44A 4EQUA 3MJ1A 4F63A 4Z55A 2HXLA 4G16A 3DLSA 1J3HA 5AUVA 1IAJA 2ZOQA 4IB1A 2XKEA 5LCKA 5C27A 3B8RA 2PY3A 3FAAA 4F65A 3C4WA 3DY7A 5AADA 3AC3A 5AV1A 5C8NA 3KL8A 4E26A 3NUPA 5BVDA 4X3FC 4XV2A 4HOKA 2JGZA 4KSPA 3L8VA 2VZ6A 5E92A 3RNYA 3ZDIA 4BIDA 2GS2A 3NW7A 1YI3A 1ZOGA 2YLEA 3BHTA 2IZUA 1UKHA 1IRKA 3D5WA 3UE4A 1MQ4A 2WD1A 4EK3A 5JKGA 3HMMA 4YLJA 3UO5A 4MQ1A 1PXMA 5I0BA 4DFNA 4L67A 4C36A 3HV3A 4IXPA 4XG7A 4L3JA 2RF9A 3I1AA 3NX8A 3D7TB 3MIYA 3HV7A 4IVCA 5EM8A 5LMBA 4HNFA 5HEZA 5IF1A 3SVVA 2W05A 2BKZA 4G3CA 4E7WA 2CLXA 4FEVA 4IWOA 2CGVA 2QD9A 3E8NA 1REKA 3V5TA 3LM0A 2NRYA 2WTKC 4MWIA 5D7AA 2XYUA 3COHA 4D5KA 4GIHA 3H3CA 4UYAA 3E7VA 4C35A 1DAYA 1VZOA 3LFSA 4MNFA 4EH3A 4IM2A 4PDSA 1RQQA 2A4LA 4R6VA 2XZSA 3RPYA 4BTMA 4PPCA 1O6YA 4FX3A 5EM5A 4M68A 4BKJA 3UNZA 3CLYA 4E6DA 4YC6A 4FNYA 4KIOA 3PY3A 3U6IA 1APME 2ITOA 2OF4A 4BYJA 4FT7A 3RAHA 3QWKA 1H0VA 4MTAA 1UNLA 1ZY4A 2UZOA 2OIDA 4F99A 3MW1A 4UV0A 3ZLYA 3AQVA 5ANIA 4ZOGA 2OZAB 4UBAA 3W10A 3PA5A 3WIGA 3VUHA 3V3VA 4BWKA 2YIQA 2QOBA 4TPTA 1OVEA 3VBVA 4QYYA 1SVEA 2X39A 3P4KA 5DH3A 3ORXA 3ZCLA 2NP8A 3MFUA 3KXXA 4IZAA 5FQDC 3RVGA 4EK6A 4AS0A 1QPDA 4WG3A 3LE6A 5K9IA 1FQ1B 2XK4A 5CU2A 2Y4PA 5BVEA 1E9HA 2WU6A 3QF9A 3PXYA 3MV5A 4MXCA 2C6KA 4G3FA 1B38A 1ZMWA 3FMKA 3F69A 4GCJA 4HVGA 1H1RA 3VHEA 2VWVA 4GL9A 1JSUA 4F6WA 4FKWA 3BYMA 2HWPA 4MXXA 2I0YA 1P5EA 3V01A 4EI4A 3IG7A 3LXNA 4EQCA 1PXOA 3AMBA 2J4ZA 5AP7A 2UW6A 2X6EA 2UVZA 3FI8A 1TQMA 2F49A 3DCVA 4MBLA 5KE0A 4AWIA 5EM6A 4DT8A 4RIWB 5M51A 4BDEA 4KA3A 4TYIA 3DKOA 2C5NA 4OTQA 4D2TA 3AGLA 3JPVA 4A9UA 4EH6A 5LVMA 4FNWA 4G3DA 3OW4A 3SHEA 5CEPA 3BBTB 1YRPA 3EQDA 5DE2A 4YBJA 1PMVA 1UNGA 5BVOA 5GZ9A 4EK4A 2XIRA 3HV6A 3D9VA 3IW7A 3QFVA 1WBWA 3KXMA 4RIXA 4C7TA 3QWJA 4D1SA 4GKIA 2OW3A 5M07A 1WBSA 4CZYB 1UVRA 3DT1A 3GC0A 5A4CA 3A7HA 4JBPA 4D1ZA 3HLLA 4JAJA 2W1DA 3IW8A 4O27B 5IH5A 3LZBA 5LWMA 4QTEA 4N6YA 5EDQA 4PMSA 1WBNA 4Q9SA 4QMXA 4RT7A 4ZXTA 3DJ5A 4DFYA 3UIMA 4NL0A 3OMVA 1XR1A 3K3IA 5EH0A 5FEEA 2PE1A 2F2CB 4G5PA 2P3GX 1DAWA 1H24A 5K0XA 3TL8A 1KE9A 3GP0A 4I21A 3TTIA 3IW4A 3MESA 1YOMA 1JLUE 4WRSA 2HCKA 4HYUA 1IR3A 2QOIA 3CQUA 3TEIA 4S33A 3VF9A 4I23A 1W7HA 3E3PA 4GG5A 4C38A 3VBWA 3ZMMA 4QQ5A 1S9JA 2EU9A 3V5QA 4QMPA 3EN5A 3R7IA 3EKNA 4FA2A 5KHWA 4ONAA 4ZS4A 4C58A 1FVRA 2Y6MA 1KE6A 3NLBA 5DOSA 3UYTA 2R3GA 1M17A 2WGJA 4ACHA 4FG9A 2R3JA 3PFQA 4IC7A 1NW1A 2B0QA 5IA1A 2EWAA 3TTJA 3SA0A 2JEDA 4BDBA 4JNWA 2QLUA 1BX6A 2XIKA 5HKMA 4EHZA 5GHVA 3SG8A 4FSWA 1WMKA 2WFYA 3G33A 5HESA 5CEIA 3MY1A 3CGOA 3OC1A 5HBJA 2V5QA 4MNEA 2R3HA 3GU8A 4GT3A 4I3ZA 1WVXA 4L45A 2XEZA 4RIYB 3R02A 3QZHA 4I92A 2VTTA 3LM5A 5L8JA 2PULA 4OTPA 5DR2A 4F08A 4OR5A 4YHTA 2FA2A 3D7TA 2Z02A 3FXWA 3COKA 3NIEA 3BGQA 3O96A 2F2UA 3POOA 4FKIA 4TWNA 3LW0A 3GENA 3QZFA 3FY2A 3I0OA 1Y91A 4O6EA 3QA8A 4ARKA 3IOKA 3CY3A 2NO3A 4CFVA 2ONLC 3RM7A 4DEAA 4EHVA 5CALA 3ID6C 3VAPA 3ZLWA 4DGGA 1XH5A 3KN5A 1AQ1A 4FZAB 3UJGA 3F2RA 4HVSA 2ACXA 3QQLA 3A7JA 4MD7E 4YJNA 2WO6A 3PXKA 2VUWA 4FKLA 4EJ7A 3LFQA 2JIUA 2OI4X 5AAEA 4P5ZA 2BRNA 2G15A 3OWKA 3CR0A 3E7OA 2XH5A 4WNPA 4H1MA 5TE0A 2OBJA 3CQEA 4YBKA 3CD8A 3KXNA 4XV9A 4AT3A 2XIXA 3FZOA 3QUPA 4AE6A 3UQFA 4ANSA 2OO8X 4YO4A 2YFXA 3A60A 2XNEA 4XP3A 3QQUA 3S00A 2Y9QA 3SC1A 3EN7A 4CFXA 3HAVA 4O7NA 5J7HA 2HWOA 3LXPA 5HCZA 3C4CA 2QO9A 4IJ9A 5A4QA 3IO7A 3GBZA 1XBCA 5JFSA 1UU9A 4DG0E 4OTRA 2X0GA 5DNRA 2WQOA 3IW5A 4MXYA 1O6KA 3GCPA 1K9AA 2BDJA 3LCTA 4IW0A 4MAOA 4XUFA 4DLJA 3UDBA 3OROA 2OXYA 4LGHA 4AW5A 2PMLX 4UMPA 3VN9A 1ND4A 4RC3A 4HJOA 3ELJA 4MBJA 4TN6A 2XRWA 3GCSA 1OKZA 5EI6A 4JIAA 4F6SA 3TUCA 2VX1A 2W5HA 4MQ2A 5HICA 4U79A 2WQMA 3JVSA 2CGWA 2WMQA 4EEVA 4LI5A 1OZ1A 3PXRA 4FTAA 4U45A 2OGVA 3O8UA 4NFMA 4Y72A 2KULA 5D7VA 1IA8A 4L68A 5GJGA 4CFNA 1MQBA 5K4IA 2IZRA 4WUAA 3TKHA 1ATPE 4FKRA 3VUTA 5TF9A 1M2PA 1XQZA 2CN8A 4C57A 3JUHA 3O7LD 3PPZA 4UZDA 3DKGA 2UVYA 4X2JA 4AZEA 4OTFA 1YXUA 3T3UA 2XK3A 4L52A 3S2PA 3P7BA 5ETIA 3DJ6A 5J95A 3MN3A 3BHHA 4QP2A 4FIJA 4M66A 3R8LA 2UZLA 4BCQA 2CPKE 3GUBA 5CI7A 4BDJA 4F7NA 4PMPA 4BBFA 4ACCA 5C4KA 2C3LA 4N57A 2AUHA 1PHKA 3P0MA 5FBNC 3C50A 2H6DA 3FZSA 3A2CA 5DA3A 5LARA 4RIOA 4IM0A 4BDAA 4IFCA 2BAJA 4FSQA 4LGDA 4AZVA 3VVHA 3O17A 4USFA 3VJOA 3U6JA 5CASA 1NVRA 3CBLA 3PZEA 3KFAA 4KRCA 4FTTA 4IX5A 2YACA 1J1CA 4UMQA 3ZFMA 3HA8A 3M11A 3UOHA 2Y4IC 5AV3A 1ZYSA 3ZRLA 5ITAA 3C5UA 3RCDA 3ZO2A 3QQKA 1DI9A 5AA8A 3ERKA 2J0IA 3DTCA 3H9RA 3TT0A 4ZTSA 1M7QA 2XM8A 4QP9A 4V04A 1YVJA 4IH8A 4YJOA 4GVAA 5DT4A 4GRBA 3ZBFA 4E20A 3LVPA 2VO7A 2H96A 1ZZLA 5DR6A 3PWYA 5HIDA 4EOMA 4CCUA 5KZIA 3PIYA 3WZKA 4UXLA 4DYMA 2YLFA 4GSBA 3PVWA 1ZOEA 4NTTA 1H8FA 3OT8A 3C4XA 5KHXA 4F0IA 4O2PA 2XK9A 4CFWA 1FPUA 4GFOA 4V01A 4IB3A 1CTPE 5I9VA 4FKSA 4D4VA 3GCQA 3IK3A 4RX5A 2BRHA 3TIZA 3NDMA 2QVSE 4W9XA 2ITYA 2XNGA 3UO4A 2BRMA 4FKPA 1A9UA 1SVHA 3ZOSA 4RIYA 4RJ8A 4NT4A 5HGIA 3D94A 2W9FB 3QZIA 4YJUA 5HD4A 3P7AA 4RVKA 4DCAA 5IA0A 4CRLA 4XYFA 4C02A 3F66A 5EOBA 4MXZA 3BWFA 5CQUA 5TOZA 3U87A 3V04A 5CAQA 3C0IA 1CM8A 5L2SA 4JDKA 2VGPA 1O6LA 2QC6A 4IIRA 1KE7A 1WCCA 3AC8A 4JDIA 5BVKA 4K0YA 4O0UA 1PY5A 3E3BX 3SQQA 1F5QA 2B4SB 3G0EA 4FSNA 3MH0A 4QMVA 4AT5A 4E73A 2RG5A 3ZLXA 5HQ0A 5KMIA 5I4NA 2LAVA 4KINA 2NRUA 5ETAA 4BVUA 1ZLTA 2WIPA 5HBEA 4MYGA 4HGEA 4M0YA 4NM5A 2X2LA 4C4EA 3FY0A 1JSVA 4EUTA 1G3NA 4O7YA 2C0OA 3BIZA 4QQJA 4S2ZA 4FIEA 4JQ7A 2I1MA 4O1PA 5DGZA 5BMMA 3V6RA 3DFCB 4JG8A 3VW8A 3BYVA 1NXKA 3PPJA 4FV4A 3TV6A 4EORA 2Q0NA 4YLKA 4PPBA 3PLAE 1YXVA 3IQ7A 3SOCA 5L6WL 5JT2A 2ITPA 1W84A 4UXQA 4BKZA 1CKIA 1OB3A 4PUZA 1LPUA 3ZSHA 3RJCA 2HELA 2QG7A 2C5XA 2X2MA 4EBWA 4AW2A 4KKGA 3ZEWA 2VWUA 1GZNA 1KOAA 2JAMA 2IW8A 5IMXA 2C69A 3ZEPA 2ZDUA 1W0XC 2UZVA 5FM2A 4CG8A 1WAKA 2JITA 2OWBA 4AOTA 2DWBA 1Z5MA 2QOHA 4OT6A 3BYOA 5JRQA 5L3AA 3QX2A 4M0ZA 4C4GA 3CSVA 2OJGA 1WVYA 3DAJA 2WMXA 2JC6A 3F3ZA 3I5ZA 3MFTA 4N6ZA 2ITVA 3H9OA 4WBBB 4XRJA 4C37A 3QTRA 5E8VA 5M44A 5FWKK 3E8CA 1KE8A 3AG9A 5F1ZA 4KBKA 1YXXA 2PWLA 3OXTA 2YDJA 3QD3A 2RFEA 2VX0A 1U54B 4H3QA 1QPCA 4TTHB 5J8IA 3PUPA 4LMNA 5CT0A 3VUKA 3E87A 4IX4A 4BTFA 3MVLA 3ANRA 4RLLA 4QNAA 2YM6A 3ZLSA 3OXIA 4ZLYA 3KREA 3UZPA 5HLPA 2C30A 2W9ZB 4FV0A 1TKIA 2UW5A 4E6CA 3N4TA 2HXQA 2F7EE 5IMEA 2FVDA 3FQEA 5E8WA 5AP0A 1ZOHA 2Z8CA 4K8AA 4NCTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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