4EKKA

Akt1 with amp-pnp
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
334
structure length
318
Chain Sequence
RVTMNEFEYLKLLGKGTFGKVILVKEKATGRYYAMKILKKEVIVAKDEVAHTLTENRVLQNSRHPFLTALKYSFQTHDRLCFVMEYANGGELFFHLSRERVFSEDRARFYGAEIVSALDYLHSEKNVVYRDLKLENLMLDKDGHIKITDFGLCKEGIKDGATMKFCGTPEYLAPEVLEDNDYGRAVDWWGLGVVMYEMMCGRLPFYNQDHEKLFELILMEEIRFPRTLGPEAKSLLSGLLKKDPKQRLGGGSEDAKEIMQHRFFAGIVWQHVYEKKLSPPFKPQVTSETDTRYFDEEFTAQMISERRPHFPQFDYSAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title An ATP-Site On-Off Switch That Restricts Phosphatase Accessibility of Akt.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RAC-alpha serine/threonine-protein kinase
total genus 92
structure length 318
sequence length 334
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF00433 Pkinase_C Protein kinase C terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ekkA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ekkA01
3QD4A 4L42A 2CKQA 4AAAA 4EOSA 2JBOA 2JDTA 4IZ5A 4UZDA 2QO7A 4DEGA 4EOLA 2YM6A 5AAGA 2B9JA 3Q3BA 5AFVA 2C5OA 3MIAA 4YC3A 3GCUA 1YXTA 3QQJA 4HVHA 3Q5IA 5AP3A 2W5AA 3G6GA 5HO8A 2XRWA 1H1SA 2FA2A 2WMAA 3K5VA 4ZTSA 4BICA 4ZAUA 1PW2A 2WQEA 4M0ZA 3ZXTA 2OXYA 4NCTA 4X0MA 5AADA 3DAJA 3MJ2A 2WOUA 2J0LA 2VTLA 4X21A 1FVVA 2GFSA 4OTPA 4W9WA 3UZPA 2A4LA 4YU2A 3H0YA 3R30A 3ZEWA 5C8NA 5H3QA 1XH7A 3DBQA 4FTAA 4C36A 5IQHA 2BTSA 2VTIA 2QC6A 2BTRA 4JBQA 4KIOA 3G0FA 2VAGA 4PX6A 4M68A 4E4MA 1MRUA 3AGLA 3ZUVA 3LMIA 2C0TA 2XJ0A 3H0ZA 3ZSIA 2OK1A 5FG8A 4E7WA 4ANSA 4PMPA 3Q4CA 4IX6A 3BLRA 3FYJX 3E7VA 4GT5A 2JIIA 4YO4A 1BUHA 3GU4A 4HYUA 5M56A 3R73A 3KCFA 2WTKB 3PRFA 2QOKA 3GFEA 5E8ZA 3SDJA 1A06A 4KD1A 2W4OA 3E8DA 4RQKA 2W06A 2Y9QA 3RM6A 4M69B 4OTQA 4PPBA 3UDBA 4WNMA 4CGAA 4BKZA 3I5NA 4OUCA 3P23A 3LJ0A 3MN3A 4YTFA 1B6CB 2E9PA 2EB2A 3EHAA 4WBBB 3W33A 4FSQA 1BI8A 5CSWA 4FTOA 3BX5A 3GEQA 3U8WA 5CU4A 4BWPA 2IVVA 3HUCA 3L8SA 3M11A 3VHKA 4WKQA 4F99A 4Q9ZA 4N70A 3VIDA 4ARKA 3HA6A 4U7ZA 3DAEA 5ACBC 4F6UA 4IW0A 4CKRA 5DT4A 1M2PA 4ZY4A 4MX9A 2B53A 3R28A 2R3LA 5AUXA 1U59A 1ZYLA 5CEQA 3TUCA 4RX9A 3JS2A 4BRXA 1ZOEA 3GVUA 3KXMA 4DE4A 2X7GA 4K9YA 4QD6A 3R2BA 2OJGA 1OKVA 3KMMA 4R5SA 3TNWA 2VTAA 1Q61A 2BAQA 3FXWA 3PRIA 4HPUE 4RFMA 3BHHA 5FXQA 4ACDA 1Q8TA 1XWSA 3MFUA 4AW0A 4G3GA 4XG8A 3RP9A 4D1ZA 3ANQA 3PUPA 2Z7LA 4FICA 5ANIA 5LARA 1YI3A 1XJDA 1K9AA 5JSMA 3CC6A 3LFSA 2G15A 4LG4A 5IUIA 3ORPA 4AP7A 3S0OA 2C1AA 3O23A 3I0OA 4RMZA 1DI9A 3DQWA 2BZHB 2QD9A 3E64A 4YJTA 2WTIA 2WO6A 3I4BA 3LFFA 3TKHA 3BU3A 5AMNA 2IVUA 2W4KA 4CZTA 4BL1A 2Y6MA 5FRIA 3BIZA 5DA3A 5HE3A 1PXJA 3ERKA 1XQZA 3ORIA 4MH7A 4ZZNA 4QPMA 4GT4A 3E63A 4WG3A 3OS3A 2QI8A 3U87A 4NL0A 5J9ZA 3CQWA 4R5YA 1JKSA 2QVSE 2FSLX 4QMYA 3DDQA 5M51A 4FEXA 3GOPA 3V6SA 2YWVA 4EK3A 5HX6A 3W2QA 1ND4A 2GQSA 4I94A 5IEVA 3T9IA 4V05A 4RX7A 4EZ7A 5J5TA 5DVRA 1CKIA 2BAKA 4R7HA 4X2FA 2IN6A 5CU2A 3NLBA 4TZRA 3DV3A 4FSRA 3RNIA 1XH6A 3I0QA 3OVVA 2QR7A 4S30A 5IA5A 4GK3A 3C5IA 4PTGA 4EOKA 4JAJA 2G9XA 5B2KA 3F66A 2IZTA 2JDVA 4F9WA 3KXGA 5LWMA 3QAME 4J71A 5CNNA 2RIOA 2X8IA 4BCJA 4C58A 3O0GA 5L2IA 1KE8A 1OGUA 3MH1A 3G51A 4CV9A 3G33A 4C3FA 3NYNA 4MXYA 3VQUA 4P7EA 1BL7A 4F1MA 1CDKA 4H36A 4AACA 4PMTA 3GU7A 4IAFA 4TXCA 4DITA 5HTBA 5AUZA 3NNUA 3TIZA 2QOHA 5EI6A 4QMTA 3GC7A 5HTIA 3OFMA 4I23A 5BVDA 5FXRA 1NA7A 5LCJA 4TYHA 3LXKA 3EQIA 3AXWA 3OD6X 4IB3A 4EWHA 4XNEA 5HBEA 4U40A 2JC6A 5HD4A 3DNEA 2YIXA 4W9XA 3VF8A 4BDKA 4EH3A 1W98A 3Q9WA 3MTLA 4WNOA 3P1AA 2GHMA 3RHXA 4RX5A 1PXPA 4DFBA 2ERZE 4UZHA 3TNQB 5EH0A 3TJDA 3R8LA 3FE3A 3KKVA 3PVGA 5F20A 4DINA 2BUJA 2J4ZA 4USEA 5EI8A 5IQGA 2GDOA 2GNFA 3UP2A 4V01A 2R3RA 2HENA 3QCSA 3UIXA 3CD8A 5E9EA 5DT0A 1J1CA 3BRBA 3IDPA 4FNXA 4GH2A 4LRJA 1VZOA 3PXQA 1X8BA 4CSVA 4F63A 5AA9A 5CX9A 3N4VA 3IGGA 4YLJA 3EZVA 3A2CA 4PDYA 4P2KA 3AD5A 4XG3A 1PXNA 3NRMA 3FLYA 2VNWA 3TNPC 5IQIA 3SXSA 2CGUA 3QC4A 2XB7A 5C27A 3NUPA 4ZEGA 2P55A 4FYOA 1P4OA 3V5QA 3EQGA 4RIYB 3NVKI 2ZV9A 4DG2E 4QPAA 5EHOA 3HRCA 3QTQA 1XH9A 4A9UA 4Z3VA 2IZUA 3VS4A 2XNEA 3MJ1A 5J7HA 3ETAA 3QX2A 2BR1A 4QO9A 5AA8A 4FKLA 3MIYA 3BPRA 4FKIA 1CKPA 3E8EA 5AR8A 3TV6A 4D4YA 4D5KA 5KUPA 4LV8A 4ANOA 5C4KA 1Q97A 1SVGA 3QD3A 3QLGA 4I0SA 3DOGA 4L43A 2ZOQA 3CTHA 2R3HA 3PE1A 2CSNA 4TYIA 4DGOA 2R9SA 5CVFA 2VTNA 3PWYA 4PV0A 3QRTA 3CQEA 3G0EA 1DAYA 1H1PA 5B7VA 2QOLA 5CF4A 4XBRA 1Q8YA 3HMIA 4L6QA 4XG4A 2F7ZE 3FI2A 2YLEA 1HCLA 1JQHA 2JKQA 4IJ9A 4X7QA 3ROYA 3TTJA 3OY1A 3V5TA 2PSQA 3MDYA 4RVKA 2BIYA 4RC3A 1KOAA 3A62A 3DK6A 3QQUA 4NM7A 3AC1A 4ZZMA 3ZH8A 5BVFA 5AEPA 4DG0E 3PG3A 3P4KA 3MH2A 3KA0A 1CTPE 5CAOA 2CCHA 3NIZA 5BVEA 2VTTA 5D12A 5KMJA 5DG5A 3DBFA 4O0TA 4C4JA 3OTUA 4FT0A 3P7CA 3UQGA 4D0XA 3L9NA 5KE0A 3ZSHA 4NFMA 4BCPA 3CJFA 3H9FA 4ZK5A 3WARA 2GSFA 4IIRA 5AJQA 3OHTA 2UVXA 3LQ3A 1PXKA 2RKUA 2XK8A 2R3MA 4U43A 5FTGA 2JFMA 4WA9A 3C4XA 4S33A 4B9DA 2UZVA 1RE8A 2AYPA 4XRLA 2JD5A 1U46A 2E9VA 5EKNA 5CU6A 2YZLA 4OT6A 4PDOA 2Z7QA 3LPBA 4DH1A 2CKOA 3ZMMA 2BRGA 1H00A 4BZOA 5I9WA 3WF5A 5L2TA 4PQNA 3ZRMA 3L9LA 4GS6A 1UA2A 3A7HA 4RIXA 5D11A 3HA8A 4LMUA 4CFWA 2Y4IC 4APPA 3UNZA 4A4XA 2W1ZA 4OTWA 4L7SA 3SQQA 4EK4A 3ZHPC 1QPJA 3OWPA 3MTFA 1ZYSA 4AWIA 5CLPA 4BDBA 1WAKA 3OWKA 4XBUA 3UE4A 2C6DA 4BYIA 1YXUA 5AV0A 5C1QB 2YEXA 5LOHA 5A54A 4W8DA 2UW0A 3Q5ZA 4I4FA 4QMNA 3ZM4A 1QMZA 5JEBA 1FQ1B 3F5PA 4QQCA 1JKKA 3D7TA 3WF6A 4R78A 3GCVA 4WOVA 5DYJA 2Y4IB 5ETIA 4NKAA 4ACCA 5HVKA 1UU3A 3WF8A 4ZLOA 3LLAA 4FT7A 3DXQA 4TT7A 1NVQA 3PPZA 2XJ1A 2Y0AA 5BVWA 2R7IA 1H28A 3MY5A 3RAIA 4D9UA 2OLCA 2W1IA 2PY3A 5I3RA 4Q5HA 4EHVA 4EKKA 1QPEA 2YCRA 4ERWA 3QLFA 2YDJA 4K1BA 3NYVA 2OFUA 2YM5A 4I6QA 3ZEPA 3GU8A 3OOMA 3ALOA 2RFNA 3P08A 1WBPA 2J0IA 5EQPA 3C5UA 2E9NA 3WBLA 3K54A 3GQLA 1CKJA 4FIHA 4TWNA 3HV7A 4TY1A 5EK7A 5G6VA 3NDMA 4ENXA 2C6IA 5A4LA 2C6TA 3WYYA 5CNOA 3KY2A 1Y6BA 5J1VA 2UZUE 4KIKB 3G2FA 5DRBA 3T8OA 3KU2A 4YC8A 2UW8A 4C4EA 3V8SA 4G3DA 3QUEA 2HZNA 2OBJA 2PZPA 4RRVA 3LM0A 4NCTC 4B6LA 3EQCA 5HLNA 3LCOA 3MY0A 4RWLA 3V04A 2YA9A 3QCYA 4S31A 3UJGA 4I20A 3EIDA 3FZOA 1OL2A 3AOXA 1FMOE 2IZRA 3ZDIA 1YOMA 3U6IA 4TWCA 3KRXA 4DT9A 4XLIA 3ZZEA 3LQ8A 3E93A 5IA0A 4ZJIA 4KBCA 3PSBA 4UX9A 4J52A 3D7ZA 2F7EE 3O7LB 3KMWA 3KXZA 5AR4A 4DTAA 1GZNA 1QL6A 3GCPA 3Q4TA 5HX8A 3NCGA 4DC2A 3NMUF 5HCXA 1J1BA 2J51A 5LMKC 4O83A 1OI9A 4P5ZA 3ZZWA 2XIZA 2EWAA 4HGLA 2ITOA 1OUYA 3BE9A 4UYAA 5FLFA 3FHIA 4O0XA 2W1CA 4LOPA 5IF1A 5JKGA 5L8LA 3P9JA 3QZIA 5DNRA 5HD7A 4EYMA 1FPUA 3DKFA 4YTCA 3S00A 3RBWA 3F9NA 5A3XA 5I9ZA 3ZLSA 4XH6A 4BDJA 1ATPE 1APME 2YM8A 3PP1A 4EH8A 2C6KA 4O22A 4ITJA 2GFCA 5GIOE 4NIFB 5CAQA 5FEQA 3LE6A 1W7HA 4JQEA 1NVSA 2WMXA 3R01A 3OC1A 4FSMA 5KMMA 4RBLA 2QHMA 2R2PA 3C50A 3DKGA 4FTKA 3SHEA 4AE6A 1ZLTA 3QRUA 5C26A 1F5QA 2GQRA 2O0UA 3VW6A 1P5EA 2HZIA 1FBNA 2UVYA 3MVHA 1ZZ2A 3Q4ZA 4L01A 5K9IA 3DPKA 3SG8A 2B7AA 4J8MA 1JSUA 2XNPA 2WHBA 3KL8A 1H8FA 3POOA 4ZLYA 4OLIA 4ALWA 2UW7A 4PL3A 3PJ2A 3G9LX 2XKDA 4XUFA 1I09A 3COIA 2HW6A 4A7CA 1K3AA 4D2RA 4ZZOA 3ORZA 4UMUA 3JY0A 4Z7GA 4ERKA 2OI4X 2QOIA 2ZM4A 3UGCA 5IQEA 3QRJA 5F1ZA 3PSCA 1NW1A 4F4PA 1YXSA 5L8JA 5AP4A 4C62A 4S32A 3PZHA 4M97A 4DH3A 4FOBA 3TJCA 4FF8A 3C4CA 3TZ9A 4Y8DA 4NEUA 5BYYA 4FL3A 3WIKA 4ZMEA 2PZ5A 4M15A 2GNJA 4IDTA 4FKSA 3FKLA 5H9BA 4BBEA 2JDRA 2OZOA 2XM8A 4G17A 4RIWA 4ANBA 4HCVA 2O5KA 4RLLA 5HO6A 4JBPA 1Q5KA 4EBVA 4LL5A 4MXCA 4TYEA 5CF8A 4FL1A 1Q24A 3V5WA 3HV3A 4ZSAA 4QMUA 3REPA 4XLVA 3FMEA 4EC8A 3K3JA 3OXIA 4BVUA 4BCHA 3EYHA 3DY7A 3LMGA 4BCFA 2W5BA 3FV8A 4O38A 3G15A 1YDRE 3ORMA 4PMMA 5EW8A 4EK6A 5DR2A 3EFJA 1YQJA 3PVBA 5E90A 4EH2A 4LGGA 4TN6A 2WMWA 5HE0A 5HU3A 3DBEA 4FKJA 2XJ2A 4H1JA 5E92A 4AOTA 4YMJA 4RVMA 3GC8A 2HELA 1H4LA 4EHZA 2EUFB 2OF2A 2H96A 3EOCA 3UYTA 3SGCA 5HIBA 1LEZA 2NRUA 5JN2A 4U81A 3BEAA 3CGOA 2B0QA 3KF4A 2YIWA 2PMIA 3VUTA 1JWHA 4UWCA 4BI1A 3QRIA 3IECA 3RMFA 4G34A 3EL7A 3NSZA 3PSDA 2GS6A 2YITA 3ZFYA 4DGGA 3TDWA 2JAMA 4G9CA 2YCFA 2Y8OA 3FZRA 1WBOA 3V5JA 4QMLA 4CVAA 4C4FA 4IQ6A 3ZXZA 4EOOA 5I9YA 2F4JA 4K77A 5AV2A 4H39A 2IJMA 3IOPA 5EM8A 4L45A 2QG7A 5KZIA 3HAVA 2F2CB 2REIA 5CXZA 4FEVA 5HICA 5GIPE 3W2OA 2PE1A 4PPCA 4EC9A 3CY2A 3QL8A 3QTIA 5HNGA 3C0HA 3IKAA 1OPLA 2FSOX 3VS7A 2C3KA 4FTRA 4TYHB 4IC8A 3GB2A 4HYHA 5EFQA 2IW8A 3SXRA 5KBRA 4CEGA 3G5DA 2X7FA 4BWXA 4RQVA 3SG9A 1OPJA 5GZ9A 3MFTA 4AT5A 5LVOA 3FC2A 5IZFA 4RGJA 2CGVA 2XEYA 3QHWA 1G5SA 5DR9A 3RK5A 4J97A 1OKZA 4FKWA 1ZMWA 2PVFA 1YRPA 2WEIA 4EH6A 4FVPA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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