5BYZA

Erk5 in complex with small molecule
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
TFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTGQQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKSVYVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADRQALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIKEAIVAEIEDFHARREGI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of a novel allosteric inhibitor-binding site in ERK5: comparison with the canonical kinase hinge ATP-binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 7
total genus 120
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5byzA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5byzA01
3QZFA 4FKPA 4YSMA 3FLQA 4M3QA 4ZXTA 2UW7A 3JVRA 1RE8A 4D2WA 4BCFA 2JIUA 4M0YA 5CSVA 1R78A 1PXPA 3V5PA 2ETRA 3SVVA 4FYNA 3VUHA 3E3BX 3SG8A 3U54A 3R21A 4BBEA 4C35A 4KBCA 2QOCA 5D9HA 2XK3A 3FZOA 4GFOA 1H26A 3QX2A 4QNYA 3Q5ZA 4D4SA 5IMXA 5LVNA 2X9EA 3RALA 3QL8A 5DG5A 2GNIA 1JSVA 1OL2A 5HBHA 4KS8A 4RVMA 2R4BA 5IQEA 5M44A 4IB5A 4AN3A 3ZYAA 4BDDA 2R5TA 4ZY5A 4IVBA 2VZ6A 4G9CA 4FIGA 2I0EA 2JDVA 3W55A 2WPAA 4R7BA 3WOWA 5CVHA 3T9TA 2Y7JA 4FEXA 2IG7A 4O6EA 4AW5A 4TYJA 4MHAA 3R1NA 3BHYA 4I6HA 3THBA 4GSBA 4C02A 5G6VA 2JDOA 3VS6A 1YWVA 4YC8A 2CHLA 4CFFA 4JS8A 3QKKA 1XJDA 4RJ4A 3D5WA 4LMNA 4X6QC 5C01A 5M4FA 4OTRA 2E9VA 3TV6A 2IWIA 2XM9A 4QQCA 4UYNA 1V0PA 2J90A 4FK6A 4L3JA 1XH8A 3BIZA 4FSUA 4FTUA 5EKNA 1ZYLA 2CLXA 3VWAA 3AOXA 4N70A 4C4IA 3Q4TA 4OBPA 2OFUA 2Z60A 5IH5A 3BQCA 4FR4A 4TWPA 3TIYA 5CI6A 1ERKA 3F2NA 1J3HA 3EFKA 4M7IA 2VTAA 4WNKA 5E8ZA 1GY3A 4FVQA 3FZ1A 4GL9A 4R5YA 1XR1A 4EH4A 4MXAA 3WZJA 4IX3A 3ZO4A 1MUOA 2YWVA 1EH4A 2ZV7A 3LCSA 3M42A 5HD7A 4CLJA 5HX6A 3D5XA 4QMXA 1OGUA 3ALOA 4E6QA 3O7LB 4XJ0A 5JT2A 5CWZA 4QMTA 5EM7A 3EH9A 1X8BA 3HECA 3OG7A 3WBLA 4DEDA 3C4WA 4FKSA 4L7SA 2G2IA 2EB2A 4W9WA 3VS5A 4OLIA 3QQKA 1H1PA 2IVTA 1NW1A 1DM2A 2JFLA 4FV2A 2C1AA 3P79A 4LRMA 4USDA 4A9SA 3QYWA 4M67A 5G1XA 3P7BA 4M84A 4D4RA 4XRLA 2XK6A 4CCBA 4KA3A 3WF5A 2AUHA 4YJOA 2G2HA 3CJFA 3E7OA 3DPKA 2Y6MA 1URWA 5TOZA 3FZPA 3WZDA 5L2IA 3F5XA 3HRFA 4PDYA 2YM5A 3LW0A 2VTHA 3LJ0A 2AYPA 3ULIA 3QD4A 3WZKA 3ZLWA 4CFNA 3TZ7A 4S30A 2XK9A 5CQUA 2HIWA 1UU3A 3LHJA 4DINA 4A9YA 4ZSJA 3EMGA 5KKRC 3ZM4A 4EH7A 4ZEGA 3F7ZA 3I6WA 2BKKA 3KF7A 3ZZWA 4AZSA 3S3IA 3QUDA 3R7YA 2B54A 2IW8A 3RHKA 2C6OA 5AR8A 2ZB1A 4GU9A 3RPOA 4BWXA 3O8UA 2HZ4A 4C61A 1ZYCA 1M2PA 1PYEA 2RSVA 3HP5A 4ACGA 1KOBA 1QCFA 2QOOA 3DZQA 2CGWA 4ZSLA 4WUNA 5KMOA 5LCJA 3MW1A 5E8YA 3AG9A 5CALA 3UQGA 3TDVA 4MD8E 5CXHA 1HCLA 4GU6A 3TV7A 4F9BA 1B39A 2PVRA 2B0QA 3C4XA 3RWQA 4WKQA 1OIRA 3E7VA 5IQCA 2W17A 4F70A 4C4EA 4JIAA 2F49A 1YI4A 2ZMDA 3TT0A 4CKIA 4PMTA 2WMVA 2C3IB 2XP2A 5A6OA 3NW5A 3VW8A 5GJFA 4D4YA 3ZM9A 3MYGA 2VWUA 3BQRA 4DFLA 2WQOA 3MBLA 2GNJA 1OKZA 4JQ7A 4JRVA 2XIRA 4QRCA 4BN1A 4ANLA 3LCDA 2JC6A 3OROA 4NTSA 4C62A 5HBJA 1ZY5A 1HCKA 4FTJA 5F9EA 2QG7A 3D94A 5LQFA 4QMUA 4U8ZA 4AGCA 3B8QA 1CM8A 3R1QA 4IDVA 2J7TA 3IDPA 4ZS0A 3Q96A 4TYHA 3CLYA 4M13A 2QCSA 3SOCA 4F6SA 1UU7A 4J96A 3DFCB 1PXKA 4YHFA 4RX8A 2YERA 3DXQA 4FIIA 3UE4A 4H3QA 3GQLA 4BTMA 2ITWA 4ITJA 1YXXA 4YBKA 5DIAA 1SMHA 3UDBA 3KEXA 3QQJA 2QU6A 5CT7A 4D1ZA 3OCBA 3TN8A 2OIQA 2PUNA 5HVKA 2QC6A 4NM5A 4WNOA 4DG3E 3WE4A 2BAQA 3L8VA 4FTMA 4QP6A 2CJMA 5A6NA 2IZTA 3A7HA 3PJCA 4CKRA 3RM6A 4CG9A 4MTAA 2XKEA 2QKWB 2Z7RA 3B2TA 1BMKA 3IW6A 2C0OA 2BDJA 4LI5A 3ZRMA 1BI7A 4DH7A 2X6EA 5HLPA 2HENA 4K1BA 2XK8A 4ANOA 4MF1A 3E92A 3BLRA 2VX0A 4FSNA 4XOZA 3ZTXA 2R7IA 4O83A 3MTLA 1SM2A 2CCIA 3L1SA 3E8DA 5TT7A 2EU9A 3L8PA 5HESA 4O7YA 2R3LA 4Y46A 1CDKA 4XBRA 3I0QA 4U44A 3AMYA 1T45A 3VBQA 3MH3A 5DNRA 1H0WA 4JDIA 4X2JA 4W9XA 4C3FA 4DG0E 3HUCA 2H34A 4PX6A 5IDPA 4FV3A 1ZAOA 3QF9A 3ZUTA 4HYUA 5HTIA 2OXDA 3DNEA 3S0OA 4ZMFA 1H1WA 5E9EA 5F95A 3TG1A 3H9OA 5CEIA 4F6UA 4FE2A 2FO0A 4PL4A 4DN5A 2PE1A 1OL7A 1U59A 3JVSA 4IHPA 5CU2A 3Q53A 4CFVA 3MI9A 2RFDA 4BCHA 4JT3A 5K5NA 2Q83A 4ORKA 3VAPA 3R9DA 3BYUA 3OWKA 2XYUA 3QD0A 4KNBA 5ANJA 3GC9A 5ETCA 3QTXA 3UG2A 1ZMUA 3ZFYA 3FDNA 5DGZA 4ZJVA 3P86A 1JSUA 3PPJA 4PQNA 2IVSA 3BELA 4EH5A 2Y0AA 5M55A 1GZOA 3MJ2A 4U81A 4J95A 3HNGA 4E20A 4ZTLA 5JFWA 2ITQA 3QYZA 3Q9YA 5L3AA 2CNUA 4W4WA 2O5KA 2UZVA 5E90A 4FEQA 2VGPA 3CGOA 4F0FA 4IM2A 1UV5A 3VNTA 2OICA 3AXWA 4FSQA 4X3FB 4C37A 3VUKA 3QKMA 3NGAA 4L3LA 5AX9A 3H30A 3VHEA 2CGVA 4BL1A 3N4VA 3BV2A 4EL9A 1BI8A 3QZHA 2WTJA 5ACKA 5FP5A 3RK7A 4NL0A 3PLAE 4DTKA 3KXNA 5CAVA 5IEYA 4ZJJA 5E92A 5FTOA 3RJCA 4I5MA 5IQDA 3EL8A 5KE0A 4CT1A 4WSQA 2CLQA 3CE3A 2OWBA 2QOIA 4LQMA 3O7LD 4AE6A 4UXLA 3TUDA 4AAAA 3HZTA 4YJPA 4FNZA 4IAYA 3GU6A 2J4ZA 2QO9A 5CQWA 1B38A 4BVUA 3R71A 1PRYA 5M06A 5AV0A 1IRKA 2B9JA 4CFMA 2VTNA 4BWKA 2ZV8A 4D28A 4BZDA 3G0EA 1ZWSA 4A4LA 4C59A 3EN5A 2Y4PA 4KRCA 4I1ZA 5HIDA 2B9FA 4F4PA 3EYHA 3OUNB 3VBYA 3CQUA 3EKKA 4IJ9A 5KHXA 4FNWA 5FXRA 3SKCA 2J9MA 1WBPA 4CLIA 2BRHA 3NAYA 2J50A 2XRWA 2OIBA 3A4PA 4H39A 4J71A 4J7BA 5EDRA 2LAVA 4YJQA 4I92A 3MA3A 3DU8A 3VBWA 5KMLA 1NXKA 5HU9A 4ZOGA 2V62A 1ZOHA 3MA6A 4FZDB 2Y4IC 4RX9A 4C8BA 3AGLA 3P08A 4WG3A 5K0KA 3LMHA 1YOLA 5HCZA 3Q2MA 4KKHA 3L8XA 3UZTA 4IM0A 5ANEA 2CGXA 1SNXA 2UZBA 4FSTA 4DH3A 4B8LA 4HVGA 5L2WA 2W4JA 1IASA 2YLEA 4NJDA 2R3JA 4TKSA 3W2SA 2UVYA 1Z9XA 3MFSA 3D2IA 1DAYA 3NYNA 3PA3A 3PY0A 4WUAA 2ZMCA 1ND4A 2BZJA 3QCSA 3RCJA 4QOXA 5M56A 3HYHA 4CZYB 3LLAA 2HW6A 3BEGA 3FI4A 3NCGA 3OOGA 2JITA 2YABA 3K5VA 4FKVA 4RFZA 3WF8A 4EK6A 5CSHA 4PL5A 3DAEA 4BDBA 3C1XA 4AX8A 4EH3A 5GINE 2G2FA 4GG7A 4JBVA 3FMNA 3UC3A 3MY5A 3PZHA 4B9DA 4EKLA 3PXFA 1OITA 3QC9A 4TXCA 4WBOA 2C5OA 4UALA 4AOJA 5A4QA 1YOJA 3HV6A 3FEGA 4IFGA 2W1EA 5IA4A 4FTNA 1NY3A 3P78A 1Q99A 3ACJA 3F7WA 3TCPA 2PHKA 4O84A 4FSWA 3GT8A 3NVMB 3F3ZA 3V6SA 5IA5A 4AW1A 2QR7A 5L2TA 3NNUA 4EK3A 1JKKA 5KBQA 2R0UA 2WMTA 5BVDA 3JY0A 3WIKA 3BE9A 4CYJA 1CTPE 5HO7A 4ITIA 4PMPA 4KIKA 4EKKA 3CQWA 4Q9ZA 2HXLA 2YM6A 4FZ6A 2W1HA 4I21A 3G90X 2P2IA 3ZUVA 4CTCA 2UUEA 5IZFA 3C5IA 2CNQA 2PE2A 2GS2A 1GZ8A 4PMMA 2XF0A 3VQHA 4IC7A 4JR3A 2HCKA 4AT3A 4BHZA 3CSVA 2FUMA 2ITVA 3T3UA 2J0IA 1BKXA 2UW5A 3BU3A 1DI9A 2QHNA 1OPKA 2DYLA 5ANDA 5EYDA 4A9RA 4RWIA 5CU3A 2YDJA 3V8WA 2OO8X 3PJ2A 4HZRA 2X8IA 5FDPA 1YXTA 3WZUA 3LOKA 5CX9A 4U3ZA 3IONA 4M66A 1UA2A 3HUBA 5M4CA 5BVNA 4A9TA 1YRPA 3AQVA 3EL7A 2ERKA 2ITYA 1AD5A 3Q5IA 4XP3A 1KE6A 1YI3A 4FTTA 5GNKA 3V04A 1Q8YA 4C2WA 1Q3DA 2JBPA 2RIOA 4YTHA 3BLHA 4U41A 2VTSA 2OZAA 4WRSA 1IA9A 5BYLA 5C26A 3Q6WA 4CT2A 3ATTA 1QPDA 4MEDA 2VWVA 3ZFMA 3RPYA 1APME 2YCFA 3W2CA 5I3RA 5JRQA 4TNDA 3RPRA 1FBNA 3ZSIA 4FTRA 2XNGA 3CTQA 4B8MA 4DLJA 1FMOE 3JPVA 3UYSA 3E87A 5JQ8A 2X2KA 4H58A 4EUUA 4N4SA 4O82A 5CF8A 4AW0A 3TUCA 2JKOA 2ITUA 4ZTNA 2J0JA 2XIKA 3C50A 4FUXA 4C33A 4BBFA 3UIUA 2QONA 3GI3A 3OZ6A 1SVGA 3DKOA 3L9LA 4YP8A 3W2QA 5IEXA 3LM5A 3NUUA 3C0IA 2W99B 3ORPA 3SXSA 3FBVA 3KULA 4YHTA 4B4LA 1ZMVA 4YZDA 1REKA 2NP8A 5CF6A 3RVGA 1PXOA 4XLIA 1J91A 3TJDA 2UZOA 1OZ1A 3FPQA 3BYMA 2CGUA 4MWIA 3QC4A 4Z9LA 4R7HA 1J7LA 4IX6A 4Z16A 1KSWA 4YNEA 2JDSA 3C13A 3FHIA 2XYNA 4OTDA 3PP0A 3DJ6A 4CRSA 4F1OA 2HZNA 1H1RA 1GNGA 4Y85A 5AV1A 4NM7A 4HOKA 3BBWA 3BCEA 3FKOA 4LG4A 5HO6A 1YWRA 5HE0A 3OUKA 1FMKA 2OBJA 3AD6A 4FKTA 5CVFA 5ANIA 4HGLA 3AT4A 3FY0A 4D2VA 3AT3A 4OR5A 3R8LA 2PVFA 4EHVA 3HV7A 2XRUA 5GIOE 3RNIA 3DBDA 3ZLXA 4AG8A 2OU7A 3OOMA 5J8IA 3LFAA 4Y5QA 5AP5A 5D12A 4BF2A 4GFGA 3ORIA 5I0BA 5M07A 3R8PA 5J7HA 4YZ9A 1WVWA 3DFAA 4XG4A 1OECA 5GZ9A 3CKWA 1Q62A 2O65A 3TKUA 3DXNA 3NW6A 4GRBA 2EXEA 3PVGA 4FTOA 4PTGA 3HMOA 5HI2A 5IG1A 3G6GA 3NEWA 4FSMA 2ESMA 3EQIA 3G15A 2ONLC 5CAOA 3O51A 4OBQA 3U6IA 4NYEA 5EDPA 1YW2A 4O21A 4XV2A 2IN6A 4L00A 2X2LA 3HP2A 3MDYA 3O0GA 4L45A 4CD0A 5HLWA 4L53A 3OT3A 5LVLA 5J1VA 2OJ9A 4I6QA 2C6EA 1JKSA 2GQGA 3TNIA 3VRYA 2XNOA 2I0VA 1O6LA 3ORMA 4FBXA 3GU4A 4EQMA 3UVPA 5JGBA 5E8TA 4NSTA 4NZWB 4G6LA 1B6CB 4E1ZA 3W1FA 3PJ1A 4RLKA 4DH1A 2BTRA 5KBRA 5KMJA 4XV9A 4R3CA 5HOAA 5DWRA 2ZV2A 4QPSA 3QTUA 5E8UA 3NIEA 1CMKE 3G2FA 4FYOA 4PY1A 1O6KA 2X6DA 3G0FA 3QQFA 5DR6A 3VVHA 2WHBA 3G6HA 1U5QA 2GMXA 2V7OA 3OT8A 4RPVA 1IG1A 4FTQA 1IAHA 1OUKA 4F1TA 2F7ZE 2JLDA 2QD9A 2R3QA 3NUXA 3QU0A 4MXXA 3RAKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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