5JGDA

Crystal structure of human tak1/tab1 fusion protein in complex with ligand 12
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
306
structure length
295
Chain Sequence
GPLHMIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGTAGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of a potent and highly selective transforming growth factor beta receptor-associated kinase 1 (TAK1) inhibitor by structure based drug design (SBDD)
pubmed doi rcsb
molecule keywords TAK1 kinase - TAB1 chimera fusion protein
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 295
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2016-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jgdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jgdA01
3B2WA 3PIZA 1GIJA 3RI1A 3WBLA 5CAQA 4H58A 3AC3A 3UP2A 2PUNA 4CFXA 5C4LA 3FKLA 5BQ0A 3EQFA 4S2ZA 4G2FA 4FEXA 1XKKA 3E7VA 3G6GA 3LCSA 1M2PA 4FK3A 4FODA 2YIRA 4DTAA 4XG4A 2WQOA 3QUPA 4AZVA 3NR9A 2XZSA 2BKZA 2J51A 2RFEA 5IUIA 3DK6A 2R64A 4L44A 3V6SA 3EQIA 3R7IA 2E9UA 4Z55A 4RC3A 2WHBA 3BELA 4BKJA 4BIEA 2VWWA 5BVWA 4H05A 3RAKA 4ZJJA 1FVTA 4M3QA 5LMAA 5BPYA 3C5IA 4PL5A 2C1AA 3AD4A 3SQQA 2ZOQA 3KN5A 4FNWA 4CYIA 4ZP5A 2OJGA 4K9YA 5FQDC 3R83A 4F0FA 4A9SA 5AR4A 1DAWA 4BDIA 1PYXA 2OI4X 5JQ5A 2BHHA 4FV0A 4G3EA 4LFIA 5EQYA 2HZ0A 3LFBA 3TXOA 3RCJA 1WMKA 3LFNA 4PMTA 3QQGA 3PVGA 2V7AA 2C3KA 2ZJWA 2W99B 4GCJA 4EJNA 2IPXA 2B1PA 3Q32A 1GZOA 3SXSA 3FI3A 4E3CA 4QTDA 5CF8A 4ZS0A 5KMKA 2J6MA 3MJ1A 4NJDA 4K11A 4N57A 4EUUA 4RQKA 1H1QA 4NH1A 3ZSIA 2FSMX 4BDJA 3SOCA 1Q3DA 2XA4A 4KBCA 2WMWA 3GC9A 2PVRA 3A7JA 3R02A 4O1OA 1PXJA 4HGEA 2QC6A 3P86A 2ZV7A 4PPAA 3UMXA 3R7UA 2WTJA 5ETAA 4QMPA 3TIZA 3BYSA 1M14A 4OTDA 1FINA 2CSNA 2ITOA 1AD5A 5M4IA 3MPMA 3E8DA 4AZEA 2QCSA 5JK3A 5FEDA 4CTBA 2XM8A 4C3FA 4YU2A 4ZLZA 5IQEA 3VBYA 3ZZWA 3Q9ZA 4F7NA 2HZNA 4RMZA 4C35A 2PZRA 4RLLA 4TYGA 2IWIA 4BF2A 4F63A 5HD4A 2CMWA 3UO6A 3F3VA 3ZMMA 1CM8A 1YWNA 3POOA 1OGUA 3W2RA 2Q0BA 4X3FC 3EFLA 3VUKA 3R9OA 1XO2B 3F3ZA 3K54A 4WNOA 4L7FA 1PRYA 4AW5A 5C4KA 4WKQA 1W83A 3G2FA 4I5CA 4A4XA 2DUVA 2VWBA 1B38A 1WAKA 4KA3A 4JG7A 5CTPA 3NUPA 1CKIA 4KIQA 4L9IA 1ZXEA 3LVPA 4JDHA 4KABA 3EB0A 5L2SA 3HRCA 3ZC6A 4DC2A 2WFYA 3OXZA 4CV8A 3ORTA 3W10A 2VWZA 4DBXA 4ZIMA 3HRFA 4K8AA 2C6LA 2C69A 3QGYA 3Q52A 4FX3A 3ZOSA 1OL7A 4FKLA 1O9UA 3BQCA 3EMGA 2BFYA 3GQLA 3DTCA 4ZMEA 3W2SA 2WB8A 2CGWA 4FOBA 3OY1A 3FJQE 1S9IA 4IIRA 4RC2A 5CSPA 3GCUA 2W5BA 3EKKA 1YW2A 3VNTA 4GYIA 4ASZA 3OF0A 2HY0A 4GK4A 4JIAA 2HXQA 1FVRA 4Q5EA 4MXYA 3TN8A 4QT1A 5A4TA 4ZMFA 5A6OA 3MB7A 2A2AA 5H2UA 4W4XA 4C4JA 4PF4A 3FAAA 5I9XA 4ASEA 1YDSE 3II5A 4BCNA 2CGUA 4XLIA 3LQ5A 3PRIA 4JI9A 3I0QA 2G1TA 4GFGA 3TTJA 3IW7A 2W5AA 2BVAA 3EH9A 3QRIA 4H36A 4TWPA 2QO7A 2JAMA 4RBLA 3BWFA 4RWLA 2BAKA 2QURA 2WTKC 3LXKA 4MEDA 4XRJA 3U9NA 3OOMA 3E64A 1OIQA 3QGWA 4E26A 4OW8A 4O0TA 4F1TA 2O2UA 2YIQA 3UO5A 4HZRA 1P4FA 5GZAA 4FTMA 1EH4A 4CT2A 1MP8A 2RL5A 5ANGA 3RK5A 4YTIA 3CGFA 3GFWA 2WMVA 3H9OA 2E9PA 3DBEA 3HP2A 3LFEA 4QTBA 3VO3A 5FP6A 4M0YA 4F1MA 4PP7A 2JFMA 5E8SA 4BDEA 3FMKA 3LIJA 3OEFX 4LL0A 3QL8A 4WRGA 3LMHA 5E90A 5AV3A 4U9AA 1UU3A 3GB2A 4QRCA 4O0VA 3RZBA 3CEKA 2IO6A 2JDOA 3W32A 1OL6A 4DITA 5KBRA 1KUTA 2C3LA 2YZAA 5CAUA 4M15A 5F4NA 2SRCA 2J5EA 2W96B 2XNMA 4H3PA 3EKNA 3UYSA 4FL1A 4RVLA 2R5TA 4RFMA 3DBCA 1NW1A 3HDNA 5HVJA 4C2VA 4WNPA 3VBVA 1KE6A 5JFXA 4QYYA 4PP9A 4XP2A 4D2VA 4AS0A 4D4SA 5A4EA 2GQRA 4YC8A 4BDDA 2JBPA 3E8CA 4MD7E 4IVDA 4RA5A 5ANDA 4AT3A 4EBVA 1FMOE 4F6UA 5I4NA 3S0OA 2C6DA 2WTKB 4FNXA 1URCA 3CY2A 2YEXA 3HP5A 4IJPA 5J87A 2R3LA 3CP9A 1Y57A 3FHRA 2CKQA 3TUBA 2QO9A 4GT3A 4YPDA 4XV2A 3PJ8A 3KKVA 4QMTA 5KMLA 3Q4CA 4U44A 3RMFA 4OTQA 5IMXA 2RFDA 3DKGA 4PNKA 4PPBA 3SRVA 1QPDA 5JGAA 2E9VA 3MBLA 3ACKA 3CJFA 3KB7A 3OUNB 5EHYA 4DH7A 3MV5A 4DGLC 4YMJA 5CAPA 5IEYA 3TUDA 4OBOA 4UY9A 3AT3A 2YCFA 3V51A 4YBJA 4TWCA 1B39A 4YLKA 2OFVA 3DK7A 4YZNA 3ZSHA 4LUDA 4AN3A 1ATPE 3R2YA 2JKMA 3R8PA 3LFAA 3WYYA 1NVRA 4IEBA 2XYUA 2X81A 3QD0A 3ETAA 5EI8A 4JX7A 1MUOA 5CU4A 2IVTA 5HNIX 4LGDA 4RVMA 4XH6A 5TO8A 4JR7A 3MTFA 1KE5A 1OB3A 3OUKA 2XNOA 3RBWA 1VR2A 4YJUA 2OGVA 4B9DA 1T45A 4RG0A 5AR7A 4JDIA 3E8EA 3QYZA 2GPHA 2YACA 3P08A 5HBJA 2WEIA 2JKKA 4BKZA 4ZOGA 5AFVA 4AOJA 2EWAA 3R00A 4AZTA 3FL5A 4AX8A 3RINA 4QMWA 2W1HA 3CPCA 3RZFA 3VQUA 2W9ZB 2GFSA 3FKOA 3NLBA 2C4GA 3A4PA 2YDKA 2OF2A 2HIWA 3Q2JA 3WE8A 3ROCA 3QD4A 5CS6A 4YJTA 5M4CA 2XK7A 4IAYA 5HIDA 4CV9A 5HCXA 4XG3A 3ID6C 3PIXA 3KA0A 4O1PA 2GQSA 2C5NA 4UXQA 3FSFA 4CEGA 3C0GA 4FIFA 1MRVA 2WZJA 5AX9A 2OK1A 4MCVA 5H3QA 5HLPA 4QMNA 4FG8A 3E93A 3G33A 3OWPA 2W1FA 5I9WA 4XG7A 3MYGA 5KKRB 5DRBA 1UU9A 3PXQA 4GV1A 4EYJA 4TYEA 3QCQA 3RNIA 2PSQA 2O64A 2OXXA 5DIAA 4Z16A 4FSUA 4I0RA 2C5YA 4Z3VA 3U55A 2UV2A 4RGJA 4JBPA 3GCVA 3IKAA 4AZWA 3IDPA 3KRXA 2UW5A 1ZZ2A 4YO6A 4WSQA 1JNKA 2Y4IB 3ZM4A 2VD5A 3CSVA 2UW3A 4NWMA 2Y6MA 3T3UA 2H96A 4BDFA 5DR6A 2BZHB 3LMGA 2YLFA 3RPSA 3C1XA 4YZMA 3L8SA 5HO6A 3RM7A 3S95A 4DEAA 3PXRA 4NEUA 4DH8A 4EONA 2ZM4A 4D1ZA 4OAVB 4AA4A 2VU3A 3BLQA 3C50A 3OS3A 4FV6A 4O21A 4L45A 3T9TA 3DB6A 3UVQA 4AAAA 4RWJA 4ZSAA 1P14A 2QOCA 3PXFA 3QUDA 3K3JA 3NWWA 4FTNA 3R0TA 3D14A 3MJ2A 4FKQA 4ACMA 3UPZA 2X39A 3PVWA 2W9FB 4FT5A 3ZCLA 1LEZA 4BIBA 4DFLA 4QP8A 3BHTA 5J5SA 4FZAB 4GG5A 4EQUA 4IBMA 5KHXA 1A06A 4IZAA 5IQIA 4ID7A 4MXAA 4P90A 1TQPA 4RWKA 5HCYA 4JRVA 3HUBA 4QMLA 4WO5A 3DDQA 4YSJA 4UX9A 3OCGA 3DFCB 1J1BA 1GJOA 4Y73A 5M07A 3CQEA 5ANJA 3W1FA 4JAIA 2IJMA 4V0GB 3LFCA 4PX6A 3OWKA 4BCPA 3OFMA 3ZSGA 4FEVA 2VTRA 3QLFA 5EW9A 4ZAUA 4DCEA 2W1IA 3WF5A 5JH6A 2WMAA 5CEQA 4U3YA 5DN3A 2RF9A 4I22A 4JR3A 3UNJA 3WYXA 2ZB1A 1ZY5A 2JDTA 4C3RA 3KXNA 3FMLA 2YA9A 4ZZNA 4QP3A 2UW6A 4IDTA 2J2IB 5E1SA 4G1WA 3RAHA 3S1HA 3DJ5A 2CDZA 2PZIA 2VTPA 2W1EA 5DT0A 4BYJA 5KHWA 2UVZA 3PY0A 1PW2A 4WT6A 4I0SA 4GK2A 1XH9A 1L8TA 1DAYA 1Q24A 2OZOA 3BGQA 4XJ0A 5E8WA 2CN8A 2HZ4A 5CF6A 2QD9A 2OXDA 2YIWA 3OVVA 1XBBA 4I6QA 1IA9A 1U4DA 3TZ8A 2YN8A 5AMNA 2G9XA 3RPVA 4IWPA 4O7RA 2J4ZA 3G9LX 3DQXA 3OROA 3IQ7A 5LXMA 1BL7A 5HBHA 2XNNA 1NA7A 3I4BA 2UUEA 3KFAA 3NVMB 3Q2MA 4WG5A 2WTDA 3VRYA 2Y8OA 3QTWA 5L2WA 3O2MA 3QZIA 5BNJA 2WU7A 5AUWA 3QXOA 3ZU7A 1A48A 5FBNC 1P4OA 3I5ZA 3Q5ZA 4HGLA 2P3GX 4L53A 4O83A 4S30A 4NTSA 2QG5A 1G5SA 2IZTA 4FKGA 3TL8A 2CNQA 4FGRA 1ZY4A 5BYYA 4I41A 4RX5A 5IQHA 3POZA 5FG8A 1YKRA 3HL7A 5EM7A 5D10A 4ASXA 3CQUA 4KS8A 2R0UA 3ZBXA 2CKOA 4YZCA 3R1NA 4I21A 5DWRA 2WOTA 2OXYA 4YTCA 3UMWA 3DY7A 1XJDA 2QODA 4GVAA 4IB3A 3SXFA 2UZLA 3FMNA 3IPHA 4UMTA 4E6AA 4EHGA 4A9RA 2BIKB 1XH7A 3HDMA 4RRVA 2PL0A 2P33A 4O82A 2JC6A 5ANIA 1H26A 3HEGA 4YPSA 4EOSA 2HAKA 2IVUA 4OTFA 4D1XA 3C7QA 4GJ2A 2IZUA 4DLJA 4R8QA 3UDBA 3W8QA 4L3JA 5J8IA 4IWDA 5DH3A 4YJOA 1E1VA 5CZHA 4F9CA 1VYZA 2BRBA 4FV5A 5F20A 5HU9A 4PDYA 2HELA 5ACBC 3VUMA 4C33A 4RJ5A 5EQPA 1Q8ZA 3FLSA 2Q83A 2C30A 3R8ZA 4EI4A 1SVEA 4PL4A 4TZRA 3UIUA 3GOKA 5IA5A 4C4GA 5LVPA 3R21A 3BHVA 3MW1A 1R1WA 4ACHA 4WIHA 4M7IA 3BYVA 4W9XA 2EB2A 4APCA 5KMMA 3ZTXA 3PPKA 1PXOA 5EOBA 3E88A 3D7ZA 3MIAA 5JMSA 2XCHA 1ND4A 4IAIA 4MF1A 4UV0A 3A7HA 4CRSA 2X2KA 4BCKA 4LRJA 3TNIA 4CFNA 2C68A 3A7FA 4EKLA 4YURA 3BI6A 1SNXA 3EL8A 3TZ9A 3MS9A 3VJNA 2X2MA 4JX3A 1Y6AA 5CVHA 5DBXA 3ZUTA 4ZSEA 4FBXA 3FMJA 1Q99A 3PVBA 1VZOA 5GHVA 2ERZE 4BDAA 1YHWA 4BTFA 5JT2A 4YUQA 2UW0A 3QQFA 4FTLA 4YLLA 2R3RA 4FZ6A 2LGCA 3TG1A 2WOUA 2C6OA 3R28A 5LARA 3SG8A 4BZOA 5M4UA 3QTXA 1J3HA 2HK5A 3CLYA 3KXZA 4IZ7A 4NM7A 4ZTHA 5G1XA 1PXIA 2W1DA 4RJ6A 4X2GA 3DXPA 4F6WA 5LCJA 5LMBA 5EDRA 4ZK5A 5KMJA 3DA6A 5IQDA 4W4YA 2HOGA 2BFXA 2F57A 3PP1A 2RFSA 5D9HA 3P4KA 5HVKA 3U4WA 4V0GA 1NT2A 4S32A 4BCJA 4Y5QA 5AEPA 5ANOA 3ODZX 4BR3A 4ALVA 5CQWA 2QONA 2J0KA 4B8MA 3HAMA 4L3LA 4FVRA 5CYIA 3O8TA 3FXXA 4MBIA 3FZPA 2FGIA 4IM2A 4EZ3A 4IZ5A 5J79A 5I5ZA 1IG1A 3VS7A 4G34A 3NUNA 2VTHA 1PMEA 1LP4A 4IX3A 5AIKA 4UN0C 4GU6A 1ZRZA 5F1ZA 5CEKA 2C5XA 2EVAA 4IVAA 5KMNA 4DFXE 4QQCA 2V55A 2IVVA 4H1JA 4X21A 2YAAA 4B0GA 4XS2A 2C6IA 2X8DA 3AC4A 3HRBA 1TKIA 3CJGA 2CCIA 3DQWA 3QX4A 4KINA 3VUIA 5K4JA 4MD8E 3A7IA 2XH5A 2OJJA 3F5UA 4FTTA 3A99A 1BL6A 1WZYA 3H30A 3M1SA 4MYGA 3VF8A 4ANOA 4CQEA 3AQVA 3ALNA 2RKUA 1OIYA 5F95A 2B52A 1RW8A 2YIYA 2YLEA 2X7OA 2ZB0A 3AMBA 3AMYA 3QF9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3B2W A;  3PIZ A;  1GIJ A;  3RI1 A;  3WBL A;  5CAQ A;  4H58 A;  3AC3 A;  4FRF A;  3UP2 A;  4CFX A;  2PUN A;  3FKL A;  5BQ0 A;  3EQF A;  4S2Z A;  5C4L A;  4G2F A;  4FEX A;  1XKK A;  3E7V A;  3G6G A;  3LCS A;  1M2P A;  4FK3 A;  4FOD A;  2YIR A;  1VLR A;  4DTA A;  4XG4 A;  2WQO A;  3QUP A;  4AZV A;  3NR9 A;  2XZS A;  2BKZ A;  2J51 A;  2RFE A;  5IUI A;  3DK6 A;  2R64 A;  4L44 A;  3V6S A;  3EQI A;  3R7I A;  2E9U A;  4Z55 A;  4RC3 A;  2WHB A;  3BEL A;  4BKJ A;  4BIE A;  2VWW A;  5BVW A;  4H05 A;  3RAK A;  4ZJJ A;  1FVT A;  4M3Q A;  5LMA A;  5BPY A;  3C5I A;  4PL5 A;  2C1A A;  3AD4 A;  3SQQ A;  2ZOQ A;  3KN5 A;  4FNW A;  4CYI A;  4ZP5 A;  2OJG A;  4K9Y A;  5FQD C;  3R83 A;  4F0F A;  4A9S A;  5AR4 A;  1DAW A;  4BDI A;  1PYX A;  2OI4 X;  5JQ5 A;  2BHH A;  4FV0 A;  4G3E A;  4LFI A;  5EQY A;  2HZ0 A;  3LFB A;  3TXO A;  3RCJ A;  1WMK A;  3LFN A;  4PMT A;  3QQG A;  3PVG A;  2V7A A;  2C3K A;  2ZJW A;  2W99 B;  4GCJ A;  4EJN A;  2IPX A;  2B1P A;  3Q32 A;  1GZO A;  3SXS A;  3FI3 A;  4E3C A;  1G8K A;  4QTD A; 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