5JGDA

Crystal structure of human tak1/tab1 fusion protein in complex with ligand 12
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
306
structure length
295
Chain Sequence
GPLHMIDYKEIEVEEVVGRGAFGVVCKAKWRAKDVAIKQIESESERKAFIVELRQLSRVNHPNIVKLYGACLNPVCLVMEYAEGGSLYNVLHGAEPLPYYTAAHAMSWCLQCSQGVAYLHSMQPKALIHRDLKPPNLLLVAGGTVLKICDFGTAGSAAWMAPEVFEGSNYSEKCDVFSWGIILWEVITRRKPFDEIGGPAFRIMWAVHNGTRPPLIKNLPKPIESLMTRCWSKDPSQRPSMEEIVKIMTHLMRYFPGADEPLQYPCQHSLPPGEDGRVEPYVDFAEFYRLWSVDH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of a potent and highly selective transforming growth factor beta receptor-associated kinase 1 (TAK1) inhibitor by structure based drug design (SBDD)
pubmed doi rcsb
molecule keywords TAK1 kinase - TAB1 chimera fusion protein
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 88
structure length 295
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.25: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase.
pdb deposition date 2016-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jgdA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jgdA01
4IXPA 3LJ0A 4YC8A 5C4LA 3VUDA 5M4FA 4FV2A 2I0HA 3QD3A 4AACA 1ZYLA 1CSNA 4G2FA 3N4VA 3QRKA 4CFFA 4KRDA 1YI3A 4FOCA 5HBEA 4AA0A 4AQCA 4RIOA 3FL4A 3OBGA 4G6LA 5AIRA 3MSSA 4IM2A 4M0YA 4C61A 4JDJA 2FA2A 5KX8A 2QG7A 3MV5A 3UDBA 4USEA 1NXKA 1R39A 4QMLA 1ZMUA 4LV5A 5B0XA 1W82A 2RSVA 3PJ2A 3F9NA 4QTAA 5AP6A 4BCQA 4QMQA 3LE6A 4AZEA 4I0TA 1O6YA 4O7VA 3IOPA 1XH6A 3KN6A 5A4CA 4GYGA 4XRJA 2IJMA 1R3CA 4YZDA 4B99A 3KEXA 5CAQA 1JKTA 4W9WA 3E63A 5A6OA 2VTQA 5ETAA 3Q4CA 2ITQA 1FPUA 1Q4LA 1S9IA 4IWOA 4UMTA 3BIZA 4W8EA 5LVNA 4TWNA 4FNXA 4AOJA 3PIYA 5KMNA 4CCBA 4OTQA 4D1ZA 3H9RA 4F7SA 5F1ZA 4EZ5A 2WU6A 5LWNA 1OL5A 4K6ZA 4YZNA 5EKOA 3E7OA 4FT0A 4XG2A 2B54A 3PPJA 2FVDA 3QQLA 5DNRA 2QVSE 3LJ2A 4J1RA 3PY0A 4YJPA 3PG1A 5FM3A 2W1HA 4MQ1A 4UV0A 4DEDA 3FSFA 4QOXA 5C26A 4XG7A 5KCVA 3QKLA 4XV1A 4DTBA 3IW7A 4JG6A 3PIXA 2PVNA 2WMQA 4U81A 3OS3A 3E87A 3LCOA 4F7JA 1E1XA 2VWIA 3AT3A 5DOSA 4ENXA 4U7ZA 1ZYCA 3EQIA 4ZZOA 2QI8A 4FKTA 4XS2A 3VS6A 2B1PA 4RLKA 3RM7A 4DGLC 1H8FA 2H96A 4FODA 3ZS5A 5JFXA 2VO7A 4EJ7A 4Y85A 1IEPA 4ZLOA 4ONAA 1YHSA 2GHGA 3OD6X 3NRMA 4CCUA 4RWLA 5KO1A 4EH8A 2Y7JA 4ZTHA 5TE0A 2WMUA 2XKFA 4WD5A 3FV8A 1H01A 1XR1A 3I0OA 1FQ1B 3QCSA 4IAKA 3GENA 4Z9LA 2FYSA 5KHWA 2Y4PA 3FI4A 3MVJA 4WNOA 3VS5A 1XJDA 3FYJX 4G3DA 3WF7A 3PXFA 3RNYA 4C0TA 1BLXA 4V0GB 5BVNA 4V05A 3KU2A 4NKAA 4F9YA 3A8XA 4HYUA 2KTYA 4BIEA 1KUTA 1VJYA 2VNWA 5CXZA 5HE3A 2BZKB 2XM8A 3I1AA 4FZAB 4M15A 3F5PA 3FI3A 4BIBA 3SDJA 3NIZA 3QRTA 4JT3A 4O82A 3EJ1A 2C68A 3BBWA 2XF0A 3AMAA 3C4WA 4R6VA 3SRVA 4J7BA 4IC7A 3GU8A 4O6LA 2BILB 3HNGA 4QMSA 4C59A 4F1OA 4O7TA 2W5AA 3FSKA 3Q9ZA 3LCKA 4X2KA 3EQGA 4BHNA 5IEYA 4I4FA 5M56A 3MI9A 4FA2A 4CKRA 3C4ZA 1DI8A 4QP1A 3RMFA 3SXFA 3L8XA 4HJOA 3UODA 2RIOA 4EJNA 1H0WA 3REPA 2QOHA 2WTKC 1YOLA 3R63A 1H1PA 1WZYA 3TI1A 4WG3A 5I9VA 2JIIA 4UWBA 2PVMA 4HW7A 4QQCA 4OTPA 4XH6A 4AZTA 4QRCA 4BDHA 5IZFA 4KS7A 5FQDC 1K9AA 4G6NA 4QO9A 2ZMDA 4F9BA 4U79A 2F7ZE 3KVXA 4OBPA 4EH6A 3HLLA 3QFVA 5KMOA 4F6UA 2WTJA 4HVGA 4TT7A 1URCA 4UY9A 3U4WA 2BALA 5JRSA 4CRLA 2R3MA 2XK3A 4BGHA 1WFCA 3KN5A 4J98A 2GSFA 4G9CA 2E9VA 3H30A 2AUHA 3PUPA 2G1TA 3QUEA 4BFMA 4AZFA 3FEGA 4AXAA 5BYLA 4RC2A 2C0IA 4D4SA 3O2MA 4O2PA 5FM2A 4CZUA 3VAPA 4L3JA 1IG1A 2C5OA 3EH9A 1IR3A 2NP8A 4XV3A 3ZUTA 3TWJA 4ANBA 1UU3A 4MXXA 4AZWA 3UVRA 3S0OA 2GPHA 3O71A 3MBLA 4O27B 5AV1A 3ZBXA 2PZ5A 5JZJA 4EOPA 1K3AA 1Q8TA 2KULA 4Z3VA 2BHHA 3DKGA 3VS2A 3P79A 1YRPA 4UB7A 5HVJA 3TL8A 3OHTA 4JNWA 3O8PA 4QQJA 4PTEA 2VZ6A 5HLPA 5KMIA 4FKSA 3FUPA 1UWJA 3HUCA 4N4SA 4HPTE 4E26A 2J2IB 1JKSA 3RAHA 3V5LA 3Q2JA 3ROYA 1H26A 4HCVA 1NVRA 4YUQA 3BYSA 4F7LA 3R8UA 2YIRA 1XH9A 5LARA 3CLYA 4DEHA 4A9TA 4ERWA 2Z7SA 3D5UA 2GS6A 4RX5A 4O0RA 4RZVA 5J9ZA 3S4QA 3EFKA 4FG8A 1RDQE 4USDA 4XG4A 5A4LA 3QCXA 4KSQA 4ZMEA 4F6SA 4LUEA 4MYGA 4HYHA 5HO7A 3KULA 3R8VA 4N6ZA 5DA3A 4I93A 3OWJA 3M1SA 5FEQA 5LMKA 4IX3A 4O22A 1M7QA 5AP0A 4TXCA 4E8AA 3BHVA 2JEDA 2ZVAA 5CU6A 3GCSA 5AMNA 3TEIA 3CR0A 1FBNA 2W1FA 4NU1A 3VF8A 4ASXA 2VO0A 3IS5A 4FIJA 3KF7A 5HOAA 2JDOA 2VD5A 3TV4A 4F9CA 2JDSA 2OBJA 3GP0A 4RX7A 4KIQA 3OCTA 2C6IA 4E5AX 5HTBA 4XV9A 5L8JA 4W8DA 2YLFA 3MH1A 4DH8A 3FBVA 2NRYA 5BUIA 4TYJA 5CXHA 4BGQA 3MPMA 3DKFA 4YZ9A 4DF3A 3MGYA 4MCVA 4MWIA 4WNKA 5ANIA 3HECA 1GZOA 4EH7A 3FYKX 3I5NA 3ZZEA 4PMTA 3HMPA 3IDBA 2OICA 4JAIA 4MKCA 3FKLA 4U44A 5AP2A 5CT7A 5CSHA 3ORPA 2YIWA 4CTBA 4G16A 4W4YA 3LAUA 2PTKA 4BYIA 3R9RA 3VBWA 3PLAE 1FMOE 4FV4A 2IVVA 4FZ6A 2OF2A 5L2IA 4FGBA 3QHWA 3PVUA 2C3JA 4LRJA 1O6KA 2JC6A 4FTRA 3CE3A 3BPRA 4PWNA 4BDIA 5BNJA 5CU4A 5DFPA 5F4NA 3W32A 2CMWA 4QYYA 4BKZA 5IUGA 3PJ8A 4FTCA 2GNHA 1OMWA 3CGFA 3R22A 3R28A 5GJDA 4EQMA 4X2NA 3UG1A 5DT0A 3V3VA 3EL8A 5JRQA 3EWHA 2ZM3A 4UMQA 5E8XA 1OZ1A 4D28A 1Q8ZA 1BI7A 1BKXA 2VX1A 2QOBA 1M7NA 1V0OA 4G3EA 4FIFA 4O0YA 3WZEA 3IO7A 3VC4A 2WQOA 4H58A 3OWPA 1YVJA 4E6AA 4AUAA 1XBAA 2W4KA 5DEWA 4EH9A 4F0IA 2B53A 5IA4A 5FDXA 4K9YA 3QYZA 4AF3A 3COMA 3KREA 5ETIA 3OBJA 3PE2A 3KC3A 4CXAA 4FKWA 3FZ1A 4YHTA 3F88A 4NK9A 2UW4A 3OEZA 5HG7A 1TQMA 3ORMA 4RVLA 2WZJA 2QR8A 2OJIA 3DK3A 5EQEA 3OOMA 5B2KA 3EN7A 4YBJA 4OAVB 4LL0A 5L3AA 2Z02A 1KV1A 4F4PA 3FHRA 4S34A 4YJRA 3QTRA 3LIJA 4I5CA 3Q3BA 1T45A 4MNEB 4XBRA 3A7HA 4JIAA 3B2WA 3NW7A 4QNYA 5CVFA 2O65A 1BUHA 3AD5A 2PZPA 2CKPA 4RMZA 3QTWA 4JVGA 4TN6A 3FLZA 5LWMA 4CEGA 4ZOGA 3P1AA 2CLXA 1Q24A 2XKCA 3UVPA 5IQIA 3ZM9A 1OECA 5FXSA 5D7AA 5HCYA 2HOGA 2WOUA 3FKOA 3V5TA 4IWPA 4E93A 4AWIA 5BYYA 4QMYA 4M3QA 4IVBA 3F3UA 2FH9A 1ATPE 4IAFA 2WNTA 4NM0A 5AP1A 5KUPA 3U55A 4BDBA 4RBLA 3RJCA 5IQCA 2VGPA 3VQUA 1PXLA 2X39A 3KXXA 5ANOA 1Q62A 3MVLA 3UNJA 5FXQA 2JAVA 3P4KA 2I1MA 4HVSA 2C0TA 3BHTA 3CD3A 4L7SA 4P5QA 2ONLA 4NUSA 3L9PA 3RI1A 4BCNA 4JDHA 4QMPA 4IEBA 4MBIA 5I4NA 2EVAA 5J1WA 2PSQA 4BTKA 2GHLA 3K3JA 3GNIB 1Y8YA 3EYGA 3VQHA 4EK6A 4JRVA 3TM0A 1PW2A 4ZLZA 3CQEA 5KMJA 4CG9A 4B6LA 3ODYX 4IX5A 3POOA 3ZTXA 4KAOA 1BYGA 1F0QA 2BMCA 3EIDA 4RA4A 4RFYA 5JKGA 3BQCA 5AEPA 1DI9A 2BROA 2PMLX 3VN9A 3KXZA 2X9EA 4FIIA 4IVAA 4UALA 2J0LA 1PMEA 3AC2A 2YN8A 2XNMA 4C36A 2W1DA 3QC9A 4IACA 5AM6A 2B9HA 4BL1A 3LQ3A 2JKQA 5E8ZA 4J96A 4KKGA 4J95A 2OF4A 2XS0A 4ZP5A 3VS7A 4BGGA 1UKHA 3ZU7A 5CQWA 5AR5A 5IH4A 4KIPA 3BGPA 4O7RA 1ZOGA 2YM7A 3TV6A 3SAYA 4HCUA 2X6EA 4FKUA 3RM6A 4G1WA 4PPAA 1Q97A 3MPTA 4LRMA 4ZZMA 4BKYA 4ZZNA 2C6OA 1H27A 2V7OA 2YACA 5CS6A 3DB6A 3E8CA 3FI2A 3LMHA 3QGWA 4MF1A 3ZSGA 5IF1A 2O3PA 4KABA 3F5GA 4JR3A 3UOJA 2QNJA 2VNYA 3OT3A 2B9FA 3RINA 3ENHA 3NUXA 3OG7A 2UZLA 1LR4A 3WZDA 3TIYA 4PQNA 3LFAA 4HCTA 4CKIA 1EH4A 1GIJA 3MTFA 2QHNA 1GZNA 3A99A 2B7AA 4J97A 3SC1A 4O7LA 1CTPE 3U4UA 2OO8X 4Q2AA 4RJ4A 2I40A 3G90X 4D2WA 4EHZA 2NO3A 1Y91A 5CNNA 2V22A 3ZFMA 4MQ2A 4YO6A 4GSBA 5H2UA 2J90A 1XH7A 4FIHA 2I7QA 2WMSA 3KRWA 4H36A 2RGPA 4F1MA 4PY1A 4FEUA 3D14A 4GFGA 4FTJA 3MH0A 3GC0A 3Q4UA 2WQBA 2R4BA 4LV8A 3LM5A 4DEBA 2EWAA 5LJJA 3PG3A 4GRBA 4FKOA 3ZO3A 1LEWA 2W1EA 4GKIA 4M14A 4UBAA 2W96B 3UOHA 2B9IA 2XVDA 4FR4A 3TG1A 4LM5A 5K0XA 4FGRA 4FKQA 5TKDA 3UIUA 1MQ4A 2W1GA 2X7GA 4MH7A 2CLQA 3TKIA 3W2CA 1OKVA 4GK2A 1XO2B 2WKMA 2G15A 3E64A 3NUSA 5I3RA 3KXNA 3ORTA 4FTKA 4XOZA 3BYMA 5IDNA 3PLSA 3LMGA 4EC9A 4HVHA 2IW9A 5H8GA 5HE0A 1UNHA 3PFQA 5C27A 1R1WA 2R2PA 5CAOA 3Q6WA 4A4XA 4IB3A 4FKGA 1QL6A 5JT2A 1FGKA 1Y57A 4JOAA 5I9ZA 5IQAA 2J6MA 1MRYA 3KL8A 4E4MA 4FEWA 3ENMA 4ENYA 1ZAOA 4W9XA 5AR2A 4GJ2A 3TXOA 4Z16A 4P5ZA 4BCJA 3G5DA 4MNEA 1NY3A 4U5JA 4QPAA 1U54B 1PJKA 4IX4A 3U51A 3FLWA 3NAXA 3MFUA 2BKKA 3CJGA 2IZTA 4PL5A 1H00A 3VWAA 2CNVA 4BDKA 4WG5A 5GNKA 2PMNX 3R00A 2F57A 4ZTMA 4DGOA 3GOPA 4ZLYA 3O96A 3VIDA 4IDTA 3A61A 2X9FA 3A7JA 4U40A 2QOKA 2YIQA 3KFAA 5D1JA 3FMMA 3QBNA 3DKOA 3DNEA 1J7LA 4ZSEA 5LMKC 3FQHA 4CYJA 3BQRA 4BTFA 4BWKA 3RP9A 1ZOHA 4NKSA 2GS7A 3F3ZA 2BRBA 4M13A 4O0TA 4Q5EA 5D41A 3R7VA 4C7TA 1R0PA 4HVDA 4ANLA 2HENA 3NCGA 3FY0A 4IZ7A 5DLSA 2GNGA 4KUJA 1M2RA 3GFWA 1URWA 3NYNA 2YJRA 1JPAA 4I41A 4H3QA 4F63A 2CKQA 4BDAA 5JFSA 4UYAA 5AX9A 3TN8A 4FV6A 4XV2A 1KWPA 1G3NA 2BCJA 4ACMA 2PY3A 1WMKA 2JIUA 3IGGA 5GJGA 3KF4A 1U46A 5L8KA 5C8KA 3Q53A 3MH2A 4NL0A 3QTSA 4M7IA 3BX5A 4CMTA 4EOLA 3T3UA 2R7IA 4NJ3A 5JH6A 2BAQA 4PDPA 4XYFA 5HI2A 5A6NA 1KOBA 4M67A 4TW9A 4C4FA 2VTIA 3BGQA 3R30A 5M06A 2OWBA 2H34A 2W5HA 2QONA 3HMNA 3BE2A 4BKJA 5AV0A 4M0ZA 3G9LX 5DT4A 3CSVA 3ZXZA 3NLBA 3PRFA 5ICPA 2GNFA 3PSCA 2P55A 4HZRA 2XK4A 3I5ZA 1DAYA 4YNOA 5EQYA 5IQHA 3V04A 2BTSA 4D2PA 4WNMA 2HIWA 3C5IA 4AW5A 5FG8A 3MA6A 2OI4X 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