5BVOA

Fragment-based discovery of potent and selective ddr1/2 inhibitors
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
308
structure length
276
Chain Sequence
DFPRSRLRFKEKLGEFGEVHLCEVDSHPLLVAVKILRPDATKNARNDFLKEVKIMSRLKDPNIIRLLGVCVQDDPLCMITDYMENGDLNQFLSAHQLEDKPTISYPMLLHVAAQIASGMRYLATLNFVHRDLATRNCLVGENFTIKIADFGMSRNLYAGDYYRVQGRAVLPIRWMAWECILMGKFTTASDVWAFGVTLWEVLMLCRAQPFGQLTDEQVIENAGEFFRDQGRQVYLSRPPACPQGLYELMLRCWSRESEQRPPFSQLHRFLAEDALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-Based Discovery of Potent and Selective DDR1/2 Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Epithelial discoidin domain-containing receptor 1
total genus 92
structure length 276
sequence length 308
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5bvoA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5bvoA01
4JOAA 2B7AA 2YIXA 4O82A 4UMTA 3ACKA 3FQEA 3OT8A 3QFVA 3RHXA 3UVQA 1KOBA 4ZZNA 3IONA 2PVLA 4EZ5A 5J7HA 3RALA 2JKMA 4ITIA 4AN9A 3VQUA 4JIKA 3EN7A 3PPZA 1OIRA 3CQWA 3OEFX 3QD4A 3UE4A 4W9XA 2GNJA 1TQMA 1MUOA 5KHXA 5EW9A 5J1VA 3QZIA 5CEIA 4APCA 4G1WA 2XRWA 3EQDA 1UWHA 2HXLA 2PE2A 3GQIA 3EIDA 3QWKA 3BU6A 3FLNC 4FKGA 4TW9A 1OKYA 5M06A 1YHVA 3F3VA 2UZOA 5AP1A 1WBTA 3TG1A 1IEPA 5LMAA 4AZTA 4PTCA 4C4GA 4OAVB 3ZSGA 4XP0A 3PG3A 2W4JA 4YC3A 4RX9A 3W2OA 1JVPP 4CXAA 4QP4A 4MNFA 4CFMA 3A61A 4D2WA 2WMTA 3KKVA 5K0KA 3WIGA 5BMSA 4DFYA 2UZDA 4FOCA 3IW7A 3ORLA 5LVNA 3C0IA 2JBPA 3G9LX 2YIRA 5C03A 3TN8A 3FMLA 3N4UA 4NIFB 2XZSA 4QMYA 5LCKA 3PY0A 4ACMA 4L67A 3N4VA 4FT7A 3QZGA 2VD5A 4BKZA 3MA6A 4EOOA 5FTOA 3DXNA 4M97A 4P5QA 3DZQA 3E8EA 4X2JA 1PHKA 1Y91A 3ZRKA 5CEKA 2BDFA 4UMUA 5IH6A 4ZLYA 3OWLA 3TWJA 3KULA 4TWCA 2YIQA 4DH8A 1NW1A 4PTGA 5BVWA 1PKGA 2IZRA 3O71A 4MBJA 5AP4A 3PE1A 1SZMA 5KMMA 2GHMA 4O7YA 2YACA 4EQMA 3ZYAA 4EYMA 5I9WA 4I6FA 3PJ3A 1M52A 3PXYA 4CYJA 1H1PA 4K33A 4DT9A 1M2PA 3JS2A 3NZ0A 2X8EA 4Y8DA 2OZOA 2YN8A 4KNBA 2CKOA 1CKIA 3RM7A 3VW8A 1HCKA 3QTRA 3QCSA 3SX9A 3R63A 4BDJA 2Y6MA 3HA6A 3TZ7A 2Q83A 4MXYA 4R3PA 4HOKA 3F5UA 4MAOA 4DTAA 3EL7A 3BE9A 4FKSA 3HYHA 1Q8TA 4GVJA 2X2LA 3ZLSA 1YHWA 4IACA 4BDGA 2P55A 4M14A 4LRKA 3BYUA 4U41A 1H1QA 4D9TA 4E5WA 2OU7A 1BL7A 2V0DA 4M67A 5HO6A 1Q4LA 4GCJA 1MQBA 5D7AA 4O96A 4AUAA 4EQCA 5HBJA 4U5JA 3OTUA 2XB7A 5EOLA 5CF6A 3PSCA 4CMTA 1IAHA 1E1VA 3EQGA 5CT7A 1P4OA 2C0TA 5L8JA 3UNKA 3NYXA 1YVJA 2OFUA 3FMNA 4V05A 4JQ8A 3S2PA 3GVUA 2CGWA 4YLJA 4C36A 3BGQA 5DYJA 1LPUA 1PXMA 2IVUA 4A9SA 3CE3A 2JIIA 1Q8WA 2F9GA 4HVSA 4R5YA 5BVEA 1QPEA 3EFKA 4PDSA 2XEYA 5GIOE 4MYGA 2CKQA 4CV9A 4RSSA 4FT5A 4X3FB 4XOYA 3UG2A 1LEZA 3LLAA 2IW9A 4NWMA 4X21A 3FXZA 4NM5A 4TYHA 2YIYA 4PV0A 2ZMCA 3ZBXA 3D14A 2BUJA 4L68A 3R7IA 5J95A 4BYJA 1UU8A 2VWXA 4XG3A 1ERKA 3N51A 5IG1A 3VHKA 1SM2A 3P7CA 4WO5A 3COKA 4X6RA 4DFBA 4UEUA 4D55A 2X7OA 4FV5A 4GG5A 4JQ7A 4ZXTA 4PMTA 2C1AA 2X81A 4G9RA 5CAUA 4ASDA 2OF4A 4ASZA 5LQFA 4GK4A 3LFNA 2PVFA 2WMWA 3MTFA 2C68A 2BMCA 2CHLA 4ZJVA 2XJ1A 3P1AA 4XH6A 3R7EA 4FNYA 4JS8A 3U9CA 4BWXA 4XLVA 4NIFA 2QLUA 2RSVA 4EHVA 3ZRMA 2REIA 3H9OA 5A54A 3LXKA 3Q53A 4HVGA 3C5UA 3TKUA 2ZJWA 2ZDTA 3Q32A 2WTWA 5BYLA 3VIDA 4GIHA 5AFVA 4IVAA 4PDPA 5ANJA 1TVOA 3WF7A 4HGEA 4UV0A 5FBOA 2X8DA 3ITZA 5IA4A 3NUUA 1XH4A 1OI9A 4FR4A 3WZDA 4Y83A 2WU6A 3RAWA 4FZDB 1PXIA 4LOQA 1W82A 2X8IA 3D15A 4S31A 4FV9A 4HYIA 5JN2A 5LJJA 3U6IA 3HL7A 5LVOA 4L3JA 4DFUA 3I79A 3U54A 3RAHA 1FOTA 1P5EA 5EM8A 4FTAA 2UZEA 5IQHA 3BIZA 3DKFA 3GEQA 3ORMA 3O17A 4QMMA 2UW5A 2BPMA 4YZ9A 4E4NA 3EQPA 4AGWA 4OTDA 2VWZA 4IVDA 3AMBA 4OUCA 4ZTNA 5AMNA 3ZLWA 3O23A 5AUYA 3NUXA 3ZM4A 4BCGA 2C3KA 5HD7A 3R04A 4LYNA 1CSNA 2BKKA 4BKYA 2YITA 1IRKA 2Y6OA 3O8PA 4IAIA 3OCTA 2QO9A 3BGZA 4HGTA 3U9NA 3ZC6A 4LRJA 2QOCA 4NL0A 4P4CA 5JZJA 4DH7A 3EHAA 5IEVA 3NUAA 1Q99A 3LMHA 3RCJA 2VX0A 3G15A 3ORXA 5IA1A 3TT0A 3PZEA 3WZJA 4W4WA 5LXMA 2VN9A 1V1KA 3OG7A 4FTRA 4ITHA 4WBBB 4F0IA 3PE2A 4G9CA 4IX3A 4QP9A 3FXXA 4FTJA 4I4EA 3KFAA 3FI8A 5JGAA 5M53A 2RFSA 4O38A 5K5XA 2XIZA 4AT5A 5JFVA 3HRBA 5CI7A 3H0YA 3FLQA 2C30A 3FY2A 3QALE 4CGAA 5E7RA 3PIXA 4F65A 4RGJA 2PZPA 3E8DA 3QAME 3U55A 1W84A 4FBXA 5ANGA 4WBOA 5F4NA 4LL0A 2OSCA 2GMXA 4CG8A 4ONAA 1UNLA 3FHIA 2I1MA 3O96A 4GYGA 4O22A 4R1YA 4EYJA 4LGGA 5JGDA 2DS1A 4C4JA 2WU7A 5E8SA 5AUZA 3KY2A 5CSHA 3PLSA 3ATTA 3FKLA 2XK3A 3MW1A 5IDPA 5KCVA 2XJ2A 3NCZA 2J0MB 4KD1A 4HNFA 3PY1A 2UZNA 2BR1A 1S9JA 3T3UA 4PNKA 3DLZA 1CTPE 2W5AA 5FBNC 2OZAA 4OTWA 2AYPA 2A1AB 5IQDA 1SNUA 2P2HA 4G17A 4IZ7A 4F0GA 1OL1A 4M7IA 4C4IA 3PWDA 2UW3A 4O2PA 4RA5A 3LMIA 5JMSA 2BROA 4RIXB 1U5QA 3QTZA 4AE6A 4RZVA 1PMVA 2ZAZA 3DB6A 4J71A 3Q5IA 4IM0A 4WNPA 3TXOA 1IA9A 4QQCA 3IDCA 2CLQA 4C2VA 3VJOA 3R22A 1XBAA 2Y4PA 4MK0A 4MQ2A 4Z7GA 1KE8A 2WD1A 4KKGA 5HICA 2W0JA 5HIEA 2ZB0A 5KO1A 3ENMA 5DR6A 3SXFA 4DCEA 4AW0A 3EKKA 2QOKA 4YC6A 1KV1A 4FIFA 1PF8A 2O63A 5FXRA 4BTMA 4XV1A 5IISA 5GJDA 1DI8A 4RFMA 3UO5A 2ZV2A 4E73A 3HV4A 3NUPA 2XNMA 4DGOA 5L4QA 3CJFA 4PL5A 4I0RA 3LXNA 2I7QA 4CZUA 4I93A 3C4ZA 2Y9QA 4BFMA 3LCTA 1UU9A 3GC0A 3UIBA 3Q9WA 3L8VA 5AV2A 3ZLYA 3MA3A 4XRJA 4F9AA 1YWNA 4B7TA 3F9NA 5E91A 2VX1A 4FTMA 4BDIA 2RGPA 3LW0A 4YBKA 3K5UA 4XNEA 4AGUA 3DGKA 3CS9A 3DTWA 2WEIA 4O0UA 3B8QA 4Z55A 4R7BA 4C02A 3F82A 4FTCA 4GFOA 4G6LA 3W1FA 3U6HA 2VWVA 1PXPA 2YDKA 4MF0A 4YNOA 3ZSHA 4KRCA 4ZSJA 5IA5A 3WILA 1ZARA 4WHZA 3DOGA 3LJ1A 3E62A 3IPHA 3CLYA 4R7IA 4RJ6A 4D2RA 5HLNA 3HECA 4P2KA 4ZK5A 2IWIA 4FT9A 1J7UA 3UVRA 2XRUA 4DAWA 4QPAA 1U54B 1GIIA 5DI1A 4FODA 3R71A 1T46A 1ZOEA 2QO7A 1BMKA 4AN2A 3DAKA 5T3QA 2RG6A 3WF8A 3R1SA 4FG8A 3GU5A 3RWPA 3UMWA 4BCNA 5B2LA 5JH6A 5EQPA 3NVKI 5LCJA 1H01A 2OIDA 3ORZA 4DLIA 3VS1A 1ZWSA 2C6OA 3DXQA 2E9UA 4E26A 4EWHA 3W16A 4CRLA 5A4TA 3CBLA 3OWKA 1GZNA 1H25A 2VU3A 3S95A 3EN6A 3UPXA 3ZMMA 4ZTMA 3BX5A 3LPBA 2FVDA 4FVQA 2BZHB 4YJQA 3L8XA 3R1NA 3MV5A 3WZEA 3ZBFA 5EDRA 2G9XA 5EHLA 3BBTB 3F2RA 4YNEA 4CTBA 2QCSA 4QYHA 3UQFA 2GSFA 4X2NA 4UMPA 2BILB 2FA2A 2VUWA 3L9PA 4LGDA 4FG9A 4XV2A 3TKHA 2YCSA 4AZVA 4X2KA 4O86A 3W2RA 1ZOGA 2UUEA 5EOBA 2XK8A 4A9TA 3O7LB 4QP8A 2VTPA 4MXOA 3VRYA 4TPTA 1IASA 3EL8A 3FUPA 3IW5A 3PSDA 2X39A 4HNIA 5J9ZA 1TQPA 4AZEA 3F7ZA 4RIXA 5CQWA 5F1ZA 2GS2A 5HLWA 4FL3A 3UBDA 3HZTA 3RNYA 2UZUE 2FO0A 4IWOA 5EHOA 5FM3A 4LV8A 3TM0A 2B54A 1IG1A 4QNAA 4JX3A 3RP9A 3FPMA 3NUNA 3FQHA 3Q4CA 5DRDA 3A7FA 2OXDA 3VN9A 4AAAA 2VO6A 1Q5KA 2BZJA 4AW2A 5AADA 1L3RE 4E6QA 2XBAA 4IBMA 4CCBA 3PXKA 4HJOA 4MWHA 4OGRA 4WSYA 2XEZA 3QUPA 2BALA 4U40A 4U81A 5EKNA 1RQQA 3QUEA 3BWFA 1VR2A 5AAEA 5CEPA 3GOPA 1Y57A 1JKKA 3E3PA 4CKJA 2VRXA 3U8WA 2C0IA 1XO2B 3QTXA 4YJRA 3CD3A 4L7FA 2A4LA 2CKEA 4QTDA 2VTTA 3NSZA 5I4NA 1OPJA 2B1PA 2CDZA 3M11A 3UO6A 1URWA 2UZWE 2Z7QA 2GFCA 4FKIA 1XH8A 4NEUA 3NUYA 2VAGA 5DHJA 1IAJA 3WBLA 3ACJA 4EEVA 4KA3A 3A62A 3CGOA 3Q4TA 4GL9A 1SVGA 5EW8A 4C61A 4CTCA 4AZWA 1GNGA 3NAYA 5LVMA 4FV1A 4FUXA 4FZAB 4EHGA 4A9UA 3HRFA 4GKIA 1CDKA 2IO6A 2C6MA 3F5GA 5HCZA 1NT2A 4QMNA 2W05A 3QLFA 4FV2A 4OTIA 3ZO3A 5AX3A 3UC4A 2JGZA 5FD2A 4EOJA 3R7YA 5L8KA 2OJGA 3VBWA 2W9FB 4FV3A 5DMZA 3ZH8A 1ND4A 3TIYA 4FSNA 4FTLA 3NS9A 3AOXA 3VS5A 4B8LA 5CVHA 5H2UA 3VHEA 4O7VA 1M7NA 4W8DA 2CCIA 4RWLA 4WIHA 5E92A 3QWJA 1J1CA 3EWHA 2R3LA 3OEZA 4FYNA 3QXOA 2OJIA 3SRVA 3VF8A 2YZLA 4DGGA 1AQ1A 2YWPA 3KEXA 3KXNA 3OF0A 3PXRA 3PY3A 4U8ZA 3R7VA 2ZOQA 4HPUE 4BI2A 5HQ0A 2HYYA 3DPKA 1SVHA 4USFA 5H9BA 3MDYA 3AD5A 3E7OA 3VW6A 4O84A 4MXZA 3A4OX 2PMOX 3C9WA 1X8BA 4YZNA 2C3LA 4MXAA 3H0ZA 5BQ0A 4Y5HA 4O7NA 3CPCA 1FMKA 4HZSA 3SXRA 2GPHA 1R0PA 2BAJA 5HBEA 4IX6A 1GZOA 4ZSGA 4A7CA 2ITQA 4QMZA 1GIHA 2PVMA 2WMRA 2WPAA 5CEOA 1YOJA 5KHWA 2C6IA 2XIRA 4IB0A 4HYHA 4FT0A 3VF9A 3BHTA 3Q3BA 4H1MA 2BRBA 3KQ7A 4RVTA 3C4XA 4G3CA 4JLCA 3A7GA 5A4EA 4TNBA 2H9VA 1UU7A 3FSFA 5KZ0A 5C4KA 3BU3A 3MPTA 4TWOA 2YM7A 4HGLA 3GOKA 3KU2A 3IW4A 4G16A 1H0VA 3PVGA 4BZDA 4G3EA 3FJQE 2PWLA 4AA4A 4ALVA 4TYEA 4BDDA 4YPSA 3KMWA 2XKEA 3BEAA 3MVHA 2BIKB 4NSTA 4O7SA 3P23A 2JFMA 3GENA 1R39A 5HKMA 4DGNA 3EFJA 5ACBC 4BDBA 3MVLA 4FV6A 3QD2B 1PXNA 4XG2A 4BCMA 5E8TA 4EC8A 4AGCA 2B9HA 1A06A 3M1SA 5ETAA 5BNJA 3PDTA 3DXPA 2YZAA 2A19B 4EONA 4AOJA 2PSQA 1CKPA 3EZRA 4NJ3A 1SVEA 3KF4A 1UWJA 2IW6A 3DJ5A 1Q3DA 1FVRA 1KE6A 3CY3A 3QCXA 5D10A 4FV7A 2B9FA 4ERKA 2G2HA 3KA0A 4Y72A 1YQJA 5HNBA 4EH3A 3I5NA 3R9NA 2UW4A 3QHRA 3DBEA 3HGKA 1H8FA 3DV3A 4XP2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JOA A;  2B7A A;  2YIX A;  4O82 A;  4UMT A;  4AAY A;  3ACK A;  3FQE A;  3OT8 A;  3QFV A;  3RHX A;  3UVQ A;  1KOB A;  4ZZN A;  3ION A;  2PVL A;  4EZ5 A;  5J7H A;  3RAL A;  2JKM A;  4ITI A;  4AN9 A;  3VQU A;  4JIK A;  3EN7 A;  3PPZ A;  1OIR A;  3CQW A;  3OEF X;  3QD4 A;  3UE4 A;  4W9X A;  2GNJ A;  1TQM A;  1MUO A;  5KHX A;  5EW9 A;  5J1V A;  3QZI A;  5CEI A;  4APC A;  4G1W A;  2XRW A;  3EQD A;  1UWH A;  2HXL A;  2PE2 A;  3GQI A;  3EID A;  3QWK A;  3BU6 A;  3FLN C;  4FKG A;  4TW9 A;  1OKY A;  5M06 A;  1YHV A;  3F3V A;  2UZO A;  5AP1 A;  1WBT A;  3TG1 A;  1IEP A;  5LMA A;  4AZT A;  4PTC A;  4C4G A;  4OAV B;  3ZSG A;  4XP0 A;  3PG3 A;  2W4J A;  4YC3 A;  4RX9 A;  3W2O A;  1JVP P;  4CXA A;  4QP4 A;  4MNF A;  4CFM A;  3A61 A;  4D2W A;  2WMT A;  3KKV A;  5K0K A;  3WIG A;  5BMS A;  4DFY A;  2UZD A;  4FOC A;  3IW7 A;  3ORL A;  5LVN A;  3C0I A;  2JBP A;  3G9L X;  2YIR A;  5C03 A;  3TN8 A;  3FML A;  3N4U A;  4NIF B;  2XZS A;  4QMY A;  5LCK A;  3PY0 A;  4ACM A;  4L67 A;  3N4V A;  4FT7 A;  3QZG A;  2VD5 A; 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