1BKXA

A binary complex of the catalytic subunit of camp-dependent protein kinase and adenosine further defines conformational flexibility
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
339
structure length
337
Chain Sequence
QESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFSEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A binary complex of the catalytic subunit of cAMP-dependent protein kinase and adenosine further defines conformational flexibility.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE
molecule tags Complex (phosphotransferase/adenosine)
source organism Mus musculus
total genus 88
structure length 337
sequence length 339
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 1997-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1bkxA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1bkxA02
2CGWA 3DLZA 3L8SA 4U79A 4MNEA 3C4XA 1BUHA 3DS6A 4UMTA 5LMKA 4AN2A 4JIAA 4KBKA 3DBQA 3SX9A 2ERKA 3HV5A 4UYNA 4BTMA 2VTLA 4KIPA 2JKOA 4PWNA 3D7TB 5ANIA 3ORZA 5CLPA 2PSQA 4FTUA 2C6TA 2HWOA 3QX2A 3KRRA 1FVTA 1UWJA 4FICA 4FSMA 4YBJA 4CRSA 2CKOA 3BIZA 2J2IB 4J71A 3IW6A 2PYWA 2QOHA 2QI8A 1H00A 1YHWA 3T9IA 3MY0A 3ZHPC 5ACKA 3LFFA 4F9WA 4O0TA 4CD0A 3RCJA 4IXPA 2C5NA 2Z2WA 4CMUA 3OC1A 4WRGA 2A19B 4NFNA 4AS0A 3FZPA 4J96A 3UPZA 5L4QA 2OZAB 3QA8A 1OZ1A 2E9NA 4MD7E 1DS5A 3OT3A 4L7FA 2OBJA 2C30A 2CHLA 1AD5A 1QPJA 2W06A 2PUPA 3FMKA 2CJMA 3BYMA 5IUIA 1J1CA 2JAMA 5E9EA 3LLAA 1ZOHA 3BPRA 5IISA 4GK4A 2QVSE 4BCGA 5DEYA 5BVKA 2I0VA 5KBQA 3IGGA 4ZJJA 2PK9A 2G01A 3PSDA 3RBWA 2ACXA 3C4EA 3D15A 4U0IA 3S3IA 3R8LA 3BHYA 3TKHA 4FK3A 4ZSLA 4O7NA 4IZYA 1H1QA 4HNFA 5DRDA 3QXPA 5CZIA 4C4EA 3QWJA 2BFXA 2CGXA 3FLSA 3ZFYA 3I7CA 1XBCA 2Q83A 2BTSA 3RVGA 3TKUA 4H39A 5EH0A 4R5SA 4WUAA 4FTLA 3UO5A 2W1CA 4WNOA 4PPAA 4MNFA 3EMGA 3RM7A 1H07A 4V01A 3GBZA 4IZAA 3C0IA 3FYJX 3DNDA 5DFPA 3V51A 2QHNA 3A2CA 3AMAA 2ZAZA 3NW6A 3UMXA 2E9OA 4R3CA 4F9AA 4OLIA 1H1WA 3EB0A 1R0PA 4AX8A 4JT3A 4DGOA 4FTJA 4KRCA 2BTRA 4BF2A 4K9YA 2OF2A 2R3QA 3G2FA 2W5AA 3DOGA 3Q4CA 2AYPA 5L3AA 1JWHA 1S9IA 3CKXA 3LOKA 3I0OA 2WOTA 2BZJA 1RQQA 4FL2A 2ZVAA 3LFEA 4XG3A 3UOJA 2UZWE 5AX9A 4LGGA 4TYIA 4C34A 1OVEA 2C1BA 4P5QA 3NUNA 3RCDA 2I0HA 2CNVA 4NM5A 4G3GA 4EH4A 5C8NA 3C5UA 2HELA 4QMYA 3D5VA 1ZMVA 2R3FA 4HJOA 1H27A 3G15A 5HO6A 3ZO3A 3MVMA 1UV5A 3KB7A 4FV8A 4D2WA 3RZFA 1BX6A 4U6RA 3PDTA 2X6DA 4L68A 3GGFA 4YC8A 1FVVA 5I9XA 2EB3A 3VQUA 3PE2A 3RPSA 4APCA 4B99A 4HVHA 4L52A 5FBNC 4YO4A 2A4LA 3KXHA 4TWNA 3R8ZA 4AXAA 4EK3A 3NEWA 4CT1A 3FMDA 3BV2A 3VHEA 3RAHA 3GOKA 2Q0BA 5CS6A 3QC9A 4LV5A 3ITZA 5DT4A 4IB1A 4RWJA 3VBYA 1R1WA 4X3FC 3CIKA 4QQTA 3BQRA 3M1SA 3LMGA 2RL5A 3BQCA 3Q96A 5KZIA 1NVRA 4ZIMA 1UU8A 3MH3A 3QALE 4BDEA 4DEHA 5KMJA 3RGFA 4A9RA 1WZYA 2HZIA 3W2CA 3DK6A 3PLSA 5J9YA 3HDNA 2WO6A 4ANOA 2XMYA 5AUXA 4HCTA 3QLGA 3D5XA 3OTVA 3MPTA 2P2IA 4D9TA 5HVYA 4MXXA 3RPRA 2H96A 2QOCA 2XUUA 3MPAA 4QMPA 4UWYA 4ZTRA 3MS9A 4FUXA 4R77A 4NIFA 3P7BA 4PMSA 3OY1A 4TZRA 4XEYA 4C4JA 4E7WA 1GIHA 4BHNA 1CKPA 3QQHA 5AWMA 1APME 1FQ1B 1ZYLA 4JRNA 5K0KA 3ZRLA 5E8TA 4CKJA 3RALA 2GQGA 1NXKA 3BCEA 4QMNA 2YHVA 4I0TA 3RPOA 1YVJA 3QQLA 4EHVA 1X8BA 5HEZA 4FIIA 5AADA 2F2CB 2QO2A 3QTRA 2W96B 3NNXA 5ANEA 5M56A 2JFLA 4KBCA 2VUWA 3TTIA 3EN6A 4C58A 1FGIA 3F3VA 4USDA 3CXWA 3FSFA 5M07A 5CASA 4EZ7A 5D11A 2EVAA 3H0ZA 4L53A 1STCE 5H8GA 3RMFA 3VBXA 3CC6A 2DS1A 4ZJVA 2CSNA 4JRVA 3ACKA 4X21A 2VTOA 3FI2A 4AA4A 1Q8WA 5I9VA 2W05A 3MI9A 3EKNA 5M4UA 2WMSA 2OH0E 4FOCA 3II5A 1RE8A 3VW6A 3RPYA 4IDTA 4YJNA 4CYJA 4LUEA 2R7BA 2R2PA 3NS9A 4EHGA 4AE9A 4N4SA 4EOQA 2J0LA 3SGCA 4LFIA 1PXMA 2E9PA 3MA3A 5HIBA 4A9YA 5M4IA 2WAJA 4NU1A 1YXTA 2CCIA 4KA3A 2BDWA 4UZHA 5DLSA 2WFYA 4HYHA 2PUIA 2REIA 3K5UA 2Y7JA 5A9UA 2WTIA 2UV2A 4YHJA 4D0WA 4BGGA 3DJ5A 4IZ5A 3QTZA 5K3YA 3DTWA 3FKOA 3RTPA 4V05A 4EK4A 1WBPA 4IZ7A 1M2QA 1U54B 3AMYA 2G2HA 1ZZLA 4JDHA 4KKHA 4RVTA 1YOLA 3IDCA 3TL8A 3VWAA 3FSKA 3TUDA 3MFUA 5L8KA 3A4PA 4XV9A 3AG9A 4IEBA 5ANGA 2F7ZE 4ZLZA 3RINA 3MH0A 5LJJA 3FXZA 5J1WA 1FMKA 5FP5A 2BUJA 2ITOA 3TJDA 3QA0A 4Z55A 1OIRA 2VTRA 3GI3A 4FZAB 1H26A 4QYYA 3ETAA 4AA0A 3QGYA 2YJRA 4ZZNA 2JLDA 4UMPA 2WMQA 3BRBA 1BL6A 4ERKA 4RWLA 1EH4A 5AAGA 4YGAA 5IA5A 4A06A 4D28A 5IDPA 1KE6A 5K5NA 2YWVA 4O0RA 4R7HA 4Y46A 5JZNA 5CXZA 3BGPA 4ONAA 4FKLA 4KUJA 3GENA 3NGAA 3R7YA 4KIKB 5HIEA 4PRJA 3EQRA 4DEBA 4APPA 4BDAA 3QCSA 4D0XA 5TR6A 3UG2A 4YURA 2JIIA 1GY3A 3L9MA 4OTRA 4JDKA 1YOMA 2P0CA 3SDJA 2W9FB 4JBPA 5JT2A 2WOUA 5EHYA 4A9SA 5AR3A 3DY7A 4EOOA 5AX3A 4YZBA 5KCVA 5E1EA 2QO7A 2WB8A 5HG8A 4B7TA 5KMLA 4FTAA 5AIRA 2CLQA 5J7BA 2HWPA 2W1GA 3MYGA 5HD4A 4IQ6A 2HYYA 4MVFA 4R78A 1H08A 1MUOA 2C3LA 3FQHA 4AACA 3E63A 4BDJA 3HRBA 3VNTA 3NVKI 3JY9A 3P86A 3PA4A 5HHWA 3UGCA 3VJOA 3ZEPA 1PJKA 1RDQE 4R3PA 2GS6A 5KZ0A 3UODA 3DFCB 3FKLA 4LGDA 1U4DA 4GJ2A 2B55A 3A99A 3PA3A 4LG4A 3ODYX 3KRLA 3SD0A 1I09A 3BYSA 3NAYA 3PSBA 4Z9LA 5I3OA 2XNOA 4XG7A 4YMJA 2PWLA 4BIEA 3OW3A 5JKGA 3EQHA 3PRFA 1ZYDA 4PV0A 4AW5A 1U5RA 3VBWA 5FGKA 4TY1A 3LVPA 4ACCA 2C0TA 2XKCA 4QQJA 3ORIA 2GNIA 2VX3A 5HE3A 5CYIA 4FV0A 4XHKB 2VTSA 3QTIA 2GS2A 3GU4A 4CVAA 4O7YA 2JBPA 4X3FA 4XBUA 4YLLA 4JJRA 5KX8A 4M84A 3JPVA 3LFCA 5I9ZA 3A62A 5IEXA 4YJOA 2XYUA 5HCYA 2FB8A 3DDQA 1QPEA 2W9ZB 3DKFA 5H8BA 3R28A 4R1VA 3CGOA 4Y73A 3T3UA 4G6LA 4EKKA 3NIEA 4BIBA 4NM3A 4WNPA 3QKMA 3Q4UA 2BIYA 4AW0A 1B6CB 4RJ8A 2Y0AA 2V7AA 3KGAA 4C37A 1JKKA 1GOLA 4EJ7A 1OIYA 3F3ZA 3O96A 3C0GA 2WMTA 5IF1A 4MAOA 4M13A 2BR1A 4LRJA 4EH8A 1SNXA 3L9PA 3M2WA 4RLKA 1H0VA 4GUBA 4YSMA 4ZEGA 1OECA 4PMMA 3BLRA 5C27A 1IRKA 4O6LA 3FMLA 3I1AA 4NEUA 4EYMA 4YTFA 4BDBA 5FEEA 5A4CA 5CEKA 3PXZA 3JXWA 5CI7A 3Q3BA 3AOXA 5EOLA 4J52A 4BZOA 4IAFA 2PVMA 3D2IA 4G9RA 1PKDA 2X1NA 1JLUE 2PVRA 4DYMA 4FG9A 4XP3A 4U3YA 4QRCA 1LEZA 1YQJA 3RHXA 2QODA 3CQWA 3U51A 3UIBA 4LOQA 4NWMA 3FZSA 3RP9A 2C6DA 1CKJA 3DLSA 3MJ2A 4L3JA 5FBOA 3NW5A 2QOOA 5ETAA 3UP2A 3OY3A 1WMKA 4LOOA 1WBTA 5AR8A 3ZO1A 3PWDA 3NRMA 3PP1A 3TNQB 4BDCA 3A7JA 4U81A 3F3UA 1UVRA 4PX6A 5CZHA 2G9XA 1OL7A 5DEWA 5C1QB 4M7IA 4P5ZA 2BAQA 3WF8A 2UW8A 4E6CA 4PL5A 5IA3A 3PZEA 1XBBA 3MBLA 3EZVA 3HGKA 4EH6A 4EOPA 5JGAA 3R7OA 3W16A 4R1YA 2XIKA 3JY0A 3GC8A 4I20A 2UZBA 3O7LB 4Y85A 3VS2A 4FIFA 2IZTA 5EYMA 5HVJA 3WYYA 4EZ3A 4WNMA 4PDPA 5IU2A 3FPMA 4HGLA 1ZARA 5EM6A 3QCYA 4GFGA 5AIKA 3ZUTA 5L2IA 1F0QA 2UZDA 4FV9A 2XNGA 3IO7A 3E92A 2V62A 4GFOA 4LGHA 4EK6A 4UZDA 4NJDA 4FOBA 3Q6UA 3SRVB 3LXPA 2W5BA 3B8QA 4YZMA 4F6SA 3DK3A 3F3TA 1JBPE 3F66A 1R39A 3QXOA 4XOYA 4BYJA 1WBNA 4ZLYA 2VD5A 2V22A 1SYKA 5LXMA 5KMNA 3KU2A 4TXCA 3ULIA 5CAQA 3MVLA 4EHEA 5HU9A 3KN6A 3FQEA 4RX9A 5J8IA 5TE0A 3FI3A 3ZMMA 4NK9A 3P78A 2NP8A 4V0GB 5AUUA 2G15A 4F99A 2R3PA 1Q61A 3GFEA 2C3JA 3PYYA 3SXRA 1KSWA 3C4WA 3HRCA 5CENA 2PMLX 3ODZX 4UN0C 4BZNA 5HQ0A 5B0XA 3FL4A 4I41A 2BVAA 1Q24A 4YLJA 3CS9A 2XJ2A 4Z7HA 4A07A 5LCKA 5F94A 3P4KA 4E5WA 3QZIA 4PF4A 4FTQA 2QNJA 3OWPA 1OMWA 4N6YA 2PE2A 3C0HA 3WYXA 4GCJA 1A06A 3GXLA 4E5AX 5EQYA 3KQ7A 2VWUA 4XLVA 3ZUUA 4CMTA 3W55A 5C8MA 2IZUA 4O1OA 3OVVA 4H1JA 4O0UA 4FNWA 4F08A 4NW6A 4A4XA 4QTCA 2OJ9A 4J99A 3PXFA 3D83A 3MSSA 3KL8A 4RX5A 4XS2A 4BY9E 5BUIA 3G6HA 3WZUA 3KA0A 2C3KA 1UKHA 1Q41A 2XKFA 4JQEA 5T6KA 5CF5A 1K2PA 5M4FA 1JSVA 4B6LA 4DHFA 3PA5A 1HOWA 3KXMA 3QD2B 3GEQA 4OTQA 3O17A 5BMMA 2IZSA 1P4OA 3EIDA 3LXNA 5K9IA 1VEBA 5HORA 1XBAA 2WTJA 3PVBA 4IACA 3ZM9A 5KHWA 2F4JA 4CLJA 4FL1A 4FEXA 2WEVA 4G6NA 4F63A 4FNZA 4AWIA 1Q4LA 3EQPA 3DXNA 3U6JA 3KCKA 2ETMA 5JFVA 3UO4A 5EYCA 4RT7A 4FV5A 4FKJA 4W8EA 4U44A 1LPUA 3HMNA 3HUCA 2R3OA 2B4SB 4RIOA 4EHZA 3HUBA 4C4IA 5ITAA 2GU8A 5E1SA 2F57A 3LXLA 4C59A 1J91A 3IECA 4ZTLA 4IMYA 4DCAA 4O7VA 3M11A 2CNQA 2PULA 5CX9A 3AC1A 3HECA 4YJRA 4BCOA 5ETCA 2ITXA 2YACA 3PIZA 4XV1A 4C62A 5JQ5A 5A3XA 2BRNA 3PRIA 5HG7A 2I7QA 2YCFA 4JBVA 2JAVA 3D14A 5FXRA 1TVOA 2BRBA 2XRWA 1OKZA 3BELA 3AC8A 3DB6A 3KXNA 4K33A 4QTAA 4KBAA 4JS8A 4JBOA 5BYYA 4FV1A 3A7IA 4IM3A 4G16A 4NT4A 3TI1A 1OM1A 3BBWA 3ZCLA 5KMMA 4DGGA 5L2TA 4G5PA 4ZOGA 4M68A 3UPXA 4D2RA 1PXJA 1V0OA 4EH2A 4QNYA 4XUFA 2QOLA 4TRLA 3RM6A 2GMXA 4GG5A 3WBLA 3HP5A 4EJNA 5DMZA 3C5IA 5BVWA 5ETIA 1J3HA 3DQXA 5FM3A 5AUTA 3TV4A 3R2YA 3D7TA 1XH6A 5FM2A 2GS7A 5CWZA 3TUCA 1MRUA 4O6EA 4RIYB 1YKRA 5J9LA 4RGJA 2W1HA 3V01A 5LVNA 5JGBA 3BX5A 4EQUA 4DG0E 2ZJWA 1PF8A 4WNKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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