3ZDUA

Crystal structure of the human cdkl3 kinase domain
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
309
structure length
297
Chain Sequence
MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYNKIAMREIKFLKQFHHENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTDIYDDEVATRWYRAPELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELKAKLLQEAKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of the Human Cdkl3 Kinase Domain
rcsb
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT KINASE-LIKE 3
total genus 89
structure length 297
sequence length 309
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zduA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zduA01
4YJSA 3TNHA 5BVWA 3VUMA 3DAKA 5E4HA 3FLSA 3K2LA 3PSCA 5GZ9A 5DR6A 3ZFMA 2HCKA 3FMJA 1WVYA 4CTCA 5CAUA 3F9NA 5IQAA 5CEMA 3UMWA 3GQLA 5HI2A 2GSFA 3O71A 4O96A 4RSSA 2YCSA 3SQQA 3WIKA 3A99A 1DAYA 2ZV9A 2OJJA 3HECA 3I5ZA 3ITZA 2YWPA 1MQBA 3OTVA 4FKSA 5D12A 2B52A 3L9PA 2X8EA 3LQ8A 3PP0A 3AD5A 4HYUA 3O17A 1FVTA 4ASDA 2YLEA 4O0WA 1R0PA 1GZOA 2JIIA 4KBAA 4F64A 3DKFA 2VWWA 3LKMA 5IUGA 3FJQE 3RK5A 3IW8A 1YOMA 4PMMA 2W4OA 2Q0NA 3ORPA 3VS4A 3GI3A 4D0XA 4D9UA 4YTCA 5BQ0A 5ETFA 3O8UA 1Z57A 3PRFA 3BYUA 2E9OA 5T3QA 1PMVA 4BTMA 2QOQA 3CKXA 4C62A 1O6KA 3LCTA 4LUEA 5GINE 1L3RE 5BPYA 5CT7A 2QQ7A 4DG3E 1H08A 4AZFA 4DFNA 3OXZA 2VX3A 3KXXA 4FTNA 3Q5IA 4BGQA 2F2CB 4NZWB 5EDPA 5A4LA 2H96A 4FIIA 2R3IA 3KRXA 4LRJA 3AGLA 3OT3A 2OFVA 1E1XA 4H58A 5KMOA 2QO9A 2YWVA 2PE1A 1IASA 1MUOA 2QONA 4NT4A 5ANKA 3E87A 5AA8A 3CSVA 3D5UA 1RW8A 2UVXA 4X2KA 3UQCA 1NW1A 2BZIB 4NCTC 2VO7A 2I0HA 4FSUA 5CVFA 4BBFA 4RX8A 3VS1A 2DQ7X 3QWJA 2Y7JA 5IA4A 4LYNA 3PY3A 2WTKB 2WGJA 4F65A 3DY7A 4JAIA 4BB4A 4YSJA 3EFJA 3R1SA 4FV1A 4O7WA 1JKSA 3MIYA 4JDHA 1OPLA 4QQ5A 3FMMA 3TZ9A 4I5CA 5A6NA 5L6OA 3FMLA 2X1NA 2PTKA 5B7VA 3BCEA 3DK3A 4MD9E 4R3RA 3GCUA 3SXFA 3ZEWA 4A07A 4EH7A 1J7LA 1UNLA 3FY2A 4NM7A 1Q8WA 2IO6A 2XKEA 5J1WA 3VS5A 2JKQA 4WNPA 1U54A 2GTNA 3KRLA 5I0BA 3JYAA 3DLZA 3ZONA 2WELA 3DK7A 4QYEA 1NVQA 3CGFA 1T45A 4AAAA 2IZSA 2QU5A 2R3MA 1J7IA 4GIHA 2GQSA 3NW7A 4BYIA 4FV3A 4IWPA 1KV2A 2VWZA 2BIYA 3H3CA 3R04A 3BLHA 5DFPA 3Q6UA 4WUNA 4KNBA 5M55A 3EYHA 3C9WA 4C4EA 4IX6A 4QP1A 1PXIA 3Q5ZA 2ITQA 4AOTA 1Q99A 4DEHA 2C1BA 5IKWA 2GFSA 5AR3A 2HOGA 3R7UA 4KIOA 3TL8A 2X7FA 3ZZWA 4RIXB 3BHHA 4IAIA 2B4SB 4FGRA 2XJ2A 4TYJA 5HX8A 4I23A 3L8PA 1F3MC 4FL2A 4QMYA 5TOZA 4ALWA 3OC1A 4WNOA 4MH7A 4M0ZA 5AAFA 3ROYA 3QZGA 3EN4A 3R1QA 1FMOE 1GOLA 3D5WA 3IKAA 3LW0A 2VTHA 3T3VA 5C4LA 4TY1A 3D14A 3W8LA 3FE3A 4IM0A 2VWIA 5C8KA 1OIUA 4BC6A 1J7UA 3EMGA 4FNYA 4RC2A 4ITJA 4PMPA 3DU8A 4I1ZA 4HZRA 4TWPA 3HAVA 4L3JA 4CFNA 2W17A 4PPBA 5AP2A 4FTRA 1CDKA 2W9ZB 2GNIA 3P4KA 4DBNA 4D2RA 1UKIA 4QNAA 3NYVA 3U6HA 5IQIA 2WHBA 3A4OX 4D4SA 4YGAA 5CF6A 2Y9QA 5HU3A 4E3CA 5EQPA 1YXTA 5CTPA 2HW6A 1Y6BA 1XH6A 4B8MA 3QHWA 2PZRA 4BZDA 4GFGA 4H1MA 3V3VA 4CYIA 5IU2A 1UV5A 4MNEA 5DOSA 3GP0A 4QTEA 4BCNA 3NRMA 4XBUA 3BV2A 3QZFA 4LRKA 3HMMA 5HVKA 4D2VA 5I9ZA 4E93A 2UW5A 3KEXA 2JC6A 4GJ3A 2UZNA 3V01A 3O8PA 3TDWA 4UXLA 4IB5A 2ITZA 4A7CA 4I41A 2YA9A 3CY3A 3D7TB 5HNBA 3RPYA 2VO6A 4L45A 3QA8A 4ZIMA 2JKOA 2CKQA 3REPA 4AU8A 3TDVA 5BUEA 3JXWA 2X9FA 4EK3A 3V5QA 2IWIA 2UW0A 3GBZA 4QMPA 1GZ8A 5M53A 5IA0A 4IEBA 1CKPA 5CQUA 4EK5A 2F2UA 1B39A 5CNNA 3BWFA 2XJ1A 2XK8A 4I21A 4OTQA 3VBQA 4TWCA 4FTAA 4U3ZA 5A6OA 2PVYA 2PMOX 2WMTA 3QQGA 2W5BA 4UEUA 3CTHA 2BR1A 3GQIA 4IX5A 4CFUA 1X8BA 4FE2A 1Q4LA 1I44A 3POZA 4PQNA 3VWAA 4CLIA 3FLWA 4LL0A 3R2YA 3I7CA 2VGPA 2XIKA 4YMJA 4AFJA 3QRTA 5EM8A 3QU0A 3BHVA 3LJ2A 2HW7A 4U79A 4UN0C 3U8WA 5AAEA 4QPAA 1ERKA 3QD0A 3SXSA 5F1ZA 1Z9XA 4APPA 3ORTA 5AUTA 1Q62A 1VR2A 4A9UA 4FL3A 4KBCA 3GC0A 3QUPA 2VWUA 1MP8A 1OBGA 3ENMA 3BU3A 2VTJA 1DI9A 3DAEA 5GZAA 3G33A 3EQIA 5ETAA 5JK3A 2G2FA 2GNJA 2I0EA 1M17A 4ALUA 5IA1A 5AV3A 3F88A 4AA4A 3VBYA 5BVFA 2GHLA 2QG5A 4YZDA 2WKMA 3ZEPA 5KX8A 2JGZA 4H39A 5CANA 3PZEA 3HRFA 4UY9A 4O0UA 5HZNA 3N4UA 1GZKA 2AUHA 3OWPA 4PDSA 4L46A 4I4FA 3BE2A 1IA8A 3TT0A 3E62A 3Q4ZA 3ZYAA 4IMYA 3G9NA 4U40A 5FRIA 3TKUA 4MAOA 3R6XA 5DYJA 4G5JA 4AZWA 5KKRC 1YQJA 2I1MA 5A46A 4JQ8A 4AN2A 3WZUA 1H01A 3GCSA 2JDTA 1E9HA 3O51A 3P86A 2WTDA 4O6EA 2RFEA 3HMOA 5CYIA 5CEKA 3JR1A 4DTAA 2XCHA 3FXWA 3VS0A 5KMLA 2JDVA 4BF2A 4ZSEA 2Z7QA 3UO6A 3FPMA 2FB8A 3EN7A 2I40A 2BUJA 2WTJA 3GNIB 4BI1A 2WB8A 3NCZA 3GENA 2G2IA 3HP5A 3Q9WA 3WI6A 5DG5A 4AZTA 4PTCA 2QU6A 5ACKA 1KSWA 3CXWA 5KHWA 2HY81 3A60A 3ZUVA 4Z9LA 2G2HA 4HVIA 3F3WA 5HICA 3UOKA 1OKVA 3W2PA 2BDFA 4BGGA 3F82A 4HYHA 3ZRMA 2OGVA 3TJDA 3UODA 5AEPA 3B2TA 5DA3A 4R1YA 4QYYA 2PUNA 2ACXA 4ERWA 1PXKA 2C5YA 4UMQA 4GK2A 3LM0A 1YRPA 2B9IA 2ZVAA 3BIZA 2PVRA 2PVNA 4IFGA 5FG8A 5IZFA 5JH6A 1TKIA 2X4ZA 2WD1A 4KIPA 5DI1A 3FLZA 4JQEA 5AR4A 3ULZA 5IG1A 2B53A 4CTBA 4CFWA 2GMXA 5D41A 4O7RA 4O6LA 5CASA 4PP9A 3ZS5A 4M8TA 1YXXA 3C4WA 4MXXA 4FSZA 3DTWA 1FOTA 4JBOA 2J0KA 2JAVA 4RVTA 4V0GB 4YJNA 5M57A 5EKOA 2RFSA 1UNHA 4W4XA 2VTNA 3MFUA 5KO1A 2HWPA 3MPMA 2JIUA 4Y95A 4EK4A 5KKRB 3A7JA 3D83A 4O0XA 4O1PA 2BTSA 4PNKA 3D5XA 4KINA 3QQJA 4RWLA 2ERZE 4JBVA 3EFWA 4EJNA 3IOKA 3I4BA 3EKNA 3TV6A 3BV3A 1Q8ZA 4CMUA 4YLKA 4EOOA 3R7YA 3UNKA 4EH4A 3OVVA 3Q60A 3DJ6A 2I0YA 3C13A 3FL5A 3U9NA 5EKNA 4G3FA 3IW7A 5KMIA 4XV2A 1O6LA 4ANQA 1OIQA 4JDJA 3TNWA 1O9UA 5FP5A 3C5UA 2YM8A 3UDBA 2I6LA 2BZJA 3S1HA 4OT5A 1IG1A 2R0IA 3FI3A 3QUEA 5ACBC 2C6KA 2JKKA 3OP5A 3E63A 3R9HA 4CFMA 1XO2B 4NH1A 2VTRA 3RALA 3H0ZA 2HZIA 1H1RA 2WMQA 4NFNA 4YHFA 4NM0A 1ZMWA 2O63A 3ANQA 2X2KA 5CXZA 5KBRA 4IAKA 5AIKA 2BILB 3ZUTA 5AM6A 3VIDA 3NUUA 3QGYA 3MH3A 3S3IA 1FQ1B 3GU5A 3HV3A 4ZP5A 4ZSGA 4BYJA 2C1AA 1GIHA 3FAAA 3L1SA 3QRKA 4YBKA 2ETMA 4CYJA 4U81A 1NXKA 2P33A 2OO8X 5H8GA 4RBLA 2ITTA 4EONA 3NVMB 4N6YA 5AAGA 3L8SA 3BHYA 2Y4IC 4TWOA 3ZXTA 1YI6A 3KQ7A 3BBTB 3KF4A 5AUWA 4BWXA 2P2IA 4G2FA 4AN9A 3SW7A 2XNPA 3FY0A 3U4WA 3WF8A 1WVWA 2JIVA 4AQCA 4F63A 2XJ0A 3OY3A 2UZTA 5JGAA 3SOAA 4BCFA 4I6HA 3RNIA 1WVXA 4AA5A 3CQWA 4QPMA 4ACCA 2DWBA 3MYGA 4P2KA 2CNUA 3QCXA 4AS0A 2YDIA 3PIZA 4AWIA 4ZSLA 4PMSA 5JFSA 4HCUA 5JKGA 3DJ5A 4O82A 1QPEA 2YM3A 4BCGA 2CGXA 4MWHA 3E93A 4JAJA 5EHOA 4L43A 4LQMA 4JG7A 2OZAA 4O38A 4K33A 5EHLA 4MF0A 1BL6A 4OW8A 3BX5A 4ANBA 4DH8A 4W4VA 4TYIA 4NKAA 1I09A 5L8JA 2ITYA 3MH0A 4FNWA 4GKIA 3R7OA 4IDVA 4KSPA 5GIOE 4QMVA 4IM2A 4GU6A 4HCVA 1BLXA 2WMUA 4IW0A 3SKCA 1KE7A 4UALA 3E64A 4FV2A 2WMSA 3IO7A 1OI9A 1WBNA 4O21A 1H07A 2XIXA 1WBTA 1R3CA 3TG1A 3DBCA 3KXNA 2BALA 2FO0A 5EFQA 4NK9A 2V7AA 5IEVA 4GW8A 4LOPA 5FUTA 1PXLA 3VS7A 4DEAA 3BPRA 4G3DA 2PY3A 2XNGA 3GU6A 4MBIA 2QR7A 4DFZE 1R0EA 5M56A 3EOCA 3QRIA 2CLXA 2GQGA 4L7FA 5TE0A 3PJ3A 3WIGA 5AUVA 1OKWA 2WTVA 4R7IA 4E6DA 5GZ8A 4BRXA 5KUPA 1U4DA 1U46A 2Y4IB 4CFXA 2EB2A 5BVDA 3F5XA 4FKJA 4NIFB 5I9XA 3DK6A 4YP8A 3LPBA 4IVAA 4CKIA 4JOAA 1YOLA 2ZMDA 3NS9A 4FT3A 3MPAA 4QP4A 2IZRA 3IW4A 3QL8A 1Q3DA 3RVGA 5DHJA 4F0GA 2G1TA 2UZEA 3L9NA 4FOBA 3QXPA 4DH3A 4BICA 1JKTA 2RSVA 3HEGA 2X7OA 3HX4A 4EQMA 3K3IA 5KMNA 2ITNA 4FV5A 5KHXA 4HNFA 4QMUA 5KE0A 3FZRA 5AP7A 1PMNA 1KUTA 1FBNA 4O27B 3ENHA 3BHTA 4YJVA 5HGIA 2CMWA 5ITAA 2JKMA 2GS6A 3DBFA 5AWMA 4BVUA 2OJIA 2HELA 3LFEA 1WBPA 4FTOA 4G34A 4QYGA 5FBOA 4XMOA 4AGCA 4AW0A 4F9AA 5J5TA 5J9LA 2UZVA 1H1QA 2J5FA 4UMUA 2F7ZE 2WNTA 3P7CA 3ELJA 1H27A 4I5PA 4EYJA 3AMBA 3V04A 1XR1A 3IGGA 3PE2A 2F9GA 1ZOGA 4YZMA 2W4JA 3KL8A 4RWJA 3W1FA 4EHVA 5IQFA 2XEYA 4ALVA 4GMYA 3QHRA 1YXVA 2UUEA 4UZHA 4AUAA 1LP4A 2DUVA 4CKJA 4QTAA 3M2WA 2O64A 3W2RA 4FTIA 3MA6A 3RHXA 3OOMA 2IVUA 1YW2A 1OBDA 3GC9A 3LCDA 4FSMA 3NUSA 4MD8E 2C47A 5D11A 1H0WA 4OTGA 4YJRA 1P2AA 2ZV7A 4AGUA 4J53A 3DV3A 1Y57A 4U43A 4I5MA 4E6QA 1H28A 1PYEA 2BAQA 3CTJA 4DA5A 3GCQA 5J9YA 3MI9A 5HIDA 2QLUA 3UIMA 3K3JA 5IA3A 4JRNA 4V04A 3LMHA 1ZLTA 4KIKA 3AC8A 4BI2A 3SLSA 2R9SA 4IXPA 4R1VA 4DGLC 5K9IA 5CY3A 4KAOA 5JRSA 4CD0A 2O65A 3QCYA 3RZBA 2XIYA 4H1JA 5IF1A 3RPVA 3VBWA 5KMKA 5DT3A 4AFEA 2VO0A 5L6PA 3W16A 4AT5A 4C3PA 3PSDA 4FI1A 3PZHA 1NA7A 3LVPA 3DQWA 4O91A 4J96A 4ACDA 5L8KA 3OW4A 2QOBA 4G1WA 5FLFA 3ZM9A 4DTBA 3AGMA 2ETRA 4DT9A 5IUHA 4GKHA 4FVPA 4QMOA 4LV5A 2WQOA 4A9TA 5CAPA 5LVOA 3NDMA 4KABA 2YZLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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