5D1JA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 (cdk2-wt) complex with n-[5-[[[5-(1,1-dimethylethyl)-2-oxazolyl] methyl]thio]-2-thiazolyl]-4-piperidinecarboxamide (bms-387032)
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
298
structure length
265
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEYGVVYKARNKLTGEVVALKKIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title N-(Cycloalkylamino)Acyl-2-Aminothiazole Inhibitors Of Cyclin-Dependent Kinase 2. N-[5-[[[5-(1,1-Dimethylethyl) -2-Oxazolyl]Methyl]Thio]-2-Thiazolyl]-4-Piperidinecarboxamide (Bms-387032), A Highly Efficacious And Selective Antitumor Agent
pubmed doi rcsb
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
total genus 77
structure length 265
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2015-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5d1jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5d1jA01
5CU3A 4PMSA 3E87A 1PYXA 4AT5A 3VUMA 3I0QA 4BCQA 3MA6A 4M14A 3E63A 1L8TA 1WVXA 2PZRA 4DYMA 1Q8UA 3PSDA 5FP6A 2C68A 3DKOA 3NUUA 1W7HA 5KNJA 1JPAA 4MNEA 2ZV8A 1H08A 4FNYA 2UZBA 1ZYSA 3IS5A 4AA4A 4BIEA 2QI8A 3F3VA 4FV4A 5JQ8A 2IZTA 3BLRA 3I5ZA 4XG3A 1J1BA 3DXNA 3PP1A 4F9BA 1AGWA 4DFZE 1Q8YA 3QD3A 4FSZA 4W8DA 3S95A 2R3MA 3M2WA 5HD4A 3DDQA 4FKIA 4J53A 3RZBA 4YSMA 2GFCA 2XEYA 5A54A 5K5XA 5E8YA 1Y8YA 3AGLA 3QLFA 4XLIA 3F6XA 4M68A 4IDVA 2GQSA 2VTOA 2W5BA 2X0GA 4L52A 3IOPA 5E7RA 4MEDA 3ULZA 3UOKA 4LMNA 5CVFA 4L3JA 2JBPA 3AMYA 2R3NA 2WQMA 1DAYA 4OUCA 4AP7A 2JGZA 4U7ZA 3MSSA 3VW6A 3G15A 4G3CA 3KFAA 5C4KA 2JDVA 5F20A 2RFEA 2OGVA 4FV9A 2V55A 3H10A 4J71A 4HVSA 4EK3A 2C0TA 2HOGA 4E3CA 3FL5A 3DBFA 3WZUA 5HLPA 5E8VA 2YDKA 4DEDA 1OUYA 3EQDA 5E92A 3FYKX 3K54A 3ZO3A 3CP9A 4ZMEA 3BU5A 1GZNA 2WAJA 3GCVA 4FV6A 4GT3A 4XOYA 3KEXA 5HKMA 4EHZA 4F09A 2OFUA 2UW4A 4G3EA 3SA0A 4RX5A 5IQIA 4LL5A 2WGJA 2V7OA 5F95A 4AE9A 4M8TA 3V6RA 2R0UA 2QO7A 3TT0A 5C01A 2QOCA 5IQHA 3V5JA 5I9ZA 3TNWA 2YCFA 4L68A 4KIQA 3POOA 1APME 5EG3A 2HENA 2XIZA 1UU7A 4FEVA 2VWBA 4RRVA 5F1ZA 3HRBA 3BQCA 1CKJA 4O2PA 4NEUA 2WMBA 5BVFA 2ITPA 3DAKA 3KQ7A 3D5VA 3P4KA 4FSMA 4RT7A 1UNLA 3GOKA 1PY5A 3V01A 4BCHA 4OLIA 1W82A 2BVAA 2PWLA 2O5KA 4ZSJA 3TCPA 2XRWA 4IACA 4F7LA 4L42A 4E73A 4JX3A 4F63A 3N4UA 5HE2A 4FEUA 4FKPA 4P2KA 5AR8A 3TZ9A 1MRUA 1YXXA 4AOIA 2YIYA 3CQUA 1IA9A 4IZAA 4O0WA 2YCRA 2IG7A 5M4IA 3VBXA 5I9YA 3IW5A 4M0ZA 1OB3A 5CI6A 5AMNA 4A7CA 4C3FA 4USEA 1CM8A 4RSSA 4F65A 4ZY6A 4DFLA 1PXOA 1U59A 2CLXA 1PW2A 5CAOA 3VHKA 3BU3A 4EEVA 2IN6A 3MN3A 5HLWA 4GYIA 2QO2A 4C4FA 5B2LA 2ETMA 2JKKA 3AD5A 3N51A 3NIEA 4RJ8A 3SW7A 2HZ4A 5GNKA 2JDOA 4NFMA 5I9UA 1TQPA 3MVJA 4ALWA 4BWPA 4JBQA 4TKSA 3HAMA 4CQGA 4LFIA 4EJNA 4ZLYA 2ZV7A 3P23A 4FUXA 2H9VA 4TZRA 5ITAA 4AS0A 3HEGA 1CTPE 1W8CA 3GCQA 3P1AA 3P9JA 3Q96A 4UYAA 3ROYA 4ANMA 2W1FA 4JDKA 4EL9A 4F6UA 3F2AA 1H8FA 4MQ2A 4N6ZA 4FSUA 3ZC6A 4CV9A 4YO6A 1XBAA 5EHLA 2ITYA 2V0DA 3FZTA 4N57A 5FXQA 3IQ7A 4CT1A 4UZDA 3HP5A 2PVLA 2UW0A 4IXPA 4EOQA 2E9NA 3UNKA 2YFXA 4FOCA 4NTSA 3AGMA 2GTMA 3KCKA 3LCSA 4PY1A 3VQHA 4DAWA 4L44A 4PQNA 3VUIA 4IE9A 1WVYA 4UB7A 4S34A 2C5YA 2WELA 5H3QA 4ZY5A 3L8PA 2QONA 5E8SA 4TYJA 4FK3A 3W10A 4QQJA 2P55A 3ZBFA 1R78A 2UW5A 2W5AA 3ID6C 1QCFA 1URCA 3O8PA 4IJPA 4YPSA 1BUHA 3BLHA 3FXXA 3CS9A 3LKMA 2UW3A 4D55A 1PXJA 4HPTE 3FPQA 2X9FA 5D10A 5DHJA 4C4GA 2J5FA 4EC9A 1S9IA 3B2TA 1YOJA 5AV0A 4BBEA 1PMUA 2C6DA 2QKWB 4M97A 5FEQA 3RHXA 2ONLA 1DI9A 3SXSA 3BCEA 4C34A 4QMXA 2VTAA 1F3MC 1M2RA 3COMA 4UZHA 2AC3A 4FG9A 4JDJA 3DKCA 4BN1A 4MXXA 1OGUA 3MY1A 4MKCA 3S0OA 1REKA 3QRJA 5LARA 3RAWA 3T9IA 2C4GA 1Y8GA 3A4OX 4GJ2A 3AD4A 3T3VA 2W4JA 4DH1A 4ERWA 4U5JA 2W1GA 4C3RA 3QUPA 3CEKA 4IAIA 2DYLA 5KMKA 4PPAA 1YXTA 4RC3A 2FH9A 3BE9A 3EN9A 3FMNA 1Z9XA 4L9IA 3WIGA 3MA3A 3IGOA 3PA5A 4BKJA 1GZKA 3KULB 1U54A 3F3TA 5CLPA 5EOLA 3RAIA 3DTCA 5AAGA 2RFSA 5D1JA 2GNIA 4B4LA 5M57A 2XYNA 3LIJA 4NT4A 3OW3A 4S2ZA 1IASA 2WPAA 5E91A 3RHKA 3SHEA 4RIXA 2QOIA 4WUNA 2XIYA 3TACA 2Y0AA 4B8LA 4Z9LA 2WMXA 4J8MA 4ACDA 2WTVA 2CKEA 1YI6A 4LRJA 4KIOA 4F7JA 4I94A 5AAFA 1G5SA 3JXWA 2XP2A 1MQ4A 3QA8A 3F88A 3HMNA 3PVBA 5J7BA 4YTIA 2JBOA 1XH9A 3QA0A 4EH4A 4JDHA 1OM1A 1NXKA 1QPDA 4FR4A 2UZWE 2RKUA 4FI1A 4LV8A 4XBUA 5HGIA 3RPYA 3OOGA 3QC4A 4NWMA 3L8VA 4H36A 3UOLA 1P5EA 5BUEA 2B54A 2WU7A 3A7HA 5IISA 3QGYA 4YNEA 3CTQA 3C0HA 5GIOE 3EMGA 2JFLA 4J96A 5ANKA 5LQFA 4XG8A 4KRDA 4ZJVA 5GIPE 2WMQA 3UQCA 2XNEA 3UC4A 5IUIA 4FT3A 4LGHA 3BV2A 3ERKA 4IAFA 3SDJA 4ANQA 5LCJA 3F9NA 4S33A 2OH0E 3BHUA 2J6MA 1ZOGA 4ZTRA 2WU6A 4Q5EA 3BQRA 5FBOA 3FZPA 3MJ1A 3LCKA 4FBXA 4DHFA 4QP7A 2R3LA 3ZM4A 4YMJA 1KE9A 2CDZA 3COKA 5HX8A 1J3HA 4BI1A 2R3RA 2Z60A 3IW6A 2QOKA 2O2UA 3RK5A 3EKNA 4MD7E 3CC6A 2QODA 4GUEA 3MH3A 2C6MA 4WSYA 4F1MA 3KGAA 4C3PA 4DEGA 3FEGA 5AX9A 4RZVA 2FSOX 3G9NA 4NKSA 2YIWA 4BIBA 4O6LA 2XKDA 2W1CA 3EB0A 4MBIA 5FP5A 4EOPA 3MDYA 5B0XA 3LJ0A 5HVJA 2O64A 2ETRA 2YWVA 3LM0A 3QALE 1EH4A 4BBFA 3VUHA 4I0SA 2GSFA 4QMWA 3QQUA 3T9TA 2HY0A 4LGGA 3QTRA 2OLCA 2PUIA 1YRPA 2G2IA 5ANGA 2O0UA 4M3QA 2UV2A 3PSBA 5FM3A 2XM8A 1BYGA 2ZYBA 3KXGA 5HHWA 2PTKA 2XJ1A 5F94A 3RI1A 4FTOA 1URWA 1XH4A 4LM5A 4AW2A 5IU2A 3FMEA 5LJJA 1H4LA 2YISA 1DAWA 3BBWA 5AP5A 5JEBA 3VC4A 3QWJA 3E3BX 3UYSA 3RCDA 4AGWA 3ROCA 2C6KA 3EHAA 4EKLA 5FTOA 4YTCA 3U6IA 3RP9A 4O81A 3U87A 4EH2A 1OITA 2A19B 5KMJA 5CF6A 2XK7A 2Y9QA 2X8DA 3CR0A 3OW4A 2P33A 3C9WA 3MJ2A 4Z3VA 4GVAA 2UZVA 4ZOGA 4NK9A 2NRUA 3D7TA 2X7GA 5HG8A 3EQPA 5DT0A 2OIBA 5IEXA 3N9XA 1YWRA 1KV1A 3F5PA 5KMOA 3MPTA 3K5UA 3TZ8A 4YJUA 4QP9A 3NUYA 4FIGA 5HZNA 4RA5A 2WKMA 4EK5A 5IQAA 3NSZA 3KRXA 4MX9A 5CNNA 3EZRA 3PJ1A 4BDFA 4GSBA 4UBAA 2QLQA 4QP3A 1O6KA 2GCDA 4EH6A 2RSVA 3NEWA 4IH8A 3SAYA 2ITUA 3NYXA 5JGBA 5AIRA 4NL0A 2BAKA 3D94A 4U45A 3HL7A 3OD6X 1S9JA 3QHRA 4GKHA 4O7RA 1B38A 3O8UA 2B55A 4J97A 3NW5A 3EYHA 1OKVA 3IW8A 3TKUA 4MNFA 2XCHA 5A4EA 1H1SA 4EUUA 2VNWA 2C6LA 4QTCA 4IVBA 3FC1X 3W18A 3O0GA 5C9CA 1JSVA 2PSQA 3DAJA 4O22A 5EI2A 3ACJA 4PNIA 4NIFA 3JS2A 3LMGA 4RIYB 4F1OA 1OECA 3FY0A 3UVRA 4ZTQA 4O0XA 4O38A 4E7WA 1UU3A 3HRCA 3R2BA 4FTNA 1T45A 4QMMA 5HORA 3GUBA 3C1XA 1KE5A 5CAPA 3G0FA 5T6KA 3O8TA 3RALA 4X2NA 4RVLA 4ZSGA 4V0GA 1KOAA 2YLFA 1ZYLA 2BRMA 4BDAA 1PKDA 3QF9A 4OAVB 5DEWA 4AFEA 4AW0A 4R8QA 3LJ2A 4BTKA 4C02A 4DG2E 5BQ0A 3NVKI 2IVSA 1UWJA 3GBZA 4EWQA 1PXKA 1PHKA 3OVVA 3HUCA 3VF8A 3MFUA 3R63A 3IDCA 3P0MA 4FZFB 4FMQA 5A3XA 3KRLA 2BPMA 4FIJA 4CZTA 3PSCA 3MB7A 5DT4A 1OL6A 3VW8A 4BDKA 1H01A 5ACKA 4I0RA 4QQCA 2QNJA 2WMWA 2XIXA 3RKBA 2PZ5A 4WOVA 2C5VA 4C59A 1SZMA 1KV2A 3KRJA 3DXQA 3IDPA 3VS7A 4O7LA 3QTUA 3DK6A 3KU2A 2I6LA 3VVHA 1P4OA 4FKUA 4LYNA 3JUHA 2VO7A 3NRMA 4C4IA 4FKLA 3VS1A 3ANQA 3PY0A 1YQJA 4GT4A 4KS8A 2H96A 3KF7A 4NCTC 3QRTA 4YJSA 5ANIA 4AAAA 3WF8A 3DV3A 2DS1A 2XVDA 4OBQA 4YUQA 1OIRA 4XBRA 4IX3A 4U43A 3ZOSA 5AUTA 4R5YA 5I4NA 3ATSA 4FV2A 3EL7A 4X3JA 4BCIA 3VUDA 4E93A 2CJMA 4EOLA 5L3AA 2WZJA 3A62A 4WBBB 5HCZA 5J9ZA 4R3PA 5HO6A 5ICPA 3MW1A 2R7BA 2V22A 4F7SA 4RX7A 3FKNA 4FUYA 2BFYA 2PMNX 2VTPA 5HE1A 3ZONA 4K18A 3R7GA 2QG7A 5HX6A 4XCUA 3KB7A 2YIXA 2IVVA 5I9VA 4FZ7A 4ZS4A 3NYVA 4QP2A 5J87A 4I4EA 4FT7A 2PE1A 3MFTA 3UP7A 2DWBA 4XG4A 2NO3A 3PLSA 4IWQA 4DFYA 2OZAA 4PV0A 3V04A 1I44A 1XH5A 4HYHA 4IZ5A 3S00A 1M7NA 5HNIX 4BWXA 4QMPA 1UU8A 3FKLA 4O0VA 4N0SA 3EJ1A 3QKMA 4BDDA 5KMIA 2VWZA 4EOSA 2VTTA 3VN9A 4AN3A 4X2KA 3I5NA 5AV3A 4EWHA 5CT7A 2FSLX 5JH6A 4L7FA 1Q3DA 3BYVA 1OL5A 5LVPA 3IW7A 4FZ6A 1A48A 4E5BA 4RLKA 3I6WA 3C4WA 5H9BA 3RPRA 4BTMA 3Q4ZA 5CEPA 2WQEA 4GT5A 4X6QC 4YHFA 1XR1A 4FGBA 4BDCA 3ZEPA 4EOOA 4IVAA 4XX9A 4NU1A 1FOTA 1K3AA 4B0GA 1QMZA 4I93A 3PXZA 4EOMA 4O7SA 3LQ3A 1ZZ2A 3QCSA 3KMUA 2OZOA 3QQFA 5IDPA 4W8EA 3LLTA 4D1ZA 2C69A 3TUDA 4KAOA 4AA0A 1J7UA 4M69B 2C0OA 4DGGA 4A9RA 4LQMA 3MBLA 4FKSA 4KIKA 2YLEA 3CPCA 3MV5A 3C4ZA 3KXZA 4GK2A 4U80A 5EI6A 4O84A 5A4LA 2AUHA 2QOQA 3QTXA 4EH5A 3PIZA 2V5QA 4WG4A 3CGFA 4AGUA 2R3PA 3IOKA 2HELA 4CYIA 4QMLA 3PLAE 5E1EA 3HDMA 3H30A 2R3GA 3PPZA 4RIOA 3MIYA 4B99A 2XJ2A 2YZAA 2VTNA 4YZMA 4XLVA 3PXFA 3EQBA 5DWRA 1M7QA 2CCIA 3R9HA 3TNPC 4AE6A 5IQDA 3HRFA 3RZFA 3RWQA 5CZIA 3FI3A 3NX8A 4C4HA 5CEMA 4DFUA 1ZRZA 2ZM3A 4FC0A 4RG0A 4Q9SA 5FRIA 4D28A 4NJDA 5BYLA 4D2PA 1H27A 3BHHA 3E5AA 3TN8A 2UZUE 2XKCA 3DB8A 3Q32A 3TKHA 3O71A 3VRYA 2GQRA 1YWVA 3GQLA 2VX1A 5CI7A 4GU6A 3FPMA 4FTRA 3VJNA 2R0IA 4O1PA 5A4QA 5HIDA 2UW7A 3U4WA 4CVAA 5JFSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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