3S4QA

P38 alpha kinase complexed with a pyrazolo-triazine based inhibitor
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
349
structure length
326
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLAATRWYRAPEIMYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazine C6-ketones as potent, orally active p38α MAP kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
total genus 85
structure length 326
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2011-05-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3s4qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3s4qA01
3ALNA 1I09A 2OZAB 2FVDA 5L2TA 2YIWA 4O0UA 1PY5A 3AMYA 3DKFA 3KGAA 3QYWA 1J7UA 4YJVA 4KAOA 3R8UA 3L9MA 3U51A 2X9EA 3A8WA 3ETAA 2YJRA 5E8XA 3ZRKA 3NS9A 3POOA 4RIYB 2XA4A 3UOLA 4R77A 3WIGA 2C6TA 3CQUA 3ITZA 5L2WA 1NVRA 4U8ZA 3QTXA 3UNKA 3FYJX 4V0GA 5K4JA 4O91A 1E9HA 2GS6A 2GQRA 2IZUA 2ONLA 2YM7A 4FOCA 5C8NA 3B8QA 5IA1A 5HIDA 4BKJA 3OS3A 5AM6A 3VUKA 5IQCA 4E7WA 4EK6A 2UZTA 4IANA 4EK4A 2V62A 3FZRA 2BDFA 4AUAA 3FLWA 3SHEA 4UV0A 3H3CA 2OIDA 4TTHB 5AV1A 4W4YA 4YJNA 1Q3WA 2QU5A 5AIRA 4L44A 1KV2A 3IG7A 3LCSA 2QOFA 1PF8A 3AGLA 5D7AA 5A6NA 2YISA 3FKOA 3FQHA 4PDOA 3V5QA 3SG8A 5FBOA 4D4VA 1U46A 1JAMA 4QP6A 4Y8DA 5TR6A 4I5PA 5CU6A 4CMOA 4BGGA 1VEBA 3Q5ZA 3FKLA 2HZIA 4OBQA 2JDVA 4AE9A 3QX2A 4UBAA 1DI9A 2QOHA 4KIQA 5EDPA 3W2CA 5BMSA 4M97A 1Y91A 3GC9A 5B7VA 3OCBA 4AW0A 2J5FA 3ENMA 3GOKA 2JGZA 3C4WA 2WMUA 4RJ8A 2R3GA 5AP3A 2C5NA 3TZ7A 4EL9A 2B0QA 4D2VA 2W1ZA 3MFRA 4JX7A 3UGCA 4KA3A 2PZPA 4IZYA 4Y46A 1REJA 3ZM4A 2C6MA 2I0HA 4CG8A 3F3ZA 4PPCA 3LIJA 2OBJA 4OTFA 3K2LA 2YJSA 4A4XA 3POZA 3EQDA 4ANMA 5DI1A 5HE0A 4DGOA 4OT6A 4U43A 2R0IA 1GY3A 4MKCA 4UALA 4XJ0A 5CEMA 1G8SA 4ENXA 3ROCA 3UZPA 4DBXA 3DA6A 5H3QA 4AS0A 4BB4A 3LOKA 4C7TA 5C1QB 4W9WA 3CJGA 4UMTA 1XH6A 5DBXA 3COKA 3ZH8A 4ZLYA 3LPBA 3CD8A 2QKWB 4KSPA 4FK6A 4IVBA 3S4QA 4RZVA 3WF9A 4AGWA 4ALVA 3QCXA 3TXOA 1GZNA 3JS2A 4O7TA 3QAME 3LVPA 1ZYCA 3BRBA 5EOLA 4EH5A 3PY1A 2WXVA 3KMWA 4MEDA 4HOKA 4I21A 4G9RA 2WMVA 4XH6A 1J7LA 2G01A 3C4FA 2QVSE 3ZTXA 4EOKA 4IM0A 2J9MA 3BBTB 3R9DA 1IASA 5HIBA 2VO0A 3ZUUA 1ZMUA 3BEGA 4I94A 4IAYA 4FR4A 5LVOA 2YAAA 3A7GA 3HV5A 3GC0A 4G17A 4L43A 4FGBA 4JRVA 3CC6A 5EK7A 5BUIA 3ACJA 3DXPA 4M66A 3E7VA 5HQ0A 4XG7A 3IDPA 4GT4A 2XZSA 3BKBA 2HENA 4AW1A 2QHMA 3P86A 5BUEA 2GNHA 3F5PA 1RDQE 3NUPA 3PPJA 4HGEA 5HNBA 4BTFA 3ATSA 2J2IB 4CFVA 4CYIA 3QQHA 2BROA 4PPAA 3RPVA 2ITZA 2GSFA 2UW3A 4FTUA 5AX9A 3SAYA 2YERA 4W4VA 3AD6A 4OTRA 4CRSA 2WMAA 1YHSA 3OP5A 4OUCA 2XYNA 3L9PA 4RT7A 4ZP5A 4P90A 4BCOA 1MQ4A 5CI6A 4HYSA 4EQMA 3RAKA 4EKKA 2VN9A 5AIKA 4EC8A 3ZXZA 4MXOA 4M3QA 5HE1A 4QT1A 2PZYA 1YOLA 1ZWSA 4PP9A 2G2FA 2W4KA 3MBLA 4C33A 4F1OA 3RPSA 5AUZA 2P3GX 4B0GA 2QQ7A 3NZ0A 4FSRA 3QX4A 1IR3A 1PXNA 4GFMA 4YO6A 4YLKA 4D2PA 4D4YA 2O2UA 1JNKA 4J7BA 2OH4A 3CPBA 2R3OA 4XCUA 1GIJA 4CZYB 2GTMA 4EH4A 2ZMCA 3BQRA 1ZXEA 3UOKA 5I9WA 3LLTA 1FGIA 5HOAA 4CFMA 4HZRA 5J79A 3ZLYA 4ZTQA 4C38A 5KMJA 2R3PA 5HHWA 4KIKA 3TM0A 4S30A 2H9VA 2OFVA 4OLIA 4FKTA 3E3BX 5HBJA 3NYNA 1KE9A 4G16A 3RAWA 5C4LA 1XH4A 4FV4A 4CV9A 5E8VA 1H28A 2QOCA 3K3IA 3QD3A 4FZAB 3KULB 4JQ7A 4NM7A 5HG9A 3T3UA 3FEGA 2O64A 1RW8A 1TQMA 3RK7A 3OG7A 4CCUA 5EQEA 2PYWA 2J51A 5AM7A 4D5KA 4U42A 3HLLA 3KK8A 4QYHA 4X3FA 4X0MA 5KMOA 2YACA 4EK5A 5KBRA 2PULA 4ZZMA 1JBPE 3QTWA 3LQ5A 4DFBA 4J95A 5AV2A 4BCMA 4LL0A 3DGKA 5HCZA 4E6AA 3NYOA 3Q2MA 4J98A 2B52A 4MXXA 4QMYA 2X4ZA 3NAXA 1OIQA 3KXZA 4YZMA 3UOHA 4MXAA 3MFUA 2VO6A 1Q41A 1ZY5A 2X6EA 5I9YA 2HZ4A 2XJ0A 3R8VA 2W5BA 3VF8A 4DAWA 3CQEA 5EYCA 3FJQE 5IF1A 4C4IA 4DEAA 5IPJA 2WTKB 5JEBA 4DEEA 1SVGA 2X2KA 4R7HA 2QG7A 5DH3A 5KKRB 1WBWA 4G31A 4O6EA 4R1VA 3F6XA 3P7AA 3PYYA 4X2KA 4XG8A 4XOZA 4BY9E 4NT4A 3RPYA 5LVPA 3EZVA 3REPA 2YAKA 2ERZE 3LE6A 4CD0A 1Y57A 3OBJA 4C34A 3P9JA 5HTBA 2VTAA 3ODYX 1LP4A 3HNGA 4OTGA 3F5UA 4PWNA 4ASXA 5GHVA 2W9ZB 3KY2A 2Z7LA 3NNXA 2WOUA 4FGRA 1UU8A 3G0EA 3EB0A 3T8OA 5CI7A 3R22A 3PSBA 4HZSA 4PF4A 4MQ2A 3QCQA 1CDKA 2WMQA 5LVMA 3KRJA 1OBDA 5CENA 3NGAA 4LOPA 4ALWA 3R83A 5A4QA 1WVXA 4FEVA 4BBEA 3NUSA 3H30A 4CKIA 4IB5A 5E8SA 3TV7A 4ZLZA 3OHTA 4L67A 5IA4A 4GKIA 3FUPA 3QRUA 4JAIA 4QMSA 3QQUA 2YM4A 2VWIA 5JFXA 3COHA 2UW8A 4GT5A 5LMKC 2ZM1A 3QRTA 4JL9A 2PZ5A 5E8UA 4YJSA 5IG1A 5LWMA 3CY2A 3QXPA 4HYUA 2X7OA 4GYIA 3E8CA 1PKGA 4BN1A 2JDTA 2NNWB 2G9XA 4F1TA 2HW7A 4RJ7A 4GCJA 3HECA 3A7FA 4PDYA 5HO7A 1SMHA 4EYJA 4UY9A 3BCEA 4IEBA 4K8AA 4IIRA 5DE2A 4TRLA 3UBDA 5CNOA 4QO9A 1JSUA 1UV5A 4FYOA 1IA9A 2C6IA 4LYNA 4V0GB 4CLIA 1ZRZA 2Z60A 4FKPA 5HG5A 3W1FA 5CWZA 5TO8A 5KHWA 1IAJA 4NFNA 4X7QA 4IM3A 3N4UA 1FVRA 1Y6BA 3NUYA 1R39A 5BVEA 3FXWA 4QMUA 3UO6A 2R7BA 4FMQA 5CANA 2I7QA 3C0HA 2XB7A 4ZTRA 5FP6A 3DOGA 4C02A 3P7CA 4RPVA 4GSBA 2Z7RA 3WE4A 4WBOA 5GIPE 4JNWA 4R5YA 5CT7A 5I3RA 3EWHA 1ZARA 4ZZNA 5HIEA 4ACMA 4IAZA 4Y95A 2VU3A 5C26A 1Q8TA 3VC4A 3I60A 4IVCA 3VS6A 4AA5A 4ASZA 3I6WA 5E91A 4UEUA 3G9NA 4U40A 1HOWA 5D10A 2WMXA 3O0GA 4FK3A 2WIHA 3UP7A 4GG5A 3ZC5A 2ESMA 4CFNA 4C36A 4IWPA 2YHVA 2IWIA 3K5VA 4R5SA 2YIXA 3MB7A 4NM3A 4BC6A 2OO8X 4G5PA 3R2YA 4JR3A 4KKHA 1XBCA 2WTKC 4RC2A 3ROYA 3QCSA 4WG5A 5H8GA 4BDGA 1XBBA 1M52A 2OGVA 2YLFA 3TNIA 4MD9E 5KKRC 3QA0A 4LGGA 4WUNA 4I0RA 3ZO3A 4AZFA 4D0XA 3EHAA 3NNWA 4QYYA 4UMUA 3BE9A 1BMKA 3QC9A 1OIRA 4P4CA 2BDJA 4DYMA 2OLCA 5AMNA 1O6YA 3I4BA 2UZLA 3U55A 5E7RA 4XX9A 3WYXA 3LW0A 1STCE 1Q8WA 4BZNA 5F94A 3CD3A 2GFSA 4C61A 4DG2E 2WTVA 2XKFA 4UMQA 4PPBA 3FY2A 2VTPA 3C5UA 4M69A 3TUDA 4XP2A 3RPRA 2KTYA 4O6LA 5JQ5A 4RWKA 4A4OA 3QU0A 4A4LA 4C3PA 2VGOA 4MD8E 3ZM9A 2XS0A 1QPDA 2BHEA 2GS7A 3ZUTA 2H8HA 5BYYA 3MY1A 1UU9A 3PVGA 5D1JA 3TACA 4L01A 4ZK5A 3TKIA 3NIZA 1Q8UA 4OT5A 4FT5A 1H8FA 3KF4A 4FEQA 2CKQA 3SKCA 3PRFA 4N0SA 4FEXA 3FBVA 1YDRE 5HX6A 4BYIA 2PE2A 1W82A 1H27A 3G5DA 4YJOA 2X6DA 5EYDA 5AR8A 4CEGA 4NW6A 4DINA 1JVPP 3HV7A 3LAUA 5DG5A 2GDOA 2R3JA 3M42A 4XP0A 3PLAE 2QODA 2W7XA 4JG7A 2OZOA 4H3QA 3I6UA 3ZO2A 2ONLC 3R21A 2WQNA 3QUPA 4CFWA 2G2IA 1OL5A 2R3RA 5K9IA 1L3RE 4YR8A 4HVHA 5I5ZA 2ACXA 5L6OA 1PXPA 3QA8A 2V5QA 3MY0A 4UB7A 4YTHA 3TDVA 4O2PA 4PDSA 3CTHA 3HKOA 1AQ1A 4XG4A 5H8BA 5FUTA 5J1VA 3VUMA 2YCSA 2JAMA 2BIYA 2F57A 2OF4A 3MTLA 3NRMA 4DH1A 2B54A 1JKLA 4MHAA 2O3PA 2R3HA 1RQQA 2IVUA 2XJ1A 4QYEA 5CTPA 4J8NA 4EOPA 5CF4A 2IZRA 2Z7QA 1ZLTA 2FGIA 4HNIA 3MPAA 1W0XC 3LCKA 4M67A 3ZO4A 3O8PA 4G3DA 1ZMWA 4NK9A 3EJ1A 3FAAA 2BCJA 2ZDUA 1R0EA 2CKEA 3F88A 5JFWA 5LVNA 2JKKA 3UPZA 3PA5A 2KULA 3EQIA 3NDMA 4FKVA 4O27B 4ACGA 4EOMA 4E20A 3LMGA 2OIQA 1OM1A 3H0ZA 4IXPA 3WZDA 5HLPA 1B39A 2XNMA 3KCFA 3BYMA 4KIKB 2VWVA 2Y8OA 3R8LA 1Z9XA 3OBGA 4LMUA 4NZWB 1OMWA 4FVRA 5IDNA 3TIYA 4TY1A 3RHXA 5AFVA 4EK3A 5AA8A 2Y6OA 3PXYA 4R7IA 3W8QA 3UC3A 3DK3A 5HZNA 3F2AA 3I7CA 3FQSA 5E90A 4EH2A 2J0JA 2CNVA 1K2PA 3R7OA 5FEDA 5ANOA 2UZBA 4F7LA 4O7WA 2YZAA 3KL8A 3BYVA 2P2IA 4YC6A 4L3LA 2XMYA 4X3FB 1W83A 2VO3A 4FTTA 4UMPA 3DTCA 1T45A 2YIYA 2I1MA 3KREA 3TZMA 3IOPA 3LFDA 3SC1A 5CAOA 4E4MA 1GZKA 5JMSA 4X6RA 5DRDA 4MAOA 3H9OA 3KCKA 1YWNA 3UP2A 4Z7GA 3F2RA 3VS5A 4O7LA 4O7RA 3EH9A 4EH6A 4DFZE 4M0YA 2B7AA 2JAVA 3IGGA 3PP0A 3P5KA 3QTZA 5DGZA 2YDKA 5DHJA 2ZM4A 5EW8A 3IKAA 5JGDA 4IB3A 5CAUA 3E63A 5F4NA 4CT1A 5BPYA 1Q8YA 2OICA 5CXZA 3VUHA 2XYUA 5JZJA 3RNIA 3ORKA 4PTEA 1QPCA 4U81A 4AGCA 5HKMA 3OY3A 4HCUA 2WIPA 3MDYA 4CVAA 4R6VA 4S33A 3BLHA 1LR4A 1H1RA 2CCIA 3VS3A 3HEGA 4Z9LA 4M0ZA 3CBLA 5EH0A 3RM7A 3UTOA 2ITPA 4WG3A 2WMSA 1DAYA 2WB8A 4FI1A 3Q2JA 1YXSA 3GT8A 1ZMVA 4XV2A 1UWJA 2QD9A 2FYSA 3BYUA 4FIJA 5BUJA 4M12A 4RC3A 4M84A 1UVRA 3NWWA 2HCKA 4FTRA 5I4NA 4AN3A 5EW9A 3C0IA 3Q9ZA 4DEDA 1VJYA 2X8EA 3LZBA 4BBFA 3ORMA 3CY3A 4MX9A 2FA2A 4N70A 5CYIA 3VW6A 4YSJA 5C8KA 4FV3A 2YEXA 3SRVA 4YZNA 4I24A 2IPXA 3FMMA 2IVSA 2OJIA 5C01A 4NJDA 1SM2A 2J0KA 2PVKA 5DIAA 2BFXA 1YDTE 1GJOA 4JIAA 4EHEA 1BLXA 4FTKA 5I3OA 2VRXA 3OUKA 3V6SA 4QQJA 3FLZA 4JR7A 4ZEGA 5E8YA 4QP2A 4PMPA 2UW5A 3O2MA 1ZZ2A 1JLUE 1FMKA 2ITYA 3KA0A 1J91A 4G34A 1LPUA 5KX8A 3C0GA 2XNOA 3NX8A 4FVQA 5IUHA 4HVIA 2OSCA 3BEAA 3EQBA 5AADA 2V55A 2ITWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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