4A9TA

Crystal structure of human chk2 in complex with benzimidazole carboxamide inhibitor
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
304
structure length
289
Chain Sequence
MSVYPKALRDEYIMSKTLGSGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKPALNVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Benzimidazole Inhibitors of the Protein Kinase Chk2: Clarification of the Binding Mode by Flexible Side Chain Docking and Protein-Ligand Crystallography.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
total genus 91
structure length 289
sequence length 304
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-11-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4a9tA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4a9tA01
1OECA 4IJPA 3KREA 4CFNA 3M2WA 5BYYA 2OF2A 5DR9A 5IU2A 1LP4A 4B0GA 2I0YA 3BLQA 3PVUA 4ALVA 4FODA 3D83A 3ORNA 3F3TA 4MQ1A 3REPA 1W84A 4YLKA 1W82A 2WTJA 3FDNA 4E5BA 2YJSA 4G31A 1FPUA 1PYEA 3OW3A 2YCFA 3UP2A 2CKQA 4GJ2A 4I4EA 3PJCA 3RJCA 3F61A 2CN8A 3H0ZA 4YJSA 4E93A 4PMSA 3TT0A 5CYIA 2NRUA 5H9BA 2WPAA 4OTPA 1UU3A 4S31A 3QBNA 4X2JA 3T3UA 1M2RA 3TACA 3W2PA 4GK3A 4IJ9A 4U6RA 1YW2A 3WE8A 2QI8A 5HTCA 2HYYA 3VS5A 3Q2JA 4HGTA 3V8SA 4FVQA 3E88A 3RK5A 4M12A 2BZHB 2GSFA 3KN6A 3UG2A 1SZMA 4BZDA 3UGCA 4CZTA 2QOCA 2R3JA 5DA3A 3D94A 3BU5A 4ZLYA 2BIKB 3ODZX 3QX2A 2EXEA 5H3QA 3VS4A 2PUPA 3NUAA 2RF9A 1BX6A 3DAKA 3QQLA 5CSHA 3QRJA 4TWCA 5AUYA 5FD2A 5C27A 2X39A 1R0PA 3PSCA 4EK3A 2QR8A 4X21A 1YI3A 5DLSA 3G5DA 3K54A 2FO0A 4O0RA 4NM3A 5CEMA 5IH6A 4C2VA 5L6OA 2I1MA 2C5VA 3CXWA 3MY0A 2YIYA 3G0EA 3LXNA 5BYZA 5KHXA 4YJQA 5DBXA 3WF6A 5AV3A 2LAVA 4FSZA 4Y8DA 2J0LA 1YXVA 1FGKA 3IW5A 2CNUA 3AMAA 5M07A 3LE6A 2UVZA 4LGDA 4RIOA 3UNJA 3BHHA 3E8DA 1WVYA 2W99B 2X7GA 4FTNA 5FP5A 3U9NA 2OIBA 3QCYA 1V0PA 2GCDA 4O1PA 3KMMA 2J50A 4YJOA 4AE9A 2XNGA 4RFYA 3C5IA 2IZTA 5JRSA 3L9PA 1M17A 3COKA 4E1ZA 4QQCA 4YURA 5FXSA 4CV9A 3VRYA 5J9ZA 2PE2A 2WELA 2WZJA 3WIKA 2HWPA 4S30A 4M66A 5AIKA 3ALOA 4JG8A 1U54B 4RX9A 5GZ8A 2RFDA 3LFSA 4PL4A 4K9YA 1FQ1B 3OBGA 1YDTE 5CSWA 1YOMA 2YWVA 4PX6A 5HD7A 2CSNA 5AR8A 1PMEA 5CY3A 3WIGA 4GU6A 4Z55A 1CDKA 4TN6A 3AGMA 3DK7A 4GRBA 4RFZA 4AWIA 3P7BA 4BZNA 4FICA 4DC2A 5C01A 3E92A 3A60A 1REJA 1YXXA 4CT2A 2GHLA 4Z16A 4YC3A 4F1OA 4NFMA 3EQFA 1T46A 3HNGA 4MD9E 3R8MA 4EBVA 4D2TA 1STCE 5DRBA 4JQ8A 5IA5A 4CD0A 1H07A 1PXPA 3RWPA 2BIYA 3UBDA 3R9HA 2FH9A 4ACMA 3PPJA 3RPSA 3G90X 1QCFA 3T9TA 5A4TA 5H8EA 1TQIA 3CSVA 5E9EA 4Y95A 3SW7A 4DEAA 5FQDC 4IXPA 4EOLA 3N51A 4FT7A 3E7OA 4XG2A 2VTNA 3FE3A 3R8ZA 4TNDA 3HUBA 5KBQA 4AE6A 4C4FA 3PXKA 3QD0A 3OHTA 1GNGA 1YOLA 4FZDB 2E9UA 4XRJA 5IH4A 3OWLA 2YN8A 3D5WA 4P90A 4AOIA 1FBNA 5CEPA 4F9WA 4U8ZA 5A54A 2WMSA 2XJ0A 3SD0A 1UWHA 4MVFA 5IKWA 4D28A 4L67A 1CM8A 4F0FA 4GT3A 4A07A 5JFSA 3TM0A 3B2TA 1FMOE 4FKSA 4YLJA 4DGOA 1SVGA 3EFLA 4FZ6A 5AX3A 4GMYA 4HOKA 3QA0A 2QOBA 2F7ZE 5M4IA 1A06A 3M11A 4V05A 2VTMA 2J0IA 3BQRA 3I81A 2IW9A 4F65A 4NYEA 2OW3A 3R9RA 2GNHA 3IPHA 4OTHA 4A4OA 1H4LA 2HZ0A 2C69A 5HIEA 5JH6A 3OROA 1JQHA 4ITIA 4RG0A 3LCSA 3G2FA 2C3IB 4RMZA 1YXUA 3VN9A 4X7QA 2R3HA 2YCSA 1H24A 4FTKA 4IZAA 3FZOA 4X3FC 3UQFA 4WG3A 3CE3A 5CNNA 1XR1A 1NW1A 3LJ1A 5LCKA 5T6KA 4E6DA 3I0QA 5JT2A 2ZV8A 4U81A 1XH6A 1ZYDA 3BKBA 4JRNA 3IG7A 4F0GA 3E7VA 2VWXA 3I1AA 4WIHA 4YJUA 3C0HA 4PPAA 1MRUA 4CGAA 5M4CA 3E63A 3DKOA 1MUOA 3R01A 1HCKA 1ATPE 3OFMA 2ZB0A 4JS8A 5CU2A 5DNRA 4EH8A 4C3PA 1YWNA 3WZDA 2ZV9A 2EWAA 3CJFA 4I41A 4C4EA 3B2WA 3KK8A 1OITA 1BL6A 2OJIA 3EFJA 4FTIA 4BCPA 4Z7GA 3N4TA 3L9LA 3TUCA 3TV4A 3ZFXA 5KMIA 1WBTA 3FQHA 3IK3A 4HPUE 1OL7A 2X2MA 5FEDA 4D2RA 2WMRA 4E8AA 2JIIA 5BX0A 2E9VA 3QCQA 3FI2A 1DM2A 4IWDA 2YIXA 5CU6A 2CLXA 3UO4A 1VYZA 4DH3A 4DTAA 4M97A 3DXPA 4IFGA 3PTGA 4FG8A 4Y5QA 5HO6A 4CFWA 3DTWA 4ZZOA 3DPKA 2RSVA 3LFNA 4HVIA 4EKLA 4EL9A 4YTHA 3EN5A 5ANGA 3O23A 3NVKI 4BCQA 3UG1A 2PU8A 3UMWA 3OUKA 3KCKA 2J0KA 3MA3A 3R9DA 3W2RA 3NCZA 5A6NA 5JRQA 4EH9A 1OKVA 3PY3A 5AA9A 4UB7A 4YJNA 2O5KA 3QQHA 4E4LA 3N4UA 1BI7A 4KRCA 1OL5A 3PP0A 5EQPA 4RJ8A 3K3IA 3IS5A 2UZUE 4DH7A 1J1CA 3QTSA 3IW6A 4EKKA 4G34A 3F69A 3DFCB 1HCLA 4IFCA 3UYSA 2C6MA 3EWHA 4IX5A 5J7BA 3MYGA 5GJFA 5HKMA 3O7LB 4QMTA 4DEHA 3R04A 3BBTB 5AAFA 3EQCA 5F9EA 4WRGA 2VWUA 2X2LA 2YM5A 3F3ZA 3Q4ZA 4OBQA 5H2UA 2HW6A 4BBMA 3D7TB 5E8ZA 2VN9A 2B53A 1UU7A 2OZAB 2UZLA 2X1NA 2W7XA 3I6UA 1YWVA 4UBAA 2JGZA 5CSXA 3OWKA 4MYGA 3GCUA 3TV6A 5IQHA 1KV2A 1K3AA 2YJRA 3DKFA 4QO9A 4QP4A 4OTQA 2UZOA 3AC5A 1U5RA 5AV4A 5BVFA 1W83A 2W9ZB 2WQNA 4FI1A 2PTKA 5EOLA 3HUCA 3QTRA 3E8EA 2JC6A 3MB7A 3CGFA 1OIQA 2R3FA 5KO1A 3GOKA 3KVXA 4IQ6A 3EYHA 4CKJA 4PF4A 4EWQA 4HCUA 4IVCA 5K0KA 4IZ7A 1OIYA 3DKCA 5EM6A 1A9UA 2ITXA 4L01A 2GHGA 3MH2A 2JLDA 2QNJA 2WNTA 4ARKA 5EM5A 1JKKA 1WBOA 2W1HA 2JDOA 2XA4A 3DLZA 4QTAA 4WNMA 4EUUA 3HVCA 3S3IA 2C1AA 4USEA 3TNHA 3TKHA 1OGUA 2ZV2A 3UDBA 5EDRA 3IOPA 2R3OA 4PP7A 4A7CA 3QU0A 1NA7A 3G9NA 4PV0A 4UYNA 3F2AA 3HEGA 2C0OA 1Q62A 4G2FA 3HRFA 3VF9A 3QF9A 4QNYA 4B8MA 3D9VA 5D7AA 2WHBA 3ZLSA 2R3KA 4DN5A 4IE9A 1Q8WA 5KMLA 4IX3A 2ITWA 3UZTA 4XLIA 3SHEA 2JD5A 5HGIA 3LFAA 4Y85A 2R3QA 4IANA 2X0GA 5D9HA 4BDBA 2HCKA 4XG8A 4YO4A 3QQKA 3VUDA 5AUUA 3A7GA 3TG1A 4JL9A 2OF4A 2O2UA 4O6LA 4XBUA 4C3FA 4DG2E 4E5WA 3FHIA 2JDTA 2B52A 3LLAA 4JDKA 4IB5A 4I3ZA 2VUWA 2QLQA 2PZPA 4MX9A 5HLWA 4R7HA 4F1MA 2W0JA 1OZ1A 3NSZA 3D5XA 3QALE 2CGWA 5HZNA 4MXCA 3VW6A 3WZEA 2F9GA 3KRJA 4O0UA 3BE2A 2WU6A 2QURA 4LI5A 4NH1A 1H01A 5AR4A 1R1WA 3HV7A 3R7OA 5KKRC 2PZ5A 2GS7A 3R83A 4IZ5A 2HZ4A 2R3GA 3ZUVA 4NEUA 4FMQA 3V3VA 3ZRLA 4DLIA 3SOCA 2VTSA 3H4JA 3UQCA 3C4ZA 3VBTA 2JKOA 3PXQA 2G9XA 2X8IA 3P7CA 4CMUA 4FSNA 4AUAA 4FTCA 4AT4A 5DN3A 2WTDA 3HYHA 1L3RE 4UWBA 3FMKA 3UIBA 4N0SA 3V5TA 2UW4A 1E9HA 3ENHA 5LMAA 2OXXA 5HBEA 1KOAA 3LKMA 4XMOA 3KQ7A 4AT3A 4AZWA 2E2BA 5IUIA 4MBIA 3W1FA 2CDZA 3WZUA 5CVHA 3BRBA 4DTKA 1IG1A 3DJ6A 4H3BA 4KNBA 4ZZMA 2YDIA 3KGAA 3QUEA 4C02A 4D4YA 4TTHB 5M44A 4L52A 5GNKA 4PDOA 2R3PA 3C4CA 4Q5EA 4G17A 4QMPA 1W0XC 3HP2A 4X2KA 3NVMB 4IM2A 4KAOA 2ESMA 2ITNA 2XVDA 3K5UA 3IW7A 3QQUA 2IVSA 1PYXA 2B9FA 3L9NA 4HGLA 1OIRA 4MXYA 5CASA 5EG3A 3KMWA 1SNXA 1U4DA 3V8TA 4XLVA 4LRKA 4BDHA 4CQEA 5I3RA 5IDPA 5LXMA 3GENA 5J1VA 5J1WA 3HKOA 3ITZA 3ZUUA 5D11A 4AGDA 3FEGA 2R4BA 2XBJA 3GOPA 1H0VA 2GHMA 1J3HA 3LIJA 3QWJA 4Z9LA 3TDWA 4R8QA 5HG5A 3F88A 4BKYA 4UV0A 4FIEA 3WYXA 4PMPA 5IMXA 4FKJA 3ULIA 1R0EA 5HLNA 3ATTA 2AUHA 4XH6A 5AR2A 3F9NA 5CS6A 3OCTA 5AP4A 3I79A 1YXSA 5EW8A 4J8MA 2WTKC 5DGZA 3KCFA 5C9CA 5C1QB 3R6XA 4I24A 5AX9A 4D1XA 2VO7A 2VTQA 4YTIA 2O3PA 4I6QA 3OY3A 2RGPA 3CPBA 3GVUA 4BTKA 4FBXA 4IIRA 2WTVA 3HMNA 4FYOA 5CF5A 3DB8A 4H36A 5K5XA 4O7TA 4NL0A 4PMMA 1IAJA 3NNUA 2Y6OA 1M14A 2BRBA 2ITVA 2JAMA 3MDYA 3P08A 2R5TA 2XM9A 4NSTA 4M15A 4Y5HA 1WFCA 2OJFE 4H1JA 4FUYA 3QYWA 4OTDA 3EN6A 1WBNA 5E8YA 5EK7A 4J1RA 1MP8A 4PY1A 4O7SA 5HO8A 4DFLA 2OBJA 4O2PA 1JAMA 3O7LD 2DQ7X 2NRYA 4BCIA 4B99A 4EEVA 3Q6WA 4O7RA 3OP5A 3POOA 3ZM9A 1PRYA 4EHZA 3FMEA 5ETIA 2X2KA 2ZMCA 2PE1A 5CXHA 2WAJA 4GKIA 3OCSA 3PIYA 2W4KA 5AR5A 3R1SA 4YO6A 5AP0A 2VAGA 3W8QA 5A14A 2W5HA 2W1DA 1H25A 2UZTA 4EQMA 4OBPA 3NW6A 2UZDA 3PJ1A 5TE0A 1ZY5A 2XK3A 4MD7E 3HA6A 3NLBA 2NPQA 2BAKA 5IDNA 4GH2A 2YLEA 3D7TA 4ANSA 4L46A 2UVXA 4YJRA 5BVWA 3HA8A 3L8XA 4TWPA 1MRVA 3V5LA 3IGOA 4XJ0A 2ZJWA 2UW9A 4G9CA 4DH8A 2C3LA 2OK1A 3QRIA 5CVGA 4O7NA 3EH9A 4D2SA 3BI6A 3GU6A 4GL9A 4BHZA 3VJOA 2XYNA 3SVVA 2C30A 2YM7A 4QQJA 2IZUA 4TWNA 5EDQA 2YZAA 4FV5A 4CFVA 4APPA 3G33A 3QKLA 3NUXA 4E6QA 5FP6A 3EKKA 3G6GA 4L3PA 5KZIA 1BL7A 3Q04A 1GZKA 1I44A 3QQFA 2GS6A 4KS8A 4TY1A 4R3PA 4YPDA 4D58A 1Q97A 3PZEA 3CTHA 4XRLA 5ANKA 4EOQA 4AAAA 4JX3A 2X8DA 2C6DA 3I0OA 3LFFA 1H1WA 3LCOA 4O96A 4QNAA 5IUGA 5LMBA 5CT0A 4D4VA 3CS9A 4AXAA 5E8XA 2VX0A 5CX9A 1VYWA 3W2CA 3VBQA 3QHWA 5A4CA 5C4LA 1RJBA 3O96A 4GCJA 1PXNA 3ORPA 4YZDA 5DT0A 3W2SA 3PWYA 4AS0A 4BC6A 3QRUA 2QONA 4F9AA 3OXZA 2JBOA 2YCQA 4X3FB 4JBPA 1PXOA 1QL6A 4BRXA 3DDQA 4KSQA 4K2RA 4QP6A 2XK8A 2FSOX 3PJ3A 2R0UA 3FYJX 4O82A 1UWJA 3BGZA 4ITHA 4XP0A 3ZSGA 1M52A 3DKGA 5JMSA 4M0YA 3UYTA 1WVWA 3KL8A 4A9UA 4BYIA 3TCPA 1Y57A 4EOOA 4WUNA 4ACCA 4KIOA 3BBWA 2PPQA 2OSCA 5FEEA 1UKIA 3ZRKA 3C0GA 2UW5A 3SA0A 5EI6A 2OXYA 3R21A 2VX3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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