4JDHA

Crystal structure of serine/threonine-protein kinase pak 4 in complex with paktide t peptide substrate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
290
structure length
289
Chain Sequence
SHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/peptide
source organism Homo sapiens
publication title Identification of a major determinant for serine-threonine kinase phosphoacceptor specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase PAK 4
total genus 95
structure length 289
sequence length 290
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4jdhA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4jdhA01
5IPJA 2R3MA 4RIYA 3NUYA 4ANLA 3L9MA 3E3BX 4TN6A 3KVWA 5LQFA 5HHWA 2XYUA 4L3PA 3U6IA 3UIXA 4C34A 4IVBA 4FVRA 1J7LA 4DFBA 1PY5A 5GIPE 4BZDA 3VW6A 4KBAA 5B2KA 4DLIA 1FPUA 2ZB0A 5EM5A 3RM6A 4M67A 1JBPE 4GW8A 1Y6AA 4TWCA 2CCIA 2OBJA 4FUYA 5CX9A 3DFCB 4YHJA 5CT7A 5FWKK 5HESA 1BL6A 2IW9A 4IWOA 4KKEA 1TQIA 3NZ0A 3RTPA 1JWHA 3W33A 3GENA 4U43A 5HE2A 3NVKI 3KXGA 4H3BA 4S30A 2WQEA 4ZJJA 3ZOSA 5HLWA 5L2IA 4YJTA 5FBNC 2C0TA 2ZMDA 4I3ZA 2ITPA 1OKWA 2ITZA 2R5TA 3AC4A 3QQUA 2WGJA 3OCBA 5EH0A 4FNZA 5F4NA 4AFEA 2R4BA 2UVXA 4Z3VA 3TNIA 3OBGA 3PA5A 3O8TA 4Q9SA 2QHMA 3UP7A 4FIGA 4DEDA 5LVMA 4KIOA 1WAKA 4QQ5A 3WYXA 2OJJA 4I94A 2ITWA 4ARKA 4Y72A 1IR3A 3D7TA 3ORIA 2OJIA 4KAOA 3QTRA 5EI2A 5HCXA 2B1PA 2XNMA 1FINA 4K9YA 4U6RA 4WBBB 2C4GA 3ZXZA 4EOQA 2IG7A 4BDIA 5AP0A 4DGLC 2YFXA 4AOIA 3D2IA 4MWHA 1M2QA 4YTIA 4IAZA 2XB7A 2H34A 3LFNA 1UKHA 1PKGA 2DS1A 5IH5A 4FL3A 2C6EA 3MV5A 5CSVA 5D41A 5DH3A 4C2WA 2C69A 3F3VA 3UODA 2HY81 3OT3A 4G3GA 4HPTE 4YJSA 2I0VA 2Y6OA 4CQEA 3T3VA 5K5XA 4LOPA 3KCFA 3U8WA 4MD8E 3PRFA 5M55A 2FSOX 4GMYA 2CHLA 3FLWA 4WG5A 3KCKA 3O7LD 1UA2A 3FMNA 3GNIB 3MVHA 3WIGA 3LFQA 3ZBFA 2VWYA 4RQVA 5CTPA 2JDVA 1WBSA 2GMXA 4Q5HA 4B0GA 1SVHA 2WMVA 5CAOA 3ZLYA 4DEEA 1PXLA 4JQ8A 4C4HA 1RE8A 3F82A 2OKRA 3UGCA 2WKMA 2FO0A 4DE4A 3TIYA 4KSQA 3HUCA 1JKSA 4QRCA 4S31A 5CI7A 3QKMA 5DWRA 5IUIA 3KMUA 5L2WA 2C0OA 4I92A 4PP7A 4EHGA 3GU4A 1ATPE 4XG8A 3TT0A 3O8PA 2QR8A 3KKVA 3QD0A 2J7TA 3BHTA 5HIDA 4ZSGA 3P7CA 4GK3A 5J8IA 4DYMA 5HO7A 2XKCA 5IQEA 4BIEA 1OUYA 2WU7A 3QHWA 1W83A 4HYIA 3DKFA 4I6FA 4JLCA 1OKYA 2AC5A 2PE0A 4QPAA 3SC1A 3GU7A 3UQCA 4R3RA 4O7WA 4FV1A 4A9RA 3IECA 3RNIA 3V5QA 4ACMA 4JRVA 3V8SA 2ONLA 5KKRB 4EZ7A 5IQAA 4IBMA 3ZZEA 3CKXA 3NR9A 4QQJA 4D9TA 3DAJA 4BCKA 2R3NA 5KMLA 5LCJA 3SLSA 4IADA 5CSXA 4YSJA 4FNYA 4LL0A 5ANIA 5BVDA 5EW9A 2XP2A 1Z9XA 4EK3A 3TDWA 3UOKA 3Q6WA 3V8TA 2X39A 3GFEA 3NLBA 4G5PA 2R3OA 5AR3A 4F0IA 3SGCA 3RWPA 4FNXA 4YLLA 3ATTA 1JVPP 4JAJA 4NFMA 1H1SA 5JSMA 1YOLA 3EKNA 4D0XA 4E4XA 5L6OA 4C3FA 2YWVA 2IW8A 4YO6A 2I40A 5DE2A 5EW8A 4FKPA 1PXKA 3THBA 3VUIA 4BYJA 4HGSA 3FBVA 3PG1A 1QL6A 3ZBXA 2ITOA 4MHAA 3EL8A 3Q9ZA 2RG5A 2G2HA 3JVSA 4O6EA 1FBNA 5CEIA 2VU3A 4BN1A 4BCNA 3QZHA 2CKPA 4YURA 5ETFA 1OIYA 4UZDA 2JDRA 2X8IA 2X7FA 3M11A 3EFWA 4KINA 4YPDA 3R28A 4EK8A 4FE2A 4H1MA 4I4EA 4O81A 2JGZA 3PDTA 4GK2A 5AR7A 4BGQA 1YVJA 4GFOA 5AX3A 3FYJX 4RJ4A 1O6LA 3OHTA 1JAMA 2P33A 3PWYA 3GCPA 5IA1A 5E8ZA 5C03A 3OWLA 2BDWA 5BVWA 2OI4X 4RBLA 3QX4A 4JOAA 3W1FA 2J5FA 1FGKA 3WZUA 5DVRA 2UW7A 4X2JA 4HGEA 4NUSA 5JGBA 2CLXA 3HDNA 3HP2A 4WNKA 4G5JA 4C4IA 2YJSA 2IPXA 3NS9A 1OGUA 4R6VA 4JR7A 4Q5EA 3ZFXA 4U8ZA 3VJNA 3VUHA 5LOHA 5FTOA 3GP0A 2FSMX 2CKEA 3OCSA 4XG6A 4YJRA 3QTQA 3ANRA 4A4OA 3OEZA 4FOBA 4XG4A 3AD4A 4V01A 4AZVA 4NJDA 4EOSA 5L4QA 5CT0A 4NSTA 5ETAA 1DS5A 4EEVA 4CYJA 5HD4A 3QWJA 4UXQA 4Y46A 3WYYA 1XH8A 2YJRA 3MPAA 4AZWA 2Y4IB 3RHXA 3G0EA 5B2MA 3GVUA 4L42A 1WBNA 3EZVA 3U6JA 5GZAA 4FSTA 2BDJA 3EN5A 4JQEA 3ACJA 5K3YA 5KKRC 3D5VA 5CZHA 3D5WA 1CM8A 4AGWA 4DF3A 4QNAA 4BI2A 5M56A 2REIA 3C0IA 4R5SA 2JAMA 5AP2A 2FA2A 2VWZA 3DT1A 4IACA 4NCTC 4TWPA 2GTNA 1OL2A 1WVYA 2CMWA 1H1QA 3E87A 3MYGA 3PVUA 2G15A 3QA8A 5EDPA 4R78A 2X2KA 5AA9A 4TY1A 2H6DA 4OAVB 2OU7A 5AIKA 3G9NA 4D2TA 3QCSA 2QOKA 1SZMA 4J96A 4OTIA 4ZTNA 1M7NA 3BHYA 3ZRKA 1U5RA 3NNUA 1XBBA 1OPLA 3K3JA 4YU2A 1VJYA 2F57A 1J3HA 4QP8A 3D7TB 5EYMA 4DCAA 4PMPA 4EK5A 5AUUA 5M4CA 5DNRA 5B2LA 2QKWB 1WCCA 3NVMB 3RK9A 3KXMA 2YM7A 1M17A 2OW3A 1OKVA 2BAQA 2E9VA 3OBJA 3U51A 4UV0A 2V0DA 4U44A 4BCOA 5L2QA 2OO8X 3R63A 2B52A 3VS7A 4AE9A 4BCFA 2BKZA 4TNDA 2PL0A 4YJPA 3LJ0A 3K2LA 2PVLA 3OVVA 3M2WA 3POOA 3WF6A 3MESA 1BLXA 4W4VA 4D1SA 3BWJA 1IAJA 3HUBA 4BBEA 2OFUA 3CSVA 5BNJA 4IZAA 3KF4A 5L8KA 3ZLSA 3R7GA 3FMMA 5LVLA 4EOJA 1G8AA 3V5JA 4QP4A 4BIBA 5K0XA 5LMKC 3LW0A 3IPHA 3NUNA 2YWPA 4XG3A 1VYWA 1GIHA 4MD7E 2NP8A 4WG4A 4C35A 4OW8A 2UW9A 4NM5A 4ZLOA 4C58A 3VUTA 5IH4A 2WO6A 5L2SA 3FI2A 4IAFA 4BHNA 1Q8TA 1ZY4A 1MQ4A 4CFWA 4YMJA 5J1WA 1KE9A 5LWNA 5A54A 3AC8A 5D7AA 2W1GA 1ZARA 1IA9A 5GNKA 2JDOA 2Z7RA 3QTWA 4JDHA 5A3XA 1H27A 4EORA 1VR2A 2YERA 2A2AA 3QD4A 2C5VA 2VO7A 2Y4IC 3ZUUA 4ANMA 5M4IA 4KS8A 3UVRA 5EYCA 3W2RA 3GC7A 4ZTSA 4XV2A 4UMRA 4HVDA 4NYEA 2VWWA 3KMMA 5CAPA 2R3GA 4D28A 5BUJA 2VNYA 5IQFA 5BYZA 4YJUA 5BVOA 3BE9A 3NW6A 2BRMA 2RF9A 4RJ5A 5FBOA 3U6HA 2C68A 1FVTA 3WIKA 2O65A 3H9OA 2BRGA 3Q4ZA 1OB3A 2WNTA 3TJCA 3CS9A 5EDRA 3OD6X 2PMNX 3Q2MA 4PUZA 2XIKA 4ALUA 2Y4PA 3E8EA 3CGOA 3NWWA 2B0QA 1PW2A 1YXXA 5DYJA 2ZJWA 4IZYA 3GQIA 4GU6A 4CRLA 4C38A 1ZOEA 4PP9A 5DN3A 1BKXA 4NEUA 4I6HA 4JIKA 3BELA 3MPTA 4O96A 4QPSA 3NCGA 4F7SA 5FM2A 4MTAA 3WZDA 3KL8A 3ZFYA 4QPMA 2HZ4A 4BCHA 4IM3A 4DN5A 2A27A 4FKQA 4X2NA 2O63A 3D0EA 4DTAA 2X4ZA 4BTFA 5KUPA 3D4QA 1UNHA 4S33A 4RLKA 5HCZA 3MGYA 4FSZA 4K77A 4AS0A 5J7HA 1OPKA 4RFZA 2Z7LA 2GFCA 5E91A 3SRVA 2F4JA 4LOQA 4CMTA 4FV8A 4ACHA 2W1ZA 4BWKA 1MRVA 4TZRA 3ZM9A 1CKIA 2X4FA 2C1BA 4R77A 2ZM3A 2PK9A 2FYSA 4WA9A 2J50A 3VS1A 2C5NA 5HE0A 2GTMA 1XHAA 3PY1A 1U54A 4QYGA 3BE2A 3NUPA 3QAME 1YXTA 3MH3A 3TJDA 2BZIB 3Q5ZA 4GFMA 3EOCA 1WBWA 4DBXA 3RAHA 3F2RA 4NWMA 3FC2A 3IO7A 2YIXA 5AUTA 2P2HA 1XBCA 3QXOA 3WI6A 2G9XA 4EHVA 5JEBA 3TZ7A 4HVIA 1YOJA 4EBVA 3IOKA 5K4JA 3VS4A 5CF8A 4XLVA 2I0YA 3OXTA 5FEEA 5BUEA 1OVEA 3LM5A 3FHIA 2BMCA 4GUEA 3A7IA 4K18A 4CMUA 1GY3A 4IX6A 4AZTA 5CVGA 3CQWA 4D9UA 4QO9A 4EL9A 2JKKA 4BTMA 3L8XA 3PSCA 4I24A 3DB8A 5E8VA 4TL0A 5HORA 2WMWA 1KUTA 3RJCA 5DHJA 1H26A 2J0KA 1H24A 1W98A 4D2SA 3ZYAA 5GIOE 4LV8A 3DJ6A 2WTCA 3ALNA 3L8VA 5E8YA 4A7CA 4O0VA 1PMNA 3FLYA 3S4QA 3DU8A 4Q2AA 3CGFA 3GB2A 2PZPA 4JS8A 4XJ0A 5DA3A 3IQ7A 3MBLA 1XQZA 5IUHA 2HIWA 4MXCA 4F7JA 3QGYA 3DBFA 4RX5A 4QTBA 4YLKA 3QRKA 4GIHA 3VBQA 4FGRA 2VO0A 2RG6A 4CT1A 3QTIA 4C57A 4MAOA 4I0RA 4AGUA 3TEIA 3COMA 4PY1A 3V5PA 2VX0A 2HELA 4RC4A 4FV3A 3LFBA 2ZMCA 2PVHA 2VTQA 2YISA 4C7TA 1S9JA 4O0RA 3RNYA 2VRXA 2WEVA 3A62A 4EONA 3BV2A 3ATSA 4GG7A 5HO8A 4I5HA 4M3QA 4JT3A 4JG6A 2JD5A 2PZYA 4QMMA 4NTTA 4PPBA 5CEQA 4NW5A 4I20A 2LGCA 4XV3A 4ASZA 3W2PA 1BX6A 4XV1A 3CXWA 4RIXB 3HX4A 3N51A 4V04A 5CVHA 5IA5A 3PUPA 4LG4A 4X2KA 3ZFMA 3KK9A 4WNOA 4J99A 1STCE 4Z9LA 4PNIA 5BVNA 3KRLA 2NNWB 4H39A 1ZLTA 2EWAA 4DBNA 3R9HA 3WZEA 4CKRA 2ZOQA 2GNGA 3I4BA 4JR3A 4YJOA 3A99A 2Y7JA 4NM0A 4EOIA 3VRZA 3WILA 4A4LA 4U3ZA 4D4YA 3L9PA 4BY9E 2OICA 3SXFA 4OAUC 4O7NA 2OG8A 3S1HA 1O6KA 2CKOA 3BWFA 2WMQA 5IQDA 2UW5A 3TL8A 4O38A 4BDEA 4KUJA 4IZ5A 3QQLA 1BUHA 3ENHA 3PSDA 3TZMA 2XYNA 5IDNA 3QRUA 4PTGA 3VHKA 4S32A 4HCTA 1RDQE 5T68A 1J7IA 5HG7A 1MQBA 1XBAA 4BVUA 4N6ZA 3RINA 4ZP5A 4KIQA 4BDHA 2R3QA 3W2SA 5JRSA 2OH0E 2QU5A 1NY3A 4QMTA 4JDKA 2C6KA 3FUPA 2WMSA 3KXXA 4RFMA 4YC3A 2OH4A 3SAYA 4C4FA 4E6QA 2E9NA 3PVGA 3ZDUA 4QMZA 3FI8A 1YDTE 4FEXA 3Q2JA 4X2FA 3EHAA 1I44A 1KE6A 3UOJA 4RMZA 3PIXA 4EZ3A 4GKIA 4E3CA 3ZXTA 3NYOA 4ZTHA 5JFWA 4PDOA 3FLQA 4IC8A 3MTFA 4K2RA 4B9DA 3LAUA 4QD6A 4CFUA 1Q8YA 3AT2A 4U7ZA 5CU6A 3TN8A 3P9JA 4F9AA 4G9CA 3CJGA 3GEQA 3VWAA 3Q96A 5E8XA 4X7QA 4FV6A 4F7LA 5CF5A 4MK0A 4BDAA 3QQHA 5HZNA 1T45A 4WBOA 2YIWA 2CNQA 4TYJA 1DI9A 1SMHA 2R0IA 2HWOA 4PL4A 4R8QA 5AUYA 3FZTA 3Q3BA 5EHLA 4QYFA 2B54A 4R7BA 4FK3A 3COHA 2XNOA 4FZAB 1UU7A 3V5WA 1BYGA 3II5A 4DEAA 4G6OA 1T46A 2RFSA 1TQMA 5EHYA 4QMOA 5FDXA 1KE8A 4GH2A 3SX9A 2VWUA 4RG0A 5EW3A 2W99B 3ALOA 3V6RA 3V01A 4AU8A 4EH7A 4DT8A 4QMYA 4W8DA 5H3QA 4J53A 4YZDA 1H0VA 3A2CA 3LE6A 2XF0A 3Q4TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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