4YUQA

Cdpk1 from eimeria tenella in complex with inhibitor uw1354
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
473
structure length
462
Chain Sequence
KLAATPGMFVQHSTAAFSDRYKGQRVLGKGSFGEVILCKDKVTGQEYAVKVISKRQLLLKEVELLKKLDHPNIMKLYEFFEDKGYFYLVTEVYTGGELFDEIISRKRFSEVDAARIIRQVLSGITYMHKNKIVHRDLKPENLLLENKRKDANIRIIDFGLSTHFESTKKMKDKIGTAYYIAPEVLHGTYDEKCDVWSTGVILYILLSGCPPFNGANEFDILKKVEKGKFTFDLPQWKKVSEPAKDLIRKMLAYVPTMRISARDALEHEWLKTTDDSIDVPSLESTILNIRQFQGTQKLAAAALLYMGSKLTTNEETVELNKIFQRMDKNGDGQLDKQELMEGYVELMKLKGEDVSALDQSAIEFEVEQVLDAVDFDKNGFIEYSEFVTVAMDRKTLLSRQRLERAFGMFDADGSGKISSSELATIFGVSEVDSETWRRVLAEVDRNNDGEVDFEEFRQMLLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Eimeria tenella
publication title CDPK is a druggable target in the apicomplexan parasite Eimeria
rcsb
molecule keywords Calmodulin-like domain protein kinase
total genus 159
structure length 462
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
A PF13499 EF-hand_7 EF-hand domain pair
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4yuqA03
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4yuqA02
1Q4LA 4D2VA 4EHZA 1PY5A 2FSMX 3QQLA 3UMXA 1AGWA 4HGLA 5DLSA 3H9RA 2R7BA 2OSCA 4I5HA 3MIAA 1OKVA 3LE6A 4DTAA 2BFYA 2IZRA 2W4JA 4X7QA 3NUUA 1LR4A 4OTQA 2VTQA 4X2KA 3IS5A 5BYYA 2OIQA 4XP2A 4IAZA 1R1WA 1DI9A 1O6KA 2AUHA 2IVSA 1YWRA 3MJ1A 3A60A 4YZNA 3R1NA 3TZ9A 2C5VA 4G1WA 4IC8A 2NO3A 2H8HA 2OIBA 4FV6A 4C57A 3BCEA 2BZKB 2Z8CA 2R3HA 3B8RA 3NW7A 4R1YA 5F20A 2RSVA 4FT3A 5CAPA 2E9UA 3F5UA 3S95A 1NA7A 4LQMA 3BQCA 3V5PA 5JN2A 2CKEA 3V8TA 3T9TA 1Q5KA 2CN8A 4W8DA 4O0WA 3C7QA 3EL7A 4AACA 2QG5A 2V7OA 2WTVA 3KGAA 4NIFA 4KNBA 4L7FA 3SRVA 2C30A 3ZDUA 3KKVA 1G8SA 1PMNA 4YC3A 1OKYA 3DQXA 1I44A 3QTXA 4R78A 4XNEA 3VUDA 4FTJA 2XA4A 3RPRA 2I0EA 2X81A 5BVKA 4HYHA 3ZLSA 2W05A 4CV9A 3MA3A 4GFOA 3P9JA 2F9GA 1Q8TA 2XBJA 3IDBA 4X2NA 2C0OA 3F9NA 2ERZE 5DEWA 5EHYA 2RG5A 1YI3A 4C35A 3ORMA 4BCFA 4EWHA 3G9NA 3FLYA 4IAFA 5DH3A 5LVLA 3O2MA 3GVUA 2ITZA 4WOVA 1V0OA 1BI7A 2WZJA 4XEYA 4BICA 1S9IA 4RBLA 4MQ2A 5HTBA 1ZLTA 2OICA 1OITA 1YW2A 2W1ZA 4JDHA 1F0QA 3AT2A 1DM2A 5CZIA 5A54A 4BBEA 4FV4A 5AJQA 5DR2A 4CQEA 4USDA 4EH7A 1W98A 3W2CA 1FOTA 3C1XA 5GNKA 3TM0A 5HVYA 1IAJA 3O0GA 3JXWA 4M12A 5LWMA 3N51A 2GCDA 2EVAA 2E9VA 3ZUTA 1PF8A 4DLJA 3AGMA 1YQJA 2PMNX 3IO7A 3FUPA 4R3PA 4AG8A 4BI0A 4QMUA 2CHLA 5DIAA 1Y6AA 3ZC5A 1REKA 4MNFA 2OBJA 1GZ8A 2Z7SA 3AD6A 3Q52A 2QOFA 5C8NA 4D4YA 1YOMA 3OWKA 4LMUA 2H96A 5AR3A 1KV2A 3E93A 4I6BA 3U9CA 3KA0A 5ETFA 2CKQA 1U59A 4FG7A 4O86A 4FE2A 4WNPA 2PZ5A 3P0MA 3FL4A 4CFXA 5G1XA 5JGAA 3S1HA 1H1QA 3C4WA 4ITJA 3FYJX 4M97A 4FVPA 4DGMA 4GJ3A 5DRDA 4Q9ZA 2V22A 4CG8A 3QF9A 3MTFA 3DBFA 3CJFA 3H9OA 3LXKA 4IZ5A 4EBWA 3CEKA 4DINA 3VUMA 4WUNA 4TZRA 3R8UA 2OJJA 3PP1A 3W2OA 3ROYA 5K4IA 4GUEA 1WVWA 5FP6A 1UNLA 2HXLA 1RQQA 3CC6A 4FZ6A 4CYJA 2ZM1A 5KX8A 3UQCA 4NKAA 4R1VA 4ZTLA 3HRCA 4MEDA 4CTBA 3MA6A 3IKAA 4QMOA 4I4FA 4YTIA 2CKPA 5I9WA 2WTKC 1ZARA 3C13A 2Q0NA 4WHZA 5D11A 3NVKI 2H9VA 4O6EA 4D4VA 1XBAA 4QP2A 3TZMA 4RX5A 3P86A 5J7BA 4GSBA 3H30A 2OWBA 4G5PA 3NYOA 4YJUA 3BYVA 4XV3A 4JL9A 3K3IA 3EIDA 5H8BA 4ZLOA 2O2UA 3A7GA 4L44A 4FTIA 2B53A 4CSVA 2YWVA 2ZMDA 3RZFA 3V01A 4DGNA 4O7TA 2YZAA 1WCCA 3W2QA 3FY0A 5AR7A 2HZ4A 3H0ZA 5B2KA 3VS1A 3JVSA 2HY0A 3PIZA 2F4JA 2JAMA 4I94A 5ETAA 2A27A 5FLFA 4PDYA 3P7BA 3TNIA 4FTQA 5C9CA 2R3LA 3LJ1A 3O96A 2RF9A 4JG7A 4L52A 3PVGA 2F7EE 3R1YA 1GY3A 4GU6A 5JGBA 4RJ6A 3RPVA 3NW5A 5FQDC 4ZS0A 4X2JA 4FSZA 4JLCA 3W32A 5AA8A 3IW6A 2WEVA 5HX8A 2B9HA 4J96A 1FVTA 5I9XA 1QPJA 1Z9XA 2IWIA 2JLDA 3VRZA 2Z7RA 3W2RA 4DGOA 3V5TA 2YACA 3BGQA 5HCXA 2WQMA 3DB6A 3S2PA 4BDEA 4O96A 5JFSA 3NUAA 1QMZA 2QURA 3F3WA 4LL5A 3NDMA 2C6OA 2BROA 3QX2A 3RI1A 4A9RA 2ZDUA 3FC1X 4O84A 4OT6A 2I6LA 3DKCA 4GKHA 3R7UA 4O2PA 3VUHA 3Q9XA 4GEOA 3G5DA 4QRCA 3Q5IA 2C6EA 3UO4A 3KMUA 3VUTA 4FSUA 4JDIA 3PFQA 4RIWB 3KMWA 4RWJA 5AR2A 4ERWA 4EK6A 4CVAA 5I9YA 3UBDA 1MQBA 4DBNA 2VUWA 2XJ1A 4NTSA 4UZHA 3VWAA 4P5ZA 4I1ZA 2IZSA 4CEGA 5AAGA 2JKOA 2WXVA 3K3JA 3ZM9A 5HU3A 5D7AA 3BV2A 4E1ZA 2VGOA 4BCQA 3F69A 4D28A 3HV6A 2B0QA 5EOLA 2P4IA 3TKIA 4FUYA 2GMXA 5CU0A 1JOWB 2JIUA 4IWQA 3TI1A 4A06A 3OT3A 5A4LA 3UO6A 2X9EA 4PDPA 4F6WA 4E4NA 4ZTMA 1H27A 3DJ5A 2BIKB 1SVEA 4V01A 4UXLA 3ATSA 2YCSA 2ZYBA 1GJOA 2BTSA 5I3OA 4IWPA 4C2WA 1XH4A 5IMEA 2J9MA 4FG8A 5GZAA 5EHOA 2Y9QA 4LOOA 4W4YA 3GCPA 4RFMA 2GQGA 3EH9A 3LXPA 3E3BX 4I23A 4Q5HA 4A4OA 2WIHA 3VQHA 5AUTA 3FAAA 4PRJA 1VZOA 2JIIA 3LMIA 4FV3A 3CPCA 2B9FA 2ITXA 3MB6A 4J53A 4LGGA 3TNHA 4MD8E 3T3VA 4CG9A 4MCVA 5AUYA 3II5A 3MIYA 5HVJA 1H1PA 3QC4A 2BRGA 3QZGA 4FKIA 3PJ8A 4I41A 3PJCA 4GH2A 3GU5A 2XZSA 5TF9A 3KN6A 3SV0A 5LOHA 3FDNA 4HZSA 5CSWA 3HV7A 4CTCA 1OECA 1IG1A 1PXKA 2XBAA 4Q5EA 4H1JA 3UVRA 1AQ1A 3I0QA 4W9WA 2QOIA 4N57A 5FGKA 2JGZA 2F7ZE 4I6FA 4CCUA 1JNKA 3L9MA 4FSQA 2J0IA 1JKTA 3ENMA 3ZH8A 2CNQA 1CM8A 3RAKA 1OIRA 4G9CA 4JRNA 2OO8X 2QOKA 5BVEA 3EFWA 3F5PA 2BPMA 4I20A 3VBVA 1H25A 3VRYA 3RAIA 3ROCA 4FTLA 5JZNA 1V0PA 3TV4A 2W5AA 4MH7A 4EOIA 2XS0A 4FC0A 4EKKA 4DEHA 2QHNA 5CF4A 2C1BA 3BBTB 4AT4A 2YDJA 2EXEA 4AXAA 1TVOA 3GOPA 4I22A 2W17A 3IW8A 4LUEA 3VUIA 2ETMA 4ALUA 4IQ6A 3HX4A 3QCQA 5G6VA 3I81A 5F9EA 3MESA 5IEVA 4U43A 1F3MC 3U55A 2W1EA 2WTWA 5CSPA 2FUMA 4RX7A 4NYEA 5DMZA 4MNEB 4PPCA 3BHHA 2Y4PA 3UQFA 4LV5A 3UTOA 3HUBA 3TIZA 5CF5A 5JQ8A 2CCHA 4E7WA 3OWPA 5M51A 4FTTA 1P14A 4RJ4A 5BUIA 2UVZA 4JBPA 3MFRA 5FRIA 4EC8A 3QD4A 4FOCA 1OBGA 4E6QA 3SC1A 2VTLA 3F2NA 5K0XA 4IACA 3UO5A 5F94A 3DXPA 4LG4A 3MYGA 4IVBA 2HY81 3HP2A 5CT0A 5L2IA 1UNGA 1OIUA 4QTAA 3W2PA 2OZOA 3R02A 4AW0A 4F9CA 4FV9A 2GNHA 3CLYA 3JS2A 3B8QA 4QD6A 4J8NA 1VYZA 1M7NA 3F2AA 4E8AA 2PVNA 1RDQE 2X2MA 2OH4A 3UGCA 1BL7A 2X2LA 1JAMA 3PPZA 3SXFA 4B99A 3ETAA 4KIKA 4U45A 5CEQA 4QTEA 3BGPA 3IOKA 4IB5A 2G9XA 4KABA 3PSDA 4O0XA 4DFZE 4U40A 5IEYA 3R04A 5D7VA 2ITPA 5HTIA 1UA2A 3KL8A 2QR7A 4YSMA 3O8TA 4I6QA 4XV9A 3I6UA 3ZEWA 4DFYA 4ZAUA 5DR6A 3BYMA 3EQBA 1PRYA 2YCQA 1TQPA 5F1ZA 5IUIA 3VUKA 2R2PA 3FZTA 1H0WA 2JKQA 4PUZA 2ITYA 2C6IA 2W9ZB 3CD3A 2RFEA 3PPJA 4F08A 4KRCA 4OBQA 3TJDA 3EFJA 2XNOA 4FBXA 1U46A 3HA6A 4I0TA 4J71A 2XYNA 3QX4A 1V0BA 2FSOX 5IQEA 4ZSGA 3R7IA 2BAJA 2XNEA 4PDOA 2W1HA 5DVRA 5EK7A 4DH5A 4USFA 4BR3A 1Q97A 4L42A 1STCE 1XKKA 4PP9A 3R2BA 4AZSA 2RL5A 3OCGA 1ZOHA 4QPMA 5HQ0A 5FBOA 3QXPA 4C8BA 1PMEA 2YIWA 2H6DA 1TQIA 2XEYA 5AMNA 3U8WA 3MH3A 4LOQA 1PKDA 2OW3A 2A4LA 2V7AA 1VEBA 4TRLA 3W16A 4BFMA 5EI8A 4ACGA 3UIXA 3DAKA 2WQNA 2QU6A 3ZO2A 3U51A 3KXGA 3A7JA 3TKUA 3AT3A 5L6WL 2OFUA 1PXJA 4FTNA 1JKLA 1K3AA 3SDJA 5A4CA 1DAYA 2X8DA 3AQVA 3GCSA 3I0OA 3ZBXA 3NRMA 5BX0A 5IH5A 1ZAOA 2XIXA 4HNFA 5DN3A 3QCYA 4A4LA 4XP3A 1JSTA 2KTYA 5CI6A 1MRYA 2PY3A 3EQIA 4O38A 1PXIA 4OTIA 4EOKA 5FEDA 2DWBA 3LCOA 4PTGA 5FM2A 5F4NA 3E63A 4MBLA 2YLFA 4KIQA 5CAVA 4IVDA 3R63A 3ZHPC 5L2TA 3LQ3A 4X2FA 4EJNA 5BUEA 4AZVA 3ZO1A 4JIAA 3N4UA 1JVPP 3D94A 4BL1A 3KCFA 4EK4A 3FXWA 4M67A 3FI2A 2PTKA 2V55A 4ONAA 1Q24A 1J1CA 4KAOA 3OD6X 4IADA 4K33A 4F4PA 3QQGA 2R3FA 4FZFB 4ALWA 3NW6A 5DGZA 3BLRA 1FQ1B 4ANSA 5BVWA 4EOSA 5AM6A 3FKLA 4AF3A 3TIYA 2VTNA 4XUFA 5DT0A 1YWVA 5E8SA 3ZYAA 4Z7HA 4EK8A 2ITQA 5HKMA 4LUDA 4U79A 2XUUA 3AG9A 3OW3A 1G8AA 2OJGA 3FQHA 4QQ5A 3DFCB 2JC6A 4RWLA 4YPSA 5T3QA 5AP2A 2Y4IB 3COIA 3U87A 5IDPA 1KUTA 4UN0C 2ONLA 2VU3A 3D14A 2VO6A 3QHWA 4ZTSA 3KULB 2UW4A 4A07A 5EHLA 4J97A 3QUEA 1FGIA 4FTRA 3WARA 4IAAA 5M4IA 2BRBA 4QMPA 2BRNA 3D7TA 4WNMA 3RZBA 5K9IA 2NRYA 4FT0A 5B2MA 1P5EA 4UWYA 3KF4A 3TNWA 2XJ2A 3KXXA 1OKWA 2W1GA 3AXWA 2R0IA 4QP8A 2YCFA 4G3GA 2R3MA 5KZIA 2CPKE 2VWXA 2OJ9A 2J51A 4TWOA 3FBVA 3ZTXA 2YA9A 2RGPA 2YN8A 3NWWA 3PIXA 5C03A 1P2AA 4BDJA 3BHYA 3ZM4A 4GYIA 5M4UA 2OLCA 4LRJA 2GSFA 2HOGA 4NU1A 3RCJA 4RJ5A 1KE7A 3ORNA 2W1DA 4RZVA 3ZDIA 3BHTA 3T8OA 3OT8A 3IW4A 3ZRKA 2IZUA 4XX9A 4EZ5A 3CJGA 4C4JA 4F63A 1G3NA 4JT3A 1IAHA 2SRCA 3VW6A 1J7LA 3UJGA 1QPCA 2PZYA 2PYWA 3PLAE 3IQ7A 4R6VA 2QR8A 5FXRA 5KHXA 1XBBA 4QP9A 4R3CA 2O8YA 1Q61A 3R9HA 2J50A 2QODA 2WEIA 2ZDTA 3LFFA 2C3IB 4F65A 2C5NA 3EZVA 5C1QB 4BC6A 3DKFA 2FO0A 3WF6A 3VBWA 3OOGA 4I5MA 3RVGA 4OW8A 2WTCA 4FVQA 3AGLA 3FQEA 2WHBA 4F0GA 5E7RA 4BYJA 3ZXTA 2R5TA 2XK4A 3SD0A 2B9JA 3HECA 3A8WA 1ZYCA 3Q9WA 4FT9A 4S30A 3CQEA 5D9HA 2XRUA 4NK9A 4HYSA 4ZJJA 2BZJA 4E5WA 4CRSA 4RPVA 3R1SA 2GNGA 4W4XA 1E1XA 4ANLA 1KE9A 5HIDA 3R8ZA 3PZHA 3CPBA 2R0UA 2B4SB 2UW5A 4PMTA 5FXSA 2WTIA 3AMAA 4AZFA 3T3UA 4CMOA 4YNOA 4DYMA 5DHJA 3CTQA 2OK1A 3TUDA 3UIBA 5LQFA 3GXLA 4PPAA 5J9YA 3JVRA 2XRWA 5H8EA 3SXRA 4ZMEA 3UZTA 5ACKA 3GB2A 4G3CA 4YR8A 4FTUA 4O0SA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4JR3 A;  3OCS A;  4UX9 A;  3O8U A;  3SG8 A;  4FIG A;  4U44 A;  5AIK A;  4UMU A;  3O23 A;  4D2S A;  5I4N A;  4N6Y A;  3EQD A;  3P08 A;  3LW0 A;  1OKZ A;  4FTK A;  3EL8 A;  2QVS E;  3EN9 A;  2VV9 A;  1H4L A;  3E8E A;  1Q8Z A;  3BRB A;  4F70 A;  2QG7 A;  3IOP A;  3QTW A;  4X21 A;  5GJG A;  3FSK A;  4D5H A;  4AGW A;  5E8V A;  2W0J A;  2HAK A;  4U41 A;  4FOD A;  1ZMV A;  3EQP A;  5KKR C;  1OUY A;  2Y7J A;  4A4X A;  3UDB A;  4DIT A;  5BUJ A;  5HTC A;  3U4W A;  1OIY A;  3E8N A;  2PVL A;  3BWF A;  3I79 A;  3DK3 A;  3ORP A;  4O0T A;  2ZM4 A;  4Q2A A;  5E9E A;  3QA0 A;  4O7W A;  2HW6 A;  5EW9 A;  1DAW A;  3G90 X;  4RVL A;  4FVR A;  4IDV A;  2WU7 A;  4U0I A;  4ACC A;  2I0V A;  3CTJ A;  5GHV A;  4J1R A;  3TZ7 A;  4O83 A;  3GU6 A;  3EQR A;  5ANI A;  1YXS A;  4F9B A;  1ZMW A;  2OGV A;  3D83 A;  4D4R A;  2A1A B;  3LFD A;  4EK5 A;  3AC5 A;  4KSQ A;  4FZA B;  2W9F B;  4DFU A;  4LL0 A;  5EW3 A;  5T68 A;  2XEZ A;  5FEE A;  2WTD A;  3TN8 A;  2XNB A;  2BVA A;  4J95 A;  4CFW A;  4RMZ A;  3EFK A;  2VZ6 A;  3QU0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1Q4L A;  4D2V A;  4EHZ A;  1PY5 A;  2FSM X;  3QQL A;  3UMX A;  1AGW A;  4HGL A;  5DLS A;  3H9R A;  2R7B A;  2OSC A;  4I5H A;  3MIA A;  1OKV A;  3LE6 A;  4DTA A;  2BFY A;  2IZR A;  2W4J A;  4X7Q A;  3NUU A;  1LR4 A;  4OTQ A;  2VTQ A;  4X2K A;  3IS5 A;  5BYY A;  2OIQ A;  4XP2 A;  4IAZ A;  1R1W A;  1DI9 A;  1O6K A;  2AUH A;  2IVS A;  1YWR A;  3MJ1 A;  3A60 A;  4YZN A;  3R1N A;  3TZ9 A;  2C5V A;  4G1W A;  4IC8 A;  2NO3 A;  2H8H A;  2OIB A;  4FV6 A;  4C57 A;  2XAM A;  3BCE A;  2BZK B;  2Z8C A;  2R3H A;  3B8R A;  3NW7 A;  4R1Y A;  5F20 A;  2RSV A;  4FT3 A;  5CAP A;  2E9U A;  3F5U A;  3S95 A;  1NA7 A;  4LQM A;  3BQC A;  3V5P A;  5JN2 A;  2CKE A;  3V8T A;  3T9T A;  1Q5K A;  2CN8 A;  4W8D A;  4O0W A;  3C7Q A;  3EL7 A;  4AAC A;  2QG5 A;  2V7O A;  2WTV A;  3KGA A;  4NIF A;  4KNB A;  4L7F A;  3SRV A;  2C30 A;  3ZDU A;  3KKV A;  1G8S A;  1PMN A;  4YC3 A;  1OKY A;  3DQX A;  1I44 A;  3QTX A;  4R78 A;  4XNE A;  3VUD A;  4FTJ A;  2XA4 A;  3RPR A;  2I0E A;  2X81 A;  5BVK A;  4HYH A;  3ZLS A;  2W05 A;  4CV9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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