5EW3A

Human vascular endothelial growth factor receptor 2 (kdr) kinase domain in complex with aal993
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
298
structure length
274
Chain Sequence
PYDASKWEFPRDRLKLGKPLGRGAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYKVKDFLTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANA
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title A Novel Potent Oral Series of VEGFR2 Inhibitors Abrogate Tumor Growth by Inhibiting Angiogenesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Vascular endothelial growth factor receptor 2
total genus 91
structure length 274
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ew3A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ew3A01
4Z16A 4WG3A 4PMSA 3HDMA 3WF8A 2GNFA 1FMKA 2JD5A 4FL2A 2F7XE 2V55A 4OTFA 5AUYA 5DEWA 5BVKA 3TIYA 5E9EA 2QOLA 4O0SA 3E93A 4UYAA 3RPRA 3CPBA 4OT5A 3JUHA 1CMKE 2UW7A 4DYMA 4E6AA 2QHMA 2ZM1A 4KKGA 3OT8A 2R3MA 5T6KA 3BRBA 1IRKA 4FKLA 5D10A 2WXVA 3HRCA 1H08A 2J0KA 3EKKA 3EN9A 2ITUA 3KCKA 4TWOA 3W2OA 3PRIA 3VF8A 4LFIA 3ZXTA 4ENXA 5FEQA 3A7IA 3JPVA 5IG1A 2R3PA 3RHXA 5H8BA 5DMZA 2NRUA 2WMSA 1UA2A 4EQCA 4DGLC 5CEKA 5CXHA 1X8BA 3V6RA 4ASEA 3ZM4A 4DH1A 2JIVA 4YTIA 2O5KA 4FKRA 3CQWA 3HV6A 5CAUA 4NJDA 5HCYA 3RPSA 4GV1A 3MFTA 1ZLTA 3C5IA 4JDJA 4ZY4A 4PV0A 3DKFA 2VTAA 4FTIA 1JSUA 1FINA 3HUBA 3V01A 1WZYA 2W5AA 5CWZA 4EYMA 3DU8A 4PX6A 2G2HA 4Z9LA 4GMYA 2BZIB 5L6WL 2CSNA 3LFSA 2JDOA 2JLDA 2CNVA 1ZYLA 4FZ6A 2BILB 4FTAA 5AWMA 3FMMA 3ROCA 5A4CA 4U79A 4CG8A 2F49A 3EFWA 3SXRA 2BAQA 5C03A 3D7TB 4DINA 4ERWA 2PVRA 3DAJA 3DT1A 5M09A 3SQQA 4QYFA 2DUVA 2KULA 3QC4A 4L53A 3D7ZA 2ZOQA 3JR1A 3AXWA 4TT7A 3UOHA 3ZC5A 3TV7A 2G01A 2WQNA 4BBMA 2PZRA 3GFWA 2C1AA 3OUNB 4X2NA 4F63A 5CI7A 5LVNA 4PP7A 2FB8A 3BU5A 4MAOA 3V04A 4G17A 4F0GA 3E8CA 3BU6A 3TWJA 3CE3A 3SW7A 3EZVA 3GC7A 3QYZA 3OF0A 4RX8A 4F7JA 4FL3A 4JXFA 3MV5A 4Z55A 4MBJA 4NW6A 4KB8A 5T3QA 3MH2A 3WF9A 4DEEA 4DFXE 2B9JA 3UZPA 5IEVA 3V5LA 3UGCA 5DA3A 4ZP5A 4CKJA 4O91A 4JJRA 3MSSA 2OH0E 2YHVA 3RZBA 5JSMA 3IOKA 4HVGA 3PXRA 2GTNA 3NYNA 4K8AA 4FTOA 4X2KA 2C5VA 4MTAA 5L2QA 4CCBA 3P78A 3FL5A 2CCHA 2XNOA 3BLQA 3I60A 4A07A 2ZV2A 2G15A 1W83A 4DT9A 1V1KA 3H30A 3NW5A 3R1NA 4YLLA 2XIKA 3UTOA 3SA0A 2QOKA 2GNHA 4EK4A 2WTDA 2I0HA 2JC6A 3MVMA 4ZJIA 2IW6A 3NNVA 5D7AA 5LWNA 2C47A 3FZOA 2VTRA 4G6LA 2VWIA 5HD7A 3CQEA 1J7LA 3DS6A 4YR8A 4RMZA 3BHVA 4I93A 4ACHA 4FSNA 4C58A 5FDXA 4IM0A 4CFUA 1LPUA 5HI2A 3VQUA 3EB0A 1EH4A 2J90A 1OECA 3SRVA 5IQHA 4PTCA 3AC3A 3CD8A 4BL1A 1J7IA 2FSOX 3ORTA 1IAJA 1Y6BA 5IKWA 3BX5A 3F3VA 1U54B 3UYTA 1ZMUA 4C0TA 4CMTA 2JDRA 3EQIA 4FK3A 3ZSIA 2H9VA 4BDAA 4N4SA 4C4EA 2PZPA 3UP2A 4WSQA 3ODZX 3CTHA 3HV7A 3PIXA 1YI4A 5K5NA 4ZIMA 4O7VA 3PDTA 5FEEA 3V5QA 4BHNA 4FKIA 2RFNA 5AFVA 4FICA 3S0OA 5HNGA 4O96A 3QCYA 3AD4A 4ZTLA 3DXPA 2QU6A 4YHFA 5CNOA 4AZVA 3KC3A 4GUBA 3HLLA 4FX3A 4EQMA 3RJCA 3LFAA 2KTYA 4Y85A 2R3JA 3PXFA 5EM7A 2VWWA 3REPA 2PVYA 1BL6A 3CTJA 4RSSA 2CN5A 1FOTA 4JBOA 4LUDA 4ONAA 4L7SA 4LM5A 2C5XA 2CGXA 5CEIA 3UNJA 1KE8A 3FBVA 2WNTA 3RBWA 3BV3A 2YA9A 3NRMA 1JSTA 2EXCX 4EK5A 3MIAA 5AX3A 3ZOSA 2P4IA 3R7UA 2X39A 3DJ7A 4AS0A 5I5ZA 1M2RA 1SMHA 2RFEA 2X0GA 3WI6A 5KHXA 2YM4A 3KN6A 2GHGA 4CFVA 2O3PA 2YITA 4JX3A 3TKHA 3BE2A 2WEIA 2Z7SA 4ZZNA 5AP2A 5CS6A 4PPCA 5CI6A 4R6VA 3W33A 3NCGA 3A7JA 3TG1A 2VWBA 2W1FA 5J87A 3R8UA 3WF6A 4BCHA 2RKUA 3GNIB 2OF2A 2B9IA 4GYGA 4JQ7A 4BKZA 3ZDIA 3UQCA 1RW8A 4YPSA 4A9UA 4J53A 3VVHA 3EKNA 4MXYA 4AT3A 5C27A 4CMOA 4FVPA 4EWQA 3RM7A 4C34A 5AP3A 1GIIA 3GOPA 4IZYA 5ANDA 4J96A 2FA2A 4EEVA 3GOKA 4O6EA 4XS2A 5AR4A 1ZYDA 2GTMA 5CAQA 4LGHA 4DEAA 1BYGA 2PK9A 5AM7A 3NDMA 2I0YA 2R9SA 3G0FA 3P0MA 3LFFA 4AN3A 3F82A 4W8DA 4Y46A 4F7LA 3UMXA 4O86A 2WTKB 5E90A 4ANQA 3AD5A 5HD4A 3FMDA 4QRCA 3MVJA 4TYHA 4ZTMA 4ZY5A 4GW8A 4WA9A 3V5JA 3ZHPC 4OBQA 3CR0A 2BDJA 3KFAA 4FSMA 5IA0A 2PU8A 2P33A 1XH9A 4FMQA 1LUFA 1U59A 4QD6A 4YZCA 4D4SA 5HLWA 4BIDA 2YJRA 2CKPA 2QOIA 3HECA 4QTBA 1JKLA 3GCUA 2CKOA 2FSMX 2R4BA 2UZLA 3IK3A 3K54A 2BHHA 2WELA 3BLRA 2OO8X 5CF8A 4FEWA 5BVNA 4YZDA 3C5UA 5BVOA 3Q9YA 5LOHA 1YHVA 4WO5A 4W9WA 1K2PA 1PHKA 3FZRA 4RT7A 5ANIA 1YOLA 3GGFA 4RQVA 3W8LA 3DFAA 5LMKA 3GT8A 3ZLXA 4EL9A 4GKHA 2YABA 3LLTA 5M53A 3S3IA 3UYSA 3TACA 4PPAA 4BWPA 3RALA 4EKLA 4YHTA 1FGIA 2XVDA 3PJ3A 5FWKK 2XEZA 2GS7A 5JN2A 2WO6A 4EK3A 5LQFA 2ITZA 5DIAA 3GC8A 2B9HA 5EYCA 4ZTQA 2F7ZE 4CXAA 3KF7A 3QKKA 4JLCA 1OIYA 4XG9A 4HW7A 3SG8A 5E7RA 1BI7A 2Z02A 5L8LA 4P5ZA 1J3HA 3QGYA 1H28A 3W16A 2W7XA 4RG0A 5DGZA 2OICA 3NCZA 4YJOA 4O0UA 1XHAA 4AQCA 2YISA 2C69A 2Z7LA 5A14A 5A54A 4UEUA 3E88A 2ITQA 1DAWA 3A4PA 2R64A 3FDNA 4MBLA 4OLIA 3R6XA 4PDPA 4ANSA 4AZFA 4B6LA 4FSTA 1U5RA 2A19B 3OW3A 4YTHA 1Q8TA 5HORA 3P23A 4J7BA 4U7ZA 5FRIA 5CTPA 3TUCA 4RBLA 1YHSA 2XM8A 1OIRA 2C6IA 3ORXA 4RGJA 4WNMA 4HOKA 4Z7HA 3F9NA 2RIOA 3F66A 4O82A 2J0IA 1YDSE 3I6WA 4BYIA 3T9IA 3UDBA 5M4UA 2PL0A 2WKMA 5DE2A 4CKRA 1ZOHA 3VBXA 3DLSA 4ZZMA 2I40A 1Y8GA 5JT2A 1NVQA 4PMTA 4YMJA 4IDTA 4KD1A 3I7CA 3P5KA 5E1EA 2WQBA 3TUBA 1TQPA 4NH1A 2C1BA 3BYUA 1ZOGA 4FNZA 3LCDA 2EWAA 3OWPA 1W8CA 2XS0A 2OK1A 3EYHA 4M7IA 4OBPA 3BCEA 4I5CA 5HLPA 5J9YA 1XBCA 4CSVA 2R3RA 2J6MA 4DE4A 4D28A 5EOBA 4XV9A 4PNKA 5JFXA 4XV2A 4GFMA 5HG8A 4KBKA 1R3CA 4G2FA 3O51A 1U4DA 4GU6A 3VBYA 4BI1A 3RNYA 5CALA 5E4HA 3ACJA 1XH8A 4KRDA 4IXPA 3AT3A 3EZRA 3TM0A 4AF3A 4QTAA 2BZHB 4NIFB 5KNJA 3FMLA 4CTBA 4NK9A 4C2VA 5I3OA 2Y0AA 4B4LA 4LOPA 4FTUA 3AT2A 5GIPE 2OJGA 2UV2A 2O0UA 4W9XA 3ULZA 4EOIA 5K5XA 2C3IB 3NUYA 4AG8A 1H1QA 2FYSA 3UC4A 3FPQA 3P7AA 3COKA 4GT5A 4TWCA 3Q9ZA 3RZFA 4RFMA 3RHKA 2B53A 4GG7A 2JKMA 1KV2A 3DAKA 3DTCA 4GT3A 4BTMA 4YC8A 3A2CA 4BCQA 3F69A 1ZOEA 1BUHA 2R3OA 4HNIA 4RFYA 4XP0A 3ULIA 2CNQA 2EVAA 4YLJA 5E1SA 3BE9A 1P2AA 1CDKA 3FQHA 4WHZA 2WTIA 5HEZA 3SHEA 3ZCLA 2BCJA 4E4NA 5EI6A 4C35A 4KIKA 5J7HA 4XYFA 3UO5A 4BDHA 4WIHA 4YP8A 4YJSA 3LAUA 4YC6A 1OBGA 3RVGA 3DXQA 4I3ZA 3DJ6A 3ENHA 3ZS5A 4X0MA 4Q2AA 1WBNA 1OPKA 4YHJA 4QQCA 4F0IA 5A46A 3SLSA 3ZRMA 3UIMA 4X2JA 2JIUA 2RG5A 4FZAB 3GFEA 3OTVA 5HICA 2VTTA 4NM3A 4R78A 2E9VA 3U51A 2W1ZA 3QD4A 3B8RA 4OR5A 1JKTA 2LAVA 4PMMA 5HE3A 3CSVA 1NA7A 3GC0A 4YJVA 2OF4A 3A8WA 2BPMA 3COMA 3R21A 4FZ7A 4IWDA 4XBRA 3ZLYA 3O71A 3ZM9A 3ORKA 1XO2B 5KO1A 4BBFA 3S2PA 3R1YA 1UKHA 4RZWA 4NTSA 2VWUA 5I9WA 4C4GA 3ORZA 3I0QA 1H27A 3MPMA 3MB7A 5DT3A 5HGIA 2ONLA 4DBNA 5M07A 3IW5A 2REIA 5FDPA 2XNMA 1GZKA 1QL6A 3KEXA 3PYYA 4LL0A 3NYXA 2V5QA 2LGCA 5M57A 3DA6A 1OB3A 4TY1A 5CF5A 2X7FA 2C5NA 5A4QA 4RIXA 3QTUA 4O0WA 2BUJA 3Q4ZA 3LHJA 1F5QA 3FLNC 3R8VA 4AA5A 2C5OA 3CPCA 2WPAA 4BCPA 3PTGA 3GCVA 2VRXA 3R1QA 3NUXA 4X3FA 3IG7A 4L3PA 2A27A 2C6LA 2VTSA 4I6QA 4QOXA 4DH3A 5CU0A 5HKMA 1YOMA 5AIKA 4NM5A 4ZLOA 4QMOA 4Q5EA 4C38A 3K3JA 4FV0A 5ACBC 3ERKA 4DF3A 1ND4A 4K11A 4XV1A 4H3PA 2QURA 3R71A 4I22A 3BWFA 5KMKA 3ELJA 4L52A 3UP7A 2HW7A 3I6UA 4X3JA 4DFUA 3VUTA 4M84A 4HVIA 2J0MB 2VTMA 4M15A 4M67A 2J4ZA 2BRMA 2Y6OA 5FD2A 4FTRA 3FZTA 4I41A 2ZM3A 4JT3A 4RA5A 4C36A 4IACA 4C37A 5CSPA 5CEOA 3VN9A 2XZSA 3IQ7A 4ZSJA 1UWJA 4EC8A 3HNGA 3GCPA 2YZAA 5LVOA 3HUCA 1GIJA 2NP8A 1KV1A 2WEVA 4FKJA 5IU2A 3QBNA 3VAPA 3UPZA 4DTBA 5E91A 2O63A 4CRLA 2R2PA 5AR8A 3GQIA 2YCSA 4RRVA 4ITHA 4BTKA 1IA9A 4JRVA 4AU8A 4YJQA 5M4CA 3LZBA 5C4LA 4IAFA 5BUEA 4IWPA 2PHKA 4D0XA 4MNEA 4PQNA 1KUTA 3LCOA 3LXNA 3NAXA 3O8TA 2RSVA 2YCQA 4DEHA 3OD6X 4IADA 4HNFA 4KSPA 2IZRA 4XG4A 5BVDA 1SM2A 1O6LA 4O1PA 3R7IA 1R0PA 4I24A 3H9RA 4NTTA 3GBZA 4OTQA 5HZNA 3OEZA 2QR8A 2VX1A 1A9UA 4QMYA 4O0VA 3ZEPA 5TR6A 1XWSA 4D2VA 4L00A 2ITOA 3QQLA 4J1RA 2X8EA 4EH4A 2UW9A 2CNUA 3QZGA 4EOKA 1CKPA 1PKDA 4R3RA 3EQHA 4TWNA 5AP6A 1NVSA 4EHVA 5HU9A 4F6WA 2NPQA 5BMMA 3DLZA 3ITZA 2Y6MA 3KXZA 5AUWA 4AZTA 3GI3A 5CU6A 4QMVA 2E9UA 2XM9A 4FG9A 1WAKA 2UW8A 3VO3A 4EOLA 4EZ5A 2WMVA 4G3FA 4N0SA 4GCJA 4IQ6A 3UJGA 4YO4A 3D2IA 4NCTC 1XBBA 3PE1A 3ORNA 4GUEA 3ZU7A 5HU3A 3V6SA 3ZZWA 4IM3A 3AC5A 3IO7A 4EOMA 3O96A 3W32A 1PXIA 4DEBA 3E8EA 4CT1A 3O7LB 2P2HA 3UODA 3QQJA 3ZFYA 2IJMA 1GY3A 4IANA 3KRRA 3GU6A 2FGIA 5KBRA 2R3FA 3JYAA 4CGAA 3OCSA 2H34A 3D14A 4USDA 5LJJA 3A7HA 2QOQA 1J1CA 2VTIA 5CF6A 5EDRA 4LUEA 4UWBA 3PJCA 1TKIA 1ZMWA 2SRCA 3TV4A 3KULB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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